病毒的分类与命名
《病毒的分类与命名》PPT课件
1999年 根据“Virus taxanomy-1999”、病毒分类系统达到了3个目,62个科。另 外亚病毒感染因子(Subviral agent)下设卫星、类病毒和朊病毒,其中 类病毒分类新设立了2个科,7个属。 2000年 ICTV公布第七个国际病毒分类报告,植物病毒的分类有了非常大的进 展,列出15个植物病毒科、73个植物病毒属,其中已归科的属有49个,未归到科 的属有24个。
病毒(bìngdú)属的命名
病毒(bìngdú)属是一群具有某些共同特征的种。其
属名的词尾“virus”;
但在设立一个新的病毒属时必需有一个同时 被承认的代表种(type species) 。
第十三页,共37页。
病毒科的命名(mìng míng)
病毒科是一群具有(jùyǒu)某些共同特征的属。科名
病毒种的命名由几个有实际意义的词组成,但不应该 只是由宿主(sùzhǔ)名加“virus”构成。
已知的细菌病毒种名就是由数字和字母组成的; 植物病毒种的命名,一般是由宿主名加症状(zhèngzhuàng)名和
“virus”构成。
例如:“T4噬菌体属”
(T4-like viruses)
第十二页,共37页。
第十六页,共37页。
3. 亚病毒感染因子(yīnzǐ)的规则
类病毒种的词尾是“viroid”,属的词尾为“-
viroid”,亚科的词尾是“-viroinae”(只用于需要这一 分类阶元时),科的词尾是“-viroidae”。
逆转座子(retrotransposons)在分类和命名中被 考虑作为病毒(bìngdú)。
第02章病毒的分类与命名
第十章杆状病毒科(Baculoviridae)一、概述二、杆状病毒的基因组结构与功能(一)同源序列区(二)重叠转录物(三)早期转录物(四)晚期转录物(五)基因重组三、病毒蛋白及功能四、状病毒感染的分子机理五、重组杆状病毒表达外源基因六、杆状病毒作为杀虫剂的应用主要参考文献一、概述能够感染昆虫的病毒大约有1200种,它们主要分属于以下四个病毒科:杆状病毒科(Baculoviridae)、呼肠孤病毒科(Reoviridae)、虹彩病毒科(Iridoviridae)和痘病毒科(Poxviridae)。
其中杆状病毒科病毒为数最多,大约有610种,主要感染鳞翅目(Lepidoptera)、双翅目(Diptera)和膜翅目(Hymenoptera)昆虫。
由于杆状病毒具有高度专一的宿主范围,某些昆虫被感染后可发生大规模的流行病,但对人、畜和其他动植物无害,加之病毒粒子包含在蛋白晶体内,在细胞外环境中十分稳定,故可以作为一种生物杀虫剂用于农业害虫防治,目前已有成功应用的实例;由于多角体蛋白的高水平表达,其基因区段可以用来构建重组病毒以高效表达外源基因。
因此,有关杆状病毒的分子生物学,倍受广大生命科学工作者的关注。
1.分类现状杆状病毒可以分为A、B、C三个亚组(Matthews 1982)。
A亚组:核型多角体病毒(Nuclear polyhedrosis virus, NPV),在单一核内蛋白晶体中包藏有许多毒粒。
根据其核壳聚集的程度又可分为单一的(SNPV)和多个的(MNPV)。
B亚组:颗粒体病毒(Granulosis virus, GV),在一般情况下,在蛋白晶体中只包藏有一个毒粒。
C亚组:非包含体杆状核型病毒(Non-Concluded baculovirus),如椰二疣独角仙病毒(Oryctes rhinoceros),无包含体,可能缺少编码晶体蛋白的基因。
2.形态结构杆状病毒的基本毒粒为杆状,本科病毒命名即来自于拉丁字Baculum。
第四章:病毒的命名和分类
二.病毒的命名规则
(一)一般规则: 一般规则:
1.病毒的分类和命名应是国际性的,应普遍 .病毒的分类和命名应是国际性的, 适用于所有病毒; 适用于所有病毒 2. 通用的病毒分类系统采用目,科,亚科, 通用的病毒分类系统采用目 亚科, 属和种的等级制度, 属和种的等级制度 , 在种的命名尚不完善 的情况下, 许多病毒可用国际通用的俗名. 的情况下 , 许多病毒可用国际通用的俗名 .
型别/分离地点 分离序号 分离时间( 年代) 型别 分离地点/分离序号 分离时间 ( 年代 ) 分离地点 分离序号/分离时间 (血凝素和神经氨酸酶序号) 血凝素和神经氨酸酶序号) e.g A/Hongkong/1/68(H3N2) ( ) A/京科 京科/1/56(H1N1) 京科 ( ) H:hemagglutinin 血凝素 : N:neuraminidase 神经氨酸酶 :
7.在细胞培养中的生长特性
对细胞种类的特异性; 对细胞种类的特异性; 病毒蛋白的聚集场所; 病毒蛋白的聚集场所; 病毒粒子的装配场所; 病毒粒子的装配场所; 病毒粒子成熟和释放的部位和性质. 病毒粒子成熟和释放的部位和性质.
8.抗原性
与其他相关病毒的血清学关系
9.生物学特性
自然宿主范围,传播方式,传播介体, 自然宿主范围,传播方式,传播介体,地理 分布,致病性及与疾病的关系; 分布,致病性及与疾病的关系; 组织嗜性和组织病理学. 组织嗜性和组织病理学.
10.不使用上标,下标,连字符,斜杠和希腊字 .不使用上标,下标,连字符, 母. 11.新名称不应与已通过的名称有重复,应选用 .新名称不应与已通过的名称有重复, 与正在使用的或过去使用的名称不相近的名称. 与正在使用的或过去使用的名称不相近的名称. 12.如果缩拼词对病毒学家有意义,且得到公认 .如果缩拼词对病毒学家有意义, 的国际专家组的推荐,可以接受作为类的名称. 的国际专家组的推荐,可以接受作为类的名称.
病毒的分类与命名
病毒的分类与命名
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按生物分类学标准,分类应能反映生物体的进化与种系发生的关系。
但病毒不可能按这个原则分类,一般仍按病毒鉴定等的实际需要而分类。
各种生物体均可有病毒寄生。
已知有动物病毒、植物病毒、放线菌病毒及细菌病毒(即噬菌体)。
医学上重要的病毒有500种左右,其中有不少对人类有致病力。
有些病毒也能在节肢动物中增殖(如虫媒病毒)。
目前通过的分类法是将支物病毒分为脱氧核糖病毒 (Deoxyriboviruses 简称DNA病毒)与核糖核酸病毒(Riboviruses 简称RNA病毒 )两大类。
再按病毒的理化性状分为若干科(族属)(表74-1)。
表74-1 按病毒理化及生物性状的分类
说明:
①正痘病毒(Orthopoxvirus)包括天花、类天花、牛痘、牛痘苗、兔痘、猴痘及鼠脱脚病等病毒皆对乙醚有抵抗性,而其他的痘病毒则对乙醚敏感。
②呼肠病毒(Reovirus)有一个外衣壳和一个内衣壳。
内壳有32个壳微粒,外衣壳的壳微粒数目则未确定,认为总共有92个壳微粒。
③病毒体大小是指直径或直径×长度。
④脱去囊膜的裸露病毒体,其核衣壳的直径为100nm,但有囊膜的病毒体则可大至200nm。
第二章_病毒的分类与命名
1978年,Luria和Darnell进一步指出,病毒只含 有一种核酸,能在活细胞内复制,并且利用活细 胞的合成机制产生子代病毒粒子。
第二节 病毒分类和命名
一 . 病毒分类与命名的沿革 1937年Levaditi和Lepine根据病毒对组织的亲和
性进行分类。 1948年Holmes提出根据病毒引起的宿主症状分类。
1950年第五届国际微生物学会提出了有关病毒分类 的八项原则:
(1)形态和繁殖方式; (2)化学结构与物理性质; (3)免疫性能; (4)对理化因子的敏感性; (5)传播方式; (6)对不同宿主组织和细胞的嗜亲性; (7)病理变化,包括包含体形式; (8)临床症状。
病毒可以在活细胞中复制和增殖,并将基因信息传 递给子代,因此病毒又可以看作是一种遗传单位。 病毒都没有自身的能量系统,只能依赖宿主细胞提 供。从这个意义上来说,任何病毒都不能离开宿主 细胞而独立的进行自我复制。
病毒的定义随着分子病毒学的发展而不断延伸。 目前,比较公认的病毒定义:病毒是一类比较原 始的、有生命特征的、能够自我复制和严格细胞 内寄生的非细胞生物。
2.病毒抗原性质 主要包括病毒血清学性质与其抗原的关系。
3.病毒生物学特性 包括病毒天然的宿主范围;病毒在自然状态下的
传播与媒介体的关系;病毒的地理分布、致病机理、 组织嗜亲性;病毒引起的病理和组织病理学特点。
一般而言,病毒粒子形态、基因组组成和复制特 性、病毒结构蛋白、非结构蛋白的数目和大小往 往作为病毒分类和命名的依据,而病毒基因组的 核酸类型、基因组的单双链、反转录过程和病毒 基因组的极性则与病毒目的分类和命名有关。
病毒的命名和分类
2)根据病毒所引起旳病变旳性质 疱疹病毒科、痘病毒科 3)以病毒酶作用旳基质 正粘病毒科、副粘病毒科 4)以病毒旳最初分离部位 腺病毒科
5)感染宿主旳部位 鼻病毒属、肠道病毒属 6)以几种属旳缩拼词作为科名 乳多空病毒科
流感病毒旳命名措施
1.国际上通用旳流感病毒命名措施
型别/分离地点/分离序号/分离时间(年代) (血凝素和神经氨酸酶序号)
3.ICTV不统一要求病毒种下列旳分类和命 名。有关血清型、基因型、病毒株、变异 株等旳命名由公认旳国际教授组决定。
4.对人工产生旳病毒和试验室杂交株不予分 类考虑,这些病毒旳命名也一样由公认旳 国际教授组决定。
5.当代表组员病毒经过充分鉴定并在刊登 旳文件上描述后,才干建立一种类,以便 与相同旳类区别。一样,命名一种病毒时, 该病毒必须经过充分鉴定并在文件上刊登 以明确区别于相同旳病毒
以mRNA为关键:根据病毒旳DNA或RNA是
与mRNA互补(-)和不互补(+) 而将病毒分
为6类。
II类(+DNA)
VI类 +RNA
IV类
I类(±DNA) mRNA
V类(-RNA)
III类(±RNA)
四、动物病毒旳分类现状
➢ 一 DNA病毒
(一)单链DNA病毒 细小病毒科(Parvoviridae):猪细小病毒(PPV) 圆环病毒科(Circoviridae) :猪圆环病毒(PCV)
最新旳病毒分类报告:第六次报告( 1995年) 目前已知旳病毒有3600多种,它们分别属于
71个病毒科; 其中动物病毒(涉及脊椎动物病毒和无椎脊动
物病毒)有2023余种,分属27个病毒科;
(二)分类根据
1.病毒旳形态学特征
第三章 病毒的分类与命名
病毒的宿主多样性,同一病毒可在不同的 宿主中寄生并致病。
二、病毒分类和命名的规则
(一)一般规则 (1)病毒分类和命名应该是国际性的,并且普遍适
用于所有的病毒。 (2)国际病毒分类系统采用目(order)、科(family)、
亚科(subfamily)、属(genus)、种(species)、分类阶元。 (3)ICTV不负责病毒种以下的分类和命名,病毒种
以下的血清型、基因型、毒力株、变异株和分离株 的名称由公认的国际专家小组确定。 (4)人工产生的病毒和实验室构建的杂种病毒在病 毒分类上不予考虑,它们的分类由公认的国际专家 小组负责。
(5)分类阶元只有在病毒代表种的特性得到 了充分了解和在公开出版物上进行过描述, 以致于明确了它们的分类地位,并使其分 类阶元与其他类似的分类阶元相区别时, 才能确定下来。
种名用斜体打印,第一个词的首字母要大写,除 了是专有名词(proper noun)外,其他词首字母 一律大写。
在正式使用场合,分类阶元名称应放在分类阶元 术语前。
如,各分类单元正式的描述是
…Reovirideae(科),…Phytoreovirus(属), …wound tumor virus(种)等。
④ 病毒脂类含量和特性(对乙醚、氯仿等 脂溶剂的敏感性)
⑤病毒的细胞培养特性
包括:对细胞和宿主的特异性; 病毒在感染细胞内的复制过程; 合成和装配部位; 在核内、细胞质内或细胞表面成熟的情况; 细胞内包涵体的形成和细胞病理变化。
⑥ 对其它物理和化学因子的敏感性: 包括对酸的稳定性、对热的稳定性和加入两
价阳离子后的稳定性。
⑦ 病毒抗原性质
包括病毒血清学性质 抗原的关系。
⑧ 流行病学特点
包括: 病毒天然的宿主范围 病毒在自然状态下的传播与媒介体的关系; 病毒的地理分布,致病机理,组织嗜亲性; 病毒引起的病理和组织病理学特点。
病毒的分类和命名
自从1898年贝杰林克(Beijerinck)首次提出“病毒”的概念以来,已经过去100多年时间。
病毒的种类由最初的几十种、几百种,发展到今天的4000多种,为了使如此多的病毒种类能够得到科学的命名和分类,国际病毒分类委员会(International Comittee on Taxonomy of Viruses, ICTV)已提出和多次修订了病毒的命名和分类原则,并且建立了由目、科(亚科)、属和种分类阶元构成的病毒分类系统。
目前病毒分类学这一门重要的基础学科已开始走向完善和逐渐成熟起来。
一、病毒的命名与分类系统进展概况病毒分类学是随着病毒学尤其是分子病毒学的发展而建立起来的,并逐渐走向成熟。
病毒的分类和命名大事记1937年Levaditi和Lepine就曾根据病毒对组织的亲和性进行分类。
1948年Holmes提出根据病毒所引起的宿主症状的分类方案。
1950年第五届国际微生物学会提出了有关病毒分类的8项原则。
1963年国际微生物命名委员会病毒分会根据安德鲁斯(Andrewes)提出的分类建议提出了新的8项分类原则:①核酸的类型、结构和分子量;②病毒粒子的形状和大小;③病毒粒子的结构;④病毒粒子对乙醚、氯仿等脂溶剂的敏感性;⑤血清学性质和抗原关系;⑥病毒在细胞培养上的繁殖特性;⑦对除脂溶剂以外的理化因子的敏感性;⑧流行病学的特征。
1966年在莫斯科举行的第九届国际微生物学会上成立了国际病毒命名委员会(International Committee on Nomenclature of Viruses, ICNV),并通过了上述新的8项分类原则。
1971年ICNV公布了关于病毒分类和命名的第一次报告,将当时了解得比较清楚的500多种病毒分为RNA和DNA病毒两大类,并且分为43个病毒属。
1973年ICNV正式更名为国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV)。
(整理)病毒的分类与命名
病毒的命名过去不够统一,有些病毒是以宿主、病理特点、致病症状、病毒颗粒形态进行命名,有些病毒是以地名和人名进行命名,还有些病毒是以字母和数字命名。
病毒的分类系统也不一致,动物病毒分类等级设立科、属、种;而植物病毒分为组、亚组、种。
为了力求分类和命名的统一,1992年Martelli首先提出了植物病毒的科、属、种分类原则,1993年8月在英国格拉斯哥召开的第9届国际病毒大会上,国际病毒分类委员会(ICTV)采纳了这一分类原则,并且新设立了一些植物病毒的科、属[1],1995年在ICTV 所公布的病毒分类和命名第六次报告中,植物病毒分类已不再采用组、亚组,而统一使用科、属、种分类系统[2]。
病毒的分类系统也开始逐渐向更高级的分类等级发展,1991年ICTV在病毒分类和命名第五次报告中首次公布了比科更为高级的分类等级,单分子负链RNA病毒目(Mononegavirales)[3],最近ICTV 又先后增设了套病毒目(Nidovirales)[4]和有尾噬菌体目(Caudovirales)[5]。
除此以外,1996年8月ICTV在第10届国际病毒大会上还对原有的病毒分类和命名规则作了进一步的修订,提出了38条新的病毒命名规则[6]。
最近据Mayo等报道,ICTV又批准了43条新的病毒分类和命名规则,同时对病毒目、科、属和种名的书写也作了专门的规范[7]。
1 病毒命名规则1.1 病毒种的定义和命名病毒“种”是指构成一个复制谱系(replicating lineage)、占据一个特定小生境(ecological niche)、具有多个分类特征的病毒。
这就是说病毒种的分类和命名不是单纯由某一个分类特征、而是由多原则分类特征决定的,包括病毒的基因组组成,病毒颗粒形态结构、生理生化特性和血清学性质等;而病毒种的一个复制谱系则强调了病毒种的系统进化特性,即现今所有的病毒种可能起源于共同的病毒祖先;病毒种所占有的小生境是指某种病毒的特定生物学特性、地理分布、宿主范围、媒介的嗜亲性、致病机理等[8]。
病毒的分类与命名
病毒的命名过去不够统一,有些病毒是以宿主、病理特点、致病症状、病毒颗粒形态进行命名,有些病毒是以地名和人名进行命名,还有些病毒是以字母和数字命名。
病毒的分类系统也不一致,动物病毒分类等级设立科、属、种;而植物病毒分为组、亚组、种。
为了力求分类和命名的统一,1992年Martelli首先提出了植物病毒的科、属、种分类原则,1993年8月在英国格拉斯哥召开的第9届国际病毒大会上,国际病毒分类委员会(ICTV)采纳了这一分类原则,并且新设立了一些植物病毒的科、属[1],1995年在ICTV 所公布的病毒分类和命名第六次报告中,植物病毒分类已不再采用组、亚组,而统一使用科、属、种分类系统[2]。
病毒的分类系统也开始逐渐向更高级的分类等级发展,1991年ICTV在病毒分类和命名第五次报告中首次公布了比科更为高级的分类等级,单分子负链RNA病毒目(Mononegavirales)[3],最近ICTV 又先后增设了套病毒目(Nidovirales)[4]和有尾噬菌体目(Caudovirales)[5]。
除此以外,1996年8月ICTV在第10届国际病毒大会上还对原有的病毒分类和命名规则作了进一步的修订,提出了38条新的病毒命名规则[6]。
最近据Mayo等报道,ICTV又批准了43条新的病毒分类和命名规则,同时对病毒目、科、属和种名的书写也作了专门的规范[7]。
1 病毒命名规则1.1 病毒种的定义和命名病毒“种”是指构成一个复制谱系(replicating lineage)、占据一个特定小生境(ecological niche)、具有多个分类特征的病毒。
这就是说病毒种的分类和命名不是单纯由某一个分类特征、而是由多原则分类特征决定的,包括病毒的基因组组成,病毒颗粒形态结构、生理生化特性和血清学性质等;而病毒种的一个复制谱系则强调了病毒种的系统进化特性,即现今所有的病毒种可能起源于共同的病毒祖先;病毒种所占有的小生境是指某种病毒的特定生物学特性、地理分布、宿主范围、媒介的嗜亲性、致病机理等[8]。
第四章病毒分类和命名
P 21~43
第四章 病毒分类和命名
• 病毒是一类比较原始的、有生命特征的、能够 自我复制和严格细胞内寄生的非细胞生物
• 病毒的定义随着分子病毒学的发展而不断延伸 • 类病毒、卫星病毒、朊病毒的发现丰富了病毒
学的内容 • 病毒分类学是随着病毒学尤其是分子病毒学的
发展而建立起来的,并逐渐走向成熟。
三、病毒分类进展及最新分类系统
• 95年以前植物病毒不设目 • 95年采用科、属、种分类系统 • 1991年ICTV第5次报告设1个目:
单分子负链RNA病毒目 Mononegavirales • 1999年第7次分类报告:认可的病毒约4000 种,设3个目
• 不是所有病毒都必须隶属某个目,在没有适当目的情况 下,科可以是最高的病毒分类等级
:
:
:
核酸链类型 核酸含量
核衣壳外形 传播方式/传播介体
R/1 : 2/5 :
E/E : S/O
RNA/SS: 200万Da/5% : 截头杆状/截头杆状: 种子植物/确切介体不详
R/1 : 2.3/5+ 0.6-1.3/5 : E/E : S/Ne (TRV)
1977年终止
三、病毒分类进展及最新分类系统
病毒命名的一般规则:
• 名称的改变、新名称以及分类单元的设立
应正式提交给ICTV常务委员会,在作出决 定之前, ICTV分会委员会和研究小组应进 行充分的协商
• 新名称的选用应考虑国家和地区敏感性问题
病毒的命名
词尾: 属名:-virus 科名 -viridae 亚科名-virinae 目:-virales
• (1)外胚层
一、病毒分类与命名的沿革
• (2)外胚层 • (3)1961以前
病毒的分类和命名
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
一、病毒分类与命名的沿革
1. 1961以前 植物病毒分类法
(2) Hansen (1956): 强调拉丁双名法的属名应反映出寄主类别、传播 方式及病毒颗粒形态,分4目: ➢ 蚜传病毒目(Aphivirales) ➢ 叶蝉传病毒目(Cicavirales) ➢ 无介传病毒目(Invirales) ➢ 介传传病毒目(Xenovirales)
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
病毒分类的国际组织机构
2 国际病毒分类委员会
• 病毒命名筹备委员会(PCNV) 1963
Preparatory Committee for Nomenclature of Virus
• 国际病毒命名委员会(ICNV) 1966
International Committee for Nomenclature of Virus
(ICTV, 1973) ;
• 只寄生于植物
➢ 第三届国际病毒学代表大会, ICTV报告特点:
❖ 从实际工作出发,首先按宿主分五大类;
❖ 病毒的化学组成、形态结构、生理生化仍是重要依据;
❖ 增加了科、属、种、群名词的词源;
❖ 设立七个小组委员会。
➢ ICTV 八次报告(2005年7月),不断修改。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
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一、病毒分类与命名的沿革
•••••1动 (((123.((((()))23514物)))))1根动临侵昆形波史勃瓦摩9病氏氏氏氏氏据物床染虫状61毒病病病病病组 病 及 部 病 分以毒毒毒毒毒分4织 毒 流 位 毒前~属属属属属胚 分 行 及 分5类:::::•••••••••属胎为病所类法多 折 细 昆 无((((((((()235689147学学致法8)))))))))角光胞虫包呼肠肝皮虫神眼唾慢个形性质痘涵与分的(吸道炎肤媒经病液病根类包和内病体病类症道病病及病系毒腺毒据群涵多有毒病毒毒黏毒统群病群毒法状病••••••••体态颗毒群群膜群病毒的(分((((((((害性粒12345786群病毒群))))))))组根1外外中外内中血致的状类毒群0织据群胚胚胚胚胚胚流肿包包群型层层层层层层感瘤涵涵亲病)、病及及向向病染病体体和 毒包毒内内神神毒病毒性 传含群胚胚经经群毒群, 染体层层性性群将 途病病病病有脊 径毒毒毒毒无群群群群椎 、及
第三章 病毒的分类与命名ppt课件
(5)分类阶元只有在病毒代表种的特性得到 了充分了解和在公开出版物上进行过描述, 以致于明确了它们的分类地位,并使其分 类阶元与其他类似的分类阶元相区别时, 才能确定下来。
(6)当病毒有明确的科、而分属未确定时, 这一病毒种在分类学上称为该科的未确定 种(unassigned species)。
植物病毒(Plant Viruses)
植物病毒(plant viruses) 噬藻体(phycophage)
真菌噬菌体或真菌病毒(mycophage) 动物病毒(Animal Viruses)
原生动物病毒(protozoal viruses) 无脊椎动物病毒(inverteble viruses)
昆虫病毒(insect viruses) 脊椎动物病毒(verteble viruses)
第三章 病毒的分类与命名
精品课件ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
病毒分类与命名的意义
病毒分类是将自然界中存在的病毒种群,按照它们的性质相 似性和亲缘关系加以归纳编排,以了解病毒共性与个性的特点. 专门研究病毒分类的学科称为病毒分类学.
由于新病毒的不断发现,且对已知不断性质的了解还不够全 面,所以目前病毒分类学尚处于不成熟阶段.
1. 进行未知病毒的分类和命名。可利用病毒分科、属、种的关系 ,对未知病毒与已经描述过的病毒比较研究和鉴定,若发现新 病毒,可按国际病毒分类命名委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)的规定,提出新描 述的病毒,附有足够的资料,申述理由
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2. 有利于病毒研究工作的交流.病毒分类使病毒研究工作的 交流能够顺利进行。
3. 对寻找新的病毒疫苗株很有意义。利用病毒分类和命名的知 识,有可能寻找新疫苗株。如 Jenner发现牛痘苗能预防人的天 花病,
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病毒的命名过去不够统一,有些病毒是以宿主、病理特点、致病症状、病毒颗粒形态进行命名,有些病毒是以地名和人名进行命名,还有些病毒是以字母和数字命名。
病毒的分类系统也不一致,动物病毒分类等级设立科、属、种;而植物病毒分为组、亚组、种。
为了力求分类和命名的统一,1992 年Martelli 首先提出了植物病毒的科、属、种分类原则,1993 年8 月在英国格拉斯哥召开的第9 届国际病毒大会上,国际病毒分类委员会(ICTV) 采纳了这一分类原则,并且新设立了一些植物病毒的科、属[1],1995 年在ICTV 所公布的病毒分类和命名第六次报告中,植物病毒分类已不再采用组、亚组,而统一使用科、属、种分类系统[ 2 ]。
病毒的分类系统也开始逐渐向更高级的分类等级发展,1991 年ICTV 在病毒分类和命名第五次报告中首次公布了比科更为高级的分类等级,单分子负链RNA 病毒目(Mononegavirales) [3 ],最近ICTV 又先后增设了套病毒目(Nidovirales) [4 ]和有尾噬菌体目(Caudovirales) [5]。
除此以外,1996 年8 月ICTV 在第10 届国际病毒大会上还对原有的病毒分类和命名规则作了进一步的修订,提出了38 条新的病毒命名规则[ 6 ]。
最近据Mayo 等报道,ICTV 又批准了43 条新的病毒分类和命名规则,同时对病毒目、科、属和种名的书写也作了专门的规范[7]。
1 病毒命名规则1.1 病毒种的定义和命名病毒“种”是指构成一个复制谱系(replicating lineage) 、占据一个特定小生境(ecological niche) 、具有多个分类特征的病毒。
这就是说病毒种的分类和命名不是单纯由某一个分类特征、而是由多原则分类特征决定的,包括病毒的基因组组成,病毒颗粒形态结构、生理生化特性和血清学性质等;而病毒种的一个复制谱系则强调了病毒种的系统进化特性,即现今所有的病毒种可能起源于共同的病毒祖先;病毒种所占有的小生境是指某种病毒的特定生物学特性、地理分布、宿主范围、媒介的嗜亲性、致病机理等[8]。
病毒种的命名由几个有实际意义的词组成,但不是单独以宿主名加“virus ”构成,当ICTV 下属委员会不能肯定一个新的病毒种的分类地位时,新的病毒种可以作为暂定种列在适宜的属和科中;在不考虑病毒属和科的情况下,病毒种名与病毒株一起,均应有明确的含义;如果数字和字母已经用于某一特定病毒种的命名,其数字、字母或其组合可作为病毒种的形容词,现在已知的细菌病毒种名就是由数字和字母组成的,这些细菌病毒通常没有太大的表型上的差异,而且感染相同或相似的宿主;植物病毒种的命名,一般是由宿主名加症状名和“virus ” 构成。
1.2 病毒属的命名病毒属是一群具有某些共同特征的种。
其属名的词尾为“virus ”,但在设立一个新的病毒属时必需有一个同时被承认的代表种(type species) 。
1.3 病毒科的命名病毒科是一群具有某些共同特征的属。
科名的词尾为“viridae ”,“ 科” 下面可以设立或不设立亚科。
亚科名的词尾为“ virinae ” 。
1.4 病毒目的命名病毒目是一群具有某些共同特征的科,目名的词尾为“ virales ”。
一般而言,病毒颗粒的形态、基因组组成、复制方式、病毒结构蛋白和非结构蛋白的数量和大小,往往都可以作为病毒科、属命名的依据,而病毒目的命名则与病毒基因组的核酸类型、基因组的单双链、逆转录过程和病毒基因组的极性有关。
此外,病毒颗粒的形态结构和转录策略也可以用作病毒目命名的根据。
2 病毒名称的书写规则在病毒分类系统中所采用的病毒目、科、亚科和属均用斜体字书写或打印,目、科、亚科和属名的第一个字母要大写。
原来规定病毒种名一律不用斜体字书写或打印,种名的第一个字母一般不大写,但在特殊情况下,如病毒种名是来自地名或某个宿主的拉丁科名、属名时,则种名的第一个字母要大写。
但1998 年3 月ICTV 在第27 次常务会上,对病毒种名的书写规则又重新作了修订,提出了所有的病毒种名用斜体,第一个词的首字母要大写,其他词除专有名词外首字母一般不大写,同时还规定暂定种(tentative species) 不用斜体,第一个字母采用大写[7 ]。
3 病毒分类系统1995年ICTV在病毒分类和命名第六次报告中共报告了 4 000多种病毒,它们分属1个目、49个科、11个亚科、164 个属(包括未分科的22 个属)[2]。
1 996 年8 月在耶路撒冷第10 届国际病毒大会期间,ICTV 对第六次报告作了修改和补充,1997年5月ICTV在法国的斯特拉斯堡再次召开常务会议,会上批准的病毒分类系统包括2个目、55个科、189个属(有23个属的分科未定)[9]。
1998年3月ICTV在美国加州San Diego召开了第27次常务会议,又新增添了1个目6个科、26个属]5]。
最近,根据Pringle惠赠的“Virus taxonomy-1999 ”,ICTV 已经批准取消乳多空病毒科(Papovaviridae) ,同时新设立了乳头瘤病毒科(Papillomaviridae) 和多瘤病毒科(Polyomaviridae) ,这样病毒分类系统达到了 3 个目、62 个科。
另外亚病毒感染因子(subviral agent) 下设卫星、类病毒和朊病毒,其中类病毒分类有 2 个科、7 个属,类病毒科名的词尾为“viroidae ”,属名词尾为“viroid ”[5,10]。
国际病毒分类系统见表。
在新近公布的国际病毒分类系统中,所设立的科、属、种的中文名除了参考黄祯祥、侯云德、田波、牛宏舜、朱关福、张成良等人的相关文献外,一些新设立的病毒科、属、种的名称均按照国际病毒命名规则和命名的过程给予了适当的中文名,如:Mononegavirales 下设4个科,即副粘病毒科(Paramyxoviridae) 、弹状病毒科(Rhabdoviridae) 、丝状病毒科(Filoviridae) 和博尔纳病毒科(Bornaviridae) 。
该病毒目是根据这4个病毒科的RNA 基因组具有单分子负极性的共同结构特性而命名的,由希腊字“monos ”(single) 、“nega ”(negative) ,加上病毒目的拉丁词尾“virales ”组成,故称为单分子负链RNA 病毒目(Mononegavirales) [11 ];Nidovirales 是以冠状病毒科(Coronaviridae) 和动脉炎病毒科(Arteriviridae) 的基因组可转录产生一组长短不等的mRNA ,即套(nest) 亚基因组mRNA 而命名的,它由拉丁字“nidus ”(nest) 加病毒目的拉丁词尾“virales ”构成[12]。
对个别确实无法给出适当中文名的病毒名称,将留给国内的病毒学家和同仁进一步研究确定。
表国际病毒分类系统Table The universal system of virus taxonomy(Caudovirales) 肌尾噬菌体科(Myoviridae) 细菌“ T4 噬菌体属(T4-like viruses) 肠杆菌T4 噬菌体(Enterobacteria phage T4) “ P1 噬菌体属(P1-like viruses) 肠杆菌P1 噬菌体(Enterobacteria phage P1) “ P2 噬菌体属(P2-like viruses) 肠杆菌P2 噬菌体(Enterobacteria phage P2) “ Mu 噬菌体属(Mu-like viruses) 肠杆菌Mu 噬菌体(Enterobacteria phage Mu) “ SPOl 噬菌体属(SPOI-like viruses) 芽抱杆菌 SPOI 噬菌体(Bacillus phage SPO1)“ H 噬菌体属(入-like viruses)肠杆菌入噬菌体(Enterobacteria phage 入) “ T1 噬菌体属仃1-like viruses) 肠杆菌T1噬菌体(Enterobacteria phage T1) “ T5 噬菌体属仃5-like viruses) 肠杆菌T5噬菌体(Enterobacteria phage T5) "书 M1 噬菌体属( H-like viruses) (Halobacterium virus (Siphoviridae)盐杆菌 H 噬菌体 H) 长尾噬菌体科 细菌 “入噬菌体属(书M1-like viruses) 甲烷杆菌书M1噬菌体(Methanobacterium 书M1) “ c2 噬菌体属(c2-like viruses) 乳球菌c2噬菌体(Lactococcus phages c2) “ L5 噬菌体属(L5-like viruses) 分枝杆菌L5噬菌体(Mycobacterium phages L5) 短尾噬菌体科(Podoviridae) 细菌“ T7噬菌体属仃7-like viruses) 肠杆菌T7噬菌体(Enterobacteria phage T7) 29噬菌体属(29-like viruses) 芽抱杆菌29噬菌体(Bacillus phage 29) P22噬菌体属(P22-like viruses) 肠杆菌P22噬菌体(Enterobacteria phage P22) —古噬菌体科(Rudiviridae) 古细菌古噬菌体属(Rudivirus) 硫化叶菌噬菌体SIRV1(Sulfolobus virus SIRV1) —复层噬菌体科(Tectiviridae) 细菌复层噬菌体属(Tectivirus) 肠杆菌PRD1 噬菌体(Enterobacteria phage PRD1) —覆盖噬菌体科(Corticoviridae) 细菌覆盖噬菌体属(Corticovirus) 交替单胞菌PM2 噬菌体(Alteromonas phage PM2) —芽生噬菌体科(Plasmaviridae) 支原体芽生噬菌体属(Plasmavirus) 无胆甾原体L2 噬菌体(Acholeplasma phage L2) —脂毛噬菌体科(Lipothrixviridae) 古细菌脂毛噬菌体属(Lipothrixvirus) 热变形菌噬菌体1 (Thermoproteus virus 1) —微小纺锤形噬菌体科(Fuselloviridae) 古细菌微小纺锤形噬菌体属(Fusellovirus) 硫化叶菌噬菌体SSV1(Sulfolobus virus SSV1) —痘病毒科(Poxviridae) 脊椎动物和无脊椎动物脊椎动物痘病毒亚科(Chordopoxvirinae) 正痘病毒属(Orthopoxvirus) 痘苗病毒(Vaccinia virus) 副痘病毒属(Parapoxvirus) 口疮病毒(Orf virus) 禽痘病毒属(Avipoxvirus) 鸡痘病毒(Fowlpox virus) 山羊痘病毒属(Capripoxvirus) 绵羊痘病毒(Sheeppox virus) 野兔痘病毒属(Leporipoxvirus) 粘液瘤病毒(Myxoma virus) 猪痘病毒属(Suipoxvirus) 猪痘病毒(Swinepox virus) 软疣痘病毒属(Molluscipoxvirus) 人传染性软疣病毒(Molluscum contagiosum virus) 亚塔痘病毒属(Yatapoxvirus) 亚巴猴肿瘤病毒(Yaba monkey tumor virus) 昆虫痘病毒亚科(Entomopoxvirinae) 昆虫痘病毒A 属(Entomopoxvirus A) 五月鳃角金龟子昆虫痘病毒(Melolontha melolontha entomopoxvirus) 昆虫痘病毒B 属(Entomopoxvirus B) 桑灯蛾昆虫痘病毒(Amsacta moorei entomopoxvirus) 昆虫痘病毒C 属(Entomopoxvirus C) 淡黄摇蚊昆虫痘病毒(Chironomus luridus entomopoxvirus) —虹彩病毒科(Iridoviridae) 无脊椎动物、脊椎动物虹彩病毒属(Iridovirus) 无脊椎动物虹彩病毒6 型(Invertebrate iridescent virus 6) 绿虹彩病毒属(Chloriridovirus) 无脊椎动物虹彩病毒3 型(Invertebrate iridescent virus 3) 蛙病毒属(Ranavirus) 蛙病毒3 型(Frog virus 3) 淋巴囊肿病毒属(Lmphocystivirus) 淋巴囊肿病病毒1 型(Lymphocystis disease virus 1) —藻类DNA 病毒科(Phycodnaviridae) 藻类绿藻病毒属(Chlorovirus) 小球藻病毒1精品感谢下载载(Paramecium bursaria Chlorella virus 1) 寄生藻病毒属 (Prasinovirus) 寄生藻病毒 SP1(Micromonas pusilla virus SP1) 金藻病毒属(Prymnesiovirus) 金藻病毒 PW1(Chrysochromulina brevifilum virus PW1) (Phaeovirus) 褐藻病毒 1(Ectocarpus siliculosis virus 1) — 杆状病毒科(Baculoviridae) 无脊椎动物 核型多角体病毒属(Nucleopolyhedrovirus) 苜蓿丫纹夜蛾核型多角体病毒感谢下载!欢迎您的下载,资料仅供参考褐藻病毒属。