MS计算所需要的文件的探讨

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MS计算所需要的文件的探讨

MS计算所需要的文件的探讨(1)

一、MS运行需要哪些文件

在ms模块中搭建好所需要的的结构,然后点一个模块比如castep下拉菜单中的“calcualtion”,出现一个菜单,在该菜单最下方出现三个选项,run,files,help,我们选择点击“files”,然后点击“save files”。这个时候你建立的结构就会默认保存在项目下。你将会发现项目下有很多文件(到工具栏下设置下显示隐藏的文件)。

1. 结构优化

将会在目录中发现如下文件:非隐藏文件(*.param,*.xsd, SMCastep_Extension_*.xms),隐藏文件(*.cell,*.kpaux,*.trjaux)。

1)*.param文件:

comment : CASTEP calculation from Materials Studio

task : GeometryOptimization

xc_functional : PBE

spin_polarized : false

opt_strategy : Speed

page_wvfns : 0

cut_off_energy : 550.000000000000000

grid_scale : 1.500000000000000

finite_basis_corr : 2

finite_basis_npoints : 3

elec_energy_tol : 5.000000000000000e-007

max_scf_cycles : 100

fix_occupancy : true

metals_method : dm

mixing_scheme : Pulay

mix_charge_amp : 0.500000000000000

mix_charge_gmax : 1.500000000000000

mix_history_length : 20

nextra_bands : 0

geom_energy_tol : 5.000000000000000e-006

geom_force_tol : 0.010000000000000

geom_stress_tol : 0.020000000000000

geom_disp_tol : 5.000000000000000e-004

geom_max_iter : 100

geom_method : BFGS

fixed_npw : false

geom_modulus_est : 500.000000000000000 GPa

calculate_stress : true

popn_calculate : false

calculate_densdiff : false

pdos_calculate_weights : false

num_dump_cycles : 0

由此可以看出*.param文件为参数文件,具体意义和castep中的calculation TAB一样

2)*.xsd

为ms特有的晶体结构文件

3) SMCastep_Extension_*.xms

为计算任务文件

4)*.cell文件

%BLOCK LATTICE_CART

4.433337044187580 0.000000000000000 0.000000000000000

0.000000000000000 4.436194********* 0.000000000000000

0.000000000000000 0.000000000000000 2.964214040510110

%ENDBLOCK LATTICE_CART

直角坐标系下晶格常数a,b,c

%BLOCK POSITIONS_FRAC

O 0.3056677837013660 0.3069474983283770 0.0000000000000000

O -0.3056677837013660 -0.3069474983283770 0.0000000000000000

O 0.1943322162986340 0.8069474983283771 0.5000000000000000

O 0.8056677837013661 0.1930525016716231 0.5000000000000000

Sn 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000

Sn 0.5000000000000000 0.5000000000000000 0.5000000000000000

%ENDBLOCK POSITIONS_FRAC

原子的分数坐标

%BLOCK KPOINTS_LIST

0.4166666666666667 0.4166666666666667 0.4375000000000000 0.027777777777778

0.4166666666666667 0.4166666666666667 0.3125000000000000

0.027777777777778 ……………………………………………………………………………………………………….. %ENDBLOCK KPOI NTS_LIST 结构优化所需要的K点

%BLOCK SYMMETRY_OPS

1.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000

0.000000000000000 1.000000000000000 0.000000000000000 …………………………………………………………………………………………….

%ENDBLOCK SYMMETRY_OPS

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