采用实时荧光定量PCR法分析小熊猫胃肠道菌群

采用实时荧光定量PCR法分析小熊猫胃肠道菌群
曾燕;邓家波;牛李丽;蒲阳;李杨;勾堃;曾东;倪学勤
【期刊名称】《湖南农业大学学报（自然科学版）》
【年(卷),期】2018(044)006
【摘要】运用实时荧光定量PCR技术,分析1只临床死亡小熊猫胃肠道13种菌群的差异性.结果显示:检测的13种菌群在小熊猫不同肠段的数量有差异,肠杆菌科(Enterobacteriaceae)在各肠段的菌群丰度差异显著(P<0.05),其菌群丰度在空肠高达9.35;白色瘤胃球菌(Ruminococcus albus)和黄色瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)的数量在直肠最多,菌群丰度分别达5.29和3.91;其他菌群的数量均在结肠最多,其中溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens)、埃氏巨球形菌(Megasphaera elsdenii)和梭菌类群IV(Clostridium cluster IV)的数量在结肠中较高,菌群丰度分别为9.03、6.06和9.13;与胃相比,菌群丰度在小熊猫空肠、结肠和直肠差异显著(P<0.05).综合分析,小熊猫的空肠、结肠和直肠对其健康生长可能起着重要的作用,肠杆菌科的细菌数量最多且在不同肠段差异显著,是今后小熊猫胃肠道菌群研究值得关注的菌群之一.
【总页数】7页(P638-644)
【作者】曾燕;邓家波;牛李丽;蒲阳;李杨;勾堃;曾东;倪学勤
【作者单位】四川农业大学动物医学院,四川成都 611130;成都动物园,四川成都610081;成都动物园,四川成都 610081;成都动物园,四川成都 610081;四川农业大学动物医学院,四川成都 611130;四川农业大学动物医学院,四川成都 611130;四川
农业大学动物医学院,四川成都 611130;四川农业大学动物医学院,四川成都611130
【正文语种】中文
【中图分类】S858.99
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