PCR技术介绍和常用方法
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Store:纯化引物在25%乙腈溶液中4℃; 冻干引物于-20℃可保存1-2年,液体状 态于-20℃可保存6个月。不用时应-20℃ 保存。
buffer 10-50mmol/L Tris-HCl(pH8.3-8.8, 20℃)。 Mg2+:for Taq polymerase activity conc.:Low:low activity
专利官司 1987年美国专利局专利授权 1989年,DuPont异议,大小公司对簿公堂,将决定 谁将获得诺贝尔奖。DuPont理由是,1971年PCR•的 雏ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ已由Khorana一系列文章阐明,并公布于众,应 当是公共产权。斯坦福大学Kornberg(研究DNA聚 合酶获诺贝尔奖)也认为,任何具备生物技术知识的 人都可以从Khorana等的文章中推知如何操作PCR。
high: non-specific amplification
dNTPs: 贮备dNTP液:1 mol/L NaOH 调pH至中性。 贮备浓度为5-10mmol/L,终浓度为20-200umol/L, 分装-20℃保存。 4种dNTP浓度应相同。
modified (6) specificity:less than 70% homology with non-specific amplification sequence, or 8bp continuous complementary base
Primer designed with the help of computer
Primer design
Most imp.
(1)length: 20~30bp (2)G+C contents:ATCG random distributed (3)primers : no complementary sequence (4)3‘end of the primer: no modification (5)5‘end of the primer:product length,can be
DNA database conservative region comparision primers or blast
PCR reaction components and their functions
template:ssDNA, dsDNA mRNA needed to be RT as cDNA
原理
类似于DNA的体内复制。首先待扩增 DNA•模板加热变性解链,随之将反应混合物 冷却至某一温度,这一温度可使引物与它的靶
序列发生退火,再将温度升高使退火引物在 DNA聚合酶作用下得以延伸。 这种热变性-复 性-延伸的过程就是一个PCR循环,PCR就是 在合适条件下的这种循环的不断重复。
procedures
美国专利局驳回DuPont异议,地方法院判属Cetus Cetus获胜后马上反诉,指出DuPont已侵犯另一项与 PCR有关的专利并要求对方赔偿以及不再销售与PCR 有关试剂和仪器
PCR发展速度
惊人,没有一种技术能与之相比
引用论文最多、应用范围十分广泛
1993•年度诺贝尔化学奖:Mullis,与开 创了“寡核苷酸基因定点诱变”加拿大 籍英国科学家Michael Smith共获
enzyme
历史
60s-70s:基因的体外分离技术。 Khorana(1971):美国MIT教授、1968年 诺贝 尔医学奖得主 “经过DNA变性,与合适引物 杂交,用DNA聚合酶延伸引物,并不断重复 该过程便可克隆tRNA基因”。 核酸体外扩增最早设想遗忘:
当时很难进行测序和合成寡核苷酸引物; 当时(1970)Smith等发现了内切酶,体外克 隆基因成为可能
primes
If the PCR product is to be cloned, it is sensible to
include the sequence of unique restriction
enzyme sites within the 5’-ends of the primers.
Can amplify fragments over 10kb in length
samples:from blood,sperm or any other tissue,from older forensic specimens, from ancient biological samples or in the lab. From bacterial colonies or phage plaques. DNA:very stable
PCR 技术介绍和常用方法
PCR(Polymerase Chain Reaction)
Three steps: denaturation, primer annealing, polymerization.
The PCR cycle
95C step to denature the duplex DNA, An annealing step of around 55C to allow the primers to bind, 72C polymerization step. Mg2+,dNTPs are required in addition to template,primers,buffer and
template(DNA or RNA),
primers, Taq enzyme, 10×PCR buffer, Mg++, 5mmol/L dNTPs
pre-denaturation-denature completely
Denaturation annealing Elongation cycles:25-30
Kary Mullis(1985)
发明过程 Mullis 在“偶然想出的聚合酶链反应”一文中写到:
“这种简单得令人惊奇,可以无限量地拷贝DNA 片段的方法是在不可想象的情况下, 即驾车行驶在 月色下的加利福尼亚山间公路上时想出来的”。
发展过程: 开始使用大肠杆菌 DNA聚合酶Klenow片段,
该酶不耐热,每次加热变性DNA后都要重新补加。 耗时、费力、易出错。耐热DNA聚合酶的应用使得 自动化。
buffer 10-50mmol/L Tris-HCl(pH8.3-8.8, 20℃)。 Mg2+:for Taq polymerase activity conc.:Low:low activity
专利官司 1987年美国专利局专利授权 1989年,DuPont异议,大小公司对簿公堂,将决定 谁将获得诺贝尔奖。DuPont理由是,1971年PCR•的 雏ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ已由Khorana一系列文章阐明,并公布于众,应 当是公共产权。斯坦福大学Kornberg(研究DNA聚 合酶获诺贝尔奖)也认为,任何具备生物技术知识的 人都可以从Khorana等的文章中推知如何操作PCR。
high: non-specific amplification
dNTPs: 贮备dNTP液:1 mol/L NaOH 调pH至中性。 贮备浓度为5-10mmol/L,终浓度为20-200umol/L, 分装-20℃保存。 4种dNTP浓度应相同。
modified (6) specificity:less than 70% homology with non-specific amplification sequence, or 8bp continuous complementary base
Primer designed with the help of computer
Primer design
Most imp.
(1)length: 20~30bp (2)G+C contents:ATCG random distributed (3)primers : no complementary sequence (4)3‘end of the primer: no modification (5)5‘end of the primer:product length,can be
DNA database conservative region comparision primers or blast
PCR reaction components and their functions
template:ssDNA, dsDNA mRNA needed to be RT as cDNA
原理
类似于DNA的体内复制。首先待扩增 DNA•模板加热变性解链,随之将反应混合物 冷却至某一温度,这一温度可使引物与它的靶
序列发生退火,再将温度升高使退火引物在 DNA聚合酶作用下得以延伸。 这种热变性-复 性-延伸的过程就是一个PCR循环,PCR就是 在合适条件下的这种循环的不断重复。
procedures
美国专利局驳回DuPont异议,地方法院判属Cetus Cetus获胜后马上反诉,指出DuPont已侵犯另一项与 PCR有关的专利并要求对方赔偿以及不再销售与PCR 有关试剂和仪器
PCR发展速度
惊人,没有一种技术能与之相比
引用论文最多、应用范围十分广泛
1993•年度诺贝尔化学奖:Mullis,与开 创了“寡核苷酸基因定点诱变”加拿大 籍英国科学家Michael Smith共获
enzyme
历史
60s-70s:基因的体外分离技术。 Khorana(1971):美国MIT教授、1968年 诺贝 尔医学奖得主 “经过DNA变性,与合适引物 杂交,用DNA聚合酶延伸引物,并不断重复 该过程便可克隆tRNA基因”。 核酸体外扩增最早设想遗忘:
当时很难进行测序和合成寡核苷酸引物; 当时(1970)Smith等发现了内切酶,体外克 隆基因成为可能
primes
If the PCR product is to be cloned, it is sensible to
include the sequence of unique restriction
enzyme sites within the 5’-ends of the primers.
Can amplify fragments over 10kb in length
samples:from blood,sperm or any other tissue,from older forensic specimens, from ancient biological samples or in the lab. From bacterial colonies or phage plaques. DNA:very stable
PCR 技术介绍和常用方法
PCR(Polymerase Chain Reaction)
Three steps: denaturation, primer annealing, polymerization.
The PCR cycle
95C step to denature the duplex DNA, An annealing step of around 55C to allow the primers to bind, 72C polymerization step. Mg2+,dNTPs are required in addition to template,primers,buffer and
template(DNA or RNA),
primers, Taq enzyme, 10×PCR buffer, Mg++, 5mmol/L dNTPs
pre-denaturation-denature completely
Denaturation annealing Elongation cycles:25-30
Kary Mullis(1985)
发明过程 Mullis 在“偶然想出的聚合酶链反应”一文中写到:
“这种简单得令人惊奇,可以无限量地拷贝DNA 片段的方法是在不可想象的情况下, 即驾车行驶在 月色下的加利福尼亚山间公路上时想出来的”。
发展过程: 开始使用大肠杆菌 DNA聚合酶Klenow片段,
该酶不耐热,每次加热变性DNA后都要重新补加。 耗时、费力、易出错。耐热DNA聚合酶的应用使得 自动化。