利用RNA-seq分析诱导性系统抗性(ISR)产生时匍匐翦股颖转录因子的表达变化
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摘 要 :研 究发 现 经 2,3一丁二 醇 的喷施 诱 导 ,匍 匐翦股颖植 株 可产 生对 草坪 草褐斑 病痛 原 立枯 丝核 茵 的抗 性 ,继 而通过 对 匍 匐翦股 颖被诱 抗 剂 2,3一丁二 醇 处理前 后 的转 录组进行 比较 ,发掘 匍 匐翦股 颖 ISR 抗 性 相 关转 录 因子 ,并研 究其表 达模 式 。 结果 表 明 :随 着诱 导 时 间的 递增 ,差 异表 达 基 因增 多,其 中 32 个转 录 因子相 关基 因可 归类为 13个转 录 因子 家族 。抗病 相 关 的转录 因子 27个 可 归类为 bHLH,Bzip, C2C2-CO-like,C2H2,C3H,NAC,WRKY,MYB,AP2一EREBP和 HSF共 1O个基 因家族 。呈持 续上 调 的转 录 因子 有 bHLH,C2C2一CO-like,1个 NAC 和 1个 MYB 转 录 因 子 ,呈 先 上调 再 下 调 表 达 的 有 W RKY 和 3个 AP2一EREBP 家族 转 录 因子 。呈 显 著 下 调 的 是 Bzip,C2H2,C3H,1个 NAC 和 1O个 HSF转 录 因子 。 同 时实时 荧光 定量 PCR验 证 了转 录组 测序 的 准确 性 。这 些转 录 因子 的共 同变化 导致 了匍 匐翦股 颖 ISR抗 性 的产 生。
收 稿 日期 :2017—06—05;修 回 日期 i2017—06—2O 基 金 项 目 :国 家 自然 科 学 基 金 “丁 二 醇 诱 导 匍 匐 翦 股 颖 抗
病 性 及 其 ISR机 理 研 究 (31360583)”资 助 作者 简 介 :史 毅 (1987一),女 ,甘 肃 兰 州 人 ,在读 博 士 。
植物 的诱 导抗 性 主 要 分两 类 ,植 物 系统 获 得 抗 性 (Systemic acquired resistance,SAR)和植 物 诱 导 系 统 抗性 (Induced systemic resistance,ISR)。SAR 通 常 报 道 为 由 水杨 酸信 号 通 路 和 NPR1(Nonexpresser of PR genes)基 因的诱导 产生 ,并且 基 于植 物 病程 相关 蛋
zobaeteria,PGPR)是 可 寄生在 植 物根 际并 且 具 有促 进 无性 繁殖 ,传播 迅速 ,冷 暖季型 禾本科 草 坪草 上该 病 害
植 物生 长 能力 的一 类 细 菌 的 总称 L1 ]。PGPR 被发 现 均发 生m]。为 了控制 草坪 病 害 ,杀 菌剂 的 使用 越 来 越
2
GRASSLAND AND TU RF(2018)
V o1.38 NO.1
物抗 病性 机理 的研 究 报道较 少 。 抗 病 诱导 过程 中 ,植 物基 因表达 的 变化 ,是诱 导抗
病性 产生 的根 本 原 因 ,而 基 因表 达 的 变 化 由调控 转 录 因子 (Transcript factors,TFs)与位 于基 因启 动子 前 的 顺式 表 达元 件 的结 合 而 产 生 。TFs在植 物生 长 发 育 , 以及逆 境胁 迫发 挥重 要 作用 。
第 38卷 第 1期
草 原 与 草 坪 2018年
利 用 RNA—seq分 析 诱 导 பைடு நூலகம் 系统 抗 性 (ISR)产 生 时 匍 匐 翦 股 颖 转 录 因子 的表 达 变化
史 毅 ,牛 奎举 ,马 晖玲
(甘肃 农业 大 学 草业 学 院/草业 生 态系统 教 育部重 点 实验室 /甘 肃省草 业工 程实 验室 /中一美草 地畜 牧业 可持 续发 展研 究 中心 ,甘肃 兰州 730070)
匍 匐 翦股 颖褐 斑 病病 原 为立 枯 丝 核 菌 (Rhizocto一
频繁 ,但 大量使 用 杀 菌剂 不 但 成 本 高 而且 严 重 污 染 环 境 。所 以 ,研究 人 员 开 始致 力 于 发 现安 全 的替 代 品 来 控制 草 坪病害 。PGPR挥发性 化 合物 是一 种 极有 前 景 的植 物真 菌病 害 控 制剂 ,然 而其 诱 导植 物产 生 抗 病 性 的作 用 机理 尚不 清 楚 ,对 其 作用 机 理 的深 入 了解 是 将 相关 化合 物应 用 于实际 的前 提 。
E-mail:shiyi214@ 126.corn 马 晖 玲 为 通 讯 作 者 。
白 (Pathogenesis—Related genes,PR)的 诱 导 而 起 作 用Ⅲ]。而 ISR通 常与茉 莉酸 /乙烯 (JA/ET)信 号通 路 有 关 ]。PGPR及 其 挥 发 性 化 合 物 诱 导产 生 的植 物 抗 病性 大多 报道 为 ISR类 型 ,通过 JA/ET通 路传播 信 号 ,引起 植物 全 面 广谱 的抵 抗 能力 。然 而 利 用转 录组 学分 析单 子 叶植物 被细 菌挥发 性化合 物处 理 后引 起植
关键 词 :匍 匐翦股 颖 ;诱 导 系统抗 性 ;转 录组 ;转录 因子 中图 分类 号 :Q 786 文献 标 志码 :A 文章编 号 :1009-5500(2O18)01—0O01一o9
植 物 根 际 益 生 菌 (Plant growth—promoting rhi— nia solani),多发 于 夏 季 ,该 菌 是 一 种 土 壤 习 居 菌 ,为
有 促生 能力 后 ,相 关 报 道指 出在 植 物 根 部 施 加 根 际益 生 菌 可 提 高 植 物 的 抗 病 能 力r3 ]。 2003~ 2004年 , Ryu等 [ 首 次报 道 PGPR的挥 发性 化合 物 可作 为诱 导剂 ,促进 拟南 芥 的生长 并且 对抗 病性 有 帮助 ,同时分 析 了 PGPR挥发 性化 合 物 的成 分 ,发 现 2,3一丁二 醇是 主要组 成物 ,证 明 了人 工 合 成 2,3一丁 二 醇 与 PGPR挥 发性化 合 物有 同样 的促 生 和抗 病 诱 导 效果 [7 ]。从 而 开启 了众 多 植 物 学 家 利 用 PGPR挥 发 性 化 合 物 诱 导 植 物抗 病性 的研 究 [9]。
收 稿 日期 :2017—06—05;修 回 日期 i2017—06—2O 基 金 项 目 :国 家 自然 科 学 基 金 “丁 二 醇 诱 导 匍 匐 翦 股 颖 抗
病 性 及 其 ISR机 理 研 究 (31360583)”资 助 作者 简 介 :史 毅 (1987一),女 ,甘 肃 兰 州 人 ,在读 博 士 。
植物 的诱 导抗 性 主 要 分两 类 ,植 物 系统 获 得 抗 性 (Systemic acquired resistance,SAR)和植 物 诱 导 系 统 抗性 (Induced systemic resistance,ISR)。SAR 通 常 报 道 为 由 水杨 酸信 号 通 路 和 NPR1(Nonexpresser of PR genes)基 因的诱导 产生 ,并且 基 于植 物 病程 相关 蛋
zobaeteria,PGPR)是 可 寄生在 植 物根 际并 且 具 有促 进 无性 繁殖 ,传播 迅速 ,冷 暖季型 禾本科 草 坪草 上该 病 害
植 物生 长 能力 的一 类 细 菌 的 总称 L1 ]。PGPR 被发 现 均发 生m]。为 了控制 草坪 病 害 ,杀 菌剂 的 使用 越 来 越
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GRASSLAND AND TU RF(2018)
V o1.38 NO.1
物抗 病性 机理 的研 究 报道较 少 。 抗 病 诱导 过程 中 ,植 物基 因表达 的 变化 ,是诱 导抗
病性 产生 的根 本 原 因 ,而 基 因表 达 的 变 化 由调控 转 录 因子 (Transcript factors,TFs)与位 于基 因启 动子 前 的 顺式 表 达元 件 的结 合 而 产 生 。TFs在植 物生 长 发 育 , 以及逆 境胁 迫发 挥重 要 作用 。
第 38卷 第 1期
草 原 与 草 坪 2018年
利 用 RNA—seq分 析 诱 导 பைடு நூலகம் 系统 抗 性 (ISR)产 生 时 匍 匐 翦 股 颖 转 录 因子 的表 达 变化
史 毅 ,牛 奎举 ,马 晖玲
(甘肃 农业 大 学 草业 学 院/草业 生 态系统 教 育部重 点 实验室 /甘 肃省草 业工 程实 验室 /中一美草 地畜 牧业 可持 续发 展研 究 中心 ,甘肃 兰州 730070)
匍 匐 翦股 颖褐 斑 病病 原 为立 枯 丝 核 菌 (Rhizocto一
频繁 ,但 大量使 用 杀 菌剂 不 但 成 本 高 而且 严 重 污 染 环 境 。所 以 ,研究 人 员 开 始致 力 于 发 现安 全 的替 代 品 来 控制 草 坪病害 。PGPR挥发性 化 合物 是一 种 极有 前 景 的植 物真 菌病 害 控 制剂 ,然 而其 诱 导植 物产 生 抗 病 性 的作 用 机理 尚不 清 楚 ,对 其 作用 机 理 的深 入 了解 是 将 相关 化合 物应 用 于实际 的前 提 。
E-mail:shiyi214@ 126.corn 马 晖 玲 为 通 讯 作 者 。
白 (Pathogenesis—Related genes,PR)的 诱 导 而 起 作 用Ⅲ]。而 ISR通 常与茉 莉酸 /乙烯 (JA/ET)信 号通 路 有 关 ]。PGPR及 其 挥 发 性 化 合 物 诱 导产 生 的植 物 抗 病性 大多 报道 为 ISR类 型 ,通过 JA/ET通 路传播 信 号 ,引起 植物 全 面 广谱 的抵 抗 能力 。然 而 利 用转 录组 学分 析单 子 叶植物 被细 菌挥发 性化合 物处 理 后引 起植
关键 词 :匍 匐翦股 颖 ;诱 导 系统抗 性 ;转 录组 ;转录 因子 中图 分类 号 :Q 786 文献 标 志码 :A 文章编 号 :1009-5500(2O18)01—0O01一o9
植 物 根 际 益 生 菌 (Plant growth—promoting rhi— nia solani),多发 于 夏 季 ,该 菌 是 一 种 土 壤 习 居 菌 ,为
有 促生 能力 后 ,相 关 报 道指 出在 植 物 根 部 施 加 根 际益 生 菌 可 提 高 植 物 的 抗 病 能 力r3 ]。 2003~ 2004年 , Ryu等 [ 首 次报 道 PGPR的挥 发性 化合 物 可作 为诱 导剂 ,促进 拟南 芥 的生长 并且 对抗 病性 有 帮助 ,同时分 析 了 PGPR挥发 性化 合 物 的成 分 ,发 现 2,3一丁二 醇是 主要组 成物 ,证 明 了人 工 合 成 2,3一丁 二 醇 与 PGPR挥 发性化 合 物有 同样 的促 生 和抗 病 诱 导 效果 [7 ]。从 而 开启 了众 多 植 物 学 家 利 用 PGPR挥 发 性 化 合 物 诱 导 植 物抗 病性 的研 究 [9]。