蛋白质化学
第五章 蛋白质化学及氨基酸代谢
式中R为α-氨基酸的侧链基团,除甘氨酸外,其余19种 α-氨基酸分子中的α碳原子均为不对称碳原子,因此, 每种氨基酸都有D型和L型两种立体异构体,组成天然蛋 白质的α-氨基酸都为L型。
(一)氨基酸的分类
根据氨基酸侧链R基团的结构不同,可将它们分为脂 肪族氨基酸、芳香族氨基酸和杂环族氨基酸。(见P100)
蛋白质多肽链是否能形成α-螺旋体以及螺旋体的稳 定程度如何,与它的氨基酸组成和排列顺序有很大关系, 而且R 基的电荷性质,R 基的大小都会影响到螺旋的形 成。 有些氨基酸出现在α-螺旋中的次数要比其它氨基酸 的多,例如丙氨酸带有小的、不带电荷的侧链,它很适 合填充在α-螺旋构象中。 而有些氨基酸则基本上不会出现在α-螺旋中,如多 肽链中有脯氨酸时α-螺旋就被中断,这是因为脯氨酸的 α-亚氨基上氢原子参与肽键形成后就再没有多余的氢原 子形成氢键,所以在有脯氨酸存在的地方就不能形成α螺旋结构。
酰胺平面:酰胺平面是构成主链构象的基本单位, 是多肽链中从一个α -碳原子到相邻α -碳原子之间的 结构。
0.147nm
C=N
0.127nm
0.132nm
(1)肽单位是一个刚性的平面结构,肽键中羰基碳原子与 氮原子之间所形成的键不能自由旋转,这样使得肽单位 所包含的六个原子处于同一个平面上,这个平面又称为 酰胺平面(amide plane)或肽平面(peptide plane).
(2)肽平面中羰基氧与亚氨基氢几乎总是处于相反的位 置,虽然肽平面中的羰基氧与亚氨基氢可以有顺式和反 式两种排布,但由于连接在相邻两个α -碳上的侧链基 团之间的立体干扰不利于顺式构象的形成,而有利于 伸展的反式构象的形成,所以蛋白质中几乎所有的肽 单位都是反式构象。
动物生物化学 第二章 蛋白质
蛋白质分子为右手-螺旋。
(1)-螺旋
-螺旋
表 几种螺旋结构参数
结构类型 残基/圈 1个氢键环的原子数 每个残基高度(nm) Φ Ψ
310螺旋 3.0
位 置
及顺序分析,
的 然后同其它方法分析的肽段进行比较,
确 确定二硫键的位置。
定
2.4 蛋白质的高级结构
2.4.1 肽单位平面结构和二面角
O
O
O
H
H
H
H2N
C
C
N H
C
C
N H
C
C
R
R
R
N端
肽单位
肽单位
O
H
H
NH C C N C COOH
H
R
R
C端
肽单位: 主肽链中的重复单位
肽键平面—由于肽键的双键性质,使得形成肽键的N、C原子以及它们相 连的四个原子形成一个平面,这个平面就叫肽键平面。
蛋白质构件分子是氨基酸。 氨基酸是蛋白质的基本单位。 自然界存在的氨基酸有300多 种,但合成蛋白质的氨基酸只 有20种,都属于α-氨基酸,其 中除甘氨酸外,其余都是L-α氨基酸。
蛋白质分子中的20种 氨基酸在DNA分子中有它 们特异的遗传密码相对应,
因而也称编码氨基酸 (Coding amino acid)。 新近发现的硒代半胱氨酸 (SeCys)也是一种编码 氨基酸。
由 两 个 氨 基 酸 组 成 的 肽 称 为 二 肽 , 由 多 个 氨 基酸组成的肽则称为多肽。因为多肽呈链状, 所以又称为多肽链。组成多肽的氨基酸单元称 为氨基酸残基。
第三章 蛋白质化学
应用:用于蛋白质的部分水解。一级结构分析。
二、氨基酸的结构和分类
(一)常见氨基酸
1、结构通式
R
R
2、20种氨基酸在结构上的共同特点 (1)除脯氨酸以外都是α-氨基酸;脯是 α-亚氨基酸。 (2)除了甘氨酸均有手性碳,具有旋光性。 (3)除甘氨酸外,蛋白质分子中的氨基酸都是L-氨基酸。 (4)不同的α-氨基酸其R基侧链不同,其余部分都相同。
[质子受体] pH=pK’+lg
[质子供体]
应用:
(1)已知各离子浓度,求溶液的pH值。
(2)根据氨基酸解离基团的pK值,可计算出任何pH 条件下,各离子浓度的比例。
例题1:计算赖氨酸的ε -NH3+20%被解离时 的溶液pH值。
解:首先写出解离方程
根据: 所以:
pK3=10.53 pH=pK’+lg
等电点时,氨基酸的溶解度最小
小结
引入等电点概念之后,AA的解离情况与环境PH的关 系可以描述为:
A、当环境PH=PI时氨基酸以两性离子形式存在。 B、当环境PH<PI时(相当于加入了H+)氨基酸带正
电荷,环境PH偏离等电点越远,氨基酸带正电荷越 多;电泳时移向负极。 C、当环境PH>PI时(相当于加入了OH-)氨基酸带 负电荷,环境PH偏离等电点越远,氨基酸带负电荷 越多;电泳时移向正极。
①解离方程:略 ②Glu-和Glu=各50%时pH为9.67 ③pH<3.22时 Glu总带正电荷 ④Glu±和Glu-缓冲范围pH4.25左右
(三)氨基酸的重要化学性质
1、α -NH2参与的重要的反应 (1)与亚硝酸的反应
NH2 R-CH-COOH + HNO2
生物化学第一章蛋白质化学
组成蛋白质的元素:
主要元素组成: 碳(C) 50% ~ 55% 氧(O) 19% ~ 24% 氢(H) 6% ~ 8% 氮(N) 13% ~ 19% 硫(S) 0% ~ 4%
少量的 磷(P)、铁(Fe)、铜(Cu)、锌(Zn)和碘(I)等
蛋白质元素组成特点:
各种蛋白质含氮量很接近,平均为16%
故可根据以下公式推算出蛋白质的大致含量: 样品中蛋白质的含量〔g〕
脱水作用
脱水作用
--
碱
酸-
-
-
-- -
不稳定的蛋白质颗粒
带负电荷的蛋白质
溶液中蛋白质的聚沉
〔三〕蛋白质的变性、沉淀与凝固
1. 蛋白质的变性〔denaturation〕 在某些理化因素作用下,蛋白质的构
象被破坏,失去其原有的性质和生物活性, 称为蛋白质的变性作用。
变性后的蛋白称为变性蛋白质。
常见的变性因素:
2. 极性中性氨基酸
R-基含有极性基团; 生理pH条件下不解离。 包括7个:
甘氨酸(Trp)、 丝氨酸(Ser)、
半胱氨酸(Cys)、 谷氨酰胺(Gln)、 天冬酰胺(Asn)、 酪氨酸(Tyr) 苏氨酸(Thr)
3. 酸性氨基酸
R-基有COOH(COO-)
带负电荷
4. 碱性氨基酸
R-基有NH2(NH3+)
牛胰核糖核酸酶的变性与复性
尿素或盐酸胍 β-巯基乙醇
透析
有活性
无活性
〔二〕一级构造与功能的关系 1.一级构造相似的蛋白质功能相似 一级构造不同的蛋白质功能不同
胰岛素的一级构造及种属差异
一级构造不同的蛋白质功能不同
ACTH 促肾上腺素皮质激素
MSH 促黑激素
蛋白质化学
蛋白质的结构与功能一、名解解释:1.氨基酸的等电点2.蛋白质一级结构和高级结构3.α-螺旋4.蛋白质变性和变构效应5.盐析6.电泳二、填空:1.氨基酸的等电点用()表示,其含义是()。
2.当氨基酸溶液的pH=pI时,氨基酸以()离子形式存在。
3.具有紫外线吸收能力的氨基酸有()()(),其中以()吸收最强。
4.在常见的20种氨基酸中,结构最简单的氨基酸是()5.蛋白质中氮元素的含量比较稳定,平均值为()。
6.在一定实验条件下()是氨基酸的特征常数。
7.天然蛋白质中的所有的氨基酸都是()型氨基酸。
8.英国化学家()用()方法首次测定了()的一级结构,并于1958年获诺贝尔化学奖。
9.维系蛋白质二级结构的主要的力是()10.参与蛋白质构象的力有()()()()()和()11.镰刀型红细胞贫血病是由于血红蛋白的()变异产生的一种分子病。
12.变性蛋白质的主要特征是()其次是()性质改变和()降低。
13.血红蛋白分子是由两个()亚基和两个()亚基组成的四聚体,在血红素中央的()是氧结合的部位。
14.血红蛋白与氧结合呈现()曲线,而肌红蛋白为()曲线。
15.蛋白质分子在直流电场中的迁移速率的大小与蛋白质分子本身的()()()有关。
16.带负电荷的氨基酸有()氨基酸与()氨基酸两类,.带正电荷的氨基酸包括()、()、()。
17.带有芳香族侧链的氨基酸有()()()。
18.带有硫元素的氨基酸有()()。
答案1.PI 当两性分子的静电荷为零时的PH值2.两性3.Trp Phe Tyr Trp4.甘氨酸5.16/1006.等电点7.L-α8.Sanger 手工操作胰岛素9.氢键10.范德华力氢键疏水作用力离子键配位键二硫键11.蛋白质一级结构12.生物功能消失物理化学,溶解度13.2个α-亚基和2个β-亚基Fe2+14.S 双15.大小形状电荷16. 天冬氨酸谷氨酸组氨酸赖氨酸精氨酸17.苯丙氨酸色氨酸酪氨酸18.蛋氨酸半胱氨酸三、选择题:1.氨基酸在等电点应具有的特点是()a 不具正电荷b 不具负电荷c A和B均对d 溶解度最大e 在电场中泳动2.下列有关α-螺旋的叙述,哪一项是错误的()a 氨基酸残基之间形成的=C=O与H-N=之间的氢键使α-螺旋稳定。
蛋白质的化学
(a)极性氨基酸:Tyr,Cys,Ser,Thr,Asn,Gln,Met,
Trp;
(b)非极性氨基酸:Gly,Ala,Val,Leu,Ile,Pro,Phe。
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(二)氨基酸的理化性质:
1.两性解离及等电点:
氨基酸分子是一种两性电解质。
通过改变溶液的pH可使氨基酸分子的解离状态发生 改变。
三级结构:所有原子空间位置
四级结构:蛋白质多聚体
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三、蛋白质的三级结构
蛋白质的三级结构是指蛋白质分子或亚基内所有原子 的空间排布,也就是一条多肽链的完整的三维结构。
维系三级结构的化学键主要是非共价键(次级键),如疏 水键、氢键、盐键、范氏引力等,但也有共价键,如二 硫键等。
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(一)氨基酸的分类:
根据R侧链基团解离性质的不同,将氨基酸进行分类:
1.酸性氨基酸——Glu,Asp;侧链基团在中性溶液中解离后带 负电荷的氨基酸。
2.碱性氨基酸——His,Arg,Lys;侧链基团在中性溶液中解 离后带正电荷的氨基酸。
3.中性氨基酸—— 侧链基团在中性溶液中不发生解离,因而
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β- 折 迭
β-折迭是由若干肽段或肽链排列起来以α-C为转
折点,形成的扇面状片层构象,其结构特征为:
⑴ 由若干条肽段或肽链平行或反平行排列组成片状 结构;
⑵ 主链骨架伸展呈锯齿状; ⑶ 借相邻主链之间的氢键维系。
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2.与肽键相连的六个原子构成刚性平面结构,称为肽单元或 肽键平面。但由于α-碳原子与其他原子之间均形成单 键,因此两相邻的肽键平面可以作相对旋转。
生物化学第三章蛋白质化学名词解释
第三章蛋白质化学1蛋白质:是一类生物大分子,由一条或多条肽链构成,每条肽链都有一定数量的氨基酸按一定序列以肽键连接形成。
蛋白质是生命的物质基础,是一切细胞和组织的重要组成成分。
2标准氨基酸:是可以用于合成蛋白质的20种氨基酸。
3、茚三酮反应:是指氨基酸、肽和蛋白质等与水合茚三酮发生反应,生成蓝紫色化合物,该化合物在570mm波长处存在吸收峰。
4、两性电解质:在溶液中既可以给出H+而表现出酸性,又可以结合H+而表现碱性的电解质。
5、兼性离子:即带正电和、又带负电荷的离子。
6、氨基酸的等电点:氨基酸在溶液中的解离程度受PH值影响,在某一PH值条件下,氨基酸解离成阳离子和阴离子的程度相等,溶液中的氨基酸以兼性离子形式存在,且净电荷为零,此时溶液的PH值成为氨基酸的等电点。
7、单纯蛋白质:完全由氨基酸构成的蛋白质。
8、缀合蛋白质:含有氨基酸成分的蛋白质。
9、蛋白质的辅基:缀合蛋白质所含有的非氨基酸成分。
10、肽键:存在于蛋白质和肽分子中,是由一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基缩合时形成的化学键。
11、肽平面:在肽单元中,羧基的π键电子对与氮原子的孤电子对存在部分共享,C-N键具有一定程度的双键性质,不能自由旋转。
因此,肽单元的六个原子处在同一个平面上,称为肽平面。
12、肽:是指由两个或者多个氨基酸通过肽键连接而成的分子。
13、氨基酸的残基:肽和蛋白质分子中的氨基酸是不完整的,氨基失去了氢,羧基失去了羟基,因而称为氨基酸的残基。
14、多肽:由10个以上氨基酸通过肽键连接而成的肽。
15、多肽链:多肽的化学结构呈链状,所以又称多肽链。
16、生物活性肽:是指具有特殊生理功能的肽类物质。
它们多为蛋白质多肽链的一个片段,当被降解释放之后就会表现出活性,例如参与代谢调节、神经传导。
食物蛋白质的消化产物中也有生物活性肽,他们可以被直接吸收。
17、谷胱甘肽:由谷氨酸、半胱氨酸和甘氨酸通过肽键连接构成的酸性三肽,是一种生物活性肽,是机体内重要的抗氧化剂。
生物化学蛋白质化学
极性不带电氨基酸
O
O
O
H 2N C H C O H Nhomakorabea二、蛋白质的分类
• 2)根据溶解度: • 清蛋白:白蛋白,溶于水; • 精蛋白:溶于水和酸性溶液,含碱性氨基酸多 • 组蛋白:溶于水及稀酸,含碱性氨基酸较多 • 球蛋白:微溶于水而溶于稀中性盐溶液 • 谷蛋白:不溶于水、醇及中性盐溶液,溶于稀
酸、稀碱,如麦蛋白。 • 醇溶蛋白:不溶于水,溶于70~80%乙醇; • 硬蛋白:不溶于水、盐、稀酸、稀碱。
组成蛋白质的元素
组成蛋白质的元素有:C、H、O、N和S,这些元素 在蛋白质中的组成百分比约为:
C:50~55% H:6~8% O:20~23% N:15~18 % S:0~4% 其它(P、Cu2+、Mn2+ 、Fe3+等) 微量
蛋白质N平均含量为16%的特点作为凯氏(Kjedahl) 定氮法测定蛋白质含量的计算依据。
蛋白质含量 = N含量×6.25
二、蛋白质的分类
1. 分类依据——蛋白质不能按化学结构分类 常用依据:生物来源、理化性质、分子形状、化学 组成等。 2. 三种分类方法——按组成分类常用 1)根据分子形状:球状和纤维状蛋白; 球状蛋白:轴比小于10,较易溶解。 常见:血红蛋白,血清球蛋白,豆类球蛋白等。 纤维状蛋白:轴比大于10,不溶于水。 常见:羽毛中的角蛋白和蚕丝中的丝蛋白等。
Cα如是不对称C(除Gly),则: 1. 具有两种立体异构体 [D-型和L-型] 2. 2. 具有旋光性 [左旋(-)或右旋(+)]
生物化学——第一章蛋白质
丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline 甲硫氨酸 Methionine
非极性氨基酸
O H 2N CH C OH
CH CH 3 CH 3
丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline 甲硫氨酸 Methionine
谷氨酸(二羧基一氨基) pK1 pK2 pK3
碱性氨基酸:pI = (pK2 + pK3 )/2
赖氨酸(一pK羧1 基二p氨K2基pK)3
• 中性氨基酸pI一般为6.0答案:
• 提问:为什么偏酸性?
• -COOH解离程度略大于-NH2 • 提问:酸性氨基酸的pI(更偏酸、更偏碱)?
• 更酸(3.0 左 右)
非极性氨基酸
O H 2 N CH C OH
CH 2 CH CH 3 CH 3
丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline 甲硫氨酸 Methionine
非极性氨基酸
O H 2 N CH C OH
CH CH 3 CH 2 CH 3
丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline 甲硫氨酸 Methionine
非极性氨基酸
H N
CO OH
吡咯
丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline 甲硫氨酸 Methionine
2、分类
各种氨基酸的区别在于侧链R基的不同。 20种基本氨基酸按R的极性可分为: (1)非极性氨基酸 (2)极性氨基酸 (不带电荷氨基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸)
第4章蛋白质的化学第五节 蛋白质的理化性质
食品生物化学
二、蛋白质的两性解离和等电点
蛋白质和氨基酸一样,既能和酸作用又能和碱作用,是两 性 电 解 质 。 分 子 中 , 除 氨 基 末 端 的 α-NH2 和 羧 基 末 端 的 αCOOH,肽链内多种氨基酸残基的R侧链还有许多可离子化基 团,如-NH3、-COOH、-OH等。在一定的pH条件下,这 些基团解离而使蛋白质分子带电荷。其解离过程和带电状态取 决于溶液的pH。当某一pH条件时,蛋白质解离成阳、阴离子 的数量相等,净电荷为零,此时溶液的pH称为蛋白质等电点。 等电点时蛋白质以兼性离子状态存在。
NH2 P
COO-
蛋白质的阴离子
三、蛋白质的溶解性
蛋白质在低盐溶液中溶解度较大,在高盐溶液中溶解度下 降。前者称为盐溶,后者称为盐析。当盐溶液较低时,蛋白质 颗粒上吸附盐离子,使蛋白质颗粒带有同种电荷而相互排斥, 并加强与水分子的作用,溶解度增加。
食品生物化学
在高盐溶液中,盐不仅与水的亲合性很强,而且又是强电 解质。一方面从蛋白质中夺取水分,破坏蛋白质表面的水膜; 另一方面,由于盐离子浓度比较高,可以大量中和蛋白质颗粒 上的电荷,破坏了蛋白质胶体的稳定性,出现沉淀。
食品生物化学
第四章 蛋白质的化学
• 第一节 概述 • 第二节 蛋白质的化学组成 • 第三节 氨基酸的化学 • 第四节 蛋白质的结构 • 第五节 蛋白质的理化性质 • 第六节 蛋白质的分类 • 第七节 食物中的蛋白质 • 第八节 食品加工储藏对蛋白质的影响
食品生物化学
学习目标
1.掌握常见氨基酸的种类、结构/重要的性质以及常见氨 基酸名称和符号。
食品生物化学
五、蛋白质的呈色反应
1.双缩脲反应 尿素在加热时,两分子尿素缩合生成双缩脲并放出一分子 氨。双缩脲在碱性溶液中能与硫酸铜反应产生紫红色络合物。 蛋白质分子中含有许多与双缩脲结构相似的肽键,因此蛋白质 分子与碱性铜溶液中的铜离子形成紫红色络合物的反应,称为 双缩脲反应。碱性铜溶液称为双缩脲试剂。该反应可用于蛋白 质和多肽的定性、定量测定,也可用于蛋白质水解程度的测定。
蛋白质化学
一、蛋白质化学1.名词解释(1).必需氨基酸:对于人和动物有一些氨基酸自身不能合成,必须从食物中获得,成为必需氨基酸。
常见的必需氨基酸有赖氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苏氨酸、甲硫氨酸。
(2)肽键:一个氨基酸的氨基与另一氨基酸羧基脱水形成的酰胺键。
(3)蛋白质一级结构:蛋白质分子中氨基酸的排列顺序就是蛋白质的一级结构。
(4)盐析和盐溶:向蛋白质溶液中加入较高浓度的中性盐,会使蛋白质的溶解度降低而从溶液中析出的现象称为盐析;相反向蛋白质溶液中加入少量中性盐使蛋白质溶解度加大的想象称为盐溶。
(5)蛋白质的变性和复性作用:蛋白质的一级结构保持不变而空间结构遭到破坏,理化性质发生变化并丧失生物学活性的现象称为变性;在一定条件下结构已变松散的变性蛋白质恢复其天然构象的过程称为复性。
2.填空题(1)蛋白质的特征性元素是(N),530mg某种物质中该元素含量为10.7mg,这种物质的蛋白质含量为(12.62%)。
(2)蛋白质的紫外吸收高峰是(280)nm,这是由于(苯丙氨酸)、(络氨酸)、(色氨酸)引起的。
(3)蛋白质二级结构包括(α螺旋)、(β折叠)、(β转角)(无规卷曲)等几种构象,其主要靠(氢)键来维持。
(4)当氨基酸处于等电点是以(两性)离子形式存在。
(5)中性盐引起蛋白质沉淀是由于胶体(水化膜)和(带电性)两个稳定因素被破坏的结果。
(6)在SDS-PAGE电泳中,蛋白质的迁移率只与(相对分子质量)有关。
3.选择题(1)His的PK1=1.82,pK2=6.00,pK3=9.17,其pI为(7.59)。
(2)下列氨基酸中不引起偏振光旋转的是(Gly)。
(3)下列哪些构象单元不属二级结构构象(结构域)。
(4)下列关于肽键的论述哪些是正确的(具有部分双键的特征、肽键的链长比正常C-N 键短、参与肽键形成的两个氨基酸残基的α碳原子呈反式结构)。
(5)Glu的pK1=2.19,pK2=4.25,PK3=9.67,当溶液pH3.5时他在电场中的移动方向是(移向正极)。
有机化学第十三章 蛋白质
结合蛋白
由简单蛋白与其它非蛋白成分结合而成, 色蛋白:由简单蛋白与色素物质结合而成。如血红 蛋白、叶绿蛋白和细胞色素等。 糖蛋白:由简单蛋白与糖类物质组成。如细胞膜中 的糖蛋白等。 脂蛋白:由简单蛋白与脂类结合而成。 如血清-, -脂蛋白等。 核蛋白:由简单蛋白与核酸结合而成。如细胞核中 的核糖核蛋白等。
在骨骼肌中与粗丝紧密缔合在一起的是细丝(thin filament), 它由肌动蛋白组成。肌动蛋白以两种形式存在,球状肌动蛋白 (G—肌动蛋白)和纤维状肌动蛋白(F—肌动蛋白)。纤维状肌动 蛋白实际上是一根由G—肌动蛋白分子(分子量为46000)缔合而 成的细丝。两根F—肌动蛋白细丝彼此卷曲形成双股绳索结构。
(2)依据蛋白质的组成分类
按照蛋白质的组成,可以分为 简单蛋白(simple protein) 和结合蛋白(conjugated protein) 。
简单蛋白
又称为单纯蛋白质;这类蛋白质只含由-氨基酸组成的肽 链,不含其它成分。 1,清蛋白和球蛋白:albumin and globulin广泛存在于动物 组织中。清蛋白易溶于水,球蛋白微溶于水,易溶于稀酸 中。 2,谷蛋白(glutelin)和醇溶谷蛋白(prolamin):植物蛋白, 不溶于水,易溶于稀酸、稀碱中,后者可溶于70-80%乙 醇中。 3,精蛋白和组蛋白:碱性蛋白质,存在与细胞核中。 4,硬蛋白:存在于各种软骨、腱、毛、发、丝等组织中, 分为角蛋白、胶原蛋白、弹性蛋白和丝蛋白。
5.结构与功能的关系
一、一级结构决定蛋白质的空间构象。 血红蛋白携带氧500多钟便以 压基上第六个氨基酸本来应该是酰胺酸被古氨酸取 代了,结果血红蛋白本来应该是圆盘状的,结果变 成了镰刀状的了,携带氧的功能发生了改变,木瓜 酶200多个氨基酸,切掉180个仍然发挥功能,癌症 碱基30个亿每天都有碱基改变,癌基因) 相似结构有相似功能 糖尿病注射胰岛素 功能改变一定有相似结构的改变
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蛋白质的主要生理功能
蛋白质( protein )是生活细胞内含量最丰富、功能最 复杂的生物大分子,并参与了几乎所有的生命活动和生命过 程。因此,研究蛋白质的结构与功能始终是生命科学最基本
的命题。
生物体最主要的特征是生命活动,而蛋白质是生命活动 的体现者,具有以下主要功能:
催化功能;结构功能;调节功能; 防御功能;运动功能;运输功能; 信息功能;储藏功能
第二节 蛋白质的基本结构 单位——氨基酸
一、蛋白质的元素组成
二、蛋白质的含氮量
• 蛋白氮占生物组织所有含氮物质的绝大部 分。 • 大多数蛋白质含氮量接近于16% • 蛋白质含量 = 每克样品中含氮的克数 6.25 • 凯氏定氮法
三、组成蛋白质的基本单位—氨基酸
(一)、-氨基酸的通式
构成蛋白质的20种氨基酸都是L-α-氨基酸
1.氨基酸的两性解离性质及等电点
R R
+
CH NH3 COOH
+ +
OHH+
CH NH3+ COO
+ OH+ H+ (pK´2)
R CH NH2 COO
(pK´1)
pH< pI
净电荷为正
pH = pI
净电荷=0
pH > pI
净电荷为负
当氨基酸溶液在某一定 pH值时,使某特定氨基酸分子上 所带正负电荷相等,成为两性离子,在电场中既不向阳极
也不向阴极移动,此时溶液的 pH值即为该氨基酸的等电点
(isoelectric point,pI)。
氨基酸等电点的计算
一氨基一羧基AA 的等电点计算:
pI=
pK´1+pK´2
2
pK´1+pK´R
一氨基二羧基AA 的等电点计算:
pI=
2
pK´2+pK´R
二氨基一羧基AA 的等电点计算:
pI=
2
可见,氨基酸的pI值等于该氨基酸的两性离子状态两侧
不带电荷(7种)
极性R基团AA 带电荷:正电荷(3种)负电荷(2种)
人的必需氨基
据营养 学分类
必需AA 非必需AA
酸
据氨基、羧 基数分类
Lys Trp Phe Val Met Leu Ile Thr 一氨基一羧基AA 二氨基一羧基AA(Lys、His、Arg) Arg、His 一氨基二羧基AA(Glu、Asp)
primary structure
二Байду номын сангаас结构
secondary structure 超二级结构 supersecondary structure 结构域 Structure doman Tertiary structure
三级结构
四级结构
quariernary structure
二、蛋白质的一级结构
蛋白质的生物学功能
5.运动作用:运动蛋白——如收缩蛋白与肌肉收 缩有关。 6.生物膜功能及受体作用:受体蛋白——起接受 和传递信息作用的受体;如接受激素的受体蛋白、 接受外界刺激的感觉蛋白(视色素、味觉蛋白)。 7.其它作用:生长、分化的调控蛋白——调节或 控制细胞的生长、分化和遗传信息的表达。如染 色质蛋白、阻遏蛋白、转录因子等。
(3) β-转角(β-turn)
(4) 无规则卷曲(nonregular coil)
α-螺旋(α-helix)
特征: 1 、 每隔 3.6 个 AA 残 基螺旋上升一圈,螺距 0.54nm; 2 、 螺旋体中所有氨基 酸残基 R 侧链都伸向外侧, 链中的全部>C=0 和>N-H几 乎都平行于螺旋轴; 3、每个氨基酸残基的 >N-H与前面第四个氨基酸残 基的>C=0形成氢键,肽链上 所有的肽键都参与氢键的形 成。 形成因素和维持力:与AA 组成和排列顺序直接相关。 链内氢键 多态性:多数为右手(较稳 定),亦有少数左手螺旋存 在(不稳定 );存在尺寸不同
蛋白质的分类
1. 根据生物学功能分:酶、抗体、运输蛋白、 激素等 2. 根据化学组成成分分类: 简单蛋白:仅由aa构成 结合蛋白:简单蛋白与其它生物分子的结合 物,糖蛋白(共价)、脂蛋白(非共价) 3. 根据分子形状分类: 球蛋白:长/宽≤3~4,血红蛋白 纤维蛋白:长/宽>10,血纤蛋白、 丝蛋白
生理活性肽的功能类别:激素、抗菌素、辅助因子
实例:谷胱甘肽(glutathione,GSH)
短杆菌肽
促甲状腺素释放因子(TRH) -天冬氨酸-苯丙氨酸甲酯(甜味剂)
一、肽和肽键的形成
氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基形成特殊的酰胺 键,称为肽键。
肽及肽平面
氨基酸以肽键相连形成的化合物称为肽。
+
PITC(phenylisothiocyanate) 弱硷中 (400 C)
(硝基甲烷 400 C) H+
苯乙内酰硫脲衍生物(PTH-AA) (phenylisothiohydantion-AA)
第三节
二、肽的重要性质
肽
一 、肽(peptide)和肽键(peptide bend)的概念 酸碱性质、重要化学反应类似于氨基酸性质 三、天然存在的活性肽
第二章 蛋白质化学
主要内容:介绍氨基酸的结构、分类、 性质及肽的概念,重点讨论蛋白质的结构、 性质以及结构和功能的相互关系。
思考
目录
第一节 第二节 第三节 蛋白质的生理功能 蛋白质的基本结构单位──氨基酸 肽
第四节
第五节 第六节
蛋白质的分子结构
蛋白质的分子结构与功能的关系 蛋白质的重要性质 思考
的螺旋。
酰胺平面与α-碳原子的二面角( φ和ψ )
二面角
两相邻酰胺平面之间,能以共同的Cα为 定点而旋转,绕 Cα-N 键旋转的角度称 φ 角 ,绕 C-Cα键旋转的角度称 ψ角。 φ和 ψ称作
二面角,亦称构象角。
酰胺平面
α-碳原子
非键合原子 接触半径
侧链
酰胺平面
Φ=1800,ψ=1800
Φ=00,ψ=00
COOH
CH2
第四节 蛋白质的分子结构
一、 蛋白质的结构层次的划分
二、 蛋白质的一级结构
三、 多肽主链折叠的空间限制和 维持蛋白质构象的作用力 四、 蛋白质的二级结构 五、 蛋白质的超二级结构和结构域 六、 蛋白质的三级结构 七、 蛋白质的四级结构
蛋 白 质 结 构 的 主 要 层 次
一级结构
精氨酸 (Arg,R) 酪氨酸 (Tyr,Y)
组氨酸 (His,H) 色氨酸 (Trg,W)
芳香族氨基酸
苯丙氨酸 (Phe,F)
三、氨基酸的性质
(1 )两性解离和等电点
(2 )光学性质
(3 )重要化学反应
a. 与茚三酮反应:用于氨基酸定量定性测定.
b.与2,4一二硝基氟苯(DNFB)的反应(sanger反应):用 于蛋白质N-端测定. c. 与苯异硫氰酯(PITC)的反应(Edman反应),• 用于 蛋白N-端测定,蛋白质顺序测定仪设计原理的依据。
非极性R基团氨基酸(8)
丙氨酸 (Ala,A)
缬氨酸 (Val,V)
亮氨酸 (Lue,L)
异亮氨酸 (Ile,I)
脯氨酸 (Pro,P)
苯丙氨酸 (Phe,F)
色氨酸 (Try,W)
甲硫氨酸
不带电荷极性R基团氨基酸(7)
甘氨酸
(Gly,G)
丝氨酸
(Ser,S)
苏氨酸 (Thr,T)
半胱氨酸 (Cys,C)
完全伸展的多肽主链构象
Φ=00,ψ=00的多肽主链构象
影响α-螺旋的稳定性的因素
• • • • 某些氨基酸,如Pro 大侧连氨基酸 离子间的作用 酸性或碱性氨基酸集中的区域
蛋白质的生物学功能
1.生物催化作用:酶蛋白——有机体新陈代谢的催化剂。 2.代谢调控作用:激素蛋白——在代谢调节中具有十分 重要的作用。如胰岛素、生长素、促卵泡激素、促甲 状腺激素等。 3.免疫防御作用:防御蛋白——动物体内的抗体、补体、 干扰素及昆虫提内的毒素等具有防御功能。 4. 运输及储存作用:运输蛋白——血红蛋白和肌红蛋白 运输氧;脂蛋白运输脂类等。 贮藏蛋白——蛋白质具有贮藏氨基酸的功能,用作有 机体及其胚胎或幼体生长发育的原料。如:蛋类中的 卵清蛋白、乳中的酪蛋白、小麦种子中的麦醇溶蛋白 等。
• 除脯氨酸是一种α-亚氨基酸外,其余的都是 α-氨基酸
• 除甘氨酸外,19种AA都具有旋光性。 • 大多数AA在中性pH时呈兼性离子状态:
• 除胱氨酸和酪氨酸外,其余AA都能溶于水。
(二)氨基酸光学性质
1、除甘氨酸外,所有天然α-氨基酸都有不对称碳原子,因此所
有天然氨基酸都具有旋光性。
2、参与蛋白质组成的20种氨基酸中色氨酸(Trp)、酪氨酸(Tyr)
的基团pK′值之和的二分之一。
2.氨基酸的光吸收
所有氨基酸在 可见光区均无 光吸收,但 Trp 、 Tyr 、 Phe 在 紫 外 光 区有吸收光谱: 在 260nm 有最 大光吸收。 (苯环上的共 扼双键)
摩 尔 吸 收 系 数
波长
3.氨基酸的颜色反应
(1).氨基酸与茚三酮反应
加热 (弱酸) NH3 CO2 RCHO 还原性茚三酮
肽单位
肽键
肽平面
肽单位
天然存在的活性肽
谷胱甘肽
谷胱甘肽在体内参与氧化还原过程,作为某些氧化还
原酶的辅因子,或保护巯基酶,或防止过氧化物积累。
短杆菌肽S
促甲状腺素释放因子
(TRH)
-天冬氨酰-苯丙氨酸甲酯 O O NH2 CH C NH CH C O CH3 CH2
多肽链中氨基酸的排列顺序,包括二硫键的位置称为蛋白