云南完成铁皮石斛全基因组精细图谱绘制

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云南完成铁皮石斛全基因组精细图谱绘制
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来源:《硅谷》2013年第18期
近日,重大科技成果“云南完成铁皮石斛基因精细图谱绘制”新闻发布会在普洱举行。

由云南农业大学联合普洱市普洱茶研究院,在中国科学院昆明动物研究所的技术支持下,以云南农业大学校长盛军(普洱市委常委、市人民政府副市长)、昆明动物研究所研究员王文为组长的课题组全面展开了云南铁皮石斛基因组计划的实施。

课题组使用目前最新的第二代测序技术和近期刚刚引入国内的第三代单分子测序技术,用一年半时间,完成了铁皮石斛全基因组测序工作,绘制了铁皮石斛的全基因精细图谱。

目前,测序深度已达铁皮石斛基因组大小的200倍,测序结果覆盖95%的全基因组和97%的基因编码区,超过国际上同行复杂基因测序的最高水平。

通过进一步解析铁皮石斛基因组中的基因信息,发现48200多个蛋白质编码基因,其基因数目是目前所有已经测序的植物中最多的,从基因水平证实了铁皮石斛基因组的复杂性。

这一研究成果标志着铁皮石斛成为第一个进行全基因组测序的药食同用植物,也是云南省主导完成的第一个植物基因组。

铁皮石斛基因组的完成,为云南省铁皮石斛行业标准制定奠定了基础,也为中国从基因水平分析和制定铁皮石斛标准提供了科学依据。

(来源:云南省科技厅)。

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