蛋白质结构和功能关系PPT

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蛋白质的结构及功能课件.ppt

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蛋白质的结构及功能课件
2. 侧链有极性但不带电荷的氨基酸是极性中 性氨基酸
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3. 侧链含芳香基团的氨基酸是芳香族氨基酸
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4. 侧链含负性解离基团的氨基酸是酸性氨基酸
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5. 侧链含正性解离基团的氨基酸属于碱性 氨基酸
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3. 氧化供能
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第一节
蛋白质的分子组成
The Molecular Component of Protein
蛋白质的结构及功能课件
蛋白质的元素组成 主要有C、H、O、N和S。 有些蛋白质含有少量P或金属元素Fe、
Cu、Zn、Mn、Co、Mo,个别蛋白质还 含有 I 。
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第三节
蛋白质结构与功能的关系
The Relation of Structure and Function of Protein
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一、蛋白质一级结构与功能的关系
(一)一级结构是空间构象的基础



牛核糖核酸酶的 一级结构
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去除尿素、 β-巯基乙醇
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生物化学与医学
• 生物化学的理论与技术已渗透到医学科 学的各个领域
• 生物化学在生命科学中占有重要的地位 • 生物化学的发展促进了疾病病因、诊断
和治疗的研究
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本课内容简介(一)
• 蛋白质的结构与功能 •酶 • 生物氧化 • 糖代谢 • 脂类代谢 • 氨基酸代谢
几种特殊氨基酸
Gly:无手性碳原子。 Pro:为环状亚氨基酸。 Cys:可形成二硫键。

蛋白质结构与功能ppt

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03
基于抗体与抗原的特异性结合原理,开发针对特定疾病的抗体
药物,如单克隆抗体、双特异性抗体等。
基因工程疫苗研究与开发
重组蛋白疫苗
利用基因工程技术将编码病原微生物保护性抗原的基因导入表达 系统,制备重组蛋白疫苗,从而诱导机体产生特异性免疫应答。
病毒样颗粒疫苗
利用病毒的结构蛋白自组装形成病毒样颗粒,模拟病毒的 自然感染过程,制备具有高免疫原性和安全性的疫苗。
05
蛋白质结构与功能的研究 方法
X射线晶体学
01
02
03
X射线衍射原理
利用X射线与晶体中的原 子相互作用产生衍射现象, 通过分析衍射图谱推断蛋 白质分子的三维结构。
晶体培养与优化
通过特定的条件和方法培 养和优化蛋白质的晶体, 以获得高质量的衍射数据。
结构解析与修正
利用计算机程序对衍射数 据进行处理、解析和修正, 最终得到蛋白质的三维结 构模型。
质的结构和动力学信息。
电镜技术
电子显微镜原理
利用高能电子束与样品相互作用产生散射、吸收等效应,通过检测 和处理这些效应产生的信号获得样品的形貌和结构信息。
样品制备与染色
制备适合电镜观察的蛋白质样品,通常需要对蛋白质进行负染或金 属投影等染色方法以增强对比度。
图像采集与处理
设置合适的实验参数,采集电子显微镜图像,并利用计算机程序对图 像进行处理和分析,得到蛋白质的结构和形貌信息。
蛋白质可以作为激素、 生长因子等,调节生物 体的生长、发育和代谢 等活动;同时,也可以 作为信号分子,参与细 胞间的通讯。
蛋白质的研究历史与现状
研究历史
自19世纪末开始,科学家们逐渐认识到蛋白质的重要性,并开展了大量的研究工作。 20世纪中叶以后,随着分子生物学和基因工程技术的发展,蛋白质研究进入了新的阶

蛋白质的结构与功能的关系PPT课件

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1、肌红蛋白Myoglobin(Mb)结构与功能
肌红蛋白:主要肌细胞贮存和分配氧的蛋白质。肌红蛋白是由一条多肽链和一个辅基血红素(原卟啉IX 和Fe的络合物)组成,除去血红素的脱辅基肌红蛋白称珠蛋白(globin),它和血红蛋白的亚基在氨基酸序列上有明显的同源性,构象和功能也相似,由8个α-螺旋组成。
这类疾病包括:人纹状体脊髓变性病、老年痴呆症、亨停顿舞蹈病、疯牛病等。
疯牛病中的蛋白质构象改变 疯牛病是由朊病毒蛋白(prion protein, PrP)引起的一组人和动物神经退行性病变。 正常的PrP富含α-螺旋,称为PrPc。 PrPc在某种未知蛋白质的作用下可转变成全为β-折叠的PrPsc,从而致病。
RER
600 核苷酸
C肽
24 aa
信号肽
3.蛋白质一级结构的种属差异与分子进化
对于不同种属来源的同种蛋白质进行一级结构测定和比较,发现存在种属差异,这种差异可能是分子进化的结果,但与功能相关的结构总是有高度的保守性。 以细胞色素C为例:细胞色素C广泛存在于真核生物细胞的线粒体中,是一种含有血红素辅基的单链蛋白质。在生物氧化时,细胞色素C在呼吸链的电子传递系统中起传递电子的作用,使血红素上铁原子的价数发生变化。
协同效应(cooperativity)
一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体结合后,能影响此寡聚体中另一个亚基与配体结合能力的现象,称为协同效应。 如果是促进作用则称为正协同效应(positive cooperativity) 如果是抑制作用则称为负协同效应(negative cooperativity) 血红蛋白的氧合具有正协同性同促效应,也即一个O2的结合增加同一Hb分子中其余空的氧结合部位对O2的亲和力。
波耳效应 (Bohr effect) pH对氧饱和曲线的影响

生物化学第1章蛋白质的结构与功能(共89张PPT)

生物化学第1章蛋白质的结构与功能(共89张PPT)

蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部
位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。
亚基之间的结合力主要是疏水作用,其次是氢
键和离子键。
血红蛋白的四级结构
第三节
蛋白质结构与功能的关系
The Relation of Structure and Function of Protein
一、蛋白质一级结构与功能的关系
二、蛋白质的二级结构
定义 蛋白质分子中某一段肽链的局部空间
结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间 位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象 。
主要的维系键: 氢键
蛋白质立体结构原则
由于C=O双键中的π电子云与N原子上的未共用电子对发生“电子 共振”,使肽键具有部贮存的作用
血红蛋白 ——运输氧 铜蓝蛋白 ——运输铜 铁蛋白 ——贮存铁
5)免疫保护作用
抗原抗体反应 凝血机制
6)参与细胞间信息传递
信号传导中的受体、信息分子等
7) 氧化供能
第一节
蛋白质的分子组成
The Molecular Component of Protein
组成蛋白质的元素
β-折叠是由 若干肽段或 肽链排列起 来所形成的 扇面状片层 构象
β-折叠包括平行式和反平行式两种类型
结构特征:
⑴ 由若干条肽段或肽链平行或反平 行排列组成片状结构;
⑵ 主链骨架伸展呈锯齿状; ⑶ 涉及的肽段较短,一般为5~10个
氨基酸残基; ⑷ 借相邻主链之间的氢键维系。
3. -转角
是多肽链180°回 折部分所形成的一
在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳 离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼 性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为 该氨基酸的等电点。

蛋白质的功能及其与结构之间的关系PPT课件

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3
兼职蛋白(moonlighting proteins)
定义:一些蛋白质虽然只有一种结构,但却能行使几种甚 至多种不同的功能。这些兼有其他功能的蛋白质被称为兼 职蛋白。
实例:(1)磷酸己糖异构酶除了在细胞内参与糖酵解以 外,还能由T淋巴细胞分泌到胞外充当一种神经白介素, 促进胚胎内某些脊髓神经元和感觉神经元的存活,以及促 进B淋巴细胞的成熟。此外,它还是一种自分泌运动因子 在由某些癌细胞分泌以后,可刺激癌细胞的迁移和扩散; (2)参与糖酵解的3-磷酸甘油醛脱氢酶以四聚体的形式 存在于细胞液,而当以单体的形式存在于细胞核的时候, 它却是一种尿嘧啶-DNA糖苷酶,参与DNA的碱基切除修 复;(3)大肠杆菌的生物素合成酶兼做其生物素操纵子 的阻遏蛋白。
Hb因为具有四级结构,因此具有正协同效应、波尔效 应和别构效应,这三个效应都有利于Hb行使运输氧气 的功能。
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肌红蛋白和血红蛋白的比较
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Mb与Hb的在一级结构的比较
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Hb的 a 链β链与Mb具有相似的三维结构
Mb 2019/11/9
2019/11ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ9
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二价态的血红素铁结合氧气
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肌红蛋白的三维结构
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血红素辅基与CO或O2的结合
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肌红蛋白的氧合曲线
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Hb的结构与功能
Hb由四个亚基组成,因而有四级结构。每一个亚基称 为珠蛋白,单个亚基的一级结构与Mb差别较大,只 有27个位置的氨基酸残基与Mb相同,但二级和三级 结构却与Mb十分相似。

蛋白质结构与功能的关系医学PPT

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一、肌红蛋白的结构和功能
(一)三级结构
哺乳动物肌细 胞贮存和分配 氧的蛋白质, 由一条多肽链 和一个辅基血 红素构成。脱 辅基称为珠蛋 白。
myoglobin,Mb
.
两套位置编号,93位His又编为F8
153个AA
8段螺旋
(二)辅基
蛋白质自身不能与氧发生可逆结合,需要过渡金属的低氧态 来结合氧。肌红蛋白由原卟啉IX来固定Fe2+。
扬州大学生物科学与技术学院 生物化学精品课程
肌红蛋白 / 血红蛋白α / 血红蛋白β AA序列大不相同,结构相似 结构决定功能(载氧)
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(二)氧结合引起的Hb的构象变化
变构 脱氧血红蛋白
对氧的亲和力低
氧合血红蛋白
对氧的亲和力高
1、氧合作用改变Hb四级结构
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滑动接触
α2β1 α1β2
可变
装配接触
α2β2 α1β1
接触面积大
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2.血红素铁的微小位移导致血红蛋白构象的转换
这一微小的移动具有很深的生物学后果。移动的 结果导致维系去氧血红蛋白四级结构的链间盐键
断裂以及b-亚基之扬间州大的学生空物科隙学与变技术窄学院。 生物化学精品课程
生物化学精品课程
肌红蛋白和血红蛋白多肽微环境的作用
• 固定血红素 • 保护血红素铁免遭氧化
• 为氧分子提供一个合适的结合部位。
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(四)Mb的氧结合曲线
血红蛋白
肌红蛋白
O2(肺或腮)
O2(组织) Mb
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Hb与O2结合的解离常数为:
变形后得: 以n代替4得到一般性方程: 该方程是一个S型曲线,但在n=1 和n=4时,具有显著差别:在n=4时,Hb与 氧的结合显示出高度协同性。P262 把上述方程进行变形,得到:
该方程谓之Hill方程,
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T
R
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H+,CO2和BPG对Hb结合氧的影响: 1. Bohr效应:当H+浓度增加时,Hb的氧分数饱和曲
A ligand binds at a site on the protein called the binding site, which is complementary to the ligand in size, shape, charge, and hydrophobic or hydrophilic character. Furthermore, the interaction is specific: the protein can discriminate among the thousands of different molecules in its environment and selectively bind only one or a few.
第二节 Hb
脊椎动物,4个亚基构成,成 人主要为HbA,含a2b2。分 别为141和146个aa残基。
Hb的近侧F8 His位于a链 His87或b链His92,远侧His 为E7,分别为His58和His63.
当O2与Hb的一个亚单位之血 红素结合时,可导致Fe被拉 回血红素平面(只是非常微 小的变化),后者又会拖动 F8His残基,从而引起Hb构 象变化,使Hb的b亚基之间 空穴减小,导致BPG被挤出, 促使Hb与O2的亲和力增加。
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Hb的构象有两种状态,即R态和T态,R态与O2亲和力更高, 在去氧状态时,T态更加稳定并由广泛的盐键维持构象
稳定,但一旦其中一个亚基与氧 结合,将使Hb由T转变为R态
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二、Hb氧合曲线
Hb的氧合曲线是S型曲线,而非Mb的双曲线,其生理意义是 在低氧分压下,有利于释放氧。这一现象早在1910年就由Hill 发现,并试图对其进行了解释。
所有AA残基。 结构:p253由8段a螺旋构成,疏水基团几乎全部位
于分子内部。
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5
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二、血红素:由原卟啉IX与Fe结合形成血红素,2 价,则为亚铁血红素,3+为高铁血红素p254,它以 非共价的形式结合于肌红蛋白分子疏水空穴中。
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三、O2与肌红蛋白的结合 在氧和肌红蛋白结合时,血红素之Fe在第五配位键
肌红蛋白与氧结合是在组织中,可逆的接受来自Hb
的O2,有:MbO2=Mb + O2,该式的解离常数可以描
Байду номын сангаас
述为: K=[Mb][O2]/[MbO2],
(1)
转换后有: [MbO2][Mb]=O2/K
(2),
引入Y,定义为给定氧压下肌红蛋白氧饱和度,即 MbO2占总Mb的比例Y=[MbO2]/[Mb]+[MbO2],(3) 以(2)式MbO2替换,得:Y=O2/O2+K,按Henry定 律,改写为O2分压,则
蛋白质一级结构决定高级结构,决定蛋白质的功能。
2
The functions of many proteins involve the reversible binding of other molecules. A molecule bound reversibly by a protein is called a ligand.p253
第六章 蛋白质结构与功能关系
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Knowing the three-dimensional structure of a protein is an important part of understanding how the protein functions. However, the structure shown in two dimensions on a page is deceptively static. Proteins are dynamic molecules whose functions almost invariably depend on interactions with other molecules, and these interactions are affected in physiologically important ways by sometimes subtle, sometimes striking changes in protein conformation.
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实践中,Y值可以通过光谱法测量,再以Y对p(O2)作 图,得到的曲线为氧合曲线或氧解离曲线。
意义:当y=1,所有Mb均与O2结合 当y=0.5时,Y=K=P50 为方便起见,对前面方程进行改写: 再两边取对数,得到:
以log[Y/(1-Y)]对logPO2作图 得到一条直线:即Hill图
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3
第一节: 肌红蛋白结构与功能 Myoglobin是重要的氧结合蛋白 一、三级结构 Myoglobin-1peptide plus 1 辅基构成,153AA,
MW16,700。脱去血红素谓之珠蛋白。 Kendew等1963年完成鲸肌红蛋白空间结构测定,利
用不同分辨率X射线衍射,可以识别出AA残基。 0.6nm,多肽链走向;0.2nm,侧链基团;0.14nm,
与His93 (proximal) 进行结合,而第六配位键与氧结 合,另一个氧原子则与His64(distal)作用。p255
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四、O2与肌红蛋白的结 合改变了肌红蛋白的构 象,氧的结合,将Fe拉 回到卟啉环平面,从而 导致His93的空间位置改 变,进而使整个蛋白的 构象发生改变。
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五、肌红蛋白氧合曲线
线向右移动的现象,即pH的降低可导致血红蛋白氧 结合力下降的现象。丹麦生理学家C.Bohr发现。从 机制上说,H+升高促进链间盐桥的形成,促进由R 转变为T态。P264Figure 生理意义 CO2同样可以降低Hb与O2 的亲和力,原因是CO2与 Hb的C端aa残基的NH2反应 生成氨甲酸-AA,产生的H+ 通过Bohr效应起作用。
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