中科大分子动力学模拟课程
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中科大分子动力学模拟课程
1 常见计算模拟方法浅析：MD、DFT、MC
2 分子模拟的发展历史、分子模拟的优势和局限
3 分子动力学基本原理：分子运动论，分子动力学的基本假设和理论框架
4 分子动力学关键技术：分子动力学的主要数值算法，时间积分方法及选择它们的理由
5 分子模拟条件和环境的控制：系综的选择，边界/截断/长程作用/系综/控温控压等一系列基本概念介绍
6 分子动力学模拟流程详解：建模> 能量最小化> 模拟> 结果分析
7 各种力场（经验势函数）详解：做模拟时如何针对自己的计算体系选择合适的势函数
8 分子模拟加速方法和高性能计算基础：周期性边界条件，并行计算，GPU加速。