最新7第十三章蛋白质的生物合成汇总

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由高度特异的氨酰-tRNA合成酶 (aminoacyl-tRNA synthetase)催化,反 应分两步
总反应式
2.肽链的起始:
➢mRNA中的起始密码是AUG,少数是GUG。 ➢起始密码子的上游约10个核苷酸的地方往往有一段富含嘌呤的序列称 SD序列(Shine-Dalgarno序列),一般为3~10个核苷酸,它与核糖体 16srRNA 3ˊ端的核苷酸序列互补,可促使核糖体与mRNA的结合。
(fMet-tRNAf)
Structure of N-formylmethionyltRNA[Met]
Differences with other tRNAs
细胞内有2种可携带Met的tRNA,它们都识别同样的 AUG密码子,但它们的一级结构和功能不同。
(1)tRNAf Met 带上Met后能甲酰化,是起始tRNA,用 于肽链
▪ EF-T:延伸因子“T”,开始误认为这类延 伸因子有肽基转
移酶的活性peptidyl transferase,所以取转 移酶的第一个字 母“T” 。 ▪
EF-G:这类延伸因子与核糖体结合时需要 GTP,当GTP水解时,这类延伸因子就从核 糖体上解离下来,总之涉及 GTP,所以用 GTP的第一个字母“G”,EF-G。
7第十三章蛋白质的生物合成
二 核糖体
(一)核糖体是蛋白质合成的部位 (二)核糖体的组成和结构
原核细胞的核糖体 真核细胞的核糖体 (三)核糖体的功能
核糖体上有两个tRNA结合位点:肽链结合 位(P位)和氨酰接受位(A位)。
原核生物核糖体
5S rRNA, 23S rRNA 50S
34种蛋白质 70S
合成的起始。
(2)tRNAmMet带上Met后不能甲酰化,用于肽链的内 部,在肽
链延伸中起作用。 所以AUG和GUG是兼职密码子,它们既可以作 为起始密码子,作为肽链合成的起始信号,这时与之 对应的氨基酸是甲酰Met。另外也可作肽链内部相应 aa的密码,这时AUG编码Met,GUG编码val。
ATP/ Mg 2+ +
inactive 70S ribosome
SD sequence
30S initiation complex
GDP + Pi
70S initiation complex
3. 肽链的延长:
肽链的延长需要一些延长因子或称延伸因子 (elongation factor,EF)
原核生物的EF有EF-T和EF-G两类:
A—PP—OCCH(NH2)R + tRNA →RCH(NH2)CO-tRNA + AMP
(二)在核糖体上合成多肽
1. 肽链合成的起始 2. 肽链的延长 3. 肽链合成的终止和释放 (三)肽链合成后的“加工处理” (四)蛋白质合成所需的能量 (五)活性肽合成的特征
E.Coli蛋白质的生物合成 : 1.氨基酸的活化:
16S rRNA 30S
21种蛋白质
真核生物核糖体
5SrRNA,5.8SrRNA,28SrRNA 60S
49种蛋白质 80S
18SrRNA 40S
33种蛋白质
三 tRNA的功能
tRNA分子上与蛋白质合成有关的位点: 1. 3′端-CCA上的氨基酸接受位点。 2. 识别氨酰-tRNA合成酶的位点。 3. 核糖体识别位点,使延长中的肽链附着于核 糖体上。 4. 反密码子位点。 第一套密码系统、第二套密码系统
在E.Coli和其它原核生物中与这起始密码 (AUG)相对应的tRNA是甲酰甲硫氨 酰—tRNA(fMet-tRNAf Met),这是起 始tRNA。
起始tRNA怎样形成?由甲硫氨酰-tRNA甲酰化
tRNA
Met
甲酰基
甲酰基转移酶 O
Met-tRNA
C Met tRNA
N10-甲酰Biblioteka BaiduH4 FH4 H
EF-T:是由Tu和Ts两个亚基组成的二聚体, ▪ EF-Ts:s是stable的意思,是稳定蛋白质, ▪ EF-Tu: u是unstable,不稳定蛋白质。 EF-Tu直接参加了氨酰-tRNA与核糖体的结 合。
肽链的延长包括3步:
❖ 氨酰-tRNA进入核糖体的A位 ❖ 肽键的形成 ❖ 移位
(1)氨酰-tRNA进入核糖体的A位
这是个比较复杂的过程,需Ts、Tu,还要 消 耗GTP。EF-Tu与GTP和氨酰-tNRA首先形成三元 复合物,才能进入A位。
(2)肽键的形成
通过一个转肽作用 (transpeptidation),由肽酰转移酶 (peptidyl transferase)催化,使一个 酯键变成了肽键,肽基转移酶的活性 由核糖体大亚基的23s rRNA承担(肽 基转移酶是一种ribozyme)。嘌呤霉 素对蛋白质的抑制作用就发生在肽键 形成这一步。
四 蛋白质生物合成的分子机制
五 蛋白质合成的一般特征: 六 蛋白质生物合成的方向:N端→C端 mRNA的翻译方向:5ˊ→3ˊ 蛋白质合成除需要aa外,还需要ATP、GTP,一系
列酶 和许多辅助因子。 (一)氨基酸的激活
ATP + HOOCCH(NH2)R → A—PP—OCCH(NH2)R + PPi
Met
tRNAm Met
tRNAf Met
AMP/Mg2+ PPi
The same aaRS
Met-tRNAmMet
AMP/Mg2+P Pi
N10-Formyltetrahydrofolate
Met-tRNAfMet
Transformylase
fMet-tRNAfMet
肽链合成的起始除了需要起始密码、SD序 列、起始tRNA外还要三种起始因子(initiation factor),即IF-1, IF-2 和IF-3,还要消耗 GTP,还需核糖体大小亚基参与,形成一个 70S的真正起始复合物。
(3)移位(translocation)
移位包括三种运动: ➢空载的tRNA离开P位。 ➢二肽基tRNA由A位移到P位
➢核糖体沿mRNA的5ˊ→3ˊ方向 移动一个密码子的距离。
移位需要EF-G和GTP。
4.肽链的终止与释放:
释放因子(release factor RF)能识别终止密码子与终止密码子结合。 ▪ RF-1:识别UAA和UAG ▪ RF-2:识别UAA和UGA ▪ RF-3:RF-3和GTP形成复
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