玉米C 型胞质不育恢复主基因SSR 标记
玉米常用的分子标记
玉米常用的分子标记
玉米是世界上最重要的粮食作物之一，因此对其进行研究至关重要。
分子标记是一种重要的研究工具，可以用于识别不同品种之间的遗传差异。
下面介绍几种常用的玉米分子标记。
1. SSR（简单序列重复）标记：SSR标记是通过检测DNA中特定序列的重复次数来识别遗传差异的。
它们通常可以用PCR扩增并通过凝胶电泳进行测定。
SSR标记在玉米遗传学和品种鉴定中被广泛使用。
2. SNP（单核苷酸多态性）标记：SNP标记是通过检测DNA中单个核苷酸的变异来识别遗传差异的。
它们通常可以通过基因芯片技术进行分析，是分子标记中最常用的。
3. RAPD（随机扩增多态性DNA）标记：RAPD标记是通过随机扩
增DNA片段来识别遗传差异的。
它们通常可以用PCR扩增并通过凝胶电泳进行测定。
RAPD标记在玉米遗传学和种质资源研究中被广泛使用。
总之，分子标记技术为玉米遗传学和育种研究提供了重要的工具，有助于识别品种之间的遗传差异和进行基因组分析。
- 1 -。
SSR分子标记技术在玉米杂种优势群划分中的应用
Ｋｅ ｒ ｓ ｍａｚ ； Ｓ ｍａ ｋ ｒ； ｎ ｒｄ ｌ ｅ ｃｕ ｔ ｒ ａｙ ｉ ｈ ｔｒ ｔ ｒ ｕ ｙ ｗｏ ｄ ： ｉ ｅ Ｓ Ｒ ｒ ｅ ｓ ｉｂ ｅ ｎ ； ｌ ｓｅ ｌ ｓｓ ｅｅ ｉ ｇｏ ｐ ｉ ｎ ａ ； ｏ ｃ
组 成 的基本 序列 串联 重复 组成 的短 片段 ， 建立 是
在 Ｐ Ｒ反应基础上的一种新型遗传标记 。研究 Ｃ
表 明 ，Ｓ ＳＲ标记 可有 效地 应用 于 玉米 种质 的遗 传
关键词 ： 玉米 ；Ｓ Ｓ Ｒ分子标记 ； 自交系 ； 聚类分析 ： 杂种优势群
中 图分 类 号 ：５ ３０ ２ Ｓ１． ３ 文献标识码： Ａ 文章 编 号 ：０ ２ ２ ８ （ ０ ２ ０ — ４ ９ ０ １０ — ４ １ ２ １ ）５ ０ ３ — ４
Ａｐｐ ｉ ａ ｉ ｎ ｆＳ ｌｃ ｔｏ ｏ ＳＲ ａ ｋｅ ｓ ｔ ｔ ｒ ｔｃ Ｇｒ ｕ ｎｇ ｏ ａ ｚ ｎｂ ｅ ｎ ｓ Ｍ ｒ ｒ ｏ Ｈｅ ｅ ｏ ｉ ｏ ｐｉ ｆＭ ｉ ｅ Ｉ ｒ ｄ Ｌｉ ｅ
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玉米品种鉴定技术规程 ssr标记法
玉米品种鉴定技术规程 ssr标记法SSR（Simple Sequence Repeat）标记法是一种用于玉米品种鉴定的技术规程。
以下是关于玉米品种鉴定技术规程 SSR 标记法的一些基本信息：1. SSR 标记的原理：SSR 标记是基于短小简单重复序列的分子标记技术。
这些重复序列在基因组中广泛存在且具有高度多态性。
通过设计特定的引物，可以扩增并检测这些 SSR 标记，从而识别不同品种之间的差异。
2. DNA 提取：从待鉴定的玉米样本中提取高质量的 DNA 是进行 SSR 分析的重要步骤。
通常使用适当的 DNA 提取方法，如 CTAB 法或商业试剂盒。
3. SSR 引物设计：针对玉米基因组中的 SSR 位点，设计特异性的引物对。
这些引物可以根据已发表的玉米 SSR 数据库或通过自行开发来获得。
4. PCR 扩增：使用设计的 SSR 引物对，对提取的 DNA 进行 PCR 扩增。
PCR 反应条件可以根据引物的特性和设备要求进行优化。
5. 电泳和凝胶分析：扩增产物通过电泳在琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶上进行分离。
根据 SSR 标记的大小差异，可以观察到不同的电泳条带。
6. 数据分析：对电泳结果进行分析，记录每个品种的 SSR 标记图谱。
通过比较不同品种之间的图谱差异，可以鉴定出品种的独特特征。
7. 品种鉴定：根据 SSR 标记的多态性和品种特有的图谱模式，可以对玉米品种进行准确的鉴定和区分。
需要注意的是，SSR 标记法需要专业的实验室设备和技术操作，同时也需要对玉米基因组和 SSR 标记的相关知识有一定的了解。
在进行品种鉴定时，建议遵循相关的标准操作程序和实验室安全规范。
SSR标记及其在玉米中的应用
Ｋｅ ｏｄ ：Ｓ （ｉ ｌ ｓｑ ｅｃ ｐａ） ｏｅｕ ｒ ｒｅｓ Ｍａ ｅ Ｒ ｖ ｗ ｙｗ ｒ ｓＳ Ｒ ｓ ｅ ｅｕ ｎｅｒ ｅｔ ；Ｍ ｌｃｌ ｋｒ， ｉ ； ｅｉ ｍｐ ｅ ａ ｍａ ｚ ｅ
玉米 是世 界上 分 布最广 泛 的粮食作 物 之一 ， 植 面积 种 仅 次于小 麦 和水 稻而 居 第 三 位 。玉 米是 重 要 的 粮食 和饲 料作 物 ， 是现 代食 品 、 也 医药 、 学 工 业 的 重要 原 料 作 物 。 化
中图分 类号
￥ １ ５３
文献标识码
Ａ
文章编号
１０ ７ ３ （０ １ １ ５ ０ ０ ７— ７ １ ２ １ ） １— ５— ４
Ｓ Ｒ ａ ｋ ｒ Ｔｅ ｈ ｏ ｏ ｙ ａ ｄ ＩＳ Ａｐ ｌ ａ ｉ ｎ ｔ ａ ｚ Ｓ Ｍ ｒ ｅ ｃ ｎ ｌ ｇ ｎ ｔ ｐ ｉ ｔ ｏ Ｍ ｉｅ ｃ ｏ
布， 由于重复次数和重复程 度的不同 ， 造成了每个基 因位
点 的多态性 。其 长度一 般较 短 ， 广泛 分布 于基 因组 的不 同
西 南 山区及 其它旱 谷 地 区的 主要 粮 食 之 一 。近 年来 随着 各 国畜牧 业 的发展 ， 全世界 玉米 需求 量大 幅增 长 。在 过去
几 十年 里 ， 国玉米 种 植 面积 和 产 量 有 了很 大 的发 展 ， 我 目
显性等优 点。简要 介绍 了 Ｓ Ｒ分子标记技 术的原理 和特 点 ， 点介 绍了 ＳＲ标记在玉米遗传 多样性 、 因定位 、 子 Ｓ 重 Ｓ 基 分 辅 助标 记、 遗传 图谱构 建、 种质 资源鉴 定等方面的应用 ， 并对 Ｓ Ｒ标记技 术在 玉米研 究 中的应用前景进行 了展 望。 Ｓ
关 键 词 ：Ｓ 分 子 标记 ； Ｓ Ｒ； 玉米 ； 述 综
SSR标记在玉米研究中的应用研究进展
SSR标记在玉米研究中的应用研究进展SSR标记是短串重复序列（Simple Sequence Repeat，SSR）的标记，也叫微卫星标记。
SSR标记在玉米研究中具有广泛的应用价值，因为它具有高度多态性、稳定性、可重复性等特点，已经成为了描绘遗传多样性、构建遗传图谱、探讨种质资源开发利用方向等方面的主要工具。
一、SSR在遗传多样性分析方面的应用SSR标记已成为了玉米遗传多样性分析的主要手段之一，因为它具有高度多态性和稳定性。
随着SSR技术的发展，越来越多的SSR标记被应用于玉米遗传多样性分析中，已经被广泛应用于各种不同品种和种群的遗传多样性分析。
通过SSR标记的应用，可以描绘玉米的遗传多样性分布、不同品种之间的遗传差异等，为玉米的保护与发展提供了有力的基础支撑。
构建遗传图谱是研究玉米遗传进化和遗传多样性的重要手段，也是探究玉米品种间亲缘关系的重要途径。
SSR标记的高度多态性、可重复性和稳定性，使其成为构建玉米遗传图谱的重要工具。
在构建玉米遗传图谱的过程中，SSR标记提供了一种快速而容易的方法，可以高效地确定基因的遗传距离和亲缘关系，从而为进一步的玉米种质资源开发提供基础支撑。
三、SSR在玉米品种分类中的应用SSR标记可以描绘不同品种之间的遗传差异，为玉米品种分类提供了有力的支撑，使其成为了玉米品种鉴定的重要工具。
通过SSR标记的分析，可以鉴别出不同品种之间的遗传差异和亲缘关系，进而为玉米品种分类提供参考，从而指导玉米种质资源的保护和留种。
种质资源是作物育种研究的基础，SSR标记可以描绘不同品种之间的遗传差异与亲缘关系，为种质资源的鉴定、保护和开发提供了重要的手段。
SSR标记在玉米种质资源开发与利用中的应用，具有以下几个方面的特点：（1）种质资源的鉴定和鉴别。
通过SSR标记分析种质资源的遗传差异和亲缘关系，可以确定不同品种或不同来源的种质资源的遗传差异和亲缘关系，为玉米育种研究提供了基础数据。
（2）新品种的创制和筛选。
SSR分子标记技术在玉米品种鉴定中的应用
１ 真 伪 性 鉴 定
近年 来 ， 由于骨干 自交系 的频 繁使 用 。 导致 品种 间 的遗 传基础 日趋狭 窄 ， 用传 统鉴定 方法难 以判别 品种 和 亲本 自交系之 间的亲子关 系 ，用Ｓ Ｒ 子标记技 术 ， Ｓ分 彻 底解 决了这一难题 。 它直接 反映个 体间Ｄ Ａ 平上 的差 Ｎ水
裹 １ 实 验 中使 用 的 ４ ２对 Ｓ Ｒ ｇ 物 Ｓ Ｉ
编号 引物名称 染色体位置 编号 引物名称 染色体位置
杂 变 玉米 种 子 是 可 行 的 。
关键 词 ：Ｓ 分子标记 ； ＳＩ Ｌ 真伪 性 ； 纯度 ； 鉴定 ； 新
品种 保 护 ： 米 玉
作物种子鉴 ห้องสมุดไป่ตู้传 统上 主要采 用形态学方法 、 田间小
后各取 ｌ粒种子 。 准品种双亲各取２ 。 Ｏ 标 粒 然后采用高文 伟等 的快速 提取法 ，用镊子 和刀片将种子切开取胚 ， 放 人 １ ｍ 离 心 管 中 ，用 锥 形玻 璃 棒碾 磨成 粉 状 ；加 入 ． ｌ ５ ３ ０ Ｉ Ｎ 提取液０Ｍ Ｎ Ｃ 。Ｍ脲）并 充分搅匀 ； ０ ￣Ｄ Ａ ａ １４ ， 加入
后备用。
因耗 时长 、 受季节 限制 、 态性差等 原 因不能 满足种子 多
于是 ， Ｃ 为基础 的Ｓ Ｒ 以Ｐ Ｒ Ｓ 分子标记技 １ Ｓ Ｒ ． Ｓ 扩增 参考国 内外文献资料 。选用多态性高 、 快速发展 的需求 ， ２ 可靠 的纯度鉴定手段 。 带 型清晰稳定 、随机 分布 于玉米ｌ 条染 色体上 的４ 对 术 以其极大 的优越性成为快速 、 Ｏ ２
异， 具有高度 的专一 性和特异性 。 在这方面 ， 北京市农林
科学院一直走在全国的前列 ，０ ５ 月 。 ２ ０ 年７ 该单位被北京
玉米品种鉴定技术规程 ssr标记法
玉米品种鉴定技术规程 ssr标记法玉米（Zea mays L.）是世界上最重要的粮食作物之一，具有广泛的生态适应性和经济价值。
为了满足农业生产的需求和科学研究的需要，科学家们开发了多种玉米品种，并针对其进行了鉴定和分类。
其中，SSR标记法是一种常用的玉米品种鉴定技术规程，本文将重点介绍该技术规程的原理和步骤。
SSR（Simple Sequence Repeat）标记法是一种基于已知序列的重复单元寻找多态性位点的分子标记技术。
其原理是利用多态性位点的存在或不存在来鉴定不同的品种。
在玉米品种鉴定中，研究人员根据SSR标记法的原理，选取一些具有丰富多态性的SSR标记位点，通过PCR扩增和凝胶电泳等技术手段，检测和分离出目标位点，并根据目标位点的存在与否来判定玉米品种。
玉米品种鉴定的具体步骤如下：1. 提取玉米DNA：玉米DNA的提取是进行SSR标记法鉴定的关键步骤。
通常采用的方法是将玉米叶片或种子样品经过粉碎处理，使用提取试剂将DNA从细胞中分离出来。
2. PCR扩增：PCR（Polymerase Chain Reaction）是一种通过体外合成技术快速扩增特定DNA片段的方法。
在玉米品种鉴定中，选择目标SSR标记位点进行PCR 扩增，采用合适的引物组合和PCR条件，使目标位点得到特异性扩增。
3. 凝胶电泳：凝胶电泳是一种常用的分子生物学技术，用于分离和鉴定扩增产物。
将PCR扩增产物与DNA分子量标记物一同加载到琼脂糖凝胶孔中，施加电场后，根据扩增产物的大小，观察和记录目标位点的迁移距离。
4. 结果分析：通过观察凝胶电泳图像，可以判断目标位点的存在与否以及不同品种之间的差异。
如果目标位点在某个品种中存在，而在其他品种中不存在，则可以判定该品种具有独特的SSR标记，从而进行鉴定和分类。
SSR标记法作为一种快速、准确、可重复的玉米品种鉴定技术规程，广泛应用于玉米遗传育种和种质资源保护等领域。
它不仅可以用于鉴定玉米品种的纯度和纯度保持，还可用于种质资源的评价、亲源分析和遗传多样性研究等方面。
SSR标记在玉米研究中的应用研究进展
SSR标记在玉米研究中的应用研究进展SSR（Simple Sequence Repeats）是一类分子标记，在玉米研究中被广泛应用于遗传多样性分析、种质资源评价、亲缘关系确定、基因定位与连锁图构建、优良品种选育等方面。
随着分子生物学、生物信息学和基因组学等领域的快速发展，SSR标记的应用也得到了不断加强和拓展。
一、遗传多样性分析遗传多样性是指种群或个体间基因型和表型的差异程度。
通过SSR标记的多态性分析，可以准确测定玉米种质资源的遗传多样性水平，评估品种的亲缘关系，为玉米育种提供依据。
通过分析遗传多样性，可以发现不同地理分布的玉米亚种之间的遗传差异，从而为玉米的种质创新和种质改良提供理论指导。
二、新品种选育在玉米育种中，新品种的选育需要对大量的种质资源进行筛选和评估。
SSR标记可以帮助鉴定表现良好的亲本，加速杂交配制和品质改良过程。
通过SSR标记与目标性状之间的关联分析，可以筛选出与特定性状相关的分子标记，缩短选育周期，提高选育效率。
SSR标记也可用于品种纯度鉴定和品种保护。
三、基因定位与连锁图构建SSR标记常用于基因定位和连锁图构建，有助于了解玉米基因组结构和基因座间的遗传距离。
通过标记与性状的关联分析，可以找出与目标性状相关的分子标记，进而鉴定和定位相应的基因。
SSR标记的高度多态性和均匀分布特性，为构建高密度的连锁图提供了可靠的工具，促进了玉米的分子遗传学研究。
四、种质资源评价SSR标记可以帮助对玉米种质资源进行鉴定和评价。
通过遗传多样性的分析，可以评估遗传资源的丰富性和多样性。
通过SSR标记的分析，可以揭示种质资源中的关联关系和遗传背景，为玉米育种提供合适的亲本材料和育种策略。
SSR标记在玉米研究中有着广泛的应用。
通过对遗传多样性的研究，可以了解玉米种质资源的多样性和遗传背景，为玉米育种提供理论依据。
通过与目标性状的关联分析，可以筛选出与特定性状相关的分子标记，加速选育过程。
通过基因定位和连锁图构建，可以了解玉米基因组结构和基因座间的遗传距离。
SSR分子标记在玉米育种中的应用
的重复 次数 变化 很 大 ．Ｓ Ｓ Ｒ与 其 它 Ｄ Ａ 标 记 相 比具 Ｄ Ａ 分子 间多 态性差 异 。进而 得 到与 此差 异相 连锁 Ｎ Ｎ 有更 高 的多 态性 。 卫 星 Ｄ Ａ两 端 多为相 对保 守 的 的标 记 。从 而将 目标基 因定 位 在这 一 区 域 内 。近年 微 Ｎ 单 拷 贝序 列 ，通 过设 计 特定 的引物 进行 Ｐ Ｒ 扩增 ， 来 。利 用 Ｓ Ｒ 分子标 记 在玉米 的遗传 图谱 构建 及基 Ｃ Ｓ
［ 向道 权 ， 海 河 ห้องสมุดไป่ตู้ 永 国， ． ２ 】 曹 曹 等 玉米 Ｓ Ｒ遗 传 图谱 的构 建 及 产 量 Ｓ 性 状基 因定 位 ［ ． 传 学 报，０ １ ８ ８ ： ８ ７ ４ Ｊ遗 ］ ２０， （） ７— ８． ２ ７
及 系谱 分析 基本 一致 ； 希 慧等【 用 Ｓ Ｒ 分 子标 记 【 路 明， 芳 ， 传 晓 ， ． 米 杂 交 种 掖 单 １ 的 Ｓ Ｒ 连 锁 图 刘 ７ Ｊ 利 Ｓ ３ 】 周 谢 等玉 ３号 Ｓ
增稳 定 、 物 序列 易 于交 流等 特 点 ， 为 目前最 经 济 生化 常规 标 记来 构建 的 。这 些 遗传 标记 的数 量在 用 引 成
省 时 的 分 子 标 记 技术 之 一 ＿ 近年 来 ，Ｓ 标 记 在 玉 来 构 成作 图群体 的一对 亲本 材 料 中极 为有 限 ， ｌ １ ， ＳＲ 因此 ， 米育 种 中得到 广泛 的应用 。文 章综 述 了 Ｓ Ｒ标 记 的 遗 传 图谱 的发展 极为缓 慢 。 组 Ｄ Ａ 技术 的问世使 Ｓ 重 Ｎ 应用 原理 及其 在玉 米育种 上 的应用 。 得 几 乎所 有 的生 物 学学 科都 被 带入 了分 子 生 物 学 的
玉米C型胞质互作雄性不育系的不育机理及恢复性研究
异 常的转 录本 和 翻译 产物 ， 而 干扰 线 粒 体 正常 从 功 能的发 挥 ，并最终 导 致雄 性 不育 。Ｃ型胞 质 ］ 互作 雄性 不育 是 Ｃ、 、 Ｓ Ｔ三 种 不育 类 型 中 遗传 关
想。
关键词 ： 玉米 ； 型胞 质 ； 性 不育 系 ； 育机 理 ； 复 性 Ｃ 雄 不 恢
Ｃ 型 不 育 系 来 自 巴 西 的 玉 米 品 种 Ｃ ａｒａ ｈ ｒｕ ，
出一 条谱带 ， Ｘｈ 用 ｏＩ和 Ｓ ｍａＩ也 可 以将三 个 亚 组 区别开来 。郑用琏 等 （９ １ 以 Ｍｏ ７ １ ７为核 １９） ｌ 、０
开放 阅读框 （ 未知来 源 的 ４ １ 核苷 酸组成 ） 由 ４ 个 和 截 短 了 的 ａｐ ｔ６基 因 。 此 嵌 合 基 因 由 来 源 于 ａｐ ｔ９
的启 动子所控 制 ， 与正 常 的 ａｐ 相 比少 了 Ｎ段 的 ｔ６ ２ ３个氨 基 酸 。由于 Ｃ—Ｃ ＭＳ的线 粒 体 中没 有 其 他拷 贝的 ａｐ ｔ６存 在 ， 与编 码 ａｐ ｔ６蛋 白有 关 的 只
分子机 制
胞质 互作雄 性不 育是 由核基 因和细胞 质基 因
相 互 作 用 而 产 生 的 ， 基 因 和 线 粒 体 基 因 的互 作 核 导 致 了 花 粉 粒 的 不 正 常 发 育 【 。 线 粒 体 基 因 组 分 ３ ］ 子 问 重 组 产 生 正 向 或 反 向 重 复 序 列 ， 是 产 生 不 这 育 相 关 基 因 的直 接 原 因 。这 些 嵌 合 基 因往 往 产 生
孢 子 体 时 期 ， 期 早 ， 育 完 全 ， 究 越 来 越 受 到 时 败 研
ssr分子标记技术及其在玉米种子鉴定上的应用
ssr分子标记技术及其在玉米种子鉴定上的应用随着现代农业的发展，种子质量的鉴定变得越来越重要。
其中，分子标记技术成为了种子鉴定的重要手段之一。
SSR分子标记技术是一种基于DNA序列多态性的分子标记技术，具有高度的稳定性、可重复性和高度的信息含量。
本文将介绍SSR分子标记技术及其在玉米种子鉴定上的应用。
一、SSR分子标记技术的基本原理SSR分子标记技术是基于DNA序列上短重复序列的多态性而开发的一种分子标记技术。
这些短重复序列通常为2-6个碱基的重复序列，如ATATAT、AGAGAG等。
在不同个体中，这些短重复序列的重复次数和排列方式不同，因此可以用作分子标记。
SSR分子标记技术的基本原理是：首先从待分析的DNA样品中提取出DNA，并使用PCR技术扩增出含有SSR位点的DNA片段。
然后，利用电泳技术将扩增出的DNA片段分离出来，并通过染色体特异性的显色剂进行染色。
最后，通过比较不同个体的DNA条带图谱，确定不同个体之间的遗传差异。
二、SSR分子标记技术在玉米种子鉴定中的应用SSR分子标记技术在玉米种子鉴定中的应用主要体现在以下几个方面：1.玉米品种的鉴定SSR分子标记技术可以通过比较不同玉米品种的DNA条带图谱，确定不同品种之间的遗传差异。
这种方法比传统的形态学鉴定方法更为准确和可靠。
2.杂交种子的鉴定杂交种子是由不同品种的玉米杂交而成的，因此杂交种子的遗传背景比较复杂。
使用SSR分子标记技术可以快速准确地鉴定杂交种子的亲本品种，有助于杂交育种的进展。
3.种子纯度的鉴定种子纯度是指种子中所含的杂质和其他品种的比例。
使用SSR分子标记技术可以准确地鉴定种子的纯度，有助于保证种子的品质和纯度。
4.种子存储的鉴定种子存储过程中，可能会发生一些突变和遗传变异，从而影响种子的品质和纯度。
使用SSR分子标记技术可以快速准确地鉴定种子存储过程中的遗传变异，有助于提高种子的品质和纯度。
三、SSR分子标记技术在玉米种子鉴定中的应用案例1.玉米品种的鉴定一项研究使用SSR分子标记技术对中国南方地区的20个玉米品种进行了鉴定。
ssr标记在玉米研究中的应用研究进展
SSR标记在玉米研究中的应用研究进展吴子温路运才*（黑龙江大学现代农业与生态环境学院，黑龙江哈尔滨150080）摘要：简单重复序列作为第二代分子标记技术，在农作物分子辅助育种、种质资源鉴定等方面得到了广泛的应用。
该文介绍了SSR标记引物开发及其原理，并对SSR标记在玉米种质资源遗传多样性分析、DNA指纹图谱构建、杂交种种子纯度鉴定以及杂种优势种群划分等方面的应用进行了综述，旨在为推进精准育种、缩短育种周期等提供参考。
关键词：玉米；简单重复序列；分子标记；标记辅助育种中图分类号S513文献标识码A文章编号1007-7731（2020）（02-03）-0013-04当前，玉米作为粮饲兼用型作物在农业生产中发挥了不可取代的作用，并在饲料、工业等方面也有一定的应用［1-2］。
截至2012年，我国玉米总产量超过了谷类产量，成为我国第一大粮食作物。
而当前，我国玉米遗传育种仍是以传统常规育种为主，这种育种方式主要依据表型性状的观察，容易受到外界因素的影响。
近年来，随着B73、Mo17等骨干玉米自交系基因组序列的公布，SSR等分子标记技术在玉米遗传育种方面得到了广泛的应用［3］。
1SSR引物开发随着引物开发软件的不断更新，不同物种引物设计的软件各不相同。
在玉米引物开发上常用软件有Prim⁃er5.0、Oligo7、DNAsis等。
NCBI、MaizeGDB等网站的BLAST选项中找到候选引物的原始序列，通过原始序列可对候选引物重新设计。
引物设计的原则：候选引物长度最好在15~30、碱基的分布应符合随机性、候选引物序列中不可出现互补序列。
现如今，MaizeGDB已经公开的玉米SSR引物约有2000对。
SSR核心序列引物的来源有以下3个：（1）利用SSR序列两翼的保守序列，在基因文库中搜索选择出所需引物序列；（2）微卫星富集法［4］；（3）利用计算机软件对核苷酸数据库中选择的引物进行引物设计。
对所获得的引物用PCR进行扩增，所扩增出来目的片段的长短，取决于引物重复单元的重复次数。
利用SSR标记技术检测玉米杂交种纯度
!H 双 蒸 水 溶 解 #$% * 分 别 用 来 检 测 #$% 质 量 和 TC" 扩增+。 *7+幼苗提取 #$%。将 78W条件下发芽 ’ [ 的种 子幼苗剪取 &8; @6，按上述方法提取 #$% 和溶解 #$%。 *<+#$% 检验。分别取两种方法提取的 #$% 溶
液 > !H 在 &G’J琼脂糖凝胶中电泳， 检测 #$% 质量。
以检测到自交系间 !!" 标记的多态性。但不同引物 检测出的扩增片段的多态性是不一致的，一些引物 检测到的扩增片段多态性尤其丰富。利用该技术除 可以检测到同一位点上不同自交系间扩增片段大小 的明显差异外， 也能检测到一些细微的差异。 图#为 利用 $%&’(# 对当前生产上应用的主要玉米杂交种 亲本自交系的扩增结果， 模板 )*+ 来自幼苗 , 以下 无特别说明， 模板 )*+ 均来自幼苗 - 。可以看出， 图
像系统观察扩增片段谱带， 拍照。
7
#"!
结果与分析
不同来源提取的 &’( 质量检测 分别将自幼苗和干种子提取的 #$% 在 &G’J 琼
脂糖凝胶上电泳进行检测 * 图 &+。结果表明， 从干种 子提取的 #$% 在分子量大小上与幼苗提取的 #$% 无明显差异， 从整粒种子中提取的 #$% 浓度和 &8; 幼苗 @6 幼苗中提取的浓度相差不明显。在图 & 中， 泳道的 浓度明显高于种子 泳道， 这 #$% "$% #$% 显然是由于代谢旺盛的幼苗中 "$% 转录活动远高 于代谢水平较低的种子而引起的。
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玉米C型不育胞质恢复基因Rf12及其紧密连锁标记的应用[发明专利]
![玉米C型不育胞质恢复基因Rf12及其紧密连锁标记的应用[发明专利]](https://img.taocdn.com/s3/m/6ec8b06f2a160b4e767f5acfa1c7aa00b52a9deb.png)
专利名称：玉米C型不育胞质恢复基因Rf12及其紧密连锁标记的应用
专利类型：发明专利
发明人：曹墨菊,张鹏,王治红,郑名敏,刘永明,赵卓凡,牛群凯,侯雨微,李川,余涛,易洪杨
申请号：CN202111251861.3
申请日：20211025
公开号：CN113846179B
公开日：
20220415
专利内容由知识产权出版社提供
摘要：本发明公开了玉米C型不育胞质恢复基因Rf12及其紧密连锁标记的应用，属于基因工程技术领域。
所述紧密连锁标记包括1对引物对：F：5’‑agtgcctgtgcttgcccattca‑3’；R：
5’‑tcagatagctacctttgcttgcgc‑3’。
所述Rf12在染色体上的位置为：
B73_RefGen_v4Chr2:234057663‑234457207。
本发明中的恢复基因Rf12可恢复大部分的玉米C型不育系；本发明中的显性标记SNP‑55可对玉米C型不育胞质在2号染色体长臂的强恢复基因Rf12进行辅助选择，加快Rf12的回交转育进程，促进玉米C型不育胞质恢复基因的应用。
申请人：四川农业大学,广西青青农业科技有限公司
地址：611130 四川省成都市温江区惠民路211号
国籍：CN
代理机构：北京东方盛凡知识产权代理事务所(普通合伙)
代理人：程小芳
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SSR分子标记及其在玉米真实性鉴定上的应用
2018年第5期云南农业科技Yunnan Nongye Keji玉米是中国主要的粮食作物、饲料作物以及重要的工业原料，在国民经济和农业生产中发挥着重要作用。
近年来，由于中国玉米种子经营渠道多、乱、杂及经营管理法制不够健全，全国各地存在以假冒真、以劣充优现象，市场上以假劣种子为起因的经济纠纷案件频频发生，严重阻碍了农业生产的发展，使广大农民和国家蒙受巨大的经济损失[1~2]。
快速准确进行玉米种子真实性鉴定对于种子质量标准化、假种鉴别、产权纠纷等有重要作用[3]。
1SSR 分子标记及其在玉米种子真实性鉴定上的应用现状品种真实性属于品种的遗传品质，是种子质量的重要指标，指一批种子所属品种、种或属与文件描述是否相符[4]。
传统鉴定品种真实性的方法主要有田间小区种植鉴定、蛋白质电泳等方法。
田间小区种植鉴定费时费力，易受环境影响，蛋白质电泳多态性低、区分能力有限。
由于品种数量越来越多，品种间的差异越来越小，传统的鉴定方法已不能满足玉米品种真实性鉴定的需求。
分子标记技术以DNA 结构多态性为基础，具有许多传统方法不具备的优点，被人们广泛应用于种子真实性鉴定的研究中。
简单重复序列（Simple Se -quence Repeat ，SSR ），是一种以特异引物PCR 为基础的分子标记技术，指基因组中以几个核苷酸（1~6个）为单位经多次串联重复形成的DNA 重复序列，由于其两端序列相对保守，可以根据两端的序列设计引物进行PCR 扩增，通过电泳检测分析基因的多态性[5]。
在不同的玉米品种中，由于SSR 核心序列的重复次数不同，通过PCR 技术可以扩增出不同大小的DNA 片段，采用凝胶电泳技术对PCR 扩增片段进行分离，从而可以对不同品种的DNA 指纹进行分析实现对品种的鉴定。
SSR 具有序列简单、重复性好、多态性高、共显性、操作简单、不受环境影响和技术成熟等特点而成为玉米品种真实性鉴定的重要手段。
农业部于2007年颁布了玉米品种DNA 指纹鉴定标准，并于2014年修订完善。
SSR 分子标记技术在玉米育种中的应用
SSR分子标记技术在玉米育种中的应用王勇,张元昶,方忠(广西大学农学院,广西南宁530005)摘要介绍了S SR分子标记技术的原理、特点、类型及其在玉米遗传图谱的构建、品种纯度鉴定和玉米遗传多样性等育种中的应用。
关键词玉米;S SR;遗传育种中图分类号S513.032文献标识码 A 文章编号0517-6611(2007)01-00052-03U t iliza t ion o f SSR M a rk e rs in M a iz e G e n e tic B re e d in gW ANG Yo n g e t a l(A g r icu ltu ra l C o lle ge,G u an gx i U n ive rsity,N ann in g,G u an gx i530005)A b s tra c t T h e pr in cip le,ch a racte r is tics an d types o f S SR m a rk e rs w e re in trodu ced.In add ition,its app lica tion w a s m a in ly rev iew ed inth re e a spects in-clud in g th e con stru ction o f th e gen e tic lin k age m ap,th e de te ction o f th e pu r ity o f va rie ty and th e stu dy o f th e m a ize gen e tic d ive rs ity.K e y w o rd s M a ize;S SR;G en e tic breed in g玉米是重要的粮食与饲料作物,是世界三大作物之一。
但是由于对玉米中许多性状的遗传机制缺乏了解,从而限制了玉米产量的提高与品质的改善,阻碍了玉米育种工作的进程。
玉米C型胞质雄性不育恢复基因的定位研究
玉米C型胞质雄性不育恢复基因的定位研究
陈绍江;陈伟程
【期刊名称】《河南农业大学学报》
【年(卷),期】1989(000)003
【摘要】以玉米C 组群内两类不育胞质（ES、C）的三个不育系、两个恢复系,以及一套Wx 易位系为材料,对C 型胞质雄性不育的恢复基因进行了定位。
结果表明,能使ES、C 胞质三个不育系的育性恢复的主效因子Rf<sub>4</sub>位于第七染色体长臂端。
除此之外,几个影响育性恢复的辅助因子（ElB73的
Rf<sub>5</sub>,Cms 黄早四的Rf<sub>6</sub>、Rf<sub>7</sub>）也被定位。
【总页数】8页(P201-208)
【作者】陈绍江;陈伟程
【作者单位】[1]河南农业大学农学系;[2]河南农业大学农学系
【正文语种】中文
【中图分类】S
【相关文献】
1.玉米C型胞质雄性不育恢复主基因的染色体定位研究 [J], 黄西林;罗福和
2.玉米C型雄性不育弱恢复基因定位研究初报 [J], 陈绍江;陈伟程
3.水稻细胞质雄性不育恢复基因遗传和定位研究进展 [J], 李霞;张金伟;万勇;胡标林;谢建坤
4.玉米C型胞质雄性不育恢复基因Rf5的抑制基因的发现与鉴定 [J], 赵素贞;谢惠
玲;吴风华;牛俊海;鲁晓民;曲延英;汤继华
5.水稻细胞质雄性不育的育性遗传及恢复基因的定位研究进展 [J], 李广贤;姚方印;庄杰云;侯恒军;姜明松
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玉米C型胞质雄性败育与育性恢复遗传机理的研究的开题报告
玉米C型胞质雄性败育与育性恢复遗传机理的研究的开题
报告
研究背景：
在玉米中，C型胞质雄性败育（CMS-C）是一种常见的遗传现象，其中母本染色体上的一种遗传因子C导致花药及其内部花粉颗粒发育不良，从而导致花朵无法进行传粉和结实。
但是，通过与一种特定的遗传因子R的组合，可以使某些玉米种群恢复育性，即产生少量的有籽果实。
研究目的：
本研究的目的是探究玉米C型胞质雄性败育与育性恢复的遗传机理，以期为利用CMS-C实现植物杂交育种提供理论指导。
研究内容：
1.筛选C型胞质雄性败育材料：收集C型胞质雄性败育的玉米材料，通过鉴定筛选出合适的试验材料。
2.分子遗传学分析：采用分子遗传学技术，分析C型胞质雄性败育玉米和恢复育性材料中特定基因的分布和结构。
3.基因功能研究：通过基因克隆和转化技术，进一步研究特定基因在C型胞质雄性败育和育性恢复中的作用机理。
4.生态学研究：通过野外实验和室内培养，研究C型胞质雄性败育玉米和恢复育性材料在不同环境条件下的表现差异。
预期结果：
通过本研究，我们将探究C型胞质雄性败育玉米和恢复育性材料的遗传机理，有助于了解玉米育种中的杂交育种原理。
在实验过程中，还可以开发出新的分子标记，并为玉米的杂交育种提供可靠的分子标记。
最终，本研究的结果将有助于推进玉米育种的发展和实践应用。