样品稀释对毛细管电泳分离检测DNA片段的影响
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样品稀释对毛细管电泳分离检测 D A片段的影响* N
宋立 国
陈 洪
( 武汉大学化学系
张
武汉
乐
407) 302
程介克 *
Hale Waihona Puke 提 要 通过理论推导和实验验证表明: 适当稀释 D A样品溶液, N 采用流体力学进样或电 动进样都不会较大
地减低峰高, D A片段毛 细管电泳的分离效率和分离度还能有所提高 。 而 N 采用稀释样 品的方 法可提高 D A样 N 品的使用效率 。 采用羟 乙基纤维 素无 胶筛分介质分离 了D A片段 。 激光诱 导荧 光( N 用 氩离子激光器 ,8 n ) 48 m 电 荷耦合器件检测。 用低浓 度的筛分介质 (. %) 04 ィ分离 了分子质量较大 的 D A Hi N- n d 全部 8 个片段 (2 b ~ 15 p
Fg1 nlec o sm l d ui o sprt n i. If ne a p i t n eaai u f e o n l o
离电压 : 2 V, -1 k 电流 2 A; 0 氩离子激光器 ( 激发波 长为 48 ;C 8 n C D检测器 ( m) 发射 波长为 50 )样品稀释倍数 :a1 2n ; m () ,
( ) ,() ,( ) 。 h2 c4 d8
C nio :aia D - cl , 0 m( d ) 35 od ) can ti ns 01 ,oa l gh c e et e odtnC p ly 1 u i lr B o mn 10 i . , 6 m(.. , ot g c e . p tt e t 6 m, fci . i h k s i n l n 0 f v
e itn t 48 m ; C dt t (a l g oe ii lh, 2 n )ri os p duo, ),b2 ( x ti lh, 8 n ) C D eo wv e t f so i t 50 m ;ts a l itn( 1 (),c cao i g e c r e n h m s n g ao f e i a m l )
离 中可保 证被分 离离子 的浓度 保持 不变 , 即在 电泳 谱 图 中相 对应 的峰高保 持不 变 , 而样 品稀 释可 以较 大地 节约样品 。 32 . 流体 力学进 样时样品稀释对 D A片段分 离的 N 影响
式() 明将 样品稀释后进样 , 3表 进样完 成后在分
D A Hn N -i d 的分 离采 用 04 . %羟 乙基 纤 维 素作为筛分介 质。 由于筛分介质粘度较低 , 于考 察 适 样 品稀 释对于 流体动力学 进样后 D A 片段 分离 的 N 影响, 结果如 图 1 示。从 图 1 ~c 所 - 玞 中可 以看 出 a
2 10 。 3 b) 用高浓度的筛分介质(.% 分离分子质量较小的pR 2-a 3 p 16ィ ) B 32 e 2 个片段( b~ 8 b) 将 H 2 1 p 57 p。 8
p R 2- a B 32H e D A样 品溶液稀释 1 倍时 ,2 p 14b 两个片段得到了分离。 N 0 13b 和 2 p
- v) 2 0 等部分组成[ 7
2 2 剂 . 试
三 羟 甲基氨 基 甲烷 ( r )硼 酸 、 二胺 四、 Ti , s 乙 乙 酸二钠 (D A) 为 国产 分析 纯 试剂 ; 乙基纤维 ET 均 羟
素为S 公司产品 2 e %的水溶液2℃时的粘度为 5
4P s ; 唑 橙 ( O) A di a・ ) 噻 T 为 lrh产 品; D A c N - Hn i d 及 p R 2- a B 32 e 购 自华美 生物工 程公 司, H 二 者 都 保 存 于 1 m o/ T i H 11 m l 0 l m L r - C ,0m o L s / N C , m o L T p 78的缓 冲溶液 中。 a ll l E A(H . ) m / D
关键词 毛 细管电泳, 激光诱导荧光, 荷耦合器 样品 电 件, 稀释,N D A片段
分类号 O68 5
1 前言
用毛细 管电泳分 离 D A 片段具 有 高效 、 N 高速 、
进样量少和 耗用试 剂低 等优点 , 成 为分子 生物 学 正
样品的使用效率 , 有重要的实际 意义。 具
2 实验部分
2 1 . 实验装置
自行组装的激光诱导荧光电荷耦合器件毛细管
电泳装 置 , 由高压 电源( 中理工 大学研 制)毛细管 华 、 ( B1 J W c nic l m, A, S 总 长 度 D -, & Si ti F s e f o o C U A, 6 c 有效分 离长 度 5 m)氩 离子 激 光器 ( 海 0 m, 5c , 上
Hn i d ( g L ; yrd nmiiet n s8m; eaao vl g-1k cret A; i l e ( ae nt o 1 / ) h doya c co 4 /c sprt n t e 2V, urn 2 n i 0 j i oa 0 A i a r vl gh o s w e n f
o DNA ame t b h d o y a c et n f f g ns y rd n mi ijci r y n o
实验条件: 毛细管 D -柱, 径 1 m 外径 35 m 涂 B1 内 0 , 0 6 , 层厚度 01 m, . 总长度 6c 分离长度 5 c 载体电解质溶液: 0m, 5m; 1 × B 缓冲溶液; 4 羟乙 TE 0 % . 基纤维素, m l 噻唑橙;N 1 oL / D A片段:D AHn 1gL ; N -i d / )流体动 力学进样,0 8 分 4s c / m;
组成。 筛分介质溶液的配制和D A片段毛细管电 N
泳分离步骤见 文献 8。 ] 将荧光插入试剂加入筛分介 质缓 冲溶液 中 , 用无菌 的双 蒸水 稀释 D A样 品。 N
3 结果与讨论
3 1 . 样品稀 释对毛 细管 电泳分 离检 测的影 响的理
论推 导
* 国家自然科学基金资助项 目 ** 通讯联系人 本文收稿 日 :980-9修 回日期 :980-2 期 19-51 , 19-71
mmo/ T i, 9mmo/ 硼 酸 和 2mmo/ E A lL r 8 s lL lL DT
体力学进样( 电堆积富集) 或电动进样( [ 5 场增强进
样) 来实现 的。 [ 6 本文依 据这一原 理通过理论推 导和 实验验证表 明 : 当稀释 样 品并将 其分 装成 若干 份 适 后分别使用 , 峰高没有 降低 或者降低 得较少 , 分离效 率和分辨率还有所 提高 。 在分 子生 物学研究 中 , 采用 毛细管电泳分离检测 D A 片段 , N 能节 约样 品, 提高
式 () 1中假定 样品溶 液与载 体 电解 质溶 液的 离子强 度 由相同的某一 电解 质控制 , 而其浓度分 别为 C 与 s
C。 b
由于被 分离离子在样 品溶 液与载体 电解 质溶液 的边 沿前后 流量须保持平衡 , 因此有 Csi C Vb i s ii V = b , 与式 () 1 结合可得
pR 2-a B 32H e D A的分离采用16 N .%羟乙基
当样 品溶液 与载体 电解质 溶液的离 子强度不 同 时 , 品溶液与载体 电解 质溶液的 电阻率不 同 , 样 由此 可导致进样前后在 外加 电压作 用下分配在样 品区带 内的电场强度 与充满 电解质溶 液的毛细管柱 的其它 部分不 同 , 品离 子 的迁移 速度也 不相 同。如果 以 样 C, V分别 代 表样 品溶液 和 载体 电解 质溶 液 中离 E, 子的浓度 、 电场强度 、 样品溶液 中被分 离离子 的迁 移 速度 , s b分别 代表样 品溶 液和 载体 电解质 溶 以 和 液 , i 表被 分 离的样 品离 子 , 在理 想条 件下 , 以 代 则 以上关系可近似表达 为
裂。
D AHn 样品在稀释倍数小于4时, N -i d 尽管峰高
和分离度都发生一定 的变化 , 但总体来 说变化不 大 。 而 当稀释倍数 为 8 , 时 峰高 的降低 及分离 度 的提高 已相 当明显 。 33 电动进样 时样 品稀释对 D A片段分 离的影响 . N
以上分 离结果表 明, 样品稀释进样应 用于 D A N 片段 的分 离 中效果 显著 , 离 时取少 量 D A样 品 分 N 稀释后进样 , 可保证检测灵敏度不 降低 或降低较小 ,
l g 5c ;a i ec o t; T E 04 hdoy hl u s, m l tioo ne D A g et N - e t 5m cre l t le 1 B ;.% yr e y cloe 1 o L z r g; N f m n:D A n h rr r y e xt e l l / h l a a r a
埃恩激光技术有限公司)单色仪( R 2, s u 、 H 30I t - nr
m n S Ic, S ) 电荷耦 合 器件 ( C 52 et n. U A 、 A, C D,1 × 52 & P R, S 、 1 E G G A U A)计算 机 ( a w y 0 4 X G t a 2 0 e 0 D
中重要的研究手段 , 在生物医学 、 医学 等领域发挥 法 着越来越重要的作用[ 。在分子 生物学 实际 的研究 1 工作 中 ,N D A样 品溶 液体积极 小 , 一般 只有 L级 , 而毛细管 电泳仪 , 无论 是商 品仪器 还是 实验 室组 装 的仪器 , 都要求样 品溶 液最少 要有 数微 升到数 十微 升 , 样才能使 毛细管 的进样 端 和电极插 入 到样 品 这 溶液中 , 完成进样操作 。由于 D A样 品较容易被污 N 染降解 , 与毛细管或 电极 接触 后 , 般仅在一 天左 右 一 D A片段就会基本 完全降解 。在需要使用 D A 分 N N 子质 量标准物 ( N Makr作毛 细管 电泳条件实 D A re) 验时 , 往往需要 大量的 D A样 品试 剂 , N 而这些 D A N 试剂一般价 格都较 昂贵 。 实验 中有时 由 P R扩增 在 的 D A样 品溶 液 的离 子强度 较 高 , 导 致 毛细 管 N 会 电泳分 离效率降低 , 分离度不 能满足要求 [。 品堆 2样
的影 响 , 们 用 它 考 察 了样 品稀 释对 电动 进 样 后 我 D A 片段分离 的影 响 , 如图 2 N 结果 所示 。从 图 2 可
以看出,B 32H e D A样品稀释 1倍后, pR 2-a N 0 峰
高变化 不明显 , 线噪声明显增大 , 分离度有 所 虽基 但 改 善 , 现 在 89 即 13 4 峰发 生 了明 显 的分 表 / ( 2/2 )
4 d 8 1 2 ,.5 4 3 0 7 4 3 2 5 3 1 .6 5 ,7 4 6 .2 1 0 ,( ). .1 5 2 6 ,.2 2 , .2 2 ,.4 6 ,6 5 7 .9 1 ,8 3 3 .
如果将样 品稀 释
得
倍 后进 样 , 则其 中各 离子 的
浓度降低 倍, i s C=C/, 即C =C /, s 代入式() 2
积(a p s ri ) sm l t k g作为一种提高毛细管电泳检测 e n a
灵敏度的柱上浓缩方法 , 由于其 简便易行 , 得到 近来
了 越来越广泛的应用[4 样品堆积是通过将分析样 3。 ,
品溶 于离子强度低于 电泳载 体缓 冲溶 液后再进行 流
载体电解质溶液采用 1 T E缓冲溶液, 9 B 由8
宋立 国
陈 洪
( 武汉大学化学系
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武汉
乐
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程介克 *
Hale Waihona Puke 提 要 通过理论推导和实验验证表明: 适当稀释 D A样品溶液, N 采用流体力学进样或电 动进样都不会较大
地减低峰高, D A片段毛 细管电泳的分离效率和分离度还能有所提高 。 而 N 采用稀释样 品的方 法可提高 D A样 N 品的使用效率 。 采用羟 乙基纤维 素无 胶筛分介质分离 了D A片段 。 激光诱 导荧 光( N 用 氩离子激光器 ,8 n ) 48 m 电 荷耦合器件检测。 用低浓 度的筛分介质 (. %) 04 ィ分离 了分子质量较大 的 D A Hi N- n d 全部 8 个片段 (2 b ~ 15 p
Fg1 nlec o sm l d ui o sprt n i. If ne a p i t n eaai u f e o n l o
离电压 : 2 V, -1 k 电流 2 A; 0 氩离子激光器 ( 激发波 长为 48 ;C 8 n C D检测器 ( m) 发射 波长为 50 )样品稀释倍数 :a1 2n ; m () ,
( ) ,() ,( ) 。 h2 c4 d8
C nio :aia D - cl , 0 m( d ) 35 od ) can ti ns 01 ,oa l gh c e et e odtnC p ly 1 u i lr B o mn 10 i . , 6 m(.. , ot g c e . p tt e t 6 m, fci . i h k s i n l n 0 f v
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离 中可保 证被分 离离子 的浓度 保持 不变 , 即在 电泳 谱 图 中相 对应 的峰高保 持不 变 , 而样 品稀 释可 以较 大地 节约样品 。 32 . 流体 力学进 样时样品稀释对 D A片段分 离的 N 影响
式() 明将 样品稀释后进样 , 3表 进样完 成后在分
D A Hn N -i d 的分 离采 用 04 . %羟 乙基 纤 维 素作为筛分介 质。 由于筛分介质粘度较低 , 于考 察 适 样 品稀 释对于 流体动力学 进样后 D A 片段 分离 的 N 影响, 结果如 图 1 示。从 图 1 ~c 所 - 玞 中可 以看 出 a
2 10 。 3 b) 用高浓度的筛分介质(.% 分离分子质量较小的pR 2-a 3 p 16ィ ) B 32 e 2 个片段( b~ 8 b) 将 H 2 1 p 57 p。 8
p R 2- a B 32H e D A样 品溶液稀释 1 倍时 ,2 p 14b 两个片段得到了分离。 N 0 13b 和 2 p
- v) 2 0 等部分组成[ 7
2 2 剂 . 试
三 羟 甲基氨 基 甲烷 ( r )硼 酸 、 二胺 四、 Ti , s 乙 乙 酸二钠 (D A) 为 国产 分析 纯 试剂 ; 乙基纤维 ET 均 羟
素为S 公司产品 2 e %的水溶液2℃时的粘度为 5
4P s ; 唑 橙 ( O) A di a・ ) 噻 T 为 lrh产 品; D A c N - Hn i d 及 p R 2- a B 32 e 购 自华美 生物工 程公 司, H 二 者 都 保 存 于 1 m o/ T i H 11 m l 0 l m L r - C ,0m o L s / N C , m o L T p 78的缓 冲溶液 中。 a ll l E A(H . ) m / D
关键词 毛 细管电泳, 激光诱导荧光, 荷耦合器 样品 电 件, 稀释,N D A片段
分类号 O68 5
1 前言
用毛细 管电泳分 离 D A 片段具 有 高效 、 N 高速 、
进样量少和 耗用试 剂低 等优点 , 成 为分子 生物 学 正
样品的使用效率 , 有重要的实际 意义。 具
2 实验部分
2 1 . 实验装置
自行组装的激光诱导荧光电荷耦合器件毛细管
电泳装 置 , 由高压 电源( 中理工 大学研 制)毛细管 华 、 ( B1 J W c nic l m, A, S 总 长 度 D -, & Si ti F s e f o o C U A, 6 c 有效分 离长 度 5 m)氩 离子 激 光器 ( 海 0 m, 5c , 上
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o DNA ame t b h d o y a c et n f f g ns y rd n mi ijci r y n o
实验条件: 毛细管 D -柱, 径 1 m 外径 35 m 涂 B1 内 0 , 0 6 , 层厚度 01 m, . 总长度 6c 分离长度 5 c 载体电解质溶液: 0m, 5m; 1 × B 缓冲溶液; 4 羟乙 TE 0 % . 基纤维素, m l 噻唑橙;N 1 oL / D A片段:D AHn 1gL ; N -i d / )流体动 力学进样,0 8 分 4s c / m;
组成。 筛分介质溶液的配制和D A片段毛细管电 N
泳分离步骤见 文献 8。 ] 将荧光插入试剂加入筛分介 质缓 冲溶液 中 , 用无菌 的双 蒸水 稀释 D A样 品。 N
3 结果与讨论
3 1 . 样品稀 释对毛 细管 电泳分 离检 测的影 响的理
论推 导
* 国家自然科学基金资助项 目 ** 通讯联系人 本文收稿 日 :980-9修 回日期 :980-2 期 19-51 , 19-71
mmo/ T i, 9mmo/ 硼 酸 和 2mmo/ E A lL r 8 s lL lL DT
体力学进样( 电堆积富集) 或电动进样( [ 5 场增强进
样) 来实现 的。 [ 6 本文依 据这一原 理通过理论推 导和 实验验证表 明 : 当稀释 样 品并将 其分 装成 若干 份 适 后分别使用 , 峰高没有 降低 或者降低 得较少 , 分离效 率和分辨率还有所 提高 。 在分 子生 物学研究 中 , 采用 毛细管电泳分离检测 D A 片段 , N 能节 约样 品, 提高
式 () 1中假定 样品溶 液与载 体 电解 质溶 液的 离子强 度 由相同的某一 电解 质控制 , 而其浓度分 别为 C 与 s
C。 b
由于被 分离离子在样 品溶 液与载体 电解 质溶液 的边 沿前后 流量须保持平衡 , 因此有 Csi C Vb i s ii V = b , 与式 () 1 结合可得
pR 2-a B 32H e D A的分离采用16 N .%羟乙基
当样 品溶液 与载体 电解质 溶液的离 子强度不 同 时 , 品溶液与载体 电解 质溶液的 电阻率不 同 , 样 由此 可导致进样前后在 外加 电压作 用下分配在样 品区带 内的电场强度 与充满 电解质溶 液的毛细管柱 的其它 部分不 同 , 品离 子 的迁移 速度也 不相 同。如果 以 样 C, V分别 代 表样 品溶液 和 载体 电解 质溶 液 中离 E, 子的浓度 、 电场强度 、 样品溶液 中被分 离离子 的迁 移 速度 , s b分别 代表样 品溶 液和 载体 电解质 溶 以 和 液 , i 表被 分 离的样 品离 子 , 在理 想条 件下 , 以 代 则 以上关系可近似表达 为
裂。
D AHn 样品在稀释倍数小于4时, N -i d 尽管峰高
和分离度都发生一定 的变化 , 但总体来 说变化不 大 。 而 当稀释倍数 为 8 , 时 峰高 的降低 及分离 度 的提高 已相 当明显 。 33 电动进样 时样 品稀释对 D A片段分 离的影响 . N
以上分 离结果表 明, 样品稀释进样应 用于 D A N 片段 的分 离 中效果 显著 , 离 时取少 量 D A样 品 分 N 稀释后进样 , 可保证检测灵敏度不 降低 或降低较小 ,
l g 5c ;a i ec o t; T E 04 hdoy hl u s, m l tioo ne D A g et N - e t 5m cre l t le 1 B ;.% yr e y cloe 1 o L z r g; N f m n:D A n h rr r y e xt e l l / h l a a r a
埃恩激光技术有限公司)单色仪( R 2, s u 、 H 30I t - nr
m n S Ic, S ) 电荷耦 合 器件 ( C 52 et n. U A 、 A, C D,1 × 52 & P R, S 、 1 E G G A U A)计算 机 ( a w y 0 4 X G t a 2 0 e 0 D
中重要的研究手段 , 在生物医学 、 医学 等领域发挥 法 着越来越重要的作用[ 。在分子 生物学 实际 的研究 1 工作 中 ,N D A样 品溶 液体积极 小 , 一般 只有 L级 , 而毛细管 电泳仪 , 无论 是商 品仪器 还是 实验 室组 装 的仪器 , 都要求样 品溶 液最少 要有 数微 升到数 十微 升 , 样才能使 毛细管 的进样 端 和电极插 入 到样 品 这 溶液中 , 完成进样操作 。由于 D A样 品较容易被污 N 染降解 , 与毛细管或 电极 接触 后 , 般仅在一 天左 右 一 D A片段就会基本 完全降解 。在需要使用 D A 分 N N 子质 量标准物 ( N Makr作毛 细管 电泳条件实 D A re) 验时 , 往往需要 大量的 D A样 品试 剂 , N 而这些 D A N 试剂一般价 格都较 昂贵 。 实验 中有时 由 P R扩增 在 的 D A样 品溶 液 的离 子强度 较 高 , 导 致 毛细 管 N 会 电泳分 离效率降低 , 分离度不 能满足要求 [。 品堆 2样
的影 响 , 们 用 它 考 察 了样 品稀 释对 电动 进 样 后 我 D A 片段分离 的影 响 , 如图 2 N 结果 所示 。从 图 2 可
以看出,B 32H e D A样品稀释 1倍后, pR 2-a N 0 峰
高变化 不明显 , 线噪声明显增大 , 分离度有 所 虽基 但 改 善 , 现 在 89 即 13 4 峰发 生 了明 显 的分 表 / ( 2/2 )
4 d 8 1 2 ,.5 4 3 0 7 4 3 2 5 3 1 .6 5 ,7 4 6 .2 1 0 ,( ). .1 5 2 6 ,.2 2 , .2 2 ,.4 6 ,6 5 7 .9 1 ,8 3 3 .
如果将样 品稀 释
得
倍 后进 样 , 则其 中各 离子 的
浓度降低 倍, i s C=C/, 即C =C /, s 代入式() 2
积(a p s ri ) sm l t k g作为一种提高毛细管电泳检测 e n a
灵敏度的柱上浓缩方法 , 由于其 简便易行 , 得到 近来
了 越来越广泛的应用[4 样品堆积是通过将分析样 3。 ,
品溶 于离子强度低于 电泳载 体缓 冲溶 液后再进行 流
载体电解质溶液采用 1 T E缓冲溶液, 9 B 由8