遗传多样性及研究方法

SSR的操作程序 DNA提取 PCR扩增 电泳检测 染 色
读带标记
SSR的功能
• 长期以来一直认为SSR是转录哑区，没有明 确的生理功能。但随着研究深入，证明并 非如此。 SSR的主要功能 的主要功能: SSR的主要功能: 编码氨基酸； 染色体末端的SSR，有保护DNA完整性、避 免降解、融合及丢失的功能； 提高或降低临近基因转录速率； 基因重组的热点，是基因变异的来源； 部分SSR可产生转录启动复合物或活化染色 体
2.研究方法
自19 世纪达尔文在《物种起源》中揭 示出生物中普遍存在变异现象即多样性开 始,国内外学者就已经对遗传多样性进行了 广泛、深入的研究Hale Waihona Puke Baidu随着生物学研究水平 的提高和实验手段的不断改进,检测遗传多 样性的方法逐步发展起来。 对遗传多样性的研究方法可分为形态 学，细胞，生化和分子等水平上进行研究。
与上述三种标记相比较，分子标记具有许多明 显的优越性，表现为： 1. 直接以DNA的形式表现，在生物体的各个组织、 各个发育阶段均可检测到，不受季节、环境限制， 不存在表达与否等问题. 2. 数量极多，遍布整个基因组，可检测座位几乎无 限. 3. 多态性高，自然界存在许多等位变异，无须人为 创造. 4. 表现为中性，不影响目标性状的表达. 5.许多标记表现为共显性的特点，能区别纯合体和 杂合体.
SSR标记分析的基本原理 是利用某一SSR两翼区域特定的DNA序列，来设 计位点专一的一对引物，在PCR仪上扩增单个 SSR位点，通过电泳，进行分析，在此基础上进 行相应的遗传分析。 优点: 1. 标记数量丰富，具有较多的等位变异，广泛分布 于各条染色体上； 2. 是共显性标记，呈孟德尔遗传； 3. 技术重复性好，易于操作，结果可靠。 缺点：开发此类标记需要预先得知标记两端的序列 信息，而且引物合成费用较高。
2.4 分子标记 • 广义的分子标记是指可遗传的并可检测的DNA 序 列或蛋白质。狭义的分子标记是指以DNA多态性 为基础的遗传标记。 • 分子标记又可分为限制性片段长度多态性 (Restriction Fragment Length Polymorphism , RFLP), 随机扩增多态性DNA (Random Amplified Polymorphic DNA ,RAPD), 扩增片段长度多态 性(Amplified Fragmeng Length Polymophism , AFLP),简单重复序列(Simple Sequence Repeats , SSR)等等。
2.2 细胞学标记
• 细胞学标记（cytological markers）主要是指染色体核型(染 色体数目、大小、随体、着丝点位置等)及带型。主要用染 色体分带技术来标记。 • 优点：染色体分带技术是一种直观、快速而经济的检测外源 遗传物质的方法。 • 缺点：由于染色体分带技术的技术性较强,易受实验条件的 影响,且大多数染色体具有这种细胞学标记数目有限,导致细 胞学标记对某些不具有特异性带型的染色体或片段进行鉴定 时结果的可靠性略差。
2.3 生化标记
• 生化标记(biochemical markers) 主要包同工酶,是鉴定外源 DNA 和研究物种起源进化的有效工具。这种方法就是后来在 系统学和进化研究领域广泛应用的同工酶电泳技术。其基本 原理是根据不同蛋白质所带电荷性质不同,通过蛋白质电泳或 色谱技术以及专门的染色反应显示出不同形式的同工酶,从而 鉴别不同的基因型。 • 优点：实验程序简单,易操作,成本较低,比较稳定,比形态学标 记更能提供较大的差异信息。 • 缺点：生化标记数目在一定程度上仍然有限,且不具有共显性, 因而限制了它的应用。
2.研究方法
2.1 形态学标记
• 形态学标记（morphological markers）是指生物的外部特 征特性。传统的检测方法是根据个体间的形态差异来区分某些特
殊个体的。 • • 优点：直接的、简便易行。 缺点：由于形态学或表型性状数量较少,易受环境条件、人为因素 测量工具及基因显隐性等因素的影响,遗传表达不稳定,因此在有些 情况下并不能完全真实全面地反映遗传多样性。
简单重复序列(SSR)
SSR也叫微卫星序列重复，是由一类由几个核苷酸 （1－5个）为重复单位组成的长达几十个核苷酸 的重复序列，长度较短，广泛分布在染色体上。 由于重复单位的次数的不同或重复程度的不完全 相同，造成了SSR长度的高度变异性，由此而产 生SSR标记。虽然SSR在基因组上的位置不尽相 SSR SSR 同，但是其两端序列多是保守的单拷贝序列，因 此可以用微卫星区域特定顺序设计成对引物，通 过PCR技术，经聚丙烯酰胺凝胶电泳，即可显示 SSR位点在不同个体间的多态性。
遗传多样性及研究方法
遗传多样性及研究方法
1. 定义
2. 研究方法
1.遗传多样性（genetic diversity） 遗传多样性（ ） 遗传多样性
• 广义的是指地球上生物所携带的各种遗传信息总和。这些 遗传信息储存在生物个体的基因中，因此，遗传多样性就 是生物遗传基因的多样性。任何一个物种或生物个体都保 存着大量的遗传基因，因此，可被看作是一个基因库。 • 狭义的主要指生物种内基因的变化，包括种内显著不同的 种群之间以及同一种群内的遗传变异，此外，遗传多样性 可以表现为多个层次上，如分子，细胞，个体等。在自然 界中，对于绝大多数有性生殖物种而言，种群内的个体之 间往往没有完全一致的基因型，而种群就是由这些具有不 同遗传结构的多个个体组成的。
问题 1. SSR分子标记的引物是怎么设计的？ 2. 共显性标记，呈孟德尔遗传是什么意思？ 3. SSR位点是怎么筛选的？
由于本人能力有限，ppt中出现的 诸多不足，望导师您提出宝贵意见。