葡萄种质资源数据库系统的构建

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葡萄种质遗传多样性的SSR分析及指纹库构建

Ｔａｂｌｅ１Ｇｒａｐｅｖａｉｒｅｔｉｅｓｆｏｒｔｅｓｔ
ＳＳＲ（ＳｉｍｐｌｅＳｅｑｕｅｎｃｅＲｅｐｅａｔ）即ＤＮＡ的简单重复序列，是一种具稳定性、可重复性、强特异性、共显性等诸多优点的分子标记技术，比ＲＦＬＰ标记操作简单和快速，在基因定位、遗传作图、品种鉴定等方面得到了广泛的应用。目前，ＳＳＲ标记已经在葡萄基因组作图、进化关系、品种鉴定等研究领域展示出巨大的应用潜力＿２］。ＳＳＲ标记可作为联系遗传图谱、序列信息以及最终的表型差异三者之间的重要纽带。该研究选取了４５个鲜食葡萄品种，利用位于不同染色体上的ＳＳＲ位点进行ＰＣＲ扩增研究，从分子水平上探讨４５份葡萄种质的亲缘关系，为有效利用ＤＮＡ标记评价葡萄种质资源亲缘关系提供理论依据。对葡萄育种、种质资源管理及其保护具
ＳＳＲ基因型数据库奠定了基础，也证明了ＳＳＲ分子标记
技术应用于葡萄品种鉴定和品种权保护是可行的。
３讨论
研究结果表明，利用ＳＳＲ的１９对基本核心引物标记能够充分揭示葡萄不同品系间存在的遗传差异。引
物扩增均具有多态性，多态性最高为１００，多态性最低为６６．７，平均多态性为９６．９３。由于选择的引物是
有重要意义。
第一作者简介：宪立杰（１９８７－），女，硕士研究生，现主要从事树木

利用数据分析提升葡萄栽培和酿造工艺的效率和质量

利用数据分析提升葡萄栽培和酿造工艺的效率和质量标题：利用数据分析提升葡萄栽培和酿造工艺的效率和质量引言：葡萄是一种重要的果树作物，在全球范围内被广泛种植，并用于生产葡萄酒。

为了提高葡萄的产量和质量，以及酿造过程的效率和质量，许多葡萄园和酿酒厂开始利用数据分析技术来优化栽培和酿造工艺。

本文将探讨如何利用数据分析来提升葡萄栽培和酿造工艺的效率和质量。

1. 数据收集和存储：要利用数据分析来优化葡萄栽培和酿造工艺，首先需要收集并存储相关的数据。

这包括葡萄园的气象数据（例如温度、湿度、降雨量等）、土壤质量数据、葡萄品种和植株生长数据，以及酿酒过程中的各项指标和质量检测数据。

这些数据可以通过气象站、土壤传感器、智能物联网设备和生产线传感器等手段进行收集，并与数据库集成以便后续分析。

2. 数据分析和模型建立：将收集到的数据进行预处理，清洗掉异常点和缺失值，并进行统计分析和可视化，以便更好地理解数据的特征和关系。

利用统计学方法和机器学习技术，可以建立相关的模型和算法来预测葡萄产量和品质，优化施肥、灌溉和采摘时间等栽培决策，以及改进酿酒工艺。

3. 栽培决策优化：通过分析历史数据和当前数据，可以预测葡萄产量和品质的变化趋势，并基于这些信息来优化栽培决策。

例如，根据天气情况预测葡萄病虫害的发生概率，及时进行预防性喷药；通过分析土壤质量数据，调整施肥方案，提高葡萄植株的养分吸收效率；结合植株生长数据和天气数据，确定最佳采摘时间，确保葡萄的成熟度和品质。

4. 酿酒工艺改进：利用数据分析可以更好地控制酿酒过程中的各项指标，提高酒的质量和口感。

通过分析历史数据和当前数据，可以确定影响酒质的关键因素，例如发酵温度、酒液浓度、酒槽通风等。

建立模型来预测酒的口感和质量，并根据模型的推荐进行调整，可以减少试错和试验的成本，提高酒的一致性和稳定性。

5. 质量控制和问题识别：利用数据分析可以实时监测葡萄园和酿酒过程中的各项指标，并及时发现和解决问题。

葡萄质量追溯系统建设与应用推广

L üs e n o n g c h a n p i n一、项目背景及来源农垦农产品质量追溯系统建设项目，以贯彻落实《农产品质量安全法》为核心，以提高农产品质量安全水平与市场竞争力为目标，按照生产有记录、信息可查询、流向能跟踪、责任可追溯为基本要求，通过农垦农产品质量系统项目建设，对于提高农产品质量安全，加快品牌建设，增强产品市场竞争力，积极发挥示范带头作用。

随着时代的发展，农产品质量问题已成为农业发展的主要矛盾,农药、化肥、兽药、饲料和添加剂、动植物激素等农资产品的大量使用，在促进农业发展和农产品产量提高的同时，也给农产品质量安全带来了严重的隐患。

随着国家《农产品质量安全法》的颁布实施，各地对农产品质量的要求越来越高。

一方面各地政府加强了对农产品质量的管理，另一方面广大消费者对农产品质量的认识逐步提高，安全消费意识增强，而消费者赖以确认农产品是否安全的依据是农产品质量管理相关部门的质量认证和标志。

因此，通过农垦农产品质量追溯系统项目的实施，提高农产品质量安全，提高农产品市场竞争力，提高社会效益和经济效益，示范带动周边种植户提高农产品质量。

二、项目实施情况1、2014年弥勒东风农场的葡萄质量追溯项目工作，在省农垦总局和弥勒东风农场的领导和大力支持下，成立了项目领导小组，明确具体分工和责任；建立完善相关制度；硬件网络建设齐备；宣传推广全力推进；追溯软件系统定制运行正常。

2014年集中信息员培训6次，集中录入250户种植户的种植管理和采收包装信息，形成追溯码2000多条。

2、2015年追溯项目落实在弥勒东风农场的小平地居委会和明以则居委会，落实面积6500亩。

项目涉及到两个居民委员会的5个居民小组的624户葡萄种植户；组织冬季修剪培训2310人次，召开无公害鲜食葡萄生产技术培训会6800人次；形成追溯链486条，打印追溯标签30827枚，可追溯葡萄产量422吨。

3、2016年对信息员进行了8次集中培训，记录施药信息1000条，施肥信息719条，管理记录830条，抽检、采收包装、销售记录各945条；打印追溯码1016条，打印追溯防伪标签576617枚，计划追溯产品产量7500吨，实际完成8779.6吨，超计划117.6%，占本单位该类产品总产量的32.2%；追溯葡萄远销云、贵、川、重庆等省市的批发市场，深受消费者喜爱。

宁夏葡萄种质资源数据库构建及管理系统研发

宁夏农林科技，Ningxia Journal of Agri.and Fores.Sci.&Tech.2023，64（10）：65-69·农林经济与信息技术·基金项目：宁夏农林科学院创新引导基金项目（NKYG-23-02）、宁夏酿酒葡萄智慧种植关键技术研究与示范。

作者简介：李季（1980—），女，吉林乾安人，副研究员，主要研究方向为农业信息化、深度学习和农业病虫害识别。

*通信作者：王盾（1970—），女，研究馆员，研究方向为信息资源管理。

收稿日期：2023-03-20葡萄是世界上栽培范围最广的果树之一，分布广泛。

据国际葡萄与葡萄酒组织（OIV ）统计，2022年全球葡萄园面积预计为730万hm 2。

宁夏贺兰山东麓具有独特的风土条件，其出产的葡萄酒具有甘润平衡的东方特性，是中国最大的集中连片葡萄产区。

统计数据显示，宁夏酿酒葡萄种植面积已达3.89万hm 2，占全国35%左右。

2021年，国家葡萄及葡萄酒产业开放发宁夏葡萄种质资源数据库构建及管理系统研发李季1，王盾2*，牛锐敏3，刘俭1，张学俭11.宁夏农林科学院农业经济与信息技术研究所，宁夏银川7500022.宁夏农林科学院，宁夏银川7500023.宁夏农林科学院园艺研究所，宁夏银川750002摘要：针对宁夏地区葡萄种质资源的保护与利用，以银川葡萄经济林国家林木种质资源圃的葡萄砧木、鲜食和酿酒品种等种质资源为基础，采用J2EE+SQLServer 数据库+Spring 架构、葡萄种质资源描述规范和数据标准，构建基于WEB 的葡萄种质资源数据库及管理系统。

对葡萄性状和属性进行规范化和标准化处理，采用二维码技术，为每个品种构建独特的识别码，实现全程识别。

同时，绘制种质资源圃实生苗木电子分布标识图，对葡萄种质资源和植株生长性状和经济性状等表型性状数据进行高效分类管理、种质资源信息保存与性状信息共享，提高了葡萄种质资源的数字保护、利用管理和知识化服务水平，旨在为葡萄产业的可持续发展提供有力支持。

新疆维吾尔自治区林木种质资源库——吐鲁番市葡萄库概览

果农之友2023.4种质资源吐鲁番市葡萄自治区林木种质资源库于2019年开始建设，2021年被列为新疆维吾尔自治区第一批林草种质资源库（圃），目前由吐鲁番市葡萄产业发展促进中心、高昌区林业和草原局共同管理，主要任务是对吐鲁番优良葡萄种质资源进行收集保存，引进、改良、繁育、推广及对现有种植品种进行保护、延续等，通过有计划地对葡萄种质资源调查分析，筛选优质、高产、多抗、适宜当地种植的葡萄新品种并予以推广，为吐鲁番市葡萄品种结构调整决策提供科学依据，为促进吐鲁番市葡萄产业的持续、稳定发展和农民增产增收提供技术基础。

1建圃情况资源圃地处吐鲁番市高昌区三堡乡园艺村，北纬42.95°，东经89.23°，在著名的火焰山脚下，资源圃建设初期按照核心基地生产用房、交通、通讯设施、防护林带基本完善，基地内水肥一体化、滴灌系统完备原则规划选址，具有顺利保存种质资源的良好条件，经过多次研究探讨决定建设，目前占地面积230亩，包括核心区100亩，附属区130亩。

2重要意义习近平总书记强调，必须把民族种业搞上去，把种源安全提升到关系国家安全的战略高度，打牢种质资源基础，做好资源收集、鉴定评价工作，并切实保护好、利用好。

新疆具有悠久的葡萄种植历史，吐鲁番作为新疆乃至全国葡萄主要产区，种植面积54万亩。

吐鲁番在我国葡萄产业发展中占有重要的位置，是驰名中外的“葡萄之乡”，葡萄品种资源极为丰富，达到550份，是驰名中外的“世界葡萄植物园”。

几千年的葡萄种植历史留下了宝贵的种质资源，部分品种依然是全区的主栽品种。

通过积极地整合葡萄种质资源，对新疆珍稀、特有及濒危葡萄种质资源安全保护、保存和延续，弥补葡萄种质资源保存系统的缺陷，推动新疆维吾尔自治区作为全国葡萄种植主产区在新品种选育方面的创新交流，有效保存葡萄遗传资源，为新疆葡萄产业优质、安全及可持续发展提供有力保障。

3人员情况吐鲁番葡萄自治区林木种质资源库由吐鲁番市葡萄产业发展促进中心组织建设，现有技术团队成员6人，其中正高级工程师1人、副研究员1人、高级工程师1人、工程师2人、助理工程师1人。

葡萄优良种质资源管理信息系统研建

2020年第2期现代园艺在生产过程中完全把握。

但消费者个人对农产品的喜好，如口感、色泽、形状又多样化，怎样实现既满足消费者个性需求，又可以尽量实现农产品质量上的批量标准化问题。

另外，农产品在交易运输过程中普遍存在包装造成农产品出现损耗，消费者往往在收到农产品时，已经出现质量差异，也因此不少用户消费者会通过微信平台或交易平台给出负面评价，更有甚者，通过互联网络发布该产品负面评价，这些都直接影响农产品线上销售。

3.2农产品保存和跨区域运输难因为农产品自身特点，与其它产品不同的是，农产品交易后物流运输成本相对较高，一是因为在农产品包装上要精细小心且包装成本大，一些生鲜农产品需要采用特殊的包装材料；二是生鲜类农产品会用到冷链物流，冷冻包装冷链物流除了价格高以外，还会出现温度变化使农产品保鲜程度不够，保险用冰在融化后还会直接影响其他快递的运输配送。

目前，在我国许多农产品还不太能够实现批量远距离配送，因此，农产品的物流配送问题是目前利用微信平台进行线上农产品营销的一大难题。

3.3传统消费者购买习惯根据我国农村城镇消费现状，目前大部分农产品消费者依然习惯在居住地周边集市或大型商超购买农产品，线上销售农产品仍集中在年轻用户群体之中，不少农产品消费主力的中老年家庭主妇对微信网络销售存在质疑与不信任，同时这些家庭主妇会将线下市场买菜购物作为日常生活中的一部分。

与此同时，微信平台不断出现假面膜、假奶粉等售假事件，更让微信营销变得十分艰难。

尽管国家已出台了很多进行网络销售的监管制度，但普通消费者在面对微信平台上的农产品时，仍会对农产品交易过程中的质量及物流运输过程存在质疑，这种不信任感直接影响了农产品微信营销的效果。

4结语在当下移动互联网发展迅速，微信用户群体不断扩大的今天，大多数微信平台用户的朋友圈都被各类微信消息广告及朋友圈广告无缝渗透，到熟悉的微信好友购买商品，只要一般商品品质较好，价格公道，对普通消费者来说，已经成为一种方便的购物方式。

[VIP专享]如何开发建设种质资源数据库

如何开发建设种质资源数据库1.省级种质资源鉴定与信息中心建设配套建设。

全省种质资源数据库硬件设施和技术集成,统一组织全省种质资源鉴定和数据入库工作,采取省农业行政主管部门管理和财政预算补助的方式,确保全省种质资源数据全面入库、信息服务流畅和资源实物共享的逐步实现。

中心也可为企业提供农产品加工品资源(基因)成份的检测服务。

2.省级中期种质库建设。

结合浙江省种质资源特点,在杭州市建设综合性或专业性的中期种质库2~3座。

负责开展入库种质资源遗传分析和综合鉴定,采取省农业行政主管部门和建设单位共同管理的方式实现资源共享。

3.重点作物种质资源繁殖保存圃建设。

建立农作物种质资源库。

根据全省种质资源分布状况和技术条件,以作物类别为主分别在嘉兴、绍兴、台州、金华、衢州、温州和丽水等市或所辖县(市、区)中选点建设繁殖保存圃20~25个,重点为水稻、油棉麻、蔬菜、旱地作物、小水果、水生作物、食用菌、中药材、野生宿根花卉等种质圃。

对有知名度的作物可单独建立,重点为食用菌、花椰菜、芥菜、中药材、麻类、樱桃、李子、柑橘等种质圃。

繁殖保寸圃以市科研单位和各级农业相关管理机构为实施主体,也可根据市场前景与开发利用基地建设相结合。

4.地方特色优势种质资源开发利用基地建设。

对有市场开发前景的种质资源,在开展鉴定、登记、保存的基础上,加快繁殖,以优势种子企业和农产品企业为实施主体,建设地方特色优势种质资源开发利用基地,包括良种基地和农产品生产加工基地,并推进与市场的连接销售,以开发利用为手段,实现可持续的保存。

5.濒危稀有种质资源保护区、保护地建设。

对发掘的稀有或濒危种质资源,需要原生境加以保护保存的,由资源生境所在地市级或县级农业行政主管部门组织,相应业务管理机构或农业科研机构负责,建设种质资源保护区或保护地。

一、托普云农植物种质资源数据库建设的意义：为了发掘和收集各种农作物品种种子，科学地加以贮藏，使种质在十几年甚至数十年之后仍具有原有的遗传特性和很高的发芽力，对于品种改良，培育高产、优质、抗逆性强的新品种，并为生物学的理论研究提供丰富的种质和研究材料具有重要意义。

我国葡萄种质资源收集保存和研究利用进展

果树资源学报　２０２１，２（２）：０１０４专家论坛我国葡萄种质资源收集保存和研究利用进展赵旗峰，黄丽萍，刘晓婷，王　敏，荀志丽，马小河（山西农业大学果树研究所／果树种质创制和利用山西省重点实验室，山西太原０３００３１）收稿日期：２０２１０１１５基金项目：农业部农作物种质资源保护，枣葡萄种质资源收集、编目、更新与利用（１１１８２１３０１３５４０５２００２）；科技部资源平台专项：国家枣葡萄种质资源平台（ＮＨＧＲＣ２０２０－ＮＨ１２－２）；国家现代农业产业技术体系专项（ＣＡＲＳ－２９－ｙｚ－５）第一作者简介：赵旗峰（１９７５－），男，副研究员，硕士，主要从事果树资源与育种研究。

电话：１３９３５４９２７６４；Ｅｍａｉｌ：４４６０２１４４５＠ｑｑ．ｃｏｍ通讯作者：马小河（１９６４－），男，研究员，主要从事果树生理与栽培技术研究。

电话：１３８３５４７３５８１；Ｅｍａｉｌ：１３８３５４７３５８１＠ｑｑ．ｃｏｍ摘　要：葡萄种质资源是葡萄科技创新和现代产业发展的物质基础，对促进乡村振兴和现代农业发展发挥着重要的支撑作用。

文章系统总结了我国葡萄种质资源的收集保存、鉴定评价和创新利用等方面的研究进展，分析存在的主要问题，对未来的发展趋势和研究方向进行了展望。

关键词：葡萄；种质资源；收集保存；鉴定评价；创新利用文章编号：２０９６８１０８（２０２１）０２０００１０４中图分类号：Ｓ６６３．１文献标识码：Ａ犆狅犾犾犲犮狋犻狅狀，犆狅狀狊犲狉狏犪狋犻狅狀狅犳犌狉犪狆犲犌犲狉犿狆犾犪狊犿犚犲狊狅狌狉犮犲狊犪狀犱犘狉狅犵狉犲狊狊狅犳犚犲狊犲犪狉犮犺，犝狋犻犾犻狕犪狋犻狅狀犻狀犆犺犻狀犪ＺＨＡＯＱｉｆｅｎｇ，ＨＵＡＮＧＬｉｐｉｎｇ，ＬＩＵＸｉａｏｔｉｎｇ，ＷＡＮＧＭｉｎ，ＸＵＮＺｈｉｌｉ，ＭＡＯＸｉａｏｈｅ（ＰｏｍｏｌｏｇｙＩｎｓｔｉｔｕｔｅ，ＳｈａｎｘｉＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ／ＳｈａｎｘｉＰｒｏｖｉｎｃｉａｌＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＦｒｕｉｔＧｅｒｍｐｌａｓｍＣｒｅａｔｉｏｎａｎｄＵｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ，Ｔａｉｙｕａｎ０３００３１，Ｃｈｉｎａ）犃犫狊狋狉犪犮狋：Ｇｒａｐｅｇｅｒｍｐｌａｓｍｒｅｓｏｕｒｃｅｓａｒｅｔｈｅｍａｔｅｒｉａｌｂａｓｉｓｆｏｒｇｒａｐｅｓｃｉｅｎｃｅａｎｄｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙｉｎｎｏｖａｔｉｏｎａｎｄｍｏｄｅｒｎｉｎｄｕｓｔｒｉａｌｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ，ａｎｄｐｌａｙａｎｉｍｐｏｒｔａｎｔｓｕｐｐｏｒｔｉｎｇｒｏｌｅｉｎｐｒｏｍｏｔｉｎｇｒｕｒａｌｒｅｖｉｔａｌｉｚａｔｉｏｎａｎｄｍｏｄｅｒｎａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ．Ｔｈｉｓｐａｐｅｒｓｙｓｔｅｍａｔｉｃａｌｌｙｓｕｍｍａｒｉｚｅｓｔｈｅｒｅｓｅａｒｃｈｐｒｏｇｒｅｓｓｉｎｔｈｅｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎａｎｄｐｒｅｓｅｒｖａｔｉｏｎ，ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄｅｖａｌｕａｔｉｏｎａｎｄｉｎｎｏｖａｔｉｖｅｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎｏｆｇｒａｐｅｇｅｒｍｐｌａｓｍｒｅｓｏｕｒｃｅｓｉｎｍｙｃｏｕｎｔｒｙ，ａｎａｌｙｚｅｓｔｈｅｍａｉｎｐｒｏｂｌｅｍｓ，ａｎｄｌｏｏｋｓｆｏｒｗａｒｄｔｏｔｈｅｆｕｔｕｒｅｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｔｒｅｎｄａｎｄｒｅｓｅａｒｃｈｄｉｒｅｃｔｉｏｎ．犓犲狔狑狅狉犱狊：ｇｒａｐｅ；ｇｅｒｍｐｌａｓｍｒｅｓｏｕｒｃｅｓ；ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎａｎｄｐｒｅｓｅｒｖａｔｉｏｎ；ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄｅｖａｌｕａｔｉｏｎ；ｉｎｎｏｖａｔｉｖｅｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ葡萄属于葡萄科（Ｖｉｔａｃｅａｅ），葡萄属（ＶｉｔｉｓＬ．）。

葡萄种质资源ISSR-PCR反应体系的建立与优化

葡萄种质资源ISSR-PCR反应体系的建立与优化代培红;朱瑜;姚正培;李玮璐;马丽;罗淑萍【期刊名称】《南方农业学报》【年(卷),期】2013(044)008【摘要】[目的]建立并优化葡萄种质资源稳定的ISSR-PCR体系,为葡萄种质资源研究和种质创新奠定基础.[方法]以新疆22个葡萄种质资源叶片为材料,采用改良CTAB法提取葡萄基因组DNA,并利用单因素法对影响ISSR反应体系中的各个影响因子进行优化.[结果]优化的最佳ISSR-PCR反应体系为:模板DNA 30ng,dNTPs 0.3 mmol/L,引物0.5 μmol/L,TaqDNA聚合酶1.0U,反应体系为25.0μL.[结论]优化了新疆葡萄种质资源ISSR-PCR反应体系中的各个影响因子,利用该体系能够扩增获得清晰、稳定的条带,可以用于葡萄种质资源遗传多样性分析.【总页数】5页(P1258-1262)【作者】代培红;朱瑜;姚正培;李玮璐;马丽;罗淑萍【作者单位】新疆农业大学农学院乌鲁木齐830052;新疆农业大学农学院乌鲁木齐830052;新疆农业大学农学院乌鲁木齐830052;新疆农业大学农学院乌鲁木齐830052;新疆农业大学科学技术学院乌鲁木齐830052;新疆农业大学农学院乌鲁木齐830052;新疆农业大学科学技术学院乌鲁木齐830052;新疆农业大学农学院乌鲁木齐830052【正文语种】中文【中图分类】S663.1【相关文献】1.石蒜属植物种质资源ISSR-PCR反应体系的建立 [J], 张雷凡;高燕会;朱玉球;刘志高;童再康;黄华宏2.葡萄ISSR－PCR反应体系的建立与正交设计优化 [J], 张娜;李群;高兴旺;赖晓辉;李佳;丁金鹏3.葡萄种质资源SRAP-PCR反应体系的建立及优化 [J], 苑炜;朱瑜;代培红;夏培蓓;罗淑萍4.葡萄种质资源ISSR-PCR反应体系的建立与优化 [J], 代培红;朱瑜;姚正培;李玮璐;马丽;罗淑萍;5.葡萄ISSR-PCR反应体系的建立与优化 [J], 赖呈纯;范丽华;谢鸿根;余亚白;郑铭西;谢福鑫因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

山葡萄核心种质初步构建

山葡萄核心种质初步构建温景辉;申海林;邹利人;陈蕾;刘洪章【摘要】采用扩增稳定且谱带清晰的18对SSR引物,对360份山葡萄资源进行遗传多样性分析.用逐级压缩法选择核心种质,比较了样本数不同的5个核心样本群的等位基因数、等位基因频率、有效等位基因数、Nei's 遗传多样性和Shannor's信息指数等参数,最终选择了79个样本组成的样本群作为核心种质.用DPS软件对初始种质和核心种质群体的有效等位基因数、Nei's遗传多样性和Shannon's信息指数分别作t测验,核心种质保留了初始种质21.9%的样品,等位基因数、有效等位基因数、Nei's遗传多样性、Shannon's信息指数的保留率分别为94.1%、106.3%、101.9%、102.2%,核心种质能很好地代表初始种质.%Eighteen pairs of SSR primers with steady amplification and clear spectrum were used to analyze the genetic diversity of 360 accessions of Vitis amurensis Rupr. in northeast China. Stepwise condensation method was used to screen the core collection. A total of 79 samples were chosen as core collection by comparing the parameters of 6 sample groups, including number of alleles, allele frequency, effective number of alleles, Nei' s genetic diversity, and Shannon information index.T-test for initial collection and core collection was performed by using DPS software. Results showed that the core collection hold 21.9 percent of samples of initial collection, and the number of alleles, the effective number of alleles, Nei' s 8enetic diversity, and Shannon information index reached 94. 1％, 106.3％, 101.9％ and 102.2％ respectively. It is demonstrated that the core collection can express initial collection well.【期刊名称】《东北林业大学学报》【年(卷),期】2011(039)006【总页数】3页(P35-37)【关键词】山葡萄(Vitis amurens Rupr.);科质资源;遗传多样性;SSR;核心种质【作者】温景辉;申海林;邹利人;陈蕾;刘洪章【作者单位】吉林农业大学,长春,130118;吉林省农业科学院;吉林省农业科学院;吉林省农业科学院;吉林农业大学【正文语种】中文【中图分类】S663.1植物遗传资源是新品种选育和种质创新的基础，种质资源的收集、保存、评价和利用非常重要[1-2]。

葡萄资源库建立和管理

葡萄资源库建立和管理摘要：葡萄资源库的建立，主要目的在于能够开展葡萄品种改良、育种、引种等等良性发展，可以说建立葡萄资源库以及对葡萄资源库进行管理对我国日后葡萄种植有重要意义。

未来葡萄资源库的建设与管理主要是根据互联网+技术和webGIS技术作为基础，设立了客户终端以及网络平台，目的在于通过网络技术来建立葡萄资源库，通过信息技术来对葡萄资源库进行管理。

关键词：葡萄；资源库；建立；管理葡萄资源库信息系统的建设主要目的在于能够对葡萄种类资源进行管理，通过网络技术的帮助，优秀葡萄种质资源将会得到快捷、高效的管理。

在葡萄资源库当中，需要实现空间与种属信息一体化管理，建立标准的数据存储机制，统一葡萄种植信息，实现多角度可视化管理。

1.葡萄资源库硬件设计1.PC客户端设计数据库服务器当中涉及了大量数据，对这些数据需要进行存储以及随时提取，因此要求系统性能和安全性都达到要求。

尤其是葡萄资源库当中数据信息过大，因此存储空间是主要的加强目标，还需要注意对硬盘的保护，避免被窃取[1]。

1.1.服务器设计由于其中保存的大量数据都较为重要，因此葡萄资源库对系统整体安全性要求较高，在实际建立葡萄资源库的过程中，可以选择戴尔2576服务器，搭载四核处理器，这一服务器安全系数较高，同时拥有数据恢复的相关功能。

1.1.网络接入设备葡萄资源库的建立并不涉及大量网络信息，因此网络接入设备可以使用网卡来接入移动、联动宽带，保障系统服务器以及终端处于稳定运行状态。

1.葡萄资源库信息系统软件设计1.系统整体架构在对优秀葡萄资源信息时空分布特点进行分析之后可以发现，其中webGIS技术的B/S结构比较符合这一特点。

B/S结构模式属于在C/S基础上，结合互联网技术进行扩展。

整体来说这一结构模式包括三层架构，分别是表示层、逻辑层、数据库层。

表示层是指用户自身使用的浏览器，主要功能是作为数据终端显示，使用了HTML页面设计方法。

通过RIA技术当中的客户端功能，可以在表示层进行搭建，实现种质信息的管理。

我国葡萄国家级种质资源圃的建设现状

我国葡萄国家级种质资源圃的建设现状任国慧;吴伟民;房经贵;宋长年【摘要】This paper comprehensively introduced 3 national grape germplasm resource nurseries in our country, including the general situation of resource nurseries, the preserved grape germplasm resources, preservation method, and the identification, evaluation and utilization of variety resources, and finally suggested constructing national grape germplasm resource nursery in the south China.%对我国3个国家级葡萄种质资源圃作了较全面的介绍,包括资源圃的概况、保存的葡萄种质资源、保存方法,品种资源的鉴定、评价与利用等,并提出了在我国南方增设国家级葡萄种质资源圃的建议.【期刊名称】《江西农业学报》【年(卷),期】2012(024)007【总页数】4页(P10-13)【关键词】葡萄;种质资源;保存;利用;国家级资源圃【作者】任国慧;吴伟民;房经贵;宋长年【作者单位】南京农业大学园艺学院,江苏南京210095;江苏省果树品种改良与种苗繁育工程中心,江苏南京210095;江苏省农业科学院园艺研究所,江苏南京210014;南京农业大学园艺学院,江苏南京210095;江苏省果树品种改良与种苗繁育工程中心,江苏南京210095;南京农业大学园艺学院,江苏南京210095;江苏省果树品种改良与种苗繁育工程中心,江苏南京210095【正文语种】中文【中图分类】S663.1葡萄属于葡萄科(Vitaceae)，葡萄属(Vitis L.)。

葡萄DNA指纹数据库的构建及品种鉴定

葡萄DNA指纹数据库的构建及品种鉴定葡萄DNA指纹数据库的构建及品种鉴定摘要：随着社会发展和技术进步，葡萄种质资源的保护和利用变得越来越重要。

通过构建葡萄DNA指纹数据库，可以实现对不同葡萄品种的鉴定和保存，并为葡萄育种工作提供便利。

本文介绍了葡萄DNA指纹数据库的构建方法和技术要点，并探讨了其在葡萄品种鉴定中的应用前景。

一、引言葡萄是重要的经济作物之一，其种类繁多，各具特色。

为了保护和利用葡萄的遗传资源，构建葡萄DNA指纹数据库成为一项迫切的需求。

葡萄DNA指纹数据库可以通过分析葡萄的遗传特征，实现对不同葡萄品种的鉴定和保存，为葡萄育种工作提供重要的依据。

二、葡萄DNA指纹数据库的构建方法1. 样本采集与保存从不同的葡萄品种中分别采集叶片、果实或芽等组织样本，并使用干冰保存，以保证样本中DNA的完整性。

2. DNA提取与扩增利用CTAB法等常规方法，从葡萄样本中提取总DNA，并利用多态性引物对DNA进行PCR扩增，以得到包含多个位点的DNA特征片段。

3. 凝胶电泳分析将PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析，通过对不同葡萄品种的DNA特征片段进行比对和分析，建立不同葡萄品种的DNA指纹图谱。

4. 数据录入与分析将凝胶电泳结果进行数字化处理，并建立数据库，用于存储不同葡萄品种的DNA指纹图谱。

通过比对和分析，确定不同葡萄品种之间的遗传关系，为葡萄品种鉴定提供依据。

三、葡萄品种鉴定的应用前景1. 品种保护葡萄种质资源的保护是构建DNA指纹数据库的重要目标之一。

通过对不同葡萄品种的DNA指纹进行录入和保存，可以有效防止品种混淆和丢失，为葡萄品种的保护提供技术支持。

2. 品种鉴定葡萄品种鉴定是葡萄育种工作中的重要环节。

利用构建的葡萄DNA指纹数据库，可以对新培育的葡萄品种进行鉴定，加快育种进程，并保证新品种的独特性和原创性。

3. 葡萄资源调查葡萄资源的调查是葡萄育种和栽培管理的基础工作。

通过葡萄DNA指纹数据库，可以对葡萄资源进行调查和分类，了解不同地区和品种的遗传特征，为葡萄的遗传资源利用提供科学依据。

葡萄全基因组SSR分析和数据库构建

南京农业大学学报 2009,32(4):28 32J ournal of N anj i ng A gricult ural Uni ver sity http://nauxb n jau edu cn蔡斌,李成慧,姚泉洪,等.葡萄全基因组SSR分析和数据库构建[J].南京农业大学学报,2009,32(4):28 32葡萄全基因组SSR分析和数据库构建蔡斌1,3,李成慧2,姚泉洪3,周军1,陶建敏1,章镇1*(1.南京农业大学园艺学院,江苏南京210095;2.苏州农业职业技术学院,江苏苏州215008;3.上海市农业科学院生物技术研究所,上海201106)摘要:利用P erl语言开发了用于探寻基因组SS R的程序SSRF i nder,并利用其从法国国家基因测序中心(G enoscope)公布的欧亚种葡萄(V itis vini fera L.)黑比诺品系PN40024的基因组序列中检索到114520个SSR。

其中含单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复单元的SS R数目分别为37648(32 9%)、30123(26 3%)、18705(16 3%)、14566(12 7%)、3492(3 0%)和9986(8 7%)个。

在各类SSR中,不同核苷酸组成的重复单元频率间存在较大的差异,其中富含A/T重复单元的SSR频率最高,而富含C/G重复单元的SSR频率最低。

SSR在基因组上主要分布在基因间隔区,其次是基因的非翻译区,在编码区的分布密度最小。

三核苷酸和六核苷酸SSR在翻译区的分布密度明显高于其他类型的SSR。

利用这些SSR序列共设计出80065(69 9%)对SS R引物。

另外,本研究开发了一个基于W eb界面的SSR数据库DGSS R,收录和注释全基因组与EST的SS R,并提供了查询界面,网址为htt p:// www yao l ab sh cn/ssr。

关键词:SSR;欧亚种葡萄;基因组;数据库中图分类号:S663 1 文献标志码:A 文章编号:1000 2030(2009)04 0028 05Analysis of SS Rs i n grape geno m e and develop m ent of SSR database CA I B i n1,3,LI Cheng hu i2,YAO Quan hong3,Z H OU Jun1,TAO Jian m i n1,Z HANG Zhen1*(1.Co llege o fH orticu lture,N anji ng A g ricu lt ura lU n i versity,N an jing210095,Chi na;2.Suzhou Po l y techn ic Instit ute o f A gr i culture,Suzhou215008,Chi na;3.B iotechnology R esearch Institute of Shanghai A cade m y o f Ag ricu ltura l Sc iences,Shangha i201106,China)Abstrac t:W e deve l oped a Per l script SSRF i nder to detect SSR s i n grape g eno m e sequence.A tota l o f114520SSR s w ere iso l a ted fro m publicly ava ilab le V itis vini f era L. P i nor N or iPN40024 g eno m ic DNA sequence.Among them,37648m ononuc l eotide re peats,30123d i nuc l eotide repea ts,18705tri nucleo ti de repeats,14566tetranuc l eotide repeats,3492pen tanuc l eo ti de repeats, and9986hex anuc leo ti de repea tsw ere found,accounti ng for32 9%,26 3%,16 3%,12 7%,3 0%,and8 7%o f t he to talrepea ts represented t he mo st abundant type,whereas C/G rich m otifs w ere t he ra rest SSR s respectively.SSR s w ith po l y(A/T)ntype.W e a lso assessed the d istri buti on o f SS R s on geno m e fragm ent.T he resu lts showed tha t the SSR s distr i buted m a i nly i n i nter genic reg i on and w ere m oderate ly abundant i n UTR s.In codi ng reg ion,t he distributi on of a ll repeat types w as l ess frequen t except tr i and hexa nucleoti de repeats.T o m ake use o f t hese SSR s,we deve l oped a database on the Interne t.The database o f g rape SSR s (DGSS R)is a database co m prehensively co ll ecting and annotating grape SSR s.T he DG SSR conta i ns all the SSR s w ith t he ir re l a ted infor m ati on de tected i n t he study.It prov i des fl ex i b l e query i nte rface and deta iled anno tati ons for i ndi v idual SSR.It a lso conta i ns SSR s detec ted from Vitis vini fera L.ES T s da taset.T he DG SSR is ava ilab l e a t h ttp://www yao l ab sh cn/ssr.K ey word s:SS R;V itis vini fera L.;genome;databaseSSR是一种以PCR反应为基础的分子标记,它既具有一般PCR反应成本低廉的特点,又兼具了RFLP标记的稳定性、可重复性、强特异性和共显性等诸多优点,还比RFLP标记操作简单和快速,因而在基因定位、遗传作图、品种鉴定和分子标记辅助育种等方面得到了广泛的应用[1]。

农作物种质资源库的信息系统的应用操作与方法

农作物种质资源库的信息系统的应用操作与方法托普云农农作物种质资源库的信息系统的应用操作首先从数据导出开始,数据导出是这个系统中非常重要的一个环节,数据导出功能可以将用户选择的农作物农作物种质资源库数据导出到用户需要的地方。

数据的导出在导出数据库数据的同时,也需要同时导出格式库和代码库中的数据,并且做出提示。

因为在设计本系统数据库时,数据库、格式库、代码库是一个整体,(都为·dbf格式),如果没有格式库和代码库,则数据库中的数据是不完整的。

然后在导出的数据库内输入你所掌握的数据并且把数据导入系统内,这一步也是非常得重要,要我们注意的是,系统外的数据表的格式和系统中的数据库表格式一致,在数据库导入时必须区别对待。

当数据库表格式一致时直接导入。

当农作物农作物种质资源库表格不一致的字样(系统中出现格式不一致)时,这时需要调整:如果字段名不一致(数据库表中的字段类型都为字符型),系统就会提示,字段的长度不一致时也会提示,若不修改我们就根本不能把数据表导入系统内。

当我们把数据表输入到系统中后,这时我们要做的是了解系统的功能。

目前我们这个系统主要是以种质的查询为主,按照自己的需要进行查询,系统中存放的种质资源信息非常的多,若用户想要从如此众多的信息当中查找自己所需要的种质信息,绝非易事,但是,如果用户按照自己所要找的作物的性状,进行查找就容易多了(参照图1),例如:我们要找一个青原294的性状,我们就要进入系统,首先要选择数据库,在任务栏中点击作物特性评价鉴定的大田作物,从大田作物中选大麦,然后按“确定”我们就进入大麦的界面,这时我们在任务栏中点击检索查询中的“通用检索查询”,就能看到很多大麦的性状,在查询条件中出入品种名称“青原294”,然后点“确认”,再点击“检索”,这时即可显示出青原294的所有性状。

该系统的第二个主要功能是统计功能,通过对不同类别相对应的质量性状或数量性状进行统计,获得各种统计结果和统计变量,将统计结果显示,使种质资源研究工作者可以统计结果了解种质资源的总体情况,在分类统计中,主要有两种统计可供用户使用,分别是:一维分类统计、二维分类统计。

农作物种质资源库平台组成要素

农作物种质资源库平台组成要素农作物种质资源是生物多样性的重要组成部分,是作物育种和农业生产的物质基础。

托普云农农作物种质资源平台建设是实现食物安全、生态安全和农民增收的重要保障。

1990年,中国初步建成了国家农作物种质资源库系统。

为了进一步提高农作物种质资源的利用效率和效益,解决农作物种质资源规范标准不统一、保存体系不完善、资源保存相对分散、资源整合有待加强、信息网络基础设施薄弱、共享利用困难等问题,2003年,我们提出了国家农作物种质资源平台的建设方案,从2004年开始,在原有国家农作物种质资源数据库系统的基础上,着手建设国家农作物种质资源平台。

到目前已基本建成了国家农作物种质资源平台,该平台可以迅速及时地为育种和科研提供丰产、优质、抗主要病虫、抗不良环境的优良种质资源信息和实物。

托普云农国家农作物种质资源平台是一个虚拟式的农作物种质资源机构。

其宗旨是:集中体现国家安全和利益,根据国家发展需求,收集、保护和利用农作物种质资源,面向全国开放共享服务,为新品种选育、科学技术研究、政府决策、人才培养、农业生产和种业发展提供服务。

平台的发展目标是:建成国际一流的农作物种质资源保存和服务中心,国际种质资源合作和交流中心,全国农作物种质资源体系的龙头,高层次种质资源人才培养和科普教育基地。

国家农作物种质资源平台由国家长期种质库、国家复份种质库、11个国家中期种质库(水稻、旱粮、棉花、麻类、油料、蔬菜、西甜瓜、甜菜、烟草、牧草、热带作物)、33个国家种质圃(野生稻、小麦野生近缘植物、甘薯、马铃薯、野生棉、苎麻、野生花生、水生蔬菜、苹果、梨、山楂、桃、杏、李、柿、核桃、板栗、枣、葡萄、草莓、柑橘、龙眼、枇杷、香蕉、荔枝、新疆名特果树、云南特有果树、寒地果树、甘蔗、茶树、桑树、橡胶等)和国家种质信息中心组成。

托普云农国家农作物种质资源库负责全国农作物种质资源的长期安全保存;国家复份种质库负责国家长期种质库保存种质资源的备份安全保护;国家中期库负责某一种或一类作物种质资源的收集编目、中期保存、整理评价、繁殖更新和分发利用,并向国家长期种质库提供新收集的种质;国家种质圃负责某一种或一类无性繁殖(多年生)作物种质资源的收集分类、编目保存、整理评价、繁殖更新和分发利用;国家种质信息中心负责全国作物种质资源信息管理和信息系统建设。