-医学图像的三维可视化幻灯片

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磁共振MRA(最大密度投影)
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重建实例一—— 利用MATLAB实现 CT断层图像的三维重建
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三维重建的常用工具 与研究基础
C VTK MITK MATLAB
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医学图像三维重建为人体结构提供了真实、 直观的反映,便于医学人员对病灶的观察 及手术的进行。但图像三维重建编程实现 困难,不易被非计算机专业人士所掌握。
另一种是直接将体像素以一定的颜色和透 明度投影到显示平面的方法,称为体绘制。
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表面重建运算量小,表面显示清晰,但对边 缘检测的要求比较高;
而体重建直接基于体数据进行显示,避免了 重建过程中所造成的伪像痕迹,但运算量较 大。
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重建方法
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预处理
为了有利于从图像中准确地提取出有用的 信息,需要对原始图像进行预处理,以突 出有效的图像信息,消除或减少噪声的干 扰。
MATLAB
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MATLAB6.5 MATLAB6.5的图像处理工具箱实现了断层
图像的三维表面重建及体重建,原理简单, 编程实现方便。 在对头部CT图片进行的三维表面重建及体 重建实验中,重建速度快,显示效果良好, 便于各类非计算机专业人士推广应用。
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三维重建技术的实现方法包括两种:
一种是通过几何单元拼接拟合物体表面来 描述物体的三维结构,称为表面绘制;
生成一个代表顶点内外部状态的二进制编码索引表 移动(前进)至下一个立方体,重复3-7步。 用此索引表查询一个长度为256的构型查找表,得到轮廓
(等值面)与立方体空间关系的具体拓扑状态(构型); 根据构型,通过线性插值确定等值面与立方体相交的三角
片顶点坐标,得到轮廓的具体位置;
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体绘制
直接由三维数据场产生屏幕上的二维图象, 称为体绘制算法。这种方法能产生三维数 据场的整体图象,包括每一个细节,并具 有图象质量高、便于并行处理等优点。体 绘制不同于面绘制,它不需要中间几何图 元,而是以体素为基本单位,直接显示图 像。
医学图像的三维可视化
上海理工大学 聂升东 泰山医学院 邱建峰
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三维可视化的意义
多排螺旋CT等的应用使的使用三维形式显 示组织和器官变得可行且必要。
图像三维显示技术可以更好的显示数据和 诊断信息,为医生提供逼真的显示手段和 定量分析工具。
三维显示还可以避免医生陷入二维图像的 数据“海洋”,防止过多浏览断层图像而 造成漏诊率上升。
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体绘制示例
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体绘制的方法
光线投射(Ray Casting)算法 对三维体数据进行预处理,包括对各断层二维图
像进行降噪; 从显示屏幕的拟显示矩阵中的每个像素按照观察
视角发出光线,光线穿过三维数据场,直接将采 样点值作为顶点值或插值; 使用梯度计算法计算各采样点的法向量,根据光 照模型进行物体表面明暗显示。 计算射线对屏幕显示矩阵中像素的贡献,即沿射 线由远及近的计算采样点的颜色和α值。
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面绘制示例
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面绘制的方法
通过配准及插值后,建立面绘制所需的基本三维体数据, 选定作为表面显示的等值面的灰度阈值
紧邻上下两层数据对应的四个像素点构成一个立方体,或 对应成一个体素;
体素的共8个顶点按照前面得到的等值面阈值进行分类, 超过或等于阈值,则顶点算作等值面的内部点;小于阈值, 顶点算作等值面的外部点;
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最大(小)密度投影
最大密度投影认为每个三维数据体的体素是一个 小的光源。按照图象空间绘制的理论,显示矩阵 的像素向外发出射线,沿观察者的视线方向,射 线穿过数据场遇到最大光强(最大密度值)时, 与最大密度相关的数据值投影在对应的屏幕上的 每个像素中形成最终图像。它可以看作是最简单 的一种图像空间体绘制,不需要定义体数据和颜 色值间的转换关系。最小密度投影道理相同,但 选择最小密度值作为屏幕像素值。
图像格式的转换与读写
图Байду номын сангаас增强
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图像格式的转换与读写
正确读取DICOM图像后,通过选择合适的 窗宽、窗位,将窗宽范围内的值通过线性 或非线性变换转换为小于256的值,将CT 图像转换为256色BMP图像。
更严格的要求是直接基于DICOM图像进行 重建,但要注意DICOM图像灰阶较多,可 以适当阶梯化后进行处理,以提高处理速 度。
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三维可视化的定义和分类
也称三维重建,是指通过对获得的数据或二维图 像信息进行处理,生成物体的三维结构,并按照 人的视觉习惯进行不同效果的显示。
常见的可视化形式有多平面重建(Multiplanar reconstruction,MPR)、 曲面显示(Curved multiplanar reconstruction,CMPR)、表面阴 影显示(Shaded surface Display,SSD)、最 大(小)密度投影(Maximum/minimum intensity projection,MIP)、虚拟内窥镜 (Virtual endoscopy,VE)等。
histeq() imadjust() fspecial() filter2() conv2() medfilt()
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灰度直方图均衡化。均匀量化的自然图像 的灰度直方图通常在低灰度区间上频率较 大,使得图像中较暗区域中的细节看不清 楚,采用直方图修整可使原图像灰度集中 的区域拉开或使灰度分布均匀,从而增大 反差,使图像的细节清晰。
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图像增强
图像增强就是根据某种应用的需要,人为 地突出输入图像中的某些信息,从而抑制 或消除另一些信息的处理过程。使输入图 像具有更好的图像质量,有利于分析及识 别。
三维重建和三维可视化往往针对某一器官 或某一组织重建,因此可以增强目标器官 的对比度或窗口宽度。
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直方图修改 图像平滑 图像边缘锐化 伪彩色增强
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基本的三维可视化技术
面绘制(Surface Rendering)技术
体绘制(Volume Rendering)技术
此外,多平面显示和曲面显示属于将三维 体视数据进行再切面,并将二维切面影像 显示出来的技术形式,因此也称二维重建 或图像重排。
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面绘制
面绘制实际上是显示对三维物体在二维平 面上的真实感投影,就像当视角位于某一 点时,从该点对三维物体进行“照相”, 相片上显示的三维物体形象。
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