MS计算所需要的文件的探讨
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MS计算所需要的文件的探讨
MS计算所需要的文件的探讨(1)
一、MS运行需要哪些文件
在ms模块中搭建好所需要的的结构,然后点一个模块比如castep下拉菜单中的“calcualtion”,出现一个菜单,在该菜单最下方出现三个选项,run,files,help,我们选择点击“files”,然后点击“save files”。这个时候你建立的结构就会默认保存在项目下。你将会发现项目下有很多文件(到工具栏下设置下显示隐藏的文件)。
1. 结构优化
将会在目录中发现如下文件:非隐藏文件(*.param,*.xsd, SMCastep_Extension_*.xms),隐藏文件(*.cell,*.kpaux,*.trjaux)。
1)*.param文件:
comment : CASTEP calculation from Materials Studio
task : GeometryOptimization
xc_functional : PBE
spin_polarized : false
opt_strategy : Speed
page_wvfns : 0
cut_off_energy : 550.000000000000000
grid_scale : 1.500000000000000
finite_basis_corr : 2
finite_basis_npoints : 3
elec_energy_tol : 5.000000000000000e-007
max_scf_cycles : 100
fix_occupancy : true
metals_method : dm
mixing_scheme : Pulay
mix_charge_amp : 0.500000000000000
mix_charge_gmax : 1.500000000000000
mix_history_length : 20
nextra_bands : 0
geom_energy_tol : 5.000000000000000e-006
geom_force_tol : 0.010000000000000
geom_stress_tol : 0.020000000000000
geom_disp_tol : 5.000000000000000e-004
geom_max_iter : 100
geom_method : BFGS
fixed_npw : false
geom_modulus_est : 500.000000000000000 GPa
calculate_stress : true
popn_calculate : false
calculate_densdiff : false
pdos_calculate_weights : false
num_dump_cycles : 0
由此可以看出*.param文件为参数文件,具体意义和castep中的calculation TAB一样
2)*.xsd
为ms特有的晶体结构文件
3) SMCastep_Extension_*.xms
为计算任务文件
4)*.cell文件
%BLOCK LATTICE_CART
4.433337044187580 0.000000000000000 0.000000000000000
0.000000000000000 4.436194********* 0.000000000000000
0.000000000000000 0.000000000000000 2.964214040510110
%ENDBLOCK LATTICE_CART
直角坐标系下晶格常数a,b,c
%BLOCK POSITIONS_FRAC
O 0.3056677837013660 0.3069474983283770 0.0000000000000000
O -0.3056677837013660 -0.3069474983283770 0.0000000000000000
O 0.1943322162986340 0.8069474983283771 0.5000000000000000
O 0.8056677837013661 0.1930525016716231 0.5000000000000000
Sn 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000
Sn 0.5000000000000000 0.5000000000000000 0.5000000000000000
%ENDBLOCK POSITIONS_FRAC
原子的分数坐标
%BLOCK KPOINTS_LIST
0.4166666666666667 0.4166666666666667 0.4375000000000000 0.027777777777778
0.4166666666666667 0.4166666666666667 0.3125000000000000
0.027777777777778 ……………………………………………………………………………………………………….. %ENDBLOCK KPOI NTS_LIST 结构优化所需要的K点
%BLOCK SYMMETRY_OPS
1.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000
0.000000000000000 1.000000000000000 0.000000000000000 …………………………………………………………………………………………….
%ENDBLOCK SYMMETRY_OPS