多重置换扩增结合短串联重复序列在植入前遗传学诊断中的应用

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多重连接依赖性探针扩增技术在产前诊断中的应用

多重连接依赖性探针扩增技术在产前诊断中的应用

多重连接依赖性探针扩增技术在产前诊断中的应用产前诊断是在遗传咨询的基础上,主要通过遗传学检测和影像学检查,对高风险胎儿进行明确诊断,通过对患胎的选择性流产达到胎儿选择的目的,从而降低出生缺陷率,提高优生质量和人口素质。

多重连接依赖性探针扩增(MLPA)技术是在多重扩增探针杂交(MAPH)技术的基础上改进而来,基本原理是针对基因组内拷贝数变异(CNV)对可与样本DNA正确杂交并被连接酶连接的探针进行扩增和半定量分析,具有精确度高、重复性好、操作简便及通量大等特点。

MLPA已广泛应用于染色体数目异常、遗传性疾病基因缺失重复、单核苷酸多态性、甲基化等多个研究领域等。

随着MLPA不断被改进,目前已成为临床上常用的产前诊断工具之一,因此本文就其在产前诊断中的应用做一总结。

1 MLPA原理MLPA是集DNA杂交技术、PCR技术、连接酶反应技术和毛细管电泳技术与一体,具有高特异性、高灵敏性和高通量的一种分子生物学技术。

MLPA最大特点在于探针的设计。

探针包括两个长短不一的荧光标记寡核苷酸片段。

短探针(5' 端探针)为化学合成而来,长约50-60bp,包括一段3'端与靶序列完全互补的杂交序列和一段5' 端长19 nt的共同PCR上游引物互补序列。

长探针(3'端探针)是经M13噬菌体衍生法制备而来,长约60-450bp,包括一段5'端与靶序列完全互补的杂交序列和一段3'端23nt共同PCR下游引物相互补序列及一段长度不一的中间填充序列。

由于填充序列长短不一,连接后总长度在130 nt-480nt之间,相邻两探针扩增产物长度相差6-9 nt,因而能在一个反应体系中,仅用一对引物即可扩增达45个不同的核苷酸序列。

由此可见,MLPA所得到了产物不是直接针对原始样本中存在的序列,而是由两条探针经连接反应形成的片段。

连接反应高度特异,只有当两个探针与靶序列完全杂交,连接反应才能进行,如果靶序列与探针序列不完全互补,即使只有一个碱基的差别,就会导致杂交不完全,使连接反应无法进行。

短串联重复序列名词解释

短串联重复序列名词解释

短串联重复序列名词解释摘要:一、短串联重复序列的定义二、短串联重复序列的特点三、短串联重复序列在生物学中的应用四、短串联重复序列的优缺点分析五、短串联重复序列的未来发展趋势正文:短串联重复序列(Short Tandem Repeats,STRs)是一类广泛存在于生物体基因组中的短序列,其特点是具有相对简单的重复模式,通常由2-6 个碱基对组成。

STRs 在生物学、法医学以及遗传学等领域具有重要的应用价值。

短串联重复序列的特点主要表现在以下几个方面:首先,STRs 具有高度的保守性,即使在不同的生物种类中,同一种STRs 的重复次数也具有很高的相似性;其次,STRs 在基因组中的分布具有随机性,这使得它们在遗传学研究中具有很好的标记作用;最后,STRs 的重复次数在不同个体之间存在差异,这种差异可以用来进行个体的识别和亲缘关系的鉴定。

短串联重复序列在生物学领域有很多应用,如:在遗传学研究中,STRs 可以作为遗传标记用于遗传病的诊断和遗传连锁分析;在法医学中,STRs 可以作为DNA 指纹用于个体识别和亲子鉴定等。

此外,STRs 在基因表达调控、基因进化以及基因组稳定性研究中也有广泛应用。

虽然短串联重复序列在生物学研究和应用中具有很多优点,但是也存在一些缺点,如:在基因组中,STRs 的分布可能过于密集,导致分析过程中出现技术误差;另外,STRs 的高度保守性也可能导致在不同物种间进行比较研究时存在局限性。

未来,随着科学技术的进步,短串联重复序列的应用将更加广泛,其在生物学、医学和法医学等领域的研究也将更加深入。

同时,随着基因组学、转录组学和表观遗传学等研究技术的发展,短串联重复序列在生物信息学中的应用也将得到进一步拓展。

综上所述,短串联重复序列作为一种重要的生物学研究工具,在多个领域具有广泛的应用前景。

DNA重复序列及其在遗传学中的作用

DNA重复序列及其在遗传学中的作用

DNA重复序列及其在遗传学中的作用DNA是构成生命的基本单元,每个物种的基因组中都含有大量不同类型的DNA序列。

其中,重复序列是一种重要的DNA序列类型,指在基因组中出现多次的相同或相似的DNA片段。

这些重复序列在进化过程中发挥了重要的作用,在遗传学领域也有着广泛的应用。

1. 重复序列的分类和特点根据DNA重复序列的长度和重复数目,可以将其分为微卫星、单拷贝基因、低复性DNA和高复性DNA四种类型。

(1)微卫星微卫星又称简单重复序列,是由2至6个核苷酸长度的重复单元组成的序列。

这些重复单元一般为A、T、C、G四种核苷酸中的某种,比如ATATATATAT、CGCGCGCGCG等。

微卫星在基因组中广泛分布,可以用于物种鉴定、亲权鉴定、犯罪调查等方面。

(2)单拷贝基因单拷贝基因包括蛋白质编码基因、rRNA编码基因等,在基因组中仅存在一两个拷贝。

这些基因的DNA序列在进化中相对稳定,可以用于物种演化的研究和亲缘关系的分析。

(3)低复性DNA低复性DNA也称为中等重复序列,包括LINEs和SINEs两种类型。

LINEs(长间隔反转录转座子)长度约为6-8kb,SINEs(短间隔反转录转座子)长度约为100-300bp。

(4)高复性DNA高复性DNA包括以DNA转座因子、LTR反转录转座子和satellite DNA为代表的多种序列,其特点是在基因组中重复的次数非常多,不同个体之间的重复长度和随机位置也差异较大。

高复性DNA中的satellite DNA有着广泛用途,可以用于人类遗传学、昆虫分类学、植物优良性状筛选等领域。

2. 重复序列在遗传学中的作用重复序列在进化和表观遗传学中扮演着重要角色。

(1)进化作用重复序列的增减和转位是进化过程中的重要变化方式。

当有害基因突变累积到一定程度时,重复序列的随机失活和转移可以在较短时间内快速创造新的重复序列并转座到新的位置,降低有害突变的积累效应。

此外,重复序列的插入和删除可以影响基因组结构和功能,进而推动基因组进化。

短串联重复序列名词解释

短串联重复序列名词解释

短串联重复序列名词解释短串联重复序列(short tandem repeat, STR)是一种在基因组中广泛存在的序列重复结构。

它们通常由2到6个碱基组成,而且这些重复单元排列成串联的形式。

短串联重复序列可在人类基因组的非编码区域和编码区域中找到,且对个体间遗传变异具有高度敏感性。

短串联重复序列的存在是由基因组中的片段发生复制错误造成的。

这种错误会导致重复单元的数目增加或减少,从而导致个体间的DNA序列差异。

STR是一种多态性标记,它们在人类个体之间的差异拥有很高的遗传变异率。

STR通常在分子遗传学和法医学中被广泛应用。

在分子遗传学研究中,STR用于构建遗传图谱和人类起源研究,以及确定基因与疾病之间的关联。

在法医学中,STR用于个体识别和人类身份验证,例如在犯罪现场DNA样本的分析。

短串联重复序列的命名通常以“D”开头,后面跟着一个数字。

这个数字表示该STR位点在基因组中的位置。

不同的STR位点具有不同的单元长度和重复单元数目。

例如,D1S80是在基因组上的一个STR位点,其导致的DNA序列多态性由80个重复单元的长度决定。

STR分析基于聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)技术,利用特异性引物扩增目标区域的DNA片段。

扩增后的DNA片段通过凝胶电泳进行分离,根据DNA片段的大小和数量进行分析和比较。

这种方法非常灵敏和可靠,可以从微量的DNA样本中分析出结果。

由于短串联重复序列在个体间高度可变且具有高复杂性,因此可以用于亲子鉴定和个体间的亲缘关系分析。

根据STR位点上的重复单元数目和长度,可以计算个体之间的遗传距离和亲缘度。

这种方法在法律和家族关系确认中有重要应用。

短串联重复序列的变异性还可用于种群遗传学研究和进化生物学中。

通过分析不同种群之间的STR多态性,可以揭示种群间的遗传结构和迁移模式。

这对于理解人类和其他生物种群的起源、扩散和历史演化具有重要意义。

多重置换扩增文献解读

多重置换扩增文献解读

多重置换扩增文献解读多重置换扩增(Multiplex PCR)是一种在单个反应中同时扩增多个目标序列的PCR技术。

它在分子生物学和遗传学研究中得到广泛应用,可以高效地检测多个基因、位点或突变,具有高通量、高灵敏度和高效率的特点。

下面我将从多个角度对多重置换扩增文献进行解读。

1. 技术原理:多重置换扩增利用多个引物对多个目标序列进行同时扩增。

引物的设计需要考虑目标序列的特异性和互补性,以确保扩增的准确性和特异性。

在PCR反应中,通过调节引物浓度和扩增条件,使得不同目标序列可以在同一反应中被扩增出来。

2. 应用领域:多重置换扩增在医学诊断、遗传病筛查、基因分型、疾病相关基因检测等领域具有广泛的应用。

例如,在遗传病筛查中,可以同时检测多个与遗传病相关的基因,提高检测效率和准确性。

在基因分型研究中,可以同时检测多个位点,用于人群遗传学研究和个体基因分型。

3. 优势和挑战:多重置换扩增相比传统的单目标PCR具有明显的优势。

首先,它可以节省时间和成本,因为多个目标序列可以在同一反应中扩增。

其次,它可以减少样本消耗,特别适用于样本量有限的情况。

然而,多重置换扩增也存在一些挑战,如引物设计的复杂性和优化反应条件的难度,需要充分考虑引物间的特异性和互补性,以及反应条件的优化,以避免非特异性扩增和引物间的竞争。

4. 实验设计和结果解读:在进行多重置换扩增实验时,需要精确设计引物和优化反应条件。

引物的选择应基于目标序列的特异性和互补性,可以通过生物信息学工具进行预测和评估。

反应条件的优化包括引物浓度、Mg2+浓度、循环数和温度等参数的调节。

在实验结果的解读中,需要根据目标序列的预期扩增大小、特异性和目标序列的存在与否进行判断。

综上所述,多重置换扩增是一种高效、高通量的PCR技术,广泛应用于分子生物学和遗传学研究。

它的应用领域广泛,具有许多优势和挑战。

在实验设计和结果解读中,需要仔细考虑引物设计和反应条件的优化,以确保实验的准确性和可靠性。

X-连锁严重联合免疫缺陷病的植入前遗传学诊断

X-连锁严重联合免疫缺陷病的植入前遗传学诊断

X-连锁严重联合免疫缺陷病的植入前遗传学诊断吴海涛;沈晓婷;叶青剑;刘瑜亮;钟依平;曾艳红;徐艳文;周灿权【摘要】[目的]采用多重置换扩增建立一种可靠、准确的植入前遗传学诊断方法,应用于X-连锁严重联合免疫缺陷病(X-SCID)的植入前遗传学诊断(PGD).[方法]选择5个位于致病基因IL-2受体γ链(IL2RG)基因两侧的短串联重复序列(STR)位点对X-SCID家系进行单体型分析,采用多重置换扩增(MDA)对单细胞进行全基因组扩增,对扩增产物采用在家系分析中具有多态性的STR位点进行单体型分析,结合位点Amel进行性别诊断,STR位点均采用单重荧光PCR,同时对IL2RG基因exon5进行测序分析.[结果]对家系分析中,共有3个STR位点具有多态性.对10个单淋巴细胞及10个单卵裂球进行了预实验:MDA扩增成功率为100%,对致病基因IL2RG exon5的行基因测序的检测效率为100%;对于3个有多态性的STR位点和AMEL,PCR扩增效率为96.3%(77/80),等位基因脱扣率(ADO)为11.5%(7/61).对该家系进行了一个周期的PGD,对7个胚胎进行了诊断,其中2个为正常胚胎,移植后获得双胎妊娠,早产活产一个健康男婴及一个健康女婴.[结论]采用多重置换扩增结合致病基因特异性扩增测序检测及单体型分析在单细胞水平对X-连锁严重联合免疫缺陷病进行检测,两者相结合可避免污染、等位基因脱扣等导致的误诊,提高了PGD诊断效率.%[Objective]To establish a reliable and accurate preimplantation genetic diagnosis (PGD)method using multipledis?placement amplification (MDA), which can be applied to the diagnosis of X-linked severe combined immunodeficiency disease (X-SCID).[Methods]Haplotype analysis for the X-SCID family was performedusing five short tandem repeats (STR) markers flanking the both sides of the interleukin-2 (IL-2) receptor gamma chain (IL2RG) gene. MDAtechnique was used for single-cell whole genomic amplification. The products were used as template in polymerase chain reaction (PCR) of informative STR markers found by linkage analysis for haplotype analysis as well as sequencing of the IL2RG gene exon 5.The amelogenin (AMEL) locus was used to do sex diag?nosis.[Results]Linked analysis revealed 3 STR markers were informative. The method was evaluated with 10 single lymphocytes and 10 single blastomeres. MDA was successful in all single cell. The detection efficiency of gene sequencing of pathogenic IL 2RG exon5 was 100%. The PCR efficiency of 3 STR informative markers and AMEL was 96.3%(77/80)and the average allele drop-out (ADO) rate was 11.5%(7/61). A cycle of PGD was performed on the family, and seven embryos were diagnosed, two of which were normal embry?os. Twin pregnancy occurred after transplantation which were given a healthy baby boy and a healthy baby girl.[Conclusion]In this study, multiple displacement amplification combined with specificamplification/sequencing of pathogenic gene and haplotype analysis in the single cell level of X-linked severe combined immunodeficiency disease were performed. The protocol can avoid misdiagnosis caused by contamination and ADO, and improve the diagnostic efficiency of PGD.【期刊名称】《中山大学学报(医学科学版)》【年(卷),期】2017(038)006【总页数】6页(P955-960)【关键词】X-连锁严重联合免疫缺陷病;植入前遗传学诊断;多重置换扩增;短串联重复序列;单体型分析【作者】吴海涛;沈晓婷;叶青剑;刘瑜亮;钟依平;曾艳红;徐艳文;周灿权【作者单位】中山大学附属第一医院生殖医学中心,广东广州 510080;江门市中心医院生殖中心,广东江门 529030;中山大学附属第一医院生殖医学中心,广东广州510080;中山大学附属第三医院妇科,广东广州 510630;中山大学附属第一医院生殖医学中心,广东广州 510080;中山大学附属第一医院生殖医学中心,广东广州510080;中山大学附属第一医院生殖医学中心,广东广州 510080;中山大学附属第一医院生殖医学中心,广东广州 510080;中山大学附属第一医院生殖医学中心,广东广州 510080【正文语种】中文【中图分类】R715严重联合免疫缺陷病(severe combinedimmunodeficiency,SCID)为一组由不同基因异常所致严重T细胞缺乏(或功能异常),并伴随B细胞功能异常的原发性免疫缺陷疾病(primaryimmunodeficiency,PID),发病率为1/(7.5~10)万[1-2]。

D3S1358等10个短串联重复序列位点在亲子鉴定中的应用

D3S1358等10个短串联重复序列位点在亲子鉴定中的应用

D3S1358等10个短串联重复序列位点在亲子鉴定中的应用短串联重复序列(STR)在人类基因组中分布广泛、多态性高且易于扩增。

因而成为重要的遗传标记系统。

被广泛应用于法医学个体识别和亲予鉴定等。

汕头出入境检验检疫局恒正司法鉴定中心采用AmpF/ STR SGM Plus试剂盒获得了广东汕头地区汉族人群群体遗传学数据。

并应用于亲子鉴定。

为综合评估这10个STR位点的应用价值。

该文从几个常用的法医统计指标和亲予鉴定的角度进行探讨。

双亲亲子鉴定共21例:排除亲子关系2例,排除指标(位点数)分别为6和4:可以肯定亲子关系19例,亲权概率RCP在0.9993~0.99999998,其中1例出现1个排除指标,其余1 8例所有位点完全匹配,未出现排除指标。

单亲亲予鉴定共93例:排除亲子关系5例,排除指标最少有4个,最多有7个:可以肯定亲子关系51例,RCP均≥99. 900/0,其中3例出现1个排除指标;其余37例的RCP< 99. 90%。

其中1例出现1个排除指标,1例出现2个排除指标。

3讨论3.1 群体遗传学分析所有位点中以D18S51和FGA位点基因型和等位基因最多。

最少的位点是D 3S1358和TH01。

按从大到小顺序大致可排列为:D 18S 51、FGA、D2S13 38、D21Sll、D19S433、D8S1179、D16S539、vWA、D3S1358、TH01. 将该文报道等位基因频率和美国人群f黑人、白人和拉美人1的等位基因分布资料‘习比较分析可见。

汕头地区汉族人群检见美国人群中未经报道的基因:D 21S11- 28.2、33;FG每24.2、25.2、26.2。

与“中国罪犯DNA数据库”报道一裂刨。

该中心2003年4月发表昀1篇文章曾报道,汕头地区汉族人群D19S433位点不符合HWE平衡,并分析认为原因之一可能是样本数太岁1J。

笔者经增加样本数重新计算后该位点已符合HWE平衡,验证了之前的推测。

多重置换扩增在法医物证鉴定中的应用的开题报告

多重置换扩增在法医物证鉴定中的应用的开题报告

多重置换扩增在法医物证鉴定中的应用的开题报告题目:多重置换扩增在法医物证鉴定中的应用一、研究背景和意义随着社会的发展,犯罪事件频繁发生,而现代科技的发展为犯罪嫌疑人的追踪和犯罪证据的鉴定提供了更为先进和精确的方法,其中法医物证鉴定是犯罪侦查工作中的一项重要的技术手段。

现代的 DNA 鉴定技术已经成为刑事案件中的重要鉴定手段,而多重置换扩增(Multiplex PCR)技术是一种快速、准确、高效的 DNA 鉴定技术,可以同时检测多个位点的 DNA 片段,因此在现代法医学中被广泛应用。

二、研究内容和方法本研究将基于多重置换扩增技术在法医物证鉴定中的应用,具体研究内容包括以下几个方面:1. 多重置换扩增技术的原理及其优势。

对多重置换扩增技术的原理进行剖析,探讨其与传统PCR 技术的区别,并介绍其在法医学中的应用。

2. 多重置换扩增技术在血样、唾液、头发等生物样本中的应用。

针对不同的生物样本,探索多重置换扩增技术的应用效果,比较其与传统PCR 技术的优缺点。

3. 多重置换扩增技术在亲子鉴定、刑事案件鉴定中的应用。

以实际案例为例,对多重置换扩增技术在亲子鉴定、刑事案件鉴定中的应用进行探讨,并分析其可行性和适用性。

本研究将采用文献研究和实验方法相结合的方式,通过查阅相关文献资料,深入了解多重置换扩增技术在法医物证鉴定中的应用,同时在实验室进行针对性的实验,比较评估多重置换扩增技术与传统PCR的鉴定效果,以验证它的可行性和适用性。

三、研究预期成果本研究预期获得以下成果:1. 建立多重置换扩增技术在法医物证鉴定中的应用模型,验证其可行性和适用性。

2. 分析比较多重置换扩增技术与传统PCR的优缺点,为法医物证鉴定提供更为准确和高效的技术手段。

3. 提高社会大众对法医物证鉴定的认识和了解,为打击犯罪提供更加有效的技术保障。

四、研究进度计划本研究计划分为以下几个阶段:1. 第一阶段(1个月):对多重置换扩增技术原理进行深入了解,研究其在法医物证鉴定中的应用。

应用二代测序技术进行胚胎植入前遗传学筛查及诊断的基本原理

应用二代测序技术进行胚胎植入前遗传学筛查及诊断的基本原理

应用二代测序技术进行胚胎植入前遗传学筛查及诊断的基本原理LI Li-li;SUN Nan;ZHANG Wen-xin【摘要】辅助生殖技术的发展已帮助越来越多不孕不育的夫妇解决生育难题,而胚胎植入前遗传学筛查(PGS)及胚胎植入前遗传学诊断(PGD)进一步排除了存在遗传缺陷的胚胎,并选择健康胚胎进行植入,从而极大降低了新生儿患遗传性疾病的概率.这两项技术最初采用基于分子杂交或聚合酶链式反应(PCR)的检测方法,随后微阵列技术也被应用其中.随着人类基因组计划的完成,DNA测序技术进入高速发展的阶段,二代测序(NGS)采用鸟枪法为基本测序策略,结合生物信息学工具,以高通量、较低成本、检测项目覆盖面广、自动化程度高、可检测未知片段等优势,正不断扩大在PGS/PGD中的应用,同时也对辅助生殖技术产生了深远的影响.【期刊名称】《中国医学装备》【年(卷),期】2019(016)007【总页数】8页(P7-14)【关键词】二代测序技术;胚胎植入前遗传学筛查;胚胎植入前遗传学诊断【作者】LI Li-li;SUN Nan;ZHANG Wen-xin【作者单位】;;【正文语种】中文【中图分类】R394-3遗传学和基因组学的快速发展对人类生命健康及繁衍的影响日益深远,对多种常见和罕见疾病的研究有助于对应预防、检测及治疗方法的开发,从而提高患者及其家人的生活质量。

在不孕不育等问题日益严峻的情况下,辅助生殖技术(assisted reproductive technology,ART)应运而生并被采用于个性化的生育治疗策略,帮助受生育难题困扰的家庭。

其中,植入前遗传学筛查(preimplantation genetic screening,PGS)主要针对高龄、反复助孕失败、反复自然流产等患者,进行植入前胚胎的染色体畸变检测,用于筛查和丢弃染色体畸变的胚胎,保证受孕者所植入的胚胎具有正常染色体组的同时,解决因胚胎染色体畸变而导致的植入失败和反复流产现象,并提高妊娠率[1-2];植入前遗传学诊断(preimplantation genetic diagnosis,PGD)则主要针对父母本已患有明确遗传病或携带其致病基因,在种植前对胚胎进行相应遗传学诊断,主要包括单基因遗传病和染色体病(如罗氏易位、平衡易位等),通过选择无致病因素的胚胎进行植入,以提高生育健康婴儿的概率[3]。

遗传学研究中的PCR技术

遗传学研究中的PCR技术

遗传学研究中的PCR技术PCR技术在遗传学研究中是非常重要的一项技术,因为它能够帮助科学家们更好地研究基因,从而更好地理解生命的本质。

本文将简要介绍PCR技术在遗传学研究中的应用和意义。

PCR技术是一种能够大量扩增DNA序列的方法。

具体来说,PCR是将一个双链DNA模板的两条链分离,并在两条链之间加入适当的引物,通过DNA聚合酶,在适当的温度下反复进行降温和升温的循环,产生大量的DNA复制品。

这种方法通常用于测定DNA序列中的单个基因或一小段DNA。

PCR技术有着广泛的应用范围,尤其是在遗传学研究领域中。

通过PCR扩增DNA序列,科学家们可以研究基因组的不同部分,了解基因表达和突变的机制,探索基因与疾病之间的关系。

下面将分别介绍PCR技术在遗传学研究中的一些典型应用。

1.基因诊断PCR技术可以用于诊断基因突变和基因缺失等遗传病。

例如,通过扩增突变基因本身或者与突变基因相邻的序列,研究者们可以确定突变位置和严重程度,并将其与不同种族和家族的正常人进行比较。

此外,PCR还可以用于分析细胞的染色体构成,检测遗传疾病相关的染色体异常。

2.人类起源和进化研究通过分析一些基因区域或基因组中的单核苷酸多态性(SNP)或简单重复序列(STR),科学家们可以研究人类之间的近亲关系,以及不同人种之间的遗传差异。

这种方法可以用于研究人类起源和进化,探讨人类间的亲缘关系,如父系和母系的起源、迁徙等。

3.基因表达和突变机制研究PCR技术还可以用于研究基因表达和突变的机制。

通过使用RT-PCR技术,科学家们可以扩增出转录后mRNA中的基因序列,从而研究基因表达和调控机制。

此外,PCR还可以用于检测基因组中复制数变异以及染色体的易位等突变。

总之,PCR技术在遗传学研究中有着重要的应用和意义。

通过这项技术,科学家们能够更好地了解基因组的结构和功能,深入研究基因与疾病之间的关系,以及人类的起源和进化。

随着PCR 技术的不断发展和改进,相信它在遗传学研究领域中的重要性将会越来越凸显。

短串联重复序列名词解释

短串联重复序列名词解释

短串联重复序列名词解释摘要:1.短串联重复序列(Short Tandem Repeats,STRs) 简介2.STRs 的结构和特点3.STRs 在遗传学中的应用4.STRs 在法医学中的应用5.STRs 在生物学研究中的应用6.STRs 在医学诊断中的应用7.短串联重复序列(STRs) 的未来研究方向正文:短串联重复序列(Short Tandem Repeats,STRs) 是一种在基因组中广泛存在的重复序列,由短的、重复的碱基序列组成,常出现在基因组的非编码区域。

STRs 的结构和特点使其在遗传学、法医学、生物学研究和医学诊断等领域中具有广泛的应用。

STRs 的结构和特点是由两个或更多的重复单元组成,每个单元包含1-6 个碱基对,这些单元在基因组中串联重复。

STRs 通常是非编码的,但可以在转录过程中产生RNA。

STRs 的长度和重复单元的数量在不同个体之间会有差异,这种变异可以用于遗传学研究和法医学鉴定。

在遗传学中,STRs 被广泛用于分析家族关系、遗传疾病研究以及种族和人群起源分析等。

STRs 在法医学中的应用包括个体识别、亲子鉴定以及犯罪现场DNA 分析等。

STRs 在生物学研究中的应用包括基因表达调控、转录起始位点预测以及基因组进化分析等。

在医学诊断中,STRs 可以用于疾病诊断和预测疾病风险等。

尽管STRs 在多个领域中都有广泛的应用,但对其作用机制和功能仍知之甚少。

未来的研究方向包括STRs 在不同生物过程中的功能、STRs 与疾病的关联以及STRs 在个体识别和亲子鉴定中的应用等。

短串联重复序列(STRs) 是一种重要的基因组序列,具有广泛的应用前景。

多重置换扩增在病理切片DNA分型中的应用

多重置换扩增在病理切片DNA分型中的应用

多重置换扩增在病理切片DNA分型中的应用张越;陈阳;杨元立;李继周;李朝品【期刊名称】《法医学杂志》【年(卷),期】2013(029)001【摘要】目的探讨多重置换扩增(multiple displacement amplification,MDA)技术应用于法医学组织病理切片DNA分型的可行性. 方法采用重复拉丁方设计实验,按保存时间、组织类型、尸源年龄3个因素分7个水平进行随机分组,共制作98例病理切片.硅珠法制备DNA模板,对照组直接采用AmpFeSTR@IdentifilerTM试剂盒进行PCR扩增,实验组进行MDA后再进行扩增.以新鲜尸体组织的分型结果为标准,对比分析切片实验组与对照组的基因座检出数与检出率. 结果各保存时间切片实验组与对照组的基因座检出率相比差异有统计学意义(P<0.01);组织切片保存时间为360d以内,实验组的16个基因座检出率均可达到95%以上.各组织类型间的差异具有统计学意义(P<0.01),而尸源年龄组间差异无统计学意义(P>0.01).结论 MDA可提高病理切片模板基因组量,相对降低PCR扩增抑制物浓度,减少等位基因脱扣现象,有效提高基因座检出率,MDA在法医切片DNA分型中具有运用价值,但应注意切片保存时间与组织类型等因素对分型结果的影响.【总页数】4页(P17-20)【作者】张越;陈阳;杨元立;李继周;李朝品【作者单位】皖南医学院医学三系,安徽芜湖241002;皖南医学院医学三系,安徽芜湖241002;公安部物证鉴定中心,北京100038;公安部物证鉴定中心,北京100038;皖南医学院医学三系,安徽芜湖241002【正文语种】中文【中图分类】DF795.2【相关文献】1.多重置换扩增在含抑制物检材中的应用 [J], 丁东雪;丁梅2.多重置换扩增在地中海贫血植入前遗传学诊断中的应用 [J], 王世凯;黄莉(综述);何冰(审校)3.多重置换扩增结合短串联重复序列在植入前遗传学诊断中的应用 [J], 沈晓婷;徐艳文;钟依平;曾艳红;王静;丁晨晖;邢卫杰;周灿权4.在β地中海贫血着床前遗传学诊断中应用多重置换扩增进行预处理的临床分析[J], 王静;徐艳文;曾艳红;丁晨晖;徐建;周灿权5.多重置换扩增在植入前胚胎性别诊断中的应用 [J], 宋学茹;白晓红;吕永焕;张颖因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

全基因组扩增技术在植入前遗传学诊断中的应用

全基因组扩增技术在植入前遗传学诊断中的应用

mu il dslcm n a lia o ( A oi tem l m liao e e pdrpdya d h p lai lpe i ae e tmpict n MD )fs h r a a pictnd vl e i ,n eapi tno t p f i o f i o a l t c o f MD ri patt ngn t i n s (G ) a rw oea dm r t nin T iat l rv w e A i pem lna o eei da oi P D hs a nm r n oeat t . hs rce e i st n i c g s d e o i e h

综 述 ・
全基 因组扩增技术在植入前遗传 学诊 断中的应用
周 怡 雯综述
【 摘
赵 晓明 审校
要 】 全基 因组扩增技术是一种 对微量 D A进行均衡扩增 的方法 . 于各类遗传检测 . 于 N 用 对
获取细胞数 目及 D A量非常有限 的植入前 遗传 学诊 断是 十分可贵 的。该项技术主要包括经热循环扩增 N 和恒温扩增两类方法 , 其中恒温扩增的多重置换扩增法为近几年发展起来 的技 术 , 目前 多重 置换 扩增 法
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多重置换扩增在含抑制物检材中的应用

多重置换扩增在含抑制物检材中的应用

多重置换扩增在含抑制物检材中的应用丁东雪;丁梅【期刊名称】《法医学杂志》【年(卷),期】2016(032)005【摘要】目的:研究多重置换扩增(multiple displacement amplification,MDA)在含抑制物检材中的抗抑制能力,与磁珠法纯化检材相比较,证明其在法医学中的应用及意义。

方法将不同浓度血红素和腐殖酸与样本DNA进行混合,分为MDA处理组、磁珠法处理组和空白对照组,PCR-STR单基因座D3S1358扩增联合聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,并应用AmpFℓSTR®IdentifilerTM Plus试剂盒联合毛细管电泳检测。

结果血红素质量浓度大于1 ng/μL或腐殖酸质量浓度大于0.1 ng/μL时,空白对照组经单基因座STR检测不能得到扩增产物;磁珠法处理组血红素质量浓度大于100 ng/μL或腐殖酸浓度大于1 ng/μL时,不能够得到扩增产物;MDA处理组各浓度抑制物均能成功扩增,完全不受抑制物影响。

结论MDA技术可消除血红素及腐殖酸的抑制作用,其抗抑制能力优于磁珠法纯化DNA,具有一定的法医学应用意义。

【总页数】4页(P342-345)【作者】丁东雪;丁梅【作者单位】中国医科大学法医学院法医血清教研室,辽宁沈阳 110001;中国医科大学法医学院法医血清教研室,辽宁沈阳 110001【正文语种】中文【中图分类】DF795.2【相关文献】1.多重置换扩增在地中海贫血植入前遗传学诊断中的应用 [J], 王世凯;黄莉(综述);何冰(审校)2.线粒体单核苷酸多态性复合扩增体系在疑难检材中的法医学应用研究 [J], 何琼;刘超;刘长晖;王慧君3.直接扩增技术在接触性检材 DNA检验中的应用 [J], 李长征;刘海东;崔文;寻超群;孙贤学;姜铭章4.在β地中海贫血着床前遗传学诊断中应用多重置换扩增进行预处理的临床分析[J], 王静;徐艳文;曾艳红;丁晨晖;徐建;周灿权5.DNA扩增技术在接触性检材检验中的应用研究 [J], 邓宇运因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

囊胚细胞WGA结合短片段Gap-PCR的α-地贫SEA突变快速植入前遗传学诊断

囊胚细胞WGA结合短片段Gap-PCR的α-地贫SEA突变快速植入前遗传学诊断

囊胚细胞WGA结合短片段Gap-PCR的α-地贫SEA突变快速植入前遗传学诊断徐惠玲;刘彦慧;晏平;何怡;秦佳纯;娄季武;周万军【摘要】目的建立一种基于囊胚细胞全基因组扩增(WGA)结合目的序列短片段Gap-PCR基因分型技术的α-地中海贫血东南亚型(SEA)缺失突变快速植入前遗传学诊断新方法.方法以多重置换扩增(MDA)WGA技术为基础,建立以管家基因GAPDH和β-actin为目的序列的WGA产物双重荧光PCR质检体系,以及突变和正常序列短片段Gap-PCR的α-地中海贫血SEA缺失基因分型体系,通过对不同细胞数SEA携带者淋巴细胞样本的检测进行灵敏度与准确性评价,对12例囊胚活检样本的检测进行应用评价.结果应用本研究建立的方法,不同淋巴细胞数样本的结果显示3细胞时即未出现等位基因脱扣,4细胞时目标模板的WGA产物量趋于稳定;10例WGA成功的囊胚活检样本的基因分型结果分别为--SEA/αα(5例)和αα/αα(5例),与验证基因型相符.结论本研究建立的方法为一个完整检测流程,即以4~6个囊胚活检细胞为检材,对MDA产物进行WGA质检及相对浓度评估后,以短片段Gap-PCR体系而实现α-地贫SEA缺失的PGD快速基因分型;此方法简单快速、结果准确、检测成本低而适合临床常规应用.【期刊名称】《南方医科大学学报》【年(卷),期】2018(038)010【总页数】5页(P1250-1254)【关键词】α-地中海贫血;多重置换扩增;植入前遗传学诊断;基因分型【作者】徐惠玲;刘彦慧;晏平;何怡;秦佳纯;娄季武;周万军【作者单位】南方医科大学基础医学院医学遗传学教研室,广东广州 510515;广东省东莞市妇幼保健院,广东东莞523122;南方医科大学南方医院惠侨医疗中心,广东广州 510515;广东省东莞市妇幼保健院,广东东莞523122;南方医科大学基础医学院医学遗传学教研室,广东广州 510515;广东省东莞市妇幼保健院,广东东莞523122;南方医科大学基础医学院医学遗传学教研室,广东广州 510515【正文语种】中文α-地中海贫血(简称α-地贫)是由于α-珠蛋白链缺乏或合成减少而导致的一种常染色体隐性遗传病,其中我国南方广东、广西地区的α-地贫基因人群携带率分别高达8.53%和17.55%[1-2]。

染色体平衡易位的PGD治疗

染色体平衡易位的PGD治疗

α-和β—双重地中海贫血的PGD助孕治疗沈晓婷曾艳红丁晨晖李荣王静周灿权徐艳文中山大学第一附属医院生殖医学中心,广东省生殖医学重点实验室【病史】女方,29岁;男方,27岁。

G2P0A2。

2013年结婚,同年于孕19+周因产前诊断发现胎儿为重型β-地中海贫血患胎行引产术。

2015年2月再次于孕13+周因胎儿为重型β-地中海贫血患胎行引产术.后避孕至今。

女方为HbH病患者(--SEA/ααCS),同时携带β-地中海贫血(CD17)杂合突变;男方为α-地中海贫血(-α3.7)杂合缺失复合β-地中海贫血(CD71—72)杂合突变。

双方染色体核型正常,前来生育咨询。

女方既往无特殊病史,平素月经规则,周期28-30天,持续3-4天,量中,无痛经及性交痛。

【临床印象】α-地贫和β-地贫双重遗传病生育风险。

【治疗或建议】1、遗传咨询患者夫妇双方在优生遗传咨询门诊行遗传咨询,被告知α-地中海贫血和β-地中海贫血均为常染色体隐性遗传性疾病,其致病基因分别为α—珠蛋白基因和β-珠蛋白基因。

根据双方携带致病基因的类型,生育后代可出现以下类型:α-地中海贫血:1/2为α—地中海贫血(—-SEA)携带者,1/4与母亲相同为HbH病(—-SEA/ααCS),1/4为HbH病(ααCS/-α3。

7 )。

β-地中海贫血:1/4为正常,1/2为β-地中海贫血携带者,1/4为重型地贫患者综合:无严重疾病表型的比率为1/2(——SEA/αα地中海贫血携带者)×3/4(β-地中海贫血携带者)=3/8。

建议可供选择的生育方案:①自行妊娠后,于孕18周抽羊水行产前基因诊断;②胚胎植入前遗传学诊断(PGD)助孕。

经过充分知情同意,夫妇选择PGD助孕。

2、PGD治疗准备:①由于引产胎儿的DNA标本无法取得,女方为HbH患者,男方(-α3.7)杂合缺失,根据遗传规律:后期胚胎中1/2为HbH患者,1/2为轻型携带者。

该家系可考虑移植的胚胎需遗传男方的正常链,提供了男方完整信息用于连锁分析.在该家系中男方父亲为(-α3.7)杂合缺失、男方母亲α-地贫未见异常,男方异常的α-地贫单体型来源于其父亲。

检验科中的遗传学检验方法

检验科中的遗传学检验方法

检验科中的遗传学检验方法在现代医学领域中,遗传学检验方法起到了至关重要的作用。

它们不仅可以用于诊断和鉴定遗传疾病,还可以用于预测个体患病风险,指导治疗方案制定以及进行遗传咨询等。

本文将全面介绍检验科中常见的遗传学检验方法。

一、PCR(聚合酶链式反应)PCR是一种快速、高效的遗传学检验方法,被广泛应用在医学诊断、疾病筛查以及法医学等领域。

它可以通过扩增目标DNA片段,从而进行检测和分析。

PCR的优点在于其高度敏感性和特异性,可以在低浓度的DNA样本中准确地检测出目标序列。

此外,PCR还能够进行多个位点的扩增,实现多样性分析等。

二、SNP(单核苷酸多态性)分析SNP分析是一种常见的遗传学检验方法,用于检测个体间的遗传差异。

SNP是指基因组中的单个核苷酸变异,其在个体间的分布及相关性可以提供重要的遗传信息。

通过对SNP位点进行检测和分析,可以揭示与遗传疾病发生相关的基因变异,帮助医生进行个性化治疗和疾病预测。

三、基因测序基因测序是一项重要的遗传学检验技术,通过测定DNA序列来揭示个体间的遗传变异和基因多样性。

它可以提供全面的遗传信息,包括基因型、变异位点以及相关功能注释等。

随着高通量测序技术的发展,基因测序变得更加快速和准确,为遗传学研究和临床应用提供了强大的工具。

四、荧光原位杂交(FISH)FISH是一种常用的细胞遗传学检验方法,用于研究染色体结构和功能。

它通过将荧光标记的DNA或RNA探针与目标序列特异性结合,从而标记出染色体上的特定区域。

FISH广泛应用于染色体异常检测、肿瘤细胞识别以及胚胎植入前遗传学诊断等领域。

五、DNA甲基化检测DNA甲基化检测是一种用于研究DNA表观遗传学变化的方法。

在许多遗传性疾病和肿瘤中,DNA甲基化失调与基因沉默和表达异常相关。

通过对DNA甲基化状态的检测,可以揭示某些疾病的发生机制和预后预测的信息。

六、串联重复序列分析串联重复序列是基因组中常见的重复DNA序列,其长度和重复次数在个体间存在差异。

多重PCR技术在疾病诊断中的应用

多重PCR技术在疾病诊断中的应用

多重PCR技术在疾病诊断中的应用PCR技术是分子生物学领域中一种重要的技术手段,常用于DNA的检测、分析和复制,广泛应用于科研、临床、农业和环境监测等领域。

多重PCR技术则是PCR技术的一个分支,通过同时扩增多个靶序列来检测目标基因的存在与否,具有高灵敏度、高特异性和高通量等优势。

在疾病诊断中,多重PCR技术可以用于检测各种病原体、突变基因和易感基因等,有助于疾病的早期诊断、预后评估和治疗选择等方面。

一、多重PCR技术的基本原理多重PCR技术是在PCR技术基础上发展起来的一种高通量PCR技术。

与传统PCR技术不同的是,多重PCR技术可以同时扩增多个靶序列,从而实现多重检测的目的。

其基本原理是在PCR 反应体系中添加多个引物,每个引物特异性地扩增一个靶序列。

引物的选择应考虑到不同靶序列的长度、GC含量、特异性、耐扩增反应等因素,并进行相应的优化。

在PCR反应中,引物与DNA 模板特异性结合,使反应体系中的目标序列被放大。

通过电泳、荧光探针、比色试剂等方法检测PCR产物可以确定目标基因的存在与否,从而实现多重检测的目的。

二、多重PCR技术在疾病诊断中的应用1. 检测传染病病原体多重PCR技术可以同时检测多种传染病病原体,如呼吸道病毒、肠道病毒、流感病毒、结核分枝杆菌、弓形虫、霍乱弧菌等。

例如,多重PCR技术可以在单个反应中检测呼吸道病毒和流感病毒,诊断患者的呼吸道感染。

此外,多重PCR技术还可以检测病原体的药物敏感性,指导临床用药。

2. 检测遗传疾病多重PCR技术可以检测某些遗传疾病的突变基因或易感基因,如囊性纤维化、地中海贫血、血友病等。

例如,通过多重PCR技术可以同时检测囊性纤维化与肺癌相关基因的多个突变位点,诊断患者是否为囊性纤维化的致病基因突变携带者。

3. 检测肿瘤基因变异多重PCR技术可以检测肿瘤基因的突变或拷贝数变异,如EGFR、ALK、BRAF等。

通过检测肿瘤的突变状态,可以指导肿瘤的治疗方案选择,例如EGFR突变阳性患者可以选择靶向药物治疗。

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8 5 2・
ห้องสมุดไป่ตู้
J O U R N AL O F P E K I NG UN I V E R S I T Y( H E A L T H S C I E N C E S )

论 著

多重 置 换 扩 增 结合 短 串联 重 复 序列 在 植 入 前 遗传 学 诊 断 中 的 应 用
MD A扩增成 功率为 9 6 . 4 %( 3 7 4 / 3 8 8 ) , 后续 P C R扩增 效 率为 9 7 . 1 %, 等 位基 因脱 扣 ( a l l e l e d r o p o u t , A D O) 率 为
1 2 . 6 %( 波动于 0~4 7 . 5 %) , 总 体诊 断 效率 为 9 4 . 6 %( 3 6 7 / 3 8 8 ) 。4 7个移 植 周 期共 移 植 9 1个胚 胎 , 种 植 率 为
d o i : 1 0 . 3 9 6 9 / j . i s s n . 1 6 7 1 — 1 6 7 X . 2 0 1 3 . 0 6 . 0 0 6
Co mb i n a t i o n o f mu l t i p l e d i s pl a c e me nt a m pl i ic f a t i o n wi t h s ho r t t a n d e m r e p e a t po l y mo r p h i s mi n pr e i mp l a n t a t i o n g e n e t i c d i a g n o s i s
3 0 . 7 %( 2 8 / 9 1 ) 。临床妊 娠率 为 4 7 . 7 %/ P G D周期 ( 2 1 / 4 4 ) , 共诞生 了 2 0个健康婴儿 ( 1 2例单胎 , 4例双胎 ) , 5例继
续妊娠 。结论 : 采用 多重置换扩增结合短 串联重复序列多 态性可建 立一个通 用的植入前 遗传 学诊 断平 台 , 其很 大 程度上缩短 了新病种植入前遗传学诊断体系的研发时间 , 而且可 同时进行 两种或两 种以上遗传 学状态 的诊 断 , 也 提高 了诊断效率 , 有利于进一步拓宽植入前遗传学诊断 的适应征 。 [ 关键词 ]植入前诊 断 ; 基因扩增 ; 微卫星重复 [ 中图分类 号]R 7 1 0 . 4 [ 文献标志码 ]A [ 文章编号 ]1 6 7 1 — 1 6 7 X( 2 0 1 3 ) 0 6 - 0 8 5 2 - 0 7
沈 晓婷 , 徐 艳 文 , 钟依 平 , 曾艳 红 , Y - 静 , 丁晨 晖 , 邢 卫杰 , 周灿权
( 1 . 中山大学附属第一医院生殖医学 中心 , 广东省生殖 医学重点实验室 , 广州
不 育 与 性 医学 科 , 广州 5 1 0 6 3 0 )
5 1 0 0 8 0; 2 .中山大学附属第三 医院
S HE N X i a o — i r n g , X U Y a n — w e n , Z H O N G Y i — p i n g , Z E N G Y a n — h o n g , WA N G J i n g , D I N G C h e n — h u i , X I N G We i — j i e ,
ZHOU Ca n q u a n
( 1 .C e n t e r f o r Re p r o d u c t i v e Me d i c i n e ,F i r s t Af f i l i a t e d Ho s p i t a l o f S u n Y a t — s e n U n i v e r s i t y ,G u a n g d o n g 5 1 0 0 8 0,C h i n a :
[ 摘
要] 目的: 探讨多重置换扩增 ( m u l t i p l e d i s p l a c e me n t a mp l i i f c a t i o n , MD A) 结合短串联重复序列多态性在植 入前
遗传学诊断 ( p r e i m p l a n t a t i o n g e n e t i c d i a g n o s i s , P G D) 中的应用 。方 法: 采 用多重 置换扩增对 单细胞进 行全基 因组 扩 增, 针对单基因疾病和人类 白细胞抗原( h u m a n l e u k o c y t e a n t i g e n , H L A ) 配型选择位于致病基因内部或两侧 的短 串联 重复序列位点进行单体 型分析 , 同时对致病基 因进 行直接检测 ; 针对染色体数量 及结构异 常或非整倍体筛查 , 选择 位 于相关染色体上 的短 串联重复序列位点进行等位 基 因数分 析。 结果: 进行 了以下 5类 1 2种类 型植入前遗 传学 诊 断的临床应 用 : ( 1 ) 单基因疾病 : 脊 髓性肌 萎缩症 、 杜 氏肌 营养不 良、 x一 连 锁慢性 肉芽肿 、 石 骨症 、 骨软骨 发育不 全、 x 一 连锁免疫缺陷综合征 ; ( 2 ) 同时合并两种单基 因疾病 : o t 一 和 B 一 双重地中海 贫血 ; ( 3 ) 染色体罗 氏易位 ; ( 4) 单基 因疾病结合 H L A配型 : B . 地 中海贫血 、 杜 氏肌 营养 不 良; ( 5 ) 单 基 因疾病 合并染 色体异常 : d 一 地 中海贫血合 并染色 体 罗氏易位 、 仪 一 地 中海 贫血合并性染 色体数 目异常 。对 3 5个 家系共进行 了 4 4个 周期 的 P G D, 共4 7个移植 周期。
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