细菌分类代码及名称
常见细菌中英文对照、菌组、菌属及代码(厌氧菌部分)
常见细菌中英文对照、菌组、菌属及代码(厌氧菌部分)革
代码
英文名称中文名称细菌分类菌属兰
aat a Actinomyces neuii ss. anitratus 诺伊放线菌无硝亚种NOSPORE 放线菌属
abe a Actinomyces bernardiae 伯尔德隐秘杆菌NOSPORE 放线菌属
abo a Actinomyces bovis 牛放线菌NOSPORE 放线菌属
acd a Acidaminococcus sp. 氨基酸球菌属AGNC 氨基酸球菌属
ace a Acetobacterium sp. 醋杆菌属check 醋杆菌属
act a Actinomyces sp. 放线菌属NOSPORE 放线菌属
afe a Acidaminococcus fermentans 发酵氨基酸球菌AGNC 氨基酸球菌属
afr a Bacteroides furcosus 叉形棍状厌氧菌AGNR 棍状厌氧菌属
age a Actinomyces gerencseriae 盖伦切尔放线菌NOSPORE 放线菌属
agg a Actinomyces georgiae 乔氏放线菌NOSPORE 放线菌属
ais a Actinomyces israelii 伊斯雷尔放线菌NOSPORE 放线菌属
ame a Actinomyces meyeri 迈尔放线菌NOSPORE 放线菌属
an- a Anaerobic gram negative organisms 厌氧革兰阴性菌AGN
an+ a Anaerobic gram positive organisms 厌氧革兰阳性菌AGP
细菌分类表
细菌分类表
本表以LPSN网站
原核生物分类的权威杂志IJSEM的分类系统,同时参考NCBI Taxonomy,但目前其它中文维基分类表可能依照其它标准,请注意其区别。
中文名称采用惯例(包括网上搜索途径)以及拉丁名直接意译,部分参考《细菌名称》第二版,拉丁文意译参考原核生物名称(英文)网站。翻译问题欢迎在原文中添加或者在讨论页中提出。
本表列到属级。 后面带*者为尚未被IJSEM杂志确认的分类。
参见:细菌。
目录
[隐藏]
1 酸杆菌门(Acidobacteria)
1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)
1.2 全噬菌纲(Holophagae)
2 放线菌门(Actinobacteria)(高G+C革兰氏阳性菌)
2.1 放线菌纲(Actinobacteria)
3 产水菌门(Aquificae)
3.1 产水菌纲(Aquificae)
4 拟杆菌门(Bacteroidetes)
4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)
4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)
4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)
4.4 纲未定
5 衣原体门(Chlamydiae)
5.1 衣原体纲(Chlamydiae)
6 绿菌门(Chlorobi)
6.1 绿菌纲(Chlorobia)
7 绿弯菌门(Chloroflexi)
7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)
7.2 暖绳菌纲(Caldilineae)
7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi)
8 产金菌门(Chrysiogenetes)
8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes)
1-常见细菌分类
•
Culture media :培养基
- Non-selective 非选择性培养基: blood agar血琼脂平板 CO2 atmosphere or ANA - Selective选择性培养基 : Columbia CNA哥伦比亚CNA 微需氧或厌氧
Corynebacteria -
非肠杆菌
Haemophilus嗜血杆菌
棒状杆菌
- Campylobacter弯曲杆菌
STAPHYLOCOCCI葡萄球菌
Gram + cocci in clusters, Catalase + 串状排列,革兰+球菌 触酶+ 20% of bacteria isolated in routine占日常检出菌的20% Main species :主要的种
动力
硫化氢
—
+或—
Leabharlann Baidu
+
—
—
+
革兰阴性球菌
脑膜炎球菌。标本来源、糖分
淋病奈瑟球菌。标本来源、葡、 麦 ….. 卡他莫拉菌。硝酸盐还原、葡萄糖分解、 DNA。
革兰阴性杆菌
常见细菌中英文对照、菌组、菌属及代码(革兰阳性部分)
棍状杆菌属
cmc
+
Corynebacteriummacginleyi
麦金利棒杆菌
COF
棒杆菌属
cmg
+
Clavibactermichiganensess.michiganense
密歇根棍状杆菌密歇根亚种
check
棍状杆菌属
cmg
+
Corynebacteriummichiganense
密歇根棍状杆菌密歇根亚种
溶血棒状杆菌
COF
隐秘杆菌属
ahe
+
Arcanobacteriumhaemolyticum
溶血隐秘杆菌
COF
隐秘杆菌属
alo
+
Alloiococcussp.
差异球菌属
CatPos
差异球菌属
amu
+
Actinomaduramadurae
马杜拉马杜拉放线菌
GPR
马杜拉放线菌属
aoi
+
Alloiococcusotitidis
D群链球菌(非肠球菌)
链球菌属
eav
+
Enterococcusavium
鸟肠球菌
CatNeg
肠球菌属
eca
+
Enterococcuscasseliflavus
细菌分类表
细菌分类表
本表以LPSN网站的分类为基础(当前版本2008年1月7日),本分类代表原核生物分类的权威杂志IJSEM的分类系统,同时参考NCBI Taxonomy,但目前其它中文维基分类表可能依照其它标准,请注意其区别。
中文名称采用惯例(包括网上搜索途径)以及拉丁名直接意译,部分参考《细菌名称》第二版,拉丁文意译参考原核生物名称(英文)网站。翻译问题欢迎在原文中添加或者在讨论页中提出。
本表列到属级。后面带*者为尚未被IJSEM杂志确认的分类。
• 1 酸杆菌门(Acidobacteria)
1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)
1.2 全噬菌纲(Holophagae)
• 2 放线菌门(Actinobacteria)(高G+C革兰氏阳性菌)
2.1 放线菌纲(Actinobacteria)
• 3 产水菌门(Aquificae)
3.1 产水菌纲(Aquificae)
• 4 拟杆菌门(Bacteroidetes)
4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)
4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)
4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)
4.4 纲未定
• 5 衣原体门(Chlamydiae)
5.1 衣原体纲(Chlamydiae)
• 6 绿菌门(Chlorobi)
6.1 绿菌纲(Chlorobia)
•7 绿弯菌门(Chloroflexi)
7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)
7.2 暖绳菌纲(Caldilineae)
7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi)
•8 产金菌门(Chrysiogenetes)
细菌的分类及命名
是 细 菌 的 种 系 发 生 关 系 (phylogenetic
relationship),即分析其基因特征从而
确定分类地位。
研究细菌的种系发生关系主要采用三种 方法:
1)测定DNA碱基(G+C)mol%
2)核酸分子杂交
3)16SrRNA寡核苷酸编目
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20
1)DNA碱基G+C%比例的测定
计算相似度的公式为:
S%=NS/(NS+ND) 其中S为相似度,NS 为相似性状, ND为相异性状。
此法应用时所选性状必须要多,越多准确 性越高,至少高达100个,否则易误判。
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28
2、常见动物致病菌的鉴定已形成固定 的程序。
革兰氏阳性细菌
革兰氏阴性细菌
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29
革兰氏阳性细菌
细菌的分类单元与动植物一样,依次为
界 Kingdom (拉:Regnum)
门 Phylum (拉:Phylum))
纲 Class (拉:Classis)
目 Order (拉:Ordo)
科 Family (拉:Familia)
属 Genus(拉:Genus)
种 Species(拉:Species)
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五、细菌的鉴定
➢ 纯培养细菌才能进行鉴定。DNA分子水 平的鉴定主要限于专业实验室;
细菌分类表
细菌分类表
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本表列到属级。 后面带*者为尚未被IJSEM杂志确认的分类。
参见:细菌。
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1 酸杆菌门(Acidobacteria)
1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)
1.2 全噬菌纲(Holophagae)
2 放线菌门(Actinobacteria)(高G+C革兰氏阳性菌)
2.1 放线菌纲(Actinobacteria)
3 产水菌门(Aquificae)
3.1 产水菌纲(Aquificae)
4 拟杆菌门(Bacteroidetes)
4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)
4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)
4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)
4.4 纲未定
5 衣原体门(Chlamydiae)
5.1 衣原体纲(Chlamydiae)
6 绿菌门(Chlorobi)
6.1 绿菌纲(Chlorobia)
7 绿弯菌门(Chloroflexi)
7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)
7.2 暖绳菌纲(Caldilineae)
7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi)
8 产金菌门(Chrysiogenetes)
8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes)
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中文名称采用惯例(包括网上搜索途径)以及拉丁名直接意译,部分参考《细菌名称》第二版,拉丁文意译参考原核生物名称(英文)网站。翻译问题欢迎在原文中添加或者在讨论页中提出。
本表列到属级。 后面带*者为尚未被IJSEM杂志确认的分类。
参见:细菌。
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1 酸杆菌门(Acidobacteria)
1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)
1.2 全噬菌纲(Holophagae)
2 放线菌门(Actinobacteria)(高G+C革兰氏阳性菌)
2.1 放线菌纲(Actinobacteria)
3 产水菌门(Aquificae)
3.1 产水菌纲(Aquificae)
4 拟杆菌门(Bacteroidetes)
4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)
4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)
4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)
4.4 纲未定
5 衣原体门(Chlamydiae)
5.1 衣原体纲(Chlamydiae)
6 绿菌门(Chlorobi)
6.1 绿菌纲(Chlorobia)
7 绿弯菌门(Chloroflexi)
7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)
7.2 暖绳菌纲(Caldilineae)
7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi)
8 产金菌门(Chrysiogenetes)
8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes)
细菌分类大全
革兰氏阳性菌
革兰氏阳性菌
革兰氏染色法的意义就在于鉴别细菌,把众多的细菌分为两大类,革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。大多数化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌,它们能产生外毒素使人致病,而大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌,它们产生内毒素,靠内毒素使人致病。
常见的革兰氏阳性菌有:葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等;常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、绿脓杆菌、百日咳杆菌、霍乱弧菌及脑膜炎双球菌等。
在治疗上,大多数革兰氏阳性菌都对青霉素敏感(结核杆菌对青霉素不敏感);而革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感(但奈瑟氏菌中的流行性脑膜炎双球菌和淋病双球菌对青霉素敏感),而对链霉素、氯霉素等敏感。所以首先区分病原菌是革兰氏阳性菌还是阴性菌,在选择抗生素方面意义重大。革兰氏阴性菌,大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌,它们产生内毒素,靠内毒素使人致病.常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、绿脓杆菌、百日咳杆菌、霍乱弧菌及脑膜炎双球菌等.革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感,可以选择氟喹诺酮类药物如诺氟沙星,左氧氟沙星等,也可以选择大环内酯类比如克拉霉素、罗红霉素等。
革兰氏阳性菌,大多数化脓性球菌都属于革兰氏阳性菌,它们能产生外毒素使人致病,常见的革兰氏阳性菌有:葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等。可以选择青霉素族,头孢曲松钠等。
革兰氏阴性菌,以[大肠杆菌]为代表。大肠杆菌为兼气性菌种,一般生存于肠道中及厌氧的还境中.革兰氏阴性菌细胞壁的特征为有一层outer membrane 与阳性菌种不同。目前对大肠杆菌的研究很多,除了它是一般食物中是否有被污染的指标外,很多分子生物学方面的研究皆需要使用到大肠杆菌当作实验宿主。
常见细菌中英文对照、菌组、菌属及代码(厌氧菌部分)
常见细菌中英文对照、菌组、菌属及代码(厌氧菌部分)革
代码
英文名称中文名称细菌分类菌属兰
aat a Actinomyces neuii ss. anitratus 诺伊放线菌无硝亚种NOSPORE 放线菌属
abe a Actinomyces bernardiae 伯尔德隐秘杆菌NOSPORE 放线菌属
abo a Actinomyces bovis 牛放线菌NOSPORE 放线菌属
acd a Acidaminococcus sp. 氨基酸球菌属AGNC 氨基酸球菌属
ace a Acetobacterium sp. 醋杆菌属check 醋杆菌属
act a Actinomyces sp. 放线菌属NOSPORE 放线菌属
afe a Acidaminococcus fermentans 发酵氨基酸球菌AGNC 氨基酸球菌属
afr a Bacteroides furcosus 叉形棍状厌氧菌AGNR 棍状厌氧菌属
age a Actinomyces gerencseriae 盖伦切尔放线菌NOSPORE 放线菌属
agg a Actinomyces georgiae 乔氏放线菌NOSPORE 放线菌属
ais a Actinomyces israelii 伊斯雷尔放线菌NOSPORE 放线菌属
ame a Actinomyces meyeri 迈尔放线菌NOSPORE 放线菌属
an- a Anaerobic gram negative organisms 厌氧革兰阴性菌AGN
an+ a Anaerobic gram positive organisms 厌氧革兰阳性菌AGP