PCR原理动画示意
PCR的基本原理和应用 PPT课件
聚合酶链式反应(PCR Polymerase Chain Reaction)
一种人工在体外进行快速DNA片断扩增的方法。
PCR技术基本原理
PCR技术的基本原理 类似于DNA的 天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两 端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成: 模板DNA的变性:模板DNA经加 热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或 经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮 反应作准备; 模板DNA与引 物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃ 左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合; 引物的延伸:DNA模板--引物结合 物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反 应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板 DNA 链互补的半保留复制链。重复循环变性--退火--延伸三过程,就可获得更多 的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循 环需 2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。到达平台期 (Plateau)所需循环次数取决于样品中模板的拷贝。
分子克隆(clone,cloned,cloning) 在生物体外用重组技术将特定基因插入载体分子中.将DNA片段(或基因)与载体 DNA分子共价连接,然后引入寄主细胞,再筛选获得重组的克隆,按克隆的目 的可分为DNA和cDNA克隆两类。
Cloning vectors (克隆载体):在基因工程重组DNA技
育,形成DNA-蛋白质复合物,电泳后用放射性自显影技 术可以确定DNA条带的位置,从而确定它与蛋白质是否 结合。
A DNA bound with more than one protein to form a larger complex.
PCR的原理和操作过程ppt课件
PPCCRR反过应程条件95℃
PCR的特点
1
2
3
高温变性 低温退火 适温延伸
94
温
度 72
(℃)
55
22
DNA 2
形 成
条变
子链延伸
单性
DNA加倍
链
DNA单链
与引物复性
DNA双螺旋
重复1~3步 25~30轮
目的DNA片段 扩增100万倍以上
1第一轮2 扩增3
4
5
时间(min)
ppt精选
6
退 火 PCR的基本原理
3扩增 在PCR仪上设置PCR反应参数(具体数据根
据引物和扩增片段的大小而定):94℃下加热4分钟左右 ;依次94℃变性1分钟,45℃退火1分钟,72℃延伸2分钟 ,循环32次左右;72℃下保温7分钟,使反应产物扩增充 分
4PCR扩增产物分析 PCR产物是否为特异性扩增,
其结果是否可靠,必须对其进行严格的分析与鉴定,才能 得出正确的结论。PCR产物的分析,可依据研究对象和 目的不同而采用不同的分析方法
PCR过程 PCR的特点
第4轮扩增
ppt精选
12
PCR的特点
PCR 的特点
• 灵敏度高
1. 皮克(pg=10-12)量级扩增到微克(ug=10-6)水平
2. 能从100万个细胞中检出一个靶细胞
3. 病毒检测的灵敏度可达3个RFU 4. 细菌检测的最小检出率为3个细菌
1. 简便、快速
1. 一次性加好反应液,2~4 小时完成扩增 2. 扩增产物一般用电泳分析
2. 对标本的纯度要求低
1. 血液、体腔液、洗嗽液、毛发、细胞、活组 织等组织的粗提DNA
ppt精选
pcr原理动画演示
pcr原理动画演示PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种常用的遗传学技术,用于扩增(amplify)DNA的特定片段。
PCR的原理相对复杂,但通过动画演示可以更直观地理解PCR的过程和原理。
首先,我们来看PCR的步骤。
PCR通常包括三个主要的温度循环:变性(denaturation)、退火(annealing)和延伸(extension)。
接下来,我们将通过动画为您展示每个步骤的详细过程。
第一步:变性在此步骤中,PCR反应混合物中的DNA双链被加热至高温,一般在94至98°C之间。
这个高温会断裂DNA双链,使其变为两个单链DNA。
动画展示:我们可以看到,在高温下,DNA的双链会逐渐分离,形成两个单链的DNA。
这个过程被称为变性,由于DNA的融点会根据序列的碱基配对程度而变化,所以需要根据目标DNA片段的融点来确定变性温度。
第二步:退火在PCR反应中,我们需要引入引物(primers),它们是特异性序列的DNA片段,可与目标DNA序列的两端碱基配对。
退火步骤的设计温度通常在50至65°C之间,具体取决于引物的特异性与引物之间的相互作用。
动画展示:在这一步骤中,温度被降至适合引物与目标DNA序列结合的退火温度。
引物结合到目标DNA的两端,并形成引物-目标DNA的复合物。
第三步:延伸在PCR反应中,我们引入了DNA聚合酶(DNA polymerase),它能够读取引物与目标DNA序列结合的起始点,并沿着DNA模板链合成新的DNA链。
此过程在温度约为72°C时进行,这是DNA聚合酶的最适温度。
动画展示:在延伸步骤中,DNA聚合酶通过读取引物与目标DNA序列结合的位置,沿着DNA模板链合成新的DNA链。
这一步完成后,DNA中的目标序列将得到扩增。
通过多次循环这三个步骤(变性、退火和延伸),PCR反应可以产生大量的特定DNA片段。
每个循环都会产生两倍的目标DNA,因此,经过足够多的循环,我们可以从初始数量极少的DNA分子扩增到数量足够进行进一步分析的水平。
PCR技术的原理及其应用 ppt课件
2021/3/26
PCR技术的原理及其应用 ppt课件
2021/3/26
PCR技术的原理及其应用 ppt课件
7
模板:模板核酸的量与纯化程度,是PCR成败与否的关键 环节之一。传统的DNA纯化方法通常采用SDS和蛋白酶K 来消化处理标本。SDS的主要功能是: 溶解细胞膜上的 脂类与蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜,并解离 细胞中的核蛋白,SDS 还能与蛋白质结合而沉淀; 蛋白 酶K能水解消化蛋白质,特别是与DNA结合的组蛋白,再 用有机溶剂酚与氯仿抽提掉蛋白质和其它细胞组份,用
2021/3/26
PCR技术的原理及其应用 ppt课件
6
酶浓度:催化PCR反应约需酶量1ul(总反应体系为100ul时), 浓度过高可引起非特异性扩增,浓度过低则合成产物量减少。
dNTP的质量与浓度:注意4种dNTP的浓度要相等(等摩尔配 制)。如其中任何一种浓度不同于其它几种时,就会引起错 配;浓度过低又会降低PCR产物的产量。dNTP能与Mg2+结 合,使游离的Mg2+浓度降低。
12
反向PCR的不足:
①需要从许多酶中选择限制酶,或者说必须选择一种 合适的酶进行酶切才能得到合理大小的DNA片段。这 种选择不能在非酶切位点切断靶DNA;
②大多数有核基因组含有大量中度和高度重复序列, 而在YAC或Cosmid中的未知功能序列中有时也会有这 些序列,这样,通过反向PCR得到的探针就有可能与多 个基因序列杂交。
PCR原理 ppt课件
医学课件
20
• 在脉冲电泳中,电场方向是周期变化的,头一 个脉冲电场方向与核酸的移动方向成45 ℃角, 下一个脉冲的电场方向与核酸移动方向在另一 侧成45 ℃角,由于加在琼脂糖凝胶电泳上的 电场方向、电流大小、以及作用时间都在交替 地变换着,这就使得DNA分子必须随时调整其 泳动的方向,来适应凝胶孔隙的无规则变化。 与分子量小的DNA分子相比,分子量大的 DNA分子需要较多的次数来更换其构型和方位, 使之能够按新的方向游动,所以迁移率就慢, 从而达到了分离大分子量DNA分子的目的。
(1min)
循环3
时间(min)
PCR反应的温度循环周期
PCR 反应的每一个温度循环周期都是由DNA变性、引
物退火和反应延伸三个步骤完成的。图中设定的反
应参数是94℃变性1min, 60 ℃退火1min, 72 ℃
延伸1.5min。如此周而复始,重复进行,直至扩增
产物的数量医满学课足件 实验需求为止。
26
Reaction Condition for a Typical PCR Assay
Parameter Concentration
Template pH dNTPs Gelatin Primers Mg2+ oncentration Enzyme Total volume
10 attomoles(~1×106 molecules) 8.4(10mM Tris-Hcl) 200 μM(each one)
Thermus aquaticus strain YT1 94 kd 72--80℃
150 nucleotides/sec/molecule >50% at 95℃ for 40 min 1.1×10-4 substitutions per cycle
PCR技术原理简介 PPT
基本原理
变性(denaturation):通过加热使DNA双螺旋氢
键断裂,双链解离成单链DNA 模板
模板
基本原理
退火(annealing):当温度降低时由于模板分子结
构较引物复杂得多,而且反应体系中引物DNA量大大多于 模板DNA,使引物和其互补的模板在局部形成杂交链,而 模板DNA双链之间互补的机会较少
目的DNA片段 扩增100万倍以上
1
2
3
4
5
时间(min)
PCR流程
PCR完成后,取1-2ul性琼脂糖凝胶电泳检测,理想结果是 目的基因扩增条带单一,片段长度与预期相符合,条带清 晰。
2、在临床医学上的应用
①病原体诊断:利用PCR可以检测标本中的各种病毒、 细菌、真菌、支原体、螺旋体、寄生虫等病原体;标 本可以是组织、细胞、血液、排泄物等。
反应体系
引物设计的原则:
引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不 佳, G+C 过多易出现非特异条带。四种碱基分布最好 是随机的,不要有聚嘌呤或聚嘧啶的存在。 Tm值最好接近72℃:以使复性条件最佳。Tm一般低于有 效启动温度5~10℃,也可按公式Tm=4(G+C)+2(A+T)估计 Tm值。 碱基要随机分布,不要有聚嘌呤或聚嘧啶的存在,尤其 是3’端不应超过3个连续的G或C。 4. 引物自身不能有连续4个碱基互补,否则引物自身会折 叠成发夹结构影响引物本身复性。
10-25mmol/L
Tris-HCl
KCl 50mmol/L
1.5mmol/L
MgCl2
明胶或牛血清白蛋白
100ug/ml
Mg2+对PCR扩增的特异性和产量有显著的影响,在一般的 PCR反应中,各种NTP浓度为200umol/L时,Mg2+浓度为1.5~ 2.0 mmol/L为宜。Mg2+浓度过高反应特异性降低,出现非特 异扩增; 浓度过低会降低 Taq DNA聚合酶的活性,使反应