质谱MRM技术在蛋白质组学研究中的应用

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mrm原理

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MRM原理什么是MRM?MRM(Multiple Reaction Monitoring,多重反应监测)是一种用于蛋白质和代谢物定量分析的质谱技术。

它是一种选择性、灵敏且高通量的方法,常用于生物学研究中的定量蛋白质和代谢物分析。

MRM的适用范围MRM技术主要用于定量分析具有特定肽段或代谢物的样品。

肽段或代谢物通过特定的生物样品制备方法进行提取,并使用质谱仪进行分析。

MRM技术适用于生物样品中的低丰度蛋白质和代谢物的定量分析,尤其对于疾病标志物的研究具有重要意义。

MRM的原理与流程原理MRM技术主要基于质谱仪中的质量筛选和反应监测原则。

首先,通过事前的方法开发和优化,确定待测分子的特征性质谱特征,如分子量、反应行为等。

然后,针对待测分子设计并进行反应监测实验,以实现高选择性和灵敏度的定量分析。

流程1.方法开发:确定待测分子的特征性质谱特征,包括分子量、裂解模式、过渡离子等。

2.方法优化:通过多重反应监测和优化过渡离子选择,提高定量分析的选择性和灵敏度。

3.样品制备:采用适当的样品准备方法,如消化、提取等,以提取待测分子。

4.样品分析:将样品注入质谱仪进行分析。

通过多重反应监测,选择待测分子的特定裂解反应进行定量分析。

5.数据分析:根据质谱仪输出的数据进行数据处理和定量分析。

MRM的优势和应用优势1.高选择性:通过设计特定的反应监测实验,实现对待测分子的高选择性分析。

2.高灵敏度:MRM技术具有很高的灵敏度,能够对低丰度的蛋白质和代谢物进行定量分析。

3.高通量:MRM技术可以同时对多个待测分子进行定量分析,提高实验效率。

应用1.生物医学研究:MRM技术在疾病标志物的发现和分析中具有重要作用,可以提供关于蛋白质表达水平和代谢物浓度的定量信息。

2.蛋白质组学研究:MRM技术在蛋白质组学研究中可以对大规模的蛋白质进行定量分析,揭示生物系统中蛋白质的功能和相互作用网络。

3.代谢组学研究:MRM技术可以对代谢物进行快速、准确的定量分析,揭示代谢途径和代谢物之间的关系。

安捷伦质谱mrm模式的方法开发

安捷伦质谱mrm模式的方法开发

安捷伦质谱MRM模式的方法开发随着科学技术的不断进步,质谱技术在生命科学领域中扮演着越来越重要的角色。

其中,安捷伦质谱MRM(多反应监测)模式作为一种高效灵敏的质谱分析方法,广泛应用于蛋白质组学、代谢组学和药物代谢动力学等领域。

本文将针对安捷伦质谱MRM模式的方法开发进行探讨,讨论MRM模式的基本原理、方法开发的关键步骤及其在生命科学研究中的应用。

一、安捷伦质谱MRM模式的基本原理MRM是一种质谱扫描模式,其基本原理是通过选择两个或多个特定的离子反应对来进行分析。

在MRM模式中,首先选择一个前体离子进行碎裂,然后选择一个或多个产物离子进行检测。

这种方法能够提高分析的特异性和灵敏度,因此在生命科学研究中得到广泛应用。

二、安捷伦质谱MRM模式方法开发的关键步骤1. 目标分子筛选:首先需要确定待测分子的化学结构特征以及其在样品中的丰度范围。

通常可以通过文献调研和实验分析来获得相关信息。

2. MS参数优化:根据待测分子的特性,对质谱扫描参数进行优化,包括碰撞能量、离子传输电压和离子源温度等。

3. 质谱方法建立:根据所选择的前体离子和产物离子,建立MRM扫描方法,并进行方法的优化和验证。

4. 样品前处理:对待测样品进行适当的前处理,包括提取、富集和洗脱等步骤,以提高待测物质的检测灵敏度和准确性。

5. 数据分析:对得到的质谱数据进行处理和分析,包括信号去噪、质谱峰识别和定量计算等。

三、安捷伦质谱MRM模式方法在生命科学中的应用1. 蛋白质组学研究:MRM模式可以用于蛋白质的定量分析,包括蛋白质的表达水平和修饰情况等。

通过MRM方法,可以实现对复杂蛋白混合物的快速、准确的定量分析。

2. 代谢组学研究:MRM模式可以用于代谢产物的定量分析,包括小分子代谢产物和中间代谢产物等。

通过MRM方法,可以实现对代谢通路和代谢产物的全面分析。

3. 药物代谢动力学研究:MRM模式可以用于药物及其代谢产物的定量分析,包括药物的代谢途径和代谢产物的药效学评价等。

质谱技术在蛋白质组学中的应用

质谱技术在蛋白质组学中的应用

质谱技术在蛋白质组学中的应用随着科技的不断发展,质谱技术在生物学领域的应用越来越广泛。

在蛋白质组学中,质谱技术被广泛应用于蛋白质的鉴定、定量、结构分析等方面。

本文将介绍质谱技术在蛋白质组学中的应用。

一、蛋白质的鉴定蛋白质组学的核心之一是蛋白质鉴定。

传统的蛋白质鉴定通常采用电泳、免疫学等技术,但这些技术存在许多限制,比如不能直接鉴定低摩尔质量的蛋白质、不能鉴定扩增的同源蛋白质等。

质谱技术则可以克服这些限制,通过离子化和分离技术将蛋白质分离并进行鉴定。

最常见的质谱技术是MALDI-TOF,它可以高效地检测出低丰度的蛋白质,并可以鉴定脱水、脱乙酰基等化学修饰对鉴定结果的影响。

二、蛋白质的定量蛋白质组学中的另一个问题是如何定量蛋白质。

蛋白质的定量方法包括贡献系数法、放射性定量法、非放射性定量法等。

但是这些方法都存在一定的局限性,比如准确性不高、操作复杂、不能直接测量蛋白质浓度等。

质谱技术可以通过分析蛋白质荷质比(m/z)和峰面积来定量蛋白质。

其中,定量方法主要包括AQUA、MRM和SILAC等。

这些高通量定量方法不仅具有高灵敏度且快速可靠,而且可以同时测量多个蛋白质,提高了定量的效率和准确性。

三、蛋白质的结构分析质谱技术在蛋白质结构分析方面也有独特的应用。

蛋白质的序列和二级结构信息可以通过质谱技术进行分析。

蛋白质序列的信息可以通过PMF(基于质量信号的谱图)和PSD(基于碎片信号的谱图)得到。

而蛋白质的二级结构信息可以通过CD(圆二色谱)、FTIR(傅里叶变换红外光谱)和NMR(核磁共振)等技术得到。

此外,质谱技术还可以用于分析蛋白质的外介体如糖基化修饰等,从而得出完整的蛋白质结构信息。

四、蛋白质组学中的应用举例在生物研究方面,质谱技术的应用举例不胜枚举。

例如,蛋白质家族的发现和定量研究、疾病的诊断和治疗、药物的发现和开发等,都需要质谱技术的支持。

以代谢组学为例,质谱技术可以定量测定代谢产物,从而更好地了解代谢通路和生成的代谢物等信息。

蛋白质组学定量分析的方法

蛋白质组学定量分析的方法

蛋白质组学定量分析的方法蛋白质组学定量分析是对细胞或组织中的蛋白质进行定量分析的一种方法。

它是研究蛋白质组学的重要手段之一,可以揭示蛋白质的表达差异、功能变化以及相关的生物学过程和疾病机制。

目前,蛋白质组学定量分析的方法主要包括质谱定量法和定量免疫学方法。

质谱定量法是蛋白质组学定量分析的主要方法之一。

它基于质谱技术和同位素标记原理,使用质谱仪对样品中的蛋白质进行定量分析。

目前常用的质谱定量方法包括多重反应监测(MRM)、定量蛋白质鉴定(iTRAQ)和标记蛋白质鉴定(TMT)等。

多重反应监测(MRM)是一种常用的质谱定量分析方法。

它利用质谱仪中的三重四极杆(triple quadrupole)进行分析。

首先,确定待测蛋白质的肽段序列,然后合成同位素标记的肽段标准品作为内标。

接下来,使用质谱仪对待测蛋白质和内标进行质谱分析,测量待测蛋白质和内标的特定肽段的质荷比和峰面积。

最后,通过内标的峰面积和待测蛋白质的峰面积进行定量计算,得到待测蛋白质的表达量。

定量蛋白质鉴定(iTRAQ)是一种基于同位素标记的质谱定量方法。

在iTRAQ 实验中,待测组织或细胞培养基中的蛋白质经过胰蛋白酶消化后,将消化产物用不同的同位素标记。

这些标记反应产物有不同的质量,通过质谱分析可以得到有关各组分的数量比。

通过比较标记反应产物的相对丰度,可以定量分析待测蛋白质的表达差异。

标记蛋白质鉴定(TMT)是一种与iTRAQ类似的同位素标记质谱定量方法。

TMT 实验中,多个待测样品用不同的同位素标记,然后将这些样品混合在一起通过液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)进行分析。

通过质谱分析可以得到不同样品中蛋白质的相对表达量和差异表达蛋白质的鉴定。

定量免疫学方法也是蛋白质组学定量分析的重要方法之一。

相比于质谱定量法,定量免疫学方法具有高灵敏度、高特异性和高通量等优点。

常用的定量免疫学方法包括酶联免疫吸附实验(ELISA)、西方印迹(Western blotting)和流式细胞术(flow cytometry)等。

非靶向蛋白质组mrm

非靶向蛋白质组mrm

非靶向蛋白质组mrm非靶向蛋白质组定量(MRM)是一种用于定量分析复杂蛋白质混合物的方法。

相比于传统的蛋白质组学方法,非靶向MRM技术具有更高的灵敏度和准确性,能够同时定量分析大量蛋白质。

非靶向蛋白质组学研究旨在全面分析生物样本中的蛋白质组成和表达水平。

然而,传统的蛋白质组学方法,如二维凝胶电泳和液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS),存在一些局限性,如低灵敏度、低覆盖率和复杂的数据分析。

为了克服这些问题,非靶向MRM技术应运而生。

非靶向MRM技术基于质谱仪的多反应监测(MRM)模式。

首先,通过质谱分析仪对样本中的蛋白质进行消化,将蛋白质降解为肽段。

然后,使用质谱仪进行肽段的分析,并选择特定的肽段进行定量分析。

这些特定的肽段被称为“转换肽”,它们的选择基于蛋白质的特异性和丰度。

非靶向MRM技术具有多个优点。

首先,相对于传统的蛋白质组学方法,非靶向MRM技术具有更高的灵敏度。

通过选择特定的转换肽,可以提高质谱仪的灵敏度,从而实现对低丰度蛋白质的定量分析。

其次,非靶向MRM技术具有更高的准确性。

通过使用内标物和标准曲线,可以准确地确定蛋白质的浓度。

此外,非靶向MRM 技术还具有较高的通量。

通过同时分析多个转换肽,可以快速而有效地定量分析大量蛋白质。

非靶向MRM技术在生物医学研究中有着广泛的应用。

例如,在疾病诊断和治疗中,非靶向MRM技术可以用于寻找生物标志物,帮助早期诊断疾病和监测治疗效果。

此外,非靶向MRM技术还可以用于药物研发和药物代谢动力学研究。

通过定量分析药物在体内的代谢产物,可以评估药物的安全性和疗效。

然而,非靶向MRM技术也存在一些挑战和限制。

首先,样本的前处理过程可能会导致损失和变异。

因此,在样本的前处理过程中需要谨慎操作,以确保蛋白质的完整性和稳定性。

其次,非靶向MRM技术对仪器的要求较高,需要具备高分辨率和高灵敏度的质谱仪。

此外,数据的处理和分析也是一个挑战,需要合适的算法和软件来处理大量的数据。

蛋白质组学MRM

蛋白质组学MRM

蛋白质组学MRM
蛋白质组学MRM是指用MRM技术进行蛋白质组学的研究,MRM主要用于目标蛋白的定量研究,可以一次性精准定量复杂样品中的多个目标蛋白。

百泰派克生物科技提供MRM定量蛋白组学分析服务。

蛋白质组学MRM简介
MRM(Multiple Reaction Monitoring)是一种研究目标蛋白分子的靶向定量蛋白组学技术。

MRM基于目标分子的已知信息或假定信息,可以有针对性的选择离子进行质谱数据采集,对于符合目标离子规则的信号进行采集,去除不符合规则的离子信号的干扰。

MRM质谱分析包括三个阶段:1.通过MS筛选出与目标分子特异性一致的母离子;2.碰撞碎裂这些母离子,去除其他离子的干扰;3.只对选定的特异
MS/MS2离子进行质谱信号的采集。

MRM质谱技术是高精准度的蛋白定量鉴定技术,是一次性精准定量研究复杂样品中多个目标蛋白的绝佳方法。

如果借助同位素标记的目标肽段作为内参,可以实现蛋白的绝对定量。

蛋白质组学MRM。

蛋白质组学MRM的特点
MRM技术通过两级离子选择,可排除大量干扰离子,使质谱的背景降低,目标检测物的信噪比显著提高,从而实现检测的高灵敏度,并具有重现性好、准确度高等特点,特别适合于已知蛋白质序列的蛋白质表达量差异检测,并可以检测较低丰度的蛋白。

MRM与PRM的不同之处在于,在对选定的母离子进行裂解后,MRM仅测量选定的碎片离子,而PRM则测量所有的碎片离子。

MRM蛋白质组

MRM蛋白质组

百泰派克生物科技
MRM蛋白质组
MRM(Multiple Reaction Monitoring)多反应监测技术或称选择性反应监测是一
种高度特异和灵敏的质谱技术,可以选择性的定量复杂混合物中的化合物,基本上任何可以电离然后碎裂的化合物都可以用于MRM分析,最典型的例子就是测量血浆、血清和其他生物样品中的蛋白质、肽、代谢物和脂质等。

利用MRM技术对蛋白/多肽进行定量研究是MRM蛋白质组的主要研究内容。

该技术
使用三重四极杆质谱,首先靶向对应于目标蛋白/肽段的离子,随后裂解该靶离子
以产生一系列子离子,可以选择这些片段子离子中的一个或多个进行定量。

只有满足对应于目标分子质量的特定母体离子和特定子离子这两个条件的化合物,才能在质谱仪中分离出来,MRM通过忽略所有其他流入质谱仪的离子,获得了良好的灵敏度,同时保持了极高的准确度。

MRM蛋白质组分析是生物标志物分析中检测和定量
的常见选择,其允许在同一实验中检测多种蛋白质,可在更短的时间内定量多种蛋白质(20分钟内约10种蛋白质),同时保证了高选择性、高灵敏度、高准确度和
高通量。

百泰派克生物科技采用AB SCIEX TripleTOF 5600质谱平台结合Nano-LC,推出MRM/PRM靶向定量蛋白组分析服务技术包裹。

您只需要将您所需研究的目标蛋白信
息提供给我们,我们提供一站式MRM定量蛋白分析服务。

包括MRM方法建立和优化、特异肽段挑选、同位素标记肽段、质谱分析、原始数据分析、生物信息学分析,欢迎免费咨询。

质谱技术在多组学研究和医学检验中的应用前景及挑战

质谱技术在多组学研究和医学检验中的应用前景及挑战

质谱技术在多组学研究和医学检验中的应用前景及挑战摘要质谱仪是一种通过测量相对分子质量或质荷比鉴定物质的分析工具,质谱仪通常由3个基本部分组成:即离子源、质量分析器和检测器。

通过将双重/多重质量分析仪串联起来或与气相色谱、液相色谱、毛细管电泳等技术平台联用,可以提高质谱仪的分析性能。

离子源是质谱仪的关键组成,是将分析物进行离子化的部分,在质谱仪发展的早期阶段,由于采用的电离方法很容易破坏有机分子中的共价键,因此很少用于生物分析。

电喷雾电离(ESI)和基质辅助激光解吸/电离(MALDI)等“软”电离方法彻底改变了质谱技术,使质谱技术应用于生物大分子的高通量质量分析成为可能,促进了质谱技术在生物学和临床医学研究中的应用和推广,现代组学中最常用的质谱仪类型有:静电场轨道阱、离子阱、四极杆、傅立叶变换离子回旋共振、飞行时间等。

检验医学在临床诊断和治疗监测方面发挥着至关重要的作用,基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多组学研究成果促进了全新诊断标志物的研究发现和临床应用。

质谱技术以其高灵敏度、高特异度和高通量的能力满足组学对复杂的生物标本分子组成及相互关系研究的需求,近年来以质谱分析技术为核心的多组学研究发现极大拓展了质谱在医学检验中的应用范围,可以预见基于质谱技术的疾病诊断方法将成为重要的临床检验诊断技术。

关键词:质谱技术;多组学;医学检验中图法分类号:R-331 文献标志码:A1以高性能质谱为核心的组学研究已成为发现检验生物标志物的主要来源生物标志物是指用于疾病诊断、风险评估及预后判断的生物分子,组学领域的扩展和检测技术手段的进步不断拓展了生物标志物的范畴。

目前生物标志物不仅涵盖了传统的核酸、蛋白质、糖类及代谢物等标志物类型,还囊括细胞遗传学和细胞动力学参数,以及体液中的外泌体、细胞等。

在过去的几十年里,研究者用各种组学技术致力于生物标志物的发现和疾病的早期诊断,质谱技术作为组学研究的核心技术,其在生物标志研发策略方面的科学价值和优势越来越受到检验医学的重视。

蛋白质组学定量分析的方法

蛋白质组学定量分析的方法

蛋白质组学定量分析的方法
蛋白质组学定量分析的方法主要有两种:定性分析和定量分析。

1. 定性分析:常用的定性分析方法有蛋白质质谱技术,如蛋白质液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)。

这些方法能够对样品中的蛋白质进行分离、鉴定和定性分析,可以确定蛋白质的氨基酸序列和特定的修饰情况。

2. 定量分析:常用的定量分析方法有标记蛋白质定量和非标记蛋白质定量。

标记蛋白质定量方法包括同位素标记法和化学标记法。

同位素标记法主要包括稳定同位素标记法(如氘代谱标法)和放射性同位素标记法(如放射性同位素测量法)。

化学标记法主要包括功能分子标记法(如荧光标记法和生物素标记法)和反应性标记法(如对硝基苯甲酸标记法和丙煮醛标记法)。

非标记蛋白质定量方法常用的有相对定量法和绝对定量法。

相对定量法主要通过蛋白质相关的性质,在样品中不同蛋白质的含量所具有的差别来进行定量。

常用的相对定量方法有比较蛋白质的荧光标记法、差减荧光凝胶法和差异凝胶电泳法等。

绝对定量法主要使用内标法,通过加入已知浓度的内标蛋白质来计算目标蛋白质的浓度。

常用的绝对定量方法有多重反应监测法(MRM)和定量蛋白质标准曲线法等。

定量蛋白质组学研究技术

定量蛋白质组学研究技术

定量蛋白质组学研究技术质谱法是一种使用质谱仪来分析蛋白质的方法。

它可以通过测量蛋白质分子的质量和电荷比例,来确定蛋白质的存在和数量。

质谱法有多种不同的变体,包括质谱法,液相色谱质谱法(LC-MS),以及多反应监测质谱法(MRM)。

这些方法结合了高效液相色谱(HPLC)和质谱仪,可以实现高通量的蛋白质分析,同时还可以检测蛋白质的修饰和亚细胞定位。

标记法是一种通过引入标记分子来量化蛋白质的方法。

常用的标记分子包括放射性同位素、生物素、荧光染料和金纳米颗粒等。

这些标记分子可以与蛋白质特定的官能基结合,并通过测量其信号强度来定量蛋白质的存在和数量。

标记法适用于大规模的蛋白质组学研究,可以同时测量大量的样品。

免疫法是一种使用抗体来定量蛋白质的方法。

这种方法通过引入与特定蛋白质结合的抗体,然后使用荧光或酶作为信号分子,来测量蛋白质的数量。

免疫法可以用于分析特定蛋白质或蛋白质家族的表达和定量。

同时,由于抗体具有高度的特异性,免疫法还可以用于检测蛋白质的修饰和亚细胞定位。

除了上述常用的方法,还有一些新兴的定量蛋白质组学研究技术。

例如,双重标记代谢组学(DIA)是一种结合了质谱法和标记法的新方法,可以同时测量整个蛋白质组的表达和修饰。

单细胞蛋白质组学是一种用于分析单个细胞蛋白质组的技术,可以揭示细胞间的异质性和复杂性。

总之,定量蛋白质组学研究技术是一种重要的工具,可以帮助我们更深入地了解生物体内蛋白质的存在和功能。

这种技术可以通过多种方法实现,包括质谱法、标记法和免疫法等。

随着技术的发展,新的定量蛋白质组学研究技术也在不断涌现,将为蛋白质组学研究带来更多的机会和挑战。

mrm 定量质谱

mrm 定量质谱

mrm 定量质谱MRM(Multiple Reaction Monitoring)定量质谱是一种用于定量分析化合物的质谱技术。

它结合了选择离子监测(SIM)和质谱/质谱(MS/MS)的原理,具有高选择性、高灵敏度和高准确性的特点。

一、MRM 定量质谱的原理如下:1. 选择目标化合物的特征离子:通过对目标化合物的结构和化学性质的了解,选择具有特异性的离子作为监测对象。

2. 设定 MRM 通道:针对每个选择的离子,设定一个MRM 通道。

该通道包括母离子(precursor ion)的质荷比、碰撞能量以及产物离子(product ion)的质荷比。

3. 扫描和监测:在质谱仪中,通过设定的 MRM 通道对样品进行扫描。

只有当母离子与设定的质荷比匹配,并在碰撞池中产生特定的产物离子时,才会被检测到。

4. 定量分析:根据检测到的目标离子的信号强度与内标或标准品的比较,进行定量分析。

二、MRM 定量质谱的优点包括:1. 高选择性:通过选择特定的离子对,可以大大提高对目标化合物的选择性,减少干扰。

2. 高灵敏度:由于只监测特定的离子对,MRM 可以提高检测的灵敏度,检测低浓度的化合物。

3. 高准确性:MRM 技术可以减少基质干扰和背景噪音,提高定量分析的准确性。

4. 可同时定量多个化合物:通过设置多个 MRM 通道,可以同时定量分析多个目标化合物。

MRM 定量质谱在环境监测、食品分析、药物代谢研究、生物标志物检测等领域有广泛的应用。

三、与其他定量分析方法相比,MRM(Multiple Reaction Monitoring,多反应监测)定量质谱具有以下优势和劣势:(一)优势:1. 高选择性和特异性:MRM 定量质谱通过选择特定的母离子和产物离子对,可以实现对目标化合物的高选择性和特异性检测。

这有助于减少干扰,提高分析的准确性。

2. 高灵敏度:由于 MRM 只监测特定的离子对,它可以提高检测的灵敏度,能够检测低浓度的目标化合物。

质谱分析在蛋白质组学中的应用

质谱分析在蛋白质组学中的应用

质谱分析在蛋白质组学中的应用(摘要 (2)1、质谱 (2)2、蛋白质组学 (2)3、质谱分析在蛋白质组学中的应用 (4)参考文献 (6)附录1································ 8)16120901(生技)20092348 王德美摘要:蛋白质组是基因组研究的继续,以基质辅助激光解吸附飞行时间质谱和电喷雾质谱为代表的现代生物质谱技术,为蛋白质组的研究提供了必要的技术手段。

主要通过获取蛋白质、多肽的分子量以及修饰片段的信息,研究蛋白—蛋白间相互作用、翻译后修饰乃至基因表达水平的变化等方面的情况,从而扩充和完善蛋白质组学的研究【1】。

本文旨在收集整理相关信息,反映质谱技术在蛋白质组学中应用的发展现状,为相关人员提供初级资料。

1、质谱质谱(Mass SPectrometry)是带电原子、分子或分子碎片按质荷比(或质量)的大小顺序排列的图谱。

质谱仪【2】是一类能使物质粒子高化成离子并通过适当的电场、磁场将它们按空间位置、时间先后或者轨道稳定与否实现质荷比分离,并检测强度后进行物质分析的仪器。

1.1原理质谱分析原理是通过进样使试样中各组分电离生成不同荷质比的离子,经加速电场的作用,形成离子束,进入质量分析器,利用电场和磁场使发生相反的速度色散——离子束中速度较慢的离子通过电场后偏转大,速度快的偏转小;在磁场中离子发生角速度矢量相反的偏转,即速度慢的离子依然偏转大,速度快的偏转小;当两个场的偏转作用彼此补偿时,它们的轨道便相交于一点。

与此同时,在磁场中还能发生质量的分离,这样就使具有同一质荷比而速度不同的离子聚焦在同一点上,不同质荷比的离子聚焦在不同的点上,将它们分别聚焦而得到质谱图,从而确定其质量。

生物质谱在蛋白质组学中的应用

生物质谱在蛋白质组学中的应用

生物质谱是一种重要的分析技术,在蛋白质组学研究中有广泛的应用。

以下是生物质谱在蛋白质组学中的几个主要应用:
1. 蛋白质鉴定和识别:生物质谱可用于鉴定和识别复杂蛋白质混合物中的特定蛋白质。

通过质谱仪器将蛋白质样品分离为肽段,然后利用质谱技术(如质谱图谱和数据库搜索)进行肽段的鉴定和匹配,从而确定样品中存在的蛋白质身份。

2. 蛋白质修饰分析:生物质谱可以用于检测和分析蛋白质上的各种修饰,如磷酸化、甲基化、乙酰化等。

通过质谱仪器的高灵敏度和高分辨率,可以定量和鉴定蛋白质中修饰的位置和程度,进一步了解修饰对蛋白质功能和调控的影响。

3. 蛋白质相互作用研究:生物质谱可用于分析蛋白质与其他分子(如蛋白质、小分子化合物等)之间的相互作用。

通过蛋白质亲和纯化、交联和质谱分析等技术,可以鉴定和分析蛋白质与其相互作用伙伴之间的物理交互关系,揭示蛋白质相互作用网络和信号传递机制。

4. 蛋白质定量分析:生物质谱也可用于蛋白质的定量分析。

通过使用同位素标记的内标和比较样品与内标之间的质谱峰强度比,可以定量测量样品中不同蛋白质的相对丰度或绝对表达水平,从而研究蛋白质组的定量变化,如生理过程中的差异表达分析和生物标记物的发现等。

总的来说,生物质谱在蛋白质组学研究中发挥着重要的作用,可以帮助揭示蛋白质组的复杂性、功能和调控机制。

它为我们深入了解蛋白质在生物学过程中的作用提供了强大的工具和技术支持。

高通量定量蛋白质组学技术在生物医学中的应用

高通量定量蛋白质组学技术在生物医学中的应用

高通量定量蛋白质组学技术在生物医学中的应用随着科技的不断发展,蛋白质组学已经成为研究生命科学领域的一个重要方向。

而高通量定量蛋白质组学技术则是在这个领域中的一个重要分支。

本文将重点探讨这一技术在生物医学中的应用,并深入探究其原理与发展。

一、高通量定量蛋白质组学技术的原理与发展高通量定量蛋白质组学技术源于代谢组学和基因组学领域的研究,是一种通过大规模筛选、鉴定和定量蛋白质的方法。

其核心技术是液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS),可以实现同时对几千种蛋白质进行快速、高效的分离和鉴定。

这种技术被广泛应用于蛋白质表达的比较、特异性标记、定量和空间分布等研究领域。

近年来,高通量定量蛋白质组学技术的发展经历了几个重要节点。

首先,以反向蛋白质组学技术为代表的“假两组实验证明了高通量技术的可靠性和价值。

其次,液相色谱分离技术的不断升级和串联质谱的强化,更加发挥了技术的优势。

最后,以MRM(重复反应监测)为代表的靶向蛋白质鉴定技术,使得定量蛋白质组学成为一种定量化、高通量检测技术。

二、1、癌症研究高通量定量蛋白质组学技术在癌症研究中的应用,可以帮助人们更好地理解肿瘤的生物学特性,鉴定癌症相关的分子标志物,并发现其在肿瘤进展和预后方面的显著性。

比如,这项技术可以用于分析角膜癌的蛋白质组,从而帮助诊断和治疗该癌症。

此外,高通量定量蛋白质组学技术还可用于监测肿瘤细胞内蛋白质调控网络中的变化,这意味着我们可以更好地理解肿瘤细胞内的信号传递机制。

2、神经退行性疾病研究神经退行性疾病如阿尔茨海默病是目前医学领域中一个不可避免却又困扰人们的难题。

高通量定量蛋白质组学技术可以帮助寻找神经退行性疾病的病因、发病机制及早期诊断标志物等。

通过使用该技术检测大鼠或人类脑组织,在神经元生存、突触传递和神经细胞死亡等方面有所突破。

这种技术不仅是神经退行性疾病研究的新方法,更是其未来超越成果的重要途径之一。

3、代谢疾病研究高通量定量蛋白质组技术在代谢疾病研究中的应用同样有着广泛的应用前景。

质谱在蛋白质组学中的应用

质谱在蛋白质组学中的应用

3.1 蛋白质的高通量分离和鉴定
3.1 Thermo蛋白质组学解决方案
样品制备
LC-MS/MS 分离鉴定
The Most Successful Labs and Companies
软件分析
3.1 Thermo蛋白质组学解决方案
蛋白质功能
亲和纯化 抗体
蛋白质表达 蛋白质相互作用
蛋白质修饰 蛋白质结构
2.3 生物质谱解析蛋白质组学基本流程——裂 解
MS
MS/MS
2.3 生物质谱解析蛋白质组学基本流程——裂 解
➢CID、ECD、ETD裂解方式示意图
➢多肽串级质谱碎片离子示意图
2.3 生物质谱解析蛋白质组学基本流程——裂

R 1
H HO
R 3
HH
肽段: H 2 N C C N C C N C C N C C O O H
进样系统 (LC或者直大气压
接进样)
离子化方式
真空系统
质量分析器
检测器
数据处理 系统
电喷雾电离 ESI 基质辅助激光解析电离 MALDI 大气压化学电离 APCI
大分子
2.4 生物质谱的离子源
2.4 生物质谱的质量分析器
进样系统 (LC或者直大气压
接进样)
离子化方式
真空系统
质量分析器
检测器
数据处理 系统
b
+1 12
1260.3
y
+1 13
1465.6
y
+1 14
1580.8
b
+1 16
1671.7
+1 b 17 1799.8
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质谱在蛋白质分析中的应用

质谱在蛋白质分析中的应用

质谱在蛋白质分析中的应用蛋白质是构成生命体的基本分子之一,承担着许多生物学过程的关键作用。

因此,研究蛋白质结构和功能对于理解生命体的本质、解决疾病治疗问题都有着非常重要的意义。

而质谱技术作为一种高精度、高灵敏度的分析手段,在蛋白质研究领域中有着广泛的应用。

质谱技术是利用质荷比或质量分布的差异来分离和测定化合物的一种分析方法。

蛋白质的分子量一般在几千到几百万之间,结构也非常复杂,因此需要先进行分离和纯化,然后用质谱技术进行进一步的分析和鉴定。

质谱在蛋白质分析中最常用的方法是质谱仪联用色谱技术(MS/MS)。

这种方法通过对蛋白质进行酶解得到多肽,再通过液相色谱分离得到单一的多肽物质,最后用质谱仪进行较为准确地分析。

质谱仪可以将多肽分子转化为气态离子,然后根据它们的质量-电荷比进行分离和检测。

质谱仪联用色谱技术可以用于鉴定蛋白质序列、确定多肽修饰、鉴定蛋白质相互作用等。

除了质谱仪联用色谱技术外,还有几种其他的质谱技术常用于蛋白质分析。

例如:飞行时间质谱(TOF-MS)可以用来测定多肽的分子量,以及定量分析,它的主要优点是灵敏度高,精度好;惊奇电场离子陷阱质谱(Q-TOF MS)可以用于高通量酶解和多肽鉴定,它对蛋白质结构和修饰也有较好的解析力;离子流动管质谱(IM-MS)可以用于气态蛋白质的分析,特别是对于具有高度异构体的蛋白质有很大的优势。

总的来说,质谱技术在蛋白质分析方面有着重要的应用,可以用于蛋白质质量的鉴定、氨基酸序列的鉴定、翻译后修饰的鉴定、蛋白质拓扑结构的鉴定、蛋白质互作的鉴定以及定量分析等。

但是质谱技术也有其局限性,例如对于大型蛋白质的分析、对于蛋白质结构的鉴定有一定的困难等,因此需要采用多种技术手段相结合的方法来进行分析。

随着质谱技术的发展和应用不断拓展,蛋白质研究的深度和广度也在不断提高。

质谱技术在蛋白质研究中的应用,对于人类生命健康和疾病治疗等方面都有着重要的意义。

单细胞蛋白质组学应用(一)

单细胞蛋白质组学应用(一)

单细胞蛋白质组学应用(一)单细胞蛋白质组学是一种全新的分析方法,可以在单个细胞水平上获取细胞蛋白质组的信息。

这项技术的应用广泛,以下是其中一些例子:1. 新型药物研发单细胞蛋白质组学可以帮助研究者了解药物与单个细胞的相互作用。

这有助于优化药物设计,并发现新型的药物作用机制。

2. 癌症研究单细胞蛋白质组学可以帮助研究者了解癌细胞的异质性以及不同次型癌的蛋白质差异,有助于更好的了解癌细胞的生物学特性,并为个性化治疗提供依据。

3. 免疫学研究单细胞蛋白质组学可以帮助研究者了解不同单个免疫细胞类型之间的功能差异和相互作用。

这些信息对于深入理解身体对不同病原体的免疫反应以及自身免疫疾病的发生机制有帮助。

4. 生殖医学研究单细胞蛋白质组学可以帮助研究者了解生殖细胞之间的差异,这对于生殖医学研究以及人工生殖技术的发展非常重要。

5. 神经科学研究单细胞蛋白质组学可以帮助研究者了解神经元之间的差异和相互作用,这对于理解神经网络的结构和功能以及神经退行性疾病的发生机制有帮助。

以上只是单细胞蛋白质组学应用的一小部分,未来随着技术的不断发展,其应用范围还将不断拓展。

单细胞蛋白质组学的技术与挑战单细胞蛋白质组学的实现需要采用高通量单细胞分析技术和高灵敏度蛋白质分析技术。

目前,单细胞蛋白质组学主要采用质谱分析技术,包括多反应监测(MRM)和质谱成像技术。

但是,单细胞样本量极小,如何在最小的样本量上获得最精确的蛋白质组信息,是当前技术面临的主要挑战。

单细胞蛋白质组学的发展前景单细胞蛋白质组学作为一项新兴的技术,已经取得了一定的进展。

未来,随着新技术的不断应用和开发,例如微流控技术、快速分离富集技术和高灵敏度质谱技术等,单细胞蛋白质组学的分析效率和准确性有望进一步提高,从而拓展其在生命科学领域中的应用。

利用质谱技术进行蛋白质磷酸化组学研究

利用质谱技术进行蛋白质磷酸化组学研究

利用质谱技术进行蛋白质磷酸化组学研究蛋白质磷酸化是一种常见且重要的表观遗传修饰方式,参与调控细胞的信号传导和功能。

随着科技的进步,质谱技术成为研究蛋白质磷酸化的重要工具之一。

利用质谱技术进行蛋白质磷酸化组学研究,可以全面、高通量地鉴定和定量细胞中的磷酸化修饰位点,揭示磷酸化修饰网络和生物过程的调控机制。

本文将带领读者探索质谱技术在蛋白质磷酸化组学研究中的重要性和应用。

一、质谱技术在蛋白质磷酸化组学研究中的重要性。

质谱技术在蛋白质磷酸化组学研究中具有重要的地位和作用。

以下是几个方面的介绍:1.高通量鉴定磷酸化位点。

质谱技术可以高通量地鉴定蛋白质中的磷酸化位点。

通过质谱仪的高分辨率和灵敏度,可以准确鉴定并定量大量的磷酸化位点,帮助构建磷酸化修饰的全貌。

2.定量分析磷酸化水平。

质谱技术不仅可以鉴定磷酸化位点,还可以定量分析磷酸化的水平。

通过质谱仪结合液相色谱等技术,可以准确测量不同样品中磷酸化位点的丰度变化,揭示磷酸化修饰在生物过程中的动态调控。

3.功能研究和生物网络分析。

质谱技术的应用可以帮助研究人员了解磷酸化修饰在信号传导、细胞周期和细胞分化等生物过程中的功能。

通过结合生物网络分析,可以构建磷酸化修饰网络,解析磷酸化修饰对细胞功能的影响。

二、质谱技术在蛋白质磷酸化组学研究中的应用。

质谱技术在蛋白质磷酸化组学研究中具有广泛的应用价值。

以下是几个重要的应用方面:1.疾病机制解析。

通过质谱技术对磷酸化位点的鉴定和定量分析,可以揭示磷酸化修饰在多种疾病的发生和发展中的调控机制。

这为疾病机制解析提供了重要的线索,有助于发现潜在的治疗靶点。

2.生物标志物的发现。

质谱技术可以帮助研究人员发现与疾病相关的磷酸化修饰位点,从而发现新的生物标志物。

这些生物标志物可以用于疾病早期诊断、预后评估和治疗监测等。

3.药物研发和个体化医学。

质谱技术在药物研发和个体化医学方面具有重要价值。

通过分析药物对蛋白质磷酸化的影响,可以评估药物的疗效和安全性,指导药物的优化和个体化治疗策略的制定。

mrm 定量质谱 -回复

mrm 定量质谱 -回复

mrm 定量质谱-回复mrm 定量质谱(MRM Quantitation Mass Spectrometry)量子质谱(mass spectrometry,MS)是一种卓越的分析工具,可以用于确定物质的分子结构、分子量和相对含量。

在分析过程中,质谱仪将分析样品中的分子离子化,并根据其质量-电荷比(m/z)进行分析和排序。

然而,对于定量分析而言,需要更精确和可重复的方法来确定目标分子的相对含量。

其中之一便是MRM定量质谱。

MRM,即Mutipule Reaction Monitoring的缩写,是一种通过选择性地监测特定的分子离子转换组合而进行的质谱分析技术。

与常规质谱技术相比,MRM定量质谱具有更高的灵敏度和选择性。

它通过选择并监测两个或多个特定的转换反应来确定目标化合物的浓度,其中一个用于选择溶液中的目标分子,另一个用于选择目标分子在质谱仪中的特定片段离子。

在MRM定量质谱的分析过程中,首先需要建立一个质谱方法,即确定目标化合物的分子离子、片段离子以及其相应的反应转换。

这需要通过先导研究来确定最佳的化合物及反应组合。

然后,需要准备合适质量的标准品,通常是已知浓度的目标分子。

这些标准品将用于构建一个标准曲线,帮助决定未知样品中目标分子的浓度。

为了分析样品中的目标分子,需要使用质谱仪进行样品分析。

首先,将样品通过适当的技术前处理方法进行提取、纯化和/或稀释。

然后,将样品注入质谱仪中,利用离子源将样品中的分子转化为离子,并加以定向并选择性地接收和分析。

质谱仪将记录所有离子信号,并将其转换为质谱图。

相应的质谱数据将被用于计算目标分子的浓度。

在分析过程中,MRM的选择性对于准确测量目标分子的浓度至关重要。

因此,质谱方法的建立阶段需要充分考虑到化合物的化学性质、质谱仪的特性以及最佳分析条件等因素。

同时,样品前处理的选择和优化也会对测量结果产生影响。

因此,为了获得可靠且准确的结果,需要进行多次实验,确保分析过程的可重复性和准确性。

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Unwin等19】采用MIDAS模式在对蛋白质磷酸化 修饰研究所得剑的结果中,既使对于500 fmol蛋白 质混合物中仅有20 fmol磷酸化蛋白质这样信号被高 度抑制的情况,也能够得到磷酸化多肽的检出,比 用母离子检测动态范围提高了一个数量级。
Wolf-Yalin等‘101在用IDA(information dependant acquisition;选择一级质谱信号中丰度最高的三个离 子进行子离子扫描的一种质谱信号采集方式)一MRM 方法定量分析蛋白质磷酸化介导的信号通路过程中, 比较了IDA信号采集模式和MRM信号采集模式对 酶切多肽混合物四次分析得到的肽段鉴定重复性实 验结果,前者的重复性仅为34%,而后者高达88%。 重复性的提高体现了MRM技术的优势,更有利于 对磷酸化修饰的动态变化进行监测和构建其相互作 用网络。
灵敏度高:MRM技术通过两级离子选择,排除 了大量干扰离子,使质谱的化学背景大大降低。目 标检测物的信噪比显著提高,能够完成其他质谱扫 描方式所望尘莫及的高灵敏度检测。
重现性好:质谱信号重现性差在一定程度上是 因为复杂生物样本基体和共流出组分对待测分子离 子化、质谱信号的抑制及源内碰撞碎裂过程的影响 导致。而在MRM技术质谱信号采集中,后两者的 影响被大大降低,因此重现性也相应提高。
MRM技术在验证和确证阶段都有极其重要的 应用,充分体现了该技术在生物标志物检测领域的 价值。例如,在Whiteaker等【71的研究中,以小鼠为 模型研究乳腺癌的生物标志物;用液相色谱串连质 谱(LC—MS/MS)对肿瘤和正常乳房组织的蛋白质进行 检测,筛查出700个以上差异蛋白质;再联合抗体 和MRM技术最后鉴定了fubulin.2作为血浆中的生 物标志物。实验结果进一步验证了MRM技术验证 生物标志物的方法,在发现新型生物标志物研究中 的可行性。
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《生命的化学》2008年28卷2期 CHEMISTRY OF LIFE 2008,28(2)
文章编号:1000.1336(2008)02—0210.04
●Technique and Methods
质谱MRM技术在蛋白质组学研究中的应用
赵焱应万涛钱小红
(军事医学科学院放射与辐射医学研究所:蛋白质组学国家重点实验室;北京蛋白质组研究中心。北京100850)
除大量不符合规则离子信号的干扰,从而得到质谱 信息的一种数据获取方式。具体地说,即是根据多 肽母离子质量数和碎片离子质量数,选择母离子-子 离子对,允许符合设定的母离子进入碰撞室,碰撞 完成后,只记录设定子离子信号。通过母离子和子 离子的两次选择,.去除干扰离子,降低化学背景,提 高灵敏度【21。在分析化学领域,这种质谱扫描模式 已成熟地用于复杂体系中小分子化合物的分析,如 环境分析、毒物分析、药物代谢物分析等口,4】。而近 年来MRM技术与多种质谱扫描模式的灵活结合,例 如MIDAS(MRM-initiated detection and sequencing,是 基于MRM获取的信号结果,对达到设定信号阈值 的多肽再进行高分辨产物离子扫描,从而对目标肽 段进行高灵敏度鉴定的方法),使复杂目标物的定性 结果更为可靠,拓宽了其在蛋白质组学领域的应用。 2.MRM技术的特点
Ahmed等…】同样采用MRM的方法,对细胞内 外生物标志物的多种修饰进行研究,定量了16个生 物标志物,并对这些细胞内外蛋白质修饰的功能作 了初步阐释。 5.MRM技术在定量蛋白质组学研究中的应用
复杂组分共流出物的干扰和宽达9个数量级以
万方数据
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《生命的化学》2008年28卷2期 CHEMISTRY OF LIFE 2008,28(2)
万方数据
●技术与方法
((生命的化学》2008年28卷2期 CHEMISTRY OF LIFE 20术特异性,对符合设 定的多肽进行检测,并且进一步进行增强产物扫描 分析,得到高分辨的串联质谱(MS/MS)碎片数据,使 分析过程中的定性结果假阳性率大大降低。该技术 与中性丢失相比,后者易检测到一些产生相似质量 丢失的假阳性肽,而一些不易产生中性丢失的目标 肽也有可能没被检测。而MRM技术则寻找产生特 异碎片的特异母离子,鉴定准确度高于全扫描和中 性丢失质谱扫描模式。
通量高:使用目前最先进的质谱系统,MRM技 术每个工作循环能处理多达300对母离子一子离子, 这种特点为研究多种蛋白质的多种修饰和丰度变化 提供了机会,更能满足蛋白质组学的研究需求。 3.MRM技术在生物标志物检测中的应用
运用蛋白组学的方法进行生物标志物的发现和 检测是目前蛋白质组研究的热点。随着蛋白质组学 技术的发展,采用二维凝胶电泳或鸟枪法(shotgun) 技术寻找上调或下调蛋白质以发现生物标志物的研 究策略已得到很大的丰富和完善。目前,标志物发 现一验证·临床确证的研究模式已得到研究者们的广 泛认可15.6】。即在发现阶段从疾病组织中寻找与正常 组织有差异的蛋白质,到验证阶段使用MRM技术 于组织周边体液或血浆中检测该差异蛋白质,利用 子离子谱进行定性,最后用MRM技术和同位素稀 释或质量标签标记(mTRAQ)的方法对筛选出来的标 记物定量,进行临床确证。这种研究模式使体液中 生物标志物的发现和验证更为有效、科学和合理。 MRM技术与金标准ELISA相比,周期更短、成本更 低,更重要的是能进行与同一疾病相关的多个标记 物同时测定且不需制备其相应的抗体,具有极大的 应用优越性。
Lenz等【17】采用此方法,研究了U1SnRNP和 1515K-61K.U4atacSnRN与RNA的相互作用信息,分 别用胰蛋白酶和RNA酶T1、A对蛋白质和RNA进 行酶切,得到相互作用的最短肽段和RNA的最短序 列,在负离子模式进行母离子扫描,依据获得的结 果设计MRM母.子离子对,在正离子模式进行MRM一 子离子增强扫描,最后得到了相互作用结构域等更 为详细的信息。 7。展望
中的低丰度蛋白质,Keshishian等【161也采用MRM和 同位素稀释的方法进行了定量分析。在未进行蛋白 质或多肽亲和富集的条件下,去除血浆6种高丰度 蛋白质后,低丰度蛋白质的检测限在1一10¨g/L,CV 值在3%一15%,与质谱直接检测血浆蛋白的方法相 比,分析性能改善了1000倍。实验结果显示了这种 MRM技术进行绝对定量的高精密度,以及用于分析 复杂样本的高动态范围。 6.MRM技术在蛋白质与RNA相互作用研究中的应 用
蛋白质一RNA复合物在调控真核细胞的基因表 达上具有重要意义。基于MS的方法研究蛋白质与 RNA的相互作用多有报道,而采用MRM与其他技 术相结合的方法,能更深入地研究蛋白质与RNA作 用的结构域,得到更丰富的相互作用结构信息。其 原理是:通过母离子扫描的模式,获得含有磷酸碎 片的所有多肽离子的准确分子量和电荷数。设计 MRM离子对,母离子扫描获得的信号离子作为母离 子,子离子设定为碱基序列AUGC,在MRM的检测 域值达到设定值后,进行高分辨增强子离子扫描,最 终获取蛋白质序列信息和与其作用的RNA序列信 息。
MRM技术是基于已知信息或假定信息设定质 谱检测规则,对符合规则的离子进行信号记录,去
收稿日期:2007.11.15 国家自然科学基金(20505019,20635010,20735005), 国家重点基础研究计划项(2007CB714104,2006CB910803) 资助 作者简介:赵焱(1978-),女,博士生,E-mail:flatl 19@sina. corn.cn;应万涛(1977-),男,博士,副研究员,联系作者,E. mail:yingwtll@yahoo.com.cn;钱小红(1955一),女,博士,博 士生导师,研究员,E-mail:qianxh@nic.bmi.ac.cn
蛋白质组学的研究对象是一个在时间和空间上 动态变化的整体,具有极端的复杂性。随着蛋白质 组学研究的深入和发展,尤其是差异蛋白质组学研 究的进展,大量功能蛋白质和潜在疾病蛋白质标志 物被发现并被鉴定,如何进一步探测这些蛋白质的 表达丰度,以阐明其功能和在疾病研究中的意义, 已变得越来越重要。仅仅依赖蛋白质大规模分离、 鉴定的技术路线(双向凝胶电泳技术分离蛋白质,质 谱技术鉴定蛋白质)已经不能满足这些研究的需求, 迫切需要更高灵敏度和更高选择性的研究方法。而 质谱多反应监测(multiple reaction monitoring,MRM)技 术作为一种高特异性,高灵敏度的质谱数据获取方 式,在进行蛋白质组学更具针对性的研究中发挥了 重要作用【11,逐步受到更多的研究者们关注。 1.MRM技术的原理
Kuhn等研究【s1表明,MRM技术与同位素标记相 结合进行绝对定量分析,可以节省分析时间,并且 能得到与抗体和免疫分析等经典验证方法具良好相 关性的检测结果。他们采用同位素标记合成肽段和 MRM技术相结合,检测来自类风湿性关节炎患者血 浆样本中诊断标记物C一反应蛋白的浓度,并对方法 的回收率、线性等进行了考察,结果能达到高达66% 的回收率和3个数量级以上的线性范围。 4.MRM技术在蛋白质翻译后修饰研究中的应用
蛋白质翻译后修饰在许多生命活动的调节过程 中起到非常重要的作用。蛋白质翻译后修饰过程的 阐明,有利于人们更深刻地理解生命体的生理和病 理过程。以蛋白质磷酸化修饰为例,MRM技术在翻 译后修饰的研究领域中显示了其独特的特点和优势。 例如,磷酸化蛋白质被酶切后,磷酸化多肽的信号 淹没在大量非磷酸化多肽的信号中,需要进行磷酸 化多肽的富集来提高分析灵敏度,改善分析效果, 但即便如此仍难以获得满意的分析结果,灵敏度低 遗漏大量信息。而以下几个实例则充分展现了MRM 技术在蛋白质磷酸化分析中的优势。
Anderson等n4】用MRM技术定量分析了人体血 浆中53种高、中丰度蛋白质。其中47个数据同批变 异系数为2%一22%,显示了定量的良好精密度。分 析结果的动态范围达到4.5个数量级。Lin等【”1用 MRM定量测定了人体血浆中中等丰度蛋白质的实 际浓度。测定结果表明其浓度范围达到了3~700nraol/L。 12次反复测量变异系数(CV)值小于25%。对于血浆
●Technique and Methods
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