基于癌症基因组图谱数据库的结直肠腺癌加权基因共表达网络的构建与分析

基于癌症基因组图谱数据库的结直肠腺癌加权基因共表达网络
的构建与分析
卞承玲;戴剑;陆亚云;李子文;常乐;孙妹;闫飞虎;赵晓光
【期刊名称】《海军医学杂志》
【年(卷),期】2018(039)005
【摘要】目的利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库结直肠腺癌组织样本表达谱数据,筛选差异表达的基因及微小RNA(miRNA),构建结直肠癌加权基因共表达网络,分析预后相关基因及miRNA.方法首先在TCGA数据库下载结直肠腺癌组织样本表达谱数据,应用生物信息学原理探索并分析差异表达基因及miRNA,构建加权基因共表达网络,筛选其枢纽基因及相关miRNA,进而发现预后相关枢纽基因及miRNA.结果共发现2个核心网络,结合2个核心网络的top10枢纽基因及相关miRNA,进一步确定了和预后相关的基因及miRNA,分别为CYP2E1和mir-885.结论构建结直肠癌加权基因共表达网络可为研究结直肠癌的潜在发病机制提供了参考,枢纽基因及相关miRNA有可能作为诊断的生物标志物和治疗靶点应用于临床.
【总页数】4页(P402-405)
【作者】卞承玲;戴剑;陆亚云;李子文;常乐;孙妹;闫飞虎;赵晓光
【作者单位】200433 上海,海军军医大学附属长海医院影像科;200433 上海,海军军医大学附属长海医院耳鼻喉科;200433 上海,海军军医大学附属长海医院影像科;200433 上海,海军军医大学附属长海医院影像科;200433 上海,海军军医大学附属长海医院影像科;200433 上海,海军军医大学附属长海医院麻醉科;200433 上海,海军军医大学附属长海医院肛肠外科;解放军第四一三医院普外科
【正文语种】中文
【中图分类】R735.3
【相关文献】
1.基于癌症基因组图谱数据库的结直肠癌竞争性内源RNA网络的构建与分析 [J], 卞承玲;戴剑;陆亚云;李子文;常乐;孙妹;任丽
2.结直肠腺瘤的加权基因共表达网络构建与分析 [J], 高亚东;屈亚威;刘海峰
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