二代基因测序流程和试剂
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二代基因测序流程和试剂
(原创实用版)
目录
1.二代基因测序的概述
2.二代基因测序的流程
3.二代基因测序的试剂
4.二代基因测序的应用领域
5.我国二代基因测序的发展状况
正文
二代基因测序的概述
二代基因测序,也称为下一代基因测序(NGS),是继 Sanger 测序之后发展起来的一种高效、快速的基因测序技术。
二代基因测序技术具有高通量、低成本、高精度等特点,使得基因测序在全基因组测序、转录组测序、基因表达谱分析等领域得到广泛应用。
二代基因测序的流程
二代基因测序的流程主要分为以下几个步骤:
1.样品准备:将待测样品提取出 DNA,并进行质量和浓度检测。
2.文库构建:将 DNA 片段进行断裂、末端修复、连接接头、PCR 扩增等步骤,构建出文库。
3.测序:将文库片段进行高通量测序,通常采用 Illumina、PacBio、Oxford Nanopore 等技术。
4.数据处理:对测序得到的原始数据进行质量控制、去除接头序列、过滤低质量序列等步骤,得到高质量的序列数据。
5.数据分析:将高质量的序列数据进行比对、拼接、注释等步骤,得
到最终的测序结果。
二代基因测序的试剂
二代基因测序所需的试剂主要包括:DNA 提取试剂盒、文库构建试剂盒、PCR 扩增试剂、测序反应试剂等。
其中,文库构建试剂盒通常包括末端修复酶、连接酶、接头等。
PCR 扩增试剂包括引物、dNTPs、缓冲液等。
测序反应试剂包括测序平台特定的测序反应液、模板 RNA、酶等。
二代基因测序的应用领域
二代基因测序技术在多个领域得到广泛应用,包括:基因组学、转录组学、表观遗传学、基因表达谱分析、基因突变检测、病原体检测等。
在基因组学领域,二代基因测序可以进行全基因组测序,揭示物种的基因组结构和功能;在转录组学领域,二代基因测序可以进行转录组测序,研究不同组织、不同发育阶段、不同处理条件下基因的表达情况。
我国二代基因测序的发展状况
我国在二代基因测序领域取得了显著的发展。
2014 年初,国家卫计委和食药监督管理总局共同出台文件叫停二代基因测序服务,并着手推进试点工作。
2015 年 4 月,卫计委公布了肿瘤领域第二代基因测序共 20 家试点单位。
尽管试点单位已经确定,但行业内部依然处于迷茫阶段。