核酸免提取HBV-DNA检测方法性能评价

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核酸免提取HBV-DNA检测方法性能评价
张春娇;仲崇明
【摘要】目的评价核酸免提取HBV-DNA实时荧光定量PCR方法检测性能.方法以高、中、低3个浓度的血清各重复测定10次,作精密度评价;以定值标准血清重复3次测量,以偏差作准确性评价;以强阳性血清10倍倍比稀释,所得样本各重复3次测定,以示值与测定平均值作相关性分析,作线性评价;以定值标准样本,25次重复检测,以22次能检测出阳性值(非阴性值)为标准,作最低检测限评价;将免提取法和煮沸法所得结果作比对,以评价两种方法的相关性.结果高、中、低3个浓度的血清精密度均<5%;定值标准血清的测量值与认定值的对数值偏差不超过±0.5;HBV-DNA在3.71E1 IU/ML-3.71E8IU/ML范围内线性关系Y=0.987X+0.071,R=0.99;免提取核酸法与煮沸法比对,Y=0.979X+0.134,R=0.99.结论 HBV-DNA荧光定量PCR免提取核酸方法检测系统性能符合YY/T1182-2010《核酸扩增检测用试剂(盒)》的要求,实验操作简便,检测灵敏度高、准确性好,对临床应用有较好的性能保证.
【期刊名称】《实验与检验医学》
【年(卷),期】2018(036)004
【总页数】3页(P513-515)
【关键词】实时荧光定量PCR;乙型肝炎病毒;性能评价;质量控制
【作者】张春娇;仲崇明
【作者单位】南京中医药大学连云港附属医院检验科,江苏连云港 222004;南京中医药大学连云港附属医院检验科,江苏连云港 222004
【正文语种】中文
【中图分类】R446.61;Q528+.2
乙型病毒肝炎是由乙型肝炎病毒(HBV)引起的一种世界性传染疾病 [1]。

血液中乙型肝炎病毒DNA(HBV-DNA)可反映患者体内病毒活动状况,对临床诊断、判断预后、指导用药及治疗监测起到了重要作用[2-4]。

中国是病毒性肝炎的高发地区[5]。

快速、简便、特异、灵敏的实验室检测技术对HBVDNA 检测非常重要[6-12]。

目前,检测 HBV-DNA 方法较多,其中,煮沸法操作步骤繁琐,快速而性能良好的方法才能较好适应临床需求。

核酸免提取方法操作简便,本文通过分析核酸免提取HBVDNA荧光定量PCR法的精密度、准确度、线性、最低检测限,并将结果与传统煮沸法进行比对,评价该法的检测性能。

1 材料与方法
1.1 质控血清及标准血清为北京康彻斯坦生物技术有限公司产品,15例患者血清标本来源于我院诊治患者。

1.2 仪器与试剂 ABI-7500荧光定量基因扩增仪购于美国应用生物技术有限公司,八连管离心机购于苏州润达生物技术有限公司,免提取核酸法试剂及标准品均购于湖南圣湘生物技术有限公司,批号2017013。

煮沸法试剂及标准品均购于西安天
隆生物技术有限公司,批号20160902。

1.3 方法
1.3.1 HBV-DNA提取与检测煮沸核酸提取法,按照天隆公司HBV-DNA荧光定量PCR检测试剂盒说明书要求操作。

核酸免提取法,按照湖南圣湘生物技术
公司HBV-DNA荧光定量PCR检测试剂盒说明书要求操作。

1.3.2 验证指标及验证方法
1.3.2.1 精密度选用高、中、低三个浓度阳性血清为待测样本,各重复测定
10次,计算SD、CV。

以YY/T1182-2010《核酸扩增检测用试剂(盒)》精密
度要求(CV<5%)为评价标准。

1.3.2.2 准确度具有溯源性定值血清(北京康彻斯坦生物技术有限公司产品),HBV-DNA含量分别为 4.6E+06IU/ML,1.41E+03IU/ML 分别重
复 3次检测,计算测量平均值与认定值偏差,以YY/T1182-2010《核酸扩增检
测用试剂(盒)》准确度要求绝对值偏差不超过0.5个对数数量值为评判标准。

1.3.2.3 线性范围以煮沸法检测3.71E+8 IU/ML强阳性血清作为初始标本,依次向下10倍梯度稀释至3.71E7 IU/ML、3.71E6 IU/ML、3.71E5 IU/ML、3.71E4 IU/ML、3.71E3 IU/ML、3.71E2 IU/ML、3.71E1 IU/ML,每个样本(8 个)分别测定 3 次,取对数值后计算均值,将均值与理论值作线性回归分
析(Y为理论值,X为实测值),得出线性回归分析Y=A+BX和相关系数R,以YY/T1182-2010《核酸扩增检测用试剂(盒)》线性要求≥0.98为评判标准。

1.3.2.4 最低检出限根据 YY/T1182-2010 《核酸扩增检测用试剂(盒)》6.8.2 条款要求,采用乙肝两对半全阴血清稀释康彻斯坦定值质控品
1.41E+03IU/ML,稀释47倍,使其达到湖南圣湘生物技术有限公司试剂声明的最低检出限(30IU/ML),进行25次重复检测,以至少22次结果检测出数值为
最低检出限通过。

1.3.2.5 将2017年8月13日我院基因扩增实验室接收的15份血清严格按照煮沸法和免提取法说明书操作。

比较两种结果一致性,并将阳性结果取对数值,做相关性分析。

2 结果
2.1 精密度高、中、低3个浓度的精密度变异系数均小于5%。

该检测方法符合YY/T1182-2010《核酸扩增检测用试剂(盒)》精密度变异系数CV<5%的要求,
也符合厂家要求,见表1。

表1 精密度评价均值标准差变异系数低值中值高值3.15 0.09 2.89%5.31 0.08 1.51%8.10 0.06 0.80%
2.2 准确度示值 4.6E+6IU/ML、1.4E+3IU/ML 定值血清测量值均值分别为5.75E+6IU/ML,1.9E+3IU/ML,符合 YY/T1182-2010《核酸扩增检测用试剂(盒)》5.4.2a 检测国家标准品(或参考品)/国际标准品(或参考品),
绝对值偏差不超过±0.5个对数值的要求,见表2。

表2 准确度评价(示值、允许范围、测量值为对数值)示值允许范围6.66 3.15测量均值偏差评价6.76 3.28 6.16-7.16 2.65-3.65 0.1 0.13符合符合
2.3 线性 HBV-DNA 在 3.71E1 IU/ML-3.71E8IU/ML 范围内有良好线性
关系 Y=0.987X+0.071,R=0.99,符合 YY/T1182-2010《核酸扩增检测
用试剂(盒)》相关系数R≥0.98的要求,也满足试剂盒线性范围要求,如图1。

2.4 最低检出限示值 30IU/ML(对数值为 1.48)的样本25次检测结果有24
次出现定量值,对数均值1.53,与厂家声明的最低检出限(30IU/ML)相符合。

2.5 两种方法检测结果的比对,以煮沸法为参照X,以免提取法检测结果为Y,
两方法结果相关性分析,Y=0.979X+0.134,R=0.99,相关性良好,如图2。

煮沸法为阳性的标本,免提取法均为阳性,煮沸法为阴性的标本,有一例免提取法为阳性,且结果为78IU/ML,低于煮沸法的最低检出限100IU/ML。

说明免提取
法的灵敏度比煮沸法要高。

图1 线性评价
图2 两种方法比对
3 讨论
核酸免提取HBV-DNA实时荧光定量PCR检测性能评估结果显示:高、中、低
浓度的精密度变异系数分 0.8%、1.51%和 2.89%低于煮沸法[8,11,12];准确度与标准品的偏差分别为0.02和0,明显低于煮沸法[8,11,12];线性验证的相关系数 R=0.99,与煮沸法没有区别;最低检出限为30IU/ML,明显低于煮沸法[8,11,12]的最低检出限.核酸免提取方法可以及时准确检测出低拷贝的病毒,达到早诊断,早治疗的目的。

对15例患者血清用两种方法同时进行检测结果显示两种方法相关性良好,说明两种方法都可应用于临床,核酸免提取法有更好的精密度,准确度和灵敏度。

本文使用核酸免提取方法精密度、准确度、线性范围、最低检出限均符合YY/T1182-2010《核酸扩增检测用试剂(盒)》的要求,也
符合厂家说明书的要求。

目前,国内试剂主要采用煮沸法提取HBVDNA,然后通过实时荧光定量PCR检
测DNA载量。

煮沸法测量 HBV-DNA 的性能验证报告[8,11,12,13]显示煮沸法操作步骤繁多,需要高温裂解及高速离心沉淀,很容易造成DNA裂解不完全或离心沉淀不彻底,而造成DNA提取及检测结果误差,吸取废液转移反应管时也很容易造成DNA的丢失及交叉污染。

免提取核酸方法使用的核酸释放剂,无需高温裂解,且整个反应过程在一个管中进行,无需移液,减少了反应步骤,缩短了操作时间,提高了工作效率。

且避免了核酸的丢失、交叉污染和人工误差,提高了检测结果的准确度、灵敏度和可重复性[14,15]。

综上所述,核酸免提取HBV检测方法具有精密度高,准确度好,灵敏度好,操作简便等优点,实验操作及检测性能能较好地满足临床需求。

参考文献
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