SAX_使用小角X射线散射确定蛋白质的结构
合集下载
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
J. Appl. Cryst.39(2006) 277-286
图1扣除背景的散射曲线
图2对距离分布函数(PDDF)
溶液结构与晶体结构进行了对比。图2显示了由SAXS曲线和葡萄糖异构酶
四聚体晶体结构计算得到的PDDF距离分布函数。三维模型与从PDB数据
库中得到的晶体结构十分吻合。
在右图中,基于SAXS数据的从头计算法
模型由白球显示,而晶体结构的骨架为
彩色。
SAXS结果进一步确认该蛋白质在其自然状态下为四聚体。
1P.V. Konarev,M.V.Petoukhov, V.V.Volkov, D.I. Svergun,
使用小角X射线散射确定蛋白质
结构
溶液中葡萄糖异构酶的三维形状使用SAXSpace进行了研
究。溶液中蛋白的结构与由X-射线晶体学得到的晶体结构进行
了对比。
SAXS和溶液中的蛋白质晶体学和NBiblioteka R是进行生物大分子结构分析的惯用方法。
小角X-射线散射(SAXS)与这两种可提供高分辨有价值信息的方法具有
互补作用。与晶体学相比,SAXS具有独特的优点:SAXS可以获得溶液中
蛋白质的三维结构和蛋白质的聚集情况,这对更好的理解蛋白质的生物功
能是必需的。
由从头计算法1得到的低分辨三维结构是对由蛋白质晶体学和NMR得到的高分辨结构不可缺少的补充信息。
实验和结果
溶解在TRIS缓冲溶液中的葡萄糖异构酶(1 % w/w)在pH为8时使用SAXSpace进行了研究。测试时间为10分钟。图1显示了测试的数据和使用GIFT软件去模糊化后的数据以及由从头计算法模型拟合的曲线。
图1扣除背景的散射曲线
图2对距离分布函数(PDDF)
溶液结构与晶体结构进行了对比。图2显示了由SAXS曲线和葡萄糖异构酶
四聚体晶体结构计算得到的PDDF距离分布函数。三维模型与从PDB数据
库中得到的晶体结构十分吻合。
在右图中,基于SAXS数据的从头计算法
模型由白球显示,而晶体结构的骨架为
彩色。
SAXS结果进一步确认该蛋白质在其自然状态下为四聚体。
1P.V. Konarev,M.V.Petoukhov, V.V.Volkov, D.I. Svergun,
使用小角X射线散射确定蛋白质
结构
溶液中葡萄糖异构酶的三维形状使用SAXSpace进行了研
究。溶液中蛋白的结构与由X-射线晶体学得到的晶体结构进行
了对比。
SAXS和溶液中的蛋白质晶体学和NBiblioteka R是进行生物大分子结构分析的惯用方法。
小角X-射线散射(SAXS)与这两种可提供高分辨有价值信息的方法具有
互补作用。与晶体学相比,SAXS具有独特的优点:SAXS可以获得溶液中
蛋白质的三维结构和蛋白质的聚集情况,这对更好的理解蛋白质的生物功
能是必需的。
由从头计算法1得到的低分辨三维结构是对由蛋白质晶体学和NMR得到的高分辨结构不可缺少的补充信息。
实验和结果
溶解在TRIS缓冲溶液中的葡萄糖异构酶(1 % w/w)在pH为8时使用SAXSpace进行了研究。测试时间为10分钟。图1显示了测试的数据和使用GIFT软件去模糊化后的数据以及由从头计算法模型拟合的曲线。