高性能计算(HPC).
高性能计算(HPC)概况及应用介绍
【一】高性能计算概述
计算机发展时间线:
➢ 第二代计算机,1959-1964,大量 采用晶体管和印刷电路板,体积 不断减小,功能不断增强,并出 现大量应用软件;
➢ 第三代计算机,1964-1972,大量 使用集成电路,以IBM360系列为代 表;
【一】高性能计算概述
计算机发展时间线:
➢ 第四代计算机,1972-至今,基于大规模集成电路及超大规模集成电路。1976年, Cray-1,第一台商用高性能计算机问世,集成了20万个晶体管,每秒可进行1.5 亿次浮点运算。
1、能耗分析 相同节点浸没液冷服务器方案功耗比风冷服务器方案低80%,其节能效果明显。 通过计算,其PUE值也明显低于风冷服务器方案。 浸没式液冷服务器PUE=1.046 风冷服务器PUE=1.361 2、占地面积分析 以上表格所指面积为投影面积,由此可见,同等节点服务器部署,浸没液冷服务 器方案比风冷服务器方案节约用地约85%。
2013年5月14日,安吉丽娜·朱莉在自 己写的文章《我的医疗选择》中称自己通 过基因检测确定带遗传缺陷基因BRCA1,医 生估测她患乳腺癌和卵巢癌的几率颇高, 分别为87%和50%,朱莉选择双侧乳腺切除 术保留乳房,降低患癌风险。2015年3月24 日,安吉丽娜·朱莉宣布,由于担心罹患卵 巢癌,她已经切除了卵巢和输卵管。
【三】高性能计算应用与展望
高性能计算之气象学研究:
气候环境研究是高性能计算领域的 传统应用,世界上第一台电子计算机 ENIAC就曾被用来进行天气预报,由于 气象相关预报往往关系到农业、工业、 军事、交通等众多核心关键业务,同时 预报天气所需要的计算能力非常高,因 此世界上最先进的高性能计算机通常都 被用来运行大规模的数值计算与气候模 拟应用。
高性能计算系统(HPC)软件实施方案
2:高性能计算平台——分系统组成
高性能计算平台——仿真计算分系统
双路计算服务器、双路GPU计算服务器、16路胖节点计算服务器组成。
硬件组成
软件配置
CAE高性能计算软件由于其计算方式的不同,对CPU、内存、IO等的要求也不同,具体分为三大类:IO密集型,通讯密集型和支持GPU加速类型。
考虑因素
应用软件兼容性Linux和Windows的互兼容性CPU兼容性厂家对操作系统的支持时间
操作系统
安装方式
Windows
图形服务器本地硬盘配置一块系统盘,全部空间都分配给c:盘。安装过程中选择带“图形界面的Windows Server”。
Linux
2路服务器本地配置一块系统盘。16路服务器本地多块配置一块系统盘。操作系统安装过程中选择“Desktop User”模式,安装完成后配置Yum,Yum源放置到/apps/rhel68下面,方便后续随时增减安装包。配置PAM动态认证插件,实现动态SSH配置,提升系统安全性。每台机器需要配置IB驱动和并行运行环境,保证并行计算可以通过IB口进行通信。并行运行环境需要配置MPICH、Open MPI和Intel MPI几种,并优先使用Intel MPI。
/opt/xcat
-
集群管理软件
/apps/<appname>
C:\(本地盘)
应用软件安装位置
计算数据区
/data
/data/<密级>/<user>
S:\(映射盘)
用户计算作业临时存储空间,不同密级的任务数据文件分开
存储规划
3:项目实施——集群时钟同步
高性能计算(HPC)资源管理和调度系统解决方案
网络安全:整个系统只需要在防火墙上针对特定服务器开放特定端口,就可以实现正常的访问和使用,保证了系统的安全性。数据安全性:通过设定ACL(访问控制列表)实现数据访问的严格控制,不同单位、项目、密级用户的数据区严格隔离,保证了数据访问的安全性。用户任务的安全性。排他性调度策略,虚拟机隔离用户账户的安全性。三员管理:系统管理员、安全管理员、审计管理员三个权限分离,互相监督制约,避免权限过大。审计系统。保证所有与系统安全性相关的事件,如:用户管理(添加、删除、修改等)、用户登录,任务运行,文件操作(上传,下载,拷贝,删除,重命名,修改属性)等都能被记录,并通过统计分析,审查出异常。密级管理。支持用户和作业的密级定义。
基于数据库的开放式调度接口
案例 用户自定义调度策略:需要根据用户余额来对其作业进行调度,如果用户余额不足,该用户的作业将不予调度。 解决方案: 针对上述需求可以自定义作业的准备阶段,在数据库中为该阶段定义一存储过程用来检测用户余额信息表,根据作业所对应的用户余额来返回结果,例如: Step 1. 根据数据库开放schema配置该自定义调度策略 表 POLICY_CONF:POLICY_NAME | POLICY_ENABLEmy_policy_01 | true Step 2. 为自定义调度策略my_policy_01自定义作业准备阶段 表JOB_PREPARE_PHASE: POLICY_NAME | READY_FUNC | REASON_IDX my_policy_01 | check_user_balance | 4 check_user_balance 为方案中所描述的存储过程,其接口需要满足作业准备阶段自定义的接口要求,其实现细节如下:
现有的LSF集群系统不用作任何改动,包括存储、操作系统、LSF、应用程序和二次开发的集成脚本等。大大降低了系统的整合的难度和工作量。也有利于保护现有的投资。同时考虑到了作业以及相关数据的转发。降低了跨集群作业管理的难度。数据传输支持文件压缩和断点续传,提高了作业远程投送的效率和稳定性。支持https加密传输,安全性更强。
高性能计算HPC解决方案
MPP 15%
Others 11%
Others1 %
CPU+ GPGPU 21 %
Others 16%
GE 36% Cluster 85%
Intel X86 89%
Linux 99%
纯CPU 79%
IB 47%
系统架构
处理器
操作系统
计算加速
互联网络
主流架构技术 - Cluster+X86+Linux+CPU+IB/GE 计算、网络加速- GPGPU加速和IB网络
目录
1 2
高性能计算挑战及趋势
高性能计算解决方案 高性能计算在全球
3
创新 - 释放高性能计算潜力
应用集成 业务调度 融合管理
融合业务管理平台
开放融合
All In Rack All In Room
液冷方案
低功耗服务器
快速交付
节能技术
加速
一体化交付
NVMe PCIe SSD 卡
低能耗产品和方案
GPU加速卡 KunLun
hpc典型组网场景hpc方案总结目录高性能计算在全球高性能计算在全球高性能计算挑战及趋势高性能计算挑战及趋势高性能计算解决斱案高性能计算解决斱案112233覆盖全球多行业的hpc建设经验内布拉斯加大学田纳西大学数字领域公司澳门气象局新加波globalfoundries新加坡科学技术研究所菲律宾气象局一期新加坡astar维多利亚大学昆士兰大学肯迪大学智利cassac天文台巴西麦肯锡大学古巴石油cupet委内瑞拉国家石油公司墨西哥水利局墨西哥农业部土耳其学术网络不信息中心ulakbim土耳其yilidiz科技大学ytu土耳其伊斯坦布尔科技大学itu土耳其harran大学土耳其yeditepe大学土耳其国家石油中国欧洲亚太北美拉美中亚沙特moi非洲中东津巴布韦高等教育科技发南非chpc国家地震防灾科技学院河北省环保局北京数据通信研究院北京交通大学北京航空航天大学西南大学首都医科大学中国电力科学院国家气象局上海天文台上海众信生物东斱物探清华大学华大基因bgp英国纽卡斯尔大学英国帝国理工大学德国汉堡大学德国吕贝克大学西班牙burgos大学法国照明娱乐公司德国戴姆勒奔驰德国爱伦堡水管局荷兰水利局意大利cnr波兰华沙大学波兰pcss波兰格但斯克大学波兰西里西亚大学波兰cyfronet波兰qumak大学俄罗斯圣彼得堡大学daimler集团选择hpc造品质最好的轿车刀片及高密服务器构建戴姆勒核心汽车研发平台劣力波兰pcss建设top80超算中心137pflopspue12全球top80超算中心劣力土耳其ytu大学打造hpc平台提升科研效率80降低初期投资成本80劣力美国数字领域构建高性能渲染平台计算密度提升25每机柜能耗降低15thankyou
高性能计算集群(HPC_CLUSTER)
高性能计算集群(HPC CLUSTER)1.1什么是高性能计算集群?简单地说,高性能计算(High-Performance Computing)是计算机科学的一个分支,它致力于开发超级计算机,研究并行算法和开发相关软件。
高性能集群主要用于处理复杂的计算问题,应用在需要大规模科学计算的环境中,如天气预报、石油勘探与油藏模拟、分子模拟、基因测序等。
高性能集群上运行的应用程序一般使用并行算法,把一个大的普通问题根据一定的规则分为许多小的子问题,在集群内的不同节点上进行计算,而这些小问题的处理结果,经过处理可合并为原问题的最终结果。
由于这些小问题的计算一般是可以并行完成的,从而可以缩短问题的处理时间。
高性能集群在计算过程中,各节点是协同工作的,它们分别处理大问题的一部分,并在处理中根据需要进行数据交换,各节点的处理结果都是最终结果的一部分。
高性能集群的处理能力与集群的规模成正比,是集群内各节点处理能力之和,但这种集群一般没有高可用性。
1.2高性能计算分类高性能计算的分类方法很多。
这里从并行任务间的关系角度来对高性能计算分类。
1.2.1高吞吐计算(High-throughput Computing)有一类高性能计算,可以把它分成若干可以并行的子任务,而且各个子任务彼此间没有什么关联。
因为这种类型应用的一个共同特征是在海量数据上搜索某些特定模式,所以把这类计算称为高吞吐计算。
所谓的Internet计算都属于这一类。
按照Flynn的分类,高吞吐计算属于SIMD(Single Instruction/Multiple Data,单指令流-多数据流)的范畴。
1.2.2分布计算(Distributed Computing)另一类计算刚好和高吞吐计算相反,它们虽然可以给分成若干并行的子任务,但是子任务间联系很紧密,需要大量的数据交换。
按照Flynn的分类,分布式的高性能计算属于MIMD (Multiple Instruction/Multiple Data,多指令流-多数据流)的范畴。
金融领域中高性能计算技术的研究与应用
金融领域中高性能计算技术的研究与应用一、引言随着金融市场的不断发展,信息技术的应用逐渐成为了金融行业优势的重要来源。
高性能计算技术随之应运而生,成为了现代金融行业中不可或缺的一部分。
本文将着重探讨金融领域中高性能计算技术的研究与应用。
二、什么是高性能计算技术高性能计算技术(High Performance Computing,以下简称HPC),是一种具有强大计算能力和高速数据处理能力的计算机技术,能够在极短时间内处理并分析海量数据。
HPC主要通过并行计算和集群计算来实现高效的数据处理。
并行计算是指将一个计算任务划分成多个子任务,同时在多台计算机系统上并行执行,从而提高计算效率。
集群计算则是将多台计算机系统联合起来,形成一个计算机网络,共同完成计算任务。
三、在金融领域中HPC的应用1. 高频交易高频交易是指通过计算机程序,利用快速传输线路、强大的计算处理能力和算法交易等技术手段,来获取微小的交易利润。
在高频交易中,毫秒级别的响应速度就可能决定着交易是否成功。
HPC技术可以通过提高计算速度和处理能力来帮助交易商获得更好的交易结果。
在金融领域中,有一些基于HPC技术的交易算法已经被广泛应用,并取得了较好的效果。
2. 风险管理金融市场的风险管理是金融机构必须解决的重要问题。
近年来,金融市场的不稳定性和风险性不断增加,使得金融机构必须寻找更加精细化的风险管理方法。
HPC技术可以实现对投资组合进行全面的监测和评估,分析不同市场和行业的数据趋势,寻找更加精细化的投资策略,并提高决策的准确性。
3. 人工智能和机器学习人工智能和机器学习技术的应用在金融领域中日益增加。
利用人工智能和机器学习技术,可以分析并预测金融市场的动态,提供更加精准的预测和决策支持。
在实际应用中,人工智能和机器学习技术需要巨大的计算和数据处理能力,HPC技术可以在这方面发挥着重要的作用。
四、HPC在金融领域中的挑战在金融领域中,HPC技术的应用面临着许多挑战:1. 硬件设施投入较大,需要高成本维护。
高性能计算介绍
进入21世纪,高性能计算进一步向并 行处理和分布式系统方向发展,利用 多核处理器和云计算等技术提高计算 性能和效率。
集群与网格计算
20世纪90年代,随着互联网技术的发 展,高性能计算开始向集群和网格计 算方向发展,实现了更广泛的资源共 享和协同工作。
02
高性能计算的硬件架构
超级计算机
超级计算机是高性能计算领域中 的重要组成部分,它通过将多个 处理器集成到一个系统中,以实
高性能计算机能够处理大量的数据,模拟复杂的物理过程,并快速地更新预测结 果。这使得气象学家能够更准确地预测极端天气事件,如暴雨、台风等,从而更 好地为灾害防范和应急响应提供支持。
基因测序
基因测序是另一个重要的高性能计算应用。通过高性能计算 机,科学家可以对人类的基因组进行测序和分析,研究基因 变异与疾病之间的关系。
高性能计算机能够模拟大规模的分子 和粒子系统,进行精细的物理和化学 分析。这有助于科学家发现新的材料、 优化产品设计、提高生产效率等。
人工智能与机器学习
人工智能与机器学习是当前最热门的 领域之一,而高性能计算在其中发挥 着关键作用。通过高性能计算机,研 究人员可以训练和部署复杂的机器学 习模型,实现人工智能的应用。
高性能计算机能够快速处理大量的基因数据,进行基因比对 和分析,并提供深入的遗传信息。这有助于科学家发现新的 药物靶点、预测疾病的遗传风险,并为个性化医疗提供支持 。
物理模拟与仿真
物理模拟与仿真涉及到各种领域,如 流体动力学、材料科学、化学反应等。 通过高性能计算机,科学家可以模拟 复杂的物理现象和化学反应过程,研 究物质的性质和行为。
VS
高性能计算机能够处理大规模的数据 集,进行高效的矩阵运算和深度学习 训练。这有助于提高人工智能的准确 性和效率,推动人工智能在语音识别、 图像处理、自然语言处理等领域的发 展和应用。
高性能计算(HPC)
可扩展性
总结词
高性能计算系统的可扩展性是指其随着规模扩大而性能提升的能力。
详细描述
可扩展性是高性能计算系统的一个重要评价指标。为了实现可扩展性,需要解决如何有效地将任务分配给多个处 理器核心、如何实现高效的节点间通信以及如何管理大规模系统的资源等问题。这需要采用先进的并行计算框架、 资源管理和调度算法等技术。
02
HPC系统架构
硬件架构
处理器架构
使用多核处理器和加速器(如GPU、FPGA)以提 高计算性能。
存储架构
采用高速缓存、分布式文件系统、内存数据库等 技术,提高数据访问速度。
网络架构
使用高速InfiniBand、以太网或定制网络技术,实 现节点间高速通信。
软件架构
01
并行计算框架
使用MPI、OpenMP、CUDA等 并行计算框架,实现任务和数据 的并行处理。
使用如Fortran、C/C、Python等语言进行高性能计 算应用程序开发。
性能优化技术
采用向量化、自动并行化、内存优化等技术,提高高 性能计算应用程序性能。
03
HPC应用案例
气候模拟
1
气候模拟是高性能计算的重要应用之一,通过模 拟大气、海洋、陆地等复杂系统的相互作用,预 测未来气候变化趋势。
05
HPC未来展望
异构计算
异构计算是指利用不同类型处理器(如CPU、GPU、FPGA等)协同完成 计算任务的技术。随着处理器技术的不断发展,异构计算在HPC中越来 越受到重视。
异构计算能够充分发挥不同类型处理器的优势,提高计算性能和能效。 例如,GPU适合于并行计算,而CPU则擅长控制和调度。通过合理地组
性能瓶颈
总结词
随着处理器性能的不断提升,高性能计算系统在内存带宽、 I/O性能以及处理器间通信等方面出现了性能瓶颈。
高性能计算与应用研究
高性能计算与应用研究随着科技和经济的不断发展,计算机技术已经成为现代生产和科学研究的重要工具。
高性能计算则是计算机领域的重要分支,可以优化计算机硬件和软件系统,实现更快、更稳定、更高效的计算和数据处理。
本文将从高性能计算的定义、技术体系、主要应用领域和未来发展趋势等多个方面进行深入探讨。
一、高性能计算的定义高性能计算,简称HPC (High Performance Computing),是指开展大规模计算、深度学习、数据科学等任务的一种计算范式。
它主要运用计算机系统的并行、分布式、异构和高可用等特点,将计算、存储、网络、软件和人力等资源无缝集成,从而实现高速度、高效率和高可靠性的计算和数据处理。
高性能计算系统通常包括多个计算节点、存储节点、网络交换机和调度器等硬件组件。
二、高性能计算技术体系高性能计算技术是一个开放的、复杂的和多层次的技术体系,涵盖了计算、存储、网络、软件和人工智能等方方面面。
具体来说,高性能计算技术体系包括以下几个方面:1.计算技术:计算技术包括CPU/GPU、FPGA/CPU/GPU、功率墙、超级计算机等不同类型的计算节点。
它们通过并行计算、向量计算、矩阵计算、量子计算等方式,提高计算效率和算法精度。
2.存储技术:存储技术包括硬盘、固态硬盘、闪存、内存等多种类型的数据存储介质。
它们通过优化数据访问、数据备份、数据恢复和数据安全等方面,提高数据的可靠性和可访问性。
3.网络技术:网络技术包括局域网、广域网、光纤、交换机、路由器等多种类型的网络设备。
它们通过优化数据传输、分布式文件系统、数据中心网络、云计算和容器化等技术,提高了计算和数据处理的效率和可靠性。
4.软件技术:软件技术包括操作系统、编程语言、编译器、并行库、调度器等多种类型的软件工具。
它们通过优化代码质量、并行性、负载均衡性、数据局部性等方面,提高了程序性能和可扩展性。
5.人工智能技术:人工智能技术包括深度学习、自然语言处理、图像识别、机器学习等多种类型的技术工具。
C++中的高性能计算和GPU加速应用
C++中的高性能计算和GPU加速应用在当今科技发展迅猛的时代,高性能计算和GPU加速应用在各行各业中发挥着越来越重要的作用。
特别是在科学研究、工程计算和人工智能等领域,高性能计算和GPU加速应用已经成为不可或缺的工具。
本文将就C++中的高性能计算和GPU加速应用进行深入探讨,探索其原理、应用和未来发展方向。
一、高性能计算和GPU加速概述高性能计算(High Performance Computing, HPC)指的是利用超级计算机、并行计算器或网络进行计算的方式。
它主要是为了解决大规模、高复杂度的科学、工程和商业问题。
而GPU加速是指利用图形处理器(GPU)进行并行计算,以加速运算速度。
在过去,高性能计算主要依赖于CPU进行计算,而CPU在逐步提升性能的同时,也遇到了瓶颈。
由于CPU的架构和设计,它在进行大规模并行计算时性能并不尽如人意。
而GPU具有数百个核心,能够并行处理大规模数据,尤其擅长于处理图像和视频数据。
因此,人们开始意识到利用GPU进行计算,可以大幅提升计算速度,从而拓展了高性能计算的应用范围。
特别是在人工智能和深度学习领域,GPU加速已成为必备技术。
二、C++在高性能计算和GPU加速中的应用C++作为一种高性能的编程语言,具有丰富的库和功能,被广泛应用于高性能计算和GPU加速领域。
在高性能计算方面,C++的优势主要体现在其性能和并行计算能力。
C++具有高效的内存管理机制和优秀的编译器优化,能够很好地发挥CPU的性能。
同时,C++支持多线程并行计算,能够充分利用多核CPU进行并行计算,提升计算速度。
在GPU加速方面,C++也表现出色。
C++具有丰富的库和框架,能够很好地支持GPU加速的开发。
特别是在CUDA(Compute Unified Device Architecture)平台上,C++能够与GPU进行高效的交互,实现并行计算。
通过CUDA编程,开发者可以借助GPU的强大计算能力,加速各种计算密集型任务,如矩阵运算、图像处理等。
hpc基本概念
hpc基本概念HPC基本概念什么是HPC•HPC全称High Performance Computing,即高性能计算。
•是一种通过集群或超级计算机等高性能计算设备,以及相应的软件和算法来处理大规模、复杂、需要高计算能力的科学、工程和商业计算问题的领域。
HPC的特点•高性能: HPC系统通常由多台计算节点组成,能够同时进行大规模并行计算,具有很高的计算能力。
•数据密集型: HPC应用往往需要处理海量、复杂的数据,包括大规模的科学数据、仿真数据等。
•并行计算: HPC系统利用并行计算技术,将任务分为多个子任务,同时在多个计算节点上执行,加快计算速度。
•可扩展性: HPC系统可以根据需求进行扩展,通过增加计算节点来提升计算能力,适应不断增长的计算需求。
HPC应用领域•科学研究: HPC在天文学、生物学、物理学等科学研究中得到广泛应用,用于模拟、模型推导、数据分析等。
•工程设计: HPC可以用于工程设计和仿真,如飞机设计、汽车碰撞测试等,加快产品开发速度并降低成本。
•天气预报:天气预报需要处理大量的气象数据,通过HPC可以加快气象模型的计算速度,提升预报准确率。
•金融风险分析: HPC可以对金融市场的海量数据进行快速分析和模拟,帮助预测风险和制定决策。
•药物研发: HPC在药物研发中能够进行大规模的分子模拟和虚拟筛选,加快新药研发进程。
HPC相关技术•并行计算: HPC系统利用并行计算技术,将任务分解为多个子任务,通过多个计算节点同时执行,提高计算速度。
•分布式存储: HPC系统通常采用分布式存储架构,将数据存储在多个节点上,提高数据访问和传输效率。
•高速互联: HPC系统需要高速的网络互联,以便于快速的数据传输和节点之间的通信。
•任务调度: HPC系统通过任务调度软件来管理和调度计算任务,合理分配计算资源,提高系统利用率。
•并行编程: HPC应用需要使用并行编程模型来实现任务的并行执行,如MPI、OpenMP等。
高性能计算平台(HPC)简介 - 通用
高性能计算平台(HPC)简介SHPC概念简介HPC技术架构HPC应用分析123HPC案例实践4HPC面临挑战5普通计算—传统列车高性能计算—高铁列车 高性能计算好比“高铁列车”,除了车头,每节车厢都有动力,所以算得快。
普通计算好比“传统列车”,只有车头有动力,所以算得慢。
高性能计算(High Performance Computing),通过软件和网络将多台独立的计算机组建成为一个统一系统,通过将一个大规模计算任务进行分割并分发至内部各个计算节点上来实现对中大规模计算任务的支持。
目标:提高大规模应用问题的求解速度,包括但不限于工程仿真、材料科学、生命医药等领域。
l 计算性能强大l 具有海量级存储空间l 高速数据通讯l 完整的软件基础平台软件部分:集群管理软件、作业调度软件、并行存储软件,并行环境,操作系统,行业应用软件硬件部分:服务器、网络、存储数据中心服务部分:专业售后服务,专业应用调优、开发服务,专业设计咨询服务生命科学气象预报数值计算石油勘探生物物理汽车设计药物设计航空航天国防军事云计算中心/省市计算中心异构集群芯片设计基因信息影视渲染船舶制造高性能计算机是一个国家综合实力的体现HPC行业应用HPC超级计算快速发展我国超级计算系统研制过去十年,我国在顶尖超算系统研制处于国际领先行列我国超级计算系统部署情况2023.062022.11过去十年,我国超算系统部署数量处于国际领先行列我国应用情况(以入围ACM Gordon Bell Prize为例)2014地震模拟2016大气动力框架相场模拟海浪模拟地震模拟气候模拟20172018图计算框架量子模拟人造太阳第一性原理过去十年,依托我国顶尖超算系统,大规模并行应用设计和研制方面取得显著进步2021获得国际超算最高奖ACM Gordon Bell奖CPU计算节点硬件平台软件平台应用场景GPU计算节点整机柜产品并行文件存储高性能计算管理平台基础设施管理平台高性能计算行业应用大内存服务器通用服务器气象海洋生命科学物理化学材料科学工业仿真高能物理石油勘探动漫渲染天文遥感基础设施数据中心高密服务器HGX机型PCIe机型整机柜服务器高速网络InfiniBand网络RoCE网络全闪存储混闪存储集群管理集群调度作业提交精细计费应用特征分析平台系统环境微模块数据中心(MDC)液冷MDC 风液式解决方案操作系统编译器并行环境数学库HPC全栈方案架构HPC集群软硬件层次架构SAAS 并行环境PAAS 节点X86机架异构节点X86刀片Gauss Fluent Vasp Wien2k 基础设施供电系统(UPS&PDU)机房机柜系统(水冷/风冷)空调系统(精密空调)……Material studio Matlab 异构开发并行开发集群管理平台网络IB/OPA 千/万兆以太网络KVM IPMIIAAS 存储存储服务器IB/FC 存储阵列集群软件操作系统Linux(RedHat,CentOS…)Windows Server 编译环境环境工具并行文件系统调试工具应用软件应用开发……并行化应用模式应用结点间通讯系统与控制内部互连计算单元处理器,物理层设计,硬件管理Linux, Windows 操作系统与配置管理 操作系统中间件通讯函数库 (MPI, DVSM, PVM, etc) 集群控制与管理编译器,函数库,性能分析与调试工具开发工具作业管理批作业序列与调度,集群监控,系统扩展工具用户, ISV’s 软件工具 HPC 增值供应商 平台与网络供应商供电系统,制冷系统,机房环境基础架构机房方HPC集群硬件拓扑图通用计算——双路计算机架(高密度)、刀片通用计算——胖节点异构节点虚拟工作站区满足所有应用的可视化需求管理登陆机架高速计算网络并行存储区:满足所有应用的共享存储需求KVM、机柜、供电等附属设施CPU Memory I/O Channel ...CPU Memory I/O Channel CPU Memory I/O Channel CPUMemoryI/O Channel CPU Memory I/O Channel 网 络集群(Cluster):将多台计算机组织起来,通过网络连接在一起,进行协同工作,来模拟一台功能更强大的计算机,叫做集群。
通用计算 异构计算 高性能计算
通用计算(GPC):这种类型的计算是指使用计算机或计算系统来执行范围广泛的任务,例如文字处理、互联网浏览和多媒体播放。
这种类型的计算需要一个通用的计算机体系结构,该体系结构足够灵活以处理不同类型的任务和应用程序。
异构计算:异构计算是指使用多种类型的处理单元(例如CPU 和GPU)来执行范围广泛的任务的系统。
这种类型的计算可以更好地利用可用资源,因为可以将不同的任务分配给最合适的处理单元。
与同类计算系统相比,这种方法可以提高性能和效率。
高性能计算(HPC):HPC 是指使用专门的计算系统和算法来解决需要大量计算能力的复杂问题。
这种类型的计算通常用于科学和工程应用,例如天气预报、药物发现和模拟。
HPC 系统通常由许多互连的计算机组成,通常具有专门的硬件和软件,旨在处理高性能计算所需的大量数据和复杂计算。
高性能计算的优势和挑战分析
高性能计算的优势和挑战分析高性能计算(High Performance Computing,HPC)是一种利用高度集成的硬件和软件技术来实现高速数据处理和计算能力的计算技术。
HPC已经成为科学技术、工业生产和社会经济发展的重要支撑。
高性能计算在许多领域都具有重要的应用,但是,它也面临着一些重大的挑战。
一、高性能计算的优势1.1 高处理能力高性能计算的最大优势在于大规模、高并发处理能力,能够完成大规模数据处理、模拟和预测等工作。
在物理、化学、材料学、气象学等自然科学领域中,HPC可以支持数值模拟、计算流体力学、分子动力学、电磁仿真等大规模计算任务。
1.2 缩短计算周期HPC能够转换为更大规模数据集,加速计算流程、优化解决方案,缩短计算周期,降低成本,提高效率。
在金融技术、生命科学、空间科学等领域,HPC可以用于精准定位、金融计算和高精度数据分析等任务。
1.3 可靠性和稳定性高性能计算的系统可靠性和稳定性非常高。
因为高性能计算需要做出很多的实验、模拟以及计算,单点故障就可能导致整个系统瘫痪。
因此,高性能计算集群通常都采取冗余设计,确保平台的可靠性和稳定性。
1.4 可扩展性HPC可以根据业务需求进行扩展,提高整个系统的计算能力。
即使是当数据量不断增长时,高性能计算集群也能扩展,维护和弹性伸缩,满足长期发展的需求。
二、高性能计算的挑战2.1 能耗问题高性能计算系统的能耗问题是这些亟待解决的问题之一。
高性能计算需要大量的能源来保证系统不断运转。
高能耗会导致更大的电费,更广泛的排放和更多的热能问题。
研究人员已经在寻找更为高效的数据中心设计,以减少系统的能耗。
2.2 存储瓶颈高速外围设备和更高容量处理器的进步已使得使用HPC来处理数据集变得更容易。
然而,数据在HPC系统中的移动以及存储访问会仍受到内存和存储设备带宽之间的瓶颈影响。
解决这个问题的方案,例如控制存储访问模式或者复制数据以降低I/O 延迟,但这些方法仍需要一个更有效的频率控制和内存访问模式来提高HPC的存储性能。
hpc通信特征
hpc通信特征
HPC(高性能计算)通信特征包括以下几个方面:
1. 低延迟:HPC通信需要快速、实时地传输大量数据,因此通信延迟必须尽可能地低。
减少通信延迟可以提高计算效率和性能。
2. 高带宽:HPC通信需要传输大量的数据,因此通信带宽必须足够高。
高带宽可以提高数据传输速度,加快计算任务的完成。
3. 可扩展性:HPC系统通常是大规模并行的,包含大量的计算节点和通信节点。
通信特征需要具备良好的可扩展性,能够支持大规模并行计算的需求。
4. 高效率:HPC通信需要高效地利用计算和通信资源,以提高整体的计算效率。
高效的通信特征可以减少通信开销和资源占用,提高计算性能。
5. 可靠性:HPC通信需要保证数据传输的可靠性,防止数据丢失或损坏。
可靠的通信特征可以提供数据完整性和可靠性保证,确保计算结果的准确性。
HPC通信特征需要具备低延迟、高带宽、可扩展性、高效率和可靠性等特点,以满足大规模并行计算的需求。
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如何做好HPC的销售工作之应用 篇
•3、计算数学 主要应用软件:Gaussian 了解用户研究方向:科研基础软件 了解关键词:需要CPU高主频,并行效果差 CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU 2、不需要大内存 硬盘选型:I/O量大,SAS 网络选型:不建议跨节点,需跨节点选择IB
如何做好HPC的销售工作之应用 篇ห้องสมุดไป่ตู้
•1、计算物理
•主要应用软件:VASP 了解用户研究方向:物理计算方向有金属、半导体、绝缘体 了解关键词:Kpoint 4X4X4 8X8X8 CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU 2、CPU及Kpoint 硬盘选型:I/O量小,SATA 网络选型:跟进Kpoint 软件线性比:高
高性能计算(HPC)概念
•指使用多处理器(作为单个机器的一部分)或者某一集群中 组织的几台计算机(作为单个计 算资源操作)的计算系统和 环境。 单指令(SIMD):跨多个处理器的同 时执行相同的计算指令和操作,理解 为计算单一任务 计算分类 多指令(MIMD):跨多个处理器的同 时执行相同的计算指令和操作,理解 为计算多任务
消息传递接口(MPI):节点间传递计算消息
函数库:提供计算过程中所必须的解释工具
高性能计算(HPC)机组成
• • • • 1、计算子系统(可包含CPU、GPU、多路子节点) 2、网络子系统(管理网络;计算网络(Ethernet、IB)) 3、存储子系统(本地存储、并行存储) 4、管理子系统(对整个高性能计算平台运行性能进行实时
• 2、了解我们能为用户做什么
a) 机群硬件系统搭建 b) 机群软件系统安装
如何做好HPC的销售工作
•Linpack 理论峰值计算 什么是Linpack?
是国际上主流测试HPC浮点运算能力的工具,影响其数值要素为:硬件、 软件及执行参数。 硬件:CPU、内存、网络 软件主要指:MPI 、数学库(函数库) 执行参数指:矩阵规模(计算一元N次方程矩阵,采用高斯消元法(就是 我们说的代入法),通常有100、1000、N即自定义三种。)
如何做好HPC的销售工作之应用 篇
•2、计算材料 •主要应用软件:Materials Studio
了解用户研究方向:分子材料模拟、高分子材料
了解关键词:分子动力学;显示输出 CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU 2、材料不需要大内存,分子动力 学需要 硬盘选型:材料I/O量小,选择SATA,分子动
理论浮点峰值= CPU主频×CPU每个时钟周期执行浮点运算的次数×系统中CPU核心数目
所以理论值和实际值是有差距的,目前要求Linpack的人在逐渐减少
如何做好HPC的销售工作
• a) b) c) • a) b) Raid 技术 Raid 0 Raid 1 Raid 5 计算网络 千兆网络 Infiniband 高速计算网络
管理节点
存储节点
存储阵列
远程
管理千兆 交换机
计算节点
高速Infiniband 交换机 控制台
以太网 Infiniband 光纤网 KVM网 机房
本地KVM
• 1、熟悉HPC的核心
a) b) c) d) e) f)
如何做好HPC的销售工作
CPU (basic、standard、advanced) 熟悉Linpack的算法 两代主流CPU直接的比较 熟悉内存和硬盘及Raid技术 了解用户计算软件应用情况 了解用户计算网络环境需求
如何做好HPC的销售工作之应用 篇
•4、流体力学/分子动力学 主要应用软件:CFD(Ansys、Fluent)工程计算 软件 了解用户研究方向:流体材料、空气动力、 化学反应 了解关键词:并行效果高,动态负载均衡 CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU 2、需要大内存
如何做好HPC的销售工作之应用 篇
•5、量子化学 主要应用软件:ADF
了解用户研究方向:物理光谱、分子计算、 材料计算 了解关键词:并行效果高,动态负载均衡 CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU 2、不需要大内存 硬盘选型:I/O量小,SATA
如何做好HPC的销售工作之应用 篇
•6、材料计算 主要应用软件:wien2k 了解用户研究方向:材料计算、电导率 了解关键词:并行效果低 CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU 2、需要大内存 硬盘选型:I/O量大,SAS 网络选型:千兆网
如何做好HPC的销售工作之应用 篇
•6、理论化学计算
主要应用软件: NAMD+CHARMM;GROMACS;AMBER
了解用户研究方向:理论化学研究;材料计 算;分子 动力学 了解关键词:并行效果高 CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU
如何做好HPC的销售工作之GPU 应用
•应用方向:1、生命科学 2、自制程序
厂商 GPGPU硬件产品 Tesla 系列GPGPU CUDA 应用软件的 较为广范的 支持 编程环境 应用情况
如何做好HPC的销售工作之GPU 应用
支持GPGPU 的生物计算软件-GROMACS
支持GPGPU 的生物计算软件-NAMD 支持GPGPU 的生物计算软件-HMMER
支持GPGPU 的生物计算软件-MUMmerGPU 支持GPGPU 的生物计算软件-AxRecon
监控和管理功能,同时还实现用户交互接口,用户可以方便地登录到 高性能计算平台,申请功能服务器及硬件资源,启动、停止自己功能 服务器功能。)
• 5、软件子系统(系统软件包括操作系统、编程语言、并行环境、
数学库、性能调优工具、管理软件、调度软件)
高性能计算设备拓扑
外网 Internet 路由器 内网 防火墙 千兆交换机 局域网