向日葵DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析
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V rS a .T h e s u n l f o w e r S S R c o n s t r u c t i o n o f DNA i f n g e r p in r t i n g p r o v i d e d s c i e n t i i f c d a t a f o r i d e n t i i f c a t i o n a s we l l a s d e t e r mi n a t i o n
S S R.8 1 p o l y mo r p h i c DN A b a n d s w e r e d e t e c t e d b y u s i n g 3 4 c o r e S S R p ime r r s wi t h a v e r a g e d 2 . 3 8 b a n d s p e r p ime r r .Ge — n e t i c s i mi l a r i t y c o e f i c i e n t wa s c o mp u t e d u s i n g t h e s o f t wa r e NT s y s 2 . 1 0 e .a n d a d e n d r o g r a m o f g e n e t i c r e l a t i o n s h i p wa s c o n — s t r u c t e d u s i n g UP GMA me t h o d .T h e r e s u l t s i n d i c a t e d ha t t t h e g e n e t i c s i mi l a r i t y r a n g e d f r o m 0 . 4 3 2 0 ~0 . 9 01 2 a mo n g 3 0 c u h i v a r s .T wo c l u s t e r g r o u p s we r e c l a s s i i f e d wi t h t h e s i mi l a r i t y c o e ic f i e n t o f 0 . 6 2 .r e v e le a d t h e g e n e i t c r e l a t i v e s a mo n g c u h i —
Z H A NG Ma n e l a 1 .( B m c h e n g Mu n i c i p a l A c a d e my o f A g r i c u l t u r a l S c i e n c e s i n J i l i n P r o v i n c e , B a i c h e n g ,J i l i n l 3 7 0 0 0 )
2 6
・
宁 夏农 林 科 技 。N i n g x i a J o u na r l o f A .a n d F o r e s .S c i . & T e h . 2 0 1 5 ,5 6 ( 0 7 ) : 2 6 — 3 0 , 4 4
生理生化 ・
向日 葵D N A指纹图谱构建及遗传多样性分析
Ab s t r a c t 3 4 c o r e S S R p i r me r s w e r e s e l e c t e d f r o m 5 0 2 S S R p ime r r s o n 1 2 s u n l f o w e r h y b r i d s a n d 1 8 p a r e n t a l l i n e s u s e d
关键词 : 向 日葵 ; S S R; 指 纹 图谱 ; 遗 传 多样 性 中 图分 类 号 : ¥ 5 6 5 . 5 文献标识码 : A 文章编号 : 1 0 0 2 - 2 0 4 X( 2 0 1 5 ) 0 7 — 0 0 2 6 — 0 5
Co n s t r u c t i o n o f DNA F i n g er p r i n t i n g a n d An a l y s i s o f Ge n e t i c Di v e r s i t y o f Su n f l o wer Cu l t i v a r s
张 曼, 田 娟, 张 雷, 牛庆杰 , 李慧英 , 孙墨可 , 张 义
吉林 省 白城市农业科学 院, 吉林 白城
摘
1 3 7 0 0 0
要: 以1 2份 向 日葵 杂 交 种 和 1 8 份向 E l 葵 亲本 为 材 料 , 利用 S S R分子标 记 , 从 5 0 2对 S S R 引 物 中 筛选 了 3 4对 核 心 引
物 。3 4对 引物在 3 0份研 究材料 中共检 测到 8 1个多态性 片段 , 平均每 对引物 的多态性 片段为 2 . 3 8个。基 于 3 4个 S S R 标记 的扩增结果 , 利 用 NT s y s 2 . 1 O e 软件 计算遗传相 似 系数 , 并 建立 UP GMA 聚类图 , 结果表 明: 3 O份材料之 间的遗传相似 系数 变化 范围为 O . 4 3 2 0 ~O . 9 0 1 2 ,在 遗传相似 系数 O . 6 2处可 以将 3 0份材料分为两大类 ,一定程度上反 映了材料 间的亲缘 关 系。同时 S S R标记指纹 图谱的建立为向 日葵品种 纯度 和真伪鉴 定提供 了科 学数据。
根据引物的多态性重复性和稳定性等情况每条染色体优选了2对ssr引物作为构建指纹图谱的核心标记引物合计34对其中ssr核心引物ors959扩增产物见图134对核心引物在30份研究材料中共检测到81个多态性片段平均每对引物的多态性片段为238个每个ssr位点可以检测到的等位基因为24个不等见表222ssr数字指纹图谱数据库的建立根据34对ssr核心标记的扩增结果构建向fi葵材料的0l二进制数字指纹代码图谱见表330份材料的字符串无一重复说明这34个ssr标记能将30份材料全部区分开形成每个品种特有的指纹