分子生物学问题汇总
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Section A 细胞与大分子
简述复杂大分子的生物学功能及与人类健康的关系。
Section C 核酸的性质
1.DNA的超螺旋结构的特点有哪些?
A 发生在闭环双链DNA分子上
B DNA双链轴线高卷曲,与简单的环状相比,连接数发生变化
C 当DNA扭曲方向与双螺旋方向相同时,DNA变得紧绷,为正超螺旋,反之变得松弛为负超螺旋。自然界几乎所有DNA分子超螺旋都为负的,因为能量最低。
2.简述核酸的性质。
A 核酸的稳定性:由于核酸中碱基对的疏水效应以及电荷偶极作用而趋于稳定
B 酸效应:在强酸和高温条件下,核酸完全水解,而在稀酸条件下,DNA的核苷键被选择性地断裂生成脱嘌呤核酸
C 碱效应:当PH超出生理范围时(7-8),碱基的互变异构态发生变化
D 化学变性:一些化学物质如尿素,甲酰胺能破坏DNA和RNA二级结构中的
而使核酸变性。
E 粘性:DNA的粘性是由其形态决定的,DNA分子细长,称为高轴比,可被机械力和超声波剪切而粘性下降。
F 浮力密度:1.7g/cm^3,因此可利用高浓度分子质量的盐溶液进行纯化和分析
G 紫外线吸收:核酸中的芳香族碱基在269nm 处有最大光吸收
H 减色性,热变性,复性。
思考题:提取细菌的质粒依据是核酸的哪些性质?
质粒是抗性基因,,在基因组或者质粒DNA中用碱提取法。
Sectio C 课前提问
1.在1.5mL的离心管中有500μL,取出10 μL稀释至1000 μL后进行检测,测得A260=0.15。
问(1):试管中的DNA浓度是多少?
问(2):如果测得A280=0.078, .A260/A280=?说明什么问题?
(1)稀释前的浓度:0.15/20=0.0075
稀释后的浓度:0.0075/100=0.75ug/ml
(2)0.15/0.078=1.92〉1.8,说明DNA中混有RNA样品。
2.解释以下两幅图
(native:非变性的;denatured:变性的)图一表示dsDNA和RNA的热变性,中间的Tm值表示解链温度。随着温度的升高,DNA和RNA逐渐变性形成单链,因此光吸收率逐渐增大,然而随着温度的升高RNA中双链部分的碱基堆积逐渐减少,其光吸收率不规则地增大。较短的碱基配对区域具有更高的热力学活性,比较长的区域变性快。图二表示的是快速慢速降温下的DNA复性,在温度缓慢下降时,DNA可以经碱基配对逐渐形成双链,但在快速降温时,DNA只形成局部区域的dsDNA,经碱基配对或者在DNA内部或者DNA之间短的互补区域的退火而形成,因此A260的下降很小。
Sectio E 提问
大肠杆菌的DNA聚合酶主要有哪几种?它们有哪些特点?
DNA聚合酶I:切除引物,修复
DNA聚合酶II:修复
DNA聚合酶III:复制
Section E DNA复制
1.细胞周期(The cell cycle)
(1)什么是细胞周期?
细胞周期包括DNA复制后的细胞分裂,即从一个母细胞产生两个子细胞。(2)细胞分裂是有序的还是无序的?为什么?
细胞周期是一个有序的过程,受细胞周期机制的控制。
2.检验点及其调控(Checkpoints and their regulation)
(1)细胞如何从G0进入G1?
G0期是指非增殖的休眠状态,称为沉默期。G1期有一限制点(R点)细胞会对环境进行评估,然后决定是否进入另一个分裂周期。细胞在到达R点之前具有胞外生长分子-促细胞分裂原即可使细胞从G0进入G1期。
(2)限制点(R点)
G1期,细胞会对环境进行评估,然后决定是否进入另一个分裂周期,G1期的
这一点称为限制点。
Section F DNA损伤、修复与重组
思考题
(1)5’-GTATCTTCTGATGGCTCGTGTACAAACACG-3’
3’-CATAGAAGACTACCGAGCACATGXXXGTGC-5’
根据Holliday 模型在什么时候可以被修复?
该损伤的DNA链“XXX”部分本为“TTT”,修复时与另一个正常的DNA 分子同源重组,“XXX”段将通过重组被正常的姐妹链上相应区域的“TTT”替代修复,而正常链上因此产生的缺口会被个填平。因为它的对面没有损伤,可通过正常的切除去掉,这样子就修复了。
(2)设计实验以区别细菌遗传转化转移中的转化、转导和结合的过程。下面列出可使用的工具:(1)合适的突变菌株及其培养基。(2)DNA酶。(3)两种滤板,一种滤板能让游离的DNA通过,不可让细菌和病毒通过;另一种滤板只能持留细菌。(4)一种是插入滤板使其分隔成两个空间的玻璃容器(如U型管)。请写出实验设计并预期3种遗传转移过程的结果。
Section K
ω亚基:ω亚基的功能尚不清楚,也有人认为ω亚基对于RNA聚合酶的结构和功能没有太大的影响。问题:
(1)什么是启动子?上游?下游?转录起点?
启动子:RNA聚合酶结合到待转录序列上游的特定起始位点,长约40bp
转录起始点:CGT/CAT,G比A更常见,被称为+1位点。
(2)原核生物δ70 启动子有哪些特点?
大肠杆菌最常见的δ因子,由40-60bp的序列组成。,含有RNA聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列。转录起始位点为+1位点,CGT/CAT,-10序列为TATAAT,也叫pribnow框,-35序列为TTGACA,也叫sextama框。
(3)原核生物的转录是如何终止的?
基因3’端自身互补的序列会在RNA中形成发夹结构作为终止子。发夹的茎部通常(G/C)含量较高,使其稳定性强,从而使聚合酶从此停顿。发夹之后通常是4个或更多的U碱基,导致RNA与反义DNA的弱结合。有利于RNA链解离,从而终止转录。
分析题
以下是一段原核生物的DNA序列,请找出以下功能位点,并说明理由:
(1) 一个启动子;(2)一个转录起始位点;(3)一个转录起始密码子;(4)一个转录终止密码子;(5)一个转录终止子。GAATTCCGGCGGCGGGGTTTTCATTATTATGATCGTTGACATGGGACA AGGGGCTCCTATAAT AGGTGCAT TTGT AGGAGGT GTGGCCAC ATG ATA GCG (-35序列)(-10序列)启动子/+1起始位点(SD 序列)(起始密码子)
+1 CGTCGAGGCATTCAGGACCGATATTGTCATATTGCCAGCATGCTGCAG CGCGCCAACTTAGTTACAACTTATACGATGATTTTAAAAAAAGAATATCA AATAGCCATCCACCCGAAAGACCACCGCAAGTATCGGTACGATCGTAC