智因东方：提高阳性率之——检测范围越全越好

智因东方：提高阳性率之——检测范围越全越好
检测范围越全，越能避免漏检，这个道理很容易懂。

智因东方认为，目前遗传病NGS检测策略主要有小Panel、临床外显子、全外显子、CNVseq 几种策略，低阳性率往往和检测策略选择有关。

Panel策略，也叫疾病相关靶向测序策略，是对某种临床症状相关的几十或几百个基因打个包。

相比于全外显子，Panel策略的优势在于成本较低，数据分析难度也小，对于相对特异的疾病群，经验丰富的医生运用起来效果也不错。

但从各种遗传病诊断的总体实际效果来看，Panel策略的阳性率只有10~20%。

相比之下，智因东方发现，全外显子组（人类全部2万个基因），能较好的解决打包不全的问题，阳性率大约可提升至35~45% 。

检测范围越全，诊断越严谨
在低通量时代，因为技术局限性，测得太多成本就太高，所以临床上一般是先怀疑（说通俗一点就是猜）哪种病，就检测哪个基因，倘若在这个基因上还真就找到了一个变异的话，就很容易先入为主、对号入座，确诊是这种病了。

智因东方认为这种情况就类似盲人摸象，摸到的只是局部，摸到象腿就说大象是柱子，摸到尾巴就说大象是绳子，检测到这个基因有变异就说患者就是这个病，难免以偏概全。

其实，智因东方的做针对性的检测——单个基因的一代测序，或是小Panel，大多是低通量时代的思维的延续，这种低通量思维主要基于以下的逻辑前提：
单基因病的表型非常特异，不会存在多种疾病混淆的情况，所以怀疑哪种病就做这种病的基因就OK。

基因变异的致病性很明确，在目标基因找到变异就可以确诊了。

然而智因东方发现的实际情况可能恰恰相反：
疾病的复杂性远超预期：单基因病种类繁多，特征相似的疾病往往很难鉴别诊断，对某种疾病的预先诊断，很有可能是错误的。

变异致病性的不确定性远超预期：与患者表型相似的疾病可能有很多，意味着有可能在很多个基因上都存在变异，但并不是所有的变异的致病性都很明确，需要在众多变异中进行选择。

在过去的低通量时代，没有办法把所有疾病进行全面筛查，我们只能是预先诊断，再做有确证性的检查，尽管不严谨，但也只能如此。

但如今智因东方进入高通量测序时代，我们就有了一窥全貌的机会，我们完全可以在更广阔、全面的遗传背景上去确证，在我们怀疑的这种疾病之外，没有其他更值得怀疑的疾病的选项了。

当然，即便是做全面的检测，也存在漏检的可能，但这总比只测一个基因或者小Panel要全面得得多，严谨得多。

因此在检测策略上，智因东方建议能做全外显子+CNV，就尽量不要选择小Panel。

要注意的是，做这么大范围的检测，必须用Trios家系策略去借助共分离筛选变异，否则数据分析难度太大，也难以发现新发变异。