酶化学
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第 六 章 酶化学 (Chemistry of Enzyme)
什么是酶
酶与一般催化剂的共性及特性 共性: 共性: 不发生质、量的变化, 改变反应速度; 不发生质、量的变化,但能 改变反应速度; 不改变反应的平衡点,但能缩短反应时; 不改变反应的平衡点,但能缩短反应时; 可降低反应活化能; 可降低反应活化能; 只能催化热力学允许的反应 。 特性: 特性: 高效性、专一性、易失活、酶活性可调控; 高效性、专一性、易失活、酶活性可调控; 催化作用与结构有关。 催化作用与结构有关。
习惯上沿用的单位如 :
乳酸 + NAD+
乳酸脱氢酶
丙酮酸 + NADH + H+
乳酸脱氢酶的活力可用丙酮酸的增加量表示, 乳酸脱氢酶的活力可用丙酮酸的增加量表示, 丙酮酸的增加量表示 也可用340nm光吸收的增加量来表示。 也可用340nm光吸收的增加量来表示。 340nm光吸收的增加量来表示
酶活力单位表示方法
* Km值等于酶促反应速度为最大反应速度一半 时的底物浓度,单位是mol/L。 时的底物浓度,单位是 。
温度对酶促反应的影响 酶活性
最适温度 温度
pH对酶促反应的影响 对酶促反应的影响
不可逆抑制
抑制剂与酶活性中心的某些必需基团共价键不可逆 结合,引起酶的活性丧失。 结合,引起酶的活性丧失。 实例: 实例:有机磷杀虫剂
Asp
活性中心以外 的必需基团
底物
催化基团
结合基团
活性中心
肠激酶
胰蛋白酶
缬天天天天赖异缬甘
组
46
丝
18 3
S S S 活性中心
S
缬天天天天赖
缬 异甘组 丝 S S S S
胰蛋白酶原的激活过程
酶作用专一性的机制
钥匙学说(模板学说)
诱导契合学说
酶作用高效性的机制——共价催化与酸碱催化 共价催化与酸碱催化 酶作用高效性的机制
酶的分类
① 氧化还原酶 ② 转移酶 ③ 水解酶 ④ 裂合酶 ⑤ 异构酶 ⑥ 合成酶
酶分子的结构特征
结合部位) (结合部位) 酶的活性中心
催化部位) (催化部位)
胰 凝 乳 蛋 白 酶 的 活 性 中 心
Ser
His 活性中心重要基团: 活性中心重要基团 His57 , Asp102 , Ser195
酶的比活力 比活力:指每mg蛋白质所具有的酶活力, 比活力:指每mg蛋白质所具有的酶活力,一般用 mg蛋白质所具有的酶活力 U/mg蛋白质来表示。 U/mg蛋白质来表示。 蛋白质来表示 比活力是酶纯度衡量的重要指标之一。 比活力是酶纯度衡量的重要指标之一。 回收率= 提纯后总活力/提纯前总活力) 回收率=(提纯后总活力/提纯前总活力)×100% 纯化倍数(纯化率) 纯化倍数(纯化率) =(提纯后比活力/提纯前比活力)×100% 提纯后比活力/提纯前比活力)
酶的组成
单纯酶:脲酶、蛋白酶、淀粉酶、纤维素酶等。 单纯酶:脲酶、蛋白酶、淀粉酶、纤维素酶等。 酶 酶蛋白(apoenzyme) 酶蛋白(apoenzyme) 结合酶 辅酶( 辅酶(coenzyme) 辅助因子 (cofacter) 辅基(prosthetic group) 辅基(prosthetic
调节酶
1. 聚合解聚调节酶 2. 共价修饰酶 3. 别构酶
效应剂
别 构 中 心
别构中心非酶活性 中心的组成部分
活性 中心
Байду номын сангаас酶的别构(变构)效应示意图
同工酶
能催化相同的化学反应,而其分子结构、 能催化相同的化学反应,而其分子结构、 理化性质不同的一组酶。 理化性质不同的一组酶。 举例:乳酸脱氢酶(LDH1~ LDH5) 举例:乳酸脱氢酶(LDH
V
Vmax
[S]
当底物浓度高达一定程度 反应速度不再增加,达最大速度; 反应速度不再增加,达最大速度; 反应为零级反应。 反应为零级反应。
米氏方程
V m ax [S ] V= K m + [S]
Km值的推导
当反应速度为最大反应速度一半时 V Vmax Vmax/2 Km [S]
Vmax 2
Vmax[S] = Km + [S] Km=[S]
H H H H LDH1 (H4) H H H M LDH2 (H3M) H H M M LDH3 (H2M2) H M M M LDH4 (HM3) M M M M LDH5 (M4)
乳酸脱氢酶的同工酶
H型亚基富含酸性 ,M型亚基富含碱性 型亚基富含酸性AA, 型亚基富含碱性 型亚基富含碱性AA 型亚基富含酸性
乳酸脱氢酶同工酶形成示意图
a
结构基因 mRNA 多肽 亚基
b
四聚体
LDH1 LDH2 LDH3 LDH4 LDH5
阳极
阴极
肝
骨骼肌
肾
红细胞
心肌
乳酸脱氢酶同工酶电泳图谱
国际单位(IU):1961年 国际单位(IU):1961年 (IU) 在最适条件下,每分钟催化1μmol底物的减少或产 在最适条件下,每分钟催化1 mol底物的减少或产 物的生产所需的酶量为一个国际单位。 物的生产所需的酶量为一个国际单位。 催量单位(katal):1972年 催量单位(katal):1972年 (katal) 指在最适条件下,每秒钟使1mol底物转化为产物 指在最适条件下,每秒钟使1mol底物转化为产物 所需的酶量。 所需的酶量。 1Kat= 可以以纳Kat Kat、 Kat来进行换算 来进行换算。 1Kat=6×107IU ,可以以纳Kat、微Kat来进行换算。
酶分子中可作为亲核基团和酸碱催化的功能基团
胰凝乳蛋白酶反应的详细机制( ) 胰凝乳蛋白酶反应的详细机制(1)
底物
结合底物
形成共价 ES复合物 复合物 His57 质子供体
C-N键断裂 键断裂
胰凝乳蛋白酶反应的详细机制( ) 胰凝乳蛋白酶反应的详细机制(2)
羰基产物释放
水亲核攻击 四面体中间物 的瓦解
羧基产物释放
酶促反应动力学 Vmax
Vmax/2
Km
Cs
酶促反应速率与底物浓度的关系
V Vmax
[S] 当底物浓度较低时 反应速度与底物浓度成正比; 反应速度与底物浓度成正比;反 应为一级反应。 应为一级反应。
V
Vmax
[S]
随着底物浓度的增高 反应速度不再成正比例加速; 反应速度不再成正比例加速;反应 为混合级反应。 为混合级反应。
O-R X P O -Ser-OH O-R O-R -Ser-O P O O-R
竞争性可逆抑制
磺胺类药物的抑菌机制: 与对氨基苯甲酸竞争二氢叶酸合成酶
非竞争性可逆抑制
反竞争性可逆抑制
酶活性
酶活力( 也称酶活性) 酶活力(enzyme activity, 也称酶活性) 酶催化一定化学反应的能力, 酶催化一定化学反应的能力,用在一定条件 下酶所催化反应的反应速度来表示。 下酶所催化反应的反应速度来表示。 酶活力的大小用酶活力单位来表示,简称酶 酶活力的大小用酶活力单位来表示,简称酶 单位( U),就是表示酶量多少的单位。 ),就是表示酶量多少的单位 单位(unit, U),就是表示酶量多少的单位。 其表示方法与所有的测定方法有关。 其表示方法与所有的测定方法有关。
什么是酶
酶与一般催化剂的共性及特性 共性: 共性: 不发生质、量的变化, 改变反应速度; 不发生质、量的变化,但能 改变反应速度; 不改变反应的平衡点,但能缩短反应时; 不改变反应的平衡点,但能缩短反应时; 可降低反应活化能; 可降低反应活化能; 只能催化热力学允许的反应 。 特性: 特性: 高效性、专一性、易失活、酶活性可调控; 高效性、专一性、易失活、酶活性可调控; 催化作用与结构有关。 催化作用与结构有关。
习惯上沿用的单位如 :
乳酸 + NAD+
乳酸脱氢酶
丙酮酸 + NADH + H+
乳酸脱氢酶的活力可用丙酮酸的增加量表示, 乳酸脱氢酶的活力可用丙酮酸的增加量表示, 丙酮酸的增加量表示 也可用340nm光吸收的增加量来表示。 也可用340nm光吸收的增加量来表示。 340nm光吸收的增加量来表示
酶活力单位表示方法
* Km值等于酶促反应速度为最大反应速度一半 时的底物浓度,单位是mol/L。 时的底物浓度,单位是 。
温度对酶促反应的影响 酶活性
最适温度 温度
pH对酶促反应的影响 对酶促反应的影响
不可逆抑制
抑制剂与酶活性中心的某些必需基团共价键不可逆 结合,引起酶的活性丧失。 结合,引起酶的活性丧失。 实例: 实例:有机磷杀虫剂
Asp
活性中心以外 的必需基团
底物
催化基团
结合基团
活性中心
肠激酶
胰蛋白酶
缬天天天天赖异缬甘
组
46
丝
18 3
S S S 活性中心
S
缬天天天天赖
缬 异甘组 丝 S S S S
胰蛋白酶原的激活过程
酶作用专一性的机制
钥匙学说(模板学说)
诱导契合学说
酶作用高效性的机制——共价催化与酸碱催化 共价催化与酸碱催化 酶作用高效性的机制
酶的分类
① 氧化还原酶 ② 转移酶 ③ 水解酶 ④ 裂合酶 ⑤ 异构酶 ⑥ 合成酶
酶分子的结构特征
结合部位) (结合部位) 酶的活性中心
催化部位) (催化部位)
胰 凝 乳 蛋 白 酶 的 活 性 中 心
Ser
His 活性中心重要基团: 活性中心重要基团 His57 , Asp102 , Ser195
酶的比活力 比活力:指每mg蛋白质所具有的酶活力, 比活力:指每mg蛋白质所具有的酶活力,一般用 mg蛋白质所具有的酶活力 U/mg蛋白质来表示。 U/mg蛋白质来表示。 蛋白质来表示 比活力是酶纯度衡量的重要指标之一。 比活力是酶纯度衡量的重要指标之一。 回收率= 提纯后总活力/提纯前总活力) 回收率=(提纯后总活力/提纯前总活力)×100% 纯化倍数(纯化率) 纯化倍数(纯化率) =(提纯后比活力/提纯前比活力)×100% 提纯后比活力/提纯前比活力)
酶的组成
单纯酶:脲酶、蛋白酶、淀粉酶、纤维素酶等。 单纯酶:脲酶、蛋白酶、淀粉酶、纤维素酶等。 酶 酶蛋白(apoenzyme) 酶蛋白(apoenzyme) 结合酶 辅酶( 辅酶(coenzyme) 辅助因子 (cofacter) 辅基(prosthetic group) 辅基(prosthetic
调节酶
1. 聚合解聚调节酶 2. 共价修饰酶 3. 别构酶
效应剂
别 构 中 心
别构中心非酶活性 中心的组成部分
活性 中心
Байду номын сангаас酶的别构(变构)效应示意图
同工酶
能催化相同的化学反应,而其分子结构、 能催化相同的化学反应,而其分子结构、 理化性质不同的一组酶。 理化性质不同的一组酶。 举例:乳酸脱氢酶(LDH1~ LDH5) 举例:乳酸脱氢酶(LDH
V
Vmax
[S]
当底物浓度高达一定程度 反应速度不再增加,达最大速度; 反应速度不再增加,达最大速度; 反应为零级反应。 反应为零级反应。
米氏方程
V m ax [S ] V= K m + [S]
Km值的推导
当反应速度为最大反应速度一半时 V Vmax Vmax/2 Km [S]
Vmax 2
Vmax[S] = Km + [S] Km=[S]
H H H H LDH1 (H4) H H H M LDH2 (H3M) H H M M LDH3 (H2M2) H M M M LDH4 (HM3) M M M M LDH5 (M4)
乳酸脱氢酶的同工酶
H型亚基富含酸性 ,M型亚基富含碱性 型亚基富含酸性AA, 型亚基富含碱性 型亚基富含碱性AA 型亚基富含酸性
乳酸脱氢酶同工酶形成示意图
a
结构基因 mRNA 多肽 亚基
b
四聚体
LDH1 LDH2 LDH3 LDH4 LDH5
阳极
阴极
肝
骨骼肌
肾
红细胞
心肌
乳酸脱氢酶同工酶电泳图谱
国际单位(IU):1961年 国际单位(IU):1961年 (IU) 在最适条件下,每分钟催化1μmol底物的减少或产 在最适条件下,每分钟催化1 mol底物的减少或产 物的生产所需的酶量为一个国际单位。 物的生产所需的酶量为一个国际单位。 催量单位(katal):1972年 催量单位(katal):1972年 (katal) 指在最适条件下,每秒钟使1mol底物转化为产物 指在最适条件下,每秒钟使1mol底物转化为产物 所需的酶量。 所需的酶量。 1Kat= 可以以纳Kat Kat、 Kat来进行换算 来进行换算。 1Kat=6×107IU ,可以以纳Kat、微Kat来进行换算。
酶分子中可作为亲核基团和酸碱催化的功能基团
胰凝乳蛋白酶反应的详细机制( ) 胰凝乳蛋白酶反应的详细机制(1)
底物
结合底物
形成共价 ES复合物 复合物 His57 质子供体
C-N键断裂 键断裂
胰凝乳蛋白酶反应的详细机制( ) 胰凝乳蛋白酶反应的详细机制(2)
羰基产物释放
水亲核攻击 四面体中间物 的瓦解
羧基产物释放
酶促反应动力学 Vmax
Vmax/2
Km
Cs
酶促反应速率与底物浓度的关系
V Vmax
[S] 当底物浓度较低时 反应速度与底物浓度成正比; 反应速度与底物浓度成正比;反 应为一级反应。 应为一级反应。
V
Vmax
[S]
随着底物浓度的增高 反应速度不再成正比例加速; 反应速度不再成正比例加速;反应 为混合级反应。 为混合级反应。
O-R X P O -Ser-OH O-R O-R -Ser-O P O O-R
竞争性可逆抑制
磺胺类药物的抑菌机制: 与对氨基苯甲酸竞争二氢叶酸合成酶
非竞争性可逆抑制
反竞争性可逆抑制
酶活性
酶活力( 也称酶活性) 酶活力(enzyme activity, 也称酶活性) 酶催化一定化学反应的能力, 酶催化一定化学反应的能力,用在一定条件 下酶所催化反应的反应速度来表示。 下酶所催化反应的反应速度来表示。 酶活力的大小用酶活力单位来表示,简称酶 酶活力的大小用酶活力单位来表示,简称酶 单位( U),就是表示酶量多少的单位。 ),就是表示酶量多少的单位 单位(unit, U),就是表示酶量多少的单位。 其表示方法与所有的测定方法有关。 其表示方法与所有的测定方法有关。