实验二 植物总RNA的提取
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实验二、植物总RNA的提取
一、实验目的: 1.了解真核生物基因组RNA提取的一般原 理。 2.掌握Trizol提取RNA的方法和步骤。 3.了解RNA纯度的检测。
二、一般原理
Trizol 试剂是由苯酚和硫氰酸胍(guā)配制而 成的单相的快速抽提总RNA的试剂,在匀 浆和裂解过程中,能破碎细胞、降解蛋白质 和其它成分,使蛋白质与核酸分离,失活RNA 酶,同时能保持RNA的完整性。在氯仿抽提、 离心分离后,RNA处于水相中,将水相转 管后用异丙醇沉淀RNA。
RNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙 醇并保存于-70℃
七、检测 1、DNA的紫外分光光度计检测
OD260/OD280>1.8 1OD260=40 μ g/mL DNA
2、甲醛变性琼脂糖电泳检测
八、注意事项
(1)Trizol、DEPC等有毒,与皮肤接触会引起
伤害。操作过程带手套,在通风条件下操作。
5、 10000r/min离心5分钟 6、取上清液(水相)转入一新的离心管,加 入等体积异丙醇,室温放置3分钟,10000r/min 离心5分钟。 7、弃去上清液,加入至少1ml的70%乙醇,涡 旋混匀,4℃下10000r/min离心5分钟。
8、小心弃去上清液,然后室温或真空干 燥5-10分钟,注意不要干燥过分,否则会降 低RNA的溶解度。然后将RNA溶于20微升 TE或DEPC处理过的水中,必要时可55℃60℃水溶 10分钟。
五、试剂
1、无RNA酶的无菌水:用将高温烘烤的玻璃瓶(180℃ 2小时)装蒸馏水,然后加入0.01%的DEPC(体积/体积), 处理过夜后高压灭菌。 2、75%乙醇:用DEPC处理水配制75%乙醇,(用高温 灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于 低温冰箱。 3、氯仿:异戊醇 [24 : 1 (v/v)] 、氯仿。 4、异丙醇、无水乙醇、70%乙醇。 5、Trizol试剂。
Trizol试剂配制 苯酚饱和液(38%)-380ml/L 硫氰酸胍盐(0.8M-118.16g) 硫氰酸铵(0.4M)-- 76.12g 醋酸钠pH 5(0.1M)- 33.4ml 甘油 – 50ml 加水至1L 。
三、材料 植物组织 四、设备 移液器,冷冻高速离心机,低 温冰箱,台式高速离心机,液氮罐, 陶瓷研钵,1.5ml离心管。
1. 琼脂糖电泳检测
(2)避免带入RNase进入样品
带手套,别用手碰任何与样品接触的物品。 使用新的已灭活RNase的塑料器皿与用具。 (3)爱护仪器设备,安全操作
作业:
1、RNA酶的变性或失活剂有那些?其中在总
RNA的抽提中主要可用哪几种?
有DEPC,Trizol,氧钒核糖核苷复合物,RNA酶的 蛋白抑制剂以及SDS,尿素,硅藻土等;在总RNA提 取中用DEPC,Trizol
六、操作步骤
1、取植物嫩叶,液氮研磨,每1.5ml tube
分装0.1克样品;
2. 每管加入0.5ml Trizol液,迅速混匀,注 意样品总体积不能超过所用Trizol体积的 10%。 3、室温下静置5分钟以利于核酸蛋白质复 合体的解离
4 、加入0.5ml的氯仿,盖紧离心管,用手剧烈 摇荡离心管15秒,室温静置3分钟
2、怎样从总RNA中进行mRNA的分离和纯化?
利用成熟的mRNA的末端具有polyA尾的特点合成 一段oligo(dT)的引物,根据碱基互补配对原则,可将Biblioteka mRNA从总RNA中分离出来
补充: DNA检测方法 1. 此外分光光度计检测
OD260值=1时,相当于含50μg/mL DNA OD260/OD280=1.8~1.9时,DNA较纯 小于1.8时,蛋白含量较高,大于2.0则含有RN A或有断裂DNA
一、实验目的: 1.了解真核生物基因组RNA提取的一般原 理。 2.掌握Trizol提取RNA的方法和步骤。 3.了解RNA纯度的检测。
二、一般原理
Trizol 试剂是由苯酚和硫氰酸胍(guā)配制而 成的单相的快速抽提总RNA的试剂,在匀 浆和裂解过程中,能破碎细胞、降解蛋白质 和其它成分,使蛋白质与核酸分离,失活RNA 酶,同时能保持RNA的完整性。在氯仿抽提、 离心分离后,RNA处于水相中,将水相转 管后用异丙醇沉淀RNA。
RNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙 醇并保存于-70℃
七、检测 1、DNA的紫外分光光度计检测
OD260/OD280>1.8 1OD260=40 μ g/mL DNA
2、甲醛变性琼脂糖电泳检测
八、注意事项
(1)Trizol、DEPC等有毒,与皮肤接触会引起
伤害。操作过程带手套,在通风条件下操作。
5、 10000r/min离心5分钟 6、取上清液(水相)转入一新的离心管,加 入等体积异丙醇,室温放置3分钟,10000r/min 离心5分钟。 7、弃去上清液,加入至少1ml的70%乙醇,涡 旋混匀,4℃下10000r/min离心5分钟。
8、小心弃去上清液,然后室温或真空干 燥5-10分钟,注意不要干燥过分,否则会降 低RNA的溶解度。然后将RNA溶于20微升 TE或DEPC处理过的水中,必要时可55℃60℃水溶 10分钟。
五、试剂
1、无RNA酶的无菌水:用将高温烘烤的玻璃瓶(180℃ 2小时)装蒸馏水,然后加入0.01%的DEPC(体积/体积), 处理过夜后高压灭菌。 2、75%乙醇:用DEPC处理水配制75%乙醇,(用高温 灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于 低温冰箱。 3、氯仿:异戊醇 [24 : 1 (v/v)] 、氯仿。 4、异丙醇、无水乙醇、70%乙醇。 5、Trizol试剂。
Trizol试剂配制 苯酚饱和液(38%)-380ml/L 硫氰酸胍盐(0.8M-118.16g) 硫氰酸铵(0.4M)-- 76.12g 醋酸钠pH 5(0.1M)- 33.4ml 甘油 – 50ml 加水至1L 。
三、材料 植物组织 四、设备 移液器,冷冻高速离心机,低 温冰箱,台式高速离心机,液氮罐, 陶瓷研钵,1.5ml离心管。
1. 琼脂糖电泳检测
(2)避免带入RNase进入样品
带手套,别用手碰任何与样品接触的物品。 使用新的已灭活RNase的塑料器皿与用具。 (3)爱护仪器设备,安全操作
作业:
1、RNA酶的变性或失活剂有那些?其中在总
RNA的抽提中主要可用哪几种?
有DEPC,Trizol,氧钒核糖核苷复合物,RNA酶的 蛋白抑制剂以及SDS,尿素,硅藻土等;在总RNA提 取中用DEPC,Trizol
六、操作步骤
1、取植物嫩叶,液氮研磨,每1.5ml tube
分装0.1克样品;
2. 每管加入0.5ml Trizol液,迅速混匀,注 意样品总体积不能超过所用Trizol体积的 10%。 3、室温下静置5分钟以利于核酸蛋白质复 合体的解离
4 、加入0.5ml的氯仿,盖紧离心管,用手剧烈 摇荡离心管15秒,室温静置3分钟
2、怎样从总RNA中进行mRNA的分离和纯化?
利用成熟的mRNA的末端具有polyA尾的特点合成 一段oligo(dT)的引物,根据碱基互补配对原则,可将Biblioteka mRNA从总RNA中分离出来
补充: DNA检测方法 1. 此外分光光度计检测
OD260值=1时,相当于含50μg/mL DNA OD260/OD280=1.8~1.9时,DNA较纯 小于1.8时,蛋白含量较高,大于2.0则含有RN A或有断裂DNA