人民医院基因扩增实验室EB病毒核酸定量检测标准操作程序

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人民医院基因扩增实验室EB病毒核酸定量检测标准操作程序
1 项目名称
单纯疱疹病毒Ⅱ型核酸定量检测
2 检验方法名称
TaqMan荧光定量检测
3 方法学原理
用一对EB病毒特异性引物和一条EB病毒特异性荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个荧光报告基团(R)和一个荧光淬灭基团(Q)。

探针完整时,R基团发射的荧光信号被Q基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解,使R荧光基团和Q荧光基团分离,Q基团对R基团的抑制吸收作用消失,荧光监测系统就可接收到R基团的荧光信号。

每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成。

被切割产生的荧光分子数与PCR产物的数量成比例,这样就实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。

因此根据PCR反应液的荧光强度即可计算出初始模板的数量。

4 标本要求
4.1 适用标本类型:全血。

4.2 标本采集
a ) 全血:用一次性无菌注射器抽取受检者静脉血2毫升,注
入含EDTA(乙二胺四乙酸二钠)或枸橼酸钠抗凝剂的玻
璃管,立即轻轻颠倒玻璃管混合5~10次,使抗凝剂与静
脉血充分混匀,密闭送检。

5 试剂
5.1 试剂名称:EB病毒病毒核酸定量检测试剂盒(PCR-荧光探针法)
5.2 生产厂家:中山大学达安基因股份有限公司;
5.3 试剂货号:#DA-B065;
5.4 包装规格:20人份/盒;
5.5 试剂成份:
5.6 试剂储存条件:保存于—20℃,有效期6个月。

6 仪器
ABI 7500全自动基因扩增检测仪
7 操作步骤
7.1 DNA提取
7.1.1 阴性质控品处理
a ) 取出阴性质控品,8,000rpm离心数秒,吸50μl至0.5ml
灭菌离心管中,加入50μl DNA提取液充分混匀,100℃恒温处理10±1分钟;
b ) 12000r/min离心5min,备用。

7.1.2 标本处理
7.1.2.1 全血
a ) 取全血1ml至干燥玻璃试管中,加入生理盐水1ml轻摇混
匀;
b ) 取干燥玻璃试管卷入500µl淋巴细胞分离液;
c ) 将稀释好的全血用加样枪缓慢加入加有淋巴细胞分离液
的试管中(注意沿管壁,速度要慢);
d ) 2000rpm离心20min;
e ) 吸取白细胞层(从上而下的第二层),加入1.5ml离心管,
12000rpm离心5分钟;12,000 rpm离心5分钟;
f ) 去上清,沉淀中加入50μl DNA提取液充分混匀,100℃
恒温处理10±1分钟;
g ) 12000r/min离心5min,备用。

7.1.3 EBV临界阳性质控品处理(同阴性质控品);
7.1.4 EBV强阳性质控品处理(同阴性质控品);
7.1.5 EBV阳性定量参考品处理:8000rpm离心数秒,备用;
7.2 PCR扩增
7.2.1 试剂准备(在试剂准备区操作):按比例(EBV PCR反应液40µl/人份+ Taq酶3µl/人份)取相应量的PCR反应液及Taq 酶,充分混匀后按43µl/管分装至0.2ml离心管中备用。

7.2.2 加样:向准备好试剂的0.2ml离心管中,分别加入处理后的样品(包括样本、阴性质控品、临界阳性质控品和强阳性质控品)上清液2µl,或直接加入阳性定量参考品2µl,8000rpm离心数秒,放入仪器样品槽。

7.2.3 设置PCR循环扩增程序如下
93℃2分钟预变性;
93℃45秒→55℃60秒10个循

93℃30秒→55℃45秒30个循环
8 结果判断:
8.1 如果增长曲线不呈S型或Ct值=30,则实验结果判为样品的HSVⅡDNA总含量小于检测下限。

8.2 如果增长曲线呈S型曲线且Ct值<30,则:
a ) 若样品的C<5.00E+003,则该样品的EBV DNA总含量<5.0
×103基因拷贝/ml;
b ) 若样品的5.00E+003≤C≤5.00E+007,则该样品的EBV
DNA总含量=C基因拷贝/ml;
c ) 若样品的C>5.00E+007,则该样品的EBV DNA总含量>5.0
×107因拷贝/ml。

如果需要精确定量结果,可将提取后的
样品稀释至线性范围内再检测。

9 质控
a ) 阴性质控品:增长曲线不呈S型曲线或Ct值=30;
b ) 阳性质控品:增长曲线呈S型曲线,且强阳性质控品定量
参考值在1×106因拷贝/ml~2×107因拷贝/ml范围,临界
阳性质控品定量参考值在2×102基因拷贝/ml~2×104基因
拷贝/ml范围;(参考值为仪器自动分析计算出的数值);
c ) 阳性定量参考品:增长曲线不呈S型曲线,Ct值<27,且
线性相关系数0.97≤|r|≤1;
d ) 以上要求需在同一次实验中同时满足,否则,本次实验无
效,需重新进行。

10 参考范围
低于检测下限
11 性能指标
灵敏度:5.0×103基因拷贝/ml
线性范围:5.0×103基因拷贝/ml~5.0×107基因拷贝/ml
12 临床意义
早期诊断:对于EB病毒急性感染如传染性单核细胞增多症,最早出现于临床标本中的是病原体本身,采用高灵敏度高特异性的实时荧光PCR方法进行检测,可以在感染的早期明确病因。

鼻咽癌的监测治疗:鼻咽癌具有对放疗敏感,易复发和远处转移等特点。

虽放疗为鼻咽癌的首选治疗方法,但其仍有部分患者出现远处转移和局部复发导致失败。

在临床上,常会以常规体检、纤维镜、胸片等作为鼻咽癌患者复发转移的监测手段,但是
这些方法要么缺乏一定的特异性,要么缺乏一定的敏感性,难以及时发现并实施早期治疗,且不能区分原发和转移癌。

因此,采用实时荧光PCR直接定量测定血液中EB病毒DNA,则可以及时准确的反映其在患者体内的消长情况,作为鼻咽癌治疗预后,转移和复发的监测指标。

EB病毒属于疱疹病毒,可引起增殖性感染和非增殖性感染。

特别是非增殖性感染,可导致细胞癌变。

被认为与传染性单核细胞增多症。

淋巴癌、胃咽癌、何杰金氏癌、慢性疲劳综合症有关13 注意事项
13.1 实验室管理应严格按照PCR基因扩增实验室的管理规范,实验人员必须进行专业培训,实验过程严格分区进行(试剂准备区、标本制备区、扩增和产物分析区),所用消耗品应灭菌后一次性使用,实验操作的每个阶段使用专用的仪器和设备,各区各阶段用品不能交叉使用;
13.2 为试剂和标本制备阶段提供生物安全柜,实验过程中穿工作服,带一次性手套,使用自卸管移液器;
13.3 对每次实验进行质量控制;
13.4 试剂使用前要完全解冻,但应避免反复冻融;
13.5 自备灭菌生理盐水;
13.6 标本处理时“去上清”步骤,注意吸头不要碰触沉淀;
13.7 试剂盒DNA提取液内含不溶于水的物质,取样时需用加样器充分混匀后吸取。

如出现因吸头嘴部太细不能吸取或取样
后堵塞吸头现象,可先用洁净无污染的剪刀将吸头嘴部剪去一截;
13.8 为保证病原体颗粒充分裂解可转至4℃静置6~8小时;
13.9 标本制备区所用过的吸头请打入盛有消毒剂的容器,并与废弃物一起灭菌后方可丢弃;
13.10 实验完毕用10%次氯酸或75%酒精或紫外灯处理工作台和移液器;
13.11 所有检测样品应视为具有传染性物质,操作和处理均需符合相关法规要求:卫生部《微生物生物医学实验室生物安全通用准则》和《医疗废物管理条例》。

14 参考文献
中华人民共和国卫生部医政司编.全国临床检验操作规程(第三版) .南京:东南大学出版社,2006
中山大学达安基因股份有限公司. EB病毒核酸定量检测试剂盒(PCR—荧光探针法)说明书.2009年4月,第一版/0。

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