血清蛋白质组学技术在结核病诊断中的研究进展
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蛋 白质 是 目前 蛋 白质 组 学研 究 的重 要 手段 。下 面介 缺陷。该技术不仅能获得肽段质量 ,而且 能获得肽 段 的氨基酸序列信息 ,具有较 高的敏感度 ,近年来 绍 几种 常用 的血清 蛋 白质组 学分 离 鉴定 技术 。 1 . 1蛋 白 质 分 离 技 术 双 向 凝 胶 电 泳 技 术 ( t wo —
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2 26 ・
结 核 病 与胸 部 肿瘤 2 0 1 7 年 第 3期
Hale Waihona Puke T u b e r &T h o r T u mo r , S e p t 2 0 1 7 , No . 3
.
综述 .
血清 蛋 白质组学技术在 结核病诊 断 中的研 究进 展
孙会姗 潘丽萍 贾红彦 张宗德
得 到 了快 速 发展 ,逐 步 应 用 于 结 核 病 患者 的 血 清研 快速准确的诊断方法对于有效控制结核病意义重大。 究。
样 品进行绝对 和相对定量的研究 ,但该技术存在需
要 同位 素标记 、标签 昂贵及标 记过程复杂 等问题。 2蛋 白质 组 学技 术在 结核 病 血 清标 志物 筛选 中的 而 非 标 记 定 量 蛋 白质 组 学 方 法 不 需 要 同位 素标 记 , 应 用 目前 多种 蛋 白质 组 学 技 术 已用 于 筛 选 结 核 病 患 依靠色谱和质谱数据来定量样本 中的肽段对不 同的 样本进行单独的质谱分析 M 】 ,获得分馏成分后检测 者 的血 清 特 异 性 蛋 白标 志 物 ,这 些 差 异 蛋 白质 可 能 峰强度或肽段 总次数 ,就能直接得到不同样本 的比 参与 了结核病 的潜伏期 、活动期 、转归期和复发期 较蛋 白质组结果 『 5 】 。这两种方法都具有较 高的蛋 白 过程 ,为深入研究其发病机制提供了重要信 息。
高 ,通 常 只用 于 MAL DI — T OF — MS不 能 鉴 定 的样 品 。 通过 2 次 凝胶 电泳 达 到分 离效 果 ,分辨 率 高 ,重 表 面增 强 激 光 解 吸离 子 化 飞 行 时 间质 谱 ( s u r f a c e . 复 性 好 ,但 对 疏 水 蛋 白质 、极 端 碱 性 蛋 白质 和 低
的研 究 应用 进 行综 述 。
基 质 辅 助 激 光 解 吸 电离 飞行
时 间 质谱 ( ma t r i x — a s s i s t e d l a s e r d e s o r p t i o n / i o n i z a t i o n
这为结核病的诊断与鉴别诊断提供 了重要 的理论依 t i me — o f - li f g h t ma s s s p e c t r o me t r y,M ALDI - T OF — MS )
e n h a n c e d l a s e r de s or pt i o n i o ni z a t i o n t i me o f li f gh t ma s s
s p e c t r o me t r y ,S E L D I . T OF — MS ) 通 过将 芯 片 技 术 与 质
谱技术相结合 ,能够敏感 、高通量 的从复杂 的体液
( 血 清 和胸 腔 积 液 等 ) 中分离 蛋 白质 ,形成 比较 蛋 白 质 谱 。该 技 术 简 单 、快 速 ,检 测 只需 要 少 量 的样 本 ( 0 . 5~ 5 . 0 g 1 )【 7 】 ,但 不 能对 检 测 到 的蛋 白质 进行 直 接 鉴定 ,需 要 对该 技术 的实验 条 件进 一步 优 化 。
结核 病是 严重 威胁 人 类健 康 的重 大传染 病 之 一 ,
目前 ,蛋 白质组学技术 已广泛应用于结核病患者血 1 . 2蛋 白质 鉴 定 技 术
清 学 的 研 究 中 ,并 发 现 了一 些 重 要 的 蛋 白质 分 子 , 据 。本 文对 血 清 蛋 白组 学 技 术 在 结 核病 患 者 诊 断 中
具 有 高 精 确 性 、高敏 感 度 和 宽 分 子 量 检 测 范 围 ,主 要 用于 肽质 量 指纹 ( p e p t i d e ma s s i f n g e r p r i n t i n g , P MF )
1 血清 蛋 白质组学技术研究进展 血液中的蛋 白质 的鉴 定 ,不需 要全部 肽片段质 量均与理 论值相符 , 处 于 不 断 的变 化 中 ,但 血 清 中含 量 只 有 1 % 的低 丰 可 同 时 处 理 许 多 样 品 ,是 大 规 模 鉴 定 的 首 选 方 法 。 MF路 线 来 鉴 定 蛋 白质 并 非 总能 获 得 成 功 , 度蛋 白质却是与疾病相关 的组织病理信息的载体 】 , 但单靠 P 因此 ,富集血清 中的低 丰度蛋 白质并筛选鉴定差异 因此 ,电喷 雾 串联 质谱 ( E S I — Ms / Ms ) 弥 补 了这 一
丰度蛋 白质等的分离仍有一定 困难 [ 2 】 。因此不基于 胶 分离 的蛋 白质组 学技术 逐渐 发展 起来 ,包括 同 位 素标 记 相对 和 绝对 定 量 ( i s o b a r i c t a g s f o r r e l a t i v e
a n d a b s o l u t e q u a n t i t a t i o n , i T R AQ ) 及 非 标 记 技 术。 i T R AQ技 术 分 辨 率 高 [ 3 】 ,通 过 i T RA Q 同 位 素 试 剂 标 记 氨 基 酸 N 端 及赖 氨 酸 侧链 基 团 ,能 同时 对 8种
d i me n s i o n a l d i f f e r e n c e g e l e l e c t r o p h o r e s i s ,2 D— DI G E )
常 与 液 相 色谱 联 用 ,具 有 在 高 复 杂 性 样 本 中鉴 定 低 丰 度 蛋 白质 的 强 大 功 能 ,但 其 系统 复 杂 、操 作 要 求
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结 核 病 与胸 部 肿瘤 2 0 1 7 年 第 3期
Hale Waihona Puke T u b e r &T h o r T u mo r , S e p t 2 0 1 7 , No . 3
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综述 .
血清 蛋 白质组学技术在 结核病诊 断 中的研 究进 展
孙会姗 潘丽萍 贾红彦 张宗德
得 到 了快 速 发展 ,逐 步 应 用 于 结 核 病 患者 的 血 清研 快速准确的诊断方法对于有效控制结核病意义重大。 究。
样 品进行绝对 和相对定量的研究 ,但该技术存在需
要 同位 素标记 、标签 昂贵及标 记过程复杂 等问题。 2蛋 白质 组 学技 术在 结核 病 血 清标 志物 筛选 中的 而 非 标 记 定 量 蛋 白质 组 学 方 法 不 需 要 同位 素标 记 , 应 用 目前 多种 蛋 白质 组 学 技 术 已用 于 筛 选 结 核 病 患 依靠色谱和质谱数据来定量样本 中的肽段对不 同的 样本进行单独的质谱分析 M 】 ,获得分馏成分后检测 者 的血 清 特 异 性 蛋 白标 志 物 ,这 些 差 异 蛋 白质 可 能 峰强度或肽段 总次数 ,就能直接得到不同样本 的比 参与 了结核病 的潜伏期 、活动期 、转归期和复发期 较蛋 白质组结果 『 5 】 。这两种方法都具有较 高的蛋 白 过程 ,为深入研究其发病机制提供了重要信 息。
高 ,通 常 只用 于 MAL DI — T OF — MS不 能 鉴 定 的样 品 。 通过 2 次 凝胶 电泳 达 到分 离效 果 ,分辨 率 高 ,重 表 面增 强 激 光 解 吸离 子 化 飞 行 时 间质 谱 ( s u r f a c e . 复 性 好 ,但 对 疏 水 蛋 白质 、极 端 碱 性 蛋 白质 和 低
的研 究 应用 进 行综 述 。
基 质 辅 助 激 光 解 吸 电离 飞行
时 间 质谱 ( ma t r i x — a s s i s t e d l a s e r d e s o r p t i o n / i o n i z a t i o n
这为结核病的诊断与鉴别诊断提供 了重要 的理论依 t i me — o f - li f g h t ma s s s p e c t r o me t r y,M ALDI - T OF — MS )
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s p e c t r o me t r y ,S E L D I . T OF — MS ) 通 过将 芯 片 技 术 与 质
谱技术相结合 ,能够敏感 、高通量 的从复杂 的体液
( 血 清 和胸 腔 积 液 等 ) 中分离 蛋 白质 ,形成 比较 蛋 白 质 谱 。该 技 术 简 单 、快 速 ,检 测 只需 要 少 量 的样 本 ( 0 . 5~ 5 . 0 g 1 )【 7 】 ,但 不 能对 检 测 到 的蛋 白质 进行 直 接 鉴定 ,需 要 对该 技术 的实验 条 件进 一步 优 化 。
结核 病是 严重 威胁 人 类健 康 的重 大传染 病 之 一 ,
目前 ,蛋 白质组学技术 已广泛应用于结核病患者血 1 . 2蛋 白质 鉴 定 技 术
清 学 的 研 究 中 ,并 发 现 了一 些 重 要 的 蛋 白质 分 子 , 据 。本 文对 血 清 蛋 白组 学 技 术 在 结 核病 患 者 诊 断 中
具 有 高 精 确 性 、高敏 感 度 和 宽 分 子 量 检 测 范 围 ,主 要 用于 肽质 量 指纹 ( p e p t i d e ma s s i f n g e r p r i n t i n g , P MF )
1 血清 蛋 白质组学技术研究进展 血液中的蛋 白质 的鉴 定 ,不需 要全部 肽片段质 量均与理 论值相符 , 处 于 不 断 的变 化 中 ,但 血 清 中含 量 只 有 1 % 的低 丰 可 同 时 处 理 许 多 样 品 ,是 大 规 模 鉴 定 的 首 选 方 法 。 MF路 线 来 鉴 定 蛋 白质 并 非 总能 获 得 成 功 , 度蛋 白质却是与疾病相关 的组织病理信息的载体 】 , 但单靠 P 因此 ,富集血清 中的低 丰度蛋 白质并筛选鉴定差异 因此 ,电喷 雾 串联 质谱 ( E S I — Ms / Ms ) 弥 补 了这 一
丰度蛋 白质等的分离仍有一定 困难 [ 2 】 。因此不基于 胶 分离 的蛋 白质组 学技术 逐渐 发展 起来 ,包括 同 位 素标 记 相对 和 绝对 定 量 ( i s o b a r i c t a g s f o r r e l a t i v e
a n d a b s o l u t e q u a n t i t a t i o n , i T R AQ ) 及 非 标 记 技 术。 i T R AQ技 术 分 辨 率 高 [ 3 】 ,通 过 i T RA Q 同 位 素 试 剂 标 记 氨 基 酸 N 端 及赖 氨 酸 侧链 基 团 ,能 同时 对 8种
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常 与 液 相 色谱 联 用 ,具 有 在 高 复 杂 性 样 本 中鉴 定 低 丰 度 蛋 白质 的 强 大 功 能 ,但 其 系统 复 杂 、操 作 要 求