原核生物基因表达调控
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Lac operon I p o Z Y A
• 特点:
● ● ●
各结构基因按一定比例协调翻译 ( Z : Y : A = 5 : 2 : 1 ) P & O基因(cis)紧密连锁 或 彼此重叠
I 基因(trans) 位点不固定,编码一种反式作用因子,可以 调控Z、Y、A结构基因的表达。含自己的启动子和终止子。
激活蛋白
●
激活转录启动
Operon off
意味转录效率极低
Negative control 一般是原核生物利用的调控方式,是 一种广泛保险的机制,使原核生物更好的适应外界营养 条件的变化。
●
Positive control 一般是真核生物喜欢利用的调控 方式。是一种灵活,严格,经济的调控机制
●
3)、Model
作用于 O 位点上的repressor 变构 脱离O位
作用于游离的repressor 变构 失去结合于O位的能力
调控机理
调控机理
w.t. (I+ O+ P+) 诱导型
add inducer operon on
no inducer operon off OC mut. (I+ OC P+) constitutive mut. (组成型) OC失去与repressor特异结合的能力
遗传信息的两大类别
I类;DNA seq. RNA seq. (codon) aa seq. protein phenotype(性状)
II类;特定DNA seq. + 特定蛋白质/ 核酸结合
基因表达的指令
gene on / off
7、调控的关键是调控基因编码蛋白质与与DNA 上的特 异位点(顺式反应位点)的结合来调控靶基因的转录。 调控基因在DNA上的位点一般位于所调控基因的上游。 这种相互作用可以通过两种方式进行: 正(Positive) 转录调控:如果在没有调节蛋白质存在 时基因是关闭的,加入这种调节蛋白质后基因被转录表 达,这样的调控是正转录调控。该调节蛋白称为激活蛋 白。
安慰诱导物:
如果某种物质能够诱导细菌产生某种酶而本身又不
被分解,这种物质被称为安慰诱导物,如IPTG(异
丙基- β –D-硫代半乳糖苷)。 相反,随环境条件变化而基因表达水平降低的现象 称为阻遏(repression),相应的基因被称为可阻遏的基 因(repressible gene)。 如果某种物质能够阻止细菌产生合成这种物质的酶, 这种物质就是辅阻遏物。(合成代谢)
在个体生长全过程,某种基因产物在个体 按不同组织空间顺序出现,称之为基因表达的
空间特异性。
空间特异性实际上是由细胞在器官的分布 决定的,所以空间特异性又称细胞或组织特异 性(cell or tissue specificity)。
二、 基因表达调控的理论与模式
一)、 transcriptional level control Prok. operon
O & P overlap repressor & RNA polymerase bind mRNA startpoint
at sites that overlap around the start point of Lac operon unwinding
RNA polymerase binding Repressor binding
●
Signal molecular be needed for both types Add signal mol. Operon on (inducible operon)
Inducer (诱导物)
Add signal mol. Operon off (repressible operon)
5、原核生物和真核生物的基因的组织形式差异很 大,细菌的功能相关的结构基因一般成簇(Cluster) 排列,而真核生物的基因则是独立存在。
原核成簇排列的结构基因能受单一启动子共同控 制:结果使整套基因或者表达或者都不表达。
6、 生物遗传信息的概念
10%; 结构基因的编码序列 triplet codon Genome DNA 90%; 重复,间隔,调节序列… 作用:基因选择性表达指令; 重要的遗传信息。
8、基因表达的规律
——时间性和空间性
1)、时间特异性(temporal specificity)
按功能需要,某一特定基因的表达严格按
特定的时间顺序发生,称之为基因表达的时间
特异性。
多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶
段特异性(stage specificity)。
2、空间特异性(spatial specificity)
②真正的诱导物是异构乳糖而非乳糖,前者是
在β -半乳糖甘酶的催化下由乳糖形成的,因 此,需要有β -半乳糖甘酶的预先存在。
解释:
本底水平的组成型合成:非诱导状态下有少量 的lac mRNA合成。
2、葡萄糖对lac操纵子的影响
如果将葡萄糖和乳糖同时加入培养基中, lac操
纵子处于阻遏状态,不能被诱导;一Baidu Nhomakorabea耗尽外源葡
组成型突变: lacOc
iC mut. (iC O+P+) constitutive mut. (组成型)
iC gene产物repressor丧失与O位点结合的能力 iS mut. (iS O+P+) super-repression mut. (超阻型) iS gene 产物repessor 不能与inducer结合
I
例 (分解酶类 lactose operon)
例如:在Lactose operon中
I gene active repressor
38 kd / monomer
tetramer 152 kd
binding on Operator
大肠杆菌乳糖操纵子的结构:
Lac. Operon structure
operon on operon off operon off operon on
Neg.
i- or 不加入I基因产物 I+ or 加入I基因产物
(激活蛋白)
Pos.
●
Repressor binding on O site 阻遏蛋白 阻止转录启动
Expressor binding front p site
负控阻遏调节
正控诱导调节
正控转录 调控系统
调节基因的产物是 激活蛋白 (activator)。
效应物分子(诱导物) 的存在使失去活性的激 活蛋白处于活性状态;
正控阻遏调节
效应物分子(辅阻遏物) 的存在使有活性的激活 蛋白处于非活性状态。
Operon control model
A、 Negative—inducible operon
• Co-repressor ( tryptophan )
stringent response应急反 应 attenuator 衰减子
1、Operon control
(1961 Jacob. & Monod.)
1)、 operon concept
●定义:是基因表达的协调单位,由启动子、操纵基
因及其所控制的一组功能上相关的结构基因所组成。 操纵基因受调节基因产物的控制。 • 例如:
Z编码β-半乳糖苷酶:将乳糖(β1,4糖苷键)水
解成葡萄糖和半乳糖
Y编码β-半乳糖苷透过酶:使外界的β-半乳糖苷
(如乳糖)能透过大肠杆菌细胞壁和原生质膜进入
细胞内。
A编码β-半乳糖苷乙酰基转移酶:乙酰辅酶A上的
乙酰基转到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。
O gene (operator) cis-action factor
Co-repressor
(共阻遏物)
原核生物基因表达调控方式:
负控诱导调节
负控转录调 控系统
调节基因的产物是 阻遏蛋白 (repressor), 阻止了结构基因的 转录。
阻遏蛋白与效应物(诱 导物)结合,使阻遏蛋 白失活,结构基因转录; 阻遏蛋白与效应物(辅阻 遏物)结合,使阻遏蛋白 产生活性,结构基因不转 录。
Luxury gene
1)、组成性表达:
指其表达几乎不受环境变动而变化的一类基因。该 类型基因通常被称为管家基因(housekeeping gene)。
2)、适应性表达:
指环境的变化容易使其表达水平变动的一类基因表达。 应环境条件变化,基因表达水平增高的现象称为诱导 (induction),这类基因被称为可诱导的基因(inducible gene)。 如果某种物质能够促使细菌产生某种酶来分解它,这种 物质就是诱导物。(分解代谢)
2、 基因表达的调控的方式:
transcriptional level(转录水平); post—transcriptional level(转录后水平); translational level(翻译水平); post—translational level (翻译后水平)。
转录水平的调控主要发生在起始时期。通常不在转 录延伸阶段进行调控,但可在终止阶段进行调控。
2)、 operon control type
Negative & Positive
(阻遏蛋白)
• I gene
repressor expressor (apoinducer)
(激活蛋白)无辅基诱导物
Negative Positive
i- or 不加入I基因产物 I+ or 加入I基因产物
(阻遏蛋白)
第一讲 原核生物基因表达 调控
主要内容
一、基因表达调控的基本概念: 二、 基因表达调控的理论与模式;
一、基因表达调控的基本概念:
1、基因表达调控的意义: 原核生物对环境的适应、对营养条件改变适应的 相关应答,都是基因表达的结果;
真核生物的细胞分化, 组织特化 , 个体发育以及 环境对个体表型的影响都是通过基因表达实现的。
repressor & RNA polymerase 对重叠位点竞争
---调控机理
无诱导剂时:repessor tetramer与operator发生特异结合 当培养基中有诱导剂时: Inducer (lactose) 与repressor 特异结合 tetramer 变构 特异结合力下降1000X operon on operon off
负(Negative) 转录调控:在没有调节蛋白质存在时基 因是表达的,加入这种调节蛋白质后基因表达活性便被 关闭,这样的调控称为负转录调控。该调节蛋白称为阻 遏蛋白。
8、 遗传信息表达的方式
• 组成型表达(constitutive expression) Housekeeping gene
• 适应性表达(adaptive expression)
4、顺式作用(cis-acting)元件:指不转变为其它任 何形式,只在原位发挥调控作用,仅影响与其在物理 上相连的基因表达的一段DNA序列。 顺式作用元件通常和启动子并列或散布在其周围。 经常与启动子相邻的一个顺式作用位点称为操纵基 因(Operator),它是调控蛋白:阻遏蛋白或激活蛋白 的靶位点。 当阻遏蛋白(或激活蛋白)和操纵基因结合时,就 会阻止(或激活)RNA 聚合酶启动转录,操纵基因下 游的结构基因表达会因此被关闭(或开放)。
萄糖,乳糖就会诱导lac操纵子表达分解乳糖所需的
三种酶。
该现象称为葡萄糖效应
其原因是代谢物阻遏效应。
B、 Negative—repressible operon (合成酶类)
• tryptophan synthease operon
• 色氨酸是一系列酶促反应的终产物
• R gene inactive repressor
组成型突变: iC
不可诱导突变(超阻遏):
两个问题: 1、lac操纵子的本底水平表达 有两个矛盾是操纵子理论所不能解释的: ①诱导物需要穿过细胞膜才能与阻遏物结合,而转运 诱导物需要透过酶,后者的合成有需要诱导。 解释:一些诱导物可以在透过酶不存在时进入细胞? 一些透过酶可以在没有诱导物的情况下合成?
在细菌中,一个mRNA的合成和它的翻译基本上是 同时进行的。翻译通常在其起始和终止阶段进行调控。 3、为了区分调控过程中的调控成分和其调控的基因, 又使用结构基因(Structural gene)和调控基因 (Regulator gene) 的概念。 结构基因是编码蛋白质或RNA的任何基因。结构基因 编码大量结构和功能各异的蛋白质,包括结构蛋白、 具有催化活性的酶和调控蛋白。 调控基因:是编码调控蛋白的结构基因,该蛋白可 以调控其它基因的表达。
• 特点:
● ● ●
各结构基因按一定比例协调翻译 ( Z : Y : A = 5 : 2 : 1 ) P & O基因(cis)紧密连锁 或 彼此重叠
I 基因(trans) 位点不固定,编码一种反式作用因子,可以 调控Z、Y、A结构基因的表达。含自己的启动子和终止子。
激活蛋白
●
激活转录启动
Operon off
意味转录效率极低
Negative control 一般是原核生物利用的调控方式,是 一种广泛保险的机制,使原核生物更好的适应外界营养 条件的变化。
●
Positive control 一般是真核生物喜欢利用的调控 方式。是一种灵活,严格,经济的调控机制
●
3)、Model
作用于 O 位点上的repressor 变构 脱离O位
作用于游离的repressor 变构 失去结合于O位的能力
调控机理
调控机理
w.t. (I+ O+ P+) 诱导型
add inducer operon on
no inducer operon off OC mut. (I+ OC P+) constitutive mut. (组成型) OC失去与repressor特异结合的能力
遗传信息的两大类别
I类;DNA seq. RNA seq. (codon) aa seq. protein phenotype(性状)
II类;特定DNA seq. + 特定蛋白质/ 核酸结合
基因表达的指令
gene on / off
7、调控的关键是调控基因编码蛋白质与与DNA 上的特 异位点(顺式反应位点)的结合来调控靶基因的转录。 调控基因在DNA上的位点一般位于所调控基因的上游。 这种相互作用可以通过两种方式进行: 正(Positive) 转录调控:如果在没有调节蛋白质存在 时基因是关闭的,加入这种调节蛋白质后基因被转录表 达,这样的调控是正转录调控。该调节蛋白称为激活蛋 白。
安慰诱导物:
如果某种物质能够诱导细菌产生某种酶而本身又不
被分解,这种物质被称为安慰诱导物,如IPTG(异
丙基- β –D-硫代半乳糖苷)。 相反,随环境条件变化而基因表达水平降低的现象 称为阻遏(repression),相应的基因被称为可阻遏的基 因(repressible gene)。 如果某种物质能够阻止细菌产生合成这种物质的酶, 这种物质就是辅阻遏物。(合成代谢)
在个体生长全过程,某种基因产物在个体 按不同组织空间顺序出现,称之为基因表达的
空间特异性。
空间特异性实际上是由细胞在器官的分布 决定的,所以空间特异性又称细胞或组织特异 性(cell or tissue specificity)。
二、 基因表达调控的理论与模式
一)、 transcriptional level control Prok. operon
O & P overlap repressor & RNA polymerase bind mRNA startpoint
at sites that overlap around the start point of Lac operon unwinding
RNA polymerase binding Repressor binding
●
Signal molecular be needed for both types Add signal mol. Operon on (inducible operon)
Inducer (诱导物)
Add signal mol. Operon off (repressible operon)
5、原核生物和真核生物的基因的组织形式差异很 大,细菌的功能相关的结构基因一般成簇(Cluster) 排列,而真核生物的基因则是独立存在。
原核成簇排列的结构基因能受单一启动子共同控 制:结果使整套基因或者表达或者都不表达。
6、 生物遗传信息的概念
10%; 结构基因的编码序列 triplet codon Genome DNA 90%; 重复,间隔,调节序列… 作用:基因选择性表达指令; 重要的遗传信息。
8、基因表达的规律
——时间性和空间性
1)、时间特异性(temporal specificity)
按功能需要,某一特定基因的表达严格按
特定的时间顺序发生,称之为基因表达的时间
特异性。
多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶
段特异性(stage specificity)。
2、空间特异性(spatial specificity)
②真正的诱导物是异构乳糖而非乳糖,前者是
在β -半乳糖甘酶的催化下由乳糖形成的,因 此,需要有β -半乳糖甘酶的预先存在。
解释:
本底水平的组成型合成:非诱导状态下有少量 的lac mRNA合成。
2、葡萄糖对lac操纵子的影响
如果将葡萄糖和乳糖同时加入培养基中, lac操
纵子处于阻遏状态,不能被诱导;一Baidu Nhomakorabea耗尽外源葡
组成型突变: lacOc
iC mut. (iC O+P+) constitutive mut. (组成型)
iC gene产物repressor丧失与O位点结合的能力 iS mut. (iS O+P+) super-repression mut. (超阻型) iS gene 产物repessor 不能与inducer结合
I
例 (分解酶类 lactose operon)
例如:在Lactose operon中
I gene active repressor
38 kd / monomer
tetramer 152 kd
binding on Operator
大肠杆菌乳糖操纵子的结构:
Lac. Operon structure
operon on operon off operon off operon on
Neg.
i- or 不加入I基因产物 I+ or 加入I基因产物
(激活蛋白)
Pos.
●
Repressor binding on O site 阻遏蛋白 阻止转录启动
Expressor binding front p site
负控阻遏调节
正控诱导调节
正控转录 调控系统
调节基因的产物是 激活蛋白 (activator)。
效应物分子(诱导物) 的存在使失去活性的激 活蛋白处于活性状态;
正控阻遏调节
效应物分子(辅阻遏物) 的存在使有活性的激活 蛋白处于非活性状态。
Operon control model
A、 Negative—inducible operon
• Co-repressor ( tryptophan )
stringent response应急反 应 attenuator 衰减子
1、Operon control
(1961 Jacob. & Monod.)
1)、 operon concept
●定义:是基因表达的协调单位,由启动子、操纵基
因及其所控制的一组功能上相关的结构基因所组成。 操纵基因受调节基因产物的控制。 • 例如:
Z编码β-半乳糖苷酶:将乳糖(β1,4糖苷键)水
解成葡萄糖和半乳糖
Y编码β-半乳糖苷透过酶:使外界的β-半乳糖苷
(如乳糖)能透过大肠杆菌细胞壁和原生质膜进入
细胞内。
A编码β-半乳糖苷乙酰基转移酶:乙酰辅酶A上的
乙酰基转到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。
O gene (operator) cis-action factor
Co-repressor
(共阻遏物)
原核生物基因表达调控方式:
负控诱导调节
负控转录调 控系统
调节基因的产物是 阻遏蛋白 (repressor), 阻止了结构基因的 转录。
阻遏蛋白与效应物(诱 导物)结合,使阻遏蛋 白失活,结构基因转录; 阻遏蛋白与效应物(辅阻 遏物)结合,使阻遏蛋白 产生活性,结构基因不转 录。
Luxury gene
1)、组成性表达:
指其表达几乎不受环境变动而变化的一类基因。该 类型基因通常被称为管家基因(housekeeping gene)。
2)、适应性表达:
指环境的变化容易使其表达水平变动的一类基因表达。 应环境条件变化,基因表达水平增高的现象称为诱导 (induction),这类基因被称为可诱导的基因(inducible gene)。 如果某种物质能够促使细菌产生某种酶来分解它,这种 物质就是诱导物。(分解代谢)
2、 基因表达的调控的方式:
transcriptional level(转录水平); post—transcriptional level(转录后水平); translational level(翻译水平); post—translational level (翻译后水平)。
转录水平的调控主要发生在起始时期。通常不在转 录延伸阶段进行调控,但可在终止阶段进行调控。
2)、 operon control type
Negative & Positive
(阻遏蛋白)
• I gene
repressor expressor (apoinducer)
(激活蛋白)无辅基诱导物
Negative Positive
i- or 不加入I基因产物 I+ or 加入I基因产物
(阻遏蛋白)
第一讲 原核生物基因表达 调控
主要内容
一、基因表达调控的基本概念: 二、 基因表达调控的理论与模式;
一、基因表达调控的基本概念:
1、基因表达调控的意义: 原核生物对环境的适应、对营养条件改变适应的 相关应答,都是基因表达的结果;
真核生物的细胞分化, 组织特化 , 个体发育以及 环境对个体表型的影响都是通过基因表达实现的。
repressor & RNA polymerase 对重叠位点竞争
---调控机理
无诱导剂时:repessor tetramer与operator发生特异结合 当培养基中有诱导剂时: Inducer (lactose) 与repressor 特异结合 tetramer 变构 特异结合力下降1000X operon on operon off
负(Negative) 转录调控:在没有调节蛋白质存在时基 因是表达的,加入这种调节蛋白质后基因表达活性便被 关闭,这样的调控称为负转录调控。该调节蛋白称为阻 遏蛋白。
8、 遗传信息表达的方式
• 组成型表达(constitutive expression) Housekeeping gene
• 适应性表达(adaptive expression)
4、顺式作用(cis-acting)元件:指不转变为其它任 何形式,只在原位发挥调控作用,仅影响与其在物理 上相连的基因表达的一段DNA序列。 顺式作用元件通常和启动子并列或散布在其周围。 经常与启动子相邻的一个顺式作用位点称为操纵基 因(Operator),它是调控蛋白:阻遏蛋白或激活蛋白 的靶位点。 当阻遏蛋白(或激活蛋白)和操纵基因结合时,就 会阻止(或激活)RNA 聚合酶启动转录,操纵基因下 游的结构基因表达会因此被关闭(或开放)。
萄糖,乳糖就会诱导lac操纵子表达分解乳糖所需的
三种酶。
该现象称为葡萄糖效应
其原因是代谢物阻遏效应。
B、 Negative—repressible operon (合成酶类)
• tryptophan synthease operon
• 色氨酸是一系列酶促反应的终产物
• R gene inactive repressor
组成型突变: iC
不可诱导突变(超阻遏):
两个问题: 1、lac操纵子的本底水平表达 有两个矛盾是操纵子理论所不能解释的: ①诱导物需要穿过细胞膜才能与阻遏物结合,而转运 诱导物需要透过酶,后者的合成有需要诱导。 解释:一些诱导物可以在透过酶不存在时进入细胞? 一些透过酶可以在没有诱导物的情况下合成?
在细菌中,一个mRNA的合成和它的翻译基本上是 同时进行的。翻译通常在其起始和终止阶段进行调控。 3、为了区分调控过程中的调控成分和其调控的基因, 又使用结构基因(Structural gene)和调控基因 (Regulator gene) 的概念。 结构基因是编码蛋白质或RNA的任何基因。结构基因 编码大量结构和功能各异的蛋白质,包括结构蛋白、 具有催化活性的酶和调控蛋白。 调控基因:是编码调控蛋白的结构基因,该蛋白可 以调控其它基因的表达。