蛋白结晶技术课件

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蛋白质晶体结晶技术

蛋白质晶体结晶技术

结晶剂
• 对于蛋白质的结晶,结晶剂的作用主要在于对溶剂水的影 响而非对蛋白质分子的影响。一般来讲,结晶剂主要分为 6 类: • ①盐类,如:磷酸盐、硫酸铵等; • ②高分子直链聚合物,如:聚乙二醇PEG、聚乙烯醇PVA、 聚乙烯吡咯烷酮PVP 等; • ③小分子多元醇MPD 类,如:2-甲基2,4-戊二醇; • ④有机溶剂类,如:乙醇、甲醇、丙酮、异丙醇、叔丁醇 等; • ⑤磺酰类染料; • ⑥去离子水。在实际工作中,通常使用混合结晶剂以获得 更好的实验效果。
• 蛋白质结晶的基本方法
• 结晶的方法分3 种:批量结晶、蒸发扩散结 晶、液/液扩散结晶。
• ①批量结晶。批量结晶是最古老和最简单 的蛋白质结晶方法。它将所要结晶的蛋白 质与结晶剂按要求的浓度在实验开始时, 就混合起来以达到所要的过饱和度。实验 样液的体积在50 μL~几个毫升左右。 由于批量结晶的样液体积较大,所以此法 并不适于对最佳结晶条件的探索实验。一 种改进的方法叫微量分批结晶技术。
• ③温度。温度的变化会引起蛋白质溶解度 的改变。研究表明,大多数的蛋白质的结 晶是在4~22 ℃温度范围内进行。某些蛋白 质的盐溶液在低温时的溶解度趋向升高, 而在聚乙二醇及甲基丙二醇 溶剂中的溶解 度随温度降低而降低。
• ④pH 值。蛋白质为两性物质,结晶体系pH 值的变化对其结晶行为有着重要的影响。 对于有些蛋白质分子如:E.coli 的闭环腺苷 酸激酶,如果不考虑所得晶体的晶型,则 结晶可在较宽的pH 值范围内进行,但是如 果涉及特定的晶型,则对pH 值的要求非常 严格,通常其波动范围不超过1。一般来讲, 越靠近最佳pH 值,晶型越单一,所得晶体 质量越高。

蛋白质结晶

蛋白质结晶

1.3 结晶方法(Crystallization Techniques)

1.3.1 分批结晶(Batch Crystallization) 这是最老的最简单的结晶方法,其原理是同步地在蛋白质溶液中加入沉淀剂,立即使溶液达到一个高过饱和状态。幸运的话,不需进一步处理即可在过饱和溶液中逐渐长出晶体。一个用于微分批结晶的自动化系统已被Chayen等人设计出(1991,1992),其微分批方法中,他们在1-2μl包含蛋白质和沉淀剂的液滴中生长晶体。液滴被悬浮在油(如石蜡)中,油的作用是作为封层以防止蒸发,它并不干扰普通沉淀剂,但是干扰能溶解油的有机溶剂(Chayen, 1997; see also Chayen, 1998)。

1.3.2 液-液扩散(Liquid–Liquid Diffusion) 这种方法中,蛋白质溶液和含有沉淀剂的溶液是彼此分层在一个有小孔的毛细管中,一个测熔点用的毛细管一般即可(如图1.2)。下层是密度大的溶液,例如浓硫酸铵或PEG溶液。如果有机溶剂如MPD被用作沉淀剂,它会在上层。以1:1混合,沉淀剂的浓度应该是所期最终浓度的二倍。两种溶液(各自约5μl)通过注射器针头导入毛细管,先导入下层的。通过一个简易的摇摆式离心机去除气泡。再加入上层,进而两层之间形成一个明显的界面,它们会逐渐彼此扩散。Garc´?a-Ruiz and Moreno (1994)已经发展液-液扩散技术至针刺法。蛋白质溶液通过毛细力被吸入狭窄的管中,管的一端是封闭的。接着,开放端被插入置于小容器的凝胶中,凝胶使得管竖直,蛋白质溶液与凝胶接触。含有沉淀剂的溶液被倒在凝胶上,整个装置被保存于封闭的盒子以防蒸发。沉淀剂通过凝胶和毛细管的扩散时间可以由毛细管插入凝胶的深度控制,从而蛋白质溶液中即可形成过饱和区域,毛细管底部高而顶部低。这也可作为一个筛选最佳结晶条件的额外信息。

蛋白质结晶

蛋白质结晶

1.3 结晶方法(Crystallization Techniques)

1.3.1 分批结晶(Batch Crystallization) 这是最老的最简单的结晶方法,其原理是同步地在蛋白质溶液中加入沉淀剂,立即使溶液达到一个高过饱和状态。幸运的话,不需进一步处理即可在过饱和溶液中逐渐长出晶体。一个用于微分批结晶的自动化系统已被Chayen等人设计出(1991,1992),其微分批方法中,他们在1-2μl包含蛋白质和沉淀剂的液滴中生长晶体。液滴被悬浮在油(如石蜡)中,油的作用是作为封层以防止蒸发,它并不干扰普通沉淀剂,但是干扰能溶解油的有机溶剂(Chayen, 1997; see also Chayen, 1998)。

1.3.2 液-液扩散(Liquid–Liquid Diffusion) 这种方法中,蛋白质溶液和含有沉淀剂的溶液是彼此分层在一个有小孔的毛细管中,一个测熔点用的毛细管一般即可(如图1.2)。下层是密度大的溶液,例如浓硫酸铵或PEG溶液。如果有机溶剂如MPD被用作沉淀剂,它会在上层。以1:1混合,沉淀剂的浓度应该是所期最终浓度的二倍。两种溶液(各自约5μl)通过注射器针头导入毛细管,先导入下层的。通过一个简易的摇摆式离心机去除气泡。再加入上层,进而两层之间形成一个明显的界面,它们会逐渐彼此扩散。Garc´?a-Ruiz and Moreno (1994)已经发展液-液扩散技术至针刺法。蛋白质溶液通过毛细力被吸入狭窄的管中,管的一端是封闭的。接着,开放端被插入置于小容器的凝胶中,凝胶使得管竖直,蛋白质溶液与凝胶接触。含有沉淀剂的溶液被倒在凝胶上,整个装置被保存于封闭的盒子以防蒸发。沉淀剂通过凝胶和毛细管的扩散时间可以由毛细管插入凝胶的深度控制,从而蛋白质溶液中即可形成过饱和区域,毛细管底部高而顶部低。这也可作为一个筛选最佳结晶条件的额外信息。

蛋白质结晶

蛋白质结晶

1895年,著名的德国物理学家伦琴发现了 X射线; 1912年,德国物理学家劳厄等人发现了X 射线在晶体中的衍射现象,确证了 X射线是一 种电磁波。
1912年,英国物理学家Bragg父子利用X 射线衍射测定了NaCI晶体的结构,从此开创了 X射线晶体结构分析的历史。
X射线的性质
X射线的物理基础
1. X射线是一种电磁波,具有波粒二象性;
Байду номын сангаас
佩鲁茨(Max Ferdinand Perutz),英国生物化学家。 1947年他与肯德鲁合作,在剑桥创办医学研究理事 会分子生物学组。他们进行血红蛋白的研究,肯德 鲁分工研究肌血红蛋白分子结构,佩鲁茨研究血红 蛋白。因佩鲁茨对球蛋白,特别是血红蛋白的结构 进行X射线衍射分析,而与肯德鲁共获1962年诺贝 尔化学奖。
2. X射线的波长: 10-2 ~ 102 Å 3. X射线的 ( Å)、振动频峰 和传播 速度C(m· s-1)符合
=c/
X射线的性质
X射线的物理基础
4. X射线可看成具有一定能量E、动量P、质 量m的X光流子 E = hv P=h/ h 为普朗克常数,h = 6.62617610-27尔格, 是1900年普朗克在研究黑体辐射时首次引 进,它是微观现象量子特性的表征。
X射线的性质
X射线的物理基础
• X射线具有很高的穿透能力,可以穿过黑纸 及许多对于可见光不透明的物质; • X射线肉眼不能观察到,但可以使照相底片 感光。在通过一些物质时,使物质原子中的 外层电子发生跃迁发出可见光;

蛋白质结晶技术的发展及应用

蛋白质结晶技术的发展及应用

蛋白质结晶技术的发展及应用蛋白质是构成细胞的基本单位之一,也是许多生物学过程的重

要组成部分。研究蛋白质结构对于理解生物学过程以及开发新药

具有重要的意义。蛋白质结晶技术是研究蛋白质结构的重要方法

之一,其发展历程与应用价值备受期待。

一、蛋白质结晶技术的发展历程

蛋白质结晶技术的起源可以追溯到20世纪初期。当时科学家

们就开始尝试将蛋白质结晶,并了解蛋白质分子之间的相互作用。但是由于许多蛋白质结构复杂多样,特别是含有金属离子的蛋白

质很难结晶,技术的发展缓慢。

到了20世纪60年代,发展了一种新的结晶策略,将蛋白质溶

解在含有结晶助剂的溶液中。这种策略被称为“溶液结晶法”(sitting drop method)。然而,这种方法的成功率并不高,并且

需要使用大量的蛋白质溶液。

1971年,S. Sheriff等人提出了一种新的结晶方法,即“磷酸盐

缓冲液结晶法”(phosphate-buffered saline method),该方法不需

要使用大量的溶液,成功率也有所提高。之后又出现了一系列技

术革新,包括磁悬浮、微重力、蛋白质工程等技术的应用,为蛋

白质结晶技术的发展注入了新的动力。

二、蛋白质结晶技术的应用领域

蛋白质结晶技术在药物研发、生物制药、生物晶体学等领域都

有重要的应用。

在药物研发方面,通过分析药物与蛋白质的作用机制,研究药

物与蛋白质的相互作用方式,设计出更优的药物分子结构。例如,阿司匹林就是通过对蛋白质结晶技术的研究,设计出来的一种治

疗药物。

在生物制药方面,蛋白质结晶技术可以帮助研究人员了解蛋白

蛋白质结晶实验步骤大全(精华版)

蛋白质结晶实验步骤大全(精华版)

蛋白质结晶实验步骤大全(精华版)

实验准备

1. 确定实验所需蛋白质样品的来源和纯度要求。

2. 购买或制备实验所需的溶液和试剂,包括缓冲溶液、盐溶液、浓缩剂等。

蛋白质提取与纯化

1. 根据蛋白质样品的特性选择合适的提取方法,如机械破碎、

超声波处理等。

2. 使用离心和过滤等技术将蛋白质从细胞或组织中提取出来。

3. 进行柱层析、凝胶电泳或其他纯化技术,使蛋白质得到进一

步纯化。

结晶条件筛选

1. 根据蛋白质的特性和实验要求,选择合适的结晶试剂和条件,包括pH值、温度、结晶剂浓度等。

2. 进行初步筛选实验,尝试不同的结晶试剂和条件组合,评估

结晶效果。

结晶试验

1. 准备结晶试剂和蛋白质溶液,注意维持合适的pH值和溶液浓度。

2. 使用结晶试剂和蛋白质溶液进行配比和混合,形成结晶试验样品。

3. 使用冷却、蒸发、扩散等方法,控制结晶样品的结晶速度和形态。

4. 观察结晶样品的形态和大小,记录结晶的质量和数量。

结晶收获和后续处理

1. 使用过滤、离心等方法,将结晶与溶液分离。

2. 进行洗涤和干燥,去除残留的溶液和杂质。

3. 对得到的蛋白质结晶进行特性分析,包括晶体学分析、质谱分析等。

结果分析和文档记录

1. 分析结晶试验结果,评估结晶效果和纯度。

2. 记录实验步骤、所用试剂和条件、观察结果等重要信息。

3. 撰写结晶实验报告,包括实验目的、方法、结果和结论等内容。

请注意,本文档提供的是蛋白质结晶实验的常用步骤,具体实验过程可能需要根据实验目的和样品特性进行调整。

蛋白质结晶机制解析解读

蛋白质结晶机制解析解读

蛋白质结晶机制解析解读

蛋白质是生命中最基本的分子之一,它们在细胞中扮演着

重要的功能角色。为了更好地理解和研究蛋白质的结构与功能,科学家们发展出了一种重要的方法——蛋白质结晶。蛋白质结晶是指将溶解在溶液中的蛋白质分子通过调节溶液条件,使其逐渐形成周期性排列的晶体结构。这种结构能够提供蛋白质的高分辨率三维结构信息,有助于我们深入了解蛋白质的生物功能和疾病机制。

蛋白质结晶的过程首先要经历两个关键的步骤:核心形成

和晶体生长。核心形成是指在溶液中形成蛋白质分子的有序核心。在特定的条件下,蛋白质分子会聚集在一起,形成一个小的晶核。晶核的形成是结晶过程中的关键一步,它决定了晶体的数量和品质。而晶体生长则是指晶核的进一步生长和扩散。晶核中的蛋白质分子会吸附溶液中的其他蛋白质分子,导致晶体逐渐增大。

蛋白质结晶的成功与否取决于多种因素,包括溶液成分、

温度、pH值、离子强度等。其中,溶液成分是影响蛋白质结

晶的最重要因素之一。一般来说,蛋白质在饱和溶液中结晶的能力较弱,需要通过添加剂的方式来提高结晶效率。添加剂常用的成分包括盐类、缓冲剂和有机溶剂等。盐类可以通过屏蔽蛋白质表面带电荷,减小蛋白质分子之间的静电斥力,从而有利于结晶的形成。缓冲剂可以调节溶液的pH值,使蛋白质保

持在最适宜的结晶条件下。有机溶剂则可以改变溶液的极性和表面张力,有助于蛋白质分子在溶液中的聚集。

此外,温度对蛋白质结晶也有重要影响。一般来说,较低

的温度有利于结晶体的生成。低温下,蛋白质分子的热运动减弱,有利于蛋白质分子在溶液中的有序排列。然而,温度过低

生物化学中的蛋白质结晶技术

生物化学中的蛋白质结晶技术

生物化学中的蛋白质结晶技术蛋白质是生命体中的基本成分之一,它具有多种生理功能,为人类提供了许多重要的物质基础。蛋白质结晶技术在生物化学和生物技术领域中起着重要的作用,可用于研究蛋白质的结构、功能和作用机制,有助于人们更好地理解生命体系的运行规律,并为新药研发提供重要的帮助。

蛋白质结晶技术是研究蛋白质结构和功能的重要手段之一,其目的是将蛋白质分子在水溶液中纯化后,使其在一定条件下形成晶体。通过晶体的形成,可以对蛋白质进行X射线衍射分析,进而确定蛋白质的精确定位、三维结构等重要信息,为进一步的研究蛋白质的功能和作用机理提供了强有力的支持。

目前,蛋白质结晶技术已经成为研究生物大分子结构和功能的主要手段之一,应用范围涵盖了基础研究、新药研发、生物技术等众多领域。但是,由于蛋白质的结晶是一个高度复杂的过程,受到多种因素的影响,因此在实际研究中还存在诸多技术难题和挑战。

在实际应用中,蛋白质结晶技术的效率和成功率受到多种因素的制约,例如蛋白质的物理化学特性、溶液条件、结晶温度、pH

值等因素都会对结晶效果产生影响。针对这些挑战,科学家们正

在不断努力,通过改变蛋白质的化学性质、调整溶液成分、选择

合适的晶种等方法,逐步攻破结晶技术面临的难关。

近年来,随着科技的进步和传统结晶技术的不断更新升级,新

型蛋白质结晶技术也不断涌现。例如,基于DNA结合蛋白的结晶

技术、以及通过引入有机小分子来辅助结晶的“串联结晶”技术等,都为蛋白质结晶技术的进一步发展提供了新的思路和方法。

总之,蛋白质结晶技术是研究蛋白质结构和功能的重要手段之一,在生物化学和生物技术领域中具有广泛的应用价值。在未来

蛋白质晶体结构解析

蛋白质晶体结构解析
考虑到已建立的立体化学资料(如键长,键角等)的限制,根 据X射线衍射数据对初始的蛋白质分子模型进行修正。
wk.baidu.com
电镜技术
近年来电镜尤其是单颗粒冷冻电镜三维重构 技术的发展使得人们能够更方便地研究分子 量在 150 kD 以上的生物大分子,其分辨率 能够到达 3 Å~4 Å。
2
专门存储蛋白质和核酸分子结构的蛋白质数据库中,接近90% 的蛋白质结构是用X射线晶体学的方法测定的。
大约9%的已知蛋白结构是通过核磁共振技术来测定的。该技 术还可用于测定蛋白质的二级结构。
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这个过程可以分为两步: 旋转(rotation)和平移(translation)。 在旋转步骤中,将计算并决定已知蛋白与未知蛋白在空间上的 相对取向。在平移过程中,需要通过计算将已知蛋白结构平 移到与未知蛋白一致的位置。 其过程如图所示:
14
15
2.3.3反常散射法 当入射的光子的能量足够高的时候,尤其是射线的波长接近
16
2.4相位的优化
从实验数据中得到了结构因子的振幅强度,然后通过各种方法 得到了结构因子的相位,有了振幅和相位就可以通过变化计算出电 子密度图。电子密度图是晶体结构分析的直接结果,它包含了结构 的全部信息。
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溶剂扁平化法是基于误差扰动产生的蛋白质“溶剂”区应该 到处都一样的原理。使用这个方法的关键是要找出蛋白质和“溶 剂”区的交界面,需要预先告知程序晶体的含水量,这样等相关 程序会自动抹平“溶剂”区。这一步骤可通过程序反复多次,直 到计算电子密度图的相位收敛为止。

蛋白质晶体结构解析

蛋白质晶体结构解析
考虑到已建立的立体化学资料(如键长,键角等)的限制,根 据X射线衍射数据对初始的蛋白质分子模型进行修正。
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这个过程可以分为两步: 旋转(rotation)和平移(translation)。 在旋转步骤中,将计算并决定已知蛋白与未知蛋白在空间上的 相对取向。在平移过程中,需要通过计算将已知蛋白结构平 移到与未知蛋白一致的位置。 其过程如图所示:
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2.3.3反常散射法 当入射的光子的能量足够高的时候,尤其是射线的波长接近
冷冻电子显微技术是近年来兴起的一种获得低分辨率(低于5 埃)蛋白质结构的方法,该方法最大的优点是适用于大型蛋白质 复合物(如病毒外壳、核糖体和类淀粉蛋白纤维)的结构测定。
3
2. X射线晶体衍射法 测定蛋白质结构的基本过程
1.蛋白质结晶 2. 数据收集 3. 相位的测定 4. 相位的优化 5. 电子密度图的解释 6. 修正
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2.3相位的测定
在晶体中一个不对称单元中有多个相同的蛋白质分子时,一 些有价值的分子之间堆积的信息可直接从结构振幅计算得出,而 不必要预先知道任何相位信息。 晶胞中分子堆积的这类基本信息对解决一些疑难的相位问题会有 很大的帮助,下面分别介绍获得相位信息的3种主要方法:
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2.3.1单对或多对同晶置换法 同晶置换法是由20世纪50年代发现的可以用于求解蛋白
一套好的衍射数据是晶体结构分析的基础,衍射数据的好 坏直接涉及结果的精密。而一套好的衍射数据又与晶体的好坏、 X射线源的强度以及收集数据的仪器和方法有关。

生物制药中的蛋白质结晶技术

生物制药中的蛋白质结晶技术

生物制药中的蛋白质结晶技术随着现代医学的不断发展,越来越多的疾病可以治愈或者控制。这得益于现代医药技术的快速发展。生物制药是近年来发展迅速

的一种新型医药,其产品原材料多为蛋白质。而生物制药中的蛋

白质结晶技术则是生产过程中的一个重要组成部分。

一、什么是蛋白质

蛋白质是一种重要的生命分子,广泛存在于自然界中。它们在

生命体内具有多样化的功能,如传递信息、参与代谢、形成肌肉等。蛋白质作为生物制药的原材料,它具有很高的特异性和生物

活性,可以抑制疾病,帮助患者恢复健康。

二、蛋白质结晶技术

蛋白质结晶技术是生物制药中蛋白质制备的一个重要工艺环节。它是利用物理化学方法使蛋白质分子在水溶液中自组装成晶体,

这样的晶体具有结构完整、纯度高、生物活性好的特点,方便后

续的纯化和工艺处理。通过蛋白质结晶可以大大提高药物的纯度

和质量,同时减少工艺污染和制剂成本。

三、蛋白质结晶技术的挑战

蛋白质结晶技术比较困难,涉及到许多因素。首先,蛋白质结

晶需要特定的物理和化学环境。其次,蛋白质分子极易受到氧化、水解、剪切和聚集等因素的影响,进而降低产量和纯度。此外,

不同蛋白质之间的性质差异也可能导致结晶条件的不同。因此,

寻找合适的结晶方法是个复杂的过程。

四、蛋白质结晶技术的发展趋势

随着现代科学技术的飞跃发展和不断的探索,蛋白质结晶技术

也在不断地完善和改进。例如,在结晶方面,研究人员通过筛选

结晶条件的方式来提高蛋白质的结晶成功率和质量。在加速结晶

方面,使用进阶的控制晶体生长方式和处理结晶表面的方法可加

速结晶的过程。这些新颖且创新的方法将助力蛋白质结晶技术快

蛋白质结晶和蛋白质晶体学方法

蛋白质结晶和蛋白质晶体学方法

蛋白质结晶和蛋白质晶体学方法蛋白质是生命体内最重要的分子之一,也是药物研发、生命科学、工业等众多领域的研究热点。而对于研究蛋白质,关键的一

步就是蛋白质的结晶和晶体学研究。

什么是蛋白质结晶?

蛋白质结晶指将溶解在水中的蛋白质在特定的条件下,使其形

成一定大小的晶体,以便使用X射线晶体学等技术进行分析结构。通常情况下,蛋白质结晶需要满足以下条件:溶液中需要有足够

浓度的蛋白质分子;结晶试剂可以形成稳定的络合物,可以帮助

蛋白质分子快速结晶;结晶条件需要控制好pH、温度、离子强度

等因素。

蛋白质晶体学方法

蛋白质晶体学方法是一种通过分析蛋白质晶体的结构来了解蛋

白质内部结构、功能和作用方式的研究方法。最常用的是X射线

晶体学方法。利用X射线照射蛋白质晶体,通过测定射线衍射图

案来确定蛋白质的结构。其它方法包括核磁共振(NMR)方法、

电子显微技术及光学方法等。

挑战和发展

蛋白质结晶和晶体学研究仍然是一个充满挑战的领域。一方面,很多蛋白质很难结晶或者很难得到足够质量的结晶。另一方面,

即使蛋白质结晶,其结构分析也需要复杂的处理和计算步骤,需

要强大的计算机能力和足够的数据存储空间。更进一步,目前蛋

白质晶体学方法虽然已经有了很大的进步和发展,但仍然存在一

些不确定性和局限性,例如确定结晶的完整性和误差,以及判断

蛋白质在溶液中的行为等问题。

虽然蛋白质结晶和晶体学研究仍然存在挑战和局限性,但是众

多研究者依然在探索新的技术和方法,以期在研究蛋白质结构和

功能方面达到更深入的了解。未来的一些新技术,如X射线自由

电子激光,以及更加稳定的冷冻电镜技术,都有望在蛋白质结晶

蛋白结晶的原理 -回复

蛋白结晶的原理 -回复

蛋白结晶的原理 -回复

蛋白结晶的原理是利用物质的溶解和结晶性质来将蛋白质分子从溶液中抽取并形成有序的晶体。

在蛋白结晶过程中,需要控制溶液的温度、pH、离子浓度、蛋白浓度和添加剂等因素,以促使蛋白质分子在溶液中形成有序的结构。一般而言,蛋白质结晶的过程包括几个主要步骤:

1. 增溶:将蛋白质分子从晶体中释放至溶液中,通常采用高渗溶液或添加较高浓度的盐类来实现增溶。

2. 溶液调控:通过调节溶液的温度、pH和离子浓度等参数,控制蛋白质在溶液中的相对稳定状态,使其有利于结晶。

3. 成核:在溶液中引入一定程度的过饱和度,促使蛋白质分子在局部范围内形成小的结晶核心。

4. 结晶生长:在形成的晶核基础上,通过晶体生长、蛋白质分子的结晶扩散、重排等过程,使晶体逐渐生长为可观察到的大晶体。

蛋白结晶的原理在很大程度上取决于蛋白质的结构和性质,以及溶液的配方和工艺条件的优化。不同的蛋白质可能需要不同的结晶条件才能获得高质量的晶体。结晶是蛋白质研究和应用中非常重要的技术,可用于蛋白质结构解析、药物研发、工业生产等领域。

2-3-蛋白质的结晶

2-3-蛋白质的结晶

对蛋白质来讲,结晶作用还有另外两个重要的 意义: 1.作为一个稳定贮存方法 2.供X光衍射分析用
一、基本原理
蛋白质结晶原理与一般的小分子类似。不同的是, 蛋白质分子的不稳定性和敏感性较大,必须维持 其基本水合状态,处于或接近生理pH及温度。保 持蛋白质分子的天然状态对蛋白质的结晶至关重 要。
(八)沉淀剂
沉淀剂可改变蛋白质的溶解度。
盐类和各种有机溶剂都可用作沉淀剂。
大多数盐类影响蛋白质的溶解度是通过盐析或 盐溶作用。 近年发现两种有机物是理想的使蛋白质结晶的 物 质 : 聚 乙 二 醇 (PEG) 和 2- 甲 基 -2, 4- 戊 二 醇 (MPD)。
(九)其它
有的蛋白质或酶不易结晶,如胰凝乳蛋白酶。 但如果加入微量的胰凝乳蛋白酶结晶,常常可导 致大量结晶的出现。有时用玻璃棒轻轻磨擦器壁, 也能促进结晶的形成。
从浓盐溶液中结晶,形成晶核的时间短(几小 时),但结晶生长较慢(数周、数月)。 但也有例外,牛肝过氧化氢酶从盐溶液中形成大 的单晶只需12-24小时。 结晶大小与结晶时间、结晶条件有关。大晶体通 常是在生长较慢的情况下得到的。
(五)pH值
pH不仅影响晶体的大小,也影响晶体的形状。 因为很多蛋白质对pH非常敏感,有时,无定形 沉淀、微晶和大单晶之间的pH差别只有0.2 pH 单位,或者更小,因此,必须选定恰当的缓冲液。 结晶溶液的pH值一般应选择在被结晶蛋白质的 等电点附近,这样有利于结晶的析出。

蛋白质结晶的分析与设计

蛋白质结晶的分析与设计

蛋白质结晶的分析与设计

蛋白质是生命体的重要组成部分,其结晶是研究蛋白质结构和功能的重要手段。蛋白质的结晶性状与其分子结构、环境条件、通用结晶方法等相关,因此,为了获得高质量的蛋白质晶体,需要进行结晶条件的优化和适合的设计。本文将详细介绍蛋白质结晶的分析与设计,包括蛋白质晶体形成机制、影响蛋白质结晶的因素以及蛋白质结晶的设计方法。

一、蛋白质晶体形成机制

蛋白质晶体的形成是一个动态的过程,涉及到许多物理和化学反应。最重要的是,蛋白质晶体的形成机制是蛋白质的分子结构,它由其氨基酸序列的物理性质和化学性质决定。由于蛋白质的溶解度和晶体质量受结晶温度和溶液pH值的影响,

因此控制结晶温度和溶液pH值对于获得优质晶体非常重要。

二、影响蛋白质结晶的因素

1. 蛋白质分子结构:蛋白质分子的完整性和结构稳定性对晶体生长非常关键。

通常,具有规则二级结构的蛋白质分子比那些不规则的蛋白质更容易结晶。

2. 溶液pH:溶液pH值对蛋白质的溶解度、空间构象、电荷状态以及交互作用等都有影响,较适当的pH值有助于晶体生长。

3. 结晶温度:一定范围内温度的变化对晶体生长速率、结晶度和结晶质量都有

不同影响。

4. 溶剂:通常是水、有机溶剂或者它们的混合物,水对生命体的一切沟通和交

换起着基础性的作用,因此水简单易得,伴随着蛋白质分子而作为解离极化的内置溶剂具有极大的亲和力。

5. 金属离子的存在:金属离子能够通过化学反应或者静电作用与蛋白质分子发

生作用,从而影响晶体生长。

三、蛋白质结晶的设计方法

1. 逆向结晶法:首先预测蛋白质的二级结构,然后设计对应的结晶缓冲溶液,

生物晶体学和蛋白质结晶的技术和应用

生物晶体学和蛋白质结晶的技术和应用

生物晶体学和蛋白质结晶的技术和应用

生物晶体学是指利用晶体学的方法研究生物大分子(如蛋白质、核酸等)的结构和性质的科学分支。而蛋白质结晶则是在生物晶体学中最为核心,也是最重要的一个部分。

一、蛋白质结晶的历史和发展

蛋白质结晶的历史可以追溯至19世纪末,当时科学家们就开始利用显微镜观察蛋白质结晶。而直到20世纪初,随着X射线晶体学的兴起,人们才开始用X射线衍射技术研究蛋白质结晶。尽管如此,由于蛋白质的结晶过程相对复杂,因此当时只能成功获取很少的实验数据。

随着电子显微镜、分子生物学技术等的发展,蛋白质结晶技术也出现了可喜的进展。特别是在20世纪后期,由于先进的计算机技术和图像处理技术的应用,蛋白质结晶技术得以取得了很大的突破。如今,蛋白质结晶技术已成为现代生物科学中极其重要的手段之一,其在新药研发、疾病诊断、生物质谱分析等方面也有着广泛的应用。

二、蛋白质结晶的原理和方法

蛋白质结晶是指将蛋白质分子由溶液状态变为晶体状态的过程。中间的过程相对复杂,一般包括表达蛋白质、净化蛋白质、制备试剂和晶体培养等步骤。

在这些步骤中,特别是在晶体培养阶段,有很多不同的方法可以用来促进蛋白质分子合成晶体。例如,常见的方法包括透析结晶法、毒运动法、温度梯度法、界面扩散法、离子交换法等等。

此外,蛋白质结晶的成功与否往往与晶体的质量和稳定性密切相关。因此,为提高晶体的质量,科学家们还发展了一系列晶体加工技术,例如在晶体成长阶段利

用不同的添加剂调整溶液的化学性质、利用超声波震荡或加热等方法来提高晶体的稳定性等等。

三、蛋白质结晶技术的应用

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学习交流PPT
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• 从膜蛋白的水溶液中形成膜蛋白晶体有两种可能 的类型。
学习交流PPT
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第一种类型的晶体一般很小,不能用于高分辨衍射的 研究。
第二类晶体,从图中可以看出,蛋白质分子不能太小, 否则极性区域接触不够。
蛋白质分子的大小无法改变,选择合适的去垢剂分子 成为关键
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• 微量蒸汽扩散法(浓度增加) • 平衡透析法(PH或离子强度) • 一批结晶法(沉淀剂) • 温度梯度结晶法(温度) • 重复结晶法
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• 结晶常用方法
悬滴法
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坐滴法
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Crystal Screen Kit
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• 产品名称 货号 用途备注
• Index Kit HR2-144 用于生物大分子结晶
• Crystal Screen Kit HR2-110 子结晶
用于蛋白质,核酸水溶性小分
• Crystal Screen 2 KitHR2-112
• wizard
• Pegrx 1 HR2-082 用于生物大分子结晶
• Pegrx 2 HR2-084 用于生物大分子结晶
作用来优化晶体生长和改变样品溶解度
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膜蛋白结晶技术
• 膜蛋白可根据膜上的位置和分离的难易分为周边 和本体两类。
• 膜蛋白有疏水和亲水两个部分,其非极性区域倾 向于形成无序化聚合物,需要采用特殊的条件才 能使膜蛋白形成晶体。
• 去垢剂(detergent)本身也像膜脂分子一样的两 亲性结构,可以替代膜脂。
(电荷均一,大小均一)
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蛋白质结晶过程
• 蛋白质结晶过程是一个有序化的过程,即溶液中 无规律的分子转变成有规则排列状态的固体。
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• 影响蛋白质溶解性的因素:
1.离子强度
2.PH和相反离子
3.温度
4.有机溶剂
改变溶液中以上因素可以使蛋白质在溶液中达到 过饱和状态,从而形成晶核,晶核进一步生长成 具有一定空间结构的晶体。
HR2-120
用于完整单抗,单抗片
段以及在低离子浓度下溶解度较低的样品结晶
• Silver Bullet & Silver Bullet Bio HR2-078 和二次结晶
用于生物大分子的初次
• HR2-080
• Peg/Tacsimate Ph5.8 Crystallization Reagent
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主要参考书目
• 卢光莹.《生物大分子晶体学基础 第二版》.北京大 学出版社.
• 梁栋材. 《X射线晶体学基础 第二版》.科学出版社. • Barry s. selinsky. <membrane protein
protocols>.Human Press.
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联系方式
邮箱
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HR2-090
• Peg/Tacsimate Ph 6.8 Crystallization Reagent HR2-092
• Peg/Tacsimate Ph 7.8 Crystallization Reagent HR2-094
• Additive Screen™ HR2-428
利用样品间和样品溶剂间相互
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结晶
• Natrix Kit HR2-116
用于核酸和蛋白核酸复合物的结晶
• Crystal Screen Cyro Kit HR2-122
用于蛋白质,可溶性缩氨酸,
核酸和水溶性小分子的初次低温结晶
• Nucleic Acid Mini Screen Kit HR2-118
Hale Waihona Puke Baidu用于核酸片段的结晶
• Low Ionic Strength Screen
• Peg/Ion Screen Kit HR2-126 用于生物大分子结晶
• Peg/Ion 2 Screen™ HR2-098 用于生物大分子结晶
• Saltrx Kit HR2-108 用于生物大分子结晶
• Membfac Kit 品结晶
HR2-114 用于膜蛋白和溶解度有限的样
• Crystal Screen Lite HR2-128学习交流PP用T 于蛋白质,缩氨酸,核酸的
蛋白质结晶技术
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Background
• 蛋白质的功能是基于蛋白质的三维结构,应用Xray蛋白质的结构需要得到高质量的蛋白质晶体。
• 得到高质量的蛋白质晶体是蛋白质功能研究的瓶 颈,严重制约着蛋白质工程、理性药物设计、合 成疫苗设计等新型生物技术的发展。
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蛋白结晶流程图
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