第7章 数据库查询
结构生物学--第7章--生物大分子结构数据库--ZH--2019
/pdb/
wwPDB In 2003
✓RCSB PDB (USA) ✓PDBe (UK) ✓PDBj (Japan) ✓BMRB (USA) :Biological Magnetic
作业1和2
• 1. 在pdb数据库中查找单克隆抗体的结构(PDB号:1igt )。找 出结晶条件、分辨率、Rfactor、Rfree、空间群。
• 2. 在PDB数据库中下载该结构,用PyMOL软件做一张该单 克隆抗体的图片。要求cartoon形式展示(show(S)-cartoon ),去除水分子(hide(H)-water),分别用紫黄两色色表示抗 体的重链和轻链(做这个大家可以尝试,我会课堂演示),在 图片上标记抗体各区域的名称。图片背景为白色(displaybackground-white),分辨率300 dpi。
• 实验(X射线晶体衍射、核磁共振NMR、电子显 微镜)测定的生物大分子的三维结构。
• 其中主要是蛋白质的三维结构,还包括核酸、糖 类、蛋白质与核酸复合物的三维结构 。
3. PDB数据格式
PDB的数据结构:对于每一个结构,包含名称、 参考文献、序列、一级结构、二级结构和原子坐 标等信息
分子类别— PDB文本文件, 用写字板打开 转运蛋白
结构生物学 第7章 生物大分子结构数据库
及结构比对 ZH 2019-05
蛋白质结构数据库
Protein Data Bank(PDB)
一、PDB(Protein Data Bank)
1.PDB概述 最重要的蛋白质分子结构数据库 1971年代建立于美国Brookhaven国家实验室 1988年由美国结构生物信息学研究合作组织
《数据库》第七章 基本SQL查询
8
Inspur Education
从表中选择多个列
要查看数据库中所有图书的名称和出版日期
SELECT bookname,pubdate
5
Inspur Education
选择表中的所有数据
显示客户customers表中所有的数据
SELECT * FROM books;
在SELECT后面键入*号
6
Inspur Education
从表中选择一列 2-1
在Oracle中,可以只在结果中返回特定的列。SELECT语 句中选择特定列被称为“投影(projection)”。可以 选择表中的一列,也可以选择多个列或者是所有的列。
示例:查询所有BOOKNAME列以“j”开头的书本。
SELECT * FROM books WHERE bookname LIKE 'j%';
17
Inspur Education
WHERE子句——连接运算符
在WHERE子句中可以使用连接运算符将各个表达式关联起 来,组成复合判断条件。常用的连接运算符有AND和OR。
INSERT INTO books (isbn, bookname, pubdate, quantity, bcost, bretail, bcategory)
VALUES (2, 'a语言', to_date('2017-10-8', 'yyyy-mm-dd'), null, '40', '68', 'computer');
第七章网络数据库检索
二、国外网络数据库检索示例
(一)Social Science Plustext 1.基本检索(Basic Search) 2.指南检索(Guided Search) 3.高级检索(Advanced Search) 4.自然语言检索(Natural Language Search) 5.出版物检索(Publication Search) 6.浏览菜单(Browse List)
二、网络数据库的检索方式与步骤 网络数据库是一种基于浏览器/服务器 (B/S)的数据库,可分为免费数据库(只要 连入因特网就ห้องสมุดไป่ตู้使用)和付费数据库(只有 付费获得授权才能使用)。
(一)网络数据库的检索方式 1.免费检索 2.普通用户检索 3.授权检索
(二)网络数据库的检索步骤 1.检索课题的主题分析 2.数据库的选择 3.检索策略的选择 4.实施检索 5.检索策略的优化 6.辅助性检索 7.检索结果的输出
(一)初级检索 1.登录中国期刊全文数据库 2.选取检索途径 3.输入检索词 4.进行检索 5.检索结果的优化与处理
(二)高级检索 利用高级检索系统能进行快速有效的组 合查询,优点是查询结果冗余少、命中率高。
(三)专业检索 专业检索允许用户按自己需要组合逻辑 表达式,进行更精确的检索。
三、国内其他网络数据库介绍
(二)Social Science Citation Index(社会科 学引文索引网络版)
1.Easy Search(简单检索) 2.Full Search(全面检索)
三、其他国外网络数据库介绍 (一)ABI/INFORM(ABI商业信息全文数据库) (二)Academic Search Premier(ASP)(学术参 考全文资料库) (三)Business Source Premier(BSP)(商业资 源电子文献全文数据库) (四)Academic Research Library(学术研究图书 馆) (五)Web of Science (六)Ei Compendex Web (七)Uncover
第七章 SQL Server数据库应用开发技术
7.2 简单查询
7.2.2 条件查询
5.使用LIKE关键字 通配符如下: 百分号 % :代表任意长度的字符串。 下划线 _ :代表任意单个字符。 封闭方括号 [ ] :代表方括号里列出的任意一个字符。 [^]:代表任意一个没有在方括号里列出的字符。 【例7.12】查询jy071、jy072和jw071班学生的姓名和班级。
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7.3 多表查询
7.3.2 外连接查询
1.左外连接 左外连接是指返回所有的匹配行,并从关键字JOIN左边的表中 返回所有不匹配行。由此可知,即使不匹配,JOIN关键字左边的 表中数据也将被保留,所以在左外连接中JOIN关键字左边的表为 主表,右边的表为从表。 语法格式: FROM 表1 LEFT [OUTER] JION 表2 ON 条件表达式 【例7.19】从教学管理数据库中查询学生的学号、姓名、课程名和 成绩(包括没有成绩的新入学同学的学号、姓名)。
第7章 数据查询
7.1 7.2 7.3 7.4 SELECT语句 简单查询 多表查询 汇总查询
7.5
小结
子查询
7.1 SELECT语句
查询是关系数据库中最基本的数据操作,通过SELECT语句来实现
基本语法格式: SELECT [ ALL | DISTINCT ] 字段列表 [INTO 目标数据表] FROM 源数据表 [,„n] [WHERE 条件表达式] [GROUP BY 分组表达式] [HAVING 搜索表达式] [ORDER BY 排序表达式 [,„n] [ASC] [DESC] ] [COMPUTE 行聚合函数名(统计表达式)[,„n] [BY 分类表达式 [,„n] ] ]
第7章 数据查询
知识技能目标:
1.理解数据查询的意义。 2.熟练掌握各种查询技术,包括单表查询、多 表查询、汇总查询、分类汇总、汇总计算、 子查询等,并能对查询结果排序、合并、保 存。
第7章 数据库数据查询
[ HAVING search_condition]
[ ORDER BY order_expression [ ASC|DESC ] ]
• 参数说明如下。
SELECT子句:指定由查询结果返回的列。
INTO子句:将查询结果存储到新表或视图中。 FROM子句:用于指定数据源。 WHERE子句:指定用于限制返回的行的搜索条件。 GROUP BY子句:指定用来放置输出行的组,并
FROM stu_info
在指定列查询中,列的显示顺序由SELECT子句指 定,与数据在表中的存储顺序无关;同时,在查询 多列时,用“,”将各字段隔开。
• 2.查询所有列
除了能够进行指定列查询以外,使用SELECT语
句还可以查询表中的所有列,这是通过星号(*) 通配符实现的。使用“*”通配符,查询结果将列 出表中所有列的值,而不必指明各列的列名,这 在用户不清楚表中各列的列名时非常有用。服务
• 【例7-5】查询所有的院系信息。
SELECT DISTINCT sdept FROM stu_info 在使用DISTINCT关键字后,去除的是SELECT子 句查询的列的重复信息。如果SELECT子句查询
的列为多列,那么只有这些列的信息同时重复的
记录才被去除;另外,如果表中有多个为NULL的 数据,服务器会把这些数据视为相等。
且如果SELECT子句select_list中包含聚合函数,则
计算每组的汇总值。
• HAVING子句:指定组或聚合函数的搜索条件。
HAVING通常与GROUP BY子句一起使用。 ORDER BY子句:指定结果集的排序方式。ASC 关键字表示升序排列结果,DESC关键字表示降序 排列结果。如果没有指定任何一个关键字,那么 ASC就是默认的关键字。如果没有ORDER BY子 句,DBMS将根据输入表中数据的存放位置来显示 数据。 在这一系列的子句中,SELECT子句和FROM子句 是必需的,其他的子句根据需要都是可选的。
计算机应用基础(中等职业技术学校)第7章
第7章 Access数据库
3.关系模型中的3种关系运算 关系数据库管理系统为了便于用户使用数据,向用户提供 了可以直接对数据库进行操作的查询语句。查询语句可以通过 对关系(即二维表)进行一系列运算来实现。 关系数据库系统至少应支持3种关系运算,即选择、投影和 连接。 选择:从二维表中选出符合条件的记录,它是从行的角度 对关系进行的运算。 投影:从二维表中选出所需要的列,它是从列的角度对关 系进行的运算。
计算机应用基础
第7章 Access数据库
7.1.3 数据模型 数据库中的数据是高度结构化的,即数据库不仅要考虑记 录内部数据项之间的关系,还要考虑记录之间的关系,数据模 型就是描述这些联系的数据库结构形式。在数据库的发展历史 中,把数据模型分为层次模型、网状模型和关系模型。 关系模型中最基本的概念是关系(relation)。表7.1给出的工资 表就是一个关系模型。
计算机应用基础
第7章 Access数据库
在这个阶段,程序与数据有了一定的独立性,程序与数据 分开,有了程序文件与数据文件的区别。数据文件可以长期保 存在外存上,对其可进行诸如查询、修改、插入、删除等操作。 但数据冗余度大,缺乏独立性,无法集中管理。 (3)数据库系统阶段。从20世纪60年代后期开始,根据 实际需要,发展了数据库技术。数据库是通用化的相关数据集 合,它不仅包括数据本身,而且包括数据之间的联系。为数据 库的建立、使用和维护而配置的软件称为数据库管理系 统(DBMS)。
计算机应用基础
第7章 Access数据库
4.报表 用窗体显示数据虽然很好,但却无法满足打印要求。 Access中的“报表”对象可以很好地解决这个问题。该对象的 作用就是实现数据的打印。 报表为查看和打印概括性的信息提供了最灵活的方法。可 以在报表中控制每一个对象的大小和显示方式,并可以按照所 需的方式来显示相应的内容。还可以在报表中添加多级汇总、 统计比较,甚至加上图片和图表。报表和窗体的建立过程基本 是一样的,只是一个显示在屏幕上,一个显示在纸上;窗体可 以有交互,而报表没有交互罢了。
Visual FoxPro VF 第7章 查询与视图(1)
• 注意:视图与查询最大的区别:视图是可 更新的,而查询不可以; • 查询有“查询去向”功能,可视图没有。
• 05-4考题: • 19、在Visual FoxPro中,关于查询和视图的正确描述 是______。 • A、查询是一个预先定义好的SQL SELECT语句 文件 • B、视图是一个预先定义好的SQL SELECT语句 文件 • C、查询和视图是同一种文件,只是名称不同 • D、查询和视图都是一个存储数据的表 • 30、在Visual FoxPro中,以下关于视图描述中错误的 是______。 • A、通过视图可以对表进行查询 • B、通过视图可以对表进行更新 • C、视图是一个虚表 • D、视图就是一种查询
• 33、删除视图myview的命令是______。 • A、DELETE myview VIEW • B、DELETE myview • C、DROP myview VIEW • D、DROP VIEW myview • 07-4考题: • 15、在Visual FoxPro中,以下关于查询的描述正 确的是______。 • A、不能用自由表建立查询 • B、只能用自由表建立查询 • C、不能用数据库表建立查询 • D、可以用数据库表和自由表建立查询
• 2、视图
• 如:CREATE VIEW e_w AS SELECT 职 工号,仓库号 FROM 职工
– 视图是一个定定的虚拟表,可以是本地的、远程的 或带参数的。 – 视图可引用一个或多个表,或引用其他视图。 – 视图是可更新的。 – 在关系数据库中,视图也称作窗口,即视图是操作 表的窗口,可以把它看作是从表中派生出来的虚表 (依赖于表,不独立存在)。 – 视图是数据库中的一个特有功能,只有在包含视图 的数据库打开时,才能使用视图。 – 视图一经建立就基本可以像基本表一样使用,适用 于基本表的命令基本都可以用于视图。 – 视图的建立:
大学数据库-第7章习题解答
〖7.2〗 在关系模式选课(学号, 课程号, 成绩)中,“学号→→课程号”正确吗?为什么?
答: 正确。因为学号能够多值决定课程号,且除了学号和课程号外还有成绩属性,它不是
平凡的多值依赖。
〖7.3〗 设有关系模式 R(A, B, C),数据依赖集 F={AB→C, C→→A},R 属于第几范式?为
什么?
〖7.6〗 在分解具有无损分解时,系统具有什么特点? 答:在分解具有无损分解时,系统具有下列特点:对关系模式 R 中满足函数依赖集 FD 的每
一个关系 r,都有 r=R1(r)⋈R2(r)⋈ …⋈Rk(r),即 r=mρ(r)。
〖7.7〗 试述查询优化的一般步骤。
答:① 把查询转换成语法树表示;② 把语法树转换成标准(优化)形式;③ 选择低层的
(7)若 R.B→R.A,R.C→R.A,则 R.(B, C)→R.A。
(8)若 R.(B, C)→R.A,则 R.B→R.A,R.C→R.A。
答:① 正确。② 正确。③ 正确。④ 正确。⑤ 正确。⑥ 正确。⑦ 正确。⑧ 不正确。例
如,(学号,课程号)→成绩,则不存在:学号→成绩,课程号→成绩。
〖7.5〗 试证明“3NF 的模式也一定是 2NF 模式”这个结论。
第 7 章习题解答
〖7.1〗 给出下列术语的定义,并加以理解。
函数依赖,部分函数依赖,完全函数依赖,传递函数依赖,候选关键字,主关键字,全
关键字,1NF,2NF,3NF,BCNF,多值依赖,4NF,连接依赖,5NF。
答:
函数依赖:设 R〈U〉是属性集 U 上的关系模式,X、Y 是 U 的子集。若对于 R〈U〉的
描述系的属性有:系名、系号、系办公室地点、人数;
描述学会的属性有:学会名、成立年份、地点、人数、学生参加某会有一个入会年
Access数据库应用基础教程习题集答案
Access数据库应用基础教程习题集答案Access数据库应用基础教程习题集答案第1章数据库系统概述1. 什么是数据库?什么是数据库系统?答:数据库(database)是存放数据的仓库,严格的讲,数据库是长期存储在计算机内,有组织的,可共享的大量数据集合。
数据库系统(database systems),是由数据库及其管理软件组成的系统。
它是为适应数据处理的需要而发展起来的一种较为理想的数据处理的核心机构。
它是一个实际可运行的存储、维护和应用系统提供数据的软件系统,是存储介质、处理对象和管理系统的集合体。
2. 什么是数据库管理系统?它有哪些主要功能?答:数据库管理系统(database management system)是一种操纵和管理数据库的大型软件,用于建立、使用和维护数据库,简称dbms。
它对数据库进行统一的管理和控制,以保证数据库的安全性和完整性。
数据库管理系统的主要功能有:数据定义、数据操作、数据库的运行管理、数据组织、数据库的保护、数据库的维护和通信。
3. 说出几种常用的数据模型。
答:层次模型、网状模型、关系模型。
4. 什么是关系模型?答:关系模型是用二维表的形式表示实体和实体间联系的数据模型。
5. 简述数据库设计的步骤。
答:需求分析、概念结构设计、逻辑结构设计、物理结构设计、数据库的建立和测试、数据库运行和维护。
第2章 SQL 语言简介1. 什么是SQL语言?SQL语言具有哪些特点和功能?答:SQL是一种数据库查询和程序设计语言,用于存取数据以及查询更新和管理关系数据库系统。
SQL的特点和功能有:查询,操作,定义和控制四个方面,SQL语言具有高度的非过程化,语言简洁,语义明显,语法结构简单,直观易懂的特点。
SQL语言即可以作为独立语言使用,用户可以在终端键盘上直接键入SQL命令对数据库进行操作,也可以作为嵌入式语言,嵌入到其他高级语言中。
2. SQL语言包含哪几个部分?答:SQL语言包含4个部分:数据定义语言(DDL-Data Definition Language)、数据查询语言(DQL-Data Query Language)、数据操纵语言(DML-Data Manipulation Language)、数据控制语言(DCL-Data Control Language)3. 在联接查询中,包含哪几类联接?答:联接可分为3类:(1)内部联接(典型的联接运算,使用类似于 = 或的比较运算符)。
第7章 数据库基础知识
教案讲稿第七章数据库基础知识[旧课复习]:复习内容:1.程序设计方法中常用方法。
2.结构化程序设计中三种基本结构。
复习目的:让学生巩固前一章节所学知识。
复习时长:大约5分钟。
[新课导入]:导入方式:复习Excel中数据操作,如排序、筛选、分类汇总导入目的:引出数据库及数据库管理系统等概念。
导入时长:大约5分钟[新课讲授]:重点:SQL语句中的insert、delect、update、select命令。
难点:查询语句select的筛选条件与分组统计。
方法:运用多媒体辅助教学,采用案例教学和任务驱动等教学法。
7.1 数据库系统的基本概念一、数据库基本概念1.数据数据(Data)实际上就是描述事物的符号记录。
计算机中的数据一般分为两部分:◆临时性数据:与程序仅有短时间的交互关系,随着程序的结束而消亡,一般存放于计算机内存中。
◆持久性数据:对系统起着长期持久的作用的数据,一般存放于计算机外存中。
数据结构:将多种相关数据以一定结构方式组合构成特定的数据框架,这样的数据框架称为数据结构。
2.数据库数据库(Database,DB)是数据的集合,它具有统一的结构形式并存放于统一的存储介质内,是多种应用数据的集成,并可被各个应用程序所共享。
数据库中的数据具有“集成”、“共享”的特点,即数据库集中了各种应用的数据,进行统一的构造与存储,从而使它们可被不同应用程序所使用。
3.数据库管理系统数据库管理系统(Database Management System,DBMS)是数据库的管理机构,它是一种系统软件,负责数据库中的数据组织、数据操纵、数据维护、控制及保护和数据服务等。
因此,数据库管理系统是数据库系统的核心且大多数DBMS 均为关系数据库系统。
4.数据库系统数据库系统(Database System,DBS)由如下5部分组成:•数据库(数据)•数据库管理系统(及其开发工具)•系统平台(软件)•硬件平台(硬件)•数据库管理员和用户(人员)这5个部分构成了一个以数据库为核心的完整的运行实体,称为数据库系统。
第7章 SELECT高级查询
1-5
《Oracle数据库应用与实践》.
(1).两表的笛卡儿积运算
条件:当两表仅通过SELECT子句和FROM子句建立连接,而不加 连接条件时,那么查询结果为两张表的笛卡儿积。 【例7-1】使用SELECT子句和FORM子句,从scott用户的emp表和dept
三种方法:
1.内连接查询 2.外连接查询 3.交叉连接
1-11
《Oracle数据库应用与实践》.
1.内连接查询
内连接:一般使用INNER JOIN关键字,INNER可以省略,默认表示内 连接。
内连接查询分为:
(1)等值连接 (2)不等连接 (3)自然连接
1-12
《Oracle数据库应用与实践》.
(1)等值连接
1-16
《Oracle数据库应用与实践》.
2.外连接查询
内连接查询:保证查询结果集中所有行都要满足连接条件
外连接查询 :返回的查询结果集中不仅包含符合连接条件行,还包含连 接运算符的左表或右表,或两个连接表中不符合连接条件的行。 对于外连接,Oracle可以使用加号(+)来表示,也可以使用 LEFT、RIGHT和FULL OUNTER JOIN关键字.。
1-19
《Oracle数据库应用与实践》.
SQL> SELECT dname,ename FROM scott.dept LEFT JOIN scott.emp ON dept.deptno= emp.deptno ; DNAME ENAME ---------------------SALES CLARK SALES ALLEN SALES WARD RESEARCH JONES 如果。。。
第7讲 复杂的数据检索
当 SELECT 语句中包含 GROUP BY 关键字时,在 该选择列表中所允许的项目是:
❖ 分组列。
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❖ 为分组列中的每个值只返回一个值的表达式
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第7章 复杂的数据检索
通用格式:
SELECT {columnA}[, …n],{ MAX(columnC) AS MaxC}[,…n]
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第7章 复杂的数据检索
COMPUTE
USE northwind
示例 1
SELECT productid, orderid
,quantity
FROM orderhist
ORDER BY productid, orderid
COMPUTE SUM(quantity)
GO
productid orderid quantity
第7章 复杂的数据检索
7.2.2 组合多个表中的数据
1. 联接概述 2. 使用内联接 3. 使用外联接 4. 使用交叉联接
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第7章 复杂的数据检索
1.
联接概述
从多个表中选择指定的字段
❖ 关键字 JOIN 指定要联接的表,以及这些 表联接的方式
❖ 关键字 ON 指定联接条件
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第7章 复杂的数据检索
USE northwind SELECT productid, orderid
,quantity FROM orderhist GO
productid orderid quantity
1
1
5
1
1
10
2
1
10
2
第7章 CS数据库和WEB数据库
第7章 CS数据库和WEB数据库在当今数字化的时代,数据库成为了信息存储和管理的核心工具。
其中,CS 数据库和 WEB 数据库是两种常见且重要的类型。
CS 数据库,即客户端服务器(ClientServer)数据库,是一种传统的数据库架构模式。
在这种模式下,数据库服务器负责存储和管理数据,客户端应用程序通过网络连接到服务器来访问和操作数据。
CS 数据库的优点之一是其强大的性能和数据处理能力。
由于服务器通常具有更强大的硬件资源和专门的数据库管理系统,能够高效地处理大量的数据请求和复杂的查询操作。
这使得它在处理大规模、高并发的数据访问时表现出色,适用于企业级的关键业务应用,比如金融交易系统、大型企业的资源管理系统等。
然而,CS 数据库也存在一些局限性。
首先,它的部署和维护成本相对较高。
需要专门的服务器硬件、操作系统和数据库软件,并且需要专业的数据库管理员进行管理和维护。
其次,客户端应用程序与服务器之间的紧密耦合可能导致灵活性不足。
如果需要对客户端进行升级或修改,可能会涉及到大量的工作和协调。
相比之下,WEB 数据库则是随着互联网的发展而兴起的一种数据库模式。
WEB 数据库通常基于浏览器服务器(BrowserServer)架构,用户通过浏览器访问网页应用程序来与数据库进行交互。
这种模式的最大优势在于其广泛的可用性和便捷性。
用户只需要一个能够连接到互联网的浏览器,就可以随时随地访问数据库中的数据,无需安装专门的客户端软件。
这使得 WEB 数据库在信息共享和远程访问方面具有很大的优势,适用于各种在线服务,如电子商务网站、社交网络平台、在线办公系统等。
另外,WEB 数据库的开发和维护相对较为简单。
由于基于网页技术,开发人员可以使用各种流行的网页开发框架和编程语言来构建应用程序,并且可以更方便地进行版本控制和更新。
同时,WEB 数据库也更容易与其他互联网技术进行集成,如云计算、移动应用等,为企业提供更灵活的信息化解决方案。
第7章数据库基础与Access2010—5
=、 >、 >=、 <、 <=、 <> And、Or、Not
逻辑运算符,分别代表与、或、非。 如:“>60 and <80”表示字段值范围只能为 60~80。
第14页
六、 查询计算
Access2010的查询不仅具有记录检索的功能,而且还具有 计算的功能。 查询除了可以用于在各个表中按用户的需要收集数据外,还 可以通过查询对数据执行计算操作。 其中预定义的计算包含求和、计数、最大值、最小值、平均 值、标准偏差以及其他类型的计算。在查询中主要进行的计 算如表7-9-2所示。 表7-9-2查询中的常用计算
第2页
2. 交叉表查询 交叉表查询可以计算并重新组织数据表的结构。这是一种 可以将表中的数据看成字段的查询方法。 交叉表查询将源数据或查询中的数据分组,一组在数据表 的左侧,另一组在数据表的上部,数据表内行与列的交叉 单元格处显示表中数据的某个统计值,如求和、求平均值 、统计个数、求最大值和最小值等。
在Access2010中,创建窗体有多种方法,使用窗体向导 创建窗体时,会对创建的每个环节进行提示,用户只须进 行简单的设置就能创建一个窗体,这种方法适用于较简单 的窗体创建,并且加快了窗体的创建过程。
第16页
具体操作步骤如下。 (1)在已经打开的一个数据 库中,在“创建”选项卡的 “窗体”组中,单击“窗体 向导”按钮,如图7-10-1所 示。 (2)在打开的“窗体向导” 对话框中“表/查询”下拉列 表框中选择“表:学生”作 为数据源,在“可用字段” 列表框中选择所需字段,然 后单击 按钮,完成后,单击 “下一步”按钮,如图7-102所示。
第19页
生物信息学7数据库的查寻
SRS系统
单位 欧洲生物信息研究所 英国基因组资源中心 英国基因组测序中心 法国生物信息中心 荷兰生物信息中心 网址 /srs6/ /srs6/ /srs6/ biogen.fr/srs6/ http://www.cmbi.kun.nl/srs6/
对于结构文件:
结构总结格式:结构的基本信息,可以看三维结构 ASN.1格式:
数据库查询、数据库检索和数据库搜索这三个 词经常混用。其实,数据库搜索在分子生物信息 学中有特定含义,它是指通过特定的序列相似性 比对算法,找出核酸或蛋白质序列数据库中与检 测序列具有一定程度相似性的序列。 例如,给定一个胰岛素序列,通过数据库搜索, 可以在蛋白质序列数据库SwissProt中找出与该 检测序列(query sequence)具有一定相似性的序 列。
对于PubMed文章:
引文(citation)格式:包含题目,文摘,MeSH主题词等 文摘格式:包含题目,文摘 ASN.1格式:文章以ASN.1格式出现 MEDLINE格式:文章以MEDLINE格式出现
对于蛋白和核酸文件:
GenBank/GenPept格式: 标准的GenBank或GenPept格式 Report格式:GenBank格式 ASN.1格式 FASTA格式 图形格式(Graphic View)
Entrez系统
检索模式(Search Modes)
www Entrez可以采用几种不同途径的检索方式:
名词列表格式(list term):当输入一检索词后, Entrez将列出与此相关的该领域中所有标准的检索词名 称, 此时,可选择一或多个标准名词去检索。 自动格式(automatic):当输入一个检索词后, 即自动检索,如果输入的检索词超过一个,则Entrez会 自动将之组合起来, 如果无结果,则可尝试将这多个检 索词用“ ”括起来。
第七章 数据查询基础
第七章数据查询基础✓查询学生信息✓查询成绩信息✓理解查询的机制✓使用SELECT语句进行条件查询✓掌握查询排序✓使用表达式、运算符和函数实现查询本章简介前一章学习了什么是SQL,并且介绍了SQL中的运算符,这些运算符除了在约束中使用之外,也经常会在UPDATE和DELETE语句中使用,此外还介绍了对数据库表进行增删改的SQL注意事项。
以及在操作MySQL数据时,经常使用到的一些函数,如字符处理函数,数学函数,以及日期函数等等。
预习作业请按以下步骤预习本章内容:1.带着以下任务,阅读、学习本章的相关资料2.标注出本章看不懂或存在疑惑的部分3.整理、记录学习中的问题4.熟记本章的英文单词请到中心听课前,完成下面的作业。
1.背诵英文单词(1)recordset:(2)order:(3)null:(4)trim:(5)replace:(6)floor:(7)ceiling:(8)round:(9)cast:(10)length:2.预习并回答以下问题阅读本章内容,在作业本上完成以下简答题(1)从学生表中查询全部数据,SQL语句应怎么写?(2)查询排序使用的关键字是什么?3.预习并完成编码题请按照id的倒序排列查询该表全部信息,表结构如图所示。
4.记录预习的问题记录学习中遇到的问题,填写于下面的横线上,以便集中探讨解决——————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————7.1SQL查询基础7.1.1查询机制简介在讲解查询之前,有必要说明一下查询的机制和查询的结果。
查询是针对表中已经存在的数据行而言的,可以简单的理解为“筛选”,将一定条件的数据抽取出来。
数据表在接收查询请求的时候,可以简单的理解为“它将逐行判断”,判断是否符合查询条件。
第七章常用中文数据库检索
第六章中文数据库检索第一节中国期刊全文数据库一、CNKI(/)简介CNKI(China National Knowledge Infrastructure),中国知识基础设施,简称CNKI 工程。
它由清华大学、清华同方发起,始建于1999 年6 月。
经过近十年努力,建成了世界上全文信息量规模最大的"CNKI 数字图书馆",并启动建设《中国知识资源总库》及CNKI 网格资源共享平台,通过产业化运作,为全社会知识资源高效共享提供最丰富的知识信息资源和最有效的知识传播与数字化学习平台。
CNKI工程已经建立了遍布全国并延伸至海内外的全球化网络化传播服务体系,形成在不同使用方式下的CNKI中心网站——各地镜像站点(CNKI 知识网络管理服务中心)——包库用户并以封闭式镜像站点和光盘为补充的知识生产与传播的良性循环体系。
CNKI 系列数据库产品包括《中国期刊全文数据库》、《中国优秀博硕士论文全文数据库》、《中国重要会议论文全文数据库》和《中国重要报纸全文数据库》等。
全部数据库包含近8000种期刊/杂志,300所大学研究院所博士硕士论文,1000种学术会议论文集,1000种重要报纸文章。
数据涵盖自然科学、工程技术、医学、农业、生物、文学、历史、哲学、政治、经济、法律、教育等领域的最新科技文献资料。
二、中国期刊全文数据库概况《中国期刊全文数据库》(China Journal Full-text Database)是目前世界上最大的连续动态更新的中国期刊全文数据库,目前收录7600 多种综合期刊与专业特色期刊的全文,内容覆盖自然科学、工程技术、农业、哲学、医学、人文社会科学等各个领域,其中核心期刊1735 种。
数据服务有网上服务、镜像、光盘等多种形式。
数据库收集时间从1994 年开始,近几年对其中的4000 多种期刊回溯至创刊,到2007年3 月31 日底,文献累积量达2290多万篇。
中国期刊全文数据库所收录的文献覆盖了现有的所有学科,以学科分类为基础,兼顾用户对文献的使用习惯,将数据库中的文献分为九个专辑,每个专辑下分为若干个专题,共计168 个专题。
数据库编程_第7章_多表查询_联接
结果集
buyer_name buyer_id Adam Barr Adam Barr Erin O’Melia Eva Corets Erin O’Melia Sean Chai 1 1 4 3 4 NULL
DEMO
列出所有教室的占用情况表 教室 教室名 上课时间段 课程名称 任课教 编号 称 师
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DEMO
教室 编号 教室名 上课时间 称 段 课程名称 任课教 师
还没有安排班级上课的教室, 还没有安排班级上课的教室,不出现在报表中
select room.RoomID, ments, class.time, , from Room inner join class on Room.RoomID = class.RoomID inner join course on class.courseid = course.courseid inner join professor on class.professorid = professor.professorid order by Room.RoomID;
某列=表 某列 表1.某列 表2.某列 某列
从多个表中选择指定的列
从多个表中选择指定的列
JOIN关键字---指定被联接的表,以及如何联接 ON关键字---指定联接条件
查询两个或者多个表,产生一个结果集
使用主键和外键做为联接条件 如果一个表是复合主键,当联接表时必须在ON子句中 引用整个主键。 使用指定的表的共有列来联接表 如果联接表的列名相同,则必须使用表名做为前缀。
案例分析2—要求
一家银行发行了新的信用卡,刚开始的时候推广得很好 ,但是逐渐废卡也越来越多(卡上的余额少于2元,并 且用户长时间不使用该卡),因此银行在二月份把这些 少于2元的卡从都数据库表中删除了,但是很快问题就 来了,用户发现他的卡再也不能使用而投诉,因此只能 再把这些卡恢复。
第7章--单表数据记录查询
mysql> SELECT * FROM goods;
+----+--------+--------------+--------------+--------------+-----------------------------+
| id | type | name | price | num
| add_time
+----+--------------+
| id | name |
+----+--------------+ | 4 | 休闲西服 | | 5 | 果汁 | | 3 | 水果糖 | | 2 | 牛奶糖 | | 1 | 西游记 | +----+--------------+
5 rows in set (0.00 sec)
— 13 —
7.2 简单数据记录查询
➢ 7.2.4 多条件查询
2
使用OR关键字查询
如果多条件查询中的条件使用OR关键字连接,表示只需要符合所有条件中的一个条件,此记录就 会被返回。
【实例7-8】
从goods表中查询type值为“糖类”或者“书籍”的记录。SQL语句及其执 行结果如下:
mysql> SELECT * FROM goods WHERE type='糖类' OR type='书籍';
➢ 7.2.3 查询指定记录
2
使用“>=”符号查询
【实例7-6】
从goods表中查询num值大于等于100的记录。SQL语句及其执行结果如下:
mysql> SELECT * FROM goods WHERE num>=100;
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【例7-12】查询teaching数据库中成绩不在80到90之
间的学生的学号、课程号和成绩。
USE teaching
SELECT * FROM sc
WHERE score NOT BETWEEN 80 AND 90
2018年10月27日星期六
4. 使用IN(属于)关键字 同 BETWEEN关键字一样, IN的引入也是为了更方 便地限制检索数据的范围。 语法格式为: 表达式 [NOT] IN (表达式1 , 表达式2 [,…表达式n]) 【例7-13】查询teaching数据库中“计算机”和“通 信”专业的学生的姓名、学号和专业。 USE teaching SELECT sname,sno,specialty FROM student WHERE specialty IN('计算机' , '通信')
2018年10月27日星期六
【例7-10】查询teaching数据库中“计算机” 专业的或“男”生的信息。 USE teaching SELECT * FROM student
WHERE specialty='计算机' OR ssex='男'
2018年10月27日星期六
3. 使用BETWEEN关键字 使用BETWEEN关键字可以更方便地限制查询数据 的范围。其语法格式为:
2018年10月27日星期六
2. 改变查询结果中标题的显示
T-SQL提供了在SELECT语句中操作列名的方法。用 户可以根据实际需要对查询数据的列标题进行改变, 或者为没有标题的列加上临时标题。 常用的方式:
①在列表达式后面给出列名。
②用“=”来连接列表达式。
③用AS关键字来连接列表达式和指定的列名。
2018年10月27日星期六
【例7-6】查询student表中所有学生的学号、姓名,将 结果中各列标题分别指定为汉字“学号”和“姓名”。 USE teaching
SELECT sno AS 学号, sname AS 姓名 FROM student
或:SELECT 学号=sno,姓名=sname FROM student 或:SELECT sno 学号 , sname 姓名 FROM student 注意:查询语句中改变的只是本次查询的列的显示标 题,对原表中列标题没有任何影响。
2018年10月27日星期六
7.1 SELECT查询语法
在SQL Server 中,可以通过SELECT语句来实现查 询,即从数据库表中检索所需要的数据。 查询可以包含: • 要返回的列 • 要选择的行 • 放置行的顺序 • 如何将信息分组的规范。
2018年10月27日星期六
SELECT语句的语法格式如下: SELECT select_list [INTO new_table_name ] FROM table_list [ WHERE search_conditions ] [ GROUP BY group_by_list ] [ HAVING search_conditions ]
2018年10月27日星期六
【例7-2】查询 teaching数据库course表中所有记录。 USE teaching SELECT * FROM course 用“*”表示表中所有的列,按用户创建表格时声明 列的顺序来显示所有的列。 【例7-3】查询 teaching数据库student表的专业名称, 滤掉重复行。 USE teaching SELECT DISTINCT specialty FROM student 用DISTINCT关键字可以过滤掉查询结果中的重复行。
2018年10月27日星期六
3. 计算列值 在进行数据查询时,经常需要对查询到的数据进行再 次计算处理。 T-SQL允许直接在SELECT语句中使用计算列。计算 列并不存在于表格所存储的数据中,它是通过对某些 列的数据进行演算得来的结果,所以没有列名。 【例7-7】查询sc表,按150分制计算成绩。 USE teaching SELECT sno, cno, score150=score*1.50 FROM sc
2018年10月27日星期六
5. 使用LIKE关键字(模糊查询) LIKE关键字搜索与指定模式匹配的字符串、日期或时间 值。模式包含要搜索的字符串,字符串中可包含4种通配 符的任意组合,搜索条件中可用的通配符。
通配符 % _ 含 义 包含零个或多个字符的任意字符串 任何单个字符
[]
[^]
代表指定范围内的单个字符,[]中可以是单个字符 (如[acef]),也可以是字符范围(如[a-f]) 代表不在指定范围内的单个字符,[^]中可以是单个字 符(如[^acef]),也可以是字符范围(如[^a-f])
2018年10月27日星期六
7.2.2 选择查询 投影查询时从列的角度进行的查询,一般对行不进行 任何过滤(DISTINCT除外)。但是,一般的查询都不 是针对全表所有行的查询,只是从整个表中选出满足 指定条件的内容,这就要用到WHERE子句进行选择查 询。 选择查询的基本语法如下: SELECT SELECT_LIST FROM TABLE_LIST WHERE SEARCH_CONDITIONS(选择查询的条件) 课本P131表7-1
2018年10月27日星期六
【例7-4】查询teaching数据库course表前三行 信息。 USE teaching SELECT top 3 * FROM course 【例7-5】查询teaching数据库course前50%。 USE teaching SELECT top 50 percent * FROM course
2018年10月27日星期六
1. 选择一个表中指定的列 使用SELECT语句选择一个表中的某些列,各 列名之间要以逗号分隔。 【例7-1】查询 teaching数据库student中学生 的姓名、性别和专业。 USE teaching SELECT sname, ssex, specialty FROM student
2018年10月27日星 期六
【例7-14】通配符的示例 LIKE 'AB%' 返回以“AB”开始的任意字符串。 LIKE 'Ab%' 返回以“Ab”开始的任意字符串。 LIKE '%abc' 返回以“abc”结束的任意字符串。 LIKE '%abc%' 返回包含“abc”的任意字符串。 LIKE '_ab' 返回以“ab”结束的三个字符的字符串。 LIKE ' [ACK]% ' 返回以“A”、“C”或“K”开始的任意字符串。 LIKE ‘ [A-T]ing’ 返回四个字符的字符串,结尾是“ing”,首字 符的范围从A到T。 LIKE 'M[^c]% ' 返回以“M”开始且第二个字符不是“c”的任 意长度的字符串。
2018年10月27日星期六
7. 复合条件查询 在 WHERE 子句中可以使用逻辑运算符把若干个搜索条 件合并起来,组成复杂的复合搜索条件。这些逻辑运算符 包括AND、OR和NOT。 AND运算符:表示只有在所有条件都为真时,才返回真。 OR运算符:表示只要有一个条件为真时,就可以返回真。 NOT运算符:取反。 当在一个 WHERE 子句中,同时包含多个逻辑运算符时, 其优先级从高到低依次是NOT、AND、OR。
2018年10月27日星期六
【例7-17】从teaching的student表中查询所有“计算机”
和“通信”专业的“女”生的信息。
USE teaching
SELECT * FROM student
WHERE ssex='女' AND(specialty='计算机'OR specialty ='通信')
2018年10月27日星期六
【例7-8】查询teaching数据库的sc表中成绩大 于等于60的学生的学号、课程号和成绩。 USE teaching SELECT * FROM sc WHERE score>=60
2018年10月27日星期六
2. 使用逻辑表达式 逻辑运算符共有3个,它们是: NOT:非,对表达式的否定。 AND:与,连接多个条件,所有的条件都成立时为真。 OR:或,连接多个条件,只要有一个条件成立就为真。 【例 7-9】查 询 teaching 数据库 中 “计 算 机” 专 业的 “男”生的信息。 USE teaching SELECT * FROM student WHERE specialty='计算机' AND ssex='男'
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1. 使用关系表达式 比较运算符用于比较两个表达式的值,共有7个: = (等于)、 < (小于)、 <= (小于等于)、 > (大 于)、 >= (大于等于)、 <> (不等于)、 != (不等 于)、!<(不小于)、!>(不大于)。 比较运算的格式为:expression { = | < | <= | > | >= | <> | != | !< | !> } expression 其中 expression 是除 text 、 ntext 和 image 外类型的表 达式。
电气与电子工程学院
所谓查询,就是对数据库内的数据进行检索、创建、 修改或删除的特定请求。数据库接受用 T-SQL 语言编 写的查询。使用查询可以按照不同的方式查看、更改 和分析数据。 查询设计是数据库应用程序开发的重要组成部分, 因为在设计数据库并用数据进行填充后,需要通过查 询来使用数据。查询分两大类:一类是用于数据检索 的选择查询,另一类是用于数据更新的操作查询。
[ ORDER BY order_list [ ASC | DESC ] ]