中国对虾SRAP分子标记体系正交优化及在遗传多样性分析中的应用

中国对虾SRAP分子标记体系正交优化及在遗传多样性分析
中的应用
陈华增;李健;何玉英;李吉涛;王清印
【期刊名称】《渔业科学进展》
【年(卷),期】2010(31)6
【摘要】利用正交设计L16(45)对影响中国对虾SRAP分子标记分析的5个因素(Taq酶,Mg2+,模板DNA,dNTP和引物浓度)在4个水平上进行了优化,筛选出各反应因素的最佳水平为:20 μl反应体系中包含1.0 U Taq酶,2.0 mmol/L的
Mg2+,40.0 ng的模板DNA,0.125 mmol/L的dNTP以及0.4 μmol/L的引物,退火温度为53.5 ℃.研究表明,各因素的不同水平对扩增结果有显著影响,其中Mg2+影响最大,影响大小顺序依次为Mg2+,Taq酶,引物,dNTP和模板DNA.利用优化的SRAP分子标记体系对中国对虾"黄海1号"第12世代选育群体进行了遗传多样性分析,实验结果表明,此标记技术可作为中国对虾遗传分析的良好技术工具.遗传多样性分析共筛选出8对可以扩增出清晰稳定条带的引物组合,共获得171个位点,其中多态性位点154个,占90.08%;有效等位基因数为1.774 1,期望杂合度均值为
0.421 9,Shannon多样性指数为0.605 5.上述参数值均高于应用AFLP技术对前几代选育群体的遗传多样性分析结果.
【总页数】11页(P43-53)
【作者】陈华增;李健;何玉英;李吉涛;王清印
【作者单位】上海海洋大学水产与生命学院,201306;中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛,266071;中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛,266071;中国水产
科学研究院黄海水产研究所,青岛,266071;中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛,266071;中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛,266071
【正文语种】中文
【中图分类】S966
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