北京华大蛋白质研发中心质谱分析服务订单-清华大学生物医学测试中心
国内外做基因测序的高校院所梳理
国内外做基因测序的高校院所梳理1. 引言基因测序是一项重要的科学技术,可以揭示生物个体的遗传信息,对于生命科学、医学研究和临床应用具有重要意义。
国内外的高校院所在基因测序领域扮演着重要角色,致力于推动基因测序技术的发展和应用。
本文将对国内外做基因测序的高校院所进行梳理和介绍。
2. 国内高校院所2.1 清华大学清华大学是中国一流的综合性大学,其基因测序实验室拥有先进的仪器设备和丰富的科研经验。
该实验室致力于基因测序技术的研究和应用,涉及基因组学、转录组学、蛋白质组学等多个领域。
清华大学的基因测序实验室在国内外享有很高的声誉,并与多家国际知名机构合作开展科研项目。
2.2 北京大学北京大学也是中国顶尖的高校之一,在基因测序领域有着卓越的研究成果。
北京大学的基因测序实验室拥有先进的测序设备和专业的科研团队,致力于基因组学和遗传学等领域的研究。
该实验室与国内外多家研究机构和生物技术公司合作,共同推动基因测序技术的发展和应用。
2.3 复旦大学复旦大学是中国著名的综合性大学,其基因测序实验室在基因组学和生物信息学等领域具有优势。
该实验室拥有先进的测序平台和专业的科研团队,致力于基因组测序和功能基因组学的研究。
复旦大学的基因测序实验室与国内外多家研究机构和生物技术公司开展合作,共同推动基因测序技术的创新和应用。
3. 国外高校院所3.1 哈佛大学哈佛大学是世界顶尖的高校之一,在基因测序领域具有广泛的研究合作和影响力。
哈佛大学的基因测序实验室拥有世界领先的测序设备和专业的科研团队,致力于基因组学、转录组学和表观遗传学等领域的研究。
该实验室与国内外多家研究机构和生物技术公司合作,开展前沿的基因测序技术研究和应用。
3.2 斯坦福大学斯坦福大学是美国著名的高等学府,其基因测序实验室在技术创新和研究成果方面具有卓越的表现。
斯坦福大学的基因测序实验室拥有先进的测序设备和专业的科研团队,致力于基因组学、遗传学和生物信息学等领域的研究。
生物信息学生物信息数据库及其信息检索讲课文档
核酸序列数据库
GenBank( ) EMBL( ) DDBJ ( ) 三个数据库每天互相交换数据 GenBank可通过NCBI的检索系统Entrez获取, Entrez集成来自主要DNA和蛋白序列数据
库的数据,包括物种、基因组、定位、蛋白结构和结构域等信息
其他各种专业核酸数据库
(SNP ) 收录已经识别的SNPs的数据库
HapMap Project()
收录了三大人群(非洲人,高加索人和亚洲人群)主要的变异模式,所选择的SNPs具有相对 代表性 CGED(http://lifesciencedb.jp/cged/) 收录多种癌症的临床和基因表达数据,更新到2007年
第二十四页,共60页。
第三十页,共60页。
复杂检索
1、限制字段类别 常用的有: Author: Bao YM[au]
Title: stress[ti]
Tilte/Abstract: stress[title/abstract]
Genome Assembly
GenBank
第十二页,共60页。
UniGene
Algorithms
GenBank中测序最多的20个物种
第十三页,共60页。
模式生物与基因测序
Ureaplasma urealyticum
Bacillus subtilis
Drosophila melanogaster
比,增加一些附加信息:经程序验证的显性化学图像信息、一致的二级结构衍生定义、与
MEDLINE相匹配的引用、基于源自生物实体的蛋白质或核酸链进行分类的分子匹 配。
第十八页,共60页。
三、功能数据库
收录生物分子的功能数据,由ID号与序列和结构数据链接 组织表达谱和亚细胞定位 根据不同组织中的EST、SAGE或芯片杂交信号,绘制出不同组织中表达基因的图谱: BodyMap() Unigene( ) SAGEmap() GEO() Stanford Microarray Database()
清华大学生物医学测试质谱中心概况及ETD离子源介绍
LOGO ETD Reagent
ETD reagent used to transport electrons into the trap where they react with peptide cations
x10 6 4
202.0
3
Fluoranthene
Ion Trap With Ions
LOGO
ETD的应用Leabharlann 的应用主要用于蛋白质翻译后修饰的分析, 主要用于蛋白质翻译后修饰的分析,可以提供更多 的裂解碎片,提高对蛋白质序列分析的覆盖率, 的裂解碎片,提高对蛋白质序列分析的覆盖率,同时保 护不稳定的翻译后修饰基团, 护不稳定的翻译后修饰基团,有助于发现更多的修饰位 点。
Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time Of Flight Mass Spectrometry
ABI, 4800 plus
2、2D ChipLC IonTrap质谱仪 、 质谱仪
LOGO
Electro-Spray Ionization (ESI) Electron Transfer Dissociation (ETD)
LOGO
Angiotensin 1 Data analysis
ETD 649
Thanks!
ETD source introduction
LOGO
What is ETD?
Electron Transfer Dissociation – Singly-charged radical anions transfer an electron to multiply-protonated peptides in the ion trap and induce fragmentation of the peptide backbone along pathways that are analogous to those observed in electron capture dissociation (ECD)
利用GFP-Trap和酵母双杂交技术筛选TaPR1互作靶标
第44卷第5期2021年9月河北农业大学学报JOURNAL OF HEBEI AGRICULTURAL UNIVERSITYVol.44 No.5Sep.2021利用GFP-Trap和酵母双杂交技术筛选TaPR1互作靶标申松松,王 菲,耿怀民,孟麟硕,冯 燕,王海燕(河北农业大学 植物保护学院/河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心,河北 保定 071000)摘要:病程相关蛋白PR1(pathogenesis related PR1 proteins, PR1)在小麦抗病防御反应中发挥重要作用。
本试验是在前期研究基础上,借助烟草成功表达TaPR1蛋白,利用 GFP-Trap 技术结合质谱分析获得与TaPR1互作的蛋白。
同时,利用酵母双杂交技术(Yeast two-hybrid, Y2H)在接种叶锈菌生理小种PHNT的‘中国春’小麦酵母文库中筛选获得与TaPR1互作的寄主蛋白。
经过序列比对分析,2种方法共同筛选出谷氨酰氨合成酶(Glutamine synthetase)、细胞色素b6(Cytochrome b6)、应激蛋白(Stress protein)等可能与TaPR1互作的蛋白,为进一步深入研究TaPR1参与小麦叶锈病防御反应的分子机制提供了理论基础。
关 键 词:小麦叶锈菌;病程相关蛋白PR1;GFP-Trap;酵母双杂交;互作蛋白中图分类号:S432.1 开放科学(资源服务)标识码(OSID):文献标志码:AScreening of interacting target of TaPR1 using GFP-Trapand yeast two-hybrid techniqueSHEN Songsong, WANG Fei, GENG Huaimin, MENG Linshuo,FENG Yan, WANG Haiyan(College of Plant Protection, Hebei Agricultural University / Biological Control Technological Innovation Center ofPlant Diseases and Plant Pests of Hebei Province, Baoding 071000, China)Abstract: Pathogenesis related PR1 (pathogenesis related PR1 proteins, PR1) proteins played an important role inwheat disease defense response. On the basis of the previous study, the TaPR1 protein was successfully expressedby tobacco, the proteins interacting with TaPR1 were obtained by GFP-Trap technique combined with massspectrometry. At the same time, host proteins interacting with the TaPR1 were screened from the yeast libraryof‘Chinese Spring’wheat inoculated with physiological race PHNT of leaf rust by yeast two-hybrid technique(Yeast two-hybrid, Y2H). Sequence analysis showed that Glutamine synthetase, Cytochrome B6, Stress protein andother proteins that might interact with the TaPR1 were screened by both two methods. The study laid a theoreticalfoundation for exploring the molecular mechanism of the TaPR1 participating in wheat leaf rust disease defenseresponse.Keywords: wheat leaf rust; pathogenesis related PR1 proteins; GFP-Trap; yeast two-hybrid; interacting proteins收稿日期:2021-03-19基金项目: 河北省自然科学基金(C2020204028).第一作者:申松松(1996-),男,河北邯郸人,硕士研究生,主要从事分子植物病理学研究.E-通信作者: 王海燕(1977-),女,河北遵化人,博士,教授,主要从事分子植物病理学研究.E-本刊网址:http: //hauxb. hebau. edu. cn文章编号:1000-1573(2021)05-0064-07DOI:10.13320/ki.jauh.2021.008565第5期作为世界上最重要的粮食作物之一,小麦的产量受多个方面的影响,其中对产量影响最大的是小麦病害。
北京国际工程咨询有限公司_企业报告(代理机构版)
6
首都师范大学附属育新学校房山分 校 2023 年信息化建设预算项目
北京市房山区教育委 员会
7881.2 7200.0
2023-07-27 2023-07-31
7
清华大学高通量多束扫描电子显微 镜购置项目(清设招第 2022726 号)
清华大学
中标公告
5500.0
2022-12-23
本报告于 2023 年 08 月 21 日 生成
18
2022 年延庆区农村地区村庄冬季清 洁取暖项目
北京市延庆区农业农 村局
19 奔驰 MFA 物业外包服务中标公告
北京鹏盛物业管理有 限公司
3670.0 3568.8 3500.0 3400.0 3400.0 3209.8 3116.9 3036.0
2022-12-22 2023-06-28 2022-11-02 2022-12-14 2022-12-26 2022-09-22 2022-08-24 2022-12-02
1.4 大额项目列表
序号
项目名称
招标单位
预算金额(万元) 公告时间
1
北京市海淀区教师进修学校附属房 山实验学校二次装修改造项目(监 理)成交公告
北京市海淀区教师进 修学校附属房山实验 学校
800000.0
2023-07-24
2
[公开]北京工商大学改善办学保障条 件-整促改落地项目-经济学院整建
北京工商大学
*平均节支率是指,项目节支金额与预算金额的比值的平均值。(节支金额=项目预算金额-中标金额)
本报告于 2023 年 08 月 21 日 生成
1 / 41
1.2 代理项目趋势
近 3 月(2023-06~2023-08):
高通量蛋白质分离检测系统通过验收
检测系统 的研制 与开发 ”课题 进行 了验收 。验 收专 家
长 ) 、科 技 部 国家 图书文献 信 息 中心吴 波 尔研 究 员 研究所陈义研究员 、大连 理工 大学贾凌云教授 、大连 医科大学王立 明教授 、科技部 国家科技基础条件平 台
组成员包括北京 蛋 白组 学研 究 中心钱小红研究 员 ( 组 人针对 高通 量蛋 白质分离检测系 统的研 制与 展 目标、研 究方 向、产 品规模化 生产 等 问题土
京市技术创新服务 中心王安居 主任 主持,中 国环境监 半 固体样 品的快速 高效萃取 ,在环保 、食 品、
测总站魏复盛院士担任鉴定委 员会 主任 ,中国计量科 地质 、法庭科学等领域,具有 良好的市场前 学研究 院李红梅 研 究员担任 鉴定委 员
会副主任 。委 员会成 员有 刘虎威 、 闫
专 家 组 一 致 认 为 : 该 项 目研 究 计 划 、
连化学物理 和课题设置合理 ,项 目实施和管理规范 ,经 ! 研究所主持承担 ,北京理工大学 、大连依利特分析 仪 理,完成 了课题合 同书 的各项任 务指标 ,一 器有 限公 司参加 的 “ 十一五 ”国家科技支撑计划项 目 “ 科学仪器设备研制 与开发 ”中 “ 高通量蛋 白质分 离 过验 收 ,同时建议 国家有 关部 门继续给予大 实现课题成果 的产业化 。 验 收会后 ,与 会领 导 、专 家 以及有 关
成德 、林 少彬 、汪 正范 、孙 汉文 、刘 潇威、刘肃 、张萍 、江林等专家 。 鉴 定 委 员 会 一 致 认 为 : 北 京
吉 天 仪 器 有 限公 司和 中科 院 大 连 化
学物 理 研 究 所 联 合 研 制 开 发 的P E L一 1 0 / 0 O 3 0 快速溶 剂萃取仪整 体 O0 20 /00
抗MFAP3L单克隆抗体及其在肿瘤检测中的应用[发明专利]
专利名称:抗MFAP3L单克隆抗体及其在肿瘤检测中的应用专利类型:发明专利
发明人:康滨,张军,邢蕊,徐宁志,吕有勇,吴琳,刘国振,刘斯奇申请号:CN200910077768.8
申请日:20090217
公开号:CN101805405A
公开日:
20100818
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明涉及产生抗MFAP3L单克隆抗体的杂交瘤、抗MFAP3L单克隆抗体及其在肿瘤检测中的应用,具体地涉及产生与人结直肠癌组织中的以及正常组织中的天然蛋白-微丝相关蛋白3样蛋白(MFAP3L)特异性结合的单克隆抗体的杂交瘤、以及相应的抗体。
进一步地,本发明涉及含有所述单克隆抗体的免疫检测试剂。
以及所述单克隆抗体或者所述检测剂在有效检测结直肠癌中的用途,从而提供了有效检测MFAP3L的检测工具。
申请人:北京华大蛋白质研发中心有限公司
地址:101318 北京市顺义区空港工业园B-8
国籍:CN
代理机构:中国国际贸易促进委员会专利商标事务所
代理人:罗菊华
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蛋白质谱鉴定 华大
蛋白质谱鉴定华大
蛋白质谱鉴定是一种用于分析蛋白质组成和结构的技术,它在
生物医学研究和临床诊断中具有重要的应用价值。
华大基因是一家
专业的生物技术公司,提供包括蛋白质组学在内的多项生物技术服务。
在蛋白质谱鉴定方面,华大基因可以利用质谱技术对样本中的
蛋白质进行分析和鉴定,包括蛋白质的组成、结构、修饰等信息。
蛋白质谱鉴定涉及到样本的制备、质谱分析和数据解释等步骤。
华大基因可以根据客户的需求进行样本的制备工作,包括蛋白质的
提取、纯化和消化等步骤,确保样品的质量符合质谱分析的要求。
在质谱分析方面,华大基因拥有先进的质谱仪设备和经验丰富的技
术团队,可以对样品进行高灵敏度、高分辨率的质谱分析,获得准
确的蛋白质信息。
此外,华大基因的专业团队还可以对质谱数据进
行解释和分析,帮助客户理解样品中蛋白质的特性和功能。
除了技术实力,华大基因在蛋白质谱鉴定服务中还注重质量控
制和数据安全。
他们严格遵循国际标准操作流程,确保分析结果的
准确性和可靠性。
同时,他们也重视客户数据的保密,采取多种措
施保护客户的数据安全。
总的来说,华大基因在蛋白质谱鉴定方面拥有丰富的经验和先
进的技术设备,可以为客户提供高质量、可靠的蛋白质谱鉴定服务。
希望这些信息能够帮助你更全面地了解华大基因在蛋白质谱鉴定领
域的能力和优势。
蛋白质谱鉴定 华大
蛋白质谱鉴定华大全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:蛋白质谱鉴定的过程主要包括样品制备、质谱分析和数据解读。
在样品制备阶段,研究人员需要对待测样品进行蛋白提取、消化、分离等处理,以获得符合质谱分析要求的蛋白质混合物。
随后,样品将被送入质谱仪进行分析,通过质谱仪的高灵敏度和高分辨率,可以准确地检测出各种蛋白质的质谱信号。
在数据解读阶段,通过与数据库比对和生物信息学分析,可以确定待测蛋白质的身份、翻译后修饰和功能等信息。
在蛋白质组学研究中,蛋白质谱鉴定技术可以帮助研究人员揭示细胞内不同蛋白质在表达水平、翻译后修饰和相互作用等方面的差异,从而深入理解生物体内蛋白质的生物功能和调控机制。
蛋白质谱鉴定技术在疾病诊断和药物研发领域也有着重要应用。
通过对体液中蛋白质组的分析,可以发现与疾病相关的生物标志物,为疾病的早期诊断和治疗提供重要依据。
在药物研发过程中,蛋白质谱鉴定可以帮助研究人员对药物靶点和作用机制进行深入研究,加速新药的开发和上市进程。
华大基因作为国内领先的生物技术公司,其蛋白质谱鉴定服务得到了广泛的认可和好评。
不仅在国内,华大基因的蛋白质谱鉴定服务也远销海外,为世界各地的科研人员提供了优质的蛋白质研究解决方案。
华大基因拥有先进的设备和技术,以及经验丰富的专业团队,能够为客户提供高质量、高效率的蛋白质谱鉴定服务,深受客户的信赖和好评。
第二篇示例:蛋白质谱鉴定是一种用于鉴定蛋白质组成和结构的技术,已经成为生物医学研究和生物技术发展中不可或缺的重要手段。
在蛋白质分离和鉴定领域,华大基因作为国内领先的基因测序和生物信息技术服务提供商,拥有丰富的经验和优秀的技术团队,为科研人员提供专业的蛋白质谱鉴定服务。
蛋白质谱鉴定是通过质谱技术来识别和定量复杂混合物中的蛋白质。
华大基因的蛋白质谱鉴定服务包括蛋白质提取、蛋白质分离、质谱分析以及生物信息学分析等步骤。
样本中的蛋白质需要被提取出来并进行分离。
分离后的蛋白质样本会经过质谱分析,通过质谱仪器将蛋白质分子转化成离子,并测量其质荷比。
国内外做基因测序的高校院所梳理
一、引言在当今社会,基因测序技术的发展日新月异,已经成为生物医学研究和临床诊断中不可或缺的重要工具。
国内外的高校和院所在基因测序领域积极开展科研工作,为推动生命科学和医学领域的发展作出了重要贡献。
本文将从国内外做基因测序的高校院所的角度展开梳理,探讨他们在该领域的研究成果和发展趋势。
二、国内高校院所概况1. 清华大学清华大学作为国内一流的高校,其生命科学和医学领域一直处于国际领先地位。
在基因测序领域,清华大学拥有一支由生物信息学、遗传学和临床医学专家组成的研究团队,致力于基因组学、转录组学和表观遗传学的研究工作。
该团队在疾病诊断和个性化治疗方面取得了重要突破。
2. 北京大学北京大学在基因测序领域也有着深厚的积淀,其生命科学学院拥有一流的实验设备和科研条件,吸引了大批科研人才从事基因测序和生物信息学方面的研究工作。
北京大学的基因测序研究涵盖了人类、动植物和微生物的基因组数据分析和挖掘。
3. 上海交通大学上海交通大学在基因测序方面也有着独特的优势,其生命科学与技术学院与医学院合作开展了一系列的生物信息学和基因组学研究项目,涉及基因组测序、组学分析和疾病表观遗传学等多个领域。
三、国外高校院所概况1. 斯坦福大学作为美国顶尖的高校之一,斯坦福大学在基因测序领域拥有世界领先水平的研究团队。
斯坦福大学的生物医学工程系和遗传学系联合开展了大量基因组学和疾病基因筛查的研究项目,推动了疾病精准医学的发展。
2. 剑桥大学英国的剑桥大学也是基因测序领域的重要研究中心,其基因组研究中心致力于开展全球范围内的人类基因组多样性和进化研究,为人类起源和疾病遗传学等领域提供了重要数据支持。
3. 日本大阪大学日本的大阪大学在基因测序技术方面也取得了丰硕的成果,其生命科学研究院和医学院的合作项目涉及了人类健康和疾病的基因组学研究,为日本的生物医学研究做出了重要贡献。
四、发展趋势分析在国内外高校院所的基因测序研究中,可以看到以下几点发展趋势:1. 跨学科合作越来越多的高校院所开始跨学科合作,将生物信息学、医学、生物工程、数学等学科的优势相结合,共同开展基因测序研究,从而提高研究成果的质量和深度。
清华大学技术服务合同(校内)——计算平台-
1、双方均对对方提供的技术情报、资料等承担保密义务,不论本合同是否变更、解除、终止,本条款长期有效。
2、本合同一式2份,自双方授权代表签字盖章,及第一笔经费到位之日起生效。双方各执1份,具有同等法律效力。
3、对本合同任何条款的修改、补充或变更,双方必须签订书面协议并签字盖章后方可生效。
委
托方
名称或姓名清华大学生命科学学院签章单位负责人签章委托代理人签章通讯地址清华大学生命科学馆名称或姓名清华大学生命科学学院签章单位负责人签章委托代理人签章通讯地址清华大学生命科学馆
合同登记编号:
技术服务合同书
(校内合同参考文本)
项目名称:高通量基因测序数据集群分析
委托方:
(甲方)
服务方:清华大学蛋白质设施实验技术中心
甲方应提供足够的技术资料、数据等和必要的工作条件,经乙方确认后,乙方开始提供技术服务。
三、履行期限、地点和方式:
本合同有效期为:2013年12月1日至2014年12月31日。
履行地点:清华大学生命科学馆
四、验收标准和方式:
甲方利用乙方提供的软硬件资源并利用特定生物软件进行高性能科学运算,全部计算结果由甲方决定是否进行进一步处理或保存,乙方负责保障软硬件运行环境的稳定性和可靠性。乙方对全部计算结果不承担任何责任,包括不承担任何法律责任和任何民事责任。
数量(个)
单价元)
合计(元)
基因测序数据
基于计算平台的科学计算和分析
甲方利用乙方提供的计算平台,进行高通量基因测序数据的科学计算和分析并自行负责对结果的保存。乙方负责保障软硬件运行环境的稳定性和可靠性。
二、工作条件和协作事项:
2013年12月至2014年12月甲方将高通量基因测序数据分批送交乙方。
华大基因质谱分析报告
1 2
数据整合与关联分析 将基因表达谱、蛋白质组学和代谢组学等多维度 数据进行整合和关联分析,揭示不同数据间的内 在联系和相互印证关系。
系统生物学分析 利用系统生物学方法,构建生物过程的网络模型, 揭示生物过程的调控机制和相互作用关系。
3
综合分析结论
根据关联分析和系统生物学分析结果,得出综合 分析结论,为生物学研究和应用提供依据和建议。
质谱分析技术仍有待进一步提高灵敏度、稳定性和标准化水平,以更 好地服务于临床和科研工作。
对未来研究的建议和展望
进一步优化质谱分析技术,提高检测灵敏度和稳定性, 降低检测成本。 开展跨学科合作,整合质谱分析技术与基因组学、蛋白 质组学等多组学研究,深入揭示生命活动的奥秘。
加强质谱分析技术在临床实践中的应用研究,拓展其 在
报告范围和限制
范围
本报告主要对华大基因的质谱分析技术进行概述,介绍其在不同领域的应用情况,并对其发展前景进 行展望。
限制
由于质谱分析是一个涉及多个学科领域的复杂技术,本报告无法涵盖其所有方面,仅对华大基因的研 究成果和应用情况进行重点介绍。同时,报告中的数据和信息主要来源于公开资料和文献,可能存在 一定的局限性。
02
华大基因质谱分析方法
质谱分析原理
质谱分析是一种基于质荷比对化合物进行分离和检测的技术。通过将样品离子化,然后在电场和磁场 中进行分离,可以得到不同质荷比的离子,从而确定化合物的分子量和结构信息。
质谱分析具有高灵敏度、高特异性和高分辨率的特点,广泛应用于生物医学、药物研发、环境监测等 领域。Biblioteka 实验设计和样本处理05
结论和建议
研究结论总结
01
华大基因质谱分析在疾病诊断、药物研发和生物标志物发现等方面具 有重要价值。
空间蛋白质组 华大 显微切割
空间蛋白质组华大显微切割华大显微切割技术是一种应用于空间蛋白质组研究的先进技术。
本文将介绍华大显微切割技术的原理和应用,并探讨其在空间蛋白质组研究中的重要性和前景。
华大显微切割技术是华大基因公司开发的一项领先的细胞切割技术,通过精确的激光切割和高效的细胞收集系统,实现对细胞的快速、准确和无损切割。
该技术可以应用于多种细胞类型,包括悬浮细胞和贴壁细胞。
华大显微切割技术的原理基于激光切割和光学显微镜的结合。
首先,利用激光器产生高能量的激光束,然后通过光学镜头将激光束聚焦到微米级别的细胞表面。
接下来,激光束在细胞表面形成一个焦点,并产生高能量密度,从而引起细胞表面的局部热损伤。
最后,利用激光切割系统的移动控制,将焦点沿着细胞表面移动,实现对细胞的切割。
华大显微切割技术的一个重要应用领域是空间蛋白质组研究。
空间蛋白质组是指在细胞内不同亚细胞结构和细胞器中存在的蛋白质组成。
研究空间蛋白质组可以揭示细胞内蛋白质的分布和功能,对于理解细胞的结构和功能具有重要意义。
传统的蛋白质组学研究方法往往无法准确地确定蛋白质的定位和分布,因为细胞内蛋白质的定位通常是高度动态和空间异质的。
然而,华大显微切割技术的出现改变了这一局面。
通过利用显微切割技术,可以将细胞切割成不同的区域,并收集每个区域中的蛋白质样品。
通过进一步的质谱分析和蛋白质鉴定,可以确定每个区域中的蛋白质组成和定位。
华大显微切割技术在空间蛋白质组研究中的应用具有多个优势。
首先,它可以实现对细胞的高分辨率切割,从而获得更准确的蛋白质定位信息。
其次,该技术具有高通量的特点,可以同时处理多个细胞,大大提高了研究效率。
此外,显微切割技术还可以实现对特定亚细胞结构的切割,如细胞核、线粒体等,从而更加精确地研究相应的蛋白质组成和功能。
空间蛋白质组研究是当今蛋白质组学领域的一个重要研究方向。
通过揭示细胞内蛋白质的空间分布和相互作用,可以深入理解细胞的功能和调控机制。
华大显微切割技术的出现为空间蛋白质组研究提供了一种强大的工具,将进一步推动该领域的发展。
蛋白质组学 华大
蛋白质组学华大华大蛋白质组学是指应用蛋白质组学技术研究蛋白质的组成、结构、功能以及相互作用的一门学科。
华大蛋白质组学是由华大基因公司发起的,该公司是全球领先的基因组学研究服务提供商之一。
蛋白质组学作为生物学研究的重要分支,对于深入理解生物体的生命活动、疾病的发生机制以及药物研发具有重要意义。
蛋白质是生物体中最重要的功能分子之一,它们参与几乎所有生物过程,包括细胞信号传导、代谢调控、基因表达调控等。
蛋白质组学的研究目标就是全面了解生物体中所有蛋白质的组成和功能,以及它们之间的相互作用关系。
通过蛋白质组学的研究,可以揭示生物体的复杂性和多样性,为生物学研究提供重要的数据支持。
华大蛋白质组学的研究方法主要包括蛋白质质谱和蛋白质芯片技术。
蛋白质质谱是一种通过分析蛋白质分子的质量和电荷来确定其组成和结构的方法。
蛋白质芯片则是利用微阵列技术将大量蛋白质固定在固体载体上,通过检测蛋白质与其他分子的相互作用来研究蛋白质的功能和调控机制。
蛋白质组学在生物医学领域具有广泛的应用价值。
通过蛋白质组学的研究,可以鉴定疾病标志物,帮助早期诊断和治疗疾病。
同时,蛋白质组学也可以用于药物研发,通过研究蛋白质的结构和功能,设计出更加有效的药物。
此外,蛋白质组学还可以用于研究蛋白质的修饰和亚细胞定位,揭示蛋白质的功能调控机制。
华大蛋白质组学在国内外学术界和产业界都取得了重要的研究成果。
华大基因公司在蛋白质组学领域具有雄厚的技术实力和丰富的经验,为科研机构和企业提供了全面的蛋白质组学研究服务。
华大蛋白质组学研究团队由一批优秀的科研人员组成,他们致力于推动蛋白质组学技术的发展和应用,取得了一系列重要的科研成果。
华大蛋白质组学是一门重要的生物学研究领域,通过研究蛋白质的组成、结构、功能和相互作用关系,可以深入了解生物体的生命活动和疾病的发生机制,为药物研发和临床诊断提供重要的支持。
华大蛋白质组学在国内外具有广泛的应用前景,将为生物医学研究和产业发展做出重要贡献。
毕赤酵母中人Ⅲ型胶原蛋白α链与病毒羟脯氨酸酶的共表达
毕赤酵母中人Ⅲ型胶原蛋白α链与病毒羟脯氨酸酶的共表达史静静;高源;贺婧;马晓轩【摘要】In order to obtain hydroxylated collagen (Hyp-containing collagen) for satisfying the application,human collagen α1 (Ⅲ) chain in Pichia pastoris was co-expressed with a viral prolyl 4-hydroxylase L593 in this study.The two recombinant plasmids pPICZB-L593 and pPIC9K-COL3A1 were constructed and trans formed into GS115 for expressing proteins.The sequencing results showed that the target genes were inserted into recombinant vectors successfully.Real-Time quantitative PCR indicated that they both expressed on mR NA level.SDS-PAGE and Western Blot results further proved the successful expression of target proteins by GS115.Hydroxyproline of collagen was confirmed by amino acid composition analysis and LC-MS/MS spectra.This research opens up a new possibility and provides a reference for production of hydroxylated collagen in Pichia pastoris.%将人Ⅲ型胶原α链与一种来源于病毒的4-羟脯氨酸酶在毕赤酵母中共表达,以获得能满足应用需求的羟基化胶原蛋白.分别构建包含酶与胶原基因的重组质粒pPICZB-L593和pPIC9K-COL3A1,并将质粒均转入毕赤酵母GS115中以表达这两种蛋白.质粒测序结果表明目的基因成功插入到载体中;实时定量PCR结果显示两种基因均在mRNA水平表达;SDS-PAGE和Western Blot 进一步证实两种蛋白在毕赤酵母GS115中的成功表达;氨基酸组成分析和质谱结果证实表达的胶原中含有羟脯氨酸.获得羟基化的胶原蛋白.【期刊名称】《西北大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2017(047)002【总页数】6页(P231-236)【关键词】共表达;4-羟脯氨酸酶;人Ⅲ型胶原α链;羟基化【作者】史静静;高源;贺婧;马晓轩【作者单位】西北大学化工学院,陕西西安710069;西北大学化工学院,陕西西安710069;西北大学化工学院,陕西西安710069;西北大学化工学院,陕西西安710069【正文语种】中文【中图分类】Q3胶原作为人体中含量最丰富的蛋白,以其低免疫原性和相容性等特点被人们所青睐。
伴侣素包含T复合蛋白1ε亚基(CCT5)是与人γδT细胞相关的自身抗原
伴侣素包含T复合蛋白1ε亚基(CCT5)是与人γδT细胞相关的自身抗原陈慧;滕达;游红琴;高运安;张建民;何维【摘要】Objective To examine the relationship between CCT 5 ,γδ T cell and autoimmune diseases .Methods Recombinant CCT5 protein was cloned , expressed and purified in E.coli.Three peptides of CCT5 protein were used to prepare for anti-CCT5 monoclonal antibodies .Purified CCT5 protein was used to expand γδT cells from pe-ripheral blood mononuclear cells (PBMC).Plasma level of CCT5 in healthy donors, patients with rheumatoid arthritis (RA) and systemic lupus erythematosus (SLE) were detected by ELISA assays .The correlation analysis between plasma CCT5 concentration and the percentage of different subtypes of γδT cells measured by flow cytometry was made . Results The CCT5 gene was amplified by PCR and the length of the target fragment was 1 750 bp.The expressed 65 ku CCT5 protein was purified and validated by SDS-PAGE.Two paired monoclonal anti-CCT5 antibodies were screened to detect CCT5 protein in plasma.Immobilized recombinant CCT5 protein was able to induce specific sig-nificant amplification of peripheral γδT cells.Correlation analysis of 10 healthy donors indicated significant corre-lation between the plasma CCT 5 concentration and the proportion of Vγ9 and Vδ2 γδ T cells.The plasma CCT5 conc entration significantly decreased in autoimmune diseases patients , including RA and SLE .Conclusions These data suggest that CCT 5 could be a novel Vγ9δ2 γδT cell-relatedfactor in autoimmune diseases , which deepen the understanding of Vγ9δ2 γδT cell fun ction in autoimmune diseases .%目的:探讨CCT5与γδT细胞及自身免疫病的关系。
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清华大学生物医学测试中心样品登记表(流式细胞仪)
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1.所送样品必须是单细胞悬液。
上机前确保已经用300目滤网过滤,样品未处理好,不可上机。
2.根据流式细胞仪的类型及荧光素的荧光光谱选择荧光抗体,尽量选择荧光光谱重叠较少的抗体组合;根据检
测物(抗原)表达量选择荧光染料。
3.做好对照,单色荧光需要阴性对照;多色荧光检测除阴性对照外,须做单色补偿对照。
4.仪器检测范围为最小检测颗粒大小0.5μm(min),最大检测颗粒大小50μm(max)。
5.容易对管路造成污染的样品,例如细菌、酵母、支原体等BD AriaⅡ不予进行分析和分选。
6.无菌分选管自带或中心提供,7元/管。
7.预约时,请认真填写样品登记表,并进行提交。
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