原核生物基因表达调控
分子生物学第七章原核生物基因表达调控
原核生物基因表达调控的特点
01
原核生物基因表达调控通常由特 定的转录因子、RNA聚合酶以及 其他调控蛋白介导,通过与DNA 的结合或解离来调节基因转录。
02
原核生物基因表达调控具有快速 响应环境变化的特点,能够在短 时间内调整基因表达模式,以适 应外界刺激和压力。
翻译后加工的调控
翻译后加工的调控
在翻译后加工阶段,新合成的蛋白质经过一系列修饰和加工,最终成为具有生物学活性的蛋白质。原 核生物通过控制翻译后加工酶的合成和活性来调控翻译后加工过程。此外,原核生物还可以通过控制 蛋白质的稳定性来影响其功能和表达水平。
总结
翻译后加工是基因表达调控的重要环节,原核生物通过控制翻译后加工酶的合成和活性,以及蛋白质 的稳定性来精细调控基因表达。
翻译延伸的调控
翻译延伸的调控
在翻译延伸阶段,核糖体沿着mRNA移动,将氨基酸组装成蛋白质。原核生物通过控制翻译延伸因子的合成和活 性,以及核糖体的合成和组装来调控翻译延伸。此外,原核生物还可以通过控制mRNA的结构和稳定性来影响翻 译延伸。
总结
翻译延伸是基因表达调控的重要环节,原核生物通过控制翻译延伸因子的合成和活性,以及核糖体的合成和组装, 以及mRNA的结构和稳定性来精细调控基因表达。
翻译起始的调控
原核生物通过控制翻译起始来调控基因表达。在翻译起始阶段, mRNA与核糖体结合,招募翻译所需的起始因子和其他成分。原 核生物通过控制起始因子的合成和活性,以及mRNA与核糖体的 结合来调控翻译起始。
总结
翻译起始是基因表达调控的重要环节,原核生物通过控制翻译起 始因子的合成和活性,以及mRNA与核糖体的结合来精细调控基 因表达。
3原核生物基因表达与调控
另一个螺旋(由7~9个氨基酸组成),没有碱基特异性, 与DNA磷酸戊糖链骨架接触。在与DNA特异结合时, 靠蛋白质的氨基酸侧链与特异碱基对之间形成氢键、 疏水键和发生静电相互作用 。
二、lac操纵子的分解代谢产物阻遏
β-半乳糖苷酶在乳糖代谢中的作用是把前者 分解成葡萄糖及半乳糖。如果将葡萄糖和乳糖 同时加入培养基中,大肠杆菌在耗尽外源葡萄 糖之前不会诱发lac操纵子,这种现象称为葡萄 糖效应(glucose effect)。
原因:是葡萄糖的某些降解产物抑制了lac
mRNA的合成,科学上把葡萄糖的这种效应 称之为分解代谢产物阻遏效应(catabolite repression)。
基因表达调控(gene regulation or gene
control):任何影响基因转录过程和翻译过程 的开启、关闭和这两个过程速率的较为直接 的因素及其作用。
第一节 细菌的转录调控
一、细菌操纵子
操纵子学说———关于原核生物基因结构及其表达 调控的学说。
操纵子(operon): 细菌基因表达和调控的单位, 包括共转录到一条mRNA上的多个结构基因和这些基 因转录所需的顺式作用元件,这些元件包括启动子、 操作子和转录调控有关的序列。
能从合成地点扩散到其它场所对其他基因的表达起 调控作用的蛋白质因子(有时为RNA)。起作用的过 程称反式作用。
二、阻遏物和激活物
阻遏物(repressor): 阻止基因表达的蛋白质,可与操 作子结合来阻止转录,为负调控蛋白。
激活物(activator):促进基因转录的蛋白质 ,为正调控 蛋白。
第十章原核生物基因表达的调控
表 16-4 E.coliσ 因子识别不同保守序列的启动子 基因 分子量 70KD 32KD 24KD 54KD 28KD 功能 普遍 热休克 热休克 氮饥饿 产生鞭毛 -35 序列 TTGACA CCCTTGAA ? CTGGNA CTAAA 间隔(bp) 16~18 13~15 ? 6 15 -10 序列 TATAAT CCCGATNT ? TTGCA GCCGATAA
基本概念
1.操纵子(operon)
很多功能上相关的结构基因在染色体上串连排列,由 一个共同的控制区来操纵这些基因的转录。包含这些结构 基因和控制区的整个核苷酸序列就称为操纵子(operon)。
一个完整的操纵子主要包括启动子、操纵基因、结构 基因和终止子。
2. 阻遏物和激活物(reperssor and activator)
2. 基因表达的极性效应
•在正常情况下原核基因表达时,其转录出来的mRNA随 即进行翻译,这时整个mRNA都覆盖着核糖体, ρ因子 无法接近mRNA,而RNA聚合酶早已越过前面的基因的 依赖ρ因子的终止子,所以转录实际上并不停止,而是继 续转录后续基因。如果在某一基因的依赖于ρ的终止子之 前发生无义突变,核糖体便从无义密码子上解离下来,翻 译停止,于是ρ就可以自由进入RNA并移动,直到赶上停 留在终止子上的RNA聚合酶,结果使RNA聚合酶释放, 不能再转录下游基因。
第十章 原核生物基因 表达的调控
生物的遗传信息是以基因的形式储藏在细 胞内的DNA(或RNA)分子中的。随着个体 的发育,DNA有序地将遗传信息,通过转 录和翻译的过程转变成蛋白质,执行各种 生理生化功能,完成生命的全过程。从 DNA到蛋白质的过程,叫做基因表达 (gene expression),对这个过程的调节 就称为基因表达调控(gene regulation或 gene control)。
第14章 原核生物基因表达调控
第14章原核生物基因的表达调控重点:操纵子的结构特点和功能;乳糖操纵子的正负调控;色氨酸操纵子的衰减作用。
难点:色氨酸操纵子的衰减作用。
第一节基因调控的基本定律一、基因调控水平二、基因和调控元件三、DNA结合蛋白一、基因调控水平基因表达的调控可以发生在DNA到蛋白质的任意节点上,如基因结构、转录、mRNA 加工、RNA的稳定性、翻译和翻译后修饰。
二、基因和调控元件基因:是指能转录成RNA的DNA序列。
结构基因:编码代谢、生物合成和细胞结构的蛋白质。
调节基因:产物是RNA或蛋白质,控制结构基因的表达。
其产物通常是DNA结合蛋白。
调控元件:不能转录但是能够调控基因表达的DNA序列。
三、DNA结合蛋白调控蛋白通常含有与DNA结合的结构域,一般由60-90个氨基酸组成。
在一个结构域中,只有少数氨基酸与DNA接触。
这些氨基酸(包括天冬氨酸、谷氨酸、甘氨酸、赖氨酸和精氨酸)常与碱基形成氢键,或者与磷酸核糖骨架结合。
根据DNA结合结构域内的模体,可以将DNA结合分成几种类型(图16.2)。
第二节大肠杆菌的乳糖操纵子一、操纵子结构二、正负调控三、乳糖操纵子四、lac突变五、正控制一、操纵子结构原核和真核生物基因调控的主要差异在于功能相关的基因的组成。
细菌的功能相关的基因常常排列在一起,并且由同一启动子控制。
一群一起转录的细菌的结构基因(包括其启动子和控制转录的额外序列)称为操纵子。
二、正负调控转录水平上的调控主要有两种类型:负调控:gene ON 阻遏蛋白 OFF正调控:gene OFF 激活蛋白 ON诱导:活性阻遏蛋白 失活诱导因子+非活性激活蛋白 活性阻遏:失活阻遏蛋白 活性共阻遏蛋白+活性激活蛋白 失活三、乳糖操纵子乳糖操纵子是诱导型操纵子,当诱导物不存在时,阻遏蛋白结合到操纵序列上并阻止转录;当诱导物存在时,阻遏蛋白与诱导物结合后失去活性,转录才得以进行。
四、lac突变为了鉴定乳糖操纵子各个成分的功能,Jacob和Monod做了细菌的接合实验,其中供体菌的F’因子上也带有乳糖操纵子。
原核生物基因表达调控
Repressor
cAMP
CAP
葡萄糖不存在,乳糖存在,阻遏蛋白失活,cAMP+CAP与CAP位点结合结合,促进基因转录
The Lac Operon: III. 葡萄糖和乳糖都存在
Repressor
RNA Pol.
CAP Bindin
g
Promoter
Operator X
LacZ
Repressor负调节与正调节协调合作
• 阻遏蛋白封闭转录时,CAP不发挥作用 • 如没有CAP加强转录,即使阻遏蛋白从操作基因上解聚仍无转录活性
3)正调控和负调控
正调控(positive control)
在没有调节蛋白质存在时基因是关闭的,加入某种调节蛋白后基因活性就被开启,这样的调控为正转录 调控。
调节基因
操纵基因
结构基因
调节蛋白
mRNA 酶蛋白
负调控(negative control)
在没有调节蛋白质存在时基因是表达的,加入这种调节蛋白质后基因表达活性便被关闭,这样的调 控负转录调控。
2)结构基因和调节基因
➢ 组成基因/管家基因(constitutive gene, housekeeping gene)是指不大受环境变动而持 续表达的一类基因。如DNA聚合酶,RNA聚合酶等代谢过程中十分必需的酶或蛋白质的基因 。 ➢调节基因(regulated gene)指环境的变化容易使其表达水平变动的一类基因。如:不同生 长发育时期表达的一些基因。
• 别乳糖是lac操纵子转录的活性诱导物 • 异丙基硫代半乳糖苷(isopropyl thiogalactoside:IPTG)结构上类似于别乳糖,是乳糖操纵
子非常有效的诱导物。可诱导lac操纵子表达,但不能被β-半乳糖苷酶水解。 • 这种能诱导酶合成,但不能被酶分解的分子称为安慰诱导物(gratuitous inducer)。安慰诱导
第九章:原核生物基因表达调控
抗σ因子与抗抗σ因子
9.1.1.3 双组分调节系统
双 组 分 调 节 系 统 的 组 成
感应激酶 应答调节子
周质结构 域、 胞质结构 域
PhoR和PhoB构成的双组分调节系统
天冬氨酸残基
9.1.2 转录终止阶段的调控
9.1.2.1 弱化子
研究表明色氨酸操纵子两种机制的调控。如果trp操纵子只受 trpR编码的阻遏物调控,那么在缺乏或存在色氨酸时,trpR 突变使trp操纵子表达的酶量应该是相同的。可是,在trpR缺
❖热激蛋白的表达调控主要发生在转录水平上。热激蛋白基 因的启动子被σ32而不是通常的σ70识别。σ32也不能识别σ70启 动子,因为这两种σ因子识别的启动子序列不一样
❖HSP的诱导合成是由于细胞内的σ32合成发 生在翻译水平。 ▪另一方面,在热激条件下σ32的稳定性也增加了。
严谨反应的分子机制
(p)ppGpp与RNA聚合酶β亚基结合,改变了RNA聚合酶对 一系列启动子的亲和力,导致细胞基因表达的整体变化,使细 胞适应新的环境。这些变化包括rRNA和tRNA的合成被抑制, 一系列参与氨基酸合成与运转的基因被激活。
人们在对大肠杆菌relA突变体进行研究时认识到是(p) ppGpp的积累引发了严紧反应。relA突变体即使在氨基酸饥饿
Fur能够感应细胞 内铁的水平。当 细胞内有充足的 铁时,Fur关闭反 义bfr基因,细胞 产生细菌铁蛋白。 在低铁条件下, 反义bfr基因被转 录,产生反义 RNA,阻止细菌 铁蛋白的合成。
生物学原核生物基因表达的调控
第二节
原核生物基因表达的 转录水平调控
Regulation of Prokaryotic Gene Expression at Transcription Level
目录
一、转录调控是以特定的DNA序列和蛋 白质结构为基础
(一)特定的DNA序列是转录起始调控的结构基础
在基因内和基因外都有一些特定的DNA序列,与结 构基因表达调控相关、能够被基因调控蛋白特异性识别 和结合,这些特定的DNA序列称为顺式作用元件(cisacting elements),亦称为顺式调控元件。在原核生物 中主要是启动子、阻遏蛋白结合位点、正调控蛋白结合 位点、增强子等。
transcription
RNA 5'-AGGUCCACG········-3'
启动子及其与转录的关系 ···
目录
(二)阻遏蛋白结合操纵元件对转录起 始进行负调控
阻遏蛋白是一类在转录水平对基因表达产生负 调控作用的蛋白质。阻遏蛋白主要通过抑制开放启 动子复合物的形成而抑制基因的转录。阻遏蛋白与 DNA结合后,RNA聚合酶仍有可能与启动子结合, 但不能形成开放起始复合物,不能启动转录;这种 作用称为阻遏(repression),特定的信号分子与阻 遏蛋白结合,使阻遏蛋白失活,从DNA 上脱落下来, 称为去阻遏,或脱阻遏(derepression)。
usually binds to CAAT box
目录
二、特定蛋白质与DNA结合后控制 转录起始
(一)σ因子和启动子决定转录是否能够起始
-35
-10
+1
5'-TAGTGTATTGACATGATAGAAGCACTCTACTATATTCTCAATAGGTCCACG············-·3·'
原核生物基因表达调控概述
原核生物基因表达调控概述基因表达调控是生物体内基因表达调节控制机制,使细胞中基因表达的过程在时间,空间上处于有序状态,并对环境条件的变化做出适当的反应复杂过程。
1.基因表达调控意义在生命活动中并不是所有的基因都同时表达,代谢过程中所需各种酶和蛋白质基因以及构成细胞化学成分的各种编码基因,正常情况下是经常表达的,而与生物发育过程有关的基因则需在特定的时空才表达,还有许多基因被暂时的或永久的关闭而不来表达。
2.原核基因表达调控特点原核生物基因表达调控存在于转录和翻译的起始、延伸和终止的每一步骤中。
这种调控多以操纵子为单位进行,将功能相关的基因组织在一起,同时开启或关闭基因表达即经济又有效,保证其生命活动的需要。
调控主要发生在转录水平,有正、负调控两种机制在转录水平上对基因表达的调控决定于DNA的结构,RNA 聚合酶的功能、蛋白质因子及其他小分子配基的相互作用。
细菌的转录和翻译过程几乎在同一时间内相互偶联。
细胞要控制各种蛋白质在不同时期的表达水平,有两条途径:(1)细胞控制从其DNA模板上转录其特异的mRNA的速度,这是一条经济的途径,可减少从mRNA合成蛋白质的小分子物质消耗,这是生物长期进化过程中自然选择的结果,这种控制称为转录水平调控。
(2)在mRNA合成后,控制从mRNA翻译肽链速度,包括一些与翻译有关的酶及其复合体分子缔合的装配速度等过程。
这种蛋白质合成及其基因表达的控制称为翻译水平的调控。
二.原核生物表达调控的概念(1)细菌细胞对营养的适应细菌必须能够广泛适应变化的环境条件。
这些条件包括营养、水分、溶液浓度、温度,pH等。
而这些条件须通过细胞内的各种生化反应途径,为细胞生长的繁荣提供能量和构建细胞组分所需的小分子化合物。
(2)顺式作用元件和反式作用元件基因活性的调节主要通过反式作用因子与顺式作用元件的相互作用而实现。
反式作用因子的编码基因与其识别或结合的靶核苷酸序列在同一个DNA分子上。
RNA聚合酶是典型的反式作用因子。
第7章原核生物基因表达的调控
Z编码β-半乳糖苷酶:将乳糖水解成葡萄糖和半乳糖。
Y编码β-半乳糖苷透过酶:使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透过大肠杆
菌细胞壁和原生质膜进入细胞内。
A编码β-半乳糖苷乙酰基转移酶:乙酰辅酶A上的乙酰基转到β-半乳糖苷
上,形成乙酰半乳糖。
gene
正调控
调控蛋白
负调控
结构基因表达
▪ 负调控:抑制基因表达的调控方式 ▪ 正调控:促进基因表达的调控方式
B、特殊代谢物的调控
诱导(induction)
阻遏(repression)
inducer
gene
repressor
gene
特殊代谢物
诱导 阻遏
结构基因表达
诱导物、可诱导基因 阻遏物、可阻遏基因
无葡萄糖、 有乳糖-----cAMP水平高 (2)cAMP与CRP结合形成有活性的
CRP- cAMP 复合物 (3)CRP-cAMP 与Plac结合 (4)增强了RNA聚合酶与启动子的结合
(5)lacZ, lacY 、 lacA高表达
105
40
105
41
乳糖、G存在与否及与操纵子正、负控因素、 基因开放与关闭情况如下:
CRP
Binding
RNA
Promoter
Operator
CRP
Pol. Repressor
cAMP
LacZ
LacY
LacA
Repressor mRNA
STOP
Right there
CRP
Polymerase
cAMP
Repressor
cAMP
CRP
5 第二章 原核生物基因表达调控
2.依赖于Rho因子的终止子
在体外实验中,发现尽管有该类终止子存在,但RNA聚合酶
只在终止子处暂停,转录并不终止。向该反应系统中加入ρ因子,
则可使转录在特定的位点终止。这种终止称为依赖ρ因子的转录
终止。
依赖于Rho因子的终止子不但柄部G•C含量较低,因而暂停
•
枯草杆菌在芽孢形成过程中采取更换σ因子的策略
2. 枯草杆菌噬菌体SP01的感染周期
一组基因的表达导致另一组基因随后表达,称为基因表达的
时序调控或级联调控,这是噬菌体感染周期中的普遍特征。 在枯草杆菌噬菌体SP01的感染周期中,其基因表达的时序调 控是由一系列的σ因子来实现的。 SP01的感染周期经历早中晚三个阶段: i. 刚刚感染时,早期基因被转录。
其一致序列为T80A95T45A60A50T96,又称为Pribnow框.
Pribnow盒是RNA聚合酶的牢固结合位点,又称结合位点,或称
为解链区。
该区域富含AT对,熔点较低, RNA聚合酶的结合使得这个AT丰
富区消耗较低的能量而解旋,此时RNA聚合酶与启动子的复合物便
由封闭复合物(closed-promoter complex) 转变为开放复合物(openpromoter complex) ,转录启动。 (2)-35区 在转录起始点上游-35bp处,有另一个保守序列,称 为-35序列。其一致序列为T82T84G78A65C54A45。该保守序列又称
• 转 录 起 始 主 要 由 DNA 分 子 上 的 启 动 子 (promoter)控制;终止由终止子控制. • DNA链上提供转录终止信号的序列称为终 止子(terminator)。是一个基因的末端或 是一个操纵子的末端的一段特定序列。
第六章 原核生物基因表达调控
图6-7 乳糖操纵子结构模式图
第二节 原核基因表达的调控
乳糖操纵子的上游有一个独立转录的基因lacI,其编码产物LacI 可以结合在乳糖操纵子的操纵基因(lacO)上,即转录控制区,阻抑 下游结构基因的表达。因此,乳糖操纵子是一个负调控系统(图68)。其中,LacI是具有负调控作用的反式作用因子,LacI作用的靶 DNA序列lacO是顺式作用元件。
trpB(UGA处翻译终止) -UGA -GAA-AUC- UGA-UGG-AA A UG-G AAtrpA(AUG处翻译起始)
第二节 原核基因表达的调控
3.稀有密码子对翻译的影响 DNA复制时,引物酶催化一段RNA引物的合成,引物酶 由dnaG编码。rpsU-dnaG-rpoD组成一个转录单位,产生多 顺反子转录物。细胞内三个基因的终产物的浓度相差却很 大,rpsU产物浓度为4×104个/细胞,dnaG产物50个/细胞, rpoD产物2800个/细胞。菌体通过使用稀有密码子,使转 录为一条mRNA链的三个基因的表达产物量可以有很大差异。
第二节 原核基因表达的调控
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
图6-10 色氨酸操纵子的负调控
第二节 原核基因表达的调控
4.阿拉伯糖操纵子 阿拉伯糖与乳糖一样,可替代葡萄糖作为碳源物质被 菌体利用。大肠杆菌中,阿拉伯糖(Ara)代谢所需酶的 三个基因分别是:核酮糖激酶基因( araB)、L-Ara异构 酶 基 因 ( araA)、L- 核 酮 糖 - 5 - 磷 酸 差 向 异 构 酶 基 因 ( araD),组成一个基因簇,有共同的启动子 PBAD。与其 它操纵子不同的是,操纵序列位于 PBAD 上游,操纵序列左 端有另一方向转录的启动子 PC,负责调节基因araC的转录, 其产物AraC蛋白有两种活性形式,Pr 对 PBAD 的表达起阻遏 作用,Pi对PBAD的表达起激活作用(图6-11)。
第11章 原核生物基因表达的调控
Ø 葡萄糖代谢导致cAMP浓度下降; Ø cAMP可以活化乳糖操纵子的激活蛋白:
CRP: cAMP receptor protein(cAMP受体蛋白) CAP: catabolite gene activator protein
(代谢降解物活化蛋白)
Ø cAMP-CRP/CAP
乳糖操纵子的正调控
Ø 每个阻遏蛋白四聚体与两个 operator 结合; Ø 阻遏蛋白与Operator结合导 致DNA弯折,干扰mRNA的 合成。
p.286 图11-7
乳糖操纵子的正调控
当细菌在含有葡萄糖和乳 糖的培养基中生长时,通常 总是优先利用葡萄糖,而不 利用乳糖;只有当葡萄糖耗 尽后,细菌经过一段停滞期, 才能在乳糖的诱导下,合成 β-半乳糖苷酶等分解利用 乳糖的酶类,细菌才能利用 乳糖。
ttrrppRR
OOPPtrptrEpE trptDrpDtrpCtrpCtrpBtrpBtrpAtrpA
ttrrppRR
OOPPtrptrEpE trptDrpDtrpCtrpCtrpBtrpBtrpAtrpA
色氨酸操纵子的衰减作用
trpR
OP trpL trpE trpD trpC trpB trpA
5’
(1) 新合成的正链 RNA可以翻译A蛋白;
3’ (-) A
5’(+)
5’
但是很快形成二级结构,阻止A蛋白 的继续合成;
所以 A蛋白与C蛋白的量为1:180
Ø Rep的合成依赖于C蛋白的表达, 证据:C基因的codon6发生无义突 变:核糖体停留在该处,导致rep基 因RBS附近的二级结构无法打开, 则rep基因无法表达。
AraC既是阻遏蛋白, 又是激活蛋白;
原核生物基因表达调控
20
同位素示踪实验
把大肠杆菌细胞放在加有放射性35S标记的氨基酸,但没 有半乳糖诱导物的培养基中繁殖几代然后再将这些带有 放射活性的细菌转移到不含35S、无放射性的培养基中 随着培养基中诱导物的加入, β-半乳糖苷酶便开始合成。 分离β-半乳糖苷酶, 发现这种酶无35S标记说明酶的合 成不是由前体转化而来的, 而是加入诱导物后新合成的。
• Jacob和Monod认为诱导酶(他们当时称为适应酶)
现象是个基因调控问题, 可以用实验方法进行研究, 因此
选为突破口, 终于通过大量实验及分析, 于1961年建立
了该操纵子的控制模型。
-
21
酶的诱导
-
22
• 酶的诱导现象是生物进化过程中出现的一种合理、 经济地利用有限资源的本能。
• 酶诱导已证明是低等生物的普遍现象。
倒位片段
鼠伤寒沙门菌鞭毛素基- 因的调节
H1鞭毛素
10
鼠伤寒沙门氏菌(S.typhimrium)的相转变(phase variation)
-
11
2.σ 因子对原核生物转录起始的调控
σ因子:原核生物RNA聚合酶的一个亚基,是转录起 始所必需的因子,主要影响RNA聚合酶对转录起始 位点的正确识别,这种σ因子称σ70,此外还有分子量 不同,功能不同的其他σ因子 。
PO
操纵子可视为原核生物的转录单位,它可以逐个
地从原核生物基因组中分离出来,对其结构功
能加以研究。
-
15
3.乳糖操纵子
1) 乳糖操纵子的结构
启动子 操纵基因
调节蛋白
(阻遏蛋白)
-
结构基因
16
3个编码的结构基因
• Z编码β-半乳糖苷酶: 将乳糖水解成葡萄糖和半乳糖,还能 将乳糖转变为异构乳糖
原核生物基因表达调控的方式
原核生物基因表达调控的方式
1.DNA、染色体水平调控:基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化。
2.转录水平调控(主要调控方式):转录起始、延伸、终止均有影响。
原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作用元件和反式作用因子相互作用进行调控。
3.转录后水平调控:主要指真核生物原初转录产物经过加工成为成熟的mRNA,包括加帽、加尾、甲基化修饰等。
4.翻译水平调控:对mRNA稳定性的调控、反义RNA对翻译水平的调控等。
5.翻译后水平调控:蛋白质的剪切、化学修饰(磷酸化、乙酰化、糖基化等)、转运等。
6.mRNA降解的调控。
分子生物学第七章原核生物基因表达调控
(三)、阻遏物 lac I 基因产物及功能
Lac 操纵子阻遏物 mRNA 是由弱启动子控制下组 成型合成的,该阻遏蛋白具有4个相同的亚基,每个亚 基均含347个氨基酸残基。
lacI 基因为组成型,通过启动子的上升突变体可获 得较多的阻遏蛋白;
阻遏物 2022/10/18
β-半乳糖苷酶 透过酶 转乙酰3酶2
2022/10/18
16
调节机理:
细胞中某一氨基酸或嘧啶的浓度发生改变
氨酰 – tRNA的浓度变化
核糖体在转录产物RNA上的结合位置不 同,使得RNA形成特定的二级结构 由RNA的二级结构判断基因能否继续转录
2022/10/18
17
3、降解物对基因活性的调节P252
葡萄糖效应或降解物抑制作用:细菌培养基中在 葡萄糖存在的情况下,即使加入乳糖、半乳糖等 诱导物,与其对应的操纵子也不会启动,这种现 象称为葡萄糖效应或降解物抑制作用。
这是通过阻止乳糖操纵子表达来完成的,这种 效应称为降解物抑制(catabolite repression)。
2022/10/18
35
(五)、cAMP与代谢物激活蛋白
葡萄糖
葡萄糖-6-磷酸
甘油 某些代谢产物抑制活性
腺苷酸环化酶
ATP
cAMP
编码
cAMP-CAP
Crp基因
代谢物激活蛋白 CAP
葡萄糖对其它糖的代谢抑制,是通过对 cAMP的抑制完成的。
2022/10/18
22
一、酶的诱导 ——
lac 体系受调控的证据
两种含硫的乳糖类似物:
异丙基巯基半乳糖苷
(IPTG)
巯甲基半乳糖苷(TMG)
E. coli 在不含乳糖的培养基生 长时,β-半乳糖苷酶含量极低;
原核生物基因表达调控概述
原核⽣物基因表达调控概述原核⽣物基因表达调控概述基因表达调控是⽣物体内基因表达调节控制机制,使细胞中基因表达的过程在时间,空间上处于有序状态,并对环境条件的变化做出适当的反应复杂过程。
1.基因表达调控意义在⽣命活动中并不是所有的基因都同时表达,代谢过程中所需各种酶和蛋⽩质基因以及构成细胞化学成分的各种编码基因,正常情况下是经常表达的,⽽与⽣物发育过程有关的基因则需在特定的时空才表达,还有许多基因被暂时的或永久的关闭⽽不来表达。
2.原核基因表达调控特点原核⽣物基因表达调控存在于转录和翻译的起始、延伸和终⽌的每⼀步骤中。
这种调控多以操纵⼦为单位进⾏,将功能相关的基因组织在⼀起,同时开启或关闭基因表达即经济⼜有效,保证其⽣命活动的需要。
调控主要发⽣在转录⽔平,有正、负调控两种机制在转录⽔平上对基因表达的调控决定于DNA的结构,RNA 聚合酶的功能、蛋⽩质因⼦及其他⼩分⼦配基的相互作⽤。
细菌的转录和翻译过程⼏乎在同⼀时间内相互偶联。
细胞要控制各种蛋⽩质在不同时期的表达⽔平,有两条途径:(1)细胞控制从其DNA模板上转录其特异的mRNA的速度,这是⼀条经济的途径,可减少从mRNA合成蛋⽩质的⼩分⼦物质消耗,这是⽣物长期进化过程中⾃然选择的结果,这种控制称为转录⽔平调控。
(2)在mRNA合成后,控制从mRNA翻译肽链速度,包括⼀些与翻译有关的酶及其复合体分⼦缔合的装配速度等过程。
这种蛋⽩质合成及其基因表达的控制称为翻译⽔平的调控。
⼆.原核⽣物表达调控的概念(1)细菌细胞对营养的适应细菌必须能够⼴泛适应变化的环境条件。
这些条件包括营养、⽔分、溶液浓度、温度,pH等。
⽽这些条件须通过细胞内的各种⽣化反应途径,为细胞⽣长的繁荣提供能量和构建细胞组分所需的⼩分⼦化合物。
(2)顺式作⽤元件和反式作⽤元件基因活性的调节主要通过反式作⽤因⼦与顺式作⽤元件的相互作⽤⽽实现。
反式作⽤因⼦的编码基因与其识别或结合的靶核苷酸序列在同⼀个DNA分⼦上。
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②真正的诱导物是异构乳糖而非乳糖,前者是
在β -半乳糖甘酶的催化下由乳糖形成的,因 此,需要有β -半乳糖甘酶的预先存在。
解释:
本底水平的组成型合成:非诱导状态下有少量 的lac mRNA合成。
2、葡萄糖对lac操纵子的影响
如果将葡萄糖和乳糖同时加入培养基中, lac操
纵子处于阻遏状态,不能被诱导;一旦耗尽外源葡
Lac operon I p o Z Y A
• 特点:
● ● ●
各结构基因按一定比例协调翻译 ( Z : Y : A = 5 : 2 : 1 ) P & O基因(cis)紧密连锁 或 彼此重叠
I 基因(trans) 位点不固定,编码一种反式作用因子,可以 调控Z、Y、A结构基因的表达。含自己的启动子和终止子。
萄糖,乳糖就会诱导lac操纵子表达分解乳糖所需的
三种酶。
该现象称为葡萄糖效应
其原因是代谢物阻遏效应。
B、 Negative—repressible operon (合成酶类)
• tryptophan synthease operon
• 色氨酸是一系列酶促反应的终产物
• R gene inactive repressor
repressor & RNA polymerase 对重叠位点竞争
---调控机理
无诱导剂时:repessor tetramer与operator发生特异结合 当培养基中有诱导剂时: Inducer (lactose) 与repressor 特异结合 tetramer 变构 特异结合力下降1000X operon on operon off
●
Signal molecular be needed for both types Add signal mol. Operon on (inducible operon)
Inducer (诱导物)
Add signal mol. Operon off (repressible operon)
8、基因表达的规律
——时间性和空间性
1)、时间特异性(temporal specificity)
按功能需要,某一特定基因的表达严格按
特定的时间顺序发生,称之为基因表达的时间
特异性。
多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶
段特异性(stage specificity)。
2、空间特异性(spatial specificity)
安慰诱导物:
如果某种物质能够诱导细菌产生某种酶而本身又不
被分解,这种物质被称为安慰诱导物,如IPTG(异
丙基- β –D-硫代半乳糖苷)。 相反,随环境条件变化而基因表达水平降低的现象 称为阻遏(repression),相应的基因被称为可阻遏的基 因(repressible gene)。 如果某种物质能够阻止细菌产生合成这种物质的酶, 这种物质就是辅阻遏物。(合成代谢)
负(Negative) 转录调控:在没有调节蛋白质存在时基 因是表达的,加入这种调节蛋白质后基因表达活性便被 关闭,这样的调控称为负转录调控。该调节蛋白称为阻 遏蛋白。
8、 遗传信息表达的方式
• 组成型表达(constitutive expression) Housekeeping gene
• 适应性表达(adaptive expression)
负控阻遏调节
正控诱导调节
正控转录 调控系统
调节基因的产物是 激活蛋白 (activator)。
效应物分子(诱导物) 的存在使失去活性的激 活蛋白处于活性状态;
正控阻遏调节
效应物分子(辅阻遏物) 的存在使有活性的激活 蛋白处于非活性状态。
Operon control model
A、 Negative—inducible operon
4、顺式作用(cis-acting)元件:指不转变为其它任 何形式,只在原位发挥调控作用,仅影响与其在物理 上相连的基因表达的一段DNA序列。 顺式作用元件通常和启动子并列或散布在其周围。 经常与启动子相邻的一个顺式作用位点称为操纵基 因(Operator),它是调控蛋白:阻遏蛋白或激活蛋白 的靶位点。 当阻遏蛋白(或激活蛋白)和操纵基因结合时,就 会阻止(或激活)RNA 聚合酶启动转录,操纵基因下 游的结构基因表达会因此被关闭(或开放)。
I
例 (分解酶类 lactose operon)
例如:在Lactose operon中
I gene active repressor
38 kd / monomer
tetramer 152 kd
binding on Operator
大肠杆菌乳糖操纵子的结构:
Lac. Operon structure
• Co-repressor ( tryptophan )
Luxury gene
1)、组成性表达:
指其表达几乎不受环境变动而变化的一类基因。该 类型基因通常被称为管家基因(housekeeping gene)。
2)、适应性表达:
指环境的变化容易使其表达水平变动的一类基因表达。 应环境条件变化,基因表达水平增高的现象称为诱导 (induction),这类基因被称为可诱导的基因(inducible gene)。 如果某种物质能够促使细菌产生某种酶来分解它,这种 物质就是诱导物。(分解代谢)
第一讲 原核生物基因表达 调控
主要内容
一、基因表达调控的基本概念: 二、 基因表达调控的理论与模式;
一、基因表达调控的基本概念:
1、基因表达调控的意义: 原核生物对环境的适应、对营养条件改变适应的 相关应答,都是基因表达的结果;
真核生物的细胞分化, 组织特化 , 个体发育以及 环境对个体表型的影响都是通过基因表达实现的。
operon on operon off operon off operon on
Neg.
i- or 不加入I基因产物 I+ or 加入I基因产物
(激活蛋白)
Pos.
●
Repressor binding on O site 阻遏蛋白 阻止转录启动
Expressor binding front p site
5、原核生和真核生物的基因的组织形式差异很 大,细菌的功能相关的结构基因一般成簇(Cluster) 排列,而真核生物的基因则是独立存在。
原核成簇排列的结构基因能受单一启动子共同控 制:结果使整套基因或者表达或者都不表达。
6、 生物遗传信息的概念
10%; 结构基因的编码序列 triplet codon Genome DNA 90%; 重复,间隔,调节序列… 作用:基因选择性表达指令; 重要的遗传信息。
在个体生长全过程,某种基因产物在个体 按不同组织空间顺序出现,称之为基因表达的
空间特异性。
空间特异性实际上是由细胞在器官的分布 决定的,所以空间特异性又称细胞或组织特异 性(cell or tissue specificity)。
二、 基因表达调控的理论与模式
一)、 transcriptional level control Prok. operon
组成型突变: lacOc
iC mut. (iC O+P+) constitutive mut. (组成型)
iC gene产物repressor丧失与O位点结合的能力 iS mut. (iS O+P+) super-repression mut. (超阻型) iS gene 产物repessor 不能与inducer结合
Co-repressor
(共阻遏物)
原核生物基因表达调控方式:
负控诱导调节
负控转录调 控系统
调节基因的产物是 阻遏蛋白 (repressor), 阻止了结构基因的 转录。
阻遏蛋白与效应物(诱 导物)结合,使阻遏蛋 白失活,结构基因转录; 阻遏蛋白与效应物(辅阻 遏物)结合,使阻遏蛋白 产生活性,结构基因不转 录。
stringent response应急反 应 attenuator 衰减子
1、Operon control
(1961 Jacob. & Monod.)
1)、 operon concept
●定义:是基因表达的协调单位,由启动子、操纵基
因及其所控制的一组功能上相关的结构基因所组成。 操纵基因受调节基因产物的控制。 • 例如:
遗传信息的两大类别
I类;DNA seq. RNA seq. (codon) aa seq. protein phenotype(性状)
II类;特定DNA seq. + 特定蛋白质/ 核酸结合
基因表达的指令
gene on / off
7、调控的关键是调控基因编码蛋白质与与DNA 上的特 异位点(顺式反应位点)的结合来调控靶基因的转录。 调控基因在DNA上的位点一般位于所调控基因的上游。 这种相互作用可以通过两种方式进行: 正(Positive) 转录调控:如果在没有调节蛋白质存在 时基因是关闭的,加入这种调节蛋白质后基因被转录表 达,这样的调控是正转录调控。该调节蛋白称为激活蛋 白。
组成型突变: iC
不可诱导突变(超阻遏):
两个问题: 1、lac操纵子的本底水平表达 有两个矛盾是操纵子理论所不能解释的: ①诱导物需要穿过细胞膜才能与阻遏物结合,而转运 诱导物需要透过酶,后者的合成有需要诱导。 解释:一些诱导物可以在透过酶不存在时进入细胞? 一些透过酶可以在没有诱导物的情况下合成?
激活蛋白
●
激活转录启动
Operon off
意味转录效率极低
Negative control 一般是原核生物利用的调控方式,是 一种广泛保险的机制,使原核生物更好的适应外界营养 条件的变化。
●
Positive control 一般是真核生物喜欢利用的调控 方式。是一种灵活,严格,经济的调控机制