cox回归分析
COX回归分析解析实用
表2 鼻腔淋巴瘤患者随访资料
编 整理
项目登记
观察记录
号 性别 年龄 分期 鼻血 放疗 化疗 开始日 终止日 结局
生
存天数
1
1
45 2
2
0
1 88-1-17 89-8-17 1
578
2
0
36 2
2
0
1 88-1-21 92-4-17 1
1549
3
0
45 2
0
1
0 88-2-2 90-12-31 0
4717
N 15 1 16 0 0
0
0
Total
16
a. Dependent Variable: DAY
P erc en t 93.8% 6.3% 100.0% .0% .0%
.0%
.0% 100.0%
第35页/共46页
Omnibus Tests of Model Coefficientsa,b
-2 Log
-1.589
Variables in the Equation
SE .421 .530
W ald 6.630 6.799
df 1 1
.695
5.221
1
Sig. .010 .009
.022
Exp(B) 2.957 3.978
.204
cox回归模型的基本形式
cox回归模型的基本形式
1.引言
1.1 概述
Cox回归模型是一种常用的生存分析方法,用于研究个体的生存时间与其它因素之间的关系。生存分析是一种统计学方法,用于分析个体在某个特定时刻或时间段内的生存情况,包括生存时间的长度、生存率以及与其它因素的关联等。
Cox回归模型的基本思想是通过描述危险函数和危险比来研究个体的生存时间。危险函数描述了在给定时间点个体发生事件(比如死亡)的概率,而危险比则代表了两个不同个体之间的危险程度比较。通过对危险函数和危险比的建模分析,我们可以得到不同变量对生存时间的影响程度,并且进行生存概率的预测。
Cox回归模型在生物医学、社会科学、经济学等领域中被广泛应用。在医学研究中,Cox回归模型可以帮助研究者探究特定疾病的生存率以及对生存时间的影响因素,从而为临床治疗和预后评估提供重要的参考依据。在社会科学领域,Cox回归模型可以用来研究人们的生活方式、社会经济地位等因素对生存时间的影响,从而对社会政策进行科学制定提供支持。
本文首先介绍Cox回归模型的定义和背景,然后详细探讨Cox回归模型的基本形式,包括单变量Cox回归模型和多变量Cox回归模型。最后,我们将总结Cox回归模型的优势和应用,希望读者对该模型有更全面的了解,并且能够应用于实际的研究工作中。
1.2 文章结构
本文将按照以下结构来讨论Cox回归模型的基本形式。
首先,在引言部分1.1中,我们将概述Cox回归模型的背景和定义,并阐明研究的目的。
接下来,在正文部分2中,我们将详细介绍Cox回归模型的基本形式。
2.1节将讨论Cox回归模型的定义和背景,以便读者对其有一个全面的了解。然后,在2.2节中,我们将重点讨论Cox回归模型的基本形式。在这一节中,我们将先介绍单变量Cox回归模型的基本形式(2.2.1小节),然后探讨多变量Cox回归模型的基本形式(2.2.2小节)。通过这些讨论,读者将能够清楚地了解Cox回归模型的具体数学表达和建模方法。
cox回归的交互效应的r代码
cox回归是一种经常用于生存分析的统计学方法,可以用来研究特定
变量对生存时间的影响。在cox回归中,研究者经常需要考虑不同变
量之间的交互效应,即这些变量之间是否存在相互影响,以及这种影
响对生存时间的影响程度。本文将介绍如何使用R语言进行cox回归
的交互效应分析。
1. 准备数据
在进行cox回归分析之前,首先需要准备数据。假设我们有一个名为"survival_data"的数据集,包含了待分析的生存时间、事件发生情况、以及若干个自变量。为了进行交互效应分析,我们需要添加一个或多
个交互项,即两个或更多自变量的乘积。可以使用以下代码来创建交
互项:
```{r}
survival_data$interaction <- survival_data$var1 *
survival_data$var2
```
其中,var1和var2是两个待分析的自变量,interaction是它们的乘积,用来表示它们之间的交互效应。
2. 运行cox回归模型
有了交互项之后,接下来就可以运行cox回归模型了。假设我们想要
分析生存时间和事件发生之间与两个自变量以及它们的交互项的关系,可以使用以下代码来进行cox回归分析:
```{r}
cox_model <- coxph(Surv(time, event) ~ var1 + var2 + interaction, data = survival_data)
```
其中,Surv(time, event)表示生存时间和事件发生的数据格式,var1、var2和interaction分别表示三个自变量,data=survival_data表示
cox回归例题
cox回归例题
以下是Cox回归的例题:
假设我们有一个研究,其中30名急性心肌梗死患者被随机分为两组,并观察和记
录了他们的病情、年龄、性别和白蛋白含量等数据。我们想知道这些因素对患者的生存时间是否有影响。为了解决这个问题,我们可以使用Cox回归模型进行分析。
具体操作如下:
1.将数据输入到统计分析软件中,例如SPSS或Minitab。
2.在主对话框中选择“生存分析”中的“Cox回归”选项。
3.输入时间变量和状态变量,以及协变量(例如年龄、性别、白蛋白含量
等)。
4.点击“运行”按钮,软件将自动进行Cox回归分析,并输出结果。
结果解释:
根据Cox回归分析的结果,我们可以看到各个因素对生存时间的影响程度和方
向。例如,如果年龄的系数为正,则表示年龄越大,患者的生存时间越短;如果白蛋白含量的系数为负,则表示白蛋白含量越高,患者的生存时间越长。同时,我们还可以通过比较不同因素对生存时间的影响程度来得出更深入的结论。
需要注意的是,Cox回归分析需要满足比例风险模型假定(PH假定),即Kaplan-Meier法分析中得到的生存曲线不存在交叉。如果结果有交叉,则不满足PH假定,需要使用其他方法进行分析。
Cox回归分析.ppt
风险率 (随时变化)
18 天
48 天
h0(18) eb1b2
90天
h0(18) e 0 h0(18) eb2
h0(18) eb1
h0(48) e 0 h0(48) eb2
h0(48) eb1
+
h0(90) eb1
条件死亡概率 (第 i 个死亡时刻)
偏似然函数 (条件概率连乘)
qi hi(t) hj(t) , Lp q1q2 qk ,
的概率。为条件概率,即活到了t时刻的条件下在t~t+t这一微 小时段内死亡的概率,用h(t)表示。
h(t) lim P(t T t t T t) lim n(t) n(t t)
t 0
t
t0 n(t) t
式 中 , T为 观 察 对象 的 生 存时 间 , n(t) 为 t 时刻 的生 存 人 数 ,
二、Cox回归分析的一般步骤
1. 分析前的准备----数据整理 2. 参数估计,建立最佳模型 3. 假设检验 4. Cox模型的解释及应用 5. Cox模型拟合优度的考察
1. 分析前的准备----数据整理
• 严密的研究设计 • 收集资料:影响疾病的因素、病人的个性及行为特征等资
料(如病人的年龄、性别、职业、是否饮酒、是否吸烟及 病情、病理类型等资料)、研究对象的生存时间和截尾指 示变量(一般用变量t表示生存时间,用变量d表示是否截 尾)。资料应尽量避免偏性及主观因素的影响。 • 样本含量:不宜过小。一般情况下,样本例数应为分析因 素的5-20倍。 • 数据预处理:如数据的变换、日历数据与生存时间的转化 等。同时要对数据进行描述性分析。
cox回归检验方法
Cox回归检验方法是一种常用的生存分析方法,它通过比较不同组的危险函数来研究多分类结局事件发生的危险因素。以下是一种Cox回归的步骤:
1. 准备数据:Cox回归需要自变量(可能影响结果的因素)和因变量(感兴趣的结果)。
2. 构建模型:使用Cox比例风险模型,将自变量作为解释变量,因变量作为生存时间。
3. 检验模型假设:Cox回归假设生存时间是连续的,且具有相同的比例风险。这些假设可以通过图形化方法和统计测试来检查。
4. 评估模型拟合:使用统计量(如AIC或BIC)来评估模型拟合优度。
5. 解释结果:解释Cox回归系数及其对应的HR和95%CI,以及它们对生存时间的影响。
以上步骤仅供参考,具体操作需根据实际情况进行调整。
cox回归分析
生存分析之COX回归分析
1.生存分析,是将终点事件出现与否与对应时间结合起来分析的一种统计方法;
2.生存时间,是从规定的观察起点到某一特定终点事件出现的时间,如膀胱癌术后5年存活率研究,及膀胱癌手术为观测起点,死亡为事件终点,两点为生存时间;
3.完全数据,观测起点到终点事件所经历的时间,上述例子即膀胱癌手术到因膀胱癌死亡的时间;
4.删失数据,因失访、研究结束终点事件未发生或患者死于规定的终点事件以外的原因而终止观察,不能确定具体生存时间的一类数据;
5.生存概率,表示某时段开始存活的个体到该时段结束仍存活的概率,p=活满某时段的人数/该时段期初有效人口数;
6.生存率,为观察起点起到研究时间点内各个时段的生存概率的累积概率,S(tk)=p1.p2.pk=S(tk-1).pk;
7.生存曲线,以生存时间为横轴,将各个时间点的生存率连在一起的曲线图;
8.中位生存期,又称半数生存期,表示50%的个体存活的时间;
9.PH假定(等比例风险假定),某研究因素对生存的影响不随时间的改变而改变,是COX回归模型建立的前提条件。
1.
Cox回归分析及其SPSS操作方法概述
前面我们已经讲过生存分析及KM法的内容,详细可以回复数字26-28查看。但有对统计不太熟悉的“微粉”还不太明白生存分析与一般统计的区别,不知道如何区别Cox回归与Logistic回归。在我们做研究时,有时我们不仅关心某种结局是否出现,还会关心结局出现的时间,例如肺部手术后观察五年生存率,一个有在1年之后死亡,另外一个人在在4.5后死亡,如果只看第5年时的结局,两者是一样的(均死亡),但是实际我们认为后者的治疗效果可能优于前者,即生存分析同时考虑结局和结局出现的时间,而一般分析只考虑结局。另外在队列随访时,可能有人在没有到5年时就失访了,如迁徙或者电话更改,我们不了解其结局如何,在一般的分析中这种病例无法使用,而中间失访的病例结局可能更差,如果直接扔掉,可能会产生偏倚;而用生存分析,这种病例可以给我们提供部分资料,即我们记录最后一次随访时病例的状态,失访前的资料可以用于分析。
生存分析与cox回归
2023/12/30
生存分析与Cox回归
22
4. 生存分析的基本内容
③ 生存过程的影响因素分析 例如,为了改善鼻咽癌患者的预后,应先了解可能影 响患者预后的因素,如年龄、病程、病情、术前健康 状况、有无淋巴结转移、术后有无感染、辅助治疗措 施、营养状况等,通过随访收集患者术后的生存时间 和上述因素的资料,然后采用多因素生存分析方法确 定影响患者预后的主要因素,从而为在手术前后进行 预防或干预提供参考依据。 常用的多因素生存分析方法:Cox比例风险回归模型
时间点(如确诊、入院或实施手术等某种处理措施后)开 始,观察到某规定时间点截止; ④ 常因失访等原因造成某些研究对象的生存时间数据不 完整; ⑤ 分布类型复杂,需用生存分析
2023/12/30
生存分析与Cox回归
19
3. 生存资料的数据形式
10年间346例大肠癌患者手术后的生存时间
患者编号 性别 年龄(岁) dtime 结局 生存时间(月)
24
二、生存资料的统计描述
生存率及其标准误 中位生存期 生存曲线
2023/12/30
生存分析与Cox回归
25
基本概念
2023/12/30
生存分析与Cox回归
26
基本概念
2023/12/30
生存分析与Cox回归
27
基本概念
2023/12/30
cox回归模型的应用场景
cox回归模型的应用场景
Cox回归模型的应用场景
概述
Cox回归模型是生存分析中一种常用的统计模型,用于分析事件发生时间和相关因素之间的关系。它是基于半参数模型的一种推断方法,可以用来估计影响事件发生时间的协变量的效应。Cox回归模型广泛应用于医学、社会科学、金融等领域,对于研究事件的发生和预测具有重要意义。
医学领域
在医学研究中,Cox回归模型经常用于分析疾病的发展和预测。例如,对于癌症患者的生存分析,可以利用Cox回归模型来评估不同因素对患者生存时间的影响。通过观察患者的基本特征、疾病的进展和治疗情况等因素,可以建立Cox回归模型来预测患者的生存概率,为临床决策提供参考。
社会科学
在社会科学研究中,Cox回归模型可用于分析个体的生命周期事件,如婚姻、离婚、就业、退休等。通过对个体特征、家庭背景、社会经济因素等进行观察和分析,可以建立Cox回归模型,探讨不同因素对生命周期事件的影响。例如,研究婚姻稳定性时,可以利用Cox回归模型来评估夫妻双方的年龄、教育程度、经济状况等因素
对婚姻稳定性的影响。
金融领域
在金融风险管理中,Cox回归模型被广泛应用于评估不同因素对违约风险的影响。通过对借款人的个人信息、信用评级、财务状况等进行观察和分析,可以构建Cox回归模型来预测违约概率。这对于金融机构在贷款审批和风险控制中具有重要意义,有助于提高贷款的准确性和风险管理能力。
其他领域
除了上述领域外,Cox回归模型还广泛应用于其他研究中,如环境科学、市场研究等。在环境科学中,可以利用Cox回归模型来分析环境因素对物种灭绝风险的影响。在市场研究中,可以利用Cox回归模型来分析市场竞争因素对产品寿命周期的影响。
cox回归分析
cox回归分析
生存分析之COX回归分析
1.生存分析,是将终点事件出现与否与对应时间结合起来分析的一种统计方法;
2.生存时间,是从规定的观察起点到某一特定终点事件出现的时间,如膀胱癌术后5年存活率研究,及膀胱癌手术为观测起点,死亡为事件终点,两点为生存时间;
3.完全数据,观测起点到终点事件所经历的时间,上述例子即膀胱癌手术到因膀胱癌死亡的时间;
4.删失数据,因失访、研究结束终点事件未发生或患者死于规定的终点事件以外的原因而终止观察,不能确定具体生存时间的一类数据;
5.生存概率,表示某时段开始存活的个体到该时段结束仍存活的概率,p=活满某时段的人数/该时段期初有效人口数;
6.生存率,为观察起点起到研究时间点内各个时段的生存概率的累积概率,S(tk)=p1.p2.pk=S(tk-1).pk;
7.生存曲线,以生存时间为横轴,将各个时间点的生存率连在一起的曲线图;
8.中位生存期,又称半数生存期,表示50%的个体存活的时间;
9.PH假定(等比例风险假定),某研究因素对生存的影响不随时间的改变而改变,是COX回归模型建立的前提条件。
1.
Cox回归分析及其SPSS操作方法概述
前面我们已经讲过生存分析及KM法的内容,详细可以回复数字26-28查看。但有对统计不太熟悉的“微粉”还不太明白生存分析与一般统计的区别,不知道如何区别Cox回归与Logistic回归。在我们做研究时,有时我们不仅关心某种结局是否出现,还会关心结局出现的时间,例如肺部手术后观察五年生存率,一个有在1年之后死亡,另外一个人在在4.5后死亡,如果只看第5年时的结局,两者是一样的(均死亡),但是实际我们认为后者的治疗效果可能优于前者,即生存分析同时考虑结局和结局出现的时间,而一般分析只考虑结局。另外在队列随访时,可能有人在没有到5年时就失访了,如迁徙或者电话更改,我们不了解其结局如何,在一般的分析中这种病例无法使用,而中间失访的病例结局可能更差,如果直接扔掉,可能会产生偏倚;而用生存分析,这种病例可以给我们提供部分资料,即我们记录最后一次随访时病例的状态,失访前的资料可以用于分析。
cox回归中c指数的95%置信区间
Cox回归是生存分析中常用的统计方法,它可以用来分析影响事件发生时间的因素。Cox回归常常会给出影响因素的风险比(Hazard Ratio)以及其置信区间,而其中的C指数也是一个重要的统计量。C 指数可以用来评估模型的预测能力和区分度,它的取值范围在0到1之间,值越接近1表示模型的预测能力越好。
然而,在Cox回归分析中,除了得到C指数的点估计值外,对C指数的置信区间也是非常重要的。置信区间可以用来评估C指数的稳定性和精度,同样也可以用来比较两个模型的预测性能。在进行Cox回归分析时,得到C指数的95置信区间是至关重要的。
那么,如何计算Cox回归中C指数的95置信区间呢?下面将从以下几个方面进行介绍。
1. Cox回归模型的基本原理
我们需要了解Cox回归模型的基本原理。Cox回归是一种半参数生存分析方法,它可以用来分析对事件发生时间有影响的协变量。Cox回归模型的基本形式如下所示:
$$h(t|X) = h_0(t) \cdot e^{(\beta_1X_1 + \beta_2X_2 + ... +
\beta_pX_p)}$$
其中,h(t|X)表示在给定协变量X下时间t的事件发生率;h0(t)是基准事件发生率;β1, β2, …, βp是协变量的参数估计值;X1, X2, …, Xp是对应的协变量值。
2. C指数的计算方法
在Cox回归模型中,C指数的计算通常基于受试者工作特征曲线(ROC曲线)来进行。ROC曲线是一种用于评估分类模型性能的常用工具,它反映了模型的敏感度和特异度。C指数就是ROC曲线下面积的一个指标,它等于ROC曲线处的斜率。
Cox回归,不懂的话来看这篇30天学会医学统计与SPSS公益课(D26)
Cox回归,不懂的话来看这篇30天学会医学统计与SPSS公
益课(D26)
Cox回归由于其复杂性和相对较少应用(除了临床研究),很多统计学习者很少接触过和应用Cox回归,对其原理与应用也不甚了解,一般医学教科书一写到Cox回归,马上会涉及到几个令人生畏的名称:比如半参数回归、风险函数,以及那无法理解的Cox回归方程,当然Cox回归全称也令人发蒙:“Cox比例风险模型”。
但随着队列研究和中长期随访的实验性研究越来越多,了解Cox 回归是一项必要的学习内容。本文撇开复杂原理,简单通俗地介绍下Cox回归,特别是它的应用。除此之外,必须值得了解的一个非常重要的指标--HR值。
Cox回归与HR值
在科学研究中,经常遇到分类的结局,主要是二分类结局(阴性/阳性;生存/死亡),研究者可以通过logistic回归来探讨影响结局的因素,或者构建预测模型来预测新患者的预期。
但很多时候logistic回归方法无法使用。比如,在随访期中,绝大部分对象都发生阳性结局( 患者全部治愈或者患者几乎都死亡了)。例如比较两种治疗手段治疗新冠肺炎效果(比如瑞德西韦和安慰剂组),可能在1一个月的效果分别是95%和90%,在统计学上可能没有差异。
logistic回归是关于率的分析,探讨影响发生率的因素,但发生率的研究不能说明一切。
我们还可以从发生率发生的速度来分析,探讨影响发生速度的因素。这便是Cox回归基本思维。
Cox回归是生存分析的重要方法,全称是“Cox比例风险模型”。它主要探讨终点事件发生速度有关的因素。通俗来说,它可以探讨,到底哪类群体的“死亡”速度更快、到底什么因素影响了“死亡”速
cox回归模型的应用场景
cox回归模型的应用场景
Cox回归模型的应用场景
Cox回归模型是生存分析中一种常用的统计模型,主要用于探究事件发生时间与多个预测因素之间的关系。该模型在医学、生物学、社会科学等领域具有广泛的应用。本文将介绍Cox回归模型的应用场景,并通过实例说明其在实际问题中的应用。
一、医学领域
在医学领域,Cox回归模型常用于研究患者的生存时间与各种预测因素之间的关系。例如,研究某种疾病的患者在接受不同治疗方案后的生存情况,可以将患者的生存时间作为因变量,治疗方案、年龄、性别、病情严重程度等作为自变量,应用Cox回归模型进行分析。通过分析结果,可以评估不同因素对患者生存时间的影响,并为医生制定个性化的治疗方案提供依据。
二、社会科学领域
在社会科学研究中,Cox回归模型常用于研究人群中各种社会因素对事件发生时间的影响。例如,研究员可以通过该模型分析员工的离职时间与薪资、工作满意度、晋升机会等因素之间的关系。通过分析结果,可以了解不同因素对员工离职时间的影响程度,从而为企业提供人力资源管理的参考。
三、生物学领域
在生物学研究中,Cox回归模型常用于研究生物实验中各种因素对生物体死亡时间的影响。例如,研究员可以通过该模型分析实验组与对照组在给定药物的作用下的生存时间差异。通过分析结果,可以评估药物对生物体生存时间的影响,为药物研发和治疗提供依据。
四、金融领域
在金融领域,Cox回归模型常用于研究个人或企业的违约时间与各种因素之间的关系。例如,研究员可以通过该模型分析借款人的违约时间与借款金额、信用评级、还款能力等因素之间的关系。通过分析结果,可以了解不同因素对违约时间的影响程度,从而为银行和金融机构的风险管理提供参考。
cox回归 c指数 r语言
cox回归 c指数 r语言
Cox回归是一种生存分析方法,也被称为比例风险模型。它是用来研究事件发生时间和影响因素之间关系的统计模型。Cox回归模型假设各个因素对事件发生的影响是恒定的,即风险比是常数。Cox回归模型常用于医学、流行病学和生存分析等领域的研究中,用来分析生存时间和影响因素之间的关系。
C指数(Concordance Index)是评价生存分析模型预测能力的一种指标。它衡量了模型对个体生存时间排序的准确性,即对于任意一对个体,如果其中一个生存时间比另一个短,那么模型预测的风险得分也应该更高。C指数的取值范围在0.5到1之间,值越接近1表示模型预测能力越好,0.5表示模型的预测能力等同于随机猜测。
R语言是一种广泛应用于统计分析和数据可视化的编程语言。它具有丰富的统计分析包和绘图功能,因此在生存分析中也有着广泛的应用。R语言中有专门用于生存分析的包,如survival包和rms包,可以实现Cox回归模型的拟合和C指数的计算等功能。
总的来说,Cox回归是一种用于生存分析的统计模型,C指数是
用来评价生存分析模型预测能力的指标,而R语言则是一种常用于统计分析和生存分析的编程语言,可以实现Cox回归模型的拟合和C指数的计算等功能。这些工具在医学、流行病学等领域的研究中有着重要的应用。
cox回归建立风险模型计算评分
cox回归建立风险模型计算评分
Cox回归是一种常用的生存分析方法,用于建立风险模型并计
算评分。首先,Cox回归可以用于分析影响某一事件发生时间的因素,比如生存时间、疾病复发时间等。在建立风险模型时,通常需
要选择一个基准时间点,比如研究对象入组的时间点,然后根据个
体的特征变量(比如年龄、性别、疾病严重程度等)和影响因素
(比如治疗方案、药物使用等)来预测个体在基准时间点后的风险。
在Cox回归中,每个个体都有一个风险函数,表示其在任意时
间点发生事件的风险。Cox回归模型假设这个风险与解释变量之间
存在一种特定的函数关系,通过估计模型参数来确定这种关系。一
旦模型参数估计完成,就可以利用模型对个体的风险进行预测。通常,模型参数估计采用的是最大似然估计方法。
在计算评分时,可以利用Cox回归模型估计得到的各个变量的
回归系数来构建评分系统。一种常见的方法是根据回归系数的大小
为每个变量赋予相应的分数,然后将各个变量的分数相加得到最终
的评分。这个评分可以用于评估个体的风险水平,比如在临床医学
中可以用于评估患者的疾病风险或预后。
需要注意的是,Cox回归模型的建立和评分计算需要严格的统计分析和模型验证,以确保模型的准确性和可靠性。同时,评分系统的实际应用也需要考虑到特定领域的实际情况和需求,比如在医学领域需要考虑到临床实际意义和患者的个体差异等因素。
COX回归分析
COX回归分析
接下来,将事件发生时间、事件状态和预测变量作为输入,进行COX
回归分析。在COX回归分析中,事件发生时间和事件状态被编码为一个对
数似然函数,即
log(λ(t)) = β0 + β1x1 + β2x2 + ... + βpxp
其中,λ(t)表示在时间t事件发生的概率密度函数,β0是一个基
准风险,β1到βp是对应预测变量的系数,x1到xp是对应预测变量的
取值。
模型评估的主要方法是似然比检验和比例风险检验。似然比检验用于
检测整个模型的有效性,比例风险检验用于检测每个预测变量的有效性。
如果似然比检验的P值小于显著水平,可以认为预测变量对事件风险有显
著影响。
结果解读时,主要关注风险比(HR)和置信区间(CI)。风险比可以
用来比较两个组之间的事件风险,HR>1表示高风险,HR<1表示低风险,HR=1表示相同风险。置信区间表示了对风险比的估计的不确定性范围,
通常使用95%置信区间。
总之,COX回归分析可以帮助研究者识别和评估多个预测变量对事件
风险的影响。通过选择预测变量、建立模型、评估模型和解读结果,可以
得到有关预测变量对事件风险影响的有效信息,为生存分析提供科学依据。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
生存分析之COX回归分析
1、生存分析,就是将终点事件出现与否与对应时间结合起来分析得一种统计方法;
2、生存时间,就是从规定得观察起点到某一特定终点事件出现得时间,如膀胱癌术后5年存活率研究,及膀胱癌手术为观测起点,死亡为事件终点,两点为生存时间;
3、完全数据,观测起点到终点事件所经历得时间,上述例子即膀胱癌手术到因膀胱癌死亡得时间;
4、删失数据,因失访、研究结束终点事件未发生或患者死于规定得终点事件以外得原因而终止观察,不能确定具体生存时间得一类数据;
5、生存概率,表示某时段开始存活得个体到该时段结束仍存活得概率,p=活满某时段得人数/该时段期初有效人口数;
6、生存率,为观察起点起到研究时间点内各个时段得生存概率得累积概率,S(tk)=p1、p2、pk=S(tk-1)、pk;
7、生存曲线,以生存时间为横轴,将各个时间点得生存率连在一起得曲线图;
8、中位生存期,又称半数生存期,表示50%得个体存活得时间;
9、PH假定(等比例风险假定),某研究因素对生存得影响不随时间得改变而改变,就是COX回归模型建立得前提条件。
Cox回归分析及其SPSS操作方法概述
前面我们已经讲过生存分析及KM法得内容,详细可以回复数字26-28查瞧。但有对统计不太熟悉得“微粉”还不太明白生存分析与一般统计得区别,不知道如何区别Cox回归与Logistic回归。在我们做研究时,有时我们不仅关心某种结局就是否出现,还会关心结局出现得时间,例如肺部手术后观察五年生存率,一个有在1年之后死亡,另外一个人在在4、5后死亡,如果只瞧第5年时得结局,两者就是一样得(均死亡),但就是实际我们认为后者得治疗效果可能优于前者,即生存分析同时考虑结局与结局出现得时间,而一般分析只考虑结局。另外在队列随访时,可能有人在没有到5年时就失访了,如迁徙或者电话更改,我们不了解其结局如何,在一般得分析中这种病例无法使用,而中间失访得病例结局可能更差,如果直接扔掉,可能会产生偏倚;而用生存分析,这种病例可以给我们提供部分资料,即我们记录最后一次随访时病例得状态,失访前得资料可以用于分析。
我们先回顾一下生存分析得KM法与寿命表法(回复数字26与27可以查瞧KM法得详细内容),其共同点就是只能分析一种因素与生存率得关系,Log-Rank法也就是比较一个因素两种水平间得生存差别,如果生存
率得影响因素有很多,我们怎么避免其它混杂因素得影响呢?我们可以使用回归分析方法,但如果使用logistic回归,也就是只能观察影响因素与结局得关联,没有考虑结局发生得时间因素。Cox回归可以解决这个问题。Cox回归一般模型假设为
其中h(t,X)就是在时刻t得风险函数又可称瞬时死亡率,h(0,t)就是基线风险率,其它与logistic回归模型相同。βj大于0则x j越大,病人死亡风险越大,βj小于0则x j越大,病人死亡风险越小,βj等于0则x j 越与死亡率没有影响。Exp(β)为危险比(HR)或相对危险度(RR)。
下面以一个例子说明在SPSS中作Cox回归如何操作。
我们想观察乳腺癌得生存率及其影响因素,收集了1207例病例并进行了随访。观察得因素包括年龄(age)、病理肿瘤大小(pathsize)、腋窝淋巴结个数(lnpos)、组织学分级(histgrad)、雌激素状态(er)、孕激素状态(pr)与淋巴结转移(ln_yesno)等。time为随访时间,status为生存状态。
在SPSS菜单里点击“分析”-“生存函数”-“Cox回归”,在弹出得对话框里,将”time”与”status”分别选入时间与状态对话框,点击“定义事件”,填写“1”,将不同得影响因素选入协变量框中,方法可以选“向后:LR”(各种方法差别不大,可以自由选择)。
如果有多分类变量需要设置哑变量,可以点击右上角“分类”,将要设置哑变量得变量选入右边框中。并可以选择以第一个或者最后一个作为参照。
在右上角点击“选项”,可以选择“CI用于exp(B)”,用于计算HR得95%置信区间。
最后点击确定可瞧到Cox回归分析结果。
结果中第一个表给出病例纳入情况,如下图,数据共1207个病例,但最后一共纳入590例,其中40例出现事件(即死亡),另外617例因为有缺失值被排除。从中可以瞧出,数据质量不太好,有缺失值得病例占一半以上且有观察终点得病例只有40例。
下面得表中就是哑变量编码情况,histgrad中“1”被编码为“0”“0”,即histgrad中“2”“3”均以“1”为参照。
下面再瞧主要得结果,即“方程中得变量”表。本表列出了多个步骤,在步骤1中,全部我们纳入得变量都进入分析,从前往后分别就是模型系数(B)、系数标准误(SE)、Wald检验值,自由度(df)、p值,HR值(Exp(B))及其置信区间。接下来瞧步骤2,其相对于步骤1少了一个变量er。即步骤2中删除了步骤1中得P值最大得变量。同理依次删除p值最最大得变量。
下面我们瞧最后一步,即步骤5、经过筛选,只剩下三个变量,即认为这三个变量对生存率得影响,其中病理肿瘤大小对应得HR为1、566,大于1,即认为病理肿瘤越大,生存时间越短;同理腋窝淋巴结个数越多,生存时间越短;孕激素状态对应得HR为0、511,小于1,即有孕激素时生存时间越长。
需要说明得就是Cox回归分析就是比例风险模型,即模型假设在任一时间点两组得危险比就是相同得。如下图所示:
而下图所示则不符合比例风险模型,不能作简单Cox回归。如果想作回归分析,可以咨询相关统计专家或查瞧专业书籍。