论文答辩水稻地方品种薄稻穗瘟抗性QTL定位分析概论
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稻瘟病尤其是穗瘟是水稻全球性的毁灭性病害之一,严重威胁世界粮 食安全。每年因稻瘟病造成稻米产量损失足达10%-30％，仅这损失 的10%粮食足以养活6000万人一年。
鉴于稻瘟病的危害性，目前南方部分省区水稻品种审定委员会对新 育成品种的抗稻瘟病性实行一票否决，如广东、福建等，很多高产 优质杂交稻新品种因抗瘟性不达标而不能通过品种审定。
讨论
穗瘟抗性QTL的定位：
在本研究中，由于稻瘟病易受温度、湿度和日照等环境以及栽培管 理等多种因素的影响，为得到可靠的表型数据，需要对群体材料进行 多次的试验分析和验证，而RIL群体可进行多次重复试验的特点，满足 该试验要求，因此利用薄稻与苏御糯构建的RIL群体进行本试验研究。
对212个RILs家系进行接种鉴定，发现感病植株占大多数，抗性植 株比较少，可能是因田间环境影响，有52个家系缺失。通过 ICIMapping4.0软件分析，共检测到2个穗瘟抗性QTL位点，都分布于第 11染色体末端上。由于q14江浦表型9-1和q14江浦表型9-2位置相邻， 所以这两个QTL很有可能为同一个抗性位点。
q14江浦表型
9-1
11 RM7277
Right Marker
RM1233
LOD PVE(%) Add
14.518
6.7792
1 -0.1082
q14江浦表型
9-2
11 RM1233
RM7654
47.806
21.8972
1 -0.2007
结果分析
如下图所示，即为用ICIMapping4.0软件读取出来的第11条染色体，其 相应位置标注于图右侧，即q14江浦表型9-1和q14江浦表型9-2.
本研究的不足：
由于时间的限制，本实验只进行了一次表型鉴定，所得实验数据 还有待考证；其次，接种鉴定是在大田中进行的，而RIL群体各家系的 生育期不一样，需批次进行接种，且接种鉴定环境条件不可控制，因 此得到的结果可能会有偏差。
为保证实验结果的可靠性，往后还需进行1-2次的重复试验，同时 可通过分批播种，尽可能使RIL群体中的各家系在一定时间范围内可进 行接种鉴定，减小环境误差。
水稻地方品种薄稻穗瘟抗性 QTL定位分析
Contents
目录
01
背景与意义
02
材料与方法
03
结果与讨论
04
致谢
研究背景
稻瘟病是由子囊真菌（the fugnal patheogen Magnaportbe oryzae） 引起的世界性水稻病害之一，严重影响了水稻的产量和质量。据统 计，在1975-1990年的16年间，由稻瘟病引起的全球产量损失高达 1.57亿t。自20世纪90年代以来，我国稻瘟病发病面积年均380万ha 以上，年损失稻谷产量达数亿公斤，直接影响我国粮食生产安全。
我国是水稻重要的起源地，因而我国拥有丰富的抗性资源。经研究 发现，薄稻可对多个稻瘟病小种产生抗病性反应，具有广谱抗性。 本试验采用稻瘟病小种Hoku1对薄稻与苏御糯杂交后代获得的重组自 交系（RILs）进行了接种鉴定，并对穗瘟抗性QTL进行了定位。
材料与方法
供试材料： 抗稻瘟病的ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ方品种薄稻；感病对照品种苏御糯；212个RILs 家系
（薄稻×苏御糯获得的F2:6重组自交系）。
供试菌株 本研究采用稻瘟病菌株Hoku1，其产孢和致病力都比较稳定。
1.采样及DNA提取 2.SSR 标记筛选
从本实验室引物库中筛选到了76对SSR标记，分布于除第3和第5染色体的 其他10条染色体上，用于对212 RILs 群体遗传分析。
3.PCR扩增
94℃预变性5min，94℃变性40 sec，55℃退火40 sec，72℃延伸40sec， 32个循环，72℃保温10min，4℃保存。
4.电泳检测
PCR反应产物在8%的聚丙烯酰胺凝胶上电泳分离，银染显色。
5.QTL分析
应用QTL IciMapping4.0对薄稻抗稻瘟病QTL进行分析，设定LOD值为3.0。
致谢：
感谢鲍老师的悉心指导！ 感谢实验室的所有师兄师姐的帮助，尤其感谢XXX师兄！ 在此一并向所有关心、支持和帮助过我的领导、同学和朋友表示 由衷的感谢!
谢谢大家！ 欢迎大家批评指正！
结果分析
2014年8月份用稻瘟病菌株Hoku1对薄稻、苏御糯和212个RIL家系进行 接种鉴定，其性状调查结果如图1所示：
结果分析
运用ICIMapping4.0遗传作图，并结合表型数据进行QTL分析，共检 测到的2个QTLs：
表一：检测到的穗瘟抗性QTL位点
Trait
Chr Left .n Marker
鉴于稻瘟病的危害性，目前南方部分省区水稻品种审定委员会对新 育成品种的抗稻瘟病性实行一票否决，如广东、福建等，很多高产 优质杂交稻新品种因抗瘟性不达标而不能通过品种审定。
讨论
穗瘟抗性QTL的定位：
在本研究中，由于稻瘟病易受温度、湿度和日照等环境以及栽培管 理等多种因素的影响，为得到可靠的表型数据，需要对群体材料进行 多次的试验分析和验证，而RIL群体可进行多次重复试验的特点，满足 该试验要求，因此利用薄稻与苏御糯构建的RIL群体进行本试验研究。
对212个RILs家系进行接种鉴定，发现感病植株占大多数，抗性植 株比较少，可能是因田间环境影响，有52个家系缺失。通过 ICIMapping4.0软件分析，共检测到2个穗瘟抗性QTL位点，都分布于第 11染色体末端上。由于q14江浦表型9-1和q14江浦表型9-2位置相邻， 所以这两个QTL很有可能为同一个抗性位点。
q14江浦表型
9-1
11 RM7277
Right Marker
RM1233
LOD PVE(%) Add
14.518
6.7792
1 -0.1082
q14江浦表型
9-2
11 RM1233
RM7654
47.806
21.8972
1 -0.2007
结果分析
如下图所示，即为用ICIMapping4.0软件读取出来的第11条染色体，其 相应位置标注于图右侧，即q14江浦表型9-1和q14江浦表型9-2.
本研究的不足：
由于时间的限制，本实验只进行了一次表型鉴定，所得实验数据 还有待考证；其次，接种鉴定是在大田中进行的，而RIL群体各家系的 生育期不一样，需批次进行接种，且接种鉴定环境条件不可控制，因 此得到的结果可能会有偏差。
为保证实验结果的可靠性，往后还需进行1-2次的重复试验，同时 可通过分批播种，尽可能使RIL群体中的各家系在一定时间范围内可进 行接种鉴定，减小环境误差。
水稻地方品种薄稻穗瘟抗性 QTL定位分析
Contents
目录
01
背景与意义
02
材料与方法
03
结果与讨论
04
致谢
研究背景
稻瘟病是由子囊真菌（the fugnal patheogen Magnaportbe oryzae） 引起的世界性水稻病害之一，严重影响了水稻的产量和质量。据统 计，在1975-1990年的16年间，由稻瘟病引起的全球产量损失高达 1.57亿t。自20世纪90年代以来，我国稻瘟病发病面积年均380万ha 以上，年损失稻谷产量达数亿公斤，直接影响我国粮食生产安全。
我国是水稻重要的起源地，因而我国拥有丰富的抗性资源。经研究 发现，薄稻可对多个稻瘟病小种产生抗病性反应，具有广谱抗性。 本试验采用稻瘟病小种Hoku1对薄稻与苏御糯杂交后代获得的重组自 交系（RILs）进行了接种鉴定，并对穗瘟抗性QTL进行了定位。
材料与方法
供试材料： 抗稻瘟病的ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ方品种薄稻；感病对照品种苏御糯；212个RILs 家系
（薄稻×苏御糯获得的F2:6重组自交系）。
供试菌株 本研究采用稻瘟病菌株Hoku1，其产孢和致病力都比较稳定。
1.采样及DNA提取 2.SSR 标记筛选
从本实验室引物库中筛选到了76对SSR标记，分布于除第3和第5染色体的 其他10条染色体上，用于对212 RILs 群体遗传分析。
3.PCR扩增
94℃预变性5min，94℃变性40 sec，55℃退火40 sec，72℃延伸40sec， 32个循环，72℃保温10min，4℃保存。
4.电泳检测
PCR反应产物在8%的聚丙烯酰胺凝胶上电泳分离，银染显色。
5.QTL分析
应用QTL IciMapping4.0对薄稻抗稻瘟病QTL进行分析，设定LOD值为3.0。
致谢：
感谢鲍老师的悉心指导！ 感谢实验室的所有师兄师姐的帮助，尤其感谢XXX师兄！ 在此一并向所有关心、支持和帮助过我的领导、同学和朋友表示 由衷的感谢!
谢谢大家！ 欢迎大家批评指正！
结果分析
2014年8月份用稻瘟病菌株Hoku1对薄稻、苏御糯和212个RIL家系进行 接种鉴定，其性状调查结果如图1所示：
结果分析
运用ICIMapping4.0遗传作图，并结合表型数据进行QTL分析，共检 测到的2个QTLs：
表一：检测到的穗瘟抗性QTL位点
Trait
Chr Left .n Marker