目的蛋白表达与纯化protocol
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目的蛋白表达与纯化protocol
小量表达测试:
1、挑一单克隆到3ml LB(含抗生素)中,370C,220rpm振荡培养10h~12h。
2、保种:700μl菌液+400μl 80%灭菌甘油,充分混匀后置于-800C保存。
3、扩大培养:以1:100接菌,即取50μl菌液到5ml LB(含抗生素)中,370C,
220rpm振荡培养2h~3h至OD值达到0.6。
4、对照取样:取1ml菌液,12000rpm离心1min,弃尽上清,-200C保存。
对照
5、另取1ml菌液于一新的试管中,加1/1000 IPTG(终浓度为1mM),370C,220rpm
振荡培养3h后收菌:12000rpm离心1min,弃尽上清,-200C保存。
370C样品
6、其余约3ml菌液于160C,220rpm继续振荡培养1h后,加0.5/1000 IPTG(终
浓度为0.5mM),160C,220rpm振荡培养12~24h(通常18h)后收菌:12000rpm 离心1min,弃尽上清,-200C保存。
160C样品
7、Bugbuster分别处理上述三个样品,取20μl总蛋白,其余离心后分离上清和
沉淀,进行SDS-PAGE电泳鉴定,上样顺序为:
对照370C样品160C样品总蛋白上清沉淀总蛋白上清沉淀总蛋白上清沉淀
若目的蛋白在上清中有表达,则可以进行大量表达与纯化,具体操作如下。
大量表达:
1、挑一单克隆到7.5ml LB(含抗生素)中,370C,220rpm振荡培养10h~12h。
注意:此步用50ml离心管摇菌!
2、扩大培养:以1:100接菌,即取将上述7.5ml菌液全部接到750ml TB(含抗
生素)中,370C,220rpm振荡培养4h~5h至OD值达到1.0。
3、对照取样:取1ml菌液,12000rpm离心1min,弃尽上清,-200C保存。
(对
照)
4、其余约菌液于160C,220rpm继续振荡培养1h后,加0.5/1000 IPTG(终浓度
为0.5mM),160C,220rpm振荡培养12~24h(通常18h)后收菌:6000rpm、40C离心10min,弃尽上清,取一点沉淀做表达鉴定(160C样品),其余-200C 保存。
5、Bugbuster分别处理上述两个样品,进行SDS-PAGE电泳鉴定。
(同小量表达
中的7)
菌体破碎(高压破菌法):
1、若目的蛋白在上清中有表达,则可取剩余菌体N g (根据目的蛋白的表达量而
定),用4-6×N ml的lysis buffer将菌体重悬,加入0.1mM的PMSF,置于50/100ml小烧杯中,并将烧杯置于冰上。
2、用超声破碎仪进行破碎,功率一般为100W~200W,超声时间为3s,间隙时
间为5s,工作次数一般为99×4次。
3、将破碎后的菌液移入50ml BECKMAN高速离心管中,18000rpm、40C离心
30-40min,将上清移入一个新的50ml离心管中。
Ni柱亲和层析:
Lysis buffer: 50mM Tris, 300mM NaCl, pH 8.0(可加入5-10%的甘油和1mMdTT,20mM咪唑)
Wash buffer: 50mM Tris, 300mM NaCl, 20mM 咪唑, pH 8.0
Elution buffer: 50mM Tris, 300mM NaCl, 500mM 咪唑, pH 8.0
1、取适量的beads灌入玻璃柱中,用大量的ddH2O冲洗beads,一般为10CV×
5(CV代表柱体积,下同)。
2、用lysis buffer进行平衡:10CV×5。
3、将平衡好的beads移入菌体破碎最后得到的上清中,Mix 1~2h。
4、500g,40C离心2min,收集上清——flow-through。
5、加入50ml wash buffer,500g,40C离心2min,收集上清——wash 1。
6、加入50ml wash buffer,500g,40C离心2min,收集上清——wash 2。
7、加入50ml wash buffer,500g,40C离心2min,收集上清——wash 3。
8、将beads灌入玻璃柱中,继续用wash buffer洗10CV×3。
9、用Elution buffer洗脱:0.5CV×10,用EP管分别收集eluates。
10、SDS-PAGE电泳鉴定。
Resin regeneration:
1、用0.1M EDTA洗2CV(清洗至beads为无色)。
2、ddH2O洗5CV。
3、0.1M NaOH洗2CV。
4、ddH2O洗5CV。
5、加2CV的NiCl2。
6、ddH2O洗5CV。
7、用20%乙醇洗2次beads,置于4~80C保存。
GST柱亲和层析:
Lysis buffer: 1×PBS (140mM NaCl, 2.7mM KCl, 10mM Na2HPO4, 1.8mM KH2PO4, pH 7.3)
Wash buffer: 1×PBS
Elution buffer: 50mM Tris, 10mM reduced glutathione, pH 8.0
1、取1ml的beads灌入玻璃柱中,用大量的ddH2O冲洗beads。
2、用lysis buffer进行平衡:10CV×5。
3、将平衡好的beads移入菌体破碎最后得到的上清中,Mix 1~2h。
4、500g,40C离心2min,收集上清——flow-through。
5、加入50ml wash buffer,500g,40C离心2min,收集上清——wash 1。
6、加入50ml wash buffer,500g,40C离心2min,收集上清——wash 2。
7、加入50ml wash buffer,500g,40C离心2min,收集上清——wash 3。
8、将beads灌入玻璃柱中,继续用wash buffer洗10CV×3。
9、用Elution buffer洗脱:0.5CV×10,用EP管分别收集eluates。
10、SDS-PAGE电泳鉴定。
Resin regeneration:
1、用6M guanidine hydrochloride洗2个柱体积。
2、立即用1×PBS洗5个柱体积。
3、用70%乙醇洗3~4个柱体积。
4、立即用1×PBS洗5个柱体积。
5、用20%乙醇洗2次beads,置于4~80C保存。
Strep·Tactin柱亲和层析:
Wash buffer: 100mM Tris, 150mM NaCl, 1mM EDTA, pH 8.0
Elution buffer:100mM Tris, 150mM NaCl, 1mM EDTA, 2.5mM desthiobiotin, pH 8.0
1、取适量的beads灌入玻璃柱中。
2、用wash buffer进行平衡:10CV×5。
3、将破碎后的上清灌入装有beads的玻璃柱中,控制流速为1滴/2s,收集
flow-through,再重复上样一次。
4、用wash buffer冲洗:1CV×5,收集washes。
5、用Elution buffer洗脱:0.5CV×6,用EP管分别收集eluates。
6、SDS-PAGE电泳鉴定。
Resin regeneration:
Regeneration buffer: 100mM Tris, 150mM NaCl, 1mM EDTA, 1mM HABA, pH 8.0
1、用regeneration buffer冲洗柱子,5CV×3,直到柱子变为红色且颜色均一。
2、加2CV wash buffer或regeneration buffer,置于4~80C保存柱子。
凝胶过滤层析(Superdex 75/200):
Binding buffer: 20mM HEPES, 100mM NaCl, pH 7.0
1、ddH2O冲洗2CV: flow rate: 1ml/min, Alarm_pressure: 0.3MPa(下同)。
2、binding buffer平衡2CV。
3、样品离心:12000rpm, 40C离心30min。
4、冲洗loop: ddH2O洗5个体积,binding buffer洗5个体积。
5、上样(injection):用注射器上样,一定要排尽注射器里的气泡。
6、Binding buffer继续洗脱约40min后,开始注意观察紫外吸收峰的出现,一旦
出峰立即开始收集。
7、样品收集完毕后,继续用binding buffer冲洗直到紫外吸收基线水平。
8、ddH2O冲洗2CV。
9、20%乙醇冲洗2CV后暂停,关闭仪器。