pktgen小结
SDTMIG学习总结
CDISC SDTM IG学习笔记学习心得:SDTM数据集与一般数据集的区别:1.数据集个数不同按照数据变量的不同来源分为不同的域,而一般的临床试验只有一个或少量几个数据集。
也就是数据不是按照在CRF表中的位置来收集的,而是按不同topic。
2.个人记录与事件记录一般数据集每个人一条记录,SDTM数据集每个人的每个事件、每次用药或每次不良反应一条记录。
变量的数量减少,记录的条数增多。
也就意味着每个受试者每次访视每个时间点可能有许多条观测记录。
3.由于变量之间存在关联,所以SDTM有关联数据集4.CDISC的重点是如何确定记录的唯一性,比如多阶段多时间多剂量的试验,就需要有三个变量来区别。
5.元数据:关于数据的数据,按照一定的标准,从信息资源中抽取出相应的特征,组成一个特征元素集合。
包括描述一个具体对象所需要的数据项集合、各项数据语义定义、规则和语法定义。
元数据标准的制定为提高数据库建库质量,使诗句加工达到规范化、标准化,促进科学数据标准化,加强数据交流。
6.作用:变量名标准化,变量取值标准化7.并不是所有的域和变量都要使用,根据研究内容来选择This model describes the contents and structure of data collected during a clinical trialThe purpose is to provide regulatory authority reviewers (FDA) a clear description of the structure, attributes and contents of each dataset and variables submitted as part of a product application1.域1.1 定义:一组具有共同主题并在逻辑上相关的观测结果集合。
A domain is defined as a collection of observations that share a common topic.每个域采用唯一的两字符(英文缩写)代码加以区别,如不良时间域(AE,Adverse Event)域是SDTM的核心,所有变量按不同的来源被分类到相关的域。
antigen的用法总结大全
antigen的用法总结大全(学习版)编制人:__________________审核人:__________________审批人:__________________编制学校:__________________编制时间:____年____月____日序言下载提示:该文档是本店铺精心编制而成的,希望大家下载后,能够帮助大家解决实际问题。
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pktgen lua语法
pktgen lua语法pktgen是一个基于Lua脚本语言的数据包发生器,用于测试网络设备的性能和稳定性。
本文将对pktgen的lua语法进行介绍,帮助读者更好地理解和使用pktgen。
一、pktgen lua脚本的基本结构pktgen的lua脚本由多个函数组成,每个函数实现一个特定的功能。
以下是一个简单的pktgen lua脚本示例:```lua-- 设置端口配置function setPortConfig()pktgen.set(mac("0:0:0:0:0:1"), "all")pktgen.set(mac("0:0:0:0:0:2"), "all")end-- 发送数据包function sendPackets()pktgen.send("0:0", "0:1")pktgen.send("0:1", "0:0")end-- 主函数,调用其他函数function main()setPortConfig()pktgen.start("0:0")pktgen.start("0:1")pktgen.delay(5000)sendPackets()pktgen.stop("0:0")pktgen.stop("0:1")end-- 调用主函数main()```上述脚本首先定义了三个函数,分别是设置端口配置、发送数据包和主函数。
然后在主函数中依次调用这三个函数,实现了pktgen的基本功能。
二、pktgen lua脚本的常用函数1. pktgen.set(mac, port)该函数用于设置指定端口的MAC地址。
mac参数是一个字符串,表示MAC地址,port参数是一个字符串,表示端口号。
go analysis of up-regulated genes in ko
go analysis of up-regulated genes in ko
在基因表达分析中,对上调基因进行GO(基因本体论)分析是一种常见的手段。
上调基因是指在特定条件下,其表达水平相对于对照或基准条件有所增加的基因。
在GO分析中,首先需要准备目的基因文件,这个文件包含差异表达信息,如果使用工具自带的背景基因文件,那么目的基因文件的基因ID类型需要与背景基因文件一致。
然后,选择“使用文件”按钮上传目的基因和背景基因文件,如果是自己准备的背景基因文件则无此限制,只需目的基因id与背景基因id一致即可。
接下来,选择是否包含log2FC列,这是表示差异倍数取对数后的值。
物种选择也很重要,根据分析需求选择正确的物种。
最后,点击提交按钮,等待分析完成。
此外,GO富集分析的结果通常包括气泡图、条形图、富集圈图等,这些结果可以帮助理解上调基因在生物学过程中的角色。
对于KEGG 富集分析,其结果还可以在KEGG通路图上体现,比如红色表示上调,
绿色表示下调。
总之,通过GO和KEGG富集分析,可以对上调基因进行深入的功能和通路分析,从而更好地理解基因表达变化的生物学意义。
pktgen dpdk 用法
文章标题:深入探讨pktgen dpdk的用法及实践在本文中,我将深入探讨pktgen dpdk的用法和实践,希望通过全面的评估和深入的讨论,让您更深入地理解这一主题。
一、pktgen dpdk的概念pktgen dpdk是一种用于数据包生成和网络性能测试的工具,它基于DPDK(Data Plane Development Kit)框架,能够实现高性能的数据包处理和流量生成。
pktgen dpdk可以用于测试网络设备、协议栈、硬件设备等,是网络性能测试中常用的工具之一。
二、pktgen dpdk的基本用法1. 下载和安装DPDK库和pktgen dpdk工具要使用pktgen dpdk,首先需要下载并安装DPDK库和pktgen dpdk工具。
可以在DPDK全球信息湾上找到最新的安装指南和下载信息,并按照指南进行安装。
2. 配置和编译pktgen dpdk工具在安装完成DPDK库之后,需要对pktgen dpdk进行配置和编译。
根据官方文档提供的配置指南,进行相关的配置和编译操作。
3. 启动pktgen dpdk工具配置完成后,可以启动pktgen dpdk工具,并开始进行数据包生成和网络性能测试。
在启动过程中,需要指定生成的数据包类型、数量、速率等参数。
4. 实际操作演示接下来,我将通过一个简单的实际操作演示,来展示pktgen dpdk工具的基本用法。
我将展示如何启动pktgen dpdk工具,并设置数据包生成的相关参数。
我将进行网络性能测试,并展示测试结果。
三、pktgen dpdk的深入应用除了基本的用法之外,pktgen dpdk还有许多深入的应用,比如:1. 多队列测试:pktgen dpdk可以进行多队列测试,测试网络设备在多队列情况下的性能表现。
2. 高级配置:pktgen dpdk支持丰富的高级配置选项,比如设置不同的报文模式、添加报文头部信息、指定不同的报文生成规则等。
3. 抓包功能:pktgen dpdk还支持抓包和分析功能,可以对生成和接收的数据包进行抓包并进行深入的分析。
pktgen 使用方法
pktgen 使用方法pktgen 是一个用于生成、修改和分析网络数据包的工具,可以帮助网络管理员和开发者更方便地进行网络协议分析和测试。
本文将介绍 pktgen 的基本使用方法。
下面是本店铺为大家精心编写的3篇《pktgen 使用方法》,供大家借鉴与参考,希望对大家有所帮助。
《pktgen 使用方法》篇1pktgen 是一个功能强大的网络工具,可以用于生成、修改和分析网络数据包。
下面是 pktgen 的基本使用方法:1. 安装 pktgenpktgen 可以在 Linux、Windows 和 macOS 等操作系统上运行。
在 Linux 和 macOS 系统中,可以使用包管理器 (如 apt、yum、brew) 安装 pktgen。
在 Windows 系统中,可以通过下载预编译的二进制文件来安装 pktgen。
2. 生成数据包pktgen 可以生成各种类型的数据包,例如 IP 包、TCP 包、UDP 包等。
可以使用以下命令来生成数据包:```pktgen -i interface -s src_ip -d dst_ip -p protocol_name -c num_packets```其中,`-i interface` 指定网络接口,`-s src_ip` 和 `-d dst_ip` 分别指定数据包的源 IP 地址和目标 IP 地址,`-p protocol_name` 指定协议类型,`-c num_packets` 指定生成的数据包数量。
例如,要生成 10 个 TCP 数据包,源 IP 地址为 192.168.1.1,目标 IP 地址为 192.168.1.2,可以使用以下命令:```pktgen -i eth0 -s 192.168.1.1 -d 192.168.1.2 -p tcp -c 10 ```3. 修改数据包pktgen 可以修改数据包的内容,例如修改数据包的头部字段、载荷等。
pktgen的安装与使用
pktgen的安装与使用0顶0踩简单的vim 配置| Linux如何在系统启动时自动加载内核模块2011-03-31pktgen的安装与使用Linux。
net脚本CC++pktgen的安装与使用系统环境:fefora core 12 如果你和我一样,在pktgen面前是个新人.是不是也曾遇到下面的问题:(1)以为pktgen和tcpdump一样是Linux下的工具软件;(2)后来,明白了pktgen不是工具,而是内核模块,但是不知道如何加载;(3)加载后,却不会使用,并且一度一位pktgen无法与网络接口eth0建立映射关系;那么,我写下的东西可能对你学习pktgen有所帮助.因为,我也在google上搜了一同,却没有很好的对于pktgen讲解的文档。
A 首先,pktgen是Linux下的一个内核模块,并不是工具软件。
所以,不能通过在命令行输入pktgen的方式运行.那么,我的系统默认pktgen不是自动加载进内核,所以,如果你和我有一样的情况,就需要自己手动添加pktgen入内核. 查看pktgen是否在内核命令:$lsmod | grep pktgen 加载pktgen模块入内核的命令: $ modprobe pktgen 此时,就会不禁想到,加载的模块文件到底在哪。
我的系统位于/lib/modules/内核版本号/kernel/net/core/pktgen.ko B 加载成功后,看看pktgen模块的线程是不是已经运行了(更准确的说,是不是处于sleep状态)。
$ ps aux | grep pktgen 看到如下内容,说明pktgen的线程已经启动了。
线程个数与cpu核数相关,本机cpu双核,所以两个线程。
root 2061 0.0 0.0 0 0 ?S<;Mar30 0:28 [kpktgend_0]root 2062 0。
0 0.0 0 0 ? S&lt;Mar30 0:00 [kpktgend_1] C 然后,pktgen。
pk参数基线校正方法
pk参数基线校正方法全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:PK参数基线校正方法是药物临床研究领域中常用的一种技术,它用于对药物代谢动力学、药效学等参数进行准确的测定和分析。
在药物研发过程中,PK参数是评估药物的有效性和安全性的重要指标之一。
通过对药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄等过程进行分析,可以获取到药物的血药浓度和药效动力学参数,从而为临床用药提供科学依据。
PK参数基线校正方法是一种通过对实验数据进行处理和分析,消除或减少干扰因素的技术手段。
在进行PK参数测定时,常常会受到外界因素的影响,如药物生物利用度、血浆蛋白结合率、代谢酶活性等。
这些因素会导致数据的不稳定性和不准确性,影响最终结果的可靠性。
通过基线校正方法,可以减少这些干扰因素的影响,提高数据的准确性和可信度。
常见的PK参数基线校正方法包括内标法、比值法、回归法等。
内标法是通过在样品中添加已知浓度的内标物质,来对实验数据进行校正。
内标物质与待测物质性质相似,通过内标法可以在不同实验条件下准确测定出待测物质的浓度。
比值法则是通过对内外标样品进行测定,计算内外标的浓度比值,然后将待测样品的浓度按比例进行调整,以消除干扰因素。
回归法则是通过对实验数据进行回归分析,建立药物浓度和时间的数学模型,对测定结果进行修正。
在进行PK参数测定时,选择合适的基线校正方法是十分重要的。
不同的药物、不同的实验条件可能需要采用不同的校正方法。
校正方法的选择还需考虑数据处理的精确性和效率,以及实验设备的限制和要求。
在进行PK参数基线校正时,需要综合考虑实验条件、样品性质以及数据分析的要求,选择最适合的方法进行校正处理。
除了技术手段上的基线校正方法外,数据质量的控制也是PK参数测定中的关键环节。
在进行实验前,需要对实验条件、仪器设备进行严格的质量控制。
在实验过程中,需要严格按照操作规程进行操作,减少实验误差和干扰。
在数据处理时,需要仔细分析数据的准确性和可靠性,对异常数据进行排除和修正。
pktgen使用文档
使用pktgen测试GWN7000包转发率思博伦通信Smartbits测试设备,做为专业的发包仪器非常不错,但唯一的缺点就是太贵.还好Linux为我们提供了一个先进的发包pktgen,这个工具以内核模块的形式存在,理论上性能应该比同等运行在应用层的工具性能要好,而且还是所谓的多核支持.1.1 测试Swich模式下的LAN口间的包转发率测试环境:测试步骤如下:步骤1),首先加载pktgen.在Linux PC上运行modprobe pktgen 命令.加载成功后, 会有对应的/proc/net/pktgen接口,pktgen是每一个cpu绑定一个内核线程,如果PC机有4个cpu,所以这里可以看到4个kpktgend_*文件(假设PC机是4核的):假如PC机一共有3个网口,拿其中的2个网口(eth1/eth2)用于pktgen测试.可以先使用ethtool工具查看eth1/eth2网口的速率.如果网口速率没有协商成1000M, 也可以使用如下命令进行修改.ethtool -s eth1 autoneg off speed 1000 duplex fullethtool -s eth2 autoneg off speed 1000 duplex full步骤2 ) 查看两个网口的中断号,并把eth1/eth2做亲和性绑定到特定的cpu.注意:先关闭系统的irqbalance服务步骤3)在PC机上运行pktgen测试脚本:脚本1:2个网口(eth1/eth2))双向对发脚本. (即GWN7000的LAN1和LAN5之间双向对发数据测试)脚本2:2个网口之间单向发送测试脚本.(即GWN7000的LAN1向LAN5发数据测试)步骤4) 执行pktgen测试脚本的同时,查看发/收数据.另开一个终端,执行mpstat命令查看cpu占用率,看网卡中断的处理是否正常:1.2 测试Nat模式下的包转发率测试1: LAN->WAN发包即PC机上的eth2口通过GWN7000的LAN1口向接在eth2口发包.步骤1) 运行modprobe pktgen 命令,加载pktgen模块. 具体方法见链接. 步骤2) 并把eth1/eth2做亲和性绑定到特定的cpu. 具体方法见链接.步骤3) 在linux PC上执行脚本:步骤4) 测试脚本的同时查看发送包数.具体方法见链接.测试2: WAN->LAN 发包即PC 机上的eth1口通过wan 口向接在LAN1口下的eth2口发包.测试步骤:步骤0) PC(Linux)上,将eth1的网口设置成静态IP 172.16.1.54, 将网关设置成GWN7000 wan 口的IP 172.16.1.84.步骤1)在GWN7000上,设置端口转发, 将wan 口上所有收到的包都转发到内网IP 192.168.1.166.步骤2) 运行modprobe pktgen 命令,加载pktgen 模块. 具体方法见链接.步骤3) 并把eth1/eth2做亲和性绑定到特定的cpu. 具体方法见链接.步骤4) 在linux PC上执行脚本:步骤4) 测试脚本的同时查看发送包数.具体方法见链接.发包测试3: WAN<->LAN步骤1)在GWN7000上,设置端口转发, 将wan口上所有收到的包都转发到内网IP 192.168.1.166.步骤2) 运行modprobe pktgen 命令,加载pktgen模块. 具体方法见链接.步骤3) 并把eth1/eth2做亲和性绑定到特定的cpu. 具体方法见链接.步骤4) 在linux PC上执行如下脚本:步骤4) 测试脚本的同时查看发送包数.具体方法见链接.1.3pktgen使用说明1)如果要修改pktgen发包的数量,即每秒发多少包, 可以修改参数delay.例如: 设置delay 1000, 表示每隔1000000ms发一个包. 这样1s就可以发1000000个包(100万个包) (即1除以10的-6次方=1Mpps, )例如:root@test-PC:/proc/net/pktgen# echo "delay 1000"> eth0然后执行 echo "start"> pgctrl 就可以开启运行.root@test-PC:/proc/net/pktgen# echo "start"> pgctrl2)如果要控制总的发包数量, 可以设置count参数.echo "count 8000000"> eth0 , 表示测试中发800万个包后,脚本就结束.echo "start"> pgctrl3)也可以用多台PC机发包,一台PC机收包.使用的测试脚本根据实际情况进行修改即可.1.3 pktgen所有命令解释如下。
pktgen 原理
pktgen 原理pktgen是一种网络数据包生成工具,它的原理是通过模拟网络流量来测试网络设备的性能和稳定性。
pktgen可以生成各种类型的数据包,并以不同的速率发送到目标设备,以模拟真实的网络负载。
pktgen的工作原理非常简单。
首先,用户需要配置pktgen的参数,包括目标设备的IP地址、发送速率、数据包大小等。
然后,pktgen会根据这些参数生成相应的数据包,并通过网络接口发送出去。
目标设备接收到这些数据包后,会进行相应的处理,并返回响应数据包。
pktgen可以通过统计响应数据包的数量和延迟时间等指标,来评估目标设备的性能。
pktgen的应用非常广泛。
它可以用于网络设备的性能测试,例如路由器、交换机等。
通过发送大量的数据包,可以测试设备在高负载情况下的性能表现。
此外,pktgen还可以用于网络安全测试。
通过发送特定类型的数据包,可以模拟各种网络攻击,以测试目标设备的安全性能。
在使用pktgen时,需要注意一些问题。
首先,要确保目标设备能够处理pktgen发送的数据包。
如果目标设备的处理能力有限,可能会导致数据包丢失或延迟增加。
其次,要根据实际需求配置pktgen的参数。
发送速率过高可能会对网络造成负载过大的影响,而发送速率过低可能无法准确评估设备的性能。
此外,还需要注意数据包的大小和类型。
不同的设备对不同类型的数据包可能有不同的处理方式,因此需要根据实际情况选择合适的数据包类型。
pktgen是一种非常实用的网络测试工具,可以帮助用户评估网络设备的性能和稳定性。
通过模拟真实的网络流量,可以更准确地了解设备的工作情况,并进行相应的优化和改进。
在使用pktgen时,需要注意配置合适的参数,并根据实际需求进行测试。
只有这样,才能得到准确可靠的测试结果,为网络设备的优化和改进提供有力的支持。
细胞产品_pk检测内容__概述说明以及解释
细胞产品pk检测内容概述说明以及解释1. 引言1.1 概述细胞产品PK检测是对细胞产品在体内的药代动力学进行评估和监测的重要手段。
随着细胞治疗和基因治疗等技术的快速发展,细胞产品作为一种新型治疗方法受到了广泛关注。
然而,为了确保细胞产品能够达到预期效果并且安全有效地应用于临床实践中,对其在体内的分布、代谢和排泄等药代动力学特性进行评价是必不可少的。
因此,细胞产品PK检测成为了研究人员关注的焦点。
1.2 文章结构本文将围绕细胞产品PK检测展开详细介绍和讨论。
首先,我们将概述细胞产品PK检测的重要性,阐明其在临床实践和科研领域中的作用和意义。
接着,我们将简要介绍PK检测方法,并针对不同类型的细胞产品列举常用的检测方法,并讨论其优缺点及适用范围。
此外,我们还将解释与分析PK检测结果所涉及到的关键指标和参数,以及如何根据这些结果评估细胞产品的药代动力学特性。
随后,我们将探讨细胞产品PK检测在医药领域、生物技术领域和研究领域中的应用,并举例说明其具体应用场景。
最后,我们将探讨细胞产品PK检测过程中所面临的挑战和解决方案,包括样本处理和预处理技术、方法验证和标准化问题以及数据分析和报告编制困难等方面。
1.3 目的本文旨在全面介绍细胞产品PK检测内容,并阐明其在临床实践和研究领域中的应用价值。
通过深入剖析PK检测方法、结果解释与分析以及应用领域,希望能够提高读者对于细胞产品PK检测的理解,并为相关研究工作提供指导和参考。
另外,通过分享在样本处理、方法验证以及数据分析等方面的挑战和解决方案,有助于推动该领域内问题的解决和进一步发展。
最后,结合对当前研究现状的总结与分析,在文章结论部分对未来细胞产品PK检测的研究方向进行展望,并给出个人的思考和观点,以期推动该领域的持续进步。
2. 细胞产品PK检测内容2.1 PK检测的重要性细胞产品的药代动力学(pharmacokinetics,简称PK)检测是评估细胞治疗产品在体内吸收、分布、代谢和排泄的关键过程。
pktgen使用说明(转发)
pktgen使⽤说明(转发)编译安装Build DPDK1. 设置运⾏时环境# sudo apt-get install libpcap-dev# export RTE_SDK=<installDir>/Pktgen-DPDK/dpdk# export RTE_TARGET=x86_64-pktgen-linuxapp-gcc2. 编译安装# cd $RTE_SDK# ./tools/setup.sh选择安装x86_64-pktgen-linuxapp-gcc,然后配置hugepagemappings for non-NUMA systems。
安装成功后在dpdk⽬录下会出现x86_64-pktgen-linuxapp-gcc⽂件夹。
Build pktgen1. 编译安装构建pktgen时确保RTE_SDK、RTE_TARGET两个环境变量的值(同dpdk配置)存在有效。
# cd examples/pktgen# make2. 配置脚本在pktgen⽬录下,setup.sh和doit.sh两个脚本⽂件需要根据⾃⾝系统来配置。
# lspci | grep Ethernet //查看以太⽹端⼝信息# name=`uname -n` //获取主机名setup.sh脚本主要⽤来a.检查环境变量和hugepages的设置; b.加载uio、igb_uio和rte_kni三个模块;c.绑定绑定⽹卡。
在环境变量设置正确的情况下b会正确执⾏。
需要⼿动配置的是c,绑定⽹卡。
如node3上的配置:name=`uname -n`if [ $name == "node3" ]; then$sdk/tools/dpdk_nic_bind.py -b igb_uio 01:00.0 06:00.0fidoit.sh脚本是设置pktgen运⾏参数并启动name=`uname -n`if [ $name == "node3" ]; then./app/build/pktgen -c f -n 3 --proc-type auto --socket-mem 256,256 --file-prefix pg -b 0000:00:19.0 -- -T -P -m "[1:3].0, [2:4].1" -ftest/set_seq.luafi注:-c 是指选择的core的掩码,f等于1111也就是选择 1 、 2 、3 core;--proc-type 选择的auto ,如果是当前系统第⼀执⾏的dpdk相关的程序,选择primary模式,如果是第⼆是secondary 模式;--file-prefix pg 设置/mnt/huge/内存分配模块的⽂件名前缀;-p 0x14 0x14等于 00010100 , 选择你当前系统的其中2块intel相关⽹卡端⼝;-P 使能⽹络混装模式,-m "2.0, 3.1" 是指⼀个矩阵模型,2.0是指,在2号lcore上绑定的端⼝0 , 3.1是指在lcore3上绑定端⼝1-f test/set_seq.lua 导⼊pktgen的执⾏配置⽂件;在执⾏pktgen时,利⽤配置产⽣数据包;测试举例+-----------+ +-----------+|node0 | | node3 || eth1 +--------+ eth2 || | | || | | |+-----------+ +-----------+Eth1与Eth2⽹线直连,node0和node3编译安装dpdk和pktgen。
阶段小结2016
3. 肝脏是合成胆固醇的主要场所,还能合成TG, 合成的内源性的TG和Ch以VLDL和LDL的形 式在血液中运输至肝外组织供能(LPL)、应 用;
肝脏和肌肉代谢的特点及联系
4. 联合脱氨基作用的方式不同: 肝肾脑--转氨作用与氧化脱氨基作用的联合 肌---嘌呤核苷酸循环脱氨基作用
肌细胞中缺乏葡萄糖-6-磷酸酶,不能使肌糖原分解为葡 萄糖而补充血糖,其分解产物是乳酸或彻底氧化为CO2和 H2O,只供肌利用。
(4)合成过程受不同激素调节: 在糖原分解代谢时肝主要受胰高血糖素的调节,而肌肉 主要受肾上腺素调节。 肌肉内糖原合酶及磷酸化酶的变构效应物主要为AMP、 ATP及6-磷酸葡萄糖。
阶段复习
1. 谷胱甘肽(GSH)的作用
1. 还原H2O2,使其变为水; 2. 保护体内蛋白质或酶分子中巯基免遭氧化; 3. 可与外源的嗜电子毒物结合,使机体免遭损害; 4. GSH在AA吸收中的作用(γ-谷氨酰基循环);
2. NADPH的来源及作用
来源:
1. 主要来自磷酸戊糖途径; 2. 胞液中异柠檬酸脱氢酶及苹果酸酶催化
代谢去路: 1.缩合成酮体 2.转变生成脂酸和胆固醇 3.经三羧酸循环彻底氧化分解 4. 合成神经递质乙酰胆碱(少数) 5. 合成乙酰谷氨酸(+氨基甲酰磷酸合成酶Ⅰ,少数)
提示:6-磷酸葡萄糖 丙酮酸 草酰乙酸 谷氨酸 ……
.
5. 肝脏和肌肉代谢的特点及联系
1 乳 酸 循 环
肝脏和肌肉代谢的特点及联系
12.蛋白质结构与功能的关系
1. 蛋白质一级结构与功能的关系 进化树,分子病
2.蛋白质空间结构与功能的关系 肌红蛋白与血红蛋白的氧解离曲线,血 红蛋白运氧的协同效应及机制
实验室比对 t检验法的详细步骤
实验室比对 t检验法的详细步骤
宝子,今天来给你唠唠实验室比对t检验法的步骤哈。
t检验法呢,是用来比较两组数据平均值是否有显著差异的方法。
第一步呀,咱得先把两组要比对的数据收集好。
这就好比你要比较两个小朋友的身高,得先知道他俩各自的身高数据一样。
这两组数据可不能是随随便便弄来的,得是按照正确的实验方法得到的哦。
然后呢,计算两组数据的平均值。
这个平均值就像是这组数据的代表啦。
比如说一组数据是1、2、3、4、5,那平均值就是把这些数加起来除以个数,也就是(1 + 2 + 3 + 4 + 5)÷5 = 3。
两组数据都要算出平均值哟。
接着呢,计算两组数据的标准差。
标准差这个东西有点像在描述这组数据有多“散”。
如果数据都挨得很近,标准差就小;要是数据很分散,标准差就大。
计算标准差有专门的公式,这里就不细说了,反正你可以用计算器或者软件来算啦。
再之后呀,就可以计算t值啦。
t值的计算公式有点复杂,不过别怕,就是用两组数据平均值的差,除以一个和两组数据的标准差还有样本数量有关的式子。
这一步就像是把两组数据的差异用一个数值表示出来。
算出t值后呢,咱得看看这个t值有没有意义呀。
这就需要查t分布表啦。
这个表就像是一个大字典,你根据你的自由度(自由度和样本数量有关哦)去找对应的临界值。
如果算出来的t值比临界值大或者小(看你是做单侧检验还是双侧检验啦),那就说明两组数据的平均值有显著差异;要是t值在临界值范围内呢,就说明两组数据平均值差异不显著。
宝子,实验室比对t检验法大概就是这么个流程啦,是不是还挺有趣的呢? 。
【免疫学总结】补休系统
【免疫学总结】补休系统补体系统第一节补体概述补体系统包括30余种成分,广泛存在于血清、组织液、细胞膜表面,是一个具有精密调控机制的蛋白质反应系统。
血浆中补体成分在被激活前无生物学活性㈠补体系统的组成1.补体固有成分2.补体调节蛋白3.补体受体㈡补体的命名经典、终末途径按其发现顺序命名;旁路途经成分分别称为BPHID因子有酶活性的补体分子,均在其上以横线表示;裂解片段后缀以英文小写字母㈢补体的生物合成90%血浆补体成分由肝脏组成第二节补体激活一、经典途径1. 参与成分包括C1(C1q、C1r、C1s)、C4、C2、C3。
2. 激活物激活物为AgAb免疫复合物(IC),Ab为IgM 、IgG1、IgG2或IgG3。
每个C1须同时与两个以上Ig 分子的Fc 段结合。
3. 活化过程(1)抗原抗体结合后,抗体构型改变,暴露Fc 段中补体结合部位,C1q 可主动识别其补体结合位点,启动经典途径。
当一分子C1q 中两个以上的球形头部与免疫复合物(IC)中IgM 或IgG Fc 段结合后,C1q的构象发生改变,C1r 活化,并激活C1s 的丝氨酸蛋白酶活性;(2)C1s 依次裂解C4、C2,产生C4b+C4a 和C2a +C2b,C2a与C4b 结合成C4b2a 复合物(C3转化酶);(3)C3转化酶将C3裂解成C3b+C3a ,C3b 与C4b2a 结合形成C4b2a3b复合物(C5转化酶)。
二、旁路途径1. 参与成分C3、B因子、D因子和P因子。
2. 激活物某些细菌、内毒素、酵母多糖等以及凝集的IgA和IgG4等,上述物质实际上是为补体激活提供保护性环境和接触表面。
3. 活化过程各种因素产生的C3b结合于激活物表面,再与B因子结合产生C3bB,在D因子作用下产生C3bBb(旁路C3转化酶)。
C3bBb与多份C3b结合形成C3bBb3b(旁路C5转化酶),后者裂解C5,引起共同的末端效应。
旁路途径可以识别自己与非己,具有放大效应。
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pktgen使用文档使用pktgen测试GWN7000包转发率思博伦通信Smartbits测试设备,做为专业的发包仪器非常不错,但唯一的缺点就是太贵.还好Linux为我们提供了一个先进的发包pktgen,这个工具以内核模块的形式存在,理论上性能应该比同等运行在应用层的工具性能要好,而且还是所谓的多核支持.1.1 测试Swich模式下的LAN口间的包转发率测试环境:测试步骤如下:步骤1),首先加载pktgen.在Linux PC上运行modprobe pktgen 命令.加载成功后, 会有对应的/proc/net/pktgen接口,pktgen是每一个cpu绑定一个内核线程,如果PC机有4个cpu,所以这里可以看到4个kpktgend_*文件(假设PC机是4核的): 1 2 3 4 5 6 7 8 9 [root@localhost ~]#modprobe pktgen [root@localhost ~]# cat /proc/cpuinfo | grep processor processor : 0 processor : 1 processor : 2 processor : 3 [root@localhost ~]#ls /proc/net/pktgen/ kpktgend_0 kpktgend_1 kpktgend_2 kpktgend_3 pgctrl 假如PC机一共有3个网口,拿其中的2个网口(eth1/eth2)用于pktgen测试. 可以先使用ethtool工具查看eth1/eth2网口的速率.如果网口速率没有协商成1000M, 也可以使用如下命令进行修改. ethtool -s eth1 autoneg off speed 1000 duplex full ethtool -s eth2 autoneg off speed 1000 duplex full1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 [root@localhostpktgen]#ifconfig eth1 eth5 Link encap:Ethernet HWaddr 00:0C:29:97:9B:B4 inet addr:192.168.1.95 Bcast:192.168.1.255 Mask:255.255.255.0 inet6 addr:fe80::20c:29ff:fe97:9bb4/64 Scope:Link UP BROADCAST RUNNING MULTICAST MTU:1500 Metric:1 RX packets:15044140 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0 TXpackets:14210498 errors:0 dropped:0 overruns:0 carrier:0 collisions:0 txqueuelen:1000 RX bytes:903846363 (861.9 MiB) TX bytes:852636332 (813.1 MiB) [root@localhost pktgen]# ifconfig eth2 eth6 Link encap:Ethernet HWaddr00:0C:29:97:9B:BE inet addr:192.168.1.96 Bcast:192.168.1.255Mask:255.255.255.0 inet6 addr: fe80::20c:29ff:fe97:9bbe/64 Scope:Link UP BROADCAST RUNNING MULTICAST MTU:1500 Metric:1 RX packets:14256340 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0 TX packets:14998657 errors:0 dropped:0 overruns:0 carrier:0 collisions:0 txqueuelen:1000 RX bytes:856589260 (816.9 MiB) TX bytes:899925597 (858.2 MiB) [root@localhost pktgen]# ethtool -s eth1 autoneg off speed 1000 duplex full [root@localhost pktgen]# ethtool -s eth2 autonegoff speed 1000 duplex full [root@localhost pktgen]# ethtool eth1 Settings foreth5: Supported ports: [ TP ] Supported link modes: 10baseT/Half10baseT/Full 100baseT/Half 100baseT/Full 1000baseT/Full Supports auto-negotiation: Yes Advertised link modes: 1000baseT/Full Advertised pause frame use: No Advertised auto-negotiation: Yes Speed: 1000Mb/s Duplex: Full Port: Twisted Pair PHYAD: 0 Transceiver: internal Auto-negotiation: on MDI-X: Unknown Supports Wake-on: d Wake-on: d Current message level: 0x00000007 (7) Link detected: yes 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 [root@localhost pktgen]# ethtool eth2 Settings foreth6: Supported ports: [ TP ] Supported link modes: 10baseT/Half 10baseT/Full 100baseT/Half100baseT/Full 1000baseT/Full Supports auto-negotiation: Yes Advertised link modes: 1000baseT/Full Advertised pause frame use: No Advertised auto-negotiation: Yes Speed: 1000Mb/s Duplex: Full Port: Twisted Pair PHYAD: 0 Transceiver: internal Auto-negotiation: on MDI-X: Unknown Supports Wake-on: d Wake-on: d Current message level: 0x00000007 (7) Link detected: yes[root@localhost pktgen]# 步骤2 ) 查看两个网口的中断号,并把eth1/eth2做亲和性绑定到特定的cpu.注意:先关闭系统的irqbalance服务[root@localhost ~]# cat /proc/interrupts | grep eth 16: 2586 540 1351588 4172554 IO-APIC-fasteoi Ensoniq AudioPCI, eth1 19: 5117 1949714 6098060 40 IO-APIC-fasteoi eth4, eth2 #说明:16和19 表示的是eth1和eth2的中断号[root@localhost ~]# /etc/init.d/irqbalance stop Stopping irqbalance: [ OK ] #使用上面的命令停止irqbalance服务后,下面的语句就是绑定特定的cpu了: 注意: cpu的值对应关系如下: Binary Hex CPU 0 00000001 1 CPU 1 00000010 2 CPU 2 00000100 4 CPU 3 00001000 8 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 例如:如果我想把 IRQ 绑定到 CPU2 上就是 00000100=4: [root@localhost ~]# echo 4 > /proc/irq/19/smp_affinity [root@localhost ~]# echo 8 > /proc/irq/16/smp_affinity [root@localhost ~]# cat /proc/irq/19/smp_affinity 04 [root@localhost ~]# cat /proc/irq/16/smp_affinity 08步骤3)在PC机上运行pktgen测试脚本:脚本1:2个网口(eth1/eth2))双向对发脚本. (即GWN7000的LAN1和LAN5之间双向对发数据测试) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 #! /bin/sh # FileName: pktgen-eth1-eth2.conf # modprobe pktgen pgset(){ local result echo $1 > $PGDEV result=`cat $PGDEV | fgrep \ if [ \ cat $PGDEV | fgrep Result: fi } pg() { echo inject > $PGDEV cat $PGDEV } # Config Start Here ----------------------------------------------------------- # thread config # Each CPU has own thread. Two CPU exammple. We add eth1, eth2 respectivly. 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53PGDEV=/proc/net/pktgen/kpktgend_2 echo \ pgset \ echo \ pgset \PGDEV=/proc/net/pktgen/kpktgend_3 echo \ pgset \ echo \ pgset \ # device config # delay 0 means maximum speed. CLONE_SKB=\# NIC adds 4 bytes CRCPKT_SIZE=\ # COUNT 0 means forever #COUNT=\COUNT=\DELAY=\PGDEV=/proc/net/pktgen/eth1 echo \ pgset \ pgset \ pgset \ pgset \ pgset \ pgset \ PGDEV=/proc/net/pktgen/eth2 echo \ pgset \ pgset \ pgset \ pgset \ pgset \ pgset \感谢您的阅读,祝您生活愉快。
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目录简介 (1)1.Pktgen能测试什么? (2)2,pktgen不能测试什么? (2)3.为什么要选用pktgen来测这些? (2)4,pktgen怎么运行? (2)5,怎么运行pktgen (4)6,pktgen性能受什么影响? (4)7,pktgen 中断亲和问题 (5)8,clone_skb:限制内存分配 (6)9,pktgen链路搭建测试 (6)10,pktgen线程 (8)11,pktgen配置 (9)12,driver/chip测试建议 (11)13,配置参数列表 (12)简介Pktgen是一个linux里面的高性能的测试工具,是一个内核模块,如果lsmod |greppktgen没有的话,需要modprobepktgen进去,如何还是没有的话那可以下载源码下来,编译它的源码,把生成的/path/xx.ko这种内核模块文件insmod /path/xx.ko进入内核,在lsmod |greppktgen就有了(当然,需要有内核开发工具,比如gcc,kernel-devel,kernel-headers之类的才能编译吧,没试过)1.Pktgen能测试什么?设备驱动你的发包过程好坏,网卡NIC发包好坏,运行网络协议栈的路由器或者网桥,等其它网络设备。
Pktgen默认在端口9上发送UDP数据包,可以配置IP,MAC地址等,因此,pktgen 数据包可以被作为内核协议栈的测试。
(pktgen sends UDP packets to port 9 (discardport) by default. IP,MAC addresses, etc. can beconfigured. Pktgen packets can hence be identifiedwithin the kernel network stack for profilingand testing.)Pktgen产生的数据包流可以用作其他网络设备的输入,pktgen也可以反映其他子系统,比如内存分配系统和IO总线系统的能力。
The author has donetests sending packets from memory to severalGIGE interfaces on different PCI-buses usingseveral CPU’s. Aggregate Rates > 10 GBit/shave been seen.2,pktgen不能测试什么?Most importantly,pktgen cannot do any TCP testing不能做tcp测试。
3.为什么要选用pktgen来测这些?pktgen is currentlythe best tool to test the TX process of devicedriver and NIC. pktgen can also be used to generateordinary packets to test other network devices. Especially of interest is the use of pktgento test routers or bridges which often also use the Linux network stack. Because pktgen is“in-kernel,” it can generate high bandwith andvery high packet rates to load routers, bridges,or other network devices 因为它在内核里面运行,可以产生高带宽和急速生成数据包的速度。
4,pktgen怎么运行?运行的时候,pktgen创建一个内核线程并且把这个线程绑定那个创建线程的cpu 上(Once running,pktgen creates a kernel thread and bindsthread to that CPU),多个cpu就会生成多个线程,可以绑定一个设备到其中一个线程,这将是这个cpu 完全控制这个设备(This to givefull control of the device to CPU relationship)。
现代的平台允许中断被分配到一个cpu上(又名IRQ亲和),这对于最小化cache-line 反弹很重要(为什么重要?)。
每个cpu运行一个pktgen线程,这个线程可以drive一个或者多个NICs(NIC:network interface card),pktgen是一个伪驱动pseudo driver,可以提供独特的性能和功能特性。
Pktgen不是一个集所有功能与一身的测试工具,它提供了一个非常有效的直接与host system NIC driver/chip Tx-process (发送进程)和绕过绝大部分的Linux network stack(网络协议栈)。
在我的一个8核服务器中,看到8个pktgen线程在我的一个32核服务器中,我看到了32个pktgen线程Pktgen由/proc文件系统控制和监视。
为了配置参数的方便,推荐使用shell scripts 建立配置和运行测试。
在pktgen运行的时候,我的8核服务器中:我的32核服务器中:可以发现都有kpktgend_x的,最后都还有一个pgctrl看看这些文件里面有什么Eth3,eth4是我做过的两个测试接口,所以kpktgend_0,kpktgend_1中才有内容,刚开始内容都和kpktgend_2中的内容一样。
Pgctrl里面是pktgen的版本,分配设备(如eth1,eth2等)到kpktgend_x线程中,这些实例将在/proc/net/pktgen下面看到如上图中的eth3,eth4就是创建的在设备这一级可以对这些文件进行深入配置。
看看这些文件里面是些神马这个eth4我测试完了,是我在脚本里的配置,是运行状态,是运行结果,结果显示64byte的包,每秒可发送202万多个。
测试可以配置成为永久运行,或者配置成为发送完指定数目的包后就结束,Ctrl+C可以终止测试。
5,怎么运行pktgenEnable CONFIG_NET_PKTGEN in the .config,compile and build pktgen.o either in-kernel oras module, insmodpktgen if needed.在.config文件里是CONFIG_NET_PKTGEN=y,在内核里编译pktgen.o或者把它编译为模块,然后insmod进去。
可参考“简介”中的介绍。
6,pktgen性能受什么影响?性能随着硬件的不同,测试类别的不同而不同(硬件不同好理解,测试的类别不同应该说的是比如说什么包大小不同之类的,所以结果pps就不同)。
还有一些其他因素影响测试性能:PCI总线速度,如pc,pci-x,pci-pci bridge,CPU speed,memory latency,DMA latency,number of MMIO reads/writes per package or per interrupt,etc(对于网卡测试,故感觉在相同的服务器,相同的系统上,相同的驱动上测试不同的网卡,即可对比网卡性能)一般来说,最好使用一样的cpu,那样产生的包将使产生的中断很对称(CPU:NIC is 1:1)Generally, we want the same CPU that generatesthe packets to also take the interrupts givena symmetrical configuration (CPU:NIC is 1:1).在一个Xeon 2.67GHz cpu中,使用一个打过补丁后的e1000驱动,每个包64 byte,这种情况下一个单流可达到1.48Mpps(即148万package per second了),据报告在BCM5703,使用tg3驱动,可以达到更高的性能。
7,pktgen中断亲和问题当添加一个设备到指定的pktgen线程里面时,应该设置/proc/irq/X/smp_affinity来绑定NIC到这个相同的cpu上(这个相同应该是指与创建pktgen线程的cpu相同),这将减少cache line在一些情况下的反弹问题:when freeing skb’s and in the NICdriver.这个clone_skb参数将在一些情况下减轻cache line的反弹影响(由于skb’s没有完全释放),我们这么做就是为了测出它的最好的性能。
(The clone_skbparameter can insome cases mitigate the effect of cache linebouncing as skb’s are not fully freed. One mustexperiment a bit to achievemaximum performance.)中断分给了哪些NICs可以在/proc/interrupts中查看,在下面的例子中,eth0使用irq 26,eth1使用irq 27下面的例子将eth0,eth1绑定到cpu0,将eth2,eth3绑定到cpu1echo 1 > /proc/irq/26/smp_affinityecho 1 > /proc/irq/27/smp_affinityecho 2 > /proc/irq/28/smp_affinityecho 2 > /proc/irq/29/smp_affinity性能差别:8,clone_skb:限制内存分配这个参数很重要。
clone_skb:sets the number of copies of the same packetclone_skb =0:use single SKB for all transmitspktgen uses a trick to increment the skb’srefcntto avoid full path of kfree and alloc when sending identical skb’s. This generally gives veryhigh sending rates. For Denial of Service (DoS)and flow tests this technique can not be used aseachskb has to be modified应该是说pktgen使用了一种特殊分配内存的方式,在发送同样的skb数据包时候避免了全路径重新的kfree和alloc,这样讲导致很高的发包速率。