肺癌癌症精准用药基因检测共22页文档
肺癌基因检测PPT课件
指南建议
所有肺腺癌患者不论性别、种族、是否吸 烟 或伴其他临床危险因素，均应接受基因检测， 其中EGFR突变和ALK 融合是首选检测项目
原发肿瘤和转移病变同样适合检测EGFR 和 ALK 状态
指南建议
EGFR 和ALK 检测不适用于非腺癌肺癌患者， 包括单纯鳞状细胞癌、单纯小细胞癌和免疫组 织化学检测缺乏腺癌分化证据的大细胞肺癌患 者
T790M次级染色体突变检测
是一种人类表皮生长因子受体（ＥＧＦＲ）基因外显子２０的Ｔ ７９０Ｍ突变快速检测方法
根据人类染色体７ｐ１２ＥＧＦＲ基因外显子２０的ＤＮＡ序列 设计一对引物，采用聚合酶链式反应（ＰＣＲ）技术特异性扩增 包含Ｔ７９０Ｍ（２３６９Ｃ＞Ｔ）突变位点的一段ＤＮＡ序列， 应用一对分子荧光探针与扩增产物杂交，通过荧光ＰＣＲ仪实时 检测反应管特征性的相应荧光强度变化，或ＰＣＲ后通过荧光分 光光度仪直接测量反应管的特异性荧光强度，检测标本是否存在 Ｔ７９０Ｍ突变
最新肺癌分子诊断指南
郑大二附院肿瘤科 巩天晓
肺癌分子学检测指南
美国病理学会(CAP)、国际肺癌研究学会 (IASLC)和美国分子病理学学会(AMP)三大权 威学术机构发布
建议所有肺腺癌患者接受基因检测，以便选择 靶向治疗药物
EGFR抑制剂（如厄洛替尼和吉非替尼）和 ALK酪氨酸激酶抑制剂（例如克里唑蒂尼）
EGFR 和ALK 状态检测时机为：适合治疗的 晚期肺癌患者确诊时；既往肺癌分期较早但未 接受基因检测的患者疾病复发或进展时
Байду номын сангаас
指南相关内容
检测对原发性和转移性癌症都同样适用
检测结果应该在10天内可以拿到，如果检验科 不能达到这个时间线，则需要做出必要的改变 来保证此标准
肺癌靶向治疗的基因检测PPT课件
23%
22% 10% 3%-21% 8%-20% 6% 5%
非常罕见
1% 2% 3%-21% 8%-20% 21% 非常罕见
肺鳞癌与腺癌基因异常发生对比
基因异常 基因定位 鳞癌 腺癌
DDR2突变 Her2过表达 PI3KCA突变 BRAF突变 EGFR突变 AKT1突变 MET突变 Her2突变 EML4-ALK突变
1q23.3 17q11.2-q12, 17q21 3q26.3 7p34 7p12 14q32.32 7q31.1 17q11.2-q12, 17q21 2p21， 2p23
4% 3%-5% 3% 2% <5% 1% 1% 1% 1%
1% 5%-9% 3% 1-3% 10%-15% 非常罕见 2% 2% 2-7%
NSCLC单一突变驱动基因的发生率
肺鳞癌与腺癌基因异常发生率对比
基因异常 基因定位 鳞癌 腺癌
P53 PI3KCA扩增
17p13.1 3q26.3
51% 33%
36% 6%
SOX2扩增
FGFR1扩增 PTEN突变 MET扩增 PTEN缺失 KRAS突变 EGFR v Ⅲ突变
3q26.3- q27
可见SOX2扩增
Cancer Discovery.2011
小细胞肺癌的靶向治疗
信号转导抑制剂 血管生成 Bcl-2反义核苷酸
间变性淋巴瘤激酶 基因融合 最常见的ALK基因重拍的融合为棘皮动物微管 相关蛋白4 EML4-ALK 3～7% 的非小细胞肺癌患者有EML4-ALK 的 基因融合 主要见于腺癌 (与EGFR突变相互排斥)
ALK检测方法
靶点基因检测-肺癌-华大基因
精准医疗分子检测项目肺癌肺癌是发病率和死亡率增长最快，对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。
近50年来许多国家都报道肺癌的发病率和死亡率均明显增高，男性肺癌发病率和死亡率均占所有恶性肿瘤的第一位，女性则占第二位。
肺癌根据其病理类型一般分为两大类，即非小细胞肺癌（N S C L C）和小细胞肺癌（S C L C）。
非小细胞肺癌包括鳞状细胞癌、腺癌和大细胞未分化癌。
目前，针对N S C L C的靶向治疗，常用的靶点有：E G F R、A L K、V E G F、P D G F等，涉及到的药物达十余种，而S C L C多位多靶点治疗（V E G F，P D G F，H e r2，K r a s等）。
抗肿瘤药物用药前基因检测的必要性由于化疗药物进入人体后，须经过肝脏代谢、细胞膜转运等机制方能有效到达病变组织，从而杀伤肿瘤细胞。
但由于遗传因素，不同个体对于化疗药物的代谢机制及细胞自我修复机制不同，即便是联合用药在不同个体也有不同的疗效。
而靶向药物治疗，是药物在研发设计时针对肿瘤细胞某些突变的基因进行“识别性的破坏”，理论上只有带这些突变基因的肿瘤细胞才能被杀死。
一种靶向药物一般只针对一种常见的突变基因，但不同肿瘤、不同患者突变基因也不尽相同。
不同个体的遗传背景，对肿瘤治疗药物的反应差异主要表现在疗效和毒副作用上。
针对肺癌的精准医疗分子检测项目即是利用最新的分子生物学研究成果，分析肿瘤治疗药物作用的机理及不同个体的基因背景，从而判断个体对不同药物的疗效和毒副作用，指导临床选择更好的药物和剂量，以达到精准治疗的目的。
分子检测项目小细胞肺癌样本编号说明：1、甲醛固定组织；2、石蜡包埋组织；3、组织切片；4、抗凝血。
检测流程备注：1 肺癌一线治疗方案（NCCN 2015第六版）（1）贝伐单抗+化疗或单纯化疗适用于PS 0-1的晚期或复发性非小细胞肺癌患者。
应给予贝伐单抗直至疾病进展。
（2）建议厄洛替尼作为敏感EGFR突变患者的一线治疗，而不应作为EGFR阴性突变或EGFR 突变状态未知患者的一线治疗。
肺癌基因检测与靶向用药介绍
ALK抑制剂药物及其靶点
ALK抑制剂药物 靶点（适应症）
耐药位点
备注
Crizotinib （克唑替尼）
ALK融合，L1198F
L1196M, G1269A/S, C1156Y/T, G1202R, L1152P/R, 1151 Tins, F1174C/L/V, S1206C/Y, I1171T/N, V1180L, F1245C, G1123S
ALK
crizotinib（克唑替尼）
EML4-ALK融合
ROS1 KRAS
crizotinib（克唑替尼） EGFR TKI 耐药
CD74-ROS1等融合 12、13密码子突变
MET
crizotinib（克唑替尼）
扩增，Exon14跳跃突变
BRAF
HER2 （ERBB2）
vemurafenib（维罗非尼） dabrafenib（达拉菲尼）
进展后二线治疗
Osimertinib ( 奥希替 尼)
T790M
L1196M/G1269A/F1174 Alectinib（阿雷替尼） L等 Ceritinib（色瑞替尼） L1196M/I1171T/C1156
Y等
蓝色药物：CFDA批准上市靶向药物
肺癌靶向治疗思路
EGFR药敏位点与靶向药物 易瑞沙 19 del 特罗凯/凯美纳 L858R 阿法替尼 18突变阿法替尼
10.PIK3CA点突变
研究表明PIK3CA点突变（E545KE、H104R等）可 能与EGFR-TKIs耐药相关。
肺癌基因检测方案
靶基因
EGFR
erlotinib（厄罗替尼） gefitinib（吉非替尼） afatinib（阿法替尼）
靶点基因检测-肺癌-华大基因
精准医疗分子检测项目肺癌肺癌是发病率和死亡率增长最快，对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。
近50年来许多国家都报道肺癌的发病率和死亡率均明显增高，男性肺癌发病率和死亡率均占所有恶性肿瘤的第一位，女性则占第二位。
肺癌根据其病理类型一般分为两大类，即非小细胞肺癌（N S C L C）和小细胞肺癌（S C L C）。
非小细胞肺癌包括鳞状细胞癌、腺癌和大细胞未分化癌。
目前，针对N S C L C的靶向治疗，常用的靶点有：E G F R、A L K、V E G F、P D G F等，涉及到的药物达十余种，而S C L C多位多靶点治疗（V E G F，P D G F，H e r2，K r a s等）。
抗肿瘤药物用药前基因检测的必要性由于化疗药物进入人体后，须经过肝脏代谢、细胞膜转运等机制方能有效到达病变组织，从而杀伤肿瘤细胞。
但由于遗传因素，不同个体对于化疗药物的代谢机制及细胞自我修复机制不同，即便是联合用药在不同个体也有不同的疗效。
而靶向药物治疗，是药物在研发设计时针对肿瘤细胞某些突变的基因进行“识别性的破坏”，理论上只有带这些突变基因的肿瘤细胞才能被杀死。
一种靶向药物一般只针对一种常见的突变基因，但不同肿瘤、不同患者突变基因也不尽相同。
不同个体的遗传背景，对肿瘤治疗药物的反应差异主要表现在疗效和毒副作用上。
针对肺癌的精准医疗分子检测项目即是利用最新的分子生物学研究成果，分析肿瘤治疗药物作用的机理及不同个体的基因背景，从而判断个体对不同药物的疗效和毒副作用，指导临床选择更好的药物和剂量，以达到精准治疗的目的。
分子检测项目小细胞肺癌样本编号说明：1、甲醛固定组织；2、石蜡包埋组织；3、组织切片；4、抗凝血。
检测流程备注：1 肺癌一线治疗方案（NCCN 2015第六版）（1）贝伐单抗+化疗或单纯化疗适用于PS 0-1的晚期或复发性非小细胞肺癌患者。
应给予贝伐单抗直至疾病进展。
（2）建议厄洛替尼作为敏感EGFR突变患者的一线治疗，而不应作为EGFR阴性突变或EGFR 突变状态未知患者的一线治疗。
肺癌基因检测
“全程化分子检测”将成为NSCLC精准诊疗的发展趋势
肺腺癌人群
经驱动基因 筛选分类
检测结果 指导用药
动态监测用药 变化
初治分子诊断 耐药分子诊断
组织检测 组织检测
血液检测 血液检测
JSCH-BDD All rights Reserved.
Mitsudomi T, et al. Nav Clin Oncol. 2013 10(4):235-244.
HER2 +T790M突变
4%
MET 扩增
HER2突变8% 3%
未知18%
获 小细胞+MET
得
扩增1%
性 小细胞1%
耐
药 小细胞+T790M
1
突变 2%
T790M突变 60%2
MET扩增+T790M
-1
4
9
14
突变 3%
PFS（月） 一线EGFR-TKI治疗8至14个月后进展，约 2/3 EGFR-TKI耐药患者发生T790M突变
目录
1JSCH-BDD All rights Reserved.
01 肺癌精准治疗 02 EGFR检测在NSCLC的应用 03 检测路径的优化 04 检测质量控制
耐药相关突变
敏感相关突变
JSCH-BDD All rights Reserved.
EGFR
Exon Distribution (%)
18
国内EGFR突变检测技术的应用现状
2015年PQCC（中国）质控项目
2015年EMQN（全球）质控项目
1% 1%
19%
1% 1%
77%
ARMS pcr-荧光探针法 液相芯片 一代测序 pcr-熔解曲线法 荧光pcr-HRM 法
《非小细胞肺癌靶向药物治疗相关基因检测的规范建议》要点
《非小细胞肺癌靶向药物治疗相关基因检测的规范建议》要点一、检测非小细胞肺癌（NSCLC）常见靶向治疗相关基因的意义肺癌是世界范围内发病率及病死率均居于首位的恶性肿瘤，其中NSCLC约占８５％左右。
随着对其分子途径探索的逐步深入和相对应的靶向药物的不断出现，给其中的部分晚期患者带来了新的希望。
由于表皮生长因子受体（EGFR）突变率在亚洲人群晚期肺腺癌患者中的发生率高达50％，且已有多个EGFR酪氨酸激酶抑制剂（TKI）在我国上市并用于临床治疗，已有的“EGFR突变NSCLC治疗之中国共识”和“中国NSCLC患者EGFR基因突变检测专家共识”对于检测和治疗EGFR突变的NSCLC发挥了积极的指导作用。
然而，随着相关研究的逐步深入，人们已经认识到除EGFR外，间变性淋巴瘤激酶（ALK）融合基因和ROS1融合基因也分别各自代表了一类具有特定临床与病理特征的NSCLC分子亚群，从而为肺癌的治疗提供了新的分子靶点。
临床研究表明，以ALK和ROS1基因改变为靶点的新型靶向药物对相应的NSCLC患者疗效显著。
而c-MET、RET和BRAF在NSCLC中的基因改变以及相应的靶向药物的治疗效果等也正在开展积极的研究和评估当中，已有的资料表明，以这些基因改变为靶点的药物同样具有显著的临床疗效。
另一方面，影响靶向治疗效果的耐药基因检测（如KRAS突变）也同样受到了关注。
二、NSCLC常见靶向治疗相关基因的改变1. EGFR：2. ALK融合基因：3. ROS1融合基因：4. c-MET基因：5. RET及BRAF：三、NSCLC靶向药物治疗相关基因检测的一般原则1. 基因检测的对象：所有晚期的NSCLC患者，在条件许可的情况下都应当进行肿瘤组织或脱落癌细胞的EGFR、ALK突变检测，以明确靶向药物的敏感位点和可能存在的耐药情况。
对EGFR和ALK突变阴性的NSCLC患者可尝试进行ROS1、c-MET、RET、KRAS及BRAF的基因检测。
肺癌基因检测，一文详解！
肺癌基因检测，一文详解！基因检测主要用于判断基因是否出现突变，以及是否存在致癌基因，为患者选择合适的靶向药物、指导常规化疗效果与预后评估。
最终的检测结果应由专业医生来判定。
当出现咳嗽、咳血、胸痛、胸闷等可疑症状时，应及时到医院就诊明确病因，做到早诊断早治疗。
基因检测用什么样品做？做基因检测，是检测肿瘤细胞的突变，因此需要获取肿瘤细胞。
临床上通常有三种方式：1、术中肿瘤样品：肺癌手术中（或胸水中）得到肿瘤样品。
2、穿刺活检样品：通常是在局部麻醉下，使用很细的针刺入疑似肿瘤，来获取少量细胞用于分析。
这样创伤很小，可以避免不必要的手术，对患者影响小。
3、液体活检：肺癌的液体活检，主要是指通过分析血液里的癌细胞或者癌细胞释放的DNA进行分析，判断癌症突变类型。
这之所以能成功，是因为晚期癌细胞，或者癌细胞的DNA，会经常跑到血液里面，现代技术有可能把它们捕获，进行分析。
什么时候需要基因检测？一般需要参考患者处于什么疾病阶段。
通俗来讲，肺癌疾病阶段分为三个阶段：第一个肺癌刚确诊的时候；第二个靶向治疗耐药以后；第三个是尝试了很多治疗都没有效果了以后，就是所谓的肿瘤终末期。
肺癌不同时期的选择标准和检测方法都是不一样的。
比如说肺癌刚确诊的时候，它的检测方法如果考虑经济因素的话，单个基因检测未尝不是一个好方法。
肺癌十基因肺癌十基因包括：EGFR、ALK、ROS1、BRAF、MET、HER-2、RET、NTRK1、PI3K、MEKI。
01EGFREGFR突变在亚裔、女性、腺癌、既往少量或无吸烟史等临床的患者中常见。
肺腺癌患者中，大约有15%的白种人和30%-50%的东亚人拥有EGFR基因突变。
而对于那些无吸烟史的东亚人，比例高达50-60%。
EGFR基因90%以上的突变发生在19号外显子缺失和21号外显子的L858R。
这两种突变位点适用于第一代EGFR靶向药物吉非替尼、厄洛替尼、埃克替尼。
19外显子缺失和L858R突变之外的称之为罕见突变，如L861Q、G719X、S768I等，这些突变位点适合使用第二代靶向药物阿法替尼，即不可逆的EGFR和HER2双重抑制剂。
精准医疗下的个体化用药基因检测精品医学课件
8.6%
0
120
180
240
300
360
0
2
4
6
8
10
12
0
60
120
180
240
300
360
0
2
4
6
8
10
12
11.2%
10.0%
心血管死亡/心梗/卒中 累积发生率(K-M%)
心血管死亡/心梗/卒中 累积发生率(K-M%)
随机后时间(天)
随机后时间(天)
氯吡格雷组，功能缺失等位基因携带者(n=1,388)
雷贝拉唑
PM型效果最好，RM型效果差
幽门螺杆菌的根除率与CYP 2C19基因型相关 （包括雷贝拉唑）
雷贝拉唑
PM型效果最好，RM型效果差
NIH，Pharm GKB，荷兰皇家药师协会建议： CYP 2C19 *17/*17： UM， Helicobacter pylori eradication esomeprazole： recommend to consider dose increase by 50-100% lansoprazole ： recommend to consider dose increase by 200% omeprazole ：recommend to consider dose increase by 100-200% pantoprazole ：consider dose increase by 400% rabeprazole ：no recommendations at this time
正确的药物：因药而异 正确的剂量：因量而异 正确的患者：因人而异
基因检测技术在肺癌精准治疗中的应用
EGFR L858
通过等位基因突变频率在结合样本病理评估中的肿瘤细胞占比，我们能够对肿瘤内 部带有不同驱动基因的肿瘤细胞亚克隆有一个大致的比例上的了解。对了解肿瘤异 质性有帮助。
精选ppt
8
NGS和ddPCR都可分辨分子顺式/分子反式
有研究发现T790M和C797S突变分子顺式/分子反式信息影响EGFR TKI治疗疗效； NGS和ddPCR都能够提供EGFR突变的in cis/in tran信息，具有重要的临床意义，传 统PCR检测则会遗漏这一信息；
• STRN-ALK
• CATSPERB-ALK
• ACVR1-ALK
• CLIP1-ALK
• DPH6-AS1-ALK
• KIF5B-ALK
• RP11-320M2.1-ALK
• UGP2-ALK
精选ppt
13
NGS能够发现新的耐药机制
发现AZD9291获得性耐药机制---C797S突变
15例患者一代TKI进展， T790M+，应用
基因检测技术在肺癌精准治疗中的应用 靶向捕获测序与ddPCR比较
精选ppt
1
测序技术的发展带来靶向治疗的纵深研究
精选ppt
Li TH, et al. J Clin Oncol 31:1039-1049 2
PCR技术也经历了3代的进化
精选ppt
3
对NSCLC驱动基因的认知随着分子检测技术 的进步在不断深入
精选ppKt.S. Thress, et al. Nat Med, 2015. 21(6): p. 560-562. 9
基于靶向捕获的NGS能够同时检测已知突变 和未知突变
ddPCR
热点1
Capture NGS
肿瘤个体化用药指导基因检测
第十五页，共28页。
化疗用药指导基因检测产品
化疗药物
铂类药物
吉西他滨 紫杉醇 甲氨碟呤 培美曲赛
检测位点 XRCC1(R194W) XRCC1(R399Q)
ERCC1(C118T)
GSTP1(I105V) CDA(A79C) CDA(G208A) MDR1(C3435T) MDR1(G2677T/A) MDR1(C3435T) MTHFR(C677T) TYMS mRNA表达量
靶向药物
吉非替尼（易瑞沙） 厄洛替尼（特罗凯） 埃克替尼（凯美纳） 西妥昔单抗（爱必妥） 帕尼单抗（维克替比） 维罗菲尼、曲美替尼、达拉非尼 伊马替尼（格列卫）
克唑替尼
曲妥珠单抗（赫赛汀）
拉帕替尼（泰克泊）
靶向治疗用药指导基因检测产品
检测基因
检测位点
EGFR
EGFR 18，19，20，21号外显子
CA：A Cancer Journal for Clinicians ，Cancer Statistics in China, 2015
第二页，共28页。
癌症的治疗手段
约90%肿瘤患者在治疗过程中 会用到抗肿瘤药物
第三页，共28页。
肿瘤临床用药存在的问题
• 化疗药物在杀灭肿瘤的同时，对增生活 跃的骨髓、胃肠道黏膜、生殖细胞、毛
结果解读 SNP-R194W:疗效CT、TT>CC SNP-R399Q:疗效GG>GA>AA SNP-C118T: 疗效CC>CT>TT
化疗药物 长春新碱
环磷酰胺
检测位点 MDR1(G2677T/A) MDR1(G2677T/A) XRCC1(R399Q)
了解肺癌ALK基因检测
化疗
• 化疗是晚期非小细胞肺癌的主要治疗方法之一。全身的化 疗是将化疗药物通过血管注入体内，经过血液循环，化疗 药物可到达体内绝大多数的部位。
PP-XLK-CHN-0017 MLR Expiration Date: 2017-9-9
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21
臧远胜,等.家庭抗癌必修课·肺癌[M].上海：上海科学技术出版社. 2013.8:79
中国肺癌患者分期
PP-XLK-CHN-0017 MLR Expiration Date: 2017-9-9
1、支修益,等.中国原发性肺癌诊疗规范 （2015年版）.中华肿瘤杂志.2015,37(1):67-78. 2、石远凯,等.中国晚期原发.性肺癌诊治专家共识 （2016年版）.中国肺癌杂志.2016,9(17):1-14.
随着对肺癌发病机制的研究和认识不断深入，大量的新药物、
新技术、新疗法成功开发并投入使用，已使肺癌患者的生存 期显著延长。2006年，世界卫生组织（WHO）正式将肿瘤 定位为“可控的慢性疾病”。
PP-XLK-CHN-0017 MLR Expiration Date: 2017-9-9
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臧远胜,等.家庭抗癌必修课·肺癌[M].上海：上海科学技术出版社. 2013.8:24
了解肺癌
目录
肺癌的治疗方法
靶向治疗 靶向治疗的用药注意事项
PP-XLK-CHN-0017 MLR
.
14
Expiration Date: 2017-9-9
肺癌非不治之症
• 研究表明，1/3的癌症是可以预防的，1/3的癌症是可以通 过早期正确的诊断和治疗而痊愈的，1/3的癌症是可以通 过相对最佳的治疗而减少痛苦，延长生存期的。
– 支气管镜检查，胸腔镜、纵隔镜检查，经皮肺穿刺检查、胸膜活检术、 痰脱落细胞检查，浅表淋巴结活检术等。
肺癌癌症精准用药基因检测ppt课件
你了解肺癌吗？
肺癌的治疗方法
1
外科手术治疗（主要治疗手段）
手术方式：全肺切除术（20世纪40-50年代）；肺叶切除术（60年代）； 多种支气管、隆突切除成形等改进术（70年代）； 区域淋巴结清扫（80年代）；心血管外科技术（90年代） 最适宜进行手术治疗：Ⅰ、Ⅱ期和部分ⅢA期的NSCLC
摘自《2010中国肺癌临床指南》
女性
发病率 (1/10 5 )
16.8 7.5 10.1 14.8 8.5
死亡例数
1098702 521041 373639 307481 468970
发病率 死亡率 5年生存 5年生存 5年生存 5年生存 发病例数 死亡例数 率(%) 例数 率(%) (1/10 5 ) 例数 (1/10 5 ) (1/10 5 )
Estimated Lung Cancer Mortality Worldwide in 2012: Women
4
香烟
大气污染
油烟
“五气”
装修污染
导 致 肺 癌 高 发 的 主 要 因 素
人口老龄化
城市现代化
农村现代化 “六化” 环境污染化
生活方式不良化
医学现代化
生气
5
你பைடு நூலகம்解肺癌吗？
肺癌(Lung cancer)：原发于支气管黏膜及肺泡上皮细胞的恶性肿瘤，又称 原发性支气管肺癌。 按照组织病理学分类： 鳞状细胞癌 腺癌 大细胞癌 小细胞肺癌
你了解肺癌吗？
肺癌诊断与治疗的一般流程
门诊拟诊肺癌患者 肺癌相关标记物检查 影像学检查 明确诊断与TNM分期 可切除 以手术为主的综合治疗 随访 复发转移 可切除性评估 继续随访 组织病理学检查 排除诊断 不可切除 以化疗为主的综合治疗