RNA分子生物学参考题及答案

名词解释：

1.imprinted RNA

某些基因呈不遵从孟德尔定律的亲源依赖性单等位基因表达, 其另一等位基因不表达或表达极弱,具有这种现象的基因被称为印迹基因。基因组印记(genomic imprinting)，又称遗传印记(genetic imprinting)或亲本印记(parental imprinting)，指控制某一表型的一对等位基因由于亲源不同而差异性表达，即机体只表达来自亲本一方的等位基因。由印记基因转录的非编码RNA即imprinted RNA。

2.染色质免疫共沉淀

在活细胞状态下固定蛋白质－DNA复合物，并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过免疫学方法沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，通过对目的片断的纯化与检测，从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起，通过超声或酶处理将染色质切为小片段后，利用抗原抗体的特异性识别反应，将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来。流程：甲醛处理细胞---收集细胞，超声破碎---加入目的蛋白的抗体，与靶蛋白-DNA复合物相互结合---加入ProteinA，结合抗体-靶蛋白-DNA复合物，并沉---对沉淀下来的复合物进行清洗，除去一些非特异性结合---洗脱，得到富集的靶蛋白-DNA复合物---解交联，纯化富集的DNA-片断---PCR分析。

3.lncRNA

Transcripts longer than 200 nucleotides that have little or no protein-coding capacity. Long ncRNAs can regulate gene expression through a diversity of mechanisms.

4.snRNA

细胞内有小核RNA(small nuclearRNA，snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA 剪接体的主要成分，参与mRNA前体的加工过程。现在发现有五种snRNA，其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸。snRNA一直存在于细胞核中，与40种左右的核内蛋白质共同组成RNA剪接体，在RNA转录后加工中起重要作用。另外，还有端粒酶RNA它与染色体末端的复制有关；以及反义RNA，它参与基因表达的调控。

5.piRNA

piRNA(piwi-interactin RNA), 是近年来新发现的一类内源性非编码的小RNA 分子, 大小集中在26-31nt, 能够特异性地同Argonuat 蛋白家族中的Piwi 亚家族蛋白结合,主要在生殖细胞中表达，与精子发生，生殖细胞成熟相关。

6.gRNA

gRNA即引导RNA，是引导RNA编辑的RNA分子，长度大约是60~80个核苷酸，是由单独的基因转录的，具有3’寡聚U的尾巴，中间有一段与被编辑mRNA精确互补的序列，5’端是一个锚定序列，它同非编辑的mRNA序列互补。在编辑时，形成一个编辑体，以gRNA内部的序列作为模板进行转录物的校正，同时产生编辑的mRNA。gRNA 3’端的oligo(U) 尾可作为被添加的U的供体。

7.RNA编辑

是指在RNA水平上改变遗传信息，导致成熟RNA编码序列和它的转录模板之间不匹配，信息改变的方式包括碱基取代、插入或缺失等。

8.细菌非编码RNA

细菌非编码RNA(small non-coding RNA, sRNA)是一类长度在50~500个核苷酸, 不编码蛋白质的RNA。迄今, 在各种细菌中共发现超过150多种sRNA。它们通过碱基配对识

别靶标mRNA, 在转录后水平调节基因的表达, 是细菌代谢、毒力和适应环境压力的重要调节因子。

9.基因沉默

基因沉默是指生物体中特定的基因由于种种原因不表达. 基因沉默发生在两种水平上，一种是由于DNA甲基化、异染色质化以及位置效应等引起的转录水平上的基因沉默（tran-scriptional gene silencing,TGS），另一种是转录后基因沉默(post-transcriptional gene silen-cing,PTGS)，即在基因转录后的水平上通过对靶标RNA进行特异性降解而使基因失活。在这两种水平上引起的基因沉默都与基因的同源性有关，称为同源依赖性的基因沉默(homology-dependent gene silencing,HDGS)。

10.mRNA剪接

mRNA前体去除掉内含子而保留外显子的修饰过程。

11.microRNA

MicroRNA (miRNA) 是一类由内源基因编码的长度约为22 个核苷酸的非编码单链RNA 分子,它们在动植物中参与转录后基因表达调控。到目前为止, 在动植物以及病毒中已经发现有4361 个miRNA 分子。大多数miRNA 基因以单拷贝、多拷贝或基因簇(cluster) 的形式存在于基因组中。

12.mRNA

messenger RNA，携带从DNA编码链得到的遗传信息，并以三联体读码方式指导蛋白质生物合成的RNA，由编码区、上游的5′非编码区和下游的3′非编码区组成。约占细胞RNA总量的3%～5%。真核生物mRNA的5′端带有7-甲基鸟苷-5′-三磷酸的帽子结构和3′端含多腺苷酸的尾巴。由核内不均一RNA剪接而成，可作为模板指导翻译产生具有特定氨基酸序列蛋白质的RNA。携带从DNA编码链得到的遗传信息，在核糖体上翻译产生多肽的RNA。

13.XIST

X-inactive specific transcript的缩写，属于Imprinted RNA，具有一些特性1.仅仅在多于一条X染色体的细胞中转录。2.仅仅转录两条X染色体中的一条，随机转录父方或母方来源的X染色体。3.不编码蛋白质，整个RNA作为功能分子。4.XIST从其转录的位点包裹产生它的X染色体，从而使染色体失活。

14.RISC

RNA-induced silencing complex (RISC)：一种RNA-蛋白质复合物，通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC，miRNA组装miRISC。RISCs（无论siRISC还是miRISC）包括两种类型：切割型和不切割型。现在的研究表明，RISC当中的AGO蛋白质决定了RISC是切割型的还是不切割型的。

15.Drosha

Drosha is a Class 2 RNase III enzyme responsible for initiating the processing of microRNA (miRNA), or short RNA molecules naturally expressed by the cell that regulate a wide variety of other genes by interacting with the RNA-induced silencing complex (RISC) to induce cleavage of complementary messenger RNA (mRNA). A microRNA molecule is synthesized as

a long RNA primary transcript known as a pri-miRNA, which is cleaved by Drosha to produce

a characteristic stem-loop structure of about 70 base pairs long, known as a pre-miRNA.

Drosha exists as part of a protein complex called the Microprocessor complex, which also contains the double-stranded RNA binding protein Pasha (also called DGCR8), which is essential for Drosha activity and is capable of binding single-stranded fragments of the pri-miRNA that are required for proper processing.