基于SRAP分子标记的贵州省棕榈种质资源遗传多样性分析
11SRAP标记在植物遗传多样性中的应用进展_王从彦
专题综述 REVIEW ARTICLES
SRAP 标记在植物遗传多样性中的应用进展
王从彦
( 南通大学生命科学学院,江苏 南通 226019) 摘要: 该文综述了 SRAP 标记在植物种类遗传多样性国内近几年的应用进展,以便为今后的研究提供相应的理论依据。同 时,并讨论了一些 SRAP 标记在植物种类遗传多样性应用中尚存在的问题。 关键词: 遗传多样性; 分子标记; 植物; SRAP
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[6]魏国栋 . 氧化葡萄篇酸杆菌高密度培养及生物催化合成轻基酸的 研究[D]. 上海: 华东理工大学,2009. [7]茅燕勇 . 微生物转化法制备 11α - 羟基化坎利酮[D]. 南京: 南京 工业大学,2005. [8]Kim G. J,Lee I Y,Choi D K,et al. High cell density cultivation of Pseudomonas putida BM01 using glucose [J]. Microbial Biotechnol. , 1996,6: 221 - 224. [9]Suzuki T. A dense - cell culture system for microorganisms using a stirred ceramic membrane reactor incorporating asymmetric porous ceramic filters[J]. Ferment Bioeng. ,1996,82: 264 - 271. [10]张文燕,堵国成,陈坚 . 流加发酵及添加 L - 半胱氨酸对产朊假 丝酵母高密度培养合成谷胱甘肽的影响[J]. 应用与环境生物学报, 2007,13( 2) : 261 - 264. [11]洒荣波 . 基于重组巴斯德毕赤酵母高密度培养研究[D]. 无锡: 江南大学硕士论文,2005. [12]梁新乐,张虹,陈敏,等 . 费氏丙酸 HZ - P - 35 细胞高密度培养转 化亚油酸生 成 共 轭 亚 油 酸[J]. 中 国 粮 油 学 报,2008,23 ( 2 ) : 106 - 110. [13]洒荣波,石贵阳,唐瑜菁 . 不同补料发酵方式对重组毕赤酵母高 密度培养的影响[J]. 食品工业科技,2010,31( 11) : 210 - 212. [14]齐士朋,徐尔尼,罗玉芬,等 . 细胞高密度培养技术的应用研究进 展[J]. 食品与发酵工业,2011,37( 2) : 139 - 143. [15]张建新,张吨,胡文波,等 . 重组大肠杆菌高密度发酵研究进展 [J]. 中国酿造,2011,227( 2) : 5 - 8.
SRAP分子标记在园林植物遗传育种中的应用
分子标记技术以能直接研究 DNA 水平上的遗 传变异,不 受 组 织 器 官、环 境 及 基 因 是 否 表 达 的 限 制,其多态性高,遗传稳定等优点广泛应用于植物的 遗传育种研究[1]。在近 30 年中,分子标记技术得到 了快速发展,目前 DNA 分子标记已达几十种,大致 可以分为 4 类: 以分子杂交技术为基础的标记,如 RFLP; 基于 PCR 技术的标记,如 RAPD、SSR、ISSR、 AFLP 和 SCAR 等; 基于 DNA 序列的标记,如 cSSR、 ITS 测序分析技术等; 以 DNA 芯片技术为基础的标 记,如 SNP 等。
1 SRAP 技术的原理与特点
相关序 列 扩 增 多 态 性 ( sequence-related amplified polymorphism,SRAP) 分子标记技术最初是由美 国加州大学蔬菜作物系 Li 与 Quiros 博士[2]于 2001 年在研究芸薹属作物时创立的,又称为基于序列扩 增多 态 性 ( sequence-based amplified polymorphism, SBAP) 。它是通过一对独特的引物对开放阅读框 ( ORF) 进行 PCR 扩增,由于物种及个体间的差异导
随着园林绿化的发展,对园林植物的需求度也 越来越高,如要求物种丰富,品种多样化,观赏性状 特异性高,可以周年生产,抗逆性强等。而近几年一 种新的分子标记方法———相关序列扩增多态性( Se-
quence-related amplified polymorphism,SRAP) 以其多 态性 高、非 等 位 检 测,样 品 信 息 量 大,操 作 简 便,重 复、稳定、可靠性高和费用低等优点,广泛应用于园 林植物的遗传多样性和亲缘关系分析、图谱构建、种 质资源鉴定、基因克隆和基因定位的研究中,为园林 植物的遗传育种提供更确切,更充分的理论依据。
基于分子标记的遗传多样性研究
基于分子标记的遗传多样性研究随着生物技术的发展,分子标记成为研究遗传多样性的重要手段之一。
分子标记是指通过分子生物学技术获得的、在DNA水平上区别不同个体间基因类型的DNA片段,如限制性片段长度多态性(RAPD)、随机扩增多态性(DNA)(SRAP)、序列特定放大长度多态性(SSR)(简称微卫星)、单核苷酸多态性(SNP)等。
这些分子标记可以直接或间接地反映不同物种及个体间的遗传变异情况,进而研究物种演化、种间亲缘关系、种群间遗传分化及群体结构等。
从方法学上看,基于分子标记的遗传多样性研究具有优势。
相较于传统的形态分类法,基于分子标记的研究方法不仅具有更高的分类精度和重复性,且能够在区别性弱、难以直观形态分类的物种中发挥作用。
基于SSR标记的遗传多样性研究是目前应用较为广泛的方法之一。
SSR标记是指在基因组DNA序列中间处不断重复出现的富集序列区段,长度一般约为10-20个核苷酸,具有多态性。
SSR标记具有多态性高、遗传信息丰富、重复性好、扩增容易等优点,可用于物种间、种群间遗传差异的检测和分子标记辅助育种等应用。
研究表明,SSR标记具有较高的遗传多样性,因此可以用于评估不同物种及群体间的遗传分化程度。
比如,许多植物物种中,种群间遗传多样性与地理距离呈负相关,因此利用SSR标记分析可以对不同物种的子群间遗传分化进行深入探讨。
此外,SNP是最近发展起来的一种新型分子标记,是单核苷酸的多态性,基于SNP的遗传多样性分析可用于评估不同物种与群体间的遗传分化,并揭示种间亲缘关系的演化过程。
总之,基于分子标记的遗传多样性研究是现代遗传学的重要组成部分,也是物种分类、种群遗传学及育种的重要工具。
未来,随着技术的不断发展以及遗传多样性研究的深入,基于分子标记的研究手段将在遗传多样性研究领域中扮演更加重要的角色,助力生命科学研究的发展和进步。
基于SRAP分子标记的果桑种质资源遗传多样性分析
202315基于SRAP分子标记的果桑种质资源遗传多样性分析孙秀秀1,2林夏1,2王景飞1,2翁春雨1,2张永豪1,2陈宣1,2*(1海南省农业科学院热带园艺研究所,海南海口571100;2海南省热带特种经济植物种质资源创新利用重点实验室,海南海口571100)摘要为探索果桑种质之间的亲缘关系,选取适宜海南地区生长的34份果桑资源,通过可靠的SRAP分子标记技术,进行果桑种质的遗传多样性分析研究。
结果表明:从100对SRAP引物组合中筛选获得16对扩增多态性高的引物组合,共扩增清晰的条带108条,其中多态性条带93条,平均多态性比率为84.96%,平均每对引物组合扩增6.75条。
平均观测等位基因数为1.8704,平均有效等位基因数为1.5200,平均Nei′s基因多样性指数为0.3022,平均Shannon′s信息指数为0.4510。
遗传相似系数为0.49~0.95,表明34份果桑种质之间遗传多样性比较高。
根据UPGMA聚类树状图,在遗传相似系数为0.32处,供试34份果桑种质可归属为五大类群,其中第Ⅰ类群27份,占79.41%,包括大部分果桑供试材料;第Ⅱ类群3份种质,占8.82%,分别为嘉陵30号、云桑2号、本地桑HNQZ01(采自海南琼中);第Ⅲ类群和第Ⅳ类群各1份种质,分别为红宝石和长果桑,均占到2.94%;第Ⅴ类群包括2份种质,分别为香金葚、长相思,占5.88%。
本研究结果可为果桑种质资源的鉴定、评价及优良品种选育提供科学依据。
关键词果桑;SRAP标记;种质资源;遗传多样性中图分类号S663.9文献标识码A文章编号1007-5739(2023)15-0073-06DOI:10.3969/j.issn.1007-5739.2023.15.020开放科学(资源服务)标识码(OSID):Genetic Diversity Analysis of Fruit Mulberry Germplasm Resources Based on SRAPMolecular MarkersSUN Xiuxiu1,2LIN Xia1,2WANG Jingfei1,2WENG Chunyu1,2ZHANG Yonghao1,2CHEN Xuan1,2*(1Institute of Tropical Horticulture,Hainan Academy of Agricultural Sciences,Haikou Hainan571100;2Hainan Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Tropical Special Economic Plants,Haikou Hainan571100)Abstract In order to explore the genetic relationships among fruit mulberry germplasms,34fruit mulberry germplasm resources suitable for growth in Hainan were selected to analyze the genetic diversity of fruit mulberry germplasm by using reliable SRAP molecular marker technology.The results showed that16pairs of highly polymorphic primers were selected from100pairs of SRAP primer combinations.A total of108clear bands were amplified,including 93polymorphic bands,with an average polymorphism rate of84.96%,and an average of6.75bands were amplified per pair of primer combinations.The average observed allele number was1.8704,the average effective number of alleles was1.5200,the average Nei′s genetic diversity index was0.3022,the average Shannon′s information index was0.4510. The genetic similarity coefficient was0.49-0.95,indicating that the genetic diversity of34fruit mulberry germplasm was relatively high.According to UPGMA clustering tree map,34fruit mulberry germplasm samples could be classified into five groups at the genetic similarity coefficient of0.32,among which,27samples were from GroupⅠ,accounting for79.41%,including most of the fruit mulberry materials.Three germplasm of GroupⅡ,which were Jialing No.30,基金项目海南省省属科研院所技术创新专项“技术创新科研”(jscx202011);农业基础性长期性科技工作观测监测专项(NAES078GR09);海南省农业科学院院本级科研项目(HAAS2022PT0206)。
基于SRAP标记的国兰种质资源遗传多样性分析
基于SRAP标记的国兰种质资源遗传多样性分析
国兰(Erianthus spp.)是一类最新致力于创造高生物质的杂交甘蔗,被认为是糖类
生产的一个重要资源。
然而,关于这一种植物遗传多样性及其形成机制的系统分析还不够。
因此,本文利用SRAP分子标记技术对国兰种质资源进行了遗传多样性分析,以期为其育种、种质保存以及进一步开发提供参考。
从125个国兰种质中共筛选出了89对SRAP引物,其中63对被筛选为具有优良特性的引物,成功扩增出了515个位点,其中比多态性率为84.85%,表明SRAP标记供灵敏且多态性很高。
91.76%多样性信息引入率能够充分反映出适用此标记系统进行遗传多样性研究的
适当性及可靠性。
聚类分析结果表明,不同类型的国兰材质被划分为两个主要的类群,这两个类群大体
上与物种分类和亲缘关系一致。
用一个树形聚类热图表示多样性的差异,可以很好地识别
出高度相关的种群及其含有的材质序列。
正如表格中所显示的,典型的样品包括来自中国、巴西、印度、泰国、加拿大和美国的具有重要特性的种质。
遗传多样性分析结果表明,国兰的遗传多样性主要集中分布在物种之间而不是在种内部,物种间的遗传分化系数(GST)值为0.40,说明兰族之间存在较大的基因差异。
AMOVA 分析显示,种群间的遗传变异是全部变异的72.38%,而种内的遗传变异贡献率仅为27.62%,表明物种间遗传多样性具有很高的变异性和组合性。
总之,本研究利用SRAP分子标记技术对国兰种质资源的遗传多样性进行了全面系统的分析,为进一步开发、育种以及保存国兰种质资源提供了有力支持。
基于SRAP分子标记的贵州5种忍冬属药用植物遗传多样性分析
基于SRAP分子标记的贵州5种忍冬属药用植物遗传多样性分析潘绿昌;赵致;何云;李园园;刘红昌;俸婷婷;周英【摘要】[目的]分析贵州5种忍冬属药用植物的遗传多样性,为忍冬属药用植物鉴定、良种筛选及开发利用提供理论依据.[方法]采集贵州6份忍冬属药用植物材料的嫩芽为试验材料,采用SRAP分子标记研究其遗传多样性,并利用NTSYS-pc2.1计算各材料间的遗传相似系数,利用UPGMA进行聚类分析.[结果]从154对SRAP引物组合中筛选出15对重复性好、条带清晰、多态性丰富,且扩增条带(100~1000 bp)数目≥5的引物组合.15对SRAP引物共扩增出197条带,其中178条为多态性条带,多态性条带比率为90.36%,平均每对引物扩增11.87条多态性条带.引物组合Me8-Em10扩增的多态性条带数最多(16条);引物组合Me2-Em2扩增的多态性条带最少(8条);引物组合Me4-Em2扩增条带数为15条,均为多态性条带,但从5种忍冬属药用植物的扩增条带数不同.聚类分析结果显示,6份忍冬属药用植物材料间遗传相似系数为0.4213~0.8477,平均0.5672;其中,野生忍冬与栽培忍冬间遗传相似系数最大(0.8477),二者亲缘关系最近,灰毡毛忍冬与野生忍冬遗传相似系数最小(0.4213),二者亲缘关系最远.在遗传相似系数0.4873处,6份忍冬属药用植物分为两大类,第Ⅰ类包括灰毡毛忍冬、红腺忍冬和黄褐毛忍冬,均为山银花的基源植物;第Ⅱ类包括野生忍冬、栽培忍冬和红白忍冬,均为金银花的基源植物.[结论]贵州5种忍冬属药用植物具有丰富的遗传多样性,SRAP分子标记能有效分析其遗传多样性及亲缘关系,其引物组合Me4-Em2可用于鉴别5种忍冬属药用植物.【期刊名称】《南方农业学报》【年(卷),期】2018(049)012【总页数】7页(P2349-2355)【关键词】忍冬属药用植物;SRAP分子标记;遗传多样性;遗传相似系数;聚类分析【作者】潘绿昌;赵致;何云;李园园;刘红昌;俸婷婷;周英【作者单位】贵州大学农学院/贵州省药用植物繁育与种植重点实验室,贵阳550025;贵州大学农学院/贵州省药用植物繁育与种植重点实验室,贵阳 550025;贵州省药食同源植物资源开发工程技术研究中心,贵阳 550025;贵州大学农学院/贵州省药用植物繁育与种植重点实验室,贵阳 550025;贵州大学农学院/贵州省药用植物繁育与种植重点实验室,贵阳 550025;贵州省药食同源植物资源开发工程技术研究中心,贵阳 550025;贵州省药食同源植物资源开发工程技术研究中心,贵阳550025【正文语种】中文【中图分类】S567.790.240 引言【研究意义】忍冬(Lonicerɑ jɑponicɑ Thunb.)、灰毡毛忍冬(L.mɑcrɑnthoides Hand.-Mazz.)、红腺忍冬(L.hypoglɑucɑ Miq.)、华南忍冬(L.confusɑ DC.)和黄褐毛忍冬(L.fulvotomentosɑ Hsu et S.C.Cheng)均被作为大宗药材金银花广泛使用。
扬州大学科技成果——园林植物新品种选育及产业化核心技术集成应用
扬州大学科技成果——园林植物新品种选育及产业化核心技术集成应用成果简介项目组针对影响我国园林植物产业发展的关键问题开展协同攻关,取得的主要创新成果如下:1、系统收集和引进15个国家和国内18个省份的特色园林植物种质资源1508份,建立了芍药、杜鹃、月季、柳树、槭树、榉树、含笑、银杏、乌桕等9个种质资源圃和1个以彩叶树种为主的新优苗木展示园,构建了基于形态和生理指标的种质资源观赏性和抗逆性评价体系,创建了基于SRAP分子标记的槭树、杜鹃种质资源遗传多样性和亲缘关系分析技术体系,阐明了乌桕叶色和芍药花色形成的生物学机制,为优异园林植物的推广应用和新品种选育提供了丰富的种质贮备和科学依据。
2、系统研发了重要园林植物的育种技术,选育出一批具有自主知识产权的园林植物新品种。
探明了杜鹃杂交后代的遗传变异特点,创建了芍药幼胚培养技术,探索了应用RNA干扰技术创制芍药新种质的育种技术,发明了提高柳树杂交效率、提早开花结实及促进杜鹃、挪威槭等种子萌发的方法,采用常规育种与现代育种技术相结合的方法,选育出具有自主知识产权的芍药、杜鹃、月季、红叶李、栾树、含笑、乌桕和鸡爪槭优良新品种21个,提高了园林植物新品种的研发能力和水平。
3、系统集成创建种苗工厂化快繁技术体系、园林苗木高效栽培技术体系和服务带动型的“一体两翼”花木科技推广服务体系。
(1)集成创新与各种园林植物配套的容器育苗、扦插育苗、嫁接育苗和组培育苗等种苗工厂化快繁技术体系,加快良种的规模化生产进程;(2)集成创新以“三新”技术为核心的园林苗木高效栽培技术体系改造传统生产方式,即:运用高接换冠技术更新改造低档品种,运用大树造型技术更新改造常规树形,运用乔、灌木立体种植技术更新改造传统种植方式,实现园林植物的集约化生产;(3)整合高校、科研院所与社会力量,共建服务带动型的“一体两翼”花木科技推广服务体系,推动园林行业科技进步。
本项目共选育出21个新品种通过省级以上品种鉴定(认定),获得授权专利17项,其中发明专利15项,制定地方标准28项,发表相关论文116篇,其中SCI收录16篇,培养博、硕士研究生15名。
贵州饲用燕麦种质资源的SRAP遗传多样性分析
相 关 序列 扩 增 多 态 性 ( e u n erl e m li o - S q e c — a da pie pl et fd y
m rhs S A ) 由美 国人 L 等于 20 年 提 出 的一 opi m,R P 是 i 01 种 基 于 P R 的 新 型 标 记 , 称 基 于 序 列 扩 增 多 态 性 C 也
组 学 研究 等方 面得 到 广泛应 用 。近年 来 , 内研究 国
人 员 逐渐 开始 在 牧草种 质 资源 上也 应 用 S A R P技 术 开
展 遗 传多 样性 的研 究 , 如黑 麦 草 ( oi prne ¨ L lm een ) 、 u
柱 花 草 ( t oate ) 、 枝 子 ( epd z ) 、 Sy snh s l 胡 L seea H
苜 蓿 ( l l ) 、白 三 叶 ( i c vr 、 苣 Aff ¨ aa Wht l e ) e o 菊 ( i oim it u) 等 草 种 质 都 有 报 道 ; 时 在 小 Cc r y s Ⅲ h u nb 同 麦 与燕 麦 杂交 种 的研究 中也 有应 用 - ]但 未见 在燕 。2 , o 麦 研 究 中的应 用 报道 。为 了充 分挖 掘 贵州本 地 优 良牧 草种 质 资 源 , 解 冬 春 季 节 饲 草 料 短 缺 的 矛 盾 , 缓 于 20 0 5年 到 2 1 在贵 州各 地 采 集 了数 十份 饲 用 燕麦 0 0年 资源 进 行 研 究 和 开发 , 试 验 就 这 些 资 源采 用 S A 本 RP 分 子 标记 进行 了遗 传 多 样 性 分 析 , 同时 也 对 S A R P分 子标 记在 燕麦 中的应用 进 行探 讨 。
贵州野生半夏资源遗传多样性的ISSR分析
图 2 不 同 分布 区样 品 的 IS S R扩 增 (9 ) 89 电泳 图谱
13 引物 筛选与 P R扩增 . C 以表 型差异较 大 的柳 叶半 夏 、 叶半 夏 和 珍珠 半 桃
距离 , S S 在 P S软件上 对遗传 距离 矩阵 和地理距 离矩 阵
进 行相关 性分 析 。
夏 为模 板进 行筛选 , 1 0条 引物 中共筛选 出 l 从 0 6条多 态 性好 、 带 清 晰 的引 物 , 退火 温 度 和序 列 见 表 1 条 其 。
较大 , 分布在 3 . % ~ 0 3 之 间 , 8O 6 .% 平均 为 5 . % , 3 4 高 于 5 % 的 样 品 占全部 贵 州样 品的 2 5 分 布 于全 省各 5 /,
为 了确保 扩增谱 带 的可 靠性 , 每个 引 物 重 复扩 增
2次 , 将重 复 出现 ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ带记 为 1 无 带 记 为 0 排 除 模糊 不 , , 清 的带 和无法 准确标 识 的带 , 计供 试 材 料 的 多态 性 统 数 据 。应 用 P P E E vr o . 2 软 件在 假 定样 品 O G N ( es n1 3 ) i 处于 H ry ib r 平 衡状 态下 , 算 6 ad We eg n 计 0个 样 品 的基
2 2 不 同样 品 的多态性 位点百 分率 .
2 / 0 L反应体 系 , 内含 1 ufr15m o LMg1, ×bf ,. m l C2 e /
2 0 N P , a N 聚合 酶 ( 京 天 根 ) 5 Ⅱ L d T s 1U T qD A 北 , 0 8 I L引物 ( . n / 上海 生工 ) 2 g模 板 D A ,0n N 。反 应程 序为 : 9 4℃预 变性 5 n 9 ;4℃变 性 3 退火 4 i, mi 0S, 5r n a 7 2℃延 伸 2mi ,5个 循环 ;2℃延 伸 7r n 保 n 3 7 i。4c a C I 存 。P R扩增 反应 产物 用 15 的琼脂糖凝 胶 ( E C .% 含 B
分子标记在亚热带森林植物遗传多样性研究中的应用
分子标记在亚热带森林植物遗传多样性研究中的应用亚热带森林是气候温和、植物多样性丰富的重要生态系统,对地球生态平衡的维护至关重要。
亚热带森林植物的遗传多样性是森林健康和生态系统服务的基础。
当前,遗传多样性的保护和管理对于生态保护和人类社会的可持续发展至关重要。
为了更好地保护亚热带森林的生态系统和遗传多样性,分子标记技术被广泛应用于亚热带森林植物遗传多样性的研究中。
分子标记技术是一种利用DNA序列上的多态性进行遗传多样性研究的方法。
它可以分析DNA序列的差异,从而实现对生物的种属鉴定、遗传关系分析和群体遗传结构分析等。
该技术被广泛应用于植物的遗传多样性研究中,并逐渐成为生态保护中不可或缺的工具。
在亚热带森林植物的遗传多样性研究中,分子标记技术常常被用来探究植物遗传多样性的来源、演化和分布。
其中,常见的分子标记包括RAPD、AFLP、SSR 和SNP等。
这些分子标记在亚热带森林植物遗传多样性研究中具有以下优势:首先,分子标记技术可以通过对DNA序列的测序和多态性分析,深入了解植物的遗传多样性来源和演化历程。
例如,通过对分子标记数据的分析,可以了解亚热带森林植物的遗传多样性是由随机漂移、非随机交配和环境选择等多种因素共同作用而形成的。
其次,分子标记技术可以用来研究亚热带森林植物的遗传多样性分布。
通过对不同区域和不同种群的植物进行分子标记分析,可以评估它们之间的遗传差异和关系。
例如,在中国南方的茶树种间遗传关系研究中,利用SSR分子标记技术分析得出了南方不同茶树种族之间存在明显的遗传分化。
此外,分子标记技术还可以用于评估亚热带森林植物群体的遗传多样性和遗传变异水平。
通过分析植物的基因型和表型数据,可以评价它们之间的遗传变异程度和群体遗传结构。
例如,在苍南麒麟竹的遗传多样性研究中,利用AFLP分子标记技术评估了它们的遗传多样性和群体遗传结构,为其保护和管理提供了科学依据。
总之,分子标记技术在亚热带森林植物遗传多样性研究中具有重要的应用价值。
基于SRAP分子标记的13份贵州芒果种质资源遗传多样性分析
热带作物学报2019, 40(1): 087 091Chinese Journal of Tropical Crops基于SRAP分子标记的13份贵州芒果种质资源遗传多样性分析刘荣,龚德勇,刘清国,黄海,范建新*贵州省农业科学院亚热带作物研究所,贵州兴义 562400摘要探索贵州芒果种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为芒果种质资源的鉴定、创新与利用提供理论依据。
利用SRAP标记对13份芒果种质资源进行遗传多样性分析。
对108对引物组合进行筛选,其中有17对引物扩增的条带多且多态性好。
17对引物共产生扩增带161条,多态性条带为133条,多态性比率为82.61%,显示较高的遗传多态性。
遗传相似系数在0.602~0.820,其中桂热芒10号与攀西红芒的相似系数最大,而桂热芒82号和红象牙芒两者之间的相似系数最小。
UPGMA聚类分析结果显示,Mi-8与桂热芒82号的亲缘关系较近,Mi-9与红芒6号的亲缘关系较近,野生种质资源Mi-5与串芒、桂热芒10号和攀西红芒的亲缘关系较近,野生种质资源Mi-6与凯特芒和金煌芒的亲缘关系较近。
以上研究结果说明SRAP技术能用于贵州芒果种质资源遗传多样性分析,也表明了贵州地区芒果种质资源遗传背景的复杂性。
关键词芒果;种质资源;SRAP标记;聚类分析;贵州中图分类号S667.7 文献标识码 AGenetic Diversity Analysis of Thirteen Mango Germplasm Resources Based on SRAP Molecular MarkersLIU Rong, GONG Deyong, LIU Qingguo, HUANG Hai, FAN Jianxin*Institute of Subtropical Crops, Guizhou Academy of Agricultural Sciences, Xingyi, Guizhou 562400, ChinaAbstract The genetic diversity and genetic relationship of mango germplasm resources were explored in Guizhou to provide the theoretical basis for mango germplasm identification, innovation and utilization. SRAP was used to assess the genetic diversity of 13 mango germplasm resources. 161 bands were amplified using 17 pairs of primers selected from 108 primers, of which 133 were polymorphic bands, and the polymorphic percentage of bands was 82.61%. Ge-netic similarity coefficients between genotypes was in the range of 0.602–0.820, with the minimum between mango Guire 10 and Panxi Red Mango, and the maximum between Guire 82 and Hongxiangya. Cluster analysis results showed that Mi-8 and Guire 82 had the closest relatives. Mi-9 and Red Mango 6 had the closest relatives. Mi-5, Chuan Mango, Guire 10 and Panxi Red Mango had the closest genetic relationship. Mi-6, Kate Mango and Jinhuang Mango had the closest genetic relationship. The test showed that SRAP technology could be used in the genetic diversity analysis of mango germplasm resources in Guizhou, and the genetic background of mango germplasm resources was complex in Guizhou.Keywords mango; germplasm resources;SRAP; cluster analysis; GuizhouDOI 10.3969/j.issn.1000-2561.2019.01.013芒果(Mangifera indica L.)属于漆树科(Anacardiaceae)、芒果属(Mangifera),是热带收稿日期 2018-05-23;修回日期 2018-08-23基金项目 贵州省科技支撑计划项目(黔科合支撑[2016]2526号,黔科合支撑[2018]2284号);贵州省人才基地项目(黔人领发[2016]22号)。
苎麻种质资源遗传多样性分析研究进展
RAPD(随机扩增多态性 DNA标记)技术是建 立在 PCR基础上对基因进行多态性分析的分子技 术。该技术在苎麻遗传多样性研究中发挥重要作 用。
揭雨成等[29]利用 RAPD技术对抗旱性较弱和 较强的基因型材料各 6个品种进行亲缘关系分析, 将其聚成两类三组,直观地反应材料间的亲缘关系, 为苎麻抗旱育种亲本选择及亲缘关系研究提供理论 依据。邱 财 生 等[30]利 用 RAPD分 析 13份 苎 麻 材 料,确 立 了 它 们 之 间 的 亲 缘 关 系。 陈 荷 泉[31]用 RAPD分子标记分析 44份苎栽培品种的遗传变异, 用 23个 RAPD引物扩增出 112个条带,多态性带 103条,多态性比率 917%。研究表明,RAPD技术 在亲缘关系分析和遗传多样性检测上具有较大的 潜力。
苎麻种质资源较丰富,不同的苎麻资源表型性 状差异较大。林敏荣等[11]通过对 27个苎麻地方品 种的叶形、叶 色、叶 缘 锯 齿、叶 柄 着 生 角 度、叶 面 皱 纹、茎毛、茎形、茎型、根型、根系类型、雌蕾色和蔸型 等 12个形态特征的调查,采用 DPS进行聚类分析, 在遗传距离 521处将 27个品种分为 4类,在遗传 距离为 365时,则为 10个类群,对选育优良苎麻品 种具有重要的指导意义。白玉超等[12]通过株高、茎 粗、鲜皮厚度、分株数、有效株率、地上部生物量 6个 农艺性状对 94份苎麻种质资源进行关联分析,得出 鲜皮厚对地上生物量的影响最大,株高和茎粗次之, 并筛选出一些优良的种质。李林林等[13]通过对 94 份苎麻种质的株高、茎粗、皮厚、有效株率、有效株、 单蔸分株数和单蔸生物量等 7个农艺性状进行聚类 分析,得到 3个聚类群,为苎麻优质高产育种的亲本 选配提供参考价值。在作物育种中形态标记虽简单 易懂,但受环境的影响,种群间的遗传变异无法准确 掌握。
贵州稀有濒危种子植物物种多样性保护与利用的研究
贵州稀有濒危种子植物物种多样性保护与利用的研究作者:邹天才李媛媛洪江黄丽华刘海燕陈龙张著林张维来源:《广西植物》2021年第10期摘要:全球性生物多样性保护与利用正逐步走向高质量发展,拥有丰富物种资源已成为夺取生物科技制高点的关键,因此,贵州稀有濒危种子植物多样性保护与利用的研究具有重要意义。
在对贵州稀有濒危种子植物资源调查的基础上,选取具有重要应用价值的小黄花茶(Camellia luteoflora)、贵州红山茶(C. kweichowensis)等103种贵州稀有濒危植物,采用模式标本产地植物追溯、现存分布区及种群散布特征调查、物种濒危等级评估、混合采种迁地保育、生物资源测试分析与资源评价相结合的方法,开展了植物物种多样性编目及其迁地保护、种子生物学特性与种子散布及分布动态变化、种苗繁育与应用栽培试验等研究。
结果表明:(1)调查评估的103种贵州稀有濒危种子植物都采取了就地保护措施,但迄今为止对濒危威胁程度减轻的效应不明显,抢救性迁地保护依然必要,其中极危(CR)23种、濒危(EN)30种、易危(VU)40种、近危(NT)7种、无危(LC)3种;采用同一地理种源迁地保护有效种群Pn≥Lf·Ee·Am的栽培方法,在贵州省植物园开展了迁地保护引种栽培试验。
其中,国家重点保护野生植物33种、3 650株,引种栽培平均成活率为95.47%,贵州及毗邻川、滇、桂极少数地区特有分布的种子植物70种、11 010株,引种栽培平均成活率为95.80%,并且建成了活植物保育圃30 200 m2。
(2)搜集文献大数据结合GIS信息追踪调查研究,发现了小黄花茶新分布区2.5 km2、长柱红山茶(C. longistyla)新分布区1.5 km2、美丽红山茶(C. delicata)新分布区1.0 km2、皱叶瘤果茶(C. rhytidophylla)新分布区6.0 km2、红花瘤果茶(C. rubituberculata)新分布区50.0 km2、贵州槭(Acer guizhouensis)新分布区0.3 km2;新分布区种群增量对其减轻濒危程度的评估效果影响不明显。
罂粟种质资源遗传多样性和亲缘关系的SRAP分析
罂粟种质资源遗传多样性和亲缘关系的SRAP分析作者:王玉红王笑张兆萍魏玉杰苏毓杰杨振华来源:《福建农业科技》2024年第05期摘要:探明罂粟种质资源遗传多样性和亲缘关系,为罂粟遗传育种研究和种质指纹图谱奠定工作基础。
利用形态标记和 SRAP 分子标记两种方法对 25 份罂粟资源的 13 个农艺性状进行测定、分析。
结果表明:从 12 对 SRAP 引物中共筛选出 11 对多态性明显、条带清晰的引物组合,对25 份供试材料基因组 DNA 分子进行扩增,共扩增出 210 条谱带,其中多态性条带81 条,多态性比率为 38.57%。
SRAP 聚类分析结果表明:25 份罂粟材料的遗传相似系数在0.907~0.992,当相似系数在 0.936 处作切割线,可将 25 份供试材料分为 5 个大类和若干亚类。
对供试罂粟材料的花色、叶形等农艺性状进行调查分析,当欧式距离为 5.0 时,可将所有罂粟材料可以分为 12 个大类和若干亚类。
综上分析表明 25 份罂粟种质资源遗传多样性较丰富,形态标记和 SRAP 分子聚类可以用于研究罂粟种质资源遗传多样性和亲缘关系分析,研究结果可为罂粟遗传育种研究和种质指纹图谱奠定工作基础。
关键词:罂粟;农艺性状;遗传多样性;SRAP 标记中图分类号:S567.21 文献标志码:A文章编号:0253−2301(2024)05−0033−06DOI: 10.13651/ki.fjnykj.2024.05.006SRAP Analysis of the Genetic Diversity and Genetic Relationship of Poppy Germplasm ResourcesWANG Yu-hong1,2,3,WANG Xiao1,2,3,ZHANG Zhao-ping1,2,3,WEI Yu-jie1,2,3,SU Yu-jie1,2,3,YANG Zhen-hua1,2,3(1. Gansu Academy of Agri-Engineering Technology, Lanzhou, Gansu 730000, China; 2. Key Laboratory of the Special Medicine Source Plant for Germplasm Innovation and Safety Utilization, Wuwei, Gansu 733006, China; 3. Hexi Comprehensive Experimental Station of National Traditional Chinese Medicine Industry Technology System, Wuwei,Gansu 733006,China)Abstract: The genetic diversity and genetic relationship of poppy germplasm resources were explored, which would lay a foundation for genetic breeding research and germplasm fingerprint of poppy. The 13 agronomic traits of 25poppy resources were measured and analyzed by using the two methods of morphological markers and SRAP molecular markers. The results showed that 11 pairs of primer combinations with obvious polymorphism and clear bands were selected from 12 pairs of SRAP primers. The genomic DNA molecules of the 25 tested materials were amplified, and a total of 210 spectrum bands were amplified, of which 81 were polymorphic bands, and the polymorphism rate was 38.57%. The results of SRAP cluster analysis showed that: the genetic similarity coefficient of25 poppy materials was 0.907-0.992. The cutting line was made when the similarity coefficient was 0.936, and the 25tested materials could be divided into 5 categories and several subcategories. The agronomic traits such as flower color and leaf shape of the tested poppy materials were investigated and analyzed. When the euclidean distance was 5.0, all the poppy materials could be divided into 12 categories and several subcategories. In summary, the analysis showed that the genetic diversity of 25 poppy germplasm resources was abundant. The morphological markers and SRAP molecular clustering could be used to study the genetic diversity and genetic relationship of poppy germplasm resources. The results could lay a foundation for the genetic breeding research and germplasm fingerprint of poppy.Key words: Poppy;Agronomic character;Genetic diversity;SRAP marker罂粟 Papaver somniferum L.为 1 年生药用草本植物,果实内含罂粟碱、吗啡、海洛因等 30 种生物碱。
18个贵州红托竹荪种质资源的遗传多样性
18个贵州红托竹荪种质资源的遗传多样性卢颖颖;桂阳;龚光禄;魏善元;朱国胜【期刊名称】《贵州农业科学》【年(卷),期】2014(000)007【摘要】为红托竹荪优良菌种的选育和开发利用提供参考,利用ITS和ISSR分子标记对18个贵州红托竹荪种质的遗传多样性进行分析。
结果表明:1)18个红托竹荪菌株的ITS序列长度为611~621 bp,GC碱基的含量为53.9%~54.68%,相似性为99.9%~100%。
2)在遗传相似度为0.77时,将18个红托竹荪菌株分为2个类群。
第Ⅰ类群包含13个菌株,分别为3个栽培菌株(ZS017,ZS036,ZS038)和10个野生菌株(YZS010-1,YZS010-2,YZS012,YZS018,YZS033,YZS035,YZS039,YZS041,YZS044,YZS046);第Ⅱ类群包含5个野生菌株(YZS040,YZS043,YZS045,YZS047,YZS052)。
结论,贵州18个红托竹荪种质的亲缘关系较近,没有明显的地域分布特点,其遗传背景差异较小。
【总页数】5页(P17-20,23)【作者】卢颖颖;桂阳;龚光禄;魏善元;朱国胜【作者单位】贵州省农作物品种资源研究所,贵州贵阳 550006; 贵州省农业生物技术重点实验室,贵州贵阳 550006;贵州省农作物品种资源研究所,贵州贵阳550006; 贵州省农业生物技术重点实验室,贵州贵阳 550006;贵州省农作物品种资源研究所,贵州贵阳 550006; 贵州省农业生物技术重点实验室,贵州贵阳550006;贵州省农作物品种资源研究所,贵州贵阳 550006; 贵州省农业生物技术重点实验室,贵州贵阳 550006;贵州省农作物品种资源研究所,贵州贵阳550006; 贵州省农业生物技术重点实验室,贵州贵阳 550006【正文语种】中文【中图分类】S646.8【相关文献】1.基于SRAP分子标记的贵州省棕榈种质资源遗传多样性分析 [J], 毛跃雄; 陆跃堂; 胡志姣; 赵杨2.贵州核桃农家品种种质资源遗传多样性的SRAP分析 [J], 杨小红;侯娜3.贵州茶树种质资源遗传多样性、群体结构和遗传分化研究 [J], 安红卫;宋勤飞;牛素贞4.贵州地方高粱种质资源遗传多样性分析 [J], 胡小兰;任明见;曾庆鸿;申涛;邱红波5.贵州普安四球茶(Camellia tetracocca Zhang)种质资源的遗传多样性分析 [J], 罗雯;陈艳艳;尹世华;王莉飞;黄晓霞;耿芳;程小毛因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
国内外烤烟品种农艺性状的遗传多样性及与SRAP标记的关联分析
1.1 试验材料 258 份烤烟品种中, 国内资源 155 份, 含地方品
种和育成品种, 收集自中国 11 个省份, 覆盖北方、 西南和东南三大烟叶产区; 国外资源 103 份, 含北 美洲 93 份、南美洲 6 份、日本和津巴布韦各 2 份。
材料名称及来源见附表 1。 1.2 试验设计及表型数据调查
SRAP 标记根据基因的内含子和外显子设计引 物, 对基因的开放阅读框(ORFs)进行扩增。该标记 具有操作简便、多态性高、重复性好、标记分布均 匀、产物易测序、便于目标片段克隆等特点[18], 已 成功应用于烟草遗传多样性分析[19], 遗传图谱构 建[20]和重要性状定位[7]等方面。
种质资源中蕴涵丰富的优异基因资源, 提高和 利用作物本身的遗传潜力是作物改良的首要措施。 本研究选取具有广泛地理来源的烤烟品种组成多样 性种质群体, 在同一栽培条件下评价其农艺性状差 异; 利用 SRAP 标记分析群体的遗传多样性和群体 结构; 在遗传多样性分析基础上, 将关联分析方法 应用于烤烟资源研究中, 进行 SRAP 标记和农艺性 状的关联分析, 筛选重要农艺性状候选标记。研究 结果可为烤烟优异种质和亲本材料发掘、分子辅助 育种和功能基因研究提供依据。
烟草(Nicotiana tabacum L.)作为生物学研究的 模式植物和重要的经济作物, 前人对其分类系统及 起源进化等进行了大量研究[1-3]。我国烤烟资源丰富, 但在烟草育种上却面临着过度依赖主体亲本、育成
品种遗传基础狭窄、主要性状趋同等问题[4]。烤烟 的农艺、品质等重要性状多为数量性状, 易受环境 影响, 根据表型进行育种选择效率低。
1030草连锁分析方面, Julio 等[5]利用 114 个 烤烟重组自交系对农艺性状、烟叶品质等 59 个性状 进行了 QTL 定位, 共检测到 75 个相关 QTL。蔡长 春等[6]利用含有 94 个株系的白肋烟 DH 群体, 定位 到 7 个化学成分和 4 个农艺性状的主效 QTL。李华 丽等[7]利用烤烟和白肋烟衍生的 127 个 F2 和 F2:3 家 系为材料对烟碱、总氯、总钾、叶长、茎叶夹角和 白粉病性状定位, 共检测到 11 个相关 QTL。
贵州不同种源棕榈苗期生长性状比较及评价
贵州不同种源棕榈苗期生长性状比较及评价王婷婷;韦小丽;张兰【摘要】为给贵阳地区棕榈人工造林的优良种源选择提供参考,以贵州省内遵义、毕节等18个市(县)的棕榈种子为试验材料,采用大田育苗的方法进行培育.对不同种源2年生棕榈苗的地上部分和地下部分的生长指标进行观测,并采用聚类分析法对棕榈种源进行类别划分,对其与种源地地理位置的相关性进行分析,采用主成分分析法对18个种源棕榈苗的生长性状进行综合评价.结果表明:不同种源2年生棕榈苗的高、地径、总根长、主根长、总根表面积、总根体积、根尖数及总生物量等指标均有显著差异(P<0.05),各指标的变幅分别为28.78~51.09 cm、8.40~21.93 mm、37.41~85.02 cm、14.73~41.20 cm、127.13~362.82 cm2、5.52~19.55 cm3、902~1536、4.64~12.32 g.聚类分析结果表明,18个种源可分为2大类,其中罗甸、兴义、毕节为苗期生长性状表现较好的一类.相关性分析结果表明,原产地是低纬度和湿润地区的棕榈苗在试验区生长表现较好.主成分分析及综合得分排序的前3名分别为罗甸、兴义、毕节种源,与聚类分析结果一致.初步评价出罗甸、兴义和毕节种源为贵阳地区首选的棕榈种源.【期刊名称】《经济林研究》【年(卷),期】2019(037)003【总页数】7页(P146-152)【关键词】棕榈;种源;苗期;生长性状;评价【作者】王婷婷;韦小丽;张兰【作者单位】贵州大学林学院,贵州贵阳 550025;贵州大学林学院,贵州贵阳550025;贵阳蓬莱城乡发展有限公司,贵州贵阳 550014【正文语种】中文【中图分类】S682.36棕榈Trachycarpus fortunei (Hook.) H.Wendl.为棕榈科常绿乔木。
棕榈的应用价值广泛,其叶鞘纤维可制绳、棕垫、地毯,其叶可制蓑衣等,是较好的经济树种。
棕榈具有宜酸性土壤和石灰土、耐阴、喜湿润气候、浅根性等特性[1]。
基于SRAP、SSR标记的辣椒种质遗传多样性分析与核心种质构建
基于SRAP、SSR标记的辣椒种质遗传多样性分析与核心种质构建辣椒(Capsicum spp.)是茄科辣椒属蔬菜作物,其果实具有特有的辣味,是我国重要的调味品和主要蔬菜作物之一。
我国的辣椒栽培品种多属一年生辣椒(C.annuum),由于长期的人工选择压力和杂交品种的广泛推广,造成辣椒种质遗传背景渐趋狭窄。
因此,在搜集、保存辣椒种质资源基础上,开展辣椒种质遗传多样性分析、构建核心种质具有非常重要的意义。
本研究首先利用SRAP分子标记,分析了512份辣椒种质遗传多样性,构建了初级核心种质;然后运用SSR分子标记对初级核心种质进行再次压缩,构建了核心种质,具体内容和研究结果如下:(1)辣椒种质资源的SRAP分析。
在266对SRAP引物组合中筛选出21对多态性丰富的引物组合,利用这21对引物组合对512份辣椒种质进行了扩增,共扩增出685条谱带,平均每对引物扩增出32.62条,多态性条带23.10条,多态性比率达69.9%。
遗传多样性分析结果显示,A-2群体的有效等位基因数Ne、基因多样性指数H和Shannon信息指数I 均小于群体A-1和总群体A-3。
聚类分析表明,512份辣椒种质之间遗传相似系数变化范围在0.543~0.997之间,平均为0.841,在遗传相似系数0.64处,可区分辣椒属3个栽培种,在相似遗传系数为0.836处,一年生辣椒可分为5个类群。
(2)基于SRAP标记技术的辣椒初级核心种质的构建。
依据SRAP分子标记扩增的数据结果,应用逐步聚类方法,构建了包含288个样品的辣椒初级核心种质,保留了56.25%的初始样品。
对初级核心种质有效性检验表明,初级核心种质有效等位分子标记数为1.2262、Nei’s指数为0.1407、Shannon’s指数为0.2255,与初始样品没有显著差异,说明初级核心种质能较好地反映初始样品的遗传多样性。
(3)辣椒初级核心种质的SSR分析。
在153对SSR引物中筛选出65对多态性好的引物组合,对288份辣椒初级核心种质进行扩增,共扩出362个多态性片段,平均每对引物扩增出5.57个位点,多态性比率达100%;运用SSR标记对种间辣椒样本群进行遗传多样性分析,结果显示,B-2群体的基因多样性指数H和Shannon 信息指数分别为0.1287和0.2005,均小于群体B-1和总群体B-3,说明一年生辣椒种内的变异小于辣椒属种间的变异。
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基于SRAP分子标记的贵州省棕榈种质资源遗传多样性分析作者:毛跃雄陆跃堂胡志姣赵杨来源:《南方农业学报》2020年第01期摘要:【目的】研究貴州省棕榈资源的遗传多样性及遗传结构,揭示其分布格局与变异趋势,为贵州省棕榈种质资源保护及开发利用提供科学依据。
【方法】基于SRAP分子标记对贵州省7个农业气候区的26个棕榈种源328份材料进行扩增,经Qsep 100全自动核酸蛋白分析仪电泳分析后,利用Popgene 1.32和NTSYS-pc 2.1计算主要遗传多样性参数及进行种源聚类分析。
【结果】贵州省棕榈遗传多样性丰富,其种级水平上的多态性条带百分率(PPB)为97.31%,观测等位基因数(Na)为1.9731、有效等位基因数(Ne)为1.4717、Neiʼs基因多样度(H)为0.2689、Shannonʼs信息指数(I)为0.4212,但在种源水平上遗传多样性差异明显。
贵州省26个棕榈种源间的遗传分化系数(Gst)为0.3305,即种源内变异是贵州省棕榈资源遗传变异的主要来源。
UPGMA聚类分析结果显示,在阈值为0.91时,26个棕榈种源可分成四大类,其遗传分化与地理环境有一定相关性。
Mantel检验结果显示,贵州省棕榈资源遗传分化与其地理距离呈正相关(r=0.2651),但相关性不显著(P>0.05)。
贵州省7个农业气候区内的棕榈资源基因流(Nm)均大于贵州省棕榈种源Nm(1.0129),说明小区域内的棕榈资源基因交流频繁。
【结论】贵州省棕榈种质资源总体遗传多样性高,种源间分化较明显,选择育种潜力巨大。
为更好地开发利用棕榈资源,应结合其遗传结构特点,实行就地保护为主及建设种质资源库为补充的保护策略。
关键词:棕榈;SRAP分子标志;遗传多样性;遗传分化;空间分布格局;贵州省中图分类号: S792.91; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;文献标志码: A 文章编号:2095-1191(2020)01-0027-09Abstract:【Objective】The study on genetic diversity and genetic structure of Trachycarpus fortunei(Hook.) H. Wendl resources in Guizhou, revealed its distribution pattern and variation trend,and provided scientific basis for the protection, development and utilization of T. fortunei germplasm resources in Guizhou. 【Method】Based on SRAP molecular markers, 328 materials from 26 T. fortunei provenances in 7 agroclimatic regions of Guizhou were amplified. After electrophoresis analysis by Qsep 100 automatic nucleic acid protein analyzer, Popgene 1.32 and NTSYS-pc 2.1 were used to calculate the main genetic diversity parameters and perform the provenances clustering analysis. 【Result】The genetic diversity of T. fortunei in Guizhou was rich,the percentage of polymorphic bands(PPB) was 97.31% at species level, the observed alleles (Na) was 1.9731,; effective alleles(Ne) was 1.4717,Nei’s gene diversi ty index(H) was 0.2689,and Shannon’s information index(I) was 0.4212, but there were significant differences in genetic diversity at the provenance level. The genetic diversity(Dst) among the 26 T. fortunei provenances in Guizhou was 0.3305, which revealed that intra-provenance variation was the main source of genetic variation of T. fortunei resources in Guizhou. The UPGMA cluster analysis showed that the 26 T. fortunei provenances could be divided into four categories at the threshold of 0.91, and their genetic differentiation was related to the geographical environment. The Mantel test showed that there was a positive correlation between genetic differentiation and geographical distance(r=0.2651) in Guizhou,but the correlation was not significant(P>0.05). The gene flow (Nm) of T. fortunei resources in seven agroclimatic regions of Guizhou was larger than that of T. fortunei species in Guizhou(1.0129), indicated that gene exchange of T. fortunei resources was frequent in small areas. 【Conclusion】 T. fortunei germplasm resources of Guizhou have high genetic diversity, large differentiation between provenances, and huge potential of selection andbreeding. In order to exploit and utilize T. fortunei resources better, combi-ning with its genetic structure characteristics, the conservation strategy is put forward, which is mainly in situ conservation and supplemented by the construction of germplasm resource bank.Key words: Trachycarpus fortunei(Hook.) H. Wendl;SRAP molecular marker; genetic diversity; genetic differentia-tion; spatial distribution pattern; GuizhouFoundation item: Guizhou Major Scientific and Technological Project (Qiankehezhongdazhuanxiang〔2014〕6024-1)0 引言【研究意义】棕榈[Trachycarpus fortunei(Hook.) H. Wendl]是贵州省的常见乡土树种,隶属于棕榈科(Palmae)贝叶棕亚科(Coryphoideae)棕榈属(Trachycarpus),全树均可开发利用,其产品多元、用途广泛(舒迎澜,2004;董云发,2005;卫强和王燕红,2016),且具有浅根性及宜石灰土等特性,是改善石漠化生态环境的优良经济树种(但新球等,2003)。
棕榈在贵州省分布广泛,但天然林破坏严重,居群呈零星分布,多为野生或半野生状态,利用效率不高。
采用分子标记技术研究物种遗传多样性和遗传结构特征,可为其种质资源保护、遗传改良及开发利用提供科学依据(凌士鹏等,2018;冯建灿等,2019),因此,加强贵州省棕榈种质资源遗传多样性研究,对促进贵州省棕榈产业发展及石漠化生态修复树种选择均具有重要意义。
【前人研究进展】至今,已有专家学者分别使用RAPD、AFLP、SRAP、ISSR和SSR等分子标记在多种棕榈科植物上开展了种质资源遗传多样性分析、遗传图谱构建及系统进化关系等相关研究工作(Ohtani et al.,2009;周丽霞和曹红星,2018),包括油棕(Hayati et al.,2004;丁灿等,2011;肖勇等,2013)、山棕(贾春媛,2009)、董棕(赵春磊,2009)、槟榔(任军方,2010)、椰子(Rajesh et al.,2015;Geethanjali et al.,2018)、蒲葵(Kondo et al.,2017)等,但针对棕榈遗传多样性的研究较少。
杨华(2005)利用RAPD分子标记与表型测定对黄藤和单叶省藤天然种群进行遗传多样性分析,结果证实种群内变异是其遗传变异的主要原因。
安琪等(2010)采用AFLP分子标记对云南省境内的11种棕榈藤亲缘关系进行分析,结果显示云南省棕榈藤遗传多样性丰富,各品种间的遗传分化程度较高,且发现原始省藤亚属和省藤亚属两个亚属物种互相交叉渗透。
Rajesh等(2015)采用SCoT分子标记评估全球23个椰子种质遗传多样性,进一步证实了SCoT分子标记用于物种遗传多样性分析的可行性。
Kondo等(2017)利用20对SSR分子标记对日本的6个蒲葵群体进行遗传多样性分析,其结果为揭示蒲葵偏远种群的起源提供了依据。