3 立体结构的表示方法
空间构型和立体构型表
空间构型和立体构型表
【原创实用版】
目录
1.空间构型和立体构型表的定义和作用
2.空间构型和立体构型表的分类
3.空间构型和立体构型表的构建方法
4.空间构型和立体构型表的应用领域
5.空间构型和立体构型表的发展前景
正文
空间构型和立体构型表是化学中用来描述分子或离子空间结构的工具。空间构型是指分子或离子中各个原子在空间中的相对位置,而立体构型则是指分子或离子在空间中的具体形状。空间构型和立体构型表能够直观地反映分子或离子的结构特征,对于研究物质的性质和行为具有重要的意义。
空间构型和立体构型表可以按照构型类型进行分类。常见的构型类型包括线性型、角型、四面体型、八面体型等。不同的构型类型对应着不同的空间结构,从而影响分子或离子的性质。
构建空间构型和立体构型表的方法主要有两种:一种是通过实验技术,如 X 射线衍射、核磁共振等手段直接观测分子或离子的结构;另一种是
通过理论计算,如量子化学方法,模拟分子或离子的结构。
空间构型和立体构型表广泛应用于化学、生物学、材料科学等领域。在化学领域,空间构型和立体构型表可以用于研究分子反应性、分子轨道理论等;在生物学领域,空间构型和立体构型表可以用于研究蛋白质结构和功能;在材料科学领域,空间构型和立体构型表可以用于研究材料的光学、磁学等性质。
随着科学技术的发展,空间构型和立体构型表的研究也在不断深入。
有机化学教学中关于构型转换的探讨
有机化学教学中关于构型转换的探讨
发表时间:2020-01-07T13:49:59.807Z 来源:《科技新时代》2019年11期作者:姚文华* 晏爱芬刘莉
[导读] 立体化学是有机化学教学中的一个重要知识点。对于初学者来说,如何正确地书写立体化学中表示化合物结构的四种表示法以及它们之间的相互转化难度很大,不容易理解。
姚文华* 晏爱芬刘莉
(保山学院资源环境学院云南保山 678000)
摘要:立体化学是有机化学教学中的一个重要知识点。对于初学者来说,如何正确地书写立体化学中表示化合物结构的四种表示法以及它们之间的相互转化难度很大,不容易理解。本文结合多年的教学经验,以特定化合物结构的书写,给大家介绍了相关的知识点,浅显易懂。
关键词:立体化学;R、S构型;构型转换;对映异构
在有机化学中,因分子具有不对称性(也称为手性),而使异构体呈现实物与镜像对映关系的现象称为对映异构[1]。由于有机化学的初学者对有机化合物的分子结构认识相对缺乏,难以形成化学结构中各原子和基团在空间的位置关系,因此感觉学起来难度非常大,不容易理解。在进行几种立体结构式的转化时,无从下手;在学习烯烃与溴单质亲电加成反应的立体化学中难以理解。为了解决这个问题,结合自己几年的教学经验,对这部分知识点做一个归纳总结,以期对大家学习有机化学的立体化学相关知识有一定的帮助。
一、分子立体结构的表示法
有机化合物具有三维立体形状,常用以下四种方式表示:
1、楔形透视式
在楔形透视式中实线表示在纸平面上的键,楔形虚线表示伸向纸平面后方的键,楔形实线表示伸向纸平面前方的键。以化合物2,3-二氯戊烷为例,写出了其中的一种楔形透视式,如图1所示。
立体结构式的写法
有机化合物分子的四种立体结构式
及其关联写法
王有贤,
(XX大学化学化工学院,750021)
摘要:介绍了有机化学中常用的四种立体结构式的写法、主要应用X围以及相互关联写法的技巧。
对于正确表示有机化合物分子的立体构型,建立空间想象力,进而学好有机立体化学提供有益的帮助。
关键词:立体化学;Fischer投影式;Newman投影式;锯架式;楔形式
中图分类号:G434 文献标识码:A
立体化学在有机化学的教学和学习中始终是个重点又是个难点。分子的性能和反应行为不但取决于它的组成,而且取决于它在三维空间的特定的构型。如何在纸平面上表示分子在三维空间的立体构型,当看到纸平面上的结构式时想象出它在三维空间的几何形状,是初学者学习立体化学时首先遇到的问题。在纸平面上正确表示分子在三维空间的立体构型,建立空间想象力是学习有机立体化学所必须掌握的基本技能。
在纸平面上表示分子立体构型的式子有四种,它们分别是Fischer投影式、Newman 投影式、锯架式和楔形式。这四种式子都可以用来表示分子在三维空间的立体构型,但各有其特点和习惯应用X围。现分别介绍如下:
1四种立体构型式的写法
1.1Fischer投影式的写法
Fischer投影式是1891年由碳水化合物之父Emil Fischer在研究单糖的构型时首创的。
图1 Fischer投影式的写法
该式通过立体模型在纸平面上的投影得到(如图1所示)。由于这种式子不具任何的立体感,所以规定:连在竖键上的原子或基团在纸平面之后,连在横键上的原子或基团在纸平面之前。横键和竖键的交叉点表示碳原子。竖向后、横向前是Fischer投影式的最基本的规定,是掌握这种式子的关键所在。Fischer投影式的辅助规定:投影式可在纸平面上旋转n1800,不能旋转n900,不能离开纸平面进行翻转等,都是源于竖向后、横向前的这一基本规定。
碳环化合物有机化合物结构的分类
有机化合物结构的分类
化合物类别
烯烃 炔烃 卤代烃 硝基化合物 胺 醇和酚 醚 醛
酮
腈 羧酸
磺酸
官能团构造
CC CC X(F,Cl,Br,I) NO2 NH2 OH O CHO O C 13 CN COOH
SO3H
官Hale Waihona Puke Baidu团名称
双键 三键 卤原子 硝基 氨基 羟基 醚键 醛基(甲酰基)
酮羰基
氰基 羧基
碳碳单键的键线均省略的方法称为结构简式。
7
7
有机化合物结构的表示方法
4. 键线式: 只表示出碳骨架及除碳、氢原子以外的原子或原子团与 碳原子的连接关系,在链或环的端点、折角处表示一个 碳原子。
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有机化合物结构的表示方法
(二)立体结构表示方法 许多分子具有三维空间结构,需要表示出分子的立体 结构。常用的表示方法有楔形透视式、锯架投影式、 纽曼投影式、费歇尔投影式。(详见第七章)
4
结构式、结构简式和键线式
4
有机化合物结构的表示方法
1. 电子式(路易斯结构式): 两个原子之间用两个圆点表示形成共价健的两个电子。
5
5
有机化合物结构的表示方法
2. 结构式: 用短线表示分子中原子或原子团的连接方式和排列次序。
6
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有机化合物结构的表示方法
化学分子结构与分子构型
化学分子结构与分子构型
在化学领域中,分子结构与分子构型是两个非常重要的概念。分子结构指的是
分子中原子之间的连接方式和排列顺序,而分子构型则是指分子在空间中的三维排列方式。分子结构和分子构型的理解对于研究化学反应机理、分子间相互作用以及设计新型材料等都具有重要意义。
一、分子结构的表示方法
化学家通常使用结构式来表示分子的结构。结构式可以分为平面结构式和立体
结构式两种。平面结构式是在平面上画出分子的连接方式和原子之间的键,常见的有平面投影式、简化式和键线式。立体结构式则是在空间中表示出分子的三维结构,常见的有骨架式、空间填充式和立体投影式。
二、分子构型的确定
分子构型的确定需要考虑分子中原子之间的空间排列方式。在分子构型的研究中,常用的方法有VSEPR理论、分子轨道理论和X射线晶体学。
1. VSEPR理论
VSEPR理论是一种简单而实用的方法,用于预测分子的几何形状。根据VSEPR理论,分子中的电子对会互相排斥,使得分子取得最稳定的构型。根据电
子对的排斥情况,可以确定分子的形状,如线性、平面三角形、四面体等。
2. 分子轨道理论
分子轨道理论是一种用量子力学方法研究分子结构和性质的理论。根据分子轨
道理论,分子中的原子轨道会相互重叠形成分子轨道。分子轨道的形状和能级决定了分子的构型和性质。
3. X射线晶体学
X射线晶体学是一种通过分析晶体中的X射线衍射图样来确定分子构型的方法。通过测量衍射图样的强度和角度,可以推导出晶体中原子之间的距离和角度,从而确定分子的构型。
三、分子结构与分子性质的关系
分子结构对分子性质有着重要的影响。分子的物理性质、化学性质和生物活性
大学有机化学总结
有机化学复习总结
一、试剂的分类与试剂的酸碱性
1、自由游离基引发剂在自由基反应中能够产生自由基的试剂叫自由基引发剂free radical initiator,产生自由基的过程叫链引发;如:
Cl2、Br2是自由基引发剂,此外,过氧化氢、过氧化苯甲酰、偶氮二异丁氰、过硫酸铵等也是常用的自由基引发剂;少量的自由基引发剂就可引发反应,使反应进行下去;
2、亲电试剂简单地说,对电子具有亲合力的试剂就叫亲电试剂electrophilic reagent;亲电试剂一般都是带正电荷的试剂或具有空的p轨道或d轨道,能够接受电子对的中性分子,如:H+、Cl+、Br+、RCH2+、CH3CO+、NO2+、+SO3H、SO
3、BF3、AlCl3等,都是亲电试剂;
在反应过程中,能够接受电子对试剂,就是路易斯酸Lewis acid,因此,路易斯酸就是亲电试剂或亲电试剂的催化剂;
3、亲核试剂对电子没有亲合力,但对带正电荷或部分正电荷的碳原子具有亲合力的试剂叫亲核试剂nucleophilic reagent;亲核试剂一般是带负电荷的试剂或是带有未共用电子对的中性分子,如:OH-、HS-、CN-、NH2-、RCH2-、RO-、RS-、PhO-、RCOO-、X-、H2O、ROH、ROR、NH3、RNH2等,都是亲核试剂;
在反应过程中,能够给出电子对试剂,就是路易斯碱Lewis base,因此,路易斯碱也是亲核试剂;
4、试剂的分类标准
在离子型反应中,亲电试剂和亲核试剂是一对对立的矛盾;如:CH3ONa + CH3Br→CH3OCH3 + NaBr的反应中,Na+和+CH3是亲电试剂,而CH3O-和Br-是亲核试剂;这个反应究竟是亲反应还是亲核反应呢一般规定,是以在反应是最先与碳原子形成共价键的试剂为判断标准;在上述反应中,是CH3O-最先与碳原子形成共价键,CH3O-是亲核试剂,因此该反应属于亲核反应,更具体地说是亲核取代反应;
大学有机化学烷烃练习题
大学有机化学烷烃练习题
学习指导:1. 烷烃的命名;脂环烃的命名;
2. 基的概念、常见取代基结构和命名;
3. 构象稳定构象的判断;
4. 脂环化合物的顺反异构;
5. 环的稳定性;
6. 烷烃沸点变化规律。
7、碳原子轨道的sp3杂化
习题
一、命名下列各物种或写出结构式。
1、写出2,6-二甲基-3,6-二乙基辛烷的构造式。 ,
2、写出
3、写出
的系统名称。的系统名称。
二、完成下列各反应式。
1、
三、理化性质比较题。
1、将下列自由基按稳定性大小排列成序:
2、将2,3-二甲基己烷、2,3,3-三甲基戊烷、己烷、2,2-二甲基丁烷按沸点高低排列成序。
3、将下列两组化合物分别按稳定性的大小排列成序: 1. 顺-1,2-二甲基环己烷反-1,2-二甲基环己烷
2. 顺-1,3-二甲基环己烷反-1,3-二甲基环己烷
四、用简便的化学方法鉴别下列各组化合物。
乙基环丙烷甲基环丁烷环戊烷
答案:
一、命名下列各物种或写出结构式。
1、2、4,4-二甲基-5-乙基辛烷、2-甲基-4-异丙基-5-叔丁基壬烷
二、完成下列各反应式。 1、
三、理化性质比较题。
1、>>
2、>>>、1.>;
四、用简便的化学方法鉴别下列各组化合物。
室温下使Br2-CCl4褪色的是。温热时才能使Br2-CCl4褪色的是.>
有机化学总结
一.有机化合物的命名
1. 能够用系统命名法命名各种类型化合物:
包括烷烃,烯烃,炔烃,烯炔,脂环烃,芳烃,醇,酚,醚,醛,酮,羧酸,羧酸衍生物,多官能团化合物。
立体结构的表示方法:
CH3
H )锯架式:
H
1)
伞形式:3OH
3)
纽曼投影式:
有机化学 第四章 立体异构
旋体有疗效,它的对映体则无抗菌作用;在培养
青霉菌时,右旋酒石酸被消耗掉,剩余为左旋体; 左旋尼古丁的毒性比右旋尼古丁大得多。
Ibuprofen
布洛芬
HOOC
H C
H
CH 3
H3 C
S
R
C
COOH
H3C H3C
CH CH 2
CH 2CH
CH 3 CH 3
直接止痛
在体内转化成左式 发挥止痛作用
由上可知,Ibuproven 尽管原子组成相同,但互为对 映异构体,构型不同,药效不同,说明生命体对异构体具 有偏爱,这是一种不对称行为。又如:
S-构型
R-构型
3、若d位于Fischer式的竖键时(不论在上还是在 下),则当a、b、c顺时针方向排列时,则手性 碳具有R-构型,相反则为S-构型。
b a d c b c d a
R-构型
S-构型
例
H
题
COOH OH CH2OH
最小基团H位于横线 基团次序: OH > COOH > CH2OH
R-构型
CHO H OH CH2OH COOH [O] HgO H OH CH2OH
D-(+)-甘油醛
D-(-)-甘油酸
If the —OH or —NH2 which attaches to the
chiral carbon atom lies on the right,the
chemdraw立体结构式
chemdraw立体结构式
在ChemDraw中绘制立体结构式的步骤如下:
用楔形表示法来反映原子或基团的相对空间位置。
选择键后,点击右键,选择Object Settings命令。
点击Object Settings弹出对话框,修改键的长短和粗细、以及切割楔键的间隙。
楔键的取向通过再次点击楔键按钮进行改变。
也可利用3D旋转来实现以实际观察角度来构建的直观立体结构。
化学结构式有三种画法,分别是:键线式、棒式和球棍式。平时用的画法叫键线式。
绘制化学结构式的方法如下:
固定键的长度和角度。在“对象”下拉菜单中,点击“固定键长”或者用键盘上“Ctrl”+“L”,则画出的键长固定。同样的方法“固定键角”,或直接“Ctrl”+“E”用于固定键的角度,默认值15°为一个单位。
单键的绘制。在工具栏里点击工具,在操作页面上单击
鼠标左键就画出单键,或者在操作页面上单击鼠标左键并按住旋转,直到要的角度放开左键即画好。
多重键的绘制。双键的绘制:点击绘制单键上再按动一次即可得到双键。通过在双键中间(出现光标块)的点击可以改变双键的位置,在上,在下或中间。也可以单击工具栏中Multiple Bonds拖住鼠标左键会出现键的选择,选择双键,在操作页面单击左键即可出现双键。
第三章 立体结构化学
1、对映异构、不对称碳原子、手性分子 2、判断手性分子 3、旋光度 4、外消旋体、内消旋体 5、构型的表示:Fischer投影式,其特点 6、构型的标记:D/L法和R/S法 7、含多个手性碳原子化合物的立体异构 8、外消旋体的拆分 9、环状化合物的立体异构
1、对映异构、不对称碳原子、手性分子
H
OH
CH3
旋转90o
H
H3C
COOH
OH
构型改变
COOH
旋转180o
H
OH
CH3
CH3
HO
H
COOH
构型不变
化合物A是对映异构体的是( ? )
CH3 HO H HO H
H OH CH3
A
CH3 H OH HO H HO H
CH3
B
CH3 H OH HO H H OH
CH3
C
CH3 HO H HO H HO CH3
普通光
偏振光 通过旋光性物质后
旋光性——能使偏振光的振动方向旋转一定角度的性质. 右旋—— (+) ; 左旋 ——(-).
旋光度——旋光性物质使偏振光的振动平面所旋转的角度. 用α表示.溶液的旋光度与浓度、盛液管长度成正比.
据此可把化合物分成两类:一类有旋光性另一类没有旋光性.
α
左旋
α 右旋
有机化学复习总结wei
有机化学复习总结
一、试剂的分类与试剂的酸碱性
1、 自由(游离)基引发剂 在自由基反应中能够产生自由基的试剂叫自由基引发剂(free radical initiator),产生自由基的过程叫链引发。如: Cl 2Cl
Br hv 或高温均裂
hv 或高温
均裂
Cl 2、Br 2是自由基引发剂,此外,过氧化氢、过氧化苯甲酰、偶氮二异丁氰、过硫酸铵等也是常用的自由基引发剂。少量的自由基引发剂就可引发反应,使反应进行下去。 2、亲电试剂 简单地说,对电子具有亲合力的试剂就叫亲电试剂(electrophilic reagent )。亲电试剂一般都是带正电荷的试剂或具有空的p 轨道或d 轨道,能够接受电子对的中性分子, 如:H +、Cl +、Br +、RCH 2+、CH 3CO +、NO 2+、+SO 3H 、SO 3、BF 3、AlCl 3等,都是亲电试剂。
在反应过程中,能够接受电子对试剂,就是路易斯酸(Lewis acid ),因此,路易斯酸就是亲电试剂或亲电试剂的催化剂。
3、亲核试剂 对电子没有亲合力,但对带正电荷或部分正电荷的碳原子具有亲合力的试剂叫亲核试剂(nucleophilic reagent )。亲核试剂一般是带负电荷的试剂或是带有未共用电子对的中性分子,如:OH -、HS -、CN -、NH 2-、RCH 2-、RO -、RS -、PhO -、RCOO -、X -、H 2O 、ROH 、ROR 、NH 3、RNH 2等,都是亲核试剂。
在反应过程中,能够给出电子对试剂,就是路易斯碱(Lewis base ),因此,路易斯碱也是亲核试剂。 4、试剂的分类标准
第 3 章 立体结构化学
丁烷的构象
H3C CH3
CH3H H CH3
CH3H
H3C H
E 能量
CH3 CH3
15.9
CH3 CH3
CH3
H3C CH3
18.8 kj.mol-1 3.7
CH3
-
-
0
60 120 180 240 300
360
旋转角度
四种典型构象能量的高低顺序:
全重叠式 > 部分重叠式 > 邻位交叉式 > 对位交叉式
习题:写出下列化合物的纽曼投影式: (1)1,2-二溴乙烷的对位交叉式构象
(2)1,2-二氯乙烷的全重叠式构象
三.环己烷构象
2: 环烷烃的结构,张力学说 (1) 拜耳的张力学说 (Baeyer Strain Theory) (平面解释) 1885 年 ,Baeyer 根据碳四面体概念,提出环丙烷与环丁烷的 键角小于 109.5。,存在张力,角度= (n-2)*180/n 环戊烷接近 109.5,应稳定. 环己烷角度为 120,似乎不稳定,(与实际不符)
R3 R1 R2
R1 N
N
R3
R1
R2
R3 R2
R1 SP3
R2
R3 N
源自文库
N
R3
R1
R2
§ 3-2 构型异构 构型异构包含:顺反异构、手性异构(见本章)
立体构型
分子构型——α、β构型;R、S构型;L、D构型
2010-02-28 14:25
α、β构型;R、S构型;L、D构型
以上三种不同的构型方式有什么区别?各自在描述哪些不同的结构时常用?如何判定相对构型?
D或L:是分子的绝对构型,是按照Fischer惯例来命名的,按照与参照化合物D-或L-甘油醛的绝对构型的实验化学关联而指认,常用于氨基酸或糖。D表示右旋,等同于“+”,L表示左旋,等同于“-”。
R或S是分子的绝对构型,是按照CIP惯例来命名的,此种命名方式避免了Fischer 惯例的局限性,手性碳上相连的四个碳原子,把排列次序最小的放在最远的位置,再看其它三个基的排列,如果由大到小是按顺时针方向,则是R型(拉丁文Rectus 的缩写,"右"的意思),如果是反时针方向,则是S型(拉丁文Sinister的缩写,"左"的意思)。
α、β构型:三萜,甾体类。当三萜或甾体的结构以通常的方式画在纸上后,只要确定取代基的位置是伸出纸面,还是指向纸内,相连碳的绝对构型就已经确定。实际上确定的是与相连手性碳的绝对构型。习惯上用α、β构型来表示,因为比较方便,这些化合物的手性碳太多了,而骨架类型又比较容易少。
认为第一段有些问题。D-或L-的命名是以甘油醛为标准,将之写成Fischer投影式,如图,不对称碳原子所结合的氢原子的位置在投影式处于主碳链的左边的这种立体结构,称为D-构型,其对映的立体结构为L-型。这样,并不能得出D-与"+"等同的结论。要说等同,这里就要提到d和l 。d与(+)同义,为右旋光性的符号;l与(-)同义,左旋。因此,我们可以看到D-(-)-xxxx或D-(+)-xxxx,却不会有d (-)这样的表示。
有机化学分类表示命名
(正)戊烷 CH3(CH2)3CH3
4 321
CH3CH2CH2CHCH3
1−甲基丁基 (1−methylbutyl)
321
CH3CH2CHCH2CH3
1−乙基丙基 (1−ethylpropyl)
异戊烷
CH3CHCH2CH3 CH3
4 32 1
CH3CHCH2CH2 CH3
3 21
CH3CHCHCH3 CH3
C 3 H 8 O C H 3 C H 2 C H 2 O H C H 3 C H C H 3
官能团异构体:由于分子中官能团不同而产生的异构体。如
C 2 H 6 OC H 3 O C H 3 C H 3 C H 2 O H
互变异构体: 因分子中某一原子在两个位置迅速移动而产生的 官能团异构体。(互变异构体是一种特殊的官能 团异构体)
构造式 CH3(CH2)16CH3 (正) CH3(CH2)17CH3 (正) CH3(CH2)18CH3 (正) CH3(CH2)19CH3 (正) CH3(CH2)20CH3 (正) CH3(CH2)28CH3 (正) CH3(CH2)29CH3 (正) CH3(CH2)30CH3 (正) CH3(CH2)38CH3 (正) CH3(CH2)48CH3 (正) CH3(CH2)58CH3 (正) CH3(CH2)68CH3 (正) CH3(CH2)78CH3 (正) CH3(CH2)88CH3 (正) CH3(CH2)98CH3 (正) CH3(CH2)132CH3 (正)
空三表现形式
空三表现形式
空三表现形式是指在三维空间中,通过不同的表现手法和技术,展示物体的形状、结构、材质和空间关系等信息的方式。以下是一些常见的空三表现形式:
1. 线框模型:使用线条来勾勒出物体的轮廓和主要结构。这种表现形式简单明了,适合快速展示物体的基本形状和结构。
2. 实体模型:通过填充物体的表面来创建实体模型。这种表现形式可以更好地展示物体的材质和细节,使其看起来更加真实。
3. 曲面模型:使用曲面来构建物体的表面。这种表现形式可以更好地表现物体的曲面和复杂形状,使其看起来更加流畅和自然。
4. 动态模型:通过动画或交互式技术来展示物体的运动和变化。这种表现形式可以更好地展示物体的动态特性和行为,使其更加生动和有趣。
5. 虚拟现实:使用虚拟现实技术来创建一个完全沉浸式的三维环境。这种表现形式可以让用户身临其境地感受物体的存在和空间关系,提供更加真实和直观的体验。
这些空三表现形式各有特点,可以根据不同的需求和目的选择合适的表现形式。无论是设计、工程、教育还是娱乐等领域,空三表现形式都发挥着重要的作用,为人们提供了更加丰富和直观的三维信息展示方式。
分子结构与化学键的三维模型
分子结构与化学键的三维模型化学键是分子内原子之间的相互作用力,是分子稳定存在的基础。了解分子结构和化学键的三维模型对于理解分子性质、反应机理以及化学合成等方面具有重要意义。本文将介绍分子结构和化学键的三维模型的基本原理、方法和应用。
一、分子结构的三维模型
分子结构的三维模型是将分子内原子的相对位置以及它们之间的化学键的长度、角度等信息用三维空间中的几何形状进行描绘的表示方法。常用的分子结构的三维模型有平面投影、空间填充模型、晶胞模型等。
1. 平面投影模型
平面投影模型是将分子结构投影到二维平面上,通过使用直线和圆环等图形来表示分子内原子的连接和相对位置。该模型便于观察平面内的化学键结构和原子排列,但无法准确表示分子的立体结构。
2. 空间填充模型
空间填充模型是通过用实心球代表原子,并将它们堆积在一起形成符合实际空间情况的分子形状。这种模型可以直观地展示出分子的三维形状,但无法显示化学键的长度和角度等信息。
3. 晶胞模型
晶胞模型是将分子结构描绘为晶胞中的原子排列方式,常用于描述晶体结构。通过晶胞的尺寸、角度等参数来表示分子间的空间位置和化学键的长度等信息。这种模型适用于研究晶体结构和晶格动力学等领域。
二、化学键的三维模型
化学键是由原子间的相互作用形成的连接,常见的化学键包括共价键、离子键和氢键等。其中,共价键是通过原子间电子的共享而形成的强化学键,离子键是由正、负离子间的电荷吸引力形成的化学键,而氢键是通过氢原子与其他原子间的电荷分布差异形成的弱化学键。
为了更好地理解化学键的性质和特点,科学家们发展了各种化学键的三维模型。
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(2) 机理已明确的情况下,涉及手性中心的转化
SN2机理:产物与原反应物构型已发生反转, 即产物构型与原反应物构型相反。
HO
COOH C H CH3
NaOH
H
COOH C Br CH3
NaN3
N3
COOH C H CH3
H2N
COOH C H CH3
(3)生物化学方法 对于氨基酸和甾体化合物:某些酶具有 构型特异性催化化学反应。 8个L氨基酸反应,如第9个氨基酸也反应, 极可能为L氨基酸。
The origin of optical activity
Achiral molecule
H CH3 OH CH3 H3C HO H3C H
2-propanol
No net rotation
Chiral molecule CH3
H OH CH2CH3
H3C HO H3CH2C H
(R)-2-butanol
• Diastereomers
• Relationships among 4 stereoisomers of 2-amino-3-hydroxybutanoic acid (threonine)
Chiral diastereomers have opposite configurations at some chiral centers. Enantiomers have opposite configurations at all chiral centers.
C R S
V W X W X Y
D S R
U Z
Y
C1 C2 A R R
• A与B、C与D互为对映体。 • A和B与C和D互为差向异构体。 • 差向异构体(diastereomer):即不是互为对 映体的立体异构体。
COOH H H OH Cl COOH HO Cl
COOH H H COOH H Cl
OH
CH2OH
• 确定绝对构型的方法: (1)在不改变手性中心的条件下:未知构型 化合物转化为已知构型化合物;或已知 构型化合物转化为未知构型化合物。
OH H3CH2C H
R
OH CH2Br H3CH2C H
S
CH3
已知化合物与未知化合物不一定具有相同 R或S构型,有可能相反,因为可能已使基 团的优先顺序发生了改变.
• 一些基团的优先顺序: COOH > COPh > COMe > CHO > CH(OH)2 > o-甲苯基(tolyl)> m-甲苯基 > p-甲苯基 >苯基 (phenyl) > -CCH > 叔 丁基 > 苯基 > 烯基 > 异丙基 > 苄基 > 新 戊基 (neopentyl)> 烯丙基 > 正戊基 > 乙 基 > 甲基 > H
Naming compounds with more than one stereocenter
S
CH3 H Br Br H H Br CH3 CH3 Br H Br H CH3 CH3 H Br
CH3
S
(2S,3S)CH3 H
Enantiomers
(2R,3R)CH3
Br Br CH3
Br Br CH3
• 2. Have 1 group steady while other 3 groups rotate: reserves the configuration
• D- 和 L-体系的构型 Rosanoff:人为规定(+) or d-glyceraldehyde (甘 油醛)为D型,其对映体为L型。 Bijvoet : 1951年用X-ray衍射法研究酒石酸钠铷 后,证实Rosanoff的指定是正确的。 D- 和 L-体系指定对映体的方法,不仅在手性中 心的对映体化合物中广泛使用,甚至在没有不 对称中心的分子,如联苯类、叠烯类化合物中 也得到了使用。 化学相关(沟通)法,可将D-或L-甘油醛与许多 化合物进行沟通(通过反应相关联),从而确 定那些化合物的绝对构型。
立体结构的表示方法 • Fischer Projection
COOH H2N C CH3 H
COOH
COOH
H2N CH3
H
H CH3
NH2
• 仅任何两个基团的互换位置,将使其转 变成为相应的对映体。该规则对立体模 型和Fisher投影式都适用。对无手性中心 的手性化合物,此规则不适用。
• Identity Testing 1. 180o Rotation on the plane reserves the configuration. 2. 90o Rotation on the plane breaks the rule (inverse the configuration)
1. Assign priorities 2. Perform motions to place the group of lowest priority at the top : H in the back
3. Determine the direction of rotation of the 3 groups
• 待测化合物需与已知构型化合物进行反应沟通, 才能确定D-或L-构型。有时需要多步化学 反应才能够沟通,其中可能存在反应前后手性 中心的构型是保持还是改变的问题,如判断错 误,可能导致最后待测化合物构型确定的错误。 • 目前,此DL体系,仅用于某些氨基酸和碳水 化合物(糖),其它类型化合物中已不再使用。
OHCl
COOH H H OH Cl COOH HO Cl COOH H H COOH H Cl COOH OH H COOH HO H COOH H Cl COOH
[α ]
-7.1° Ⅰ
+7.1° Ⅱ
-9.3° Ⅲ
+9.3° Ⅳ
V U X
1 2
V W Z W Z Y
S S B
V U X U Z Y
Meso Compounds (内消旋化合物)
A structures with two stereocenters will not always have four possible stereoisomers. Sometimes,there are only three (2n-1). This happens because some molecules with stereocenters are, overall, achiral
H
2S
H
The plane of symmetry
H
2R Meso compounds
• 2个手性中心:两个对映体,4个立体异 构体。 当两个手性中心连有相同基团时:一对对 映体,一个立体异构体。 多于一个手性中心的分子异构体数:2n个 异构体。
At the same two chiral carbons (含两个相同手性 碳原子的化合物)
1.光学异构体数目
COOH H HO OH H COOH Ⅰ HO H
(2n-1);
COOH H OH COOH Ⅱ
* * HOOCCHCHCOOH
OHOH COOH
COOH H H COOH Ⅳ
H H
(6)对手性醇采用手性非对映试剂的衍生 化处理,再用气相色谱测定差向异构体 的比率
Ph Me N Cl O Ph N N P O Cl
(7)MTPA (Mosher’s acid)方法:用 于手性仲醇的构型确定。 MTPA: -methoxy--trifluoromethyl phenylacetic acid
• 4. 相同元素,质量数(中子数)多的同 位数优先于质量数(中子数)低的同位 数。 • 如:18O>16O; 14C>13C>12C; 氚>氘>氢
• R, S Configuration
• 在Fisher投影式中,RS构型的确定:将 最低等级基团位于上或下位置,其它三 个基团等级顺序如为顺时针,则为R构型, 若为反时针,则为S构型。
• Sequence Rules (to determine priorities ): Cahn-Ingold-Prelog (CIP) Rules 1. Ranging by atomic number (原子序数) of atom connected to chiral carbon Br > Cl > O > N > C > H 35 17 8 7 6 1 2. Look at 2nd, 3rd, or 4th atom away from the chiral carbon If the 1st atoms are H same.
COOH OH H COOH HO H
COOH H Cl COOH
Ⅰ
Ⅱ
Ⅲ
Ⅳ
ⅠandⅡor III and IV are enantiomers (对映体); Ⅰand Ⅲ or Ⅳ are diastereomers (为非对映体);(Ⅱ 与Ⅲ或Ⅳ为非对映体); 2. The characteristic of diastereomers (非对映异构体 的特点): 1)Physical property, specific rotation is different (物 性不同、比旋光度不同); 2)Chemical property is similar (化性相似,但反应 有差异)
(H3C)2HC C Br CH2OH
C, C, H
O, H, H
O>C, CH2OH>CH(CH3 )3 Br>CH2OH>CH(CH3)3>H
• 3. Multiple-bonded atoms are equivalent to the same number of single-bonded atoms
(S)-2-butanol
Rotation
Molecules with more than one stereocenters
1) Compounds contain two different chiral carbons (含两个不相同手性碳原子的化合 * * 物) n HOOCCHCHCOOH 2
• 如最低等级基团不位于上或下位置,则 将其与另外上或下基团互换,再判断是 顺时针还是反时针,确定R或S构型,但 所确定构型与实际构型相反。
H OHC OH
R
OH CH2OH HOH2C H
R
CHO
H HOH2C OH CHO H
R
OH CHO OHC H CHO OH HOH2C H
S
CH2OH
OH OH COOH Ⅲ
HO HO
ⅠandⅡ are enantiomers (对映异构体);Ⅲ and Ⅳ are at the same compounds;Ⅰand Ⅲ are diastereomers;Ⅱand Ⅲ are distereomers (非对映体); Ⅲ is a meso compound (内消旋体)
O F 3C OH MeO Ph
+
O F3C
R*OH
1
H NMR
OR* MeO Ph
HPLC
Lanthanide shift reagent (镧系元素位移 试剂) (8) 其它方法: CD Circular dichroism (圆二色性) ORD Optical Rotatory Dispersion (旋光 色散) 不对称合成
CHO H OH CH2OH
HgO
COOH H OH
d D型
(+)
氧化前后,中心 手性碳构型不变
l D型
(-)
CH2OH
• 具有相同DL构型的分子பைடு நூலகம்不一定具有相 同的旋光方向。 • 相同的化合物在不同条件下(溶剂、波长 或温度),可能旋光方向相反。
• Assigning R, S configuration
2,3-dibromobutane
CH3
H CH3 Br H CH3 CH3 CH3 H H CH3 Br Br Br Br CH3 Br H CH3 CH3 H Br
* CHBr
Br
* CHBr Enantiomers
CH3 H
The plane of symmetry
H
Meso compounds
(4)旋光比较:旋光的符号、旋光度,有 时可用于确定构型。 在同系列化合物中,旋光的变化是渐变 的和同方向的。如有足够多的化合物的 构型已知,则缺失化合物的构型也易于 确定。 某些化合物中基团对母体分子的旋光的 贡献量或大或小,相对固定,在刚性骨 架的母核中更是如此,如甾体化合物。
(5)X-ray衍射法:铜版;引入重原子; 引入已知手性的基团。