中山大学分子生物学提纲
中山大学生物
04海洋活性产物的新药研究与开发
05海洋生物病原生物学与病害控制
06海水养殖鱼类病害防治技术
07海洋动物免疫与病原分子生物学
08海洋生物资源与环境
071001植物学
01植物系统学与资源学
方向(01、02、03、04、05、06、07、08、09、10、
11、12、13、14、15、16)
(3)654生物化学(一)
(4)867细胞生物学
复试专业课:
F3314动物学(含昆虫学,动物生态学)
02昆虫化学生态学
03昆虫免疫及发育
04动物分子生态与环境生物学
05昆虫分类与系统进化
06环境毒理学与污染物归宿
07动物生态与环境保护
08寄生生物分子生物学
09动物遗传资源及功能基因组
10动物分子营养与免疫
F3310遗传学
02基因工程和功能基因组
03微生物代谢与分子遗传
04分子遗传与基因工程
05数量遗传学
06非编码RNA与疾病
07基因组学与人类遗传学
08分子遗传
09人类与动物细胞的表观遗传学
10病毒诱导突变及基因组调控网络机制
071009细胞生物学
01癌症机理
方向(01、02、03、04、05、06、07、08)
11昆虫资源研究与利用
12昆虫检疫与鉴定
中山大学生物化学考研历年问答题
中山大学生物化学考研历年问答题
生物化学是生命科学领域的一门重要学科,也是许多高校生物学、医学和农学等专业硕士研究生入学考试的必考科目。中山大学作为中国著名的高等学府之一,其生物化学专业在国内享有很高的声誉。本文将整理并分析中山大学生物化学考研历年问答题的考点和难点,帮助考生更好地应对考试。
一、蛋白质的结构与功能
蛋白质是生物体内最重要的分子之一,具有多种生物学功能。在中山大学生物化学考研中,对蛋白质的结构与功能的考查是一个重点。考生需要掌握蛋白质的基本结构、一级结构、二级结构、三级结构和四级结构的概念和特点,同时理解蛋白质功能与其结构的关系。
二、DNA的复制、转录与翻译
DNA的复制、转录和翻译是细胞内基因表达的关键过程。考生需要掌握这些过程的定义、反应过程、调节机制以及与蛋白质合成的。这些知识点通常会以填空题、选择题和问答题的形式出现,需要考生对基本概念和过程有深入的理解。
三、糖类代谢
糖类是生物体内主要的能源物质,其代谢过程包括糖酵解、柠檬酸循环和电子传递系统等。考生需要掌握这些过程的反应机理、调节方式和在细胞内的定位,同时理解它们在能量代谢和物质代谢中的作用。
四、脂类代谢
脂类是生物体内重要的能源物质和信号分子。考生需要掌握脂类代谢的基本过程,如脂肪的合成与分解、甘油磷脂的合成与降解等,同时理解脂类代谢与能量代谢之间的关系。
五、氨基酸代谢
氨基酸是生物体内重要的营养物质和代谢中间产物。考生需要掌握氨基酸的合成与分解、尿素循环等基本过程,同时理解氨基酸代谢与蛋白质代谢之间的关系。
六、分子生物学技术
生物考研经验篇-中山大学生命科学院
【转载】生物考研经验篇-中山大学生命科学院
热3xianke9092009-04-22 19:30
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复试结束,尘埃落定,休息了这么久,终于想写点东西记录自己这两年的考研历程所以现在我写下这篇文章,作为以后的师妹师弟一个指明灯,让你们少走弯路!
对于政治和英语这两门公共课我想对不管考哪个学校的人都是一样的,政治是绝对不需要上辅导班,最后背一下启航,领航压的大题,基本就差不多了,而这些资料到了考试前20天,网上一大堆。完全没有必要参加辅导班,如果你嫌钱和时间精力有多,那就另当别论。英语可以早点开始复习,看看英语方面的报刊,背背单词,作文背背模板什么的。重点还是专业课!
生物化学:中大的生物化学考的主要是王境岩版的,但是还有一本英文的参考教材《基础生物化学》(Fundamentals Of Biochemistry),参考习题为清华大学王希成主编的习题集,英文的基本不用看,考研要利用好一切时间,做最有效率的事,所以英文教材仍一边。王境岩的书简直就是百科全书,什么知识都有,很厚条理也不太好,许多知识点都是零散的,复习起来有一定的难度,我当时复习时,第一遍先大概地把书翻一遍,知道它大概讲了什么,有一个基本的印象,能够把知识点连起来,第二遍看的时候就要适当做些笔记了,一开始笔记簿要记得太详细,记下一些大概的框架,每一章能形成一个体系,看见这个体系就能回忆起这章的基本内容,一些重复出现的内容,可以将它们合并起来,第三遍时再在这个框架体系上添加一些比较零碎的知识点,特别是一些比较难记住的,重大每年的题目都有一些考得特别细,特别碎,所以千万不要忽略掉一些小的知识点,如果你有时间看第四遍,(当时我是没有时间了)这时候你该整理一些大题了,虽然重大的题目每年都有比较活的,但基本的知识点都是这些,通过不断的做习题,既可以巩固看过的知识点,也可以了解书中哪些才是重点,也便于自己总结,虽然生化中有好多知识点是关于细胞生物学,但也别小看这些,譬如今年生化中就出了一道细胞方面的题“简要说明G蛋白在信号转导中的作用”,如果细胞复习的好,这种问题应该难不倒!好多大题出的都比较宽泛,(具体题目不太记得了,考过就忘得差不多了,)所以对于生化你一定要有一个整体的脉络,知识点不能是零碎的,拿到一道大题,你就要有话说,而且是最好能把相关的都一并说了!现在说说另一本书《基础生物化学》,这也是上下两册,这一套书相对于王境岩的来说更有条例一些,有些知识点讲的也比较细,翻开历年真题,发现在王境岩的那本书上找不到的边边角角的小知识点在这本书上都能找到,当时因为时间不够,我只是大概看了下,就看了后面的小结和书中的黑字体,考试时发现还是有点用的,填空题大概有三道,判断题也有几道都是那本书上的,因为看过有点印象所以就能填出来!但是也要注意主次,还是要以王境岩的那本为主,有时间再看那两本《基础生物化学》。还有几个专题每年都考,大家要自己整理,如真核生物和原核生物的比较(包括基因组、DNA复制、转录、蛋白质合成等等方面的),还有就是中大几年的真题里重复率都是有一点的,所以要利用好真题,总结总结,有时候他也会将以前的非大题(填空,判断等)转化为大题再来考!另外分子生物学和基因工程应该找两本薄一点的看看,基因工程考到的几率更大一点;实验方面,从真题发散开去,在网上了解一下新一点的实验技术,自己主动思考一下实验技巧与漏洞等等,但生化和基因工程涉及到的实验一定要发散开去,主要的原理与易犯错误要掌握!
分子生物学与基因打靶实验讲义
分子生物学与基因打靶实验技术培训讲义
中山大学药学院
微生物与生化制药实验室
2005-05-30
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广州润兴生物科技有限公司
广州经济技术开发区宝石路11号留学人员创业园
E-mail :zequn@263
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单抗识别
T 细胞
血涂片
1.分子生物学基本实验技术
1.1酚抽提法制备哺乳动物基因组DNA及其定量
1.1.1从哺乳动物的细胞和组织中分离DNA的四种常用方法:
(1) Bin 和 Siafford(1976)根据Gross-Bellard等(l973)所提出的原始
方案改进而成,利用蛋白酶K、SDS和酚,所获DNA的大小(100-150kb)适用于在λ噬菌体载体上构建基因组DNA文库。
(2) 包括用蛋白酶K消化、用高浓度甲酰胺使DNA-蛋白质复合物解离,以及
通过火棉胶袋透析除去残存的蛋白酶K等步骤(Kupiec等,1987)。该方法较第一种方法费时,但省去了有机溶剂抽提的费力步骤,由于DNA未经振摇,不通过移液管,也不经过乙醇沉淀,故其分子量非常大,不过最终获得的DNA通常浓度颇低(约10μg/ml)。
中山大学化学生物学教学大纲
中山大学化学生物学教学大纲
一、课程介绍
化学生物学是一门研究生物体内化学成分、生物化学反应和细胞分子生物学等内容的交叉学科。本课程旨在为学生提供化学生物学领域的基础知识和实践操作技能,以便他们在相关领域的研究和应用中胜任。
二、教学目标
1.了解化学生物学的基本概念、原理和研究方法;
2.掌握常见的细胞分子生物学实验技术和仪器操作;
3.培养学生的科学研究思维和解决问题的能力;
4.提高学生的学术写作和报告演讲能力。
三、教学内容
1.化学生物学的基本概念和研究领域
- 化学生物学的定义和发展历程
- 生物大分子的结构和功能
- 酶的结构和反应机理
- 生物膜的结构和功能
2.细胞分子生物学实验技术和仪器操作- DNA/RNA提取和纯化技术
- PCR技术和基因克隆
- 蛋白质表达和纯化技术
- 生物大分子的电泳和质谱分析技术3.细胞信号传导和代谢调控机制
- 细胞膜上的受体和信号转导通路
- 细胞核内的转录调控机制
- 细胞中的代谢途径和调控机制
- 细胞凋亡和细胞周期的调控机制
4.化学生物学在生物医药领域的应用- 药物设计和药物靶点研究
中山大学药学院本科
中山大学药学院本科
《生物学基础与细胞生物学》教学大纲
授课教师:钟翎教授,莫德林博士(生科院讲师)
2010-9
一、教学目的
本课程分为生物学基础和医学细胞生物学两大部分。
生物学基础着重介绍动物学内容,主要包括动物多样性、动物的结构与功能和发育生物学的基本理论和基础知识;医学细胞生物学以细胞的显微结构和亚显微结构为线索,使学生系统掌握细胞质膜和细胞表面、细胞基质和内膜系统、线粒体、细胞骨架、细胞核与染色体、细胞增殖与细胞周期、细胞分化、细胞衰老与死亡等方面的基本知识以及各个结构功能与医学的关系。
本课程是为药学院本科生二年级开设的专业基础必修课程。它主要使学生从宏观和微观的不同层次上了解动物的分布、结构及其发育过程;在细胞、细胞超微结构和分子不同水平上,认识细胞结构、功能及各种生命活动和生命现象。
动物特别是哺乳动物作为医药领域研究的材料和对象,了解其结构及其发育过程具有重要的意义;细胞生物学以细胞为研究对象,经历了从显微水平到亚显微水平和分子水平的发展过程,成为今天在分子层次上研究细胞精细结构和生命活动规律的学科,是当代生命科学中发展迅速和极其活跃的学科,其研究的新知识、新技术不断向医药学领域渗透,已成为认识疾病发病机制、获取疾病防治措施的基础和支柱学科。
通过对本课程教学,使学生掌握动物学和医学细胞生物学的基本理论,了解其最新研究成果和发展状态,以激发学生对生命科学的兴趣,为将来从事医药相关的研究工作打下基础,以利今后的发展。
二、教学方法:
课堂授课
三、学时:
54学时(48节课,3节课/周,共15周教学)
分子生物学讲义 中山大学
重组与转座(recombination and transposition)
1. 重组的类型
⏹同源重组(homologous recombination)
⏹位点专一重组(site-specific recombination)
⏹转座(transposition),又称异常重组(illegitimate recombination
2. 同源重组
(1)同源重组的形式
⏹常发生在同源染色体之间(分子间重组),也可发生在同一DNA分子内(分子内重组)
2)Holliday 模型
⏹说明同源重组的一个经典模型,基于重组过程中有十字形的中间产物
(3)RecBCD重组途径
⏹存于E. coli中,需要RecBCD蛋白(RecBCD protein,recB、recC、recD基因的产物)的参与
⏹RecA
38 kD 的蛋白质,具多种功能,其中一种就是在重组中促进同源DNA单链的交换(主要是一单链与一双链中的同源单链交换);交换过程需A TP
⏹RecBCD
一种具多功能的酶
依赖于DNA的A TPase(水解A TP,为DNA的解螺旋提供能量)
DNA nuclease,可作用于单链或双链DNA,切割χ位点(GCTGGTGG)χ(chi): crossover hotspot instigator
DNA helicase活性
RecBCD的切点与底物(序列)有关,可在χ位点3‘端4 ~ 6 nt
⏹RuvA和RuvB
两者均具DNA helicase活性(RuvB还有A TPase活性),且两者一起才能与DNA很好地结合(RuvA先结合,然后RuvB 才能结合)
分子生物学 教学大纲
分子生物学教学大纲
一、引言
分子生物学是现代生物学的重要分支之一,通过研究生物体内分
子水平的结构、功能和相互作用,揭示了生命现象的本质和机制。本
教学大纲旨在为分子生物学课程的教学提供指导,明确课程目标和内容,培养学生的综合能力和专业素养。
二、课程目标
1.了解分子生物学的基本理论和方法,培养分析和解决生物学问
题的能力;
2.熟悉生物分子的结构与功能,掌握基本的实验技术和仪器操作;
3.培养学生的科学研究能力,培养科学精神和批判思维;
4.了解分子生物学在医学、农业、生物工程等领域的应用,培养
学生的应用能力和创新意识。
三、教学内容
1.基本概念和核心理论
a.生命分子的组织和功能
b.核酸的结构与功能
c.蛋白质的结构与功能
d.酶的功能与调控
e.细胞信号传导与调控机制
2.分子遗传学基础
a.基因组学与基因结构
b.DNA复制与遗传信息的传递
c.RNA的合成与转录调控
d.蛋白质的合成与翻译调控
e.基因调控与表观遗传学
3.分子生物学实验技术
a.核酸的提取与纯化技术
b.PCR技术及其应用
c.基因克隆与重组DNA技术
d.蛋白质的表达与纯化技术
e.转基因技术及其伦理问题
4.应用前沿与拓展
a.基因工程与基因治疗
b.分子诊断与药物研发
c.转基因农业与遗传改良
d.分子生物学与肿瘤学
e.分子生物学与神经科学
四、教学方法
1.理论讲授:结合教材和相关文献,讲授细胞生物学的基本概念和分子生物学的原理;
2.实验教学:通过实验操作,培养学生的实验技能和分析能力;
3.案例研究:引导学生阅读和分析生物学研究的经典案例,激发学生的兴趣和探索精神;
中山大学662生物化学(一)真题答案笔记重难点学长学姐考研复习资料
中山大学662生物化学(一)真题答案笔记重难点学长学姐考研复习资料
一、详情
《中山大学考研662生物化学(一)复习全析【含真题与答案,共四册】》
根据
往年中山大学662生物化学(一)的官方参考书目:
《生物化学》(王镜岩上册)
《生物化学》(王镜岩下册)
同时,2020年中山大学662生物化学(一)的考试范围为:
662生物化学(一)
重要生物分子如糖、脂质、蛋白质、酶、核酸、维生素、激素等的结构与功能;生物膜结构与物质运输的机理;物质代谢及其调节;生物能学与生物氧化;分子生物学基础如DNA复制、转录和翻译,细胞代谢与基因表达调控等;现代生物化学与分子生物学研究基本技术与方法。
该书通过提供院系专业相关考研内部信息,系统梳理核心考点,总结分析各章节内的重难点知识点往年考察情况,详细分析各章中的重点内容与难点内容,且通过考题预测的形式巩固上述知识点,并对历年真题进行透彻的解析,使考生复习更有针对性,从而提高复习效率。
二、适用范围
适用院系:
生命科学学院:【海洋科学、生物学(植物学、动物学、生理学、水生生物学、微生物学、遗传学、发育生物学、细胞生物学、生物化学与分子生物学、生物物理学、生物信息学)、生态学、植物保护、生物工程(专业学位)】
生态学院:【生态学】
农学院:【生态学、植物保护】
适用科目:
662生物化学(一)
具体内容详情可以移步逸仙中大考研网--考研资料一栏,点击对应专业查看
这里提醒大家,在复习备考的时候不要只顾闷头苦学,还要多多分析自己的专业情况,比如分数线、报录比,什么时候报名,什么时候现场确认都要重视起来,这些信息推荐以后查询逸仙中大考研网,都有总结好,非常节省搜集整理信息的时间,建议大家加入收藏夹,经常访问查阅。有问题也可以咨询老师和学姐,人都挺好的,他们做考研比较久了,资料和专业课的班也是信得过的,我有的同学是经过他们的培训的。
生物化学与分子生物学专业硕博连读研究生培养方案-中山大学研究生院
生物化学与分子生物学专业硕博连读研究生培养方案
一、培养目的
本专业培养德、智、体全面发展的生物化学与分子生物学高级专门人才,要求学生坚持四项基本原则,热爱祖国,具有良好的道德品质,具有团结合作,勇于追求真理和献身于科学研究及教育的精神。掌握本学科坚实宽厚的基础理论和系统深入的专门知识,熟悉学科的发展趋势,并需掌握一定的相关学科的知识。熟练地掌握科学研究的基本技能和方法,具有独立从事科学研究工作的能力,在有关领域中做出创造性的成果。能熟练地运用至少一门外国语。
二、研究方向
基因表达与调控;基因的结构、功能与进化;医药生化及分子生物学;分子生物学(含基因工程);分子进化;癌变的分子机理;生物信息学;功能基因组学及其相关技术;RNA 基因与调控;分子免疫学;肿瘤治疗的分子基础;微生物分子遗传学;微生物分子生态;海洋分子生物学;植物分子生物学;药物发现及分子生物学;蛋白质组学与免疫学;鱼类分子免疫学;免疫细胞信号传导。
三、学习年限
按中山大学《学位与研究生教育工作手册》及中大研院[2003]3号《中山大学硕博连读研究生培养工作试行办法》的规定要求。硕士学制三年。
四、课程设置
五、考核
按中山大学《学位与研究生教育工作手册》及中大研院[2003]3号《中山大学硕博连读
研究生培养工作试行办法》的规定要求。
六、学位论文的工作及发表论文的要求
按中山大学《学位与研究生教育工作手册》及中大研院[2003]3号《中山大学硕博连读研究生培养工作试行办法》的规定执行。本专业特别要求必须在SCI源杂志发表(含接受)一篇研究论文或在中文一级学报发表(含接受)二篇以上研究论文方可授予博士学位。
中山大学-分子生物学ppt及考研真题
中山大学-分子生物学ppt及考研真题
分子生物学(由ppt整理)
第二章、染色质、染色体、基因和基因组1
一、染色质, 染色体结构组成
主要成分是DNA和蛋白质,它们之间的不同,不过是同一物质在间期和分裂期的不同形态表现而已。
→染色质出现于间期,在光镜下呈颗粒状,不均匀地分布于细胞核中,比较集中于核膜的内表面。
染色体出现于分裂期中, 染色体是由染色质浓集而成的,内部为紧密状态,呈高度螺旋卷曲的结构。
核小体的组成
2. 螺线管(30nm)
3、侧环(Loop)
染色体
原核染色体:单一环型双链DNA分子
真核染色体:线型双链DNA分子及结合蛋白形成的遗传物质单位
染色体结构相关概念
染色体单体,短臂,长臂,着丝粒,主缢痕,副缢痕,随体
端粒DNA主要功能
端粒酶(telomerase )
真核细胞染色体端粒的重复序列不是染色体DNA复制时连续合成的,而是由端粒酶合成后添加到染色体末端。
端粒酶是一种核糖核蛋白复合物,具有逆转录酶的性质,以物种专一的内在RNA为模板,把合成的DNA添加到染色体的3’端。
染色体组型
也叫核型,是指某一生物体细胞中全部染色体的数目、大小形态特征。
→不同生物有不同数目、不同形态和不同大小的染色体。
→按它们各自的一个体细胞中的全部染色体的数目、大小及着丝粒位置进行配对、排列而成的图像,就是它们各自的染色
二、染色质和染色体的化学成分及组成
主要化学成份:
1,DNA
2.组蛋白
含量最高的一种染色体蛋白质,带大量精氨酸和组氨酸(碱性氨基酸)分为,有H1、H2A、H2B、H3、H4五种
组蛋白可以通过磷酸化、乙酰基化、甲基化修饰,降低正电荷含量而改变功能
生物化学及分子生物学(人卫第九版)-12DNA合成word版本
原核生物的DNA聚合酶
DNA-pol Ⅰ
分子量(kD) 组成
分子数/细胞 5’3’核酸外切酶活性
基因突变后的致死性
109 单肽链
400 有 可能
DNA-pol Ⅱ
DNA-pol Ⅲ
120 ? ? 无 不可能
250 多亚基不对称二聚体
20 无 可能
DNA聚合酶Ⅲ全酶结构:
全酶结构包括:
•2个核心酶 •1个-复合物(、、 、、、 6种亚 基) •1对-亚基(可滑动 的DNA夹子)
高保真度DNA聚合酶利用严格的碱基配对原则是保证复 制保真性的机制之一;体内复制叉的复杂结构提高了复制 的准确性;DNA聚合酶的核酸外切酶活性和校读功能以 及复制后修复系统对错配加以纠正
第二节
DNA复制的酶学和拓扑学
Enzymology and topology of DNA replication
5´ A G C T T C A G G A T A
3´
? | | | | | | | | | | |
3´ T C G A A G T C C T A G C G A C 5´
➢ 3’5’外切酶活性: 能辨认错配的碱基对,并将其水解
➢ 5’3’外切酶活性: 能切除突变的 DNA片段
(一)原核生物有3种DNA聚合酶 ➢ DNA-pol Ⅰ ➢ DNA-pol Ⅱ ➢ DNA-pol Ⅲ
中山大学分子生物学提纲
考试范围及题型
考试范围包括所讲过的内容
考试题有选择题(单选)、是非题和问答题,其中选择题和是非题有50%左右以英语出题
课程复习:原核生物与真核生物两大体系
1.原核基因组与真核基因组(prokaryotic genomes and eukaryotic genomes)
1.1.大小(size):基因组大小(genome size)一般以单倍体基因组的核酸量来衡量,单位有pg、Dalton、bp 或kb 、Mb等.1 pg = 6.02 x 1011 Daltons = 9.8 x 108 bp. 原核生物的genome size一般都比较小,且变化范围也不大(最大/最小约为20)。由于原核生物基因组中的非基因DNA(non-genic DNA)的含量较少,因此它们的基因组大小与其所含的基因数目是相对应的.真核生物的genome size一般要比原核生物的大很多,且变化范围也很大(最大/最小可达8万)
1.2.基因结构(gene structure: continuous coding sequences, split genes)
类核基因组--环状,较小;通常由单拷贝或低拷贝(low-copy)的DNA序列组成;基因排列紧密,较少非编码序列(streamlined)
核基因组--多线状;大小一般要比类核基因组大好几个数量级,且变化范围很大;有大量的非编码序列(重复序列、内含子等)
1.3.非编码序列(non-coding sequences: repeated sequences, introns)
中大生物科学类大一课程表
中大生物科学类大一课程表
摘要:
一、课程概述
二、课程设置
1.生物学基础课程
2.专业核心课程
3.实验操作课程
4.通识教育课程
三、课程安排
1.第一学期
2.第二学期
3.第三学期
4.第四学期
四、课程特点
正文:
正文
中山大学生物科学类大一课程旨在培养学生扎实的生物学基础知识,提高学生的科学素养和创新能力。课程涵盖生物科学、生物技术、生物工程等多个领域,既有理论教学,也有实验操作,使学生在掌握理论知识的同时,提高实际操作能力。
一、课程概述
中山大学生物科学类大一课程旨在培养学生扎实的生物学基础知识,提高学生的科学素养和创新能力。课程涵盖生物科学、生物技术、生物工程等多个领域,既有理论教学,也有实验操作,使学生在掌握理论知识的同时,提高实际操作能力。
二、课程设置
1.生物学基础课程
- 普通生物学:介绍生物科学的基本概念、原理和分类系统,为学习其他生物学课程奠定基础。
- 生物化学:研究生物大分子的结构、功能和代谢,为生物科学和生物技术领域提供理论支持。
- 分子生物学:探讨基因、蛋白质等生物大分子的结构、功能和相互作用,为遗传工程和基因疗法等生物技术发展提供理论基础。
- 遗传学:研究生物遗传规律和基因传递、突变、表达等过程,为遗传改良和基因诊断等应用提供理论依据。
2.专业核心课程
- 细胞生物学:研究细胞结构、功能和生命活动规律,为细胞工程和细胞疗法等生物技术领域提供理论支持。
- 生态学:探讨生物与环境相互关系及其规律,为生态环境保护、资源利用和可持续发展提供理论基础。
- 进化生物学:研究生物进化过程和机制,为生物多样性的形成和保护提供理论依据。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
考试范围及题型
考试范围包括所讲过的内容
考试题有选择题(单选)、是非题和问答题,其中选择题和是非题有50%左右以英语出题
课程复习:原核生物与真核生物两大体系
1. 原核基因组与真核基因组(prokaryotic genomes and eukaryotic
genomes)
1.1. 大小(size):基因组大小(genome size)一般以单倍体基因组的核酸量来衡量,单位有pg、Dalton、bp 或kb 、Mb等.1 pg = 6.02 x 1011 Daltons = 9.8 x 108 bp. 原核生物的genome size一般都比较小,且变化范围也不大(最大/最小约为20)。由于原核生物基因组中的非基因
DNA(non-genic DNA)的含量较少,因此它们的基因组大小与其所含的基因数目是相对应的.真核生物的genome size一般要比原核生物的大很多,且变化范围也很大(最大/最小可达8万)
1.2. 基因结构(gene structure: continuous coding sequences, split genes)类核基因组--环状,较小;通常由单拷贝或低拷贝(low-copy)的DNA序列组成;基因排列紧密,较少非编码序列(streamlined)
核基因组--多线状;大小一般要比类核基因组大好几个数量级,且变化范围很大;有大量的非编码序列(重复序列、内含子等)
1.3. 非编码序列(non-coding sequences: repeated sequences, introns)
局部分布的重复序列(串联式的高度重复序列)
散布的重复序列(SINES, LINES)
内含子(intron)
I 类
II 类
III 类
核mRNA内含子(nuclear mRNA intron)即剪接体内含子(spliceosomal intron)
核tRNA内含子(nuclear tRNA intron)
古细菌内含子(archaebacterial intron)
1.4. 细胞器基因组(organelle genomes: mitochondrial genomes, chloroplast genomes)
线粒体基因组--在不同类型的生物(多细胞动物、高等植物、原生动物、藻类、真菌)中变化很大
多细胞动物:细小、致密,没有或很少非编码序列
高等植物:复杂、不均一,比动物的大得多
原生动物、藻类、真菌:或偏向于动物型,或偏向于植物型,但又有其各自的独特之处
叶绿体基因组--比较均一,85 ~ 292 kb(大部分都在120 ~ 160 kb之内);特例:伞藻属(Acetabularia),2000 kb
2. 转录(transcription)
2.1. RNA聚合酶(RNA polymerase)
原核生物:1种,全酶(holoenzyme)由核心酶(2α, β, β’)与σ亚基组成,σ亚基的作用是a)降低酶与非特异DNA的亲和力; b)提升酶与启动子的亲和力。
真核生物:3种,由两个较大的亚基和多个较小的亚基组成Polymerase I: large rRNA precursor, 位于核仁
Polymerase II: mRNA precursors, snRNAs, 位于核质。核心亚基(core subunits)
Rpb1, Rpb2, Rpb3,对聚合酶的活性必不可少,分别与原核RNA聚合酶的β’, β和α亚基同源,且功能也基本相同.
Polymerase III: tRNA precursors, 5S rRNA precursor, U6, etc. 位于核质
2.2. 顺式作用元件与反式作用因子(cis-acting elements and trans-
acting factors)
2.2.1. 顺式作用元件
启动子(promoters)
cis- 顺式、同一分子
trans- 反式、不同分子
in vivo 体内、细胞内
in vitro 体外、无细胞体系
in situ 原位
in silico 在电脑中
聚合酶的结合位点(binding site),一般位于转录起始位点上游。RNA聚合酶与启动子的结合,并且从Closed promoter complexOpen promoter complex,转录才能开始.
结构:
原核启动子:Consensus sequency: -10 box (Pribnow box),负责解链; -35 box),用于识别。
真核启动子:I类, II类,III类
增强子:较多在真核生物中存在
转录因子(transcription factors)为反式作用因子,真核基因的转录需反式作用因子
通用转录因子: I类, II类,III类
基因特异转录因子(激活子)
2.3. 多顺反子转录与单顺反子转录
原核生物的转录方式:操纵子(operons)介导的多顺反子转录操纵子--一组相邻的协同控制的基因。
经典模型:乳糖操纵子(the lac operon)
lacZ: 编码β-半乳糖苷酶
lacY: 编码半乳糖苷透过酶
lacA: 编码半乳糖苷乙酰基转移酶
lacI: 调节基因(regulatory gene)
Operator: 操纵区
Repressor: 阻遏子(阻遏物)
Inducer: 诱导物(异构乳糖,allolactose)
机制:lacZ、Y、A基因的转录是由lacI基因指令合成的阻遏蛋白所
控制。lacI一般和结构基因相毗连,但它本身具有自己的启动子
和终止子,成为独立的转录单位。
弱化作用的调控:色氨酸操纵子(the trp operon)
单顺反子转录是真核生物的主要转录方式
2.4. 转录起始、延伸及终止
起始所需条件
原核生物:RNA聚合酶全酶,启动子
真核生物:RNA聚合酶,启动子,转录因子,染色质的合适结构(启动子区无核小体)
起始步骤:
形成闭合启动子复合物
转化为开放启动子复合物
Polymerizing the first few nucleotides (up to 10) while the polymerase remain at the promoter
Promoter clearance
Dissociation of σ factor ?
延伸
原核生物:RNA聚合酶核心酶(β亚基参与转录出的RNA的磷酸二酯键