甘蓝S位点受体激酶基因(SRK)编码区的甲基化分析

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甘蓝型油菜角果数突变体基因的定位及候选基因分析

作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2022, 48(1): 27 39/ ISSN 0496-3490; CN 11-1809/S; CODEN TSHPA9E-mail:***************本研究由江西省自然科学基金项目(20202BABL205016), 湖北省自然科学基金重点(杰青)项目(2018CFA075), 优质高产多抗油菜新品种选育项目(2018ABA087)和国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-13)资助。

This study was supported by the Natural Science Foundation of Jiangxi Province (20202BABL205016), the Hubei Provincial Natural Science Foundation (Outstanding Youth) (2018CFA075), the Breeding of New Rapeseed Varieties with High Quality, High Yield and Multiple Resistance (2018ABA087), and the China Agriculture Research System (CARS-13).*通信作者(Corresponding author): 师家勤,E-mail:*******************同等贡献(Contributed equally to this work)第一作者联系方式:E-mail:*****************Received (收稿日期): 2020-12-27; Accepted (接受日期): 2021-04-14; Published online (网络出版日期): 2021-06-15. URL: https:///kcms/detail/11.1809.S.20210615.1402.008.htmlDOI: 10.3724/SP.J.1006.2022.04281甘蓝型油菜角果数突变体基因的定位及候选基因分析赵改会1,** 李书宇2,** 詹杰鹏1 李晏斌3 师家勤1,* 王新发1 王汉中11中国农业科学院油料作物研究所, 湖北武汉 430062; 2 江西省农业科学院作物研究所, 江西南昌 330200; 3武汉市农业技术推广中心, 湖北武汉 430400 摘要: 角果数是油菜单株产量重要的构成因子之一, 其优异等位基因的发掘和利用对产量的提高至关重要。

甘蓝一代杂种S单元型的分布

甘蓝一代杂种S单元型的分布苗雯雯;田磊;庄木;刘玉梅;杨丽梅;张扬勇;方智远【摘要】利用SRK基因激酶区的3对特异性引物,对23份甘蓝一代杂种进行PCR 扩增,经过克隆测序、Blast分析初步鉴定甘蓝一代杂种的S单元型.结果表明:供试23份材料中共出现了11个S单元型,分别是S7、S16、S28、S35、S45、S57、S68和未知的Sn等8个Ⅰ类S单元型及S2、S5、S15等3个Ⅱ类S单元型.其中,Ⅱ类S单元型的S5出现频率最高,达到19.6％；其次为Ⅰ类S单元型的S28,达到17.4％.相比甘蓝类作物中存在的50多个S单元型而言,本试验材料涉及的S单元型并不多,预示在遗传育种中利用更多的S单元型是十分必要的.【期刊名称】《中国蔬菜》【年(卷),期】2013(000)010【总页数】6页(P23-28)【关键词】甘蓝;S单元型;一代杂种;分布【作者】苗雯雯;田磊;庄木;刘玉梅;杨丽梅;张扬勇;方智远【作者单位】中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081;中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081;中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081;中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081;中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081;中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081;中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081【正文语种】中文【中图分类】S635.1当前，甘蓝（Brassica oleracea L. var. capitata L.）的商业栽培品种中几乎都是利用自交不亲和系或雄性不育系配制的一代杂种。

在甘蓝育种实践中，一代杂种的结实性对新品种的示范推广进程具有重要的影响，且与亲本材料的自交不亲和性（self-incompatibility，SI）存在着密切的联系。

甘蓝属于典型的孢子体型自交不亲和体系，在遗传上由一个具有多个复等位基因的S位点控制，又称S单元型（S haplotype）（Nasrallah & Nasrallah，1993）。

甘蓝自交不亲和性信号传导元件与传导过程

作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2015, 41(1): 1 14/ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9 E-mail: xbzw@本研究由重庆市自然科学基金重点项目(cstc2012jjB80010)资助。

第一作者联系方式: 朱利泉, E-mail: zhuliquan@, Tel: 023-********Received(收稿日期): 2013-11-06; Accepted(接受日期): 2014-11-05; Published online(网络出版日期): 2014-11-11. URL: /kcms/detail/11.1809.S.20141111.1557.010.htmlDOI: 10.3724/SP.J.1006.2015.00001甘蓝自交不亲和性信号传导元件与传导过程朱利泉周燕西南大学农学与生物技术学院, 重庆400715摘要: 甘蓝自交不亲和性是由多态性的S 位点基因编码的蛋白质介导的信号传导途径实现的。

该信号传导途径由8个蛋白质元件(SLG 、SCR 、SRK 、MLPK 、THL 、ARC1、Exo70A1和MOD/MIP-MOD)组成, 本文详细综述了这些元件的编码基因、蛋白质元件的结构和功能, 以及元件间的相互作用所构成的信号传导过程。

在此基础上, 根据新进展提出了今后可能的研究重点, 以期为包括甘蓝在内的芸薹属自交不亲和性的深入研究提供新的内容。

关键词: 甘蓝; SI; S 位点; 信号传导Protein Elements and Signal Transduction Process of Self-Incompatibility in Brassica oleraceaZHU Li-Quan and ZHOU YanCollege of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Chongqing 400715, ChinaAbstract: The self -incompatibility (SI) system in Brassica oleracea is genetically controlled by a single polymorphic S -locus that encodes proteins initiating a process of SI signaling transduction. This process involves eight protein elements including SLG , SCR, SRK, MLPK, THL, ARC1, Exo70A1, and MIP-MOD. Here, based on their corresponding gene’s architecture, we summa-rized these elements on their advances both in structure and function of their genes and proteins, as well as their interaction along the whole SI signal transduction process. Furthermore, we put forward some insights into unknown areas of SI, hoping to provide a few of clues for further exploration of SI mechanism in B. oleracea or other Brassica species. Keywords: Brassica oleracea ; Self-incompatibility; S -locus; Signal transduction自交不亲和性(self-incompatibility, SI)是指可育的雌雄同株植物柱头乳突细胞识别“自花”和“异花”花粉, 并特异地拒绝“自花”花粉, 不产生或不能产生足量合子的现象,“自花”花粉, 既指同株花粉, 也指不同株但具有相同S 单倍型的花粉。

羽衣甘蓝类受体激酶FERONIA基因克隆、表达及与相互作用蛋白分析

羽衣甘蓝类受体激酶FERONIA基因克隆、表达及与相互作用蛋白分析荀宝茹;秦洪涛;马蕊;郭楠枫;刘运平;吴莹;蓝兴国【期刊名称】《植物研究》【年(卷),期】2024(44)2【摘要】FERONIA(FER)受体激酶在有性生殖中的花粉与柱头信号识别中发挥重要作用,为分析类受体激酶FERONIA(FER)在羽衣甘蓝(Brassica oleraceavar.acephala)授粉中的作用,以羽衣甘蓝自交不亲和系(S_(13-b)S_(13-b))为研究材料,采用RT-PCR从柱头中克隆得到BoFER基因,获得的BoFER cDNA序列,全长2682 bp编码893个氨基酸,其含有高度保守激酶结构域和Ser/Thr激酶结合位点。

利用qRT-PCR技术对BoFER在授粉过程中的表达水平进行分析,结果发现BoFER 在不亲和授粉过程其表达量逐渐升高,而在亲和授粉过程中其表达量逐渐降低。

利用酵母双杂交分析BoFER与已知的自交不亲和相关蛋白的相互作用,结果显示BoFER与S位点受体激酶BoSRK13-b的激酶域存在相互作用。

【总页数】9页(P298-306)【作者】荀宝茹;秦洪涛;马蕊;郭楠枫;刘运平;吴莹;蓝兴国【作者单位】东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室【正文语种】中文【中图分类】S635【相关文献】1.羽衣甘蓝S13-b位点受体激酶基因的克隆及激酶结构域的原核表达2.甘蓝两种单倍型S-位点受体激酶胞外结构域(eSRK)和S-位点半胱氨酸富集蛋白(SCR)基因的克隆及其相互作用特异性检测3.利用酵母双杂交系统鉴定羽衣甘蓝臂重复蛋白(ARC1)与结球甘蓝S位点受体激酶(SRK)激酶结构域的相互作用4.巴西橡胶树FERONIA类受体激酶基因(HbFER)的克隆及表达分析5.羽衣甘蓝类蛋白质二硫键异构酶PDIL1-2的基因克隆及蛋白表达分析因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

结球甘蓝SRK-ARC1-Exo70A1互作域的确定及作用强度

结球甘蓝SRK-ARC1-Exo70A1互作域的确定及作用强度施松梅;高启国;廉小平;毕云龙;刘晓欢;蒲全明;刘贵喜;柳菁;任雪松【期刊名称】《中国农业科学》【年(卷),期】2016(049)001【摘要】[目的]深入研究甘蓝自交不亲和信号传导关键元件S-位点受体激酶SRK 与臂重复蛋白ARC1及ARC1与Exo70A1间相互识别的分子机理,鉴定SRK-ARC1及ARC1-Exo70A1之间的互作区段,并分析其作用强度,明确蛋白间互作功能域.[方法]通过生物信息学分析得到蛋白功能域,根据分析结果以典型的自交不亲和结球甘蓝E1为材料分别扩增SRK、ARC1和Exo70A1含不同功能域的截短体片段,利用分子克隆技术将SRK激酶域(SRKj)及其截短体SRKjΔ1—SRKjΔ4,Exo70A1全长及其截短体Exo70h1Δ1—Exo70h1Δ3的编码序列分别亚克隆至pGADT7(AD)质粒,将ARC1及其截短体ARC1Δ1—ARC1Δ8的编码序列分别亚克隆至载体pGBKT7(BD)质粒.用PEG/LiAc法将获得的AD和BD重组质粒两两组合分别共转化到酵母AH109感受态中,观察融合菌株在SD/-Leu-Trp-His-Ade/X-α-gal/25 mM 3-AT平板上的菌落生长情况和颜色变化情况,进一步测定其β-半乳糖苷酶活性.最后通过原核表达体外孵育检测蛋白质相互作用的方法对SRK-ARC1及ARC1-Exo70A1的相互作用进行验证.[结果]DNA测序和内切酶分析显示成功构建18个酵母双杂交表达载体,且无自激活能力.在SRK-ARC1的1 0个试验组合中,只有ARC1Δ4、ARC1Δ8、ARC1与SRKj组合的融合菌株在SD/-Leu-Trp-His-Ade/X-α-gal/25 mM 3-AT培养基上长出蓝色菌落,激活报告基因HIS3、ADE2和MEL1.随着SRKj或ARC1截短体片段的延长,二者的β-半乳糖苷酶活性逐渐增加,其中,ARC1Δ4与SRKj组合的β-半乳糖苷酶活性最高(酶活为15.98).在ARC1-Exo70A1 16个试验组合中,Exo70A1Δ3与ARC1Δ1Δ3都相互作用,其融合菌株在SD/-Leu-Trp-His-Ade/X-α-gal/25 mM 3-AT培养基上长出蓝色菌落,激活报告基因HIS3、ADE2和MEL1.随着ARC1或Exo70A1截短体片段的延长,二者的β-半乳糖苷酶活性呈现先增加后降低的趋势,其中ARC1Δ2与Exo70A1Δ3组合的β-半乳糖苷酶活性最大(酶活性为25.07).说明ARC1的N端和Exo70A1的N端发生了互作,而ARC1的C端、全长与Exo70A1都不发生互作.体外表达检测蛋白相互作用发现,SRKj与ARC1Δ4、ARC1Δ2与Exo70A1Δ3均可以直接发生相互作用.[结论]SRK的激酶域(SRKj)与ARC1的C端臂重复区发生互作,缩短SRK激酶域中的任何结构域或者缩短ARC1的臂重复区,二者都不会发生互作.ARC1的亮氨酸拉链和蜷曲螺旋与Exo70h1的N端结构域(去除pfamExo70A1域)介导了二者的相互作用.SRK-ARC1的作用力强度小于ARC1-Exo70A1的作用力强度.【总页数】13页(P14-26)【作者】施松梅;高启国;廉小平;毕云龙;刘晓欢;蒲全明;刘贵喜;柳菁;任雪松【作者单位】西南大学农学部,重庆400715;重庆市蔬菜学重点实验室,重庆400715;西南大学农学部,重庆400715;重庆市蔬菜学重点实验室,重庆400715;重庆市蔬菜学重点实验室,重庆400715;西南大学农学部,重庆400715;重庆市蔬菜学重点实验室,重庆400715;重庆市蔬菜学重点实验室,重庆400715;西南大学农学部,重庆400715;西南大学农学部,重庆400715;重庆市蔬菜学重点实验室,重庆400715【正文语种】中文【相关文献】1.甘蓝两种单倍型S-位点受体激酶胞外结构域(eSRK)和S-位点半胱氨酸富集蛋白(SCR)基因的克隆及其相互作用特异性检测 [J], 韦静宜;高启国;王小佳;李成琼;宋明;任雪松2.利用酵母双杂交系统鉴定羽衣甘蓝臂重复蛋白(ARC1)与结球甘蓝S位点受体激酶(SRK)激酶结构域的相互作用 [J], 张贺翠;李成琼;王小佳;杨昆;朱利泉;杨永军;薛丽琰;杨红;常登龙;高启国;任雪松3.甘蓝S-位点受体激酶(SRK)激酶结构域编码区分子特性及其与类硫氧还蛋白(THL1)相互作用检测 [J], 高启国;宋明;牛义;杨昆;朱利泉;王小佳4.结球甘蓝雌蕊发育调控因子SPT与HEC1的基因克隆及相互作用 [J], 许俊强;孙梓健;刘智宇;杨朴丽;汤青林;王志敏;宋明;王小佳5.张量多项式强度准则相互作用系数实验确定方法 [J], 谢仁华;唐羽章因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

人工合成甘蓝型油菜及其亲本的甲基化变异模式分析

作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2016, 42(4): 513-524/ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@本项目由国家重点基础研究计划(973计划)项目(2015CB150201), 中国和江苏省博士后基金(2014M561719, 2015T80591, 1401078B)资助。

This study was supported by the National Key Basic Research Program of China (2015CB150201), China and Jiangsu Postdoctoral Program (2014M561719, 2015T80591, 1401078B).*通讯作者(Corresponding author): 蒋金金, E-mail: jjjiang@, Tel: 0514-********第一作者联系方式: E-mail: 185********@, Tel: 185********Received(收稿日期): 2015-08-27; Accepted(接受日期): 2016-01-11; Published online(网络出版日期): 2016-01-25. URL: /kcms/detail/11.1809.S.20160125.1622.014.htmlDOI: 10.3724/SP.J.1006.2016.00513人工合成甘蓝型油菜及其亲本的甲基化变异模式分析谢涛戎浩蒋金金* 孔月琴冉丽萍吴健王幼平扬州大学生物科学与技术学院, 江苏扬州 225009摘要: 甘蓝型油菜作为多倍体起源和发生的历史较短, 遗传背景较为狭窄, 人工合成甘蓝型油菜可作为植物多倍化研究的优选模型, 本文以人工合成的甘蓝型油菜为材料, 通过HPLC 分析发现白菜型油菜和甘蓝的甲基化率分别为8.33%和15.88%, 2个杂种株系的全基因组甲基化水平介于双亲之间, 分别为10.29%和12.83%。

基于转录组分析的PUB蛋白与甘蓝S-位点受体激酶的相互作用研究

基于转录组分析的PUB蛋白与甘蓝S-位点受体激酶的相互作用研究自交不亲和(Self-incompatibility,SI)是显花植物防止自交、促进杂交,保持物种遗传多样性的重要机制之一。

甘蓝等芸薹属(Brassica)植物属于典型孢子体型自交不亲和植物,其自交不亲和性由S位点(S-locus)上的复等位基因所控制。

当自花授粉时,花粉落到柱头上,花粉中SCR可与柱头上SRK胞外域识别并特异性结合,引起SRK构象的变化和自体磷酸化,使其释放结合在SRK激酶结构域的类硫氧还蛋白1/2(THL1/2),随后ARC1结合到SRK胞内激酶域上,并被磷酸化,ARC1是E3泛素连接酶,通过泛素化作用向下继续传导细胞信号,最终导致自交不亲和。

最近研究表明,在琴叶拟南芥(Arabidopsis lyrata)中通过反义抑制柱头内的ARC1基因表达,只能部分地打破材料的不亲和性;在拟南芥(Arabidopsis thaliana)中,ARC1直系同源基因是假性遗传因子,仅仅转入SRK-SCR基因后,拟南芥植株也能呈现出自交不亲和性。

由此说明ARC1可能并非SRK唯一的下游信号蛋白,柱头内可能存在其他未知底物与SRK作用,在柱头内继续传递SI信号。

在甘蓝自花授粉的过程中,柱头内PUB蛋白的活性急剧增高,由此我们推测柱头内可能存在其他的泛素蛋白与SRK 作用,因此前期对甘蓝高代自交不亲和A4的花期柱头做了自花授粉0 min和自花授粉30 min两种处理,提取了柱头总RNA后进行转录组测序分析,发现25条表达差异明显的PUB蛋白基因。

我们挑取了4条表达差异最为明显的PUB蛋白进行后续研究,分别命名为BoSU03、BoSU05、BoSU07、BoSU11;随后,运用qRT-PCR筛选出自花授粉后甘蓝柱头内基因表达水平发生变化的PUB蛋白。

参照PUB蛋白基因的同源序列设计扩增引物,以甘蓝A4 cDNA为模板来扩增基因片段,构建T载体克隆并测序。

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羽衣甘蓝S13-b位点受体激酶基因的克隆及激酶结构域的原核表达

质特异表达，表达产物进行分离纯化，得了ＳＫ，激酶结构域的融合蛋白。结论：衣甘蓝ＳＫ “ 基因的克隆对获Ｒｂ＿羽Ｒ及激酶结构域的原核表达，为研究ＳＫ的功能及自交不亲和性奠定了基础。Ｒ［键词］羽衣甘蓝；关自交不亲和；位点受体激酶；核表达；化Ｓ原纯
［图分类号］Ｑ８中７
［献标识码］Ａ文
［文章编号］１０ — ０２００２０１— ３０９００（１） — ２００２０
ＣｌｎｎｆＳＫ．ＧｅｅｏｎｍｅｔｌＫａｅ（ｒｓｉａｏｅａｅａ．ｏｉｇｏＲｎｆＯｒａｎａｌＢａｓｌｒｃａｖｒｃａｅｈｌｃｐａａ）ａｄＰｏａｙｔｘｒｓｉｎｏｎｓｍａｎｏＲ３ｎｒｋｒｏｉＥｐｅｓｆＫｉａｅＤｏｉｆＳＫ１ｂｃｏ＿
２ｌ０
生
ＬＴｒＲＳＩＯＥＣＥＥＮＢＩＴＨＮＯＧＹＶｏ．１ＯＬ１Ｎｏ２Ｍａ．００２．ｒ，２１
物
技术
通
Hale Waihona Puke 讯ｄ：０９９．ｎ０９００．１．．５ｏ１３￣ｉ．０－０２００２１ｉ．６ｓ１ｓ２００
研究报告
表达载体并进行重组蛋白质的原核表达和纯化。法：取羽衣甘蓝ＳＳ自交不亲和系花期柱头的ＲＡ，Ｒ — 方提Ｎ用Ｔ

甘蓝S-位点基因SRK、SLG和SP11SCR密码子偏好性分析

作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2022, 48(5): 1152 1168 / ISSN 0496-3490; CN 11-1809/S; CODEN TSHPA9 E-mail:***************本研究由国家自然科学基金项目(31572127)和中央高校基本科研业务费专项资金(XDJK2020D024)资助。

This study was supported by the National Natural Science Foundation of China (31572127) and the Fundamental Research Funds for the Central Universities (XDJK2020D024).*通信作者(Corresponding author): 朱利泉,E-mail:*****************.cn **同等贡献(Contributed equally to this work)第一作者联系方式: 张以忠,E-mail:****************Received (收稿日期): 2021-01-11; Accepted (接受日期): 2021-09-09; Published online (网络出版日期): 2021-10-18. URL: https:///kcms/detail/11.1809.S.20211018.1156.002.htmlDOI: 10.3724/SP.J.1006.2022.14003甘蓝S-位点基因SRK 、SLG 和SP11/SCR 密码子偏好性分析张以忠1,2,** 曾文艺1,** 邓琳琼2 张贺翠1 刘倩莹1 左同鸿1 谢琴琴1 燈胡科1 袁崇墨1 廉小平1 朱利泉1,*1西南大学农学与生物科技学院, 重庆 400715; 2贵州工程应用技术学院生态工程学院, 贵州毕节 551700摘要: S 位点是芸薹属植物自交不亲和反应的关键位点, 控制自交不亲和反应的识别与启动。

甘蓝自交不亲和信号传导元件ARC1的体外表达及其与SRK相互作用验证

作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2009, 35(7): 1202−1208/zwxb/ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@本研究由国家自然科学基金项目(30471190和30671429), 重庆市自然科学基金项目(9266), 高校博士点基金项目(20050625003), 西南大学科研基金项目(SWU208044)资助。

*通讯作者(Corresponding authors): 王小佳, E-mail: wxj@; 朱利泉, E-mail: zhuliquan@, Tel: 023-********, Fax: 023-********第一作者联系方式: E-mail: niuy2001134@; Tel: 023-********(4); Fax: 023-******** Received(收稿日期): 2008-12-05; Accepted(接受日期): 2009-03-16.DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01202甘蓝自交不亲和信号传导元件ARC1的体外表达及其与SRK 相互作用验证牛义1 王志敏1 高启国1 宋明1 王小佳1,* 朱利泉2,*1西南大学重庆市蔬菜学重点实验室; 2 西南大学植物生理生物化学实验室, 重庆400716摘要: 在甘蓝自交不亲和信号传导中ARC1和上游因子SRK 之间可能存在相互作用。

为进一步证实该相互作用, 以甘蓝E1为材料, 采用RT-PCR 技术扩增ARC1的编码序列, 构建ARC1原核表达质粒pET43.1a-ARC1, 转化宿主菌大肠杆菌BL21, 通过SDS-PAGE 检测该蛋白的表达。

利用免疫共沉淀原理及pET43.1a-ARC1融合蛋白序列中的6×His 标签与Ni +结合的特点建立了体外检测蛋白质相互作用的新方法, 并用该方法对ARC1与SRK 的相互作用进行了检测。

甘蓝型油菜SLG基因片段的克隆及序列分析

作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2008, 34(5): 764−769/zwxb/ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@基金项目: 国家自然科学基金项目(30600397); 中国博士后科学基金(2005038643); 浙江省自然科学基金项目(Y305140); 2006年度浙江省博士后科研项目择优资助项目(2006-BSH-40)作者简介: 柯丽萍(1976–), 女, 博士, 研究方向为油菜分子生物学。

E-mail ：kelip@*通讯作者(Corresponding author): 陈锦清, 男, 研究员, 主要从事油料作物基因工程与品质改良研究。

Tel (Fax): 0571-********;E-mail: j.q.chen@Received(收稿日期): 2007-12-05; Accepted(接受日期): 2007-12-22.DOI: 10.3724/SP.J.1006.2008.00764甘蓝型油菜SLG 基因片段的克隆及序列分析柯丽萍郑滔吴学龙何海燕陈锦清*(浙江省农业科学院病毒学与生物技术所, 浙江杭州310021)摘要: 通过不同甘蓝型油菜中SLG 基因的克隆及序列分析, 探索了甘蓝型油菜中是否存在与芸薹属二倍体中相同或相似的S -locus 基因。

对10个甘蓝型油菜品种和品系中SLG 基因的PCR 扩增和序列比较分析发现, 这些甘蓝型油菜中都存在第2类的SLG 基因, 而且, 同二倍体芸薹属物种一样, 第2类SLG 基因之间具有较高的同源性; 只有5个甘蓝型油菜品种和品系中存在第一类SLG 基因, 而且这些基因序列之间表现出高度的保守性, 即同源性在96%以上, 明显高于不同等位基因之间的同源性。

这些甘蓝型油菜中的class I SLG 基因可能源于同一个自交不亲和单体。

关键词: 甘蓝型油菜; 自交不亲和; SLG 基因; 同源性分析Analysis of Self-Incompatibility Locus Gene in Brassica napusKE Li-Ping, ZHENG Tao, WU Xue-Long, HE Hai-Yan, and CHEN Jin-Qing *(Institute of Virology and Biotechnology, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310021, Zhejiang, China)Abstract : Self-incompatibility (SI) is one of the most important mechanisms in flowering plants to prevent inbreeding and pro-moter outcrossing. In Brassica , the diploid varieties of Brassica oleracea (CC) and B. campestris (AA) were self-incompatibility, while the amphidiploid B. napus varieties (AACC) were usually self-compatible. In the SI response, SLG gene was one of the S -locus genes that supposed to contribute to receptor —ligand interactions and signal transduction. SLG gene shares a similarity of 85–98% with eSRK (SRK ectodomain) in the same S haplotype, while in different S haplotypes, the SLGs and SRKs behave dif-ferently. In order to make out whether the S -locus exist in B. napus , the SLG gene in the S -locus in several varieties of B. napus were cloned. By PCR analysis and sequences comparison, the class II SLG gene was found in all tested varieties of B. napus , while class I SLG genes were only found in 5 of the 10 tested varieties. Further studies indicated that the five varieties that had the class I SLG genes were probably derived from the same S haploid years ago. The results would provide scientific reference for further study and exploitation on the mechanistic studies of self-compatibility in Brassica napus L. Keywords: Brassica napus ; Self-incompatibility; SLG gene; Homologous analysis芸薹属中二倍体物种甘蓝(Brassica oleracea , CC)、白菜和白菜型油菜(B. campestris , AA)存在广泛的自交不亲和性, 而其相应的异源四倍体种甘蓝型油菜(B. napus , AACC)通常表现为自交亲和[1]。

不同感温性甘蓝型冬油菜DNA甲基化差异及At4g02000-like结构预测

中国油料作物学报ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌｏｆＯｉｌＣｒｏｐＳｃｉｅｎｃｅｓ
２０１９，４１（３）：３４９－３５９ｄｏｉ：１０．７５０５／ｊ．ｉｓｓｎ．１００７－９０８４．２０１９．０３．００６
不同感温性甘蓝型冬油菜ＤＮＡ甲基化差异及Ａｔ４ｇ０２０００－ｌｉｋｅ结构预测
白静，孙万仓，刘丽君，武军艳，马骊，何辉立，常瑜，蒲媛媛，米文博，方彦，李学才
收稿日期：２０１８１０１２基金项目：国家现代农业产业技术体系（ＣＡＲＳ－１２）；国家自然２０１５ＣＢ１５０２０６）；科技部项目
（２０１６ＹＦＤ０１０１３００）；国家农业科技成果转化项目（２０１４Ｇ１００００３１７）；国家自然科学基金（３１５６０３９７）；甘肃省自然科学基金（１４５ＲＪＺＧ０５０）作者简介：白静，女，硕士研究生，从事油菜育种研究，Ｅ－ｍａｉｌ：１３２８２２９３３１＠ｑｑ．ｃｏｍ通讯作者：孙万仓，男，教授，博士，主要从事油菜育种及十字花科种质资源研究，Ｅ－ｍａｉｌ：１８２９３１２１８５１＠１６３．ｃｏｍ
Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｏｂｅｔｔｅｒｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｔｈｅｃｏｌｄ－ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅｏｆｗｉｎｔｅｒｒａｐｅｓｅｅｄ（ＢｒａｓｓｉｃａｎａｐｕｓＬ．），ＤＮＡｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎｗｅｒｅｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｄｕｓｉｎｇＭＳＡＰ（ｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎｓｅｎｓｉｔｉｖｅａｍｐｌｉｆｉｅｄｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ）ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙｏｎ１３ｍａｔｅｒｉａｌｓｗｉｔｈｄｉｆｆｅｒｅｎｔｃｏｌｄｒｅｓｉｓｔａｎｃｅｕｎｄｅｒｌｏｗｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ（４℃）ｓｔｒｅｓｓ．ＭＳＡＰｒｅｓｕｌｔｓｓｈｏｗｅｄｔｈａｔ，ａｆｔｅｒ４℃ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ，ｔｈｅｗｅａｋｃｏｌｄ－ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅｌｉｎｅｓ（１４Ｍｅｉｑｉｅｓｈｉ７，１４Ｍｅｉｑｉｅｓｈｉ１６，１４Ｍｅｉｑｉｅｓｈｉ２０，１４Ｍｅｉｑｉｅｓｈｉ３ａｎｄＭｅｉｑｉｅｓｈｉ３８ｈａｄｉｎｃｒｅａｓｅｄＤＮＡｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎｌｅｖｅｌａｎｄｈａｄｈｉｇｈｅｒｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎｄｅｇｒｅｅ．Ｔｈｅｓｔｒｏｎｇｃｏｌｄ－ｒｅｓｉｓｔａｎｔｌｉｎｅｓ（１５ＴＳ３０６，１４ＮＳ５２－３，１５ＴＳ３０９，１４ＮＳ５４－７ａｎｄ１５ＴＳ３１２）ｈａｄｈｉｇｈｅｒｄｅｇｒｅｅｏｆｄｅｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ．Ｓｅｑｕｅｎｃｅａｎａｌｙｓｉｓｏｆｔｈｅｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙｍｅｔｈｙｌａｔｅｄｆｒａｇｍｅｎｔｓｓｈｏｗｅｄｔｈａｔ１６ｏｆ２２ｆｒａｇｍｅｎｔｓｗｅｒｅｓｉｍｉｌａｒｔｏｔｈｅｋｎｏｗｎａｎｄｐｕｔａｔｉｖｅｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｅｎｚｙｍｅｓ．Ａｍｏｎｇｔｈｅｍ，Ａｔ４ｇ０２０００－ｌｉｋｅｐｒｏｔｅｉｎｈａｄｔｈｅｇｒｅａｔｅｓｔｖａｒｉａｔｉｏｎ．Ｃｌｏｎｉｎｇａｎｄｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｒｅｓｕｌｔｓｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｉｔｓｉｓｏｅｌｅｃｔｒｉｃｐｏｉｎｔｗａｓ９．２０ａｎｄｔｈｅｒｅｌａｔｉｖｅｍｏｌｅｃｕｌａｒｗｅｉｇｈｔｗａｓ３９．８９ｋＤ．Ｉｎｓｕｍｍａｒｙ，ａｆｔｅｒｌｏｗｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅｓｔｒｅｓｓ，ｔｈｅｓｔｒｏｎｇｃｏｌｄ－ｒｅｓｉｓｔａｎｔｌｉｎｅｓｈａｄｄｅｃｒｅａｓｅｄＤＮＡｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎｌｅｖｅｌｗｉｔｈｄｏｍｉｎａｎｔ

【国家自然科学基金】_类受体蛋白激酶_基金支持热词逐年推荐_【万方软件创新助手】_20140802

ห้องสมุดไป่ตู้
cxcr4 b类ⅰ型清道夫受体 bri1 bki1 bcr-abl
1 1 1 1 1
2013年序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25
科研热词推荐指数高糖 1 隐丹参酮 1 视黄醇类x受体 1 血管新生 1 血管平滑肌细胞 1 蛋白激酶c 1 蛋白激酶b 1 膜附着型配体类 1 细胞外信号调节激酶1/2 1 细胞增殖 1 类胰岛素样生长因子-1受体 1 类受体蛋白 1 离子通道受体 1 病理生理学 1 拟南芥 1 受体酪氨酸激酶 1 受体激酶 1 受体,eph家族 1 双向信号 1 pc12细胞 1 g蛋白偶联受体 1 gabab受体 1 ephrin类 1 cle多肽 1 (原)形成层 1
2012年序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50
科研热词推荐指数酵母双杂交 2 水稻 2 鸡胚原代肝细胞 1 高糖 1 逆境反应 1 过识别 1 视黄醇类x受体 1 蛋白质相互作用 1 蛋白质互作 1 蛋白激酶c 1 自身免疫性疾病 1 脱氢表雄酮(dhea) 1 肝脏脂肪代谢 1 结构域 1 细胞壁连接的类受体激酶(wak) 1 组织培养 1 类硫氧还蛋白(thl) 1 类受体蛋白激酶 1 生长发育 1 生物信息学分析 1 甘蓝 1 炎症性肠病 1 炎性细胞因子 1 激素信号 1 氧化应激 1 模式识别受体 1 植物 1 抗肿瘤活性 1 巨噬细胞 1 天然免疫反应 1 大麻素类 1 基因克隆 1 器官发生 1 哺乳动物 1 单核细胞 1 再生相关基因 1 信号转导通路 1 信号传递 1 体细胞胚胎发生 1 优势结构 1 人急性单核细胞白血病细胞 1 s位点富含半胱氨酸蛋白(scr) 1 s位点受体激酶(srk) 1 p38 mapk信号通路 1 osesg1基因 1 lrr-rlk 1 g蛋白偶联受体55 1 camp反应元件结合蛋白(creb) 1 camp/pka信号通路 1 4-喹诺酮 1

甘蓝基因组测序分析完成

（光明日报）
３Ｓ・
素在植物生长发育中作用的理解，也为水稻及其他植
物通过 “ 根工程 ”改良营养吸收及非生物胁迫耐受性
提供了极具潜力的靶标基因和思路。
（中国科学报）
作物种间和种内基因组呈现多层次不对称的进化规律。
该研究成果近日在线发表在国际权威学术期刊Ｎａｔｕｒｅ
ＰｈｙｓｉｃａｌｌｙＩｎｔｅｒａｃｔｗｉｔｈＰＩＬｌｔｏＲｅｇｕｌａｔｅＩｔｓ
甘蓝基因组测序是白菜、甘蓝和油菜等芸薹属全基因组测序项目的一部分，上述成果在中国农科院油料研究所和蔬菜花卉研究所、华大基因研究院的主导下，联合国内外多家科研机构共同完成。我国主要油料作物油菜（基因组命名为ＡＡＣＣ）、主要蔬菜作物白菜（基因组为ＡＡ）和甘蓝（基因组为ＣＣ）同属于芸薹属作物，而油菜是由白菜和甘蓝杂交后进化而来的。甘蓝和白菜共同祖先种的基因组含三份同源基因组（三倍化，称为亚基因组）。研究还发现，甘蓝基
ＳｔａｂｉｌｉｔｙａｎｄＰｈｏｔｏｍｏｒｐｈｏｇｅｎｉｃＤｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｉｎ
Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ ” 。该研究阐释了模式植物拟南芥ＰＩＬｌ蛋
白通过与光形态建成的关键负调控因子ＣＯＰ１以及红
从而愚弄鸟儿去吃它。
（中国科学报）

甘蓝型油菜漆酶基因家族成员表达模式及与茎秆抗折力的关联分析

甘蓝型油菜漆酶基因家族成员表达模式及与茎秆抗折力的关联分析目录一、内容概要 (2)1. 研究背景 (2)2. 研究目的与意义 (3)3. 研究方法与实验设计 (4)二、甘蓝型油菜漆酶基因家族成员概述 (5)1. 漆酶基因家族的定义与分类 (7)2. 甘蓝型油菜漆酶基因家族成员的筛选与鉴定 (7)3. 漆酶基因家族成员的基本信息 (9)三、甘蓝型油菜漆酶基因家族成员表达模式分析 (10)1. 表达谱数据获取与处理 (11)2. 表达模式可视化与统计分析 (12)3. 表达模式聚类与功能注释 (14)4. 表达模式在不同组织及发育阶段的比较 (15)四、甘蓝型油菜漆酶基因家族成员与茎秆抗折力的关联分析 (16)1. 材料准备与实验设计 (17)2. 茎秆抗折力测定方法 (18)3. 基因表达量与茎秆抗折力的相关性分析 (18)4. 基因编辑技术验证 (20)五、结论与讨论 (21)1. 甘蓝型油菜漆酶基因家族成员表达模式的比较分析 (23)2. 漆酶基因家族成员与茎秆抗折力的关联机制探讨 (23)3. 研究的创新点与不足之处 (25)六、展望 (26)1. 深入挖掘漆酶基因家族在甘蓝型油菜中的功能与应用 (27)2. 探讨漆酶基因家族与植物其他性状的关联分析 (28)3. 为甘蓝型油菜的高产、抗逆等育种目标提供新的思路与策略..30一、内容概要甘蓝型油菜漆酶基因家族的鉴定与生物信息学分析：通过基因序列比对、生物信息学软件分析等手段，鉴定甘蓝型油菜漆酶基因家族的成员，并对其基因结构、蛋白质特性等进行深入研究。

表达模式分析：利用实时荧光定量PCR等技术，分析不同组织部位、不同发育阶段以及不同环境条件下甘蓝型油菜漆酶基因家族成员的表达情况，探究其表达模式。

茎秆抗折力测定：通过物理测试方法，测定甘蓝型油菜茎秆的抗折力，分析其力学特性。

关联分析：结合表达模式分析结果和茎秆抗折力数据，分析甘蓝型油菜漆酶基因家族成员的表达与茎秆抗折力之间的关联性，探讨其在提高茎秆抗折力方面的作用机制。