传染性造血器官坏死病毒环介导等温扩增检测方法的建立和初步应用

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(1������ Beijing Aquatic Wildlife Rescue and Conservation Centerꎬ Beijing 102100ꎬ Chinaꎻ 2������ Zhengzhou Fengyang Foreign Language Schoolꎬ Zhengzhou 450000ꎬ China)
Abstract: A reverse transcription loop ̄mediated isothermal amplification method for detection of trout infectious haemato ̄ poietic necrosis virus( IHNV) in both of laboratory and field was established in this study������ A set of specific primers were designed based on the IHNV N gene sequence������ IHNV RNA was used as a template for RT ̄LAMP in a reaction mixture con ̄ taining reverse transcriptase and Bst DNA polymerase������ Positive samples exhibited a fluorescent green color whereas negative samples exhibited a reddish brown color������ The optimum temperature for the reaction was 64 ℃������ Specific tests results showed that this method was capable to detect the IHNV had no cross action with SVCVꎬ HRVꎬ VHSV and H2 O������ Sensitivity test results showed that this method could detect 1������ 0 × 10 -4 μg / μL IHNV RNA������ In summaryꎬ the method established in this study was suitable for field detection of IHNV and convenient perform quarantine of mass samples with high specificity and sensitivityꎬ rapidityꎬ simpleꎬ low costꎬ and without relying on any special equipment������ Key words: infectious hematopoietic necrosis virusꎻ troutꎻ loop ̄mediated isothermal amplificationꎻ N gene
Establishment and preliminary application of loop ̄mediated isothermal amplification for detection of infectious haematꎬ CHEN Yi ̄jing2 ꎬ SHI Xiao1 ꎬ ZHANG Bao ̄li1 ꎬ WEN Zhan ̄hua1 ꎬ CHEN Chun ̄shan1 ꎬ LI Bo1 ꎬ DU Ying ̄chun1
传染性造血器官坏死病( infectious haematopoi ̄ etic necrosisꎬIHN) 是极易对冷水鱼养殖造成严重 危害的鱼类急性全身性传染病ꎬ 是世界动物卫生组 织( OIE) 规定必须申报的动物疫病ꎬ 我国农业部也
淡水渔业ꎬ 2019ꎬ 49(3) : 66 - 70 Freshwater Fisheries
2019 年 5 月 May������ 2019
传染性造血器官坏死病毒环介导等温扩增 检测方法的建立和初步应用
何亚鹏1 ꎬ 陈怡静2 ꎬ 时 晓1 ꎬ 张宝莉1 ꎬ 温战华1 ꎬ 陈春山1 ꎬ 李 博1 ꎬ 杜迎春1
(1������ 北京市水生野生动植物救护中心ꎬ 北京 102100ꎻ 2������ 郑州外国语新枫杨学校ꎬ 郑州 450000)
摘要: 实验建立了一套反转录环介导等温扩增方法( reverse transcription loop ̄mediated isothermal amplificationꎬRT ̄ LAMP) ꎬ 用于实验室及现场检测鲑鳟鱼传染性造血器官坏死病毒( infectious haematopoietic necrosis virusꎬIHNV) ꎮ 针对 IHNV 的核蛋白基因设计特异性引物ꎬ 以 IHNV 基因组 RNA 为模板ꎬ 在反转录酶及 Bst DNA 聚合酶的作用 下进行反转录 LAMPꎬ 结果阳性样本表现为荧光绿色ꎬ 阴性样本仍为红棕色ꎮ 反应条件优化结果表明最适反应温 度为 64 ℃ ꎻ 特异性试验表明仅 IHNV 发生特异性扩增ꎬ 而 SVCV、 HRV、 VHSV 和 H2 O 均不发生反应ꎻ 敏感性试 验表明该 LAMP 方法可检出浓度为 1������ 0 × 10 -4 μg / μL 的 IHNV 核酸ꎮ 本研究所建立的 IHNV 反转录 LAMP 检测法 成本低、 操作简单、 反应迅速、 不依赖专门的仪器ꎬ 同时具有较高的灵敏度和特异性ꎬ 适合 IHNV 的现场检测和 大批量样品的检疫ꎮ 关键词: 传染性造血器官坏死病毒ꎻ 鲑鳟ꎻ 环介导等温扩增ꎻ 核蛋白基因 中图分类号: S941������ 41 文献标识码: A 文章编号: 1000 ̄6907 ̄(2019)03 ̄0066 ̄05
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