高级别浆液性卵巢癌复发相关的潜在功能性关键miRNA-mRNA:基于生物信息学方法

高级别浆液性卵巢癌复发相关的潜在功能性关键miRNA-
mRNA：基于生物信息学方法
张攀扬;何明敏;曾园媛;蔡雄伟
【期刊名称】《南方医科大学学报》
【年(卷),期】2023(43)1
【摘要】目的探讨在高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)中的潜在功能性miRNA-mRNA调控网络与复发的相关性及其生物学意义。

方法使用来自癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库的HGSOC患者样本表达数据,根据基因本体论生物过程(GO_BP)将HGSOC患者分成不同的亚型,分析不同亚型与复发的相关性;通过基因表达综合(GEO)数据库找到两个与复发相关的数据集,与TCGA数据取交集,获得共同差异表达的miRNAs;预测miRNAs的靶基因,构建与HGSOC复发相关的关键miRNA-mRNA网络;通过RT-qPCR及Western blot检测miR-506-3p与SNAI2的表达水平;双荧光素酶实验验证miR-506-3p与SNAI2的靶向结合;划痕实验及Trans well实验检测miR-506-3p对卵巢癌细胞迁移与侵袭的影响。

结果共筛选出与HGSOC相关通路活性的303个GO通路,确定两个亚型C1和C2。

亚型与复发相关,C1患者的复发概率显著高于C2患者。

C1和C2亚型之间的差异表达基因主要富集在上皮间质转化(EMT)通路,GSE25204、GSE73582及TCGA 3个数据集中有5个共同差异表达的miRNAs,共有41个靶基因能在C1和C2亚型之间差异表达的EMT通路中找到,利用这5个miRNAs及41个mRNAs构建与HGSOC复发相关的关键miRNA-mRNA网络。

MiR-506-3p与SNAI2靶向结合,上调miR-506-3p抑制了SNAI2表达及降低SKOV3和CAOV3的迁移及侵袭(P<0.05);而敲低miR-506-3p显著上调SNAI2表达水平及增强SKOV3和
CAOV3的迁移及侵袭(P<0.05)。

结论miR-506-3p和SNAI2是与HGSOC复发相关的关键分子,miR-506-3p可能通过SNAI2调控卵巢癌细胞的迁移和侵袭影响EMT,对HGSOC的复发有预测价值。

【总页数】9页(P8-16)
【作者】张攀扬;何明敏;曾园媛;蔡雄伟
【作者单位】重庆市妇幼保健院(重庆医科大学附属妇女儿童医院)妇产科;陆军军医大学第一附属医院妇产科
【正文语种】中文
【中图分类】R73
【相关文献】
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5.基于生物信息学的系统性硬化症潜在miRNA-mRNA调控网络的构建
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