微生物细胞大小的测定反思

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细胞大小测量方法
大小是细胞形态最基本的方面,细胞大小控制的基础是生长和分裂的共同作用。

环境微生物的细胞大小差异对其代谢通量、生物合成能力和营养物质的交换有重要的影响。

测定细菌的大小对于研宄环境中细菌的群落生态功能具有重要的意义。

而不同的环境中的细菌数量和其体积大小变化很大。

细胞的大小可以通过多种方法来测量(表1)。

表1细胞大小测量方法
以上方法均可对细细胞大小做比较准确的测量,但是其对于测量大小的同时对于获取其丰度信息,以及获得足够的样本量进行高通量测序等方面存在不同程度的局限。

针对以上环境中细胞大小的测量方法的局限,Portillo设计了利用不同孔径滤膜将细菌按照大小分级处理,间接对细菌大小进行测量的方法。

其利用密度梯度离心法从土壤基质中分离出微生物细胞,然后使其通过一系列孔径为5-0.2μm的滤膜。

利用显微镜测定每个过滤器上细胞的丰度,并通过16S rRNA 基因的高通量测序确定细胞在每个大小分级中的物种信息。

利用这种组合方法,确定了不同生物环境土壤中细菌和古菌的数量与大小分布情况。

研究发现细菌和
古菌群落具有不同的大小分布特征,大多数细菌的细胞大小要小于一般培养分离的细胞,超过60%的细胞直径超过1.2μm。

不同类型土壤中同一细菌的细胞大小分布与数量存在一定差异,表明特定分类群的细胞大小模式并不固定,与所处环境紧密相关。

另外还发现细胞平均大小与可培养率存在一定的相关性,较小的细胞往往难以培养。

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