疏水相互作用色谱

疏水相互作用色谱
在化学里，疏水性指的是一个分子（疏水物）与水互相排斥的物理性质。

举例来说，
疏水性分子包含有烷烃、油、脂肪和多数含有油脂的物质。

疏水性通常也可以称为亲脂性，但这两个词并不全然是同义的。

即使大多数的疏水物通常也是亲脂性的，但还是有例外，
如硅橡胶和碳氟化合物（fluorocarbon）。

疏水性分析
蛋白质肽链上各残基侧链对溶剂的相对亲水性就是一个关键的特征参量。

逊于二级结
构中各残基对溶剂的相对亲水性或奏水性的性质就是逊于二级结构的一个关键结构特征。

在天然状态，形成蛋白质的亲水性氨基酸残基多数就是处于分子的内部，构成亲水性内核，从而维系蛋白质的密切三维结构。

对于逊于二级结构这一局域空间结构的亲水性特性的构成，奏水性的变化规律等都就是尚待化解的问题。

逊于二级结构中亲水性特性的阐明和介绍，对蛋白质肽链的卷曲规律的重新认识和预测存有一定价值。

国际上一些生物学家，近
年来对这一工作积极开展了研究，并存有文献报导。

首先，运用t．j．richmond和f．m．richards在年明确提出的方法对逊于二级结构中每一残基侧链对溶剂的亲水性展开排序。

然后根据hubbard和blundell（）得出的帕累托展开推论。

该帕累托就是国际上比较通用型的一种帕累托。

如果残基侧链对溶剂相对碰触面积大于7%，那么该残基被称作奏水性的，在疏水性模式中用“i”则表示；如果残基侧链对溶剂相对碰触面积大于7%，则
表示该残基为溶剂亲水性的，在疏水性模式中用“o”则表示而立。

奏水性上限值的确认
是因为当氨基酸相对溶剂碰触面积大于7%时，则亲水性质类同，几乎不变化。

这样便排序出来各类型逊于二级结构单元奏水性模式。

从中可以获得逊于二级结构这一段肽链上每个
残基奏水性和构象的关系，以及构象和氨基酸序列模式的关系。

疏水性结合
在药物分子中大都会存有非极性部分，即为只由碳氢原子共同组成的部分，在受体分
子中所含非极性氨基酸残基，例如苯丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸，这些氨基酸残
基的侧链在构成蛋白质的立体结构时，可能将碰到一起构成活性部位的非极性区，称作奏
水袋（hy-drophobic pocket）。

在体内，药物的非极性部分和受体的非极性区的表面均
为有序排序的水分子所围困。

当药物与受体吻合至一定程度时，由于中间空间的增大，将
有序排序的水分子冷落过来。

出现回去水合现象（desolvation），这样便并使系统的熵
值升高，由此并使系统的自由能减少，而沦为较平衡的状态。

这种自由能的减少就是保持
药物与受体构成复合物的力，称作奏水性融合（hydrophobic binding），奏水性结合力
的含义就是不明晰的，因此，这种作用力的强度没明晰的计算方法，但它在药物与受体相
互作用中几乎就是普遍存在的。

据估计，两个次甲基间的疏水性促进作用可以放出
0.7kcal/mol的能量，尽管较弱，但当存有多个相等于次甲基间的疏水性融合时，其作用
力仍就是丰厚的。